| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,953,938 | Δ1 bp | 6.1% | coding (585/1977 nt) | PP_5606 ← | YVTN beta‑propeller repeat‑containing protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,953,938 | 0 | C | . | 6.1% | 211.7 / 6.9 | 66 | coding (585/1977 nt) | PP_5606 | YVTN beta‑propeller repeat‑containing protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (32/30); new base . (2/2); total (34/32) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.40e-01 | |||||||||||
GATCACTGTTACCCCACCTTTGGCCGGGTCGCTGCTGTTGTTGCCAACCCACAGCCGATGCTGGTCCGGCTGCAGGGCCACGCGCAGCGGCTGGTCGCCGGCGTCCAGGTCGGCCACGCGGGTGAAGGTTTCGGT‑ATCGATCACCGAGACCTTGCCCCGCTCGGGTATCGACACGAAAACCTGCTTGTCGTCGCTGGTGGCCGCCCAGTCCATGGGCCGCCCTGGCAGCTCGATGCGCGCCATGGTGCTGGTCACGCCCCCCACCGACACCGTCGGGTCGATCACTGTC > NC_002947/3953797‑3954085 | gATCACGGTTACCCCCCCTTTGGCCGGGTCGCTGCTGTTGTTGCCAACCCACAGCCGATGCTGGTCCGGCTGCAGGGCCACGCGCAGCGGCTGGTCGCCGGCGTCCAGGTCGGCCACGCGGGTGAAGGTTTCGGT‑ATCGATCACCgaga < 8:147590/149‑1 (MQ=255) aTCACTGTTACCCCACCTTTGGCCGGGTCGCTGCTGTTGTTGCCAACCCACAGCCGATGCTGGTCCGGCTGCAGGGCCACGCGCAGCGGCTGGTCGCCGGCGTCCAGGTCGGCCACGCGGGTGAAGGTTTCGGT‑ATCGATCACCGAGAc > 1:78820/1‑149 (MQ=255) aTCACTGTTACCCCACCTTTGGCCGGGTCGCTGCTGTTGTTGCCAACCCACAGCCGATGCTGGTCCGGCTGCAGGGCCACGCGCAGCGGCTGGTCGCCGGCGTCCAGGTCGGCCACGCGGGTGAAGGTTTCGGT‑ATCGATCACCGAGAc < 2:78820/149‑1 (MQ=255) cTGTTACCCCACCTTTGGCCGGGTCGCTGCTGTTGTTGCCAACCCACAGCCGATGCTGGTCCGGCTGCAGGGCCACGCGCAGCGGCTGGTCGCCGGCGTCCAGGTCGGCCACGCGGGTGAAGGTTTCGGT‑ATCGATCACCGAGACCTTg > 4:287098/1‑149 (MQ=255) tGTTACCCCACCTTTGGCCGGGTCGCTGCTGTTGTTGCCAACCCACAGCCGATGCTGGTCCGGCTGCAGGGCCACGCGCAGCGGCTGGTCGCCGGCGTCCAGGTCGGCCACGCGGGTGAAGGTTTCGGT‑ATCGATCACCGAGACCTTGc > 1:217785/1‑149 (MQ=255) tGTTACCCCACCTTTGGCCGGGTCGCTGCTGTTGTTGCCAACCCACAGCCGATGCTGGTCCGGCTGCAGGGCCACGCGCAGCGGCTGGTCGCCGGCGTCCAGGTCGGCCACGCGGGTGAAGGTTTCGGT‑ATCGATCACCGAGACCTTGc > 6:229226/1‑149 (MQ=255) cccACCTTTGGCCGGGTCGCTGCTGTTGTTGCCAACCCACAGCCGATGCTGGTCCGGCTGCAGGGCCACGCGCAGCGGCTGGTCGCCGGCGTCCAGGTCGGCCACGCGGGTGAAGGTTTCGGT‑ATCGATCACCGAGAc < 1:22694/138‑1 (MQ=255) cccACCTTTGGCCGGGTCGCTGCTGTTGTTGCCAACCCACAGCCGATGCTGGTCCGGCTGCAGGGCCACGCGCAGCGGCTGGTCGCCGGCGTCCAGGTCGGCCACGCGGGTGAAGGTTTCGGT‑ATCGATCACCGAGAc > 2:22694/1‑138 (MQ=255) cccACCTTTGGCCGGGTCGCTGCTGTTGTTGCCAACCCACAGCCGATGCTGGTCCGGCTGCAGGGCCACGCGCAGCGGCTGGTCGCCGGCGTCCAGGTCGGCCACGCGGGTGAAGGTTTCGGT‑ATCGATCACCGAGACCTTGCCCCGCt > 3:118270/1‑149 (MQ=255) cACCTTTGGCCGGGTCGCTGCTGTTGTTGCCAACCCACAGCCGATGCTGGTCCGGCTGCAGGGCCACGCGCAGCGGCTGGTCGCCGGCGTCCAGGTCGGCCACGCGGGTGAAGGTTTCGGT‑ATCGATCACCGAGACCTTGCCCCGCTCg > 1:157660/1‑149 (MQ=255) aCCTTTGGCCGGGTCGCTGCTGTTGTTGCCAACCCACAGCCGATGCTGGTCCGGCTGCAGGGCCACGCGCAGCGGCTGGTCGCCGGCGTCCAGGTCGGCCACGCGGGTGAAGGTTTCGGT‑ATCGATCACCGAGACCTTGCCCCGCTCgg < 7:35363/149‑1 (MQ=255) aCCTTTGGCCGGGTCGCTGCTGTTGTTGCCAACCCACAGCCGATGCTGGTCCGGCTGCAGGGCCACGCGCAGCGGCTGGTCGCCGGCGTCCAGGTCGGCCACGCGGGTGAAGGTTTCGGT‑ATCGATCACCGAGACCTTGCCCCGCTCgg < 5:70189/149‑1 (MQ=255) ccTTTGGCCGGGTCGCTGCTGTTGTTGCCAACCCACAGCCGATGCTGGTCCGGCTGCAGGGCCACGCGCAGCGGCTGGTCGCCGGCGTCCAGGTCGGCCACGCGGGTGAAGGTTTCGGT‑ATCGATCACCGAGACCTTGCCCCGCTCggg < 5:229226/149‑1 (MQ=255) cGGGTCGCTGCTGTTGTTGCCAACCCACAGCCGATGCTGGTCCGGCTGCAGGGCCACGCGCAGCGGCTGGTCGCCGGCGTCCAGGTCGGCCACGCGGGGCAAGGTCTCGGTGATCGAT‑ACCGAAACCttcaccc > 3:81962/1‑129 (MQ=37) cGGGTCGCTGCTGTTGTTGCCAACCCACAGCCGATGCTGGTCCGGCTGCAGGGCCACGCGCAGCGGCTGGTCGCCGGCGTCCAGGTCGGCCACGCGGGGCAAGGTCTCGGTGATCGAT‑ACCGAAACCttcaccc < 4:81962/134‑6 (MQ=37) ctgctgTTGTTGCCAACCCACAGCCGATGCTCGTCCGGCTGCAGGGCCACGCGCAGCGGCTGGTCGCCGGCGTCCAGGTCGGCCACGCGGGTGAAGGTTTCGGT‑ATCGATCACCGAGACCTTGCCCCGCTCGGGTATCGACACGAAAAc > 1:30052/1‑149 (MQ=255) tgttgtTGCCAACCCACAGCCGATGCTGGTCCGGCTGCAGGGCCACGCGCAGCGGCTGGTCGCCGGCGTCCAGGTCGGCCACGCGGGTGAAGGTTTCGGT‑ATCGATCACCGAGACCTTGCCCCGCTCGGGTATCGACACGAAAACCTGc < 2:99614/149‑1 (MQ=255) tgttgtTGCCAACCCACAGCCGATGCTGGTCCGGCTGCAGGGCCACGCGCAGCGGCTGGTCGCCGGCGTCCAGGTCGGCCACGCGGGTGAAGGTTTCGGT‑ATCGATCACCGAGACCTTGCCCCGCTCGGGTATCGACACGAAAACCTGc > 7:128281/1‑149 (MQ=255) ttgttgCCAACCCACAGCCGATGCTGGTCCGGCTGCAGGGCCACGCGCAGCGGCTGGTCGCCGGCGTCCAGGTCGGCCACGCGGGTGAAGGTTTCGGT‑ATCGATCACCGAGACCTTGCCCCGCTCGGGTATCGACACGAAAACCTGc < 8:128281/147‑1 (MQ=255) ccACAGCCGATGCTGGTCCGGCTGCAGGGCCACGCGCAGCGGCTGGTCGCCGGCGTCCAGGTCGGCCACGCGGGTGAAGGTTTCGGT‑ATCGATCACCGAGACCTTGCCCCGCTTGGGTATCGACACGAAAACCTGCTTgtc > 7:112113/1‑141 (MQ=255) ccACAGCCGATGCTGGTCCGGCTGCAGGGCCACGCGCAGCGGCTGGTCGCCGGCGTCCAGGTCGGCCACGCGGGTGAAGGTTTCGGT‑ATCGATCACCGAGACCTTGCCCCGCTTGGGTATCGACACGAAAACCTGCTTgtc < 8:112113/141‑1 (MQ=255) ccACAGCCGATGCTGGTCCGGCTGCAGGGCCACGCGCAGCGGCTGGTCGCCGGCGTCCAGGTCGGCCACGCGGGTGAAGGTTTCGGT‑ATCGATCACCGAGACCTTGCCCCGCTCGGGTATCGACACGAAAACCTg > 3:1755/1‑135 (MQ=255) ccACAGCCGATGCTGGTCCGGCTGCAGGGCCACGCGCAGCGGCTGGTCGCCGGCGTCCAGGTCGGCCACGCGGGTGAAGGTTTCGGT‑ATCGATCACCGAGACCTTGCCCCGCTCGGGTATCGACACGAAAACCTg < 4:1755/135‑1 (MQ=255) ccACAGCCGATGCTGGTCCGGCTGCAGGGCCACGCGCAGCGGCTGGTCGCCGGCGTCCAGGGCGGCCACGCGGGTGAAGGTTTCGGT‑ATCGATCCCCGAGCCCGTGCCCCGCTCGGGTATCGACACGAAAACCTGCTGGTCGTCGCtgg > 6:261583/1‑149 (MQ=255) caGCCGATGCTGGTCCGGCTGCAGGGCCACGCGCCGCGGCTGGTCGCCGGCGTCCAGGTCGGCCCCGCGGGGGAAGGTTTCGGT‑AGCGATCACCGAGACCTTGCCCCGCTCGGGTATCGACACGAAAACCTGCTTGTCGGCGCtggggg < 2:227308/149‑1 (MQ=255) caGCCGATGCTGGGCCGGCTGCAGGGCCACGCGCAGCGGCGGGGCGCCGGCGGCCAGGGCGGCCACGCGGGTGAAGGTTTCGGT‑CTCGCTCACCGAGACCTTGCCCCGCTCGGGTATCGACACGAAACCCTGCTTGTCGTCGCtggggg < 2:222377/149‑1 (MQ=255) cGATGCTGGTCCGGCTGCAGGGCCACGCGCAGCGGCTGGTCGCCGGCGTCCAGGTCGGCCACGCGGGTGAAGGTTTCGGT‑ATCGATCACCGAGACCTTGCCCCGCTCGGGTATCGACACGAAAACCTGCTTGTCGTCGc < 6:196842/139‑1 (MQ=255) cGATGCTGGTCCGGCTGCAGGGCCACGCGCAGCGGCTGGTCGCCGGCGTCCAGGTCGGCCACGCGGGTGAAGGTTTCGGT‑ATCGATCACCGAGACCTTGCCCCGCTCGGGTATCGACACGAAAACCTGCTTGTCGTCGc > 5:196842/1‑139 (MQ=255) gATGCTGGTCCGGCTGCAGGGCCACGCGCAGCGGCTGGTCGCCGGCGTCCAGGTCGGCCACGCGGGTGAAGGTTTCGGT‑ATCGATCACCGAGACCTTGCCCCGCTCGGGTATCGACACGAAAACCTGCTTGTCGTCGCTGGTGgccgcc > 4:181717/1‑149 (MQ=255) aTGCTGGTCCGGCTGCAGGGCCACGCGCAGCGGCTGGTCGCCGGCGTCCAGGTCGGCCACGCGGGTGAAGGTTTCGGT‑ATCGATCACCGAGACCTTGCCCCGCTCGGGTATCGACACGAAAACCTGCTTGTCGTCGCTGGTGgccgcc > 1:288297/1‑148 (MQ=255) cTGGTCCGGCTGCAGGGCCACGCGCAGCGGCTGGTCGCCGGCGTCCAGGTCGGCCACGCGGGTGAAGGTTTCGGT‑ATCGATCACCGAGACCTTGCCCCGCTCGGGTATCGACACGAAAACCTGCTTGTCGTCGCTGGTGGCCGCCCAGt < 2:288297/149‑1 (MQ=255) tGGTCCGGCTGCAGGGCCACGCGCAGCGGCTGGTCGCCGGCGTCCAGGTCGGCCACGCGGGTGAAGGTTTCGGT‑ATCGATCACCGAGACCTTGCCCCGCTCGGGTATCGACACGAAAACCTGCTTGTCGTCGCTGGTGGCCGCCCAGTc > 8:158996/1‑149 (MQ=255) gTCCGGCTGCAGGGCCACGCGCAGCGGCTGGTCGCCGGCGTCCAGGTCGGCCACGCGGGTGAAGGTTTCGGT‑ATCGATCACCGAGACCTTGCCCCGCTCGGGTATCGACACGAAAACCTGCTTGTCGTCGCTGGTGGCCGCCCAGTCCa > 2:344951/1‑149 (MQ=255) gCAGGGCCACGCGCAGCGGCTGGTCGCCGGCGTCCAGGTCGGCCACGCGGGTGAAGGTTTCGGT‑ATCGATCACCGAGACCTTGCCCCGCTCGGGTATCGACACGAAAACCTGCTTGTCGTCGCTGGTGGCCGCCCAGTCAATGGgccgc > 6:55154/1‑149 (MQ=255) aGGGCCACGCGCAGCGGCTGGTCGCCGGCGTCCAGGTCGGCCACGCGGGTGAAGGTTTCGGT‑ATCGATCACCGAGACCTTGCCCCGCTCGGGTATCGACACGAAAACCTGCTTGTCGTCGCTGGTGGCCGCCCAGTCCATGGGCCGccc > 7:144778/1‑149 (MQ=255) gggCCACGCGCAGCGGCTGGTCGCCGGCGTCCAGGTCGGCCACGCGGGTGAAGGTTTCGGT‑ATCGATCACCGAGACCTTGCCCCGCTCGGGTATCGACACGAAAACCTGCTTGTCGTCGCTGGTGGCCGCCCAGTCCATGGGCCGCCCt < 8:144778/149‑1 (MQ=255) ccACGCGCAGCGGCTGGTCGCCGGCGTCCAGGTCGGCCACGCGGGTGAAGGTTTCGGT‑ATCGATCACCGAGACCTTGCCCCGCTCGGGTATCGACACGAAAACCTGCTTGTCGTCGCTGGTGGCCGCCCAGTCCATGGGCCGCCCTgg > 6:290993/1‑148 (MQ=255) gcgcAGCGGCTGGTCGCCGGCGTCCAGGTCGGCCACGCGGGTGAAGGTTTCGGT‑ATCGATCACCGAGACCTTGCCCCGCTCGGGTATCGACACGAAAACCTGCTTGTCGTCGCTGGTGGCCGCCCAGTCCATGGGCCGCCCTGGCAGCt > 8:146047/1‑149 (MQ=255) ccgaccTGGACGCCGGCGACCAGGTCGGCCACGCGGGTGAAGGTTTCGGT‑ATCGATCACCGAGACCTTGCCCCGCTCGGGTATCGACACGAAAACCCGCTTGTCGTCGCTGGTGGCCGCCCAGTCCATGGGCCGCCCTGGCAGCTCGAt > 1:342330/6‑149 (MQ=255) gaccTGGACGCCGGCGACCAGGTCGGCCACGCGGGTGAAGGTTTCGGT‑ATCGATCACCGAGACCTTGCCCCGCTCGGGTATCGACACGAAAACCTGCTTGTCGTCGCTGGTGGCCGCCCAGTCCATGGGCCGCCCTGGCAGCTCGATgc > 7:279012/4‑149 (MQ=255) cGGCTGGTCGCCGGCGTCCAGGTCGGCCACGCGGGTGAAGGTTTCGGT‑ATCGATCACCGAGACCTTGCCCCGCTCGGGTATCGACACGAAAACCTGCTTgtc < 3:55423/102‑1 (MQ=255) cGGCTGGTCGCCGGCGTCCAGGTCGGCCACGCGGGTGAAGGTTTCGGT‑ATCGATCACCGAGACCTTGCCCCGCTCGGGTATCGACACGAAAACCTGCTTgtc > 4:55423/1‑102 (MQ=255) cGGCTGGTCGCCGGCGTCCAGGTCGGCCACGCGGGTGAAGGTTTCGGT‑ATCGATCACCGAGACCTTGCCCCGCTCGGGTATCGACACGAAAACCTGCTTGTCGTCGCTGGTGGCCGCCCAGTCCATGGGCCGCCCTGGCAGCTCGATgc < 2:157660/149‑1 (MQ=255) gTCGCCGGCGTCCAGGTCGGCCACGCGGGTGAAGGTTTCGGT‑ATCGATCACCGAGACCTTGCCCCGCTCGGGTATCGACACGAAAACCTGCTTGTCGTCGCTGGTGGCCGCCCAGTCCATGGGCCGCCCTGGCAGCTCGATGCGCGCCa < 5:290993/149‑1 (MQ=255) gTCGCCGGCGTCCAGGTCGGCCACGCGGGTGAAGGTTTCGGT‑ATCGATCACCGAGACCTTGCCCCGCTCGGGTATCGACACGAAAACCTGCTTGTCGTCGCTGGTGGCCGCCCAGTCCATGGGCCGCCCTGGCAGCTCGATGCGCGCCa > 7:49053/1‑149 (MQ=255) gTCGCCGGCGTCCAGGTCGGCCACGCGGGTGAAGGTTTCGGT‑ATCGATCACCGAGACCTTGCCCCGCTCGGGTATCGACACGAAAACCTGCTTGTCGTCGCTGGTGGCCGCCCAGTCCATGGGCCGCCCTGGCAGCTCGATGCGCGCCa < 3:287098/149‑1 (MQ=255) gCCGGCGTCCAGGTCGGCCACGCGGGTGAAGGTTTCGGT‑ATCGATCACCGAGACCTTGCCCCGCTCGGGTATCGACACGAAAACCTGCTTGTCGTCGCTGGTGGCCGCCCAGTCCATGGGCCGCCCTGGCAGCTCGATGCGCGCCATgg < 7:146047/149‑1 (MQ=255) gCGTCCAGGTCGGCCACGCGGGTGAAGGTTTCGGT‑ATCGATCACCGAGACCTTGCCCCGCTCGGGTATCGACACGAAAACCTGCTTGTCGTCGCTGGTGGCCGCCCAGTCCATGGGCCGCCCTGGCAGCTCGATGCGCGCCATGGTGCt < 7:158996/149‑1 (MQ=255) gCGTCCAGGTCGGCAAGGGGGGTGATGGTTTCGGA‑TCCGACCACCGTGACCTTGCCCGGCTC‑GGTATCGACACGAAAACCTGCTTGTCGTCGCTGGTGGCCGCCCAGTCCATGGGCCGCCCTGGCAGCTCGATGCGCGCCATGGTGCTg < 2:217785/149‑1 (MQ=255) cGTCCAGTGCGGCCACGCGGGTGAAGGTTTCGGT‑ATCGATCACCGAGACCTTGCCCCGCTCTGGTATCGACACGAAAACCTGCTGGTCGTCGCTGGTGGCCGCCCAGGCCATGGGCCGCCCGGGCAGCTCGATGCGCGCCATGGTGCTg < 5:261583/149‑1 (MQ=255) gaccAGGTCGGCCACGCGGGTGAAGGTTTCGGT‑ATCGATCACCGAGACCTTGCCCCGCTCGGGTATCGACACGAAAACCCGCTTGTCGTCGCTGGTGGCCGCCCAGTCCATGGGCCGCCCTGGCAGCTCGATGCGCGCCATGGTGCTgg < 2:342330/147‑1 (MQ=255) cGGCCACGCGGGTGAAGGTTTCGGT‑ATCGATCACCGAGACCTTGCCCCGCTCGGGTATCGACACGAAAACCTGCTTGTCGTCGCTGGTGGCCGCCCAGTCCATGGGCCGCCCTGGCAGCTCGATGCGCGCCATGGTGCTGGTCACGccc < 8:49053/149‑1 (MQ=255) ccgagcgGGGCAAGGTCTCGGTGATCGAT‑ACCGAAACCTTCACCCGCTCGGGTATCGACACGAAAACCTGCTTGTCGTCGCTGGTGGCCGCCCAGTCCATGGGCCGCCCTGGCAGCTCGATGCGCGCCATGGTGCTGGTCACGccccc > 4:111464/5‑148 (MQ=37) ccACGCGGGTGAAGGTTTCGGT‑ATCGATCACCGAGACCTTGCCCCGCTCGGGTATCGACACGAAAACCTGCTTGTCGTCGCTGGTGGCCGCCCAGTCCATGGGCCGCCCTGGCAGCTCGATGCGCGCCATGGTGCTGGTCACGccccc > 5:228361/1‑148 (MQ=255) ggTGAAGGTTTCGGT‑ATCGATCACCGAGACCTTGCCCCGCTCGGGTATCGACACGAAAACCTGCTTGTCGTCGCTGGTGGCCGCCCAGTcc < 4:332226/91‑1 (MQ=255) ggTGAAGGTTTCGGT‑ATCGATCACCGAGACCTTGCCCCGCTCGGGTATCGACACGAAAACCTGCTTGTCGTCGCTGGTGGCCGCCCAGTcc > 3:332226/1‑91 (MQ=255) ggTGAAGGTTTCGGT‑ATCGATCACCGAGACCTTGCCCCGCTCGGGTATCGACACGAAAACCTGCTTGTCGTCGCTGGTGGCCGCCCAGTCCATGGGCCGCCCTGGCAGCTCGATGCGCGCCATGGTGCTGGTCACGCCCCCCACCGaca > 6:255340/1‑149 (MQ=255) aaGGTTTCGGT‑ATCGATCACCGAGACCTTGCCCCGCTCGGGTATCGACACGAAAACCTGCTTGTCGGCGCTGGTGGCCGCCCAGTCCATGGGCCGCCCTGGCAGCTCGATGCGCGCCATGGTGCTGGTCACGCCCCCCACCGACACCGt < 1:344951/149‑1 (MQ=255) aGGTTTCGGT‑ATCGATCACCGAGACCTTGCCCCGCTCGGGTATCGACACGAAAACCTGCTTGTCGTCGCTGGTGGCCGCCCAGTCCATGGGCCGCCCTGGCAGCTCGATGCGCGCCATGGTGCTGGTCACGCCCCCCACCGACACCGTc < 4:118270/149‑1 (MQ=255) gTTTCGGT‑ATCGATCACCGAGACCTTGCCCCGCTCGGGTATCGACACGAAAACCTGCTTGTCGTCGCTGGTGGCCGCCCAGTCCATGGGCCGCCCTGGCAGCTCGATGGGCGCCATGGTGCTGGTCACGCCCCCCACCGACACCGTCgg > 4:263166/1‑149 (MQ=255) gTTTCGGT‑ATCGATCACCGAGACCTTGCCCCGCTCGGGTATCGACACGAAAACCTGCTTGTCGTCGCTGGTGGCCGCCCAGTCCATGGGCCGCCCTGGCAGCTCGATGCGCGCCATGGTGCTGGTCACGCCCCCCACCGa < 3:146324/140‑1 (MQ=255) gTTTCGGT‑ATCGATCACCGAGACCTTGCCCCGCTCGGGTATCGACACGAAAACCTGCTTGTCGTCGCTGGTGGCCGCCCAGTCCATGGGCCGCCCTGGCAGCTCGATGCGCGCCATGGTGCTGGTCACGCCCCCCACCGa > 4:146324/1‑140 (MQ=255) cGGT‑ATCGATCACCGAGACCTTGCCCCGCTCGGGTATCGACACGAAAACCTGCTTGTGGTCGCTGGTGGCCGCCCAGTCCATGGGCCGCCCTGGCAGCTCGATGCGCGCCATGGTGCTGGTCACGCCCCCCACCGACACCGTCGGGTc < 2:30052/148‑1 (MQ=255) ggtgaTCGAT‑ACCGAAACCTTCACCCGCTCGGGTATCGACACGAAAACCTGCTTGTCGTCGCTGGTGGCCGCCCAGTCCATGGGCCGCCCTGGCAGCTCGATGCGCGCCATGGTGCTGGTCACGCCCCCCACCGACACCGTCGGGt < 3:111464/142‑1 (MQ=255) tCGATCACCGAGACCTTGCCCCGCTCGGGTATCGACACGAAAACCTGCTTGTCGTCGCTGGTGGCCGCCCAGTCCATGGGCCGCCCTGGCAGCTCGATGCGCGCCATGGTGCTGGTCACGCCCCCCACCGACACCGTCGGGTCGATCAc > 3:285911/1‑149 (MQ=255) tCACCGAGACCTTGCCCCGCTCGGGTATCGACACGAAAACCTGCTTGTCGTCGCTGGTGGCCGCCCAGTCCATGGGCCGCCCTGGCAGCTCGATGCGCGCCATGGTGCTGGTCACGCCCCCCACCGACACCGTCGGGTCGATCACTGTc > 2:272851/1‑149 (MQ=255) | GATCACTGTTACCCCACCTTTGGCCGGGTCGCTGCTGTTGTTGCCAACCCACAGCCGATGCTGGTCCGGCTGCAGGGCCACGCGCAGCGGCTGGTCGCCGGCGTCCAGGTCGGCCACGCGGGTGAAGGTTTCGGT‑ATCGATCACCGAGACCTTGCCCCGCTCGGGTATCGACACGAAAACCTGCTTGTCGTCGCTGGTGGCCGCCCAGTCCATGGGCCGCCCTGGCAGCTCGATGCGCGCCATGGTGCTGGTCACGCCCCCCACCGACACCGTCGGGTCGATCACTGTC > NC_002947/3953797‑3954085 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |