| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 503,825 | Δ1 bp | 10.5% | intergenic (+28/‑123) | PP_0414 → / → rpe | polyamine ABC transporter permease/ribulose‑5‑phosphate 3‑epimerase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 503,825 | 0 | G | . | 10.5% | 285.5 / 28.2 | 95 | intergenic (+28/‑123) | PP_0414/rpe | polyamine ABC transporter permease/ribulose‑5‑phosphate 3‑epimerase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (41/44); new base . (4/6); total (45/50) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.44e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.15e-01 | |||||||||||
GAGCCCGACCATTGCCGCGGCGGCGACCTTGCTGATTGCGTTCTCGGTGTTGTTGCTGCTGACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGGCCTCTTCGC‑GGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCAGCCTTCATCGCTTTCCCTGAGTTACAATGCGCGCCACCGTGAATTTGCCAACAGGTGCGCCATGCAGCCCTACGCTATTGCCCCCTC > NC_002947/503680‑503973 | gAGCCCGACCATTGCCGCGGCGGCGACCTTGCTGATTGCGTTCTCGGTGTTGTTGCTGCTGACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGGCCTCTTCGC‑gg > 8:199750/1‑149 (MQ=255) aGCCCGACGTTTGCCGCGGCGGCGACCTTGCTGATTGCGTTCTCGGGGTTGTGGCTGCTGACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGGCCTCTTCGC‑GGc < 5:76988/149‑1 (MQ=255) aGCCCGACCATTGCCGCGGCGGCGACCTTGCTGATTGCGTTCTCGGTGTTGTTGCTGCTGACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGGCCTCTTCGC‑GGc > 4:98683/1‑149 (MQ=255) ccGACCATTGCCGCGGCGGCGACCTTGCTGATTGCGTTCTCGGTGTTGTTGCTGCTGACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGGCCTCTTCGC‑GGCTa > 7:8383/1‑148 (MQ=255) gACCATTGCCGCGGCGGCGACCTTGCTGATTGCGTTCTCGGTGTTGTTGCTGCTGACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGGCCTCTTCGC‑GGCTAAAg > 7:238087/1‑149 (MQ=255) aTTGCCGCGGCGGCGACCTTGCTGATTGCGTTCTCGGTGTTGTTGCTGCTGACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGGCCTCTTCGC‑GGCTAAAGCCg > 1:189276/1‑148 (MQ=255) gCCGCGGCGGCGACCTTGCTGATTGCGTTCTCGGTGTTGTTGCTGCTGACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGGCCTCTTCGC‑GGCTAAAGCCG‑Gaa < 1:12455/148‑1 (MQ=255) gCCGCGGCGGCGACCTTGCTGATTGCGTTCTCGGTGTTGTTGCTGCTGACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGGCCTCTTCGC‑GGCTAAAGCCG‑Gaa < 1:335861/148‑1 (MQ=255) ccGCGGCGGCGACCTTGCTGATTGCGTTCTCGGTGTTGTTGCTGCTGACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTGCCGGCCTCTTC‑C‑GGCTTTAGCCGCGAaga < 7:285886/149‑1 (MQ=39) cgcgGCGGCGACCTTGCTGATTGCGTTCTCGGTGTTGTTGCTGCGGACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTGCCGGCCTCTTC‑C‑GGCTTTAGCCGCGAagag < 5:242482/149‑1 (MQ=38) cggcggcgACCTTGCTGATTGCGTTCTCGGTGTTGTTGCTGCTGACCCTTGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTGCCGGCCTCTTC‑C‑GGCTTTAGCCGCGAagag < 5:139090/147‑1 (MQ=38) cggcggcgACCTTGCTGATTGCGTTCTCGGTGTTGTTGCTGCTGACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTGCCGGCCTCTTC‑C‑GGCTTTAGCCGCGAagag > 6:139090/1‑147 (MQ=39) cggcggcgACCTTGCTGATTGCGTTCTCGGTGTTGTTGCTGCTGACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTGCCGGCCTCTTC‑C‑GGCTTTAGCCGCGAAGAGGc < 7:54827/149‑1 (MQ=38) cggcggcgACCTTGCTGATTGCGTTCTCGGTGTTGTTGCTGCTGACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGGCCTCTTCGC‑GGCTAAAGCCG‑GAAGAGGc < 8:238087/149‑1 (MQ=255) ggcggcgACCTTGCTGATTGCGTTCTCGGTGTTGTTGCTGCTGACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTGCCGGCCTCTTC‑C‑GGCTTTAGCCGCGAAGAGGcc < 4:223794/149‑1 (MQ=38) gcggcgACCTTGCTGATTGCGTTCTCGGTGTTGTTGCTGCTGACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGGCCTCTTCGC‑GGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCg < 7:287646/149‑1 (MQ=255) gACCTTGCTGATTGCGTTCTCGGTGTTGTTGCTGCTGACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGGCCTCTTCGC‑GGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGcaca < 7:199750/149‑1 (MQ=255) cTTGCTGATTGCGTTCTCGGTGTTGTTGCTGCTGACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGGCCTCTTCGC‑GGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGt > 5:129630/1‑149 (MQ=255) ttGCTGATTGCGTTCTCGGTGTTGTTGCTGCTGACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGGCCTCTTCGC‑GGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGtt > 3:247203/1‑149 (MQ=255) tGATTGCGTTCTCGGTGTTGTTGCTGCTGACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGGCCTCTTCGC‑GGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGt > 1:242508/1‑149 (MQ=255) gATTGCGTTCTCGGTGTTGTTGCTGCTGACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGGCCTCTTCGC‑GGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGtt > 6:264100/1‑149 (MQ=255) gATTGCGTTCTCGGTGTTGTTGCTGCTGACCCTGGAGTGGTTGCGT‑GGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGGCCTCTTCGC‑GGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGTTg < 5:64487/149‑1 (MQ=255) ttGCGTTCTCGGTGTTGTTGCTGCTGACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGGCCTCTTCGC‑GGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGTTgg > 7:185280/1‑149 (MQ=255) cGTTCTCGGTGTTGTTGCTGCTGACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGGCCTCTTCGC‑GGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGTTGGTc < 8:8383/148‑1 (MQ=255) cGTTCTCGGTGTTGTTGCTGCTGACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGGCCTCTTCGC‑GGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGTTGGTc < 2:74971/148‑1 (MQ=255) cGTTCTCGGTGTTGTTGCTGCTGACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGGCCTCTTCGC‑GGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGTTGGTc < 2:189276/148‑1 (MQ=255) gTTCTCGGTGTTGTTGCTGCTGACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGGCCTCTTCGC‑GGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGt < 3:85307/142‑1 (MQ=255) gTTCTCGGTGTTGTTGCTGCTGACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGGCCTCTTCGC‑GGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGt > 4:85307/1‑142 (MQ=255) tctcGGTGTTGTTGCTGCTGACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACCGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGGCCTCTTCGC‑GGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGTTGGTCGaca > 6:81452/1‑149 (MQ=255) ctcGGTGTTGTTGCTGCTGACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGGCCTCTTCGC‑GGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGTTGGTCGaca < 3:131605/148‑1 (MQ=255) tcGGTGTTGTTGCTGCTGACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGACAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGGCCTCTTCGC‑GGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGTTGGTCGacac > 6:1196/1‑148 (MQ=255) gtgtTGTTGCTGCTGACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGGCCTCTTCGC‑GGCTAAAGCCG‑Gaa > 3:264178/1‑115 (MQ=255) gtgtTGTTGCTGCTGACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGGCCTCTTCGC‑GGCTAAAGCCG‑Gaa < 4:264178/115‑1 (MQ=255) gtgtTGTTGCTGCTGACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGGCCTCTTCGC‑GGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGTTGGTCGACACCAAt > 5:47993/1‑149 (MQ=255) gtgtTGTTGCTGCTGACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGGCCTCTTCGC‑GGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGTTGGTCGACACCAAt > 3:83541/1‑149 (MQ=255) gtgtTGTTGCTGCTGACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGGCCTCTTCGC‑GGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGTTGGTCGACACCAAt > 6:10961/1‑149 (MQ=255) gttgttGCTTCTGACCGTGGAGTGGTTGGGTGGGCGTAGCGATAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGTTGGCTTGCCTGTACCGGCCTCTTCGC‑GGCTAAAGCCG‑TAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGTTGGTCGACACCAAtt < 2:242508/148‑1 (MQ=255) ttgttgCTGCTGACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGGCCTCTTCGC‑GGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGa < 4:223088/149‑1 (MQ=255) gttgCTGCTGACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGGCCTCTTCGC‑GGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGAt < 4:83541/148‑1 (MQ=255) ttgCTGCTGACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGGCCTCTTCGC‑GGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATa < 7:48544/148‑1 (MQ=255) ttgCTGCTGACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGGCCTCTTCGC‑GGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATAc < 3:25648/149‑1 (MQ=255) ttgCTGCTGACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGGCCTCTTCGC‑GGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATAc < 5:10961/149‑1 (MQ=255) tgctgcTGACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGGCCTCTTCGC‑GGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATAc < 2:85916/148‑1 (MQ=255) gctgctGACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGGCCTCTTCGC‑GGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATAcc > 5:163396/1‑148 (MQ=255) gctgACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGGCCTCTTCGC‑GGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGa < 5:90665/141‑1 (MQ=255) gctgACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGGCCTCTTCGC‑GGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGa > 6:90665/1‑141 (MQ=255) ggAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGGCCTCTTCGC‑GGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGAt > 2:229977/1‑133 (MQ=255) ggAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGGCCTCTTCGC‑GGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGAt < 1:229977/133‑1 (MQ=255) gAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGGCCTCTTCGC‑GGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCAGCCTTCATc < 6:47993/149‑1 (MQ=255) gTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGGCCTCTTCGC‑GGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCAGCCTTCATCGCtt < 1:304560/148‑1 (MQ=255) cGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGGCCTCTTCGC‑GGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCAGCCTTCATCGCTTTccc < 6:163396/148‑1 (MQ=255) gTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGGCCTCTTCGC‑GGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGAt < 6:188887/122‑1 (MQ=255) gTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGGCCTCTTCGC‑GGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGAt > 5:188887/1‑122 (MQ=255) gTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGGCCTCTTCGC‑GGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCAGCCTTCATCGCTTTCCCt > 6:87032/1‑148 (MQ=255) tGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGGCCTCTTCGC‑GGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCAGCCTTCATCGCTTTCCCTGa < 4:247203/149‑1 (MQ=255) tAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCTGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGGCCTCTTCGC‑GGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCAGCCTTCATCGCTTTCCCTGAGTTACa < 8:272257/149‑1 (MQ=255) gCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGGCCTCTTCGC‑GGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCAGCCTTCATCGCTTTCCCTGAGTTACAAt < 6:129630/149‑1 (MQ=255) tGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGGCCTCTTCGC‑GGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCAGCCTTCATCGCTTTCCCTGAGTTACAATGCGCGCCAc > 1:112188/1‑149 (MQ=255) gAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGGCCTCTTCGC‑GGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCAGCCTTCATCGCTTTCCCTGAGTTACAATGCGCGCCAcc > 3:223863/1‑149 (MQ=255) aGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGGCCTCTTCGC‑GGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCAGCCTTCATCGCTTTCCCTGAGTTACAATGCGCGCCAc < 5:264100/147‑1 (MQ=255) tCAACAGCCGGTTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGTTGGTCCACACCAATTGATACCAATCAGCCTTCATCGCTTTCCCTGAGTTACAATGCGCGCCACCGTGaa > 1:250052/1‑149 (MQ=255) tCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGGCCTCTTCGC‑GGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCg < 3:115628/78‑1 (MQ=255) tCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGGCCTCTTCGC‑GGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCg > 4:115628/1‑78 (MQ=255) tCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGGCCTCTTCGC‑GGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCAGCCTTCATCGCTTTCCCTGGGTTACAATgc < 3:228099/135‑1 (MQ=255) tCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGGCCTCTTCGC‑GGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCAGCCTTCATCGCTTTCCCTGGGTTACAATgc > 4:228099/1‑135 (MQ=255) tCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGGCCTCTTCGC‑GGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCAGCCTTCATCGCTTTCCCTGAGTTACAATGCGCGCCACCGTGAAt > 3:255874/1‑149 (MQ=255) aaCAGCGGGCTTGATGATGGATTGCCGGTACCGGCCTCTTCGC‑GGCTAAAGCCG‑GAAGATGCCGGCACAGGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCAGCCTTCATCGCTTTCCCTGAGTTACAATGCGCGCCACCGTGAAttt < 4:255874/149‑1 (MQ=255) aaCAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGGCCTCTTCGC‑GGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCAGCCTTCATCGCTTTCCCTGAGTTACAATGCGCGCCACCGTGAAttt < 5:1196/149‑1 (MQ=255) aaCAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGGCCTCTTCGC‑GGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCAGCCTTCATCGCTTTCCCTGAGTTACAATGCGCGCCACCGTGAAt < 3:98683/147‑1 (MQ=255) aaCAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGGCCTCTTCGC‑GGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCAGCCTTCATCGCTTTCCCAGAGTTACAATtcgc > 4:338670/1‑135 (MQ=255) cAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGGCCTCTTCGC‑GGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCAGCCTTCATCGCTTTCCCTGAGTTACAATGCGCGCCACCGTGAATTTGc < 2:112188/149‑1 (MQ=255) ccGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGGCCTCTTCGC‑GGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCAGCCTTCATCGCTTTCCCTGAGTTACAATGCGCGCCACCGTGAATTTGCCaa > 7:182620/1‑149 (MQ=255) ggCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGGCCTCTTCGC‑GGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCAGCCTTCATCGCTTTcc < 3:168215/112‑1 (MQ=255) ggCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGGCCTCTTCGC‑GGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCAGCCTTCATCGCTTTcc > 4:168215/1‑112 (MQ=255) gtttGATGATGGCTTGCCTGTACCGGCCTCTTCGC‑GGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCAGCCTTCATCGCTTTCCCTGAGTTACAATGCGCGCCACCGTGAATTTGCCAACAg < 2:250052/147‑1 (MQ=255) tgatgGCTTGCCTGTACCGGCCTCTTCGC‑GGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCAGCCTTCATCGCTTTCCCTGAGTTACAATGCGCGCCACCGTGAATTTGCCAACAGGTgcgc > 7:239131/1‑149 (MQ=255) tgatgGCTTGCCTGTACCGGCCTCTTCGC‑GGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGCGTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCAGCCTTCATCGCTTTCCCTGAGTTACAATGCGCGCCACCGTGAATTTGCCAACAGGTgcgc > 4:100143/1‑149 (MQ=255) tgatgGCTTGCCTGTACCGGCCCCTTCGC‑GGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCAGCCTTCATCGCTTTCCCTGAGTTACAATGCGCGCCACCGTGAATTTGCCAACAGGTgcgc > 8:113550/1‑149 (MQ=255) atgGCTTGCCTGTACCGGCCTCTTCGC‑GGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCAGCCTTCATCGCTTTCCCTGAGTTACAATGCGCGCCACCGTGAATTTGCCAACAGGTGCGCCa > 7:234384/1‑149 (MQ=255) gCTTGCCTGTACCGGCCTCTTCGC‑GGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCAGCCTTCATCGCTTTCCCTGAGTTACAATGCGCGCCACCGTGAATTTGCCAACAGGTGCGCCATGc < 8:182620/149‑1 (MQ=255) cTTGCCTGTACCGGCCTCTTCGC‑GCCTTAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCCCAGGTTTGGTTGGTGGACACCAATTGATACGAATCAGCGATCATCGCATTCCCTGAGTTAAAAAGGCTGGCACCGTGAATTTGCAAACAGGTGCGCCAtt > 8:209596/1‑146 (MQ=255) ttGCCTGTACCGGCCTCTTCGC‑GGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCAGCCTTCATCGCTTTCCCTGAGTTACAATGCGCGCCACCGTGAATTTGCCAACAGGTgcg < 3:302843/141‑1 (MQ=255) ttGCCTGTACCGGCCTCTTCGC‑GGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCAGCCTTCATCGCTTTCCCTGAGTTACAATGCGCGCCACCGTGAATTTGCCAACAGGTgcg > 4:302843/1‑141 (MQ=255) ttGCCTGTACCGGCCTCTTCGC‑GGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCAGCCTTCATCGCTTTCCCTGAGTTACAATGCGCGCCACCGTGAATTTGCCAACAGGTGCGCCATGCAg > 8:8348/1‑149 (MQ=255) ccTGTACCGGCCTCTTCGC‑GGCTAAAGCAG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCAGCCTTCATCGCTTTCCCTGAGTTACAATGCGCGCCACCGTGAATTTGCCAACAGGTGCGCCATGCAGccc > 1:19871/1‑149 (MQ=255) cTGTGCCGGCCTCTTC‑C‑GGCTTTAGCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCAGCCTTCATCGCTTTCCCTGAGTTACAATGCGCGCCACCGTGAATTTGCCAACAg > 4:132768/1‑132 (MQ=37) cTGTGCCGGCCTCTTC‑C‑GGCTTTAGCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCAGCCTTCATCGCTTTCCCTGAGTTACAATGCGCGCCACCGTGAATTTGCCAACAg < 3:132768/132‑1 (MQ=37) cTGTACCGGCCTCTTCGC‑GGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCAGCCTTCATCGCTTTCCCTGAGTTACAATGCGCGCCAcc > 3:121356/1‑116 (MQ=255) cTGTACCGGCCTCTTCGC‑GGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCAGCCTTCATCGCTTTCCCTGAGTTACAATGCGCGCCAcc < 4:121356/116‑1 (MQ=255) tACCGGCCTCTTCGC‑GGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCAGCCTTCATCGCTTTCCCTGAGTTACAATGCGCGCCACCGTGAATTTGCCAACAGGTGCGCCATGCAGCCCTACg < 8:239131/149‑1 (MQ=255) cGGCCTCTTCGC‑GGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCAGCCTTCATCGCTTTCCCTGAGTTACAATGCGCGCCACCGTGAATTTGCCAACAGGTGCGCCAt < 2:221655/135‑1 (MQ=255) cGGCCTCTTCGC‑GGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCAGCCTTCATCGCTTTCCCTGAGTTACAATGCGCGCCACCGTGAATTTGCCAACAGGTGCGCCATGCAGCCCTACGCTa > 1:345856/1‑149 (MQ=255) gCCTCTTC‑C‑GGCTTTAGCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCAGCCTTCATCGCTTTCCCTGAGTTACAATGCGCGCCACCGTGAATTTGCCAACAGGTGCGCCATGCAGCCCTACGCTAtt > 5:136100/1‑149 (MQ=38) ccTCTTC‑C‑GGCTTTAGCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCAGCCTTCATCGCTTTCCCTGAGTTACAATGCGCGCCACCGTGAATTTGCCAACAGGTGCGCCATGCAGCCCTACGCTATTg > 4:249799/1‑149 (MQ=39) ctattCGC‑GGATAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGATGGTCGACACCAATTGATACCAATCACCCTTCATCGCTTACCCTGAGTTACAATGCGTGCCACCGTGAATTTGCCAACAGGTGCGCCATGCAGCCCTACGCTATTGc < 7:209596/146‑1 (MQ=255) cgc‑gGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCTTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCAGCCTTCATCGCTTTCCCTGAGTTACAATGCGCGCCACCGTGAATTTGCCAACAGGTGCGCCATGCAGCCCTACGCTATTGccccc < 8:185280/148‑1 (MQ=255) cgc‑gGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCAGCCTTCATCGCTTTCCCTGAGTTACAATGCGCGCCACCGTGAATTTGCCAACAGGTGCGCCATGCAGcc < 1:27099/132‑1 (MQ=255) cgc‑gGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCAGCCTTCATCGCTTTCCCTGAGTTACAATGCGCGCCACCGTGAATTTGCCAACAGGTGCGCCATGCAGcc > 2:27099/1‑132 (MQ=255) cgc‑gGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCAGCCTTCATCGCTTTCCCTGAGTTACAATGCGCGCCACCGTGAATTTGCCAACAGGTGCGCCATGCAGCCCTACGCTATTGccccc < 7:113550/148‑1 (MQ=255) gc‑gGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCAGCCTTCATCGCTTTCCCTGAGTTACAATGCGCGCCACCGTGAATTTGCCAACAGGTGCGCCATGCAGCCCTACGCTATTGCCCCCTc < 4:223863/149‑1 (MQ=255) | GAGCCCGACCATTGCCGCGGCGGCGACCTTGCTGATTGCGTTCTCGGTGTTGTTGCTGCTGACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTGTACCGGCCTCTTCGC‑GGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCAGCCTTCATCGCTTTCCCTGAGTTACAATGCGCGCCACCGTGAATTTGCCAACAGGTGCGCCATGCAGCCCTACGCTATTGCCCCCTC > NC_002947/503680‑503973 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |