| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,160,521:1 | +C | 6.9% | coding (259/816 nt) | pabC → | 4‑amino‑4‑deoxychorismate lyase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,160,521 | 1 | . | C | 6.9% | 226.5 / 9.6 | 58 | coding (259/816 nt) | pabC | 4‑amino‑4‑deoxychorismate lyase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (23/31); new base C (2/2); total (25/33) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.37e-01 | |||||||||||
CTTGCTGGACGGCCACCTCGCACGCCTGGCACTGGGCTGCCAGCGCCTGGCGATCAACGCCGATCTGGCGCTGGTGCGCGACGAGCTGCTGCGCTACGCCAGCCAGCTGGGTGAGGGTGTCGTCAAACTCATCCTTACCCGTGGCG‑ATAGCCAGCGTGGCTATGCGCCAGCTGTCGATGCAGCGCCGCGGCGTATCCTGCAAGGCAGCCCATTACCCC‑GTTATCCTGTCGAGCATGCTGAGCATGGCGTGCGTTTGTTCCCTTGCCATACCCGGCTTGGGGAACAACCACTGCT > NC_002947/2160376‑2160669 | cTTGCTGGACGGCCACCTCGCACGCCTGGCACTGGGCTGCCAGCGCCTGGCGATCAACGCCGATCTGGCGCTGGTGCGCGACGAGCTGCTGCGCTACGCCAGCCAGCTGGGTGAGGGTGTCGTCAAACTCATCCTTACCCGTGGCG‑a > 3:120198/1‑147 (MQ=255)cTTGCTGGACGGCAACCTCGCACGCCTGGCACTGGGCTGCCAGCGCCTGGCGATCAACGCCGATCTGGCGCTGGTGCGCGACGAGCTGCTGCGCTACGCCAGCCAGCTGGGTGAGGGTGTCGTCAAACTCATCCTTACCCGTGGCG‑a > 8:5229/1‑147 (MQ=255)aagctgggACGGCCACCTCGCACGCCTGGCACTGGGCTGCCAGCGCCTGGCGATCAACGCCGATCTGGCGCTGGTGCGCGACGAGCTGCTGCGCTACGCCAGCCAGCTGGGTGAGGGTGTCGTCAAACTCATCCTTACCCGTGGCG‑a > 8:39288/7‑147 (MQ=255)aagctgggACGGCCACCTCGCACGCCTGGCACTGGGCTGCCAGCGCCTGGCGATCAACGCCGATCTGGCGCTGGTGCGCGACGAGCTGCTGCGCTACGCCAGCCAGCTGGGTGAGGGTGTCGTCAAACTCATCCTTACCCGTGGCG‑ATa < 7:39288/143‑1 (MQ=255) gCTGGACGGCCACCTCGCACGCCTGGCACTGGGCTGCCAGCGCCTGGCGATCAACGCCGATCTGGCGCTGGTGCGCGACGAGCTGCTGCGCTACGCCAGCCAGCTGGGTGAGGGTGTCGTCAAACTCATCCTTACCCGTGGCG‑ATAg < 4:220603/147‑1 (MQ=255) gCTGGACGGCCACCTCGCACGCCTGGCACTGGGCTGCCAGCGCCTGGCGATCAACGCCGATCTGGCGCTGGTGCGCGACGAGCTGCTGCGCTACGCCAGCCAGCTGGGTGAGGGTGTCGTCAAACTCATCCTTACCCGTGGCG‑ATAg < 2:208077/147‑1 (MQ=255) gCTGGACGGCCACCTCGCACGCCTGGCACTGGGCTGCCAGCGCCTGGCGATCAACGCCGATCTGGCGCTGGTGCGCGACGAGCTGCTGCGCTACGCCAGCCAGCTGGGTGAGGGTGTCGTCAAACTCATCCTTACCCGTGGCG‑ATAGc < 4:143041/148‑1 (MQ=255) ggACGGCCACCTCGCACGCCTGGCACTGGGCTGCCAGCGCCTGGCGATCAACGCCGATCTGGCGCTGGTGCGCGACGAGCTGCTGCGCTACGCCAGCCAGCTGGGTGAGGGTGTCGTCAAACTCATCCTTACCCGTGGCG‑ATAGCCAGc > 2:242284/1‑149 (MQ=255) ggCCACCTCGCACGCCTGGCACTGGGCTGCCAGCGCCTGGCGATCAACGCCGATCTGGCGCTGGTGCGCGACGAGCTGCTGCGCTACGCCAGCCAGCTGGGTGAGGGTGTCGTCAAACTCATCCTTACCCGTGGCG‑ATAGCCAGCGTgg > 8:322794/1‑149 (MQ=255) ccACCTCGCACGCCTGGCACTGGGCTGCCAGCGCCTGGCGATCAACGCCGATCTGGCGCTGGTGCGCGACGAGCTGCTGCGCTACGCCAGCCAGCTGGGTGAGGGTGTCGTCAAACTCATCCTTACCCGTGGCG‑ATAGCCAGCGTGGc > 1:6275/1‑148 (MQ=255) cACCTCGCACGCCTGGCACTGGGCTGCCAGCGCCTGGCGATCAACGCCGATCTGGCGCTGGTGCGCGACGAGCTGCTGCGCTACGCCAGCCAGCTGGGTGAGGGTGTCGTCAAACTCATCCTTACCCGTGGCGCATAGCCacgctggc > 1:162171/1‑141 (MQ=255) aCCTCGCACGCCTGGCACTGGGCTGCCAGCGCCTGGCGATCAACGCCGATCTGGCGCTGGTGCGCGACGAGCTGCTGCGCTACGCCAGCCAGCTGGGTGAGGGTGTCGTCAAACTCATCCTTACCCGTGGCG‑ATAGCCAGCGTGGCTAt > 6:170007/1‑149 (MQ=255) cTCGCACGCCTGGCACTGGGCTGCCAGTGCCTGGCGATCAACGCCGATCTGGCGCTGGTGCGCGACGAGCTGCTGCGGTACGCCAGCCAGCTGGGTGAGGGTGTCGTCAAACTCATCCTTACCCGTGGCGCATAGCCACGCTGGCTAtc > 1:109206/1‑148 (MQ=255) tCGCACGCCTGGCACTGGGCTGCCAGCGCCTGGCGATCAACGCCGATCTGGCGCTGGTGCGCGACGAGCTGCTGCGCTACGCCAGCCAGCTGGGTGAGGGTGTCGTCAAACTCATCCTTACCCGTGGCG‑ATAGCCAGCGTGGCTATgcg > 3:241516/1‑149 (MQ=255) tCGCACGCCTGGCACTGGGCTGCCAGCCCCTGGCGATCAACCCCGATCTGGCGCTGGTGCGCGACGAGCTGCTGCCCTACGCCAGCCAGCTGGGTGAGGGTGTCGTCAAACTCATCCTTACCCGAGGCG‑AAAGCCAGCGTGGCTATgcg > 2:300371/1‑149 (MQ=255) cACGCCTGGCACTGGGCTGCCAGTGCCTGGCGATCAACGCCGATCTGGCGCTGGTGCGCGACGAGCTGCTGCGCTACGCCAGCCAGCTGGGTGAGGGTGTCGTCAAACTCATCCTTACCCGTGGCGCATAGCCACGCTGGCTAT‑CGCCa < 2:109206/149‑1 (MQ=255) cACGCCTGGCACTGGGCTGCCAGCGCCTGGCGATCAACGCCGATCTGGCGCTGGTGCGCGACGAGCTGCTGCGCTACGCCAGCCAGCTGGGTGAGGGTGTCGTCAAACTCATCCTTACCCGTGGCGCATAGCCACGCTGGCTAT‑CGCCa < 2:162171/149‑1 (MQ=255) gCCTGGCACTGGGCTGCCAGCGCCTGGCGATCATCGCCGATGTGGCGCTGGTGCGCGACGAGCTGCTGCGGTACGCCTGCCAGCTGGGTGAGGGTGTCGTCAAACTCATCCTTACCCGTGGCG‑ATAGCCAGCGTGGCTATGCGCCAGCt < 5:242079/149‑1 (MQ=255) gCCTGGCACTGGGCTGCCAGCGCCTGGCGATCAACGCCGATCTGGCGCTGGTGCGCGACGAGCTGCTGCGCTACGCCAGCCAGCTGGGTGAGGGTGTCGTCAAACTCATCCTTACCCGTGGCG‑ATAGCCAGCGTGGCTATGCGCCAGCt > 8:1176/1‑149 (MQ=255) ggCACTGGGCTGCCAGCGCCTGGCGATCAACGCCGATCTGGCGCTGGTGCGCGACGAGCTGCTGCGCTACGCCAGCCAGCTGGGTGAGGGTGTCGTCAAACTCATCCTTACCCGTGGCG‑ATAGCCAGCGTGGCTATGCGCCAGCTGTc > 2:50683/1‑148 (MQ=255) gCACTGGGCTGCCAGCGCCTGGCGATCAACGCCGATCTGGCGCTTGTGCGCGACGAGCTGCTGCGCTACGCCAGCCAGCTGGGTGAGGGTGTCGTCAAACTCATCCTTACCCGTGGCG‑ATAGCCAGCGTGGCTATGCGCCAGCTGTCGa < 7:322794/149‑1 (MQ=255) gCACTGGGCTGCCAGCGCCTGGCGATCAACGCCGATCTGGCGCTGGTGCGCGACGAGCTGCTGCGCTACGCCAGCCAGCTGGGTGAGGGTGTCGTCAAACTCATCCTTACCCGTGGCG‑ATAGCCAGCGTGGCTATGCGCCAGCTGTCGa < 2:292473/149‑1 (MQ=255) ccAGCGCCTGGCGATCAACGCCGATCTGGCGCTGGTGCGCGACGAGCTGCTGCGCTACGCCAGCCAGCTGGGTGAGGGTGTCGTCAAACTCATCCTTACCCGTGGCG‑ATAGCCAGCGTGGCTATGCGCCAGCTGTCGATGCAGcgccgc > 4:190914/1‑149 (MQ=255) cAGCGCCTGGCGATCAACGCCGATCTGGCGCTGGTGCGCGACGAGCTGCTGCGCTACGCCAGCCAGCTGGGTGAGGGTGTCGTCAAACTCATCCTTACCCGTGGCG‑ATAGCCAGCGTGGCTATGCGCCAGCTGTCGATGCAGCGCcgcg < 4:120198/149‑1 (MQ=255) aGCGCCTGGCGATCAACGCCGATCTGGCGCTGGTGCGCGACGAGCTGCTGCGCTACGCCAGCCAGCTGGGTGAGGGTGTCGTCAAACTCATCCTTACCCGTGGCG‑ATAGCCAGCGTGGCTATGCGCCAGTTGTCGATGCAGCGCCgcgg < 8:50240/149‑1 (MQ=255) gcgcCTGGCGATCAACGCCGATCTGGCGCTGGTGCGCGACGAGCTGCTGCGCTACGCCAGCCAGCTGGGTGAGGGTGTCGTCAAACTCATCCTTACCCGTGGCG‑ATAGCCAGCGTGGCTATGCGCCAGCTGTCGATGCAGCGCCgcggc < 6:18509/149‑1 (MQ=255) gcgcCTGGCGATCAACGCCGATCTGGCGCTGGTGCGCGACGAGCTGCTGCGCTACGCCAGCCAGCTGGGTGAGGGTGTCGTCAAACTCATCCTTACCCGTGGCG‑ATAGCCAGCGTGGCTATGCGCCAGCTGTCGATGCAGCGCCgcggc < 3:190914/149‑1 (MQ=255) gcgcCTGGCGATCAACGCCGATCTGGCGCTGGTGCGCGACGAGCTGCTGCGCTACGCCAGCCAGCTGGGTGAGGGTGTCGTCAAACTCATCCTTACCCGTGGCG‑ATAGCCAGCGTGGCTATGCGCCAGCTGTCGATGCAGCGCCgcggc > 5:249691/1‑149 (MQ=255) gcCTGGCGATCAACGCCGATCTGGCGCTGGTGCGCGACGAGCTGCTGCGCTACGCCAGCCAGCTGGGTGAGGGTGTCGTCAAACTCATCCTTACCCGTGGCG‑ATAGCCAGCGTGGCTATGCGCCAGCTGTCGATGCAGCGCCGCGGCGt < 7:111477/149‑1 (MQ=255) gCGATCAACGCCGATCTGGCGCTGGTGCGCGACGAGCTGCTGCGCTACGCCAGCCAGCTGGGTGAGGGTGTCGTCAAACTCATCCTTACCCGTGGCG‑ATAGCCAGCGTGGCTATGCGCCAGCTGTCGATGCAGCGCCGCGGCGTATcc < 1:242284/148‑1 (MQ=255) cGATCAACGCCGATCTGGCGCTGGTGCGCGACGAGCTGCTGCGCTACGCCAGCCAGCTGGGTGAGGGTGTCGTCAAACTCATCCTTACCCGTGGCG‑ATAGCCAGCGTGGCTATGCGCCAGCTGTCGATGCAGCGCCGCGGCGTATCCTg < 1:50683/149‑1 (MQ=255) gATCAACGCCGATCTGGCGCTGGTGCGCGACGAGCTGCTGCGCTACGCCAGCCAGCTGGGTGAGGGTGTCGTCAAACTCATCCTTACCCGTGGCG‑ATAGCCAGCGTGGCTATGCGCCAGCTGTCGATGCAGCGCCGCGGCGTATCCTg > 7:256132/1‑148 (MQ=255) aTCAACGCCGATCTGGCGCTGGTGCGCGACGAGCTGCTGCGCTACGCCAGCCAGCTGGGTGAGGGTGTCGTCAAACTCATCCTTACCCGTGGCG‑ATAGCCAGCGTGGCTATGCGCCAGCTGTCGATGCAGCGCCGCGGCGTATCCTGCa < 4:241516/149‑1 (MQ=255) aaCGCCGATCTGGCGCTGGTGCGCGACGAGCTGCTGCGCTACGCCAGCCAGCTGGGTGAGGGTGTCGTCAAACTCATCCTTACCCGTGGCG‑ATAGCCAGCGTGGCTATGCGCCAGCTGTCGATGCAGCGCCGCGGCGTATCCTGCAAg < 7:1176/148‑1 (MQ=255) ccGATCTGGCGCTGGTGCGCGACGAGCTGCTGCGCTACGCCAGCCAGCTGGGTGAGGGTGTCGTCAAACTCATCCTTACCCGTGGCG‑ATAGCCAGCGTGGCTATGCGCCAGCTGTCGATGCAGCGCCGCGGCGTATCCTGCAAGGCAGc > 5:247649/1‑149 (MQ=255) gcgcTGGTGCGCGACGAGCTGCTGCGCTACGCCAGCCAGCTGGGTGAGGGTGTCGTCAAACTCATCCTTACCCGTGGCG‑ATAGCCAGCGTGGCTATGCGCCAGCTGTCGATGCAGCGCCGCGGCGTATCCTGCAAGGCAGCCCATTAc < 5:97569/148‑1 (MQ=255) aggtgtcgaGCTGCTGCGCTAGGCCAGCCAGCTGGGTGAGGGTGTCGTCAAACTCATCCTTACCCGTGGCG‑ATAGCCAGCGTGGCTATGCGCCAGCTGTCGATGCAGCGCCGCGGCGTATCCTGCAAGGCAGCCCATTACCCC‑GTTATc < 1:295205/143‑1 (MQ=255) cgcgACGAGCTGCTGCGCTACGCCAGCCAGCTGGGTGAGGGTGTCGTCAAACTCATCCTTACCCGTGGCG‑ATAGCCAGCGTGGCTATGCGCCAGCTGTCGATGCAGCGCCGCGGCGTATCCTGCAAGGCAGCCCATTACCCC‑GTTATc < 3:285705/148‑1 (MQ=255) gacgaGCTGCTGCGCTACGCCAGCCAGCTGGGTGAGGGTGTCGTCAAAGTCATCCTTACCCGTGGCG‑ATAGCCAGCGTGGCTATGCGCCAGCTGTCGATGCAGCGCCGCGGCGTATCCTGCAAGGCAGCCCATTACCCC‑GTTATCCTGt < 1:300371/149‑1 (MQ=255) ctgcGCTACGCCAGCCAGCTGGGTGAGGGTGTCGTCAAACTCATCCTTACCCGTGGCG‑ATAGCCAGCGTGGCTATGCGCCAGCTGTCGATGCAGCGCCGCGGCGTATCCTGCAAGGCAGCCCATTACCCC‑GTTATCCTGTCGAGCATg < 7:5229/148‑1 (MQ=255) ctgcGCTACGCCAGCCAGCTGGGTGAGGGTGTCGTCAAACTCATCCTTACCCGTGGCG‑ATAGCCAGCGTGGCTATGCGCCAGCTGTCGATGCAGCGCCGCGGCGTATCCTGCAAGGCAGCCCATTACCCC‑GTTATCCTGTCGAGCATGc > 5:140505/1‑149 (MQ=255) tgcGCTACGCCAGCCAGCTGGGTGAGGGTGTCGTCAAACTCATCCTTACCCGTGGCG‑ATAGCCAGCGTGGCTATGCGCCAGCTGTCGATGCAGCGCCGCGGCGTATCCTGCAAGGCAGCCCATTACCCC‑GTTATCCTGTCGa < 5:18045/142‑1 (MQ=255) tgcGCTACGCCAGCCAGCTGGGTGAGGGTGTCGTCAAACTCATCCTTACCCGTGGCG‑ATAGCCAGCGTGGCTATGCGCCAGCTGTCGATGCAGCGCCGCGGCGTATCCTGCAAGGCAGCCCATTACCCC‑GTTATCCTGTCGa > 6:18045/1‑142 (MQ=255) cgcTACGCCAGCCAGCTGGGTGAGGGTGTCGTCAAACTCATCCTTACCCGTGGCG‑ATAGCCAGCGTGGCTATGCGCCAGCTGTCGATGCAGCGCCGCGGCGTATCCTGCAAGGCAGCCCATTACCCC‑GTTATCCTGTCGAGCATGCt < 8:256132/147‑1 (MQ=255) gcTACGCCAGCCAGCTGGGTGAGGGTGTCGTCAAACTCATCCTTACCCGTGGCG‑ATAGCCAGCGTGGCTATGCGCCAGCTGTCGATGCAGCGCCGCGGCGTATCCTGCAAGGCAGCCCATTACCCC‑GTTATCCTGTCGAGCATGCTGAg > 4:68334/1‑149 (MQ=255) tACGCCAGCCAGCTGGGTGAGGGTGTCGTCAAACTCATCCTTACCCGTGGCG‑ATAGCCAGCGTGGCTATGCGCCAGCTGTCGATGCAGCGCCGCGGCGTATCCTGCAAGGCAGCCCATTACCCC‑GTTATCCTGTCGAGCATGCTGAGCa > 7:293718/1‑149 (MQ=255) cGCCAGCCAGCTGGGTGAGGGTGTCGTCAAACTCATCCTTACCCGTGGCG‑ATAGCCAGCGTGGCTATGCGCCAGCTGTCGATGCAGCGCCGCGGCGTATCCTGCAAGGCAGCCCATTACCCC‑GTTATCCTGTCGAGCATGCTGAGCATg < 5:170007/149‑1 (MQ=255) gccagccaGCTGGGTGAGGGTGTCGTCAAACTCATCCTTACCCGTGGCG‑ATAGCCAGCGTGGCTATGCGCCAGCTGTCGATGCAGCGCCGCGGCGTATCCTGCAAGGCAGCCCATTACCCC‑GTTATCCTGTCGa > 1:112386/1‑134 (MQ=255) gccagccaGCTGGGTGAGGGTGTCGTCAAACTCATCCTTACCCGTGGCG‑ATAGCCAGCGTGGCTATGCGCCAGCTGTCGATGCAGCGCCGCGGCGTATCCTGCAAGGCAGCCCATTACCCC‑GTTATCCTGTCGa < 2:112386/134‑1 (MQ=255) cagccagcTGGGTGAGGGTGTCGTCAAACTCATCCTTACCCGTGGCG‑ATAGCCAGCGTGGCTATGCGCCAGCTGTCGATGCAGCGCCGCGGCGTATCCTGCAAGGCAGCCCATTACCCC‑GTTATCCTGTCGAGCATGCTGAGCATGgcg > 2:235431/1‑149 (MQ=255) ccagcTGGGTGAGGGTGTCGTCAAACTCATCCTTACCCGTGGCG‑ATAGCCAGCGTGGCTATGCGCCAGCTGTCGATGCAGCGCCGCGGCGTATCCTGCAAGGCAGcc > 8:237126/1‑107 (MQ=255) cTGGGTGAGGGTGTCGTCAAACTCATCCTTACCCGTGGCG‑ATAGCCAGCGTGGCTATGCGCCAGCTGTCGATGCAGCGCCGCGGCGTATCCTGCAAGGCAGCCCATTACCCC‑GTTATCCTGTCGAGCATGCTGAGCATGGCGTGCGttt < 6:247649/149‑1 (MQ=255) ggTGAGGGTGTCGTCAAACTCATCCTTACCCGTGGCG‑ATAGCCAGCGTGGCTATGCGCCAGCTGTCGATGCAGCGCCGCGGCGTATCCTGCAAGGCAGCCCATTACCCC‑GTTATCCTGTCGAGCATGCTGAGCATGGCGTGCGTTTGtt < 6:140505/149‑1 (MQ=255) ggTGAGGGTGTCGTCAAACTCATCCTTACCCGGGGCG‑AAAGCCAGCGTGGCTATGCGCCAGCTGTCGATGCAGCGGCGCGGGGGAACCTGCAAGGCATCCCCTTACCCCAGTTATCCTGTCGAGCATGCTGAGCATGGCGTGCGttt < 1:235431/147‑1 (MQ=255) tGAGGGTGTCGTCAAACTCATCCTTACCCGTGGCG‑ATAGCCAGCGTGGCTATGCGCCAGCTGTCGATGCAGCGCCGCGGCGTATCCTGCAAGGCAGCCCATTACCCC‑GTTATCCTGTCGAGCATGCTGAGCATGGCGTGCGTTTGTTcc < 3:139237/149‑1 (MQ=255) tcgtcAAACTCATCCTTACCCGTGGCG‑ATAGCCAGCGTGGCTATGCGCCAGCTGGCGATGCAGCGCCGCGGCGTATCCTGCAAGGCAGCCCATTACCCC‑GTTATCCTGTCGAGCATGCTGAGCATGGCGTGCGTTTGTTCCCTTGCCa > 4:135216/1‑148 (MQ=255) aTCCTTACCCGTGGCG‑ATAGCCAGCGTGGCTATGCGCCAGCTGTCGATGCAGCGCCGCGGCGTATCCTGCAAGGCAGCCCATTACCCC‑GTTATCCTGTCGAGCATGCTGAGCATGGCGTGCGTTTGTTCCCTTGCCATACCCGGCTTgg > 4:312937/1‑149 (MQ=255) cccGTGGCG‑ATAGCCAGCGTGGCTATGCGCCAGCTGTCGATGCAGCGCCGCGGCGTATCCTGCAAGGCAGCCCATTACCCC‑GTTATCCTGTCGAGCATGCTGAGCATGGCGTGCGTTTGTTccc > 7:168279/1‑124 (MQ=255) cccGTGGCG‑ATAGCCAGCGTGGCTATGCGCCAGCTGTCGATGCAGCGCCGCGGCGTATCCTGCAAGGCAGCCCATTACCCC‑GTTATCCTGTCGAGCATGCTGAGCATGGCGTGCGTTTGTTccc < 8:168279/124‑1 (MQ=255) gTGGCG‑ATAGCCAGCGTGGCTATGCGCCAGCTGTCGATGCAGCGCCGCGGCGTATCCTGCAAGGCAGCCCATTACCCC‑GTTATCCTGTCGAGCATGCTGAGCATGGCGTGCGTTTGTTCCCTTGCCATACCCGGCTTgg > 2:219876/1‑139 (MQ=255) gTGGCG‑ATAGCCAGCGTGGCTATGCGCCAGCTGTCGATGCAGCGCCGCGGCGTATCCTGCAAGGCAGCCCATTACCCC‑GTTATCCTGTCGAGCATGCTGAGCATGGCGTGCGTTTGTTCCCTTGCCATACCCGGCTTgg < 1:219876/139‑1 (MQ=255) g‑ATAGCCAGCGTGGCTATGCGCCAGCTGTCGATGCAGCGCCGCGGCGTATCCTGCAAGGCAGCCCATTACCCC‑GTTATCCTGTCGa < 7:29013/86‑1 (MQ=255) g‑ATAGCCAGCGTGGCTATGCGCCAGCTGTCGATGCAGCGCCGCGGCGTATCCTGCAAGGCAGCCCATTACCCC‑GTTATCCTGTCGa > 8:29013/1‑86 (MQ=255) g‑ATAGCCAGCGTGGCTATGCGCCAGCTGTCGATGCAGCGCCGCGGCGTATCCTGCAAGGCAGCCCATTACCCC‑GTTATCCTGTCGAGCATGCTGAGCATGGCGTGCGTTTGTTCCCTTGCCATACCCGGCTTGGGGAACAACCActgct < 3:68334/149‑1 (MQ=255) | CTTGCTGGACGGCCACCTCGCACGCCTGGCACTGGGCTGCCAGCGCCTGGCGATCAACGCCGATCTGGCGCTGGTGCGCGACGAGCTGCTGCGCTACGCCAGCCAGCTGGGTGAGGGTGTCGTCAAACTCATCCTTACCCGTGGCG‑ATAGCCAGCGTGGCTATGCGCCAGCTGTCGATGCAGCGCCGCGGCGTATCCTGCAAGGCAGCCCATTACCCC‑GTTATCCTGTCGAGCATGCTGAGCATGGCGTGCGTTTGTTCCCTTGCCATACCCGGCTTGGGGAACAACCACTGCT > NC_002947/2160376‑2160669 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |