New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 932218 = | 48 (0.890) | 6 (0.110) | 5/252 | NT | 10.6% | coding (13404/18933 nt) | PP_0806 | surface adhesion protein |
? | NC_002947 | 932300 = | 55 (1.050) | coding (13322/18933 nt) | PP_0806 | surface adhesion protein |
CCTGTAGGGTAGCGGGCAGCGATACGGTGCCATCGGGGCCCGTTGCGCTGACCTGCAACACTTCGCCATTGGCCTGTGCACTGCCGAGATTGACAGTGAACGTGCCGTCGTTGGTGACCGGGCTGCTGCCCAGCAATACGCCGTTGGGGCCGTACACCTTGATTGTGCTGCCCGCCTCGGCGGTGCCGCTCACCGACAGGCCGTCGGCGGCCAGTATCAGGTTGTCCGGCGTGGCCGGTGCCAGCGCGCCCGGCGCCGTCACGTTTTGCGCAGGGGAGACATTCTGTGCGGCATCG > NC_002947/932070‑932365 | ccTGTAGGGTAGCGGGCAGCGATACGGTGCCATCGGGGCCCGTTGCGCTGACCTGCAACACTTCGCCATTGGCCTGTGCACTGCCGAGATTGACAGTGAACGTGCCGTCGTTGGTGACCGGGCTGCTGCCCAGCAATACGCCGTTgggg < 5:206912/149‑1 (MQ=255) tacagtggccgccgacggtcacttcagcgtgtccctgtcaccggcagcgatcacgggtgaaagcctgagcgtggtccaggccgatgccgcacagaatgtctcccctgcgcaaaacgtgacggcgccgggcgcgctggcaccggccacGc > 7:175239‑M1/148‑149 (MQ=255) gggTAGCGGGCAGCGATACGGTGCCATCGGGGCCCGTTGCGCTGACCTGCAACACTTCGCCATTGGCCTGTGCACTGCCGAGATTGACAGTGAACGTGCCGTCGTTGGTGACCGGGCTGCTGCCCAGCAATACGCCGTTGGGGCCGTac < 1:63525/149‑1 (MQ=255) tAGCGGGAAGCGATACGGTGACATCGTGGCCCGTTGAGCTGACCTGCAAAACTTCGCCATTGGCATGTGCAATGACGAGATTGAAAGTGAACGTGACGTCGTTGTTGACCGGGCTGATGCCAAGCAATACGCCGTTGGGGCCGTAAAcc > 2:99907/1‑149 (MQ=255) gCGGGCAGCGATACGGTGCCATCGGGGCCCGTTGCGCTGACCTGCAACACTTCGCCATTGGCCTGTGCACTGCCGAGATTGACAGTGAACGTGCCGTCGTTGGTGACCGGGCTGCTGCCCAGCAATACGCCGTTGGGGCCGTACACCt < 4:94013/148‑1 (MQ=255) gCGATACGGTGCCATCGGGGCCCGTTGCGCTGACCTGCAACACTTCGCCATTGGCCTGTGCACTGCCGAGATTGACAGTGAACGTGCCGTCGTTGGTGTCCGGGCTGCTGCCCAGCAATACGCCGTTGGGGCCGTACACCTTGATtgtg < 1:154010/149‑1 (MQ=255) cATCGGGGCCCGTTGCGCTGACCTGCAACACTTCGCCATTGGCCTGTGCACTGCCGAGATTGACAGTGAACGTGCCGTCGTTGGTGACCGGGCTGCTGCCCAGCAATACGCCGTTGGGGCCGTACACCTTGAtt > 3:267124/1‑134 (MQ=255) cATCGGGGCCCGTTGCGCTGACCTGCAACACTTCGCCATTGGCCTGTGCACTGCCGAGATTGACAGTGAACGTGCCGTCGTTGGTGACCGGGCTGCTGCCCAGCAATACGCCGTTGGGGCCGTACACCTTGAtt < 4:267124/134‑1 (MQ=255) atccgcccccGATGCGCTGACCTGCAACACTTCGCCATTGCCCTGTGCACTGCCGACATAGACACCCAACGTCCCCTCGTAGCTCACCGGGCTGCTGCCCAGCAATACGCCGATGGGGCCGTACACCTAGATTCTGCTCCCCGCCTcgg < 2:169663/142‑1 (MQ=255) ggCCCGTTGCGCTGACCTGCAACACTTCGCCATTGGCCTGTGCACTGCCGAGATTGACAGTGAACGTGCCGTCGTTGGTGACCGGGCTGCTGCCCAGCAATACGCCGTTGGGGCCGTACAACTTGATTGTGCTGCCCGCCTCGGCGGTg < 1:99907/149‑1 (MQ=255) gCCCGTTGCGCTGACCTGCAACACTTCGCCATTGGCCTCTGCACTGCCGAGATTGACAGTGAACGTGCCGTCGTTGGTGACCGGGCTGCTGCCCAGCAATACGCCGTTGGGGCCGTGCACCTTGATTGTGCTGCCCGCCTCGGCGGTGc < 1:72466/149‑1 (MQ=255) cGTTGCGCTGACCTGCAACACTTCGCCATTGGCCTGTGCACTGCCGAGATTGACAGTGAACGTGCCGTCGTTGGTGACCGGGCTGCTGCCCAGCAATACGCCGTTGGGGCCGTACACCTTGATTGTGCTGCCCGCCTCGGCGGTGCCGc > 1:243615/1‑149 (MQ=255) gCAACACTTCGCCATTGGCCTGTGCACTGCCGAGATTGACAGTGAACGTGCCGTCGTTGGTGACCGGGCTGCTGCCCAGCAATACGCCGTTGGGGCCGTACACCTTGATTGTGCTGCCCGCCTCGGCGGTGCCGCTCACCGACAGGCCg > 7:120834/1‑149 (MQ=255) cgggtgaaagcctgagcgtggtccaggccgatgccgcacagaatgtctcccctgcgcaaaacgtgacggcgccgggcgcgctggcaccggccacGCCGTACACCTTGATTGTGCTGCCCGCCTCGGCGGTGCCGCTCACCGACAGGCCg < 3:258591‑M1/55‑1 (MQ=255) tgaaagcctgagcgtggtccaggccgatgccgcacagaatgtctcccctgcgcaaaacgtgacggcgccgggcgcgctggcaccggccacGCCGGACAACCTGATA‑‑‑CTGCCCGCCTCGGCGGTGCCGCTCACCGACAGGCCGTcggcgg < 6:115692‑M1/59‑1 (MQ=255) cacTTCGCCATTGGCCTGTGCACTGCCGAGATTGACAGTGAACGTGCCGTCGTTGGTGACCGGGCTGCTCCCCAGCAATACGCCGTTGGGGCCGTACACCTTGATTGTGCTGCCCGCCTCGGCGGTGCCGCTCACCGACAGGCCGTcgg > 8:110800/1‑149 (MQ=255) aaagcctgagcgtggtccaggccgatgccgcacagaatgtctcccctgcgcaaaacgtgacggcgccgggcgcgctggcaccggccacGCCGGACAACCTGATA‑‑‑CTGCCCGCCTCGGCGGTGCCGCTCACCGACAGGCCGTCGGCGGcc > 5:115692‑M1/89‑149 (MQ=255) gcctgagcgtggtccaggccgatgccgcacagaatgtctcccctgcgcaaaacgtgacggcgccgggcgcgctggcaccggccacGCCGTACACCTTGATTGTGCTGCCCGCCTCGGCGGTGCCGCTCACCGACAGGCCGTCGGCGGcc > 4:258591‑M1/86‑149 (MQ=255) cGCCATTGGCCTGTGCACTGCCGAGATTGACAGTGAACGTGCCGTCGTTGGTGACCGGGCTGCTGCCCAGCAATACGCCGTTGGGGCCGTACACCTTGATTGTGCTGCCCGCCTCGGCGGTGCCGCTCACCGACAGGCCGTCggcggc > 2:100519/1‑148 (MQ=255) gCCATTGGCCTGTGCACTGCCGAGATTGACAGTGAACGTGCCGTCGTTGGTGACCGGGCTGCTGCCCAGCAATACGCCGTTGGGGCCGTACACCTTGATTGTGCTGCCCGCCTCGGCGGTGCCGCTCACCGACAGGCCGTCGGCGGcc < 3:173571/148‑1 (MQ=255) gCCATTGGCCTGTGCACTGCCGAGATTGACAGTGAACGTGCCGTCGTTGGTGACCGGGCGGCTGCCCAGCAATACGCCGTTGGGGCCGTACACCTTGATTGTGCTGCCCGCCTCGGCGGTGCCGCTCACCGACAGGCCGTCGGCGGCCa < 7:293350/149‑1 (MQ=255) ccATTGGCCTGTGCACTGCCGAGATTGACAGTGAACGTGCCGTCGTTGGTGACCGGGCTGCTGCCCAGCAATACGCCGTTGGGGCCGTACACCTTGATTGTGCTGCCCGCCTCGGCGGTGCCGCTCACCGACAGGCCGTCGGCGGCCAg > 2:110459/1‑149 (MQ=255) cATTGGCCTGTGCACTGCCGAGATTGACAGTGAACGTGCCGTCGTTGGTGACCGGGCTGCTGCCCAGCAATTCGCCGTTGGGGCCGTACACCTTGATTGTGCTGCCCGCCTCGGCGGTGCCGCTCACCGACAGGCCGTCGGCGGCCAGt < 1:110459/149‑1 (MQ=255) cATTGGCCTGTGCACTGCCGAGATTGACAGTGAACGTGCCGTCGTTGGTGACCGGGCTGCTGCCCAGCAATACGCCGTTGGGGCCGTACACCTTGATTGTGCTGCCCGCCTCGGCGGTGCCGCTCACCGACAGGCCGt < 2:166154/138‑1 (MQ=255) cATTGGCCTGTGCACTGCCGAGATTGACAGTGAACGTGCCGTCGTTGGTGACCGGGCTGCTGCCCAGCAATACGCCGTTGGGGCCGTACACCTTGATTGTGCTGCCCGCCTCGGCGGTGCCGCTCACCGACAGGCCGt > 1:166154/1‑138 (MQ=255) ggtccaggccgatgccgcacagaatgtctcccctgcgcaaaacgtgacggcgccgggcgcgctggcaccggccacGCCGTACACCTTGATTGTGCTACCCGCCTCGGCGGTGCCGCTCACCGACAGGCCGTCGGCGGCCAGTATCAGGt < 3:109816‑M1/74‑1 (MQ=255) tgtgCACTGCCGAGATTGACAGTGAACGTGCCGTCGTTGGTGACCGGGCTGCTGCCCAGCAATACGCCGTTGGGGCCGTACACCTTGATTGTGCTGCCCGCCTCGGCGGTGCCGCTCACCGACAGGCCGTCGGCGGCCAGTATCAGGtt > 5:250508/1‑149 (MQ=255) gCACTGCCGAGATTGACAGTGAACGTGCCCTCGTTGGTGAACGGGCTGCTGCCCAGCAATACGCCGTTGGCGCCGTACACCTTGATTGTGCTGCCCGCCTCTGCGGAGCCGCTCACCGACAGGCCGTCGGCGGCCAGTATCAGGTTGTc > 3:28250/1‑149 (MQ=255) gccgatgccgcacagaatgtctcccctgcgcaaaacgtgacggcgccgggcgcgctggcaccggccacGCCGTACACCTTGATTGTGCTACCCGCCTCGGCGGTGCCGCTCACCGACAGGCCGTCGGCGGCCAGTATCAGGTTGTCCgg > 4:109816‑M1/69‑149 (MQ=255) gagaTTGACAGTGAACGTGCCGTCGTTGGTGACCGGGCTGCTGCCCAGCAATACGCCGTTGGGGCCGTACACCTTGATTGTGCTGCCCGCCTCGGCGGTGCCGCTCACCGACAGGCCGTCGGCGGCCAGTATCAGGTTGTCCGGCGTgg > 3:75177/1‑149 (MQ=255) agaTTGACAGTGAACGTGCCGTCGTTGGTGACCGGGCTGCTGCCCAGCAATACGCCGTTGGGGCCGTACACCTTGATTGTGCTGCCCGCCTcggc < 8:90515/95‑1 (MQ=255) agaTTGACAGTGAACGTGCCGTCGTTGGTGACCGGGCTGCTGCCCAGCAATACGCCGTTGGGGCCGTACACCTTGATTGTGCTGCCCGCCTcggc > 7:90515/1‑95 (MQ=255) gaTTGACAGTGATCGTGGGGTCGTTGGTGACCGGTGTGCTGCCCAGGAATAGGCCGTTGGGGGCGTACACCTTGTTTGTGCTGCCCGCCTCGGGGGTGGCGCTCACCGACAGGCCGTCGGCGGCCAGTATCAGGTTGTCCGGCGTGGc < 4:28250/148‑1 (MQ=255) gACAGTGAACGTGCCGTCGTTGGTGACCGGGCTGCTGCCCAGCAATACGCCGTTGGGGCCGTACACCTTGATTGTGCTGCCCGCCTCGGCGGTGCCGCTCACCGACAGGCCGTCGGCGGCCAGTATCAGGTTGTCCGGCGTGGCCGGt < 4:75177/148‑1 (MQ=255) aCAGTGAACGTGCCGTCGTTGGTGACCGGGCTGCTGCCCAGCAATACGCCGTTGGGGCCGTACACCTTGATTGTGCTGCCCGCCTCGGCGGTGCCGCTCACCGACAGGCCGTCGGCGGCCAGTATCAGGTTGTCCGGCGTGGCCGGTGc > 6:237954/1‑149 (MQ=255) aGTGAACGTGCCGTCGTTGGTGACCGGGCTGCTGCCCAGCAATACGCCGTTGGGGCCGTACACCTTGATTGTGCTGCCCGCCTCGGCGGTGCCGCTCACCGACAGGCCGTCGGCGGCCAGTATCAGGTTGTCCGGCGTGGCCGGTGc > 4:194831/1‑147 (MQ=255) tGAACGTGCCGTCGTTGGTGACCGGGCTGCTGCCCAGCAATACGCCGTTGGGGCCGTACACCTTGATTGTGCTGCCCGCCTCGGCGGTGCCGCTCACCGACAGGCCGTCGGCGGCCAGTATCAGGTTGTCCGGCGTGGCCGGTGCCAgc < 8:120834/149‑1 (MQ=255) gCCGTCGTTGGTGACCGGGCTGCTGCCCAGCAATACGCCGTTGGGGCCGTACACCTTGATTGTGCTGCCCGCCTCGGCGGTGCCGCTCACCGACAGGCCGTCGGCGGCCAGTATCAGGTTGTCCGGCGTGGCCGGTGCCAGCGCGCCCg > 4:257195/1‑149 (MQ=255) tcgtTGGTGACCGGGCTGCTGCCCAGCAATACGCCGTTGGGGCCGTACACCTTGATTGTGCTGCCCGCCTCGGCGGTGCCGCTCACCGACAGGCCGTCGGCGGCCAGTATCAGGTTGTCCGGCGTGGCCGGTGCCAGCGCGCCCGgcgc > 2:208521/1‑149 (MQ=255) ttGGTGACCGGGCTGCTGCCCAGCAATACGCCGTTGGGGCCGTACACCTTGATTGTGCTGCCCGCCTCGGCGGTGCCGCTCACCGACAGGCCGTCGGCGGCCAGTATCAGGTTGTCCGGCGTGGCCGGTGCCAGCGCGCCCGGCGACGt > 2:339375/1‑149 (MQ=255) cGGGCTGCTGCCCAGCAATACGCCGTTGGGGCCGTACACCTTGATTGTGCTGCCCGCCTCGGCGGTGCCGCTCACCGACAGGCCGTCGGCGGCCAGTATCAGGTTGTCCGGCGTGGCCGGTGCCAGCGCGCCCGGCGCCGTCACGtttt > 3:279682/1‑149 (MQ=255) gctgctGCCCAGCAATACGCCGTTGGGGCCGTACACCTTGATTGTGCTGCCCGCCTCGGCGGTGCCGCTCACCGACAGGCCGTCGGCGGCCAGTATCAGGTTGTCCGGCGTGGCCGGTGCCAGCGCGCCCGGCGCCGTCACGTTTTgcg < 4:279682/149‑1 (MQ=255) tgctgcCCAGCAATACGCCGTTGGGGCCGTACACCTTGATTGTGCTGCCCGCCTCGGCGGTGCCGCTCACCGACAGGCCGTCGGCGGCCAGTATCAGGTTGTCCGGCGTGGCCGGTGCCAGCGCGCCCGGCGCCGTCACGTTTTGCGCa < 7:110800/149‑1 (MQ=255) ctgcCCAGCAATACGCCGTTGGGGCCGTACACCTTGATTGTGCTGCCCGCCTCGGCGGTGCCGCTCACCGACAGGCCGTCGGCGGCCAGTATCAGGTTGTCCGGCGTGGCCGGTGCCAGCGCGCCCGGCGCCGTCACGTTTTGCGCAgg < 3:194831/149‑1 (MQ=255) tgcCCAGCAATACGCCGTTGGGGCCGTACACCTTGATTGTGCTGCCCGCCTCGGCGGTGCCGCTCACCGACAGGCCGTCGGCGGCCAGTATCAGGTTGTCCGGCGTGGCCGGTGCCAGCGCGCCCGGCGCCGTCACGTTTTGCGCAggg > 2:60933/1‑149 (MQ=255) cccAGCAATACGCCGTTGGGGCCGTACACCTTGATTGTGCTGCCCGCCTCGGCGGTGCCGCTCACCGACAGGCCGTCGGCGGCCAGTATCAGGTTGTCCGGCGTGGCCGGTGCCAGCGCGCCCGGCGCCGTCACGTTTTgcgc < 1:244382/143‑1 (MQ=255) cccAGCAATACGCCGTTGGGGCCGTACACCTTGATTGTGCTGCCCGCCTCGGCGGTGCCGCTCACCGACAGGCCGTCGGCGGCCAGTATCAGGTTGTCCGGCGTGGCCGGTGCCAGCGCGCCCGGCGCCGTCACGTTTTgcgc > 2:244382/1‑143 (MQ=255) cccAGCAATACGCCGTTGGGGCCGTACACCTTGATTGTGCTGCCCGCCTCGGCGGTGCCGCTCACCGACAGGCCGTCGGCGGCCAGTATCAGGTTGTCCGGCGTGGCCGGTGCCAGCGCGCCCGGCGCCGTCACGTTTTGCGCAggg > 2:116697/1‑147 (MQ=255) cccAGCAATACGCCGTTGGGGCCGTACACCTTGATTGTGCTGCCCGCCTCGGCGGTGCCGCTCACCGACAGGCCGTCGGCGGCCAGTATCAGGTTGTCCGGCGTGGCCGGTGCCAGCGCGCCCGGCGCCGTCACGTTTTGCGCAGGGga < 3:257195/149‑1 (MQ=255) cAGCAATACGCCGTTGGGGCCGTACACCTTGATTGTGCTGCCCGCCTCGGCGGTGCCGCTCACCGACAGGCCGTCGGCGGCCAGTATCAGGTTGTCCGGCGTGGCCGGTGCCAGCGCGCCCGGCGCCGTCACGTTTTGCGCAGGGgaga > 5:256604/1‑149 (MQ=255) cAGCAATACGCCGTTGGGGCCGTACACCTTGATTGTGCTGCCCGCCTCGGCGGTGCCGCTCACCGACAGGCCGTCGGCGGCCAGTATCAGGTTGTCCGGCGTGGCCGGTGCCAGCGCGCCCGGCGCCGTCACGTTTTGCGCAGGGgaga > 5:189150/1‑149 (MQ=255) cGCCGTTGGGGCCGTACACCTTGATTGTGCTGCCCGCCTCGGCGGTGCCGCTCACCGACAGGCCGTCGGCGGCCAGTATCAGGTTGTCCGGCGTGGCCGGTGCCAGCGCGCCCGGCGCCGTCACGTTTTGCGCAGGGGAGACATTCtgt < 2:243615/149‑1 (MQ=255) gCCGTTGGGGCCGTACACCTTGATTGTGCTGCCCGCCTCGGCGGTGCCGCTCACCGACAGGCCGTCGGCGGCCAGTATCAGGTTGTCCGGCGTGGCCGGTGCCAGCGCGCCCGGCGCCGTCACGTTTTGCGCAGGGGAGACATTCtgtg > 7:248106/1‑149 (MQ=255) gCCGTTGGGGCCGTACACCTTGATTGTGCTGCCCGCCTCGGCGGTGCCGCTCACCGACAGGCCGTCGGCGGCCAGTATCAGGTTGTCCGGCGTGGCCGGTGCCAGCGCGCCCGGCGCCGTCACGTTTTGAGCACGGGAGACATTCagtg > 6:119186/1‑149 (MQ=255) ccGTTGGGGCCGTACACCTTGATTGTGCTGCCCGCCTCGGCGGTGCCGCTCACCGACAGGCCGTCGGCGGCCAGTATCAGGTTGTCCGGCGTGGCCGGTGCCAGCGCGCCCGGCGCCGTCACGTTTTGCGCAGGGGAGACATTCTGTGc < 1:100519/149‑1 (MQ=255) gTTGGGGCCGTACACCTTGATTGTGCTGCCCGCCTCGGCGGTGCCGCTCACCGACAGGCCGTCGGCGGCCAGTATCAGGTTGTCCGGCGTGGCCGGTGCCAGCGCGCCCGGCGCCGTCACGTTTTGCGCAGGGGAGACATTCTGTGCgg > 8:163239/1‑149 (MQ=255) ggggCCGTACACCTTGATTGTGCTGCCCGCCTCGGCGGTGCCGCTCACCGACAGGCCGTCGGCGGCCAGTATCAGGTTGTCCGGCGTGGCCGGTGCCAGCGCGCCCGGCGCCGACACGtttt > 2:291132/1‑122 (MQ=255) ggCCGTACACCTTGATTGTGCTGCCCGCCTCGGCGGTGCCGCGCACCGACAGGCCGTCGGCGGCCAGTATCAGGTTGTCCGGCGTGGCCGGTGCCAGCGCGCCCGGCGCCGTCACGTTTTGCGCAGGGGAGACATTCTGTGCGGCATCg < 4:114902/149‑1 (MQ=255) | CCTGTAGGGTAGCGGGCAGCGATACGGTGCCATCGGGGCCCGTTGCGCTGACCTGCAACACTTCGCCATTGGCCTGTGCACTGCCGAGATTGACAGTGAACGTGCCGTCGTTGGTGACCGGGCTGCTGCCCAGCAATACGCCGTTGGGGCCGTACACCTTGATTGTGCTGCCCGCCTCGGCGGTGCCGCTCACCGACAGGCCGTCGGCGGCCAGTATCAGGTTGTCCGGCGTGGCCGGTGCCAGCGCGCCCGGCGCCGTCACGTTTTGCGCAGGGGAGACATTCTGTGCGGCATCG > NC_002947/932070‑932365 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |