New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1589369 | 50 (0.920) | 4 (0.080) | 4/246 | NT | 6.9% | coding (158/1638 nt) | PP_1394 | acetolactate synthase large subunit |
? | NC_002947 | = 1589401 | 61 (1.190) | coding (190/1638 nt) | PP_1394 | acetolactate synthase large subunit |
CGAAGTACTGGTCAAACTCCTTGAAGGCTATGGCGTCGATCATGTCTTCGGCATCCCCGGTGTGCATACCGTGGAGCTCTATCGTGGCCTGGCGGGCTCTTCCATTCGCCACATCACCCCGCGTCATGAGCAAGGTGCCGGGTTCATGGCTGACGGCTATGCGCGCACCCGCGGCAAAC‑CCGGGGTATGCTTCATCATCACTGGCCCGGGCATGACCAATATCACCACTGCCATGGGCCAGGCCTATGCCGACTCGATCCCGATGCTGGTGATTTCCAGCGTGCAG > NC_002947/1589226‑1589511 | cgAAGTACTGGTCAAACTCCTTGAAGGCTATGGCGTCGATCATGTCTTCGGCATCCCCGGTGTGCATACCGTGGAGCTCTATCGTGGCCTGGCGGGCTCTTCCATTCGCCACATCACCCCGCGTCATGAGCAAGGTGCCGGGTTCATgg < 3:261404/149‑1 (MQ=255) cTGGTCAAACTCCTTGAAGGCTATGGCGTCGATCATGTCTTCGGCATCCCCGGTGTGCATACCGTGGAGCTCTATCGTGGCCTGGCGGGCTCTTCCATTCGCCACATCACCCCGCGTCATGAGCAAGGTGCCGGGTTCATGGCTGACgg < 6:92089/149‑1 (MQ=255) tGGTCAAACTCCTTGAAGGCTATGGCGTCGATCATGTCTTCGGCATCCCCGGTGTGCATACCGTGGAGCTCTATCGTGGCCTGGCGGGCTCTTCCATTCGCCACATCACCCCGCGTCATGAGCAAGGTGCCGGGTTCATGGCTGACGGc > 1:281270/1‑149 (MQ=255) gTCAAACTCCTTGAAGGCTATGGCGTCGATCATGTCTTCGGCATCCCCGGTGTGCATACCGTGGAGCTCTATCGTGGCCTGGCGGGCTCTTCCATTCGCCACATCACCCCGCGTCATGAGCAAGGTGCCGGGTTCATGGCTGACGGCt < 3:274626/148‑1 (MQ=255) gTCAAACTCCTTGAAGGCTATGGCGTCGATCATGTCTTCGGCATCCCCGGTGTGCATACCGTGGAGCTCTATCGTGGCCTGGCGGGCTCTTCCATTCGCCACATCACCCCGCGTCATGAGCAAGGTGCCGGGTTCATGGCTGACGGCTa > 4:79382/1‑149 (MQ=255) cAAACTCCTTGAAGGCTATGGCGTCGATCATGTCTTCGGCATCCCCGGTGTGCATACCGTGGAGCTCTATCGTGGCCTGGCGGGCTCTTCCATTCGCCACATCACCCCGCGTCATGAGCAAGGTGCCGGGTTCATGGCTGACGGCTATg > 3:306116/1‑149 (MQ=255) aaaCTCCTTGAAGGCTATGGCGTCGATCATGTCTTCGGCATCCCCGGTGTGCATACCGTGGAGCTCTATCGTGGCCTGGCGGGCTCTTCCATTCGCCACATCACCCCGCGTCATGAGCAAGGTGCCGGGTTCATGGCTGACGGCTATgc > 8:4077/1‑149 (MQ=255) aaaCTCCTTGAAGGCTATGGCGTCGATCATGTCTTCGGCATCCCCGGTGTGCATACCGTGGAGCTCTATCGTGGCCTGGCGGGCTCTTCCATTCGCCACATCACCCCGCGTCATGAGCAAGGTGCCGGGTTCATGGCTGACGGCTATgc > 8:67305/1‑149 (MQ=255) aCTCCTTGAAGGCTATGGCGTCGATCATGTCTTCGGCATCCCCGGTGTGCATACCGTGGAGCTCTATCGTGGCCTGGCGGGCTCTTCCATTCGCCACATCACCCCGCGTCATGAGCAAGGTGCCGGGTTCATGGCTGACGGCTATgcgc < 2:281270/149‑1 (MQ=255) aCTCCTTGAAGGCTATGGCGTCGATCATGTCTTCGGCATCCCCGGTGTGCATACCGTGGAGCTCTATCGTGGCCTGGCGGGCTCTTCCATTCGCCACATCACCCAGCGTCATGAGCAAGGTGCCGGGTTtgccgcgggtgcgcgcatag > 3:184779‑M1/1‑129 (MQ=255) aaGGCTATGGCGTCGATCATGTCTTCGGCATCCCCGGTGTGCATACCGTGGAGCTCTATCGTGGCCTGGCGGGCTCTTCCATTCGCCACATCACCCCGCGTCATGAGCAAGGTGCCGGGTTCATGGCTGACGGCTATGCGCGCACCcgc > 7:108164/1‑149 (MQ=255) gTCGATCATGTCTTCGGCATCCCCGGTGTTCATACCGTGGAGCTCTATCGGGGCCTGGCGGGCTCTTCCATTCGCCACATCACCCCGCGTCATGAGCAAGGTGCCGGGTTtgccgcgggtgcgcgcatagccgtcagccatgaacccgg < 4:184779‑M1/149‑40 (MQ=255) gTCGATCATGTCTTCGGCATCCCCGGTGTGCATACCGTGGAGCTCTATCGTGGCCTGGCGGGCTCTTCCATTCGCCACATCACCCCGCGTCATGAGCAAGGTGCCGGGTTCATGGCTGACGGCTATGCGCGCACCCGCGGCAaacccgg > 2:254224‑M2/1‑142 (MQ=255) gTCGATCATGTCTTCGGCATCCCCGGTGTGCATACCGTGGAGCTCTATCGTGGCCTGGCGGGCTCTTCCATTCGCCACATCACCCCGCGTCATGAGCAAGGTGCCGGGTTCATGGCTGACGGCTATGCGCGCACCCGCGGCAaacccgg < 3:296734‑M2/149‑8 (MQ=255) tCGATCATGTCTTCGGCATCCCCGGTGTGCATACCGTGGAGCTCTATCGTGGCCTGGCGGGCTCTTCCATTCGCCACATCACCCCGCGTCATGAGCAAGGTGCCGGGTTCATGGCTGACGGCTATGCGCGCACCCGCGGCAAAC‑CCggg < 5:199811/149‑1 (MQ=255) tCGATCATGGCTTCGGCATCCCCGGTGTGCATACCGTGGAGCTCTATCGTGGCCTGGCGGGCTCTTCCATTCGCCACATCACCCCGCGTCATGAGCAAGGTGCCGGGTTCATGGCTGACGGCTATGCGCGCACCCGCGGCAAAC‑CCggg < 4:82368/149‑1 (MQ=255) tCTTCGGCATCCCCGGTGTGCATACCGTGGAGCTCTATCGTGGCCTGGCGGGCTCTTCCATTCGCCACATCACCCCGCGTCATGAGCAAGGTGCCGGGTTCATGGCTGACGGCTATGCGCGCACCCGCGGCAAAC‑CCGGGGTATGCtt < 7:4077/148‑1 (MQ=255) tCTTCGGCATCCCCGGTGTGCATACCGTGGAGCTCTATCGTGGCCTGGCGGGCTCTTCCATTCGCCACATCACCCCGCGTCATGAGCAAGGTGCCGGGTTCATGGCTGACGGCTATGCGCGCACCCGCGGCAAAC‑CCGGGGTATGCtt < 3:79382/148‑1 (MQ=255) tCTTCGGCATCCCCGGTGTGCATACCGTGGAGCTCTATCGTGGCCTGGCGGGCTCTTCCATTCGCCACATCACCCCGCGTCATGAGCAAGGTGCCGGGTTCATGGCTGACGGCTATGCGCGCACCCGCGGCAAAC‑CCGGGGTATGCTtc < 7:131524/149‑1 (MQ=255) ttCGGCATCCCCGGTGTGCATACCGTGGAGCTCTATCGTGGCCTGGCGGGCTCTTCCATTCGCCACATCACCCCGCGTCATGAGCAAGGTGCCGGGTTtgccgcgggtgcgcgcatagccgtcagccatgaacccggcac > 1:176763‑M1/1‑98 (MQ=255) ttCGGCATCCCCGGTGTGCATACCGTGGAGCTCTATCGTGGCCTGGCGGGCTCTTCCATTCGCCACATCACCCCGCGTCATGAGCAAGGTGCCGGGTTtgccgcgggtgcgcgcatagccgtcagccatgaacccggcac < 2:176763‑M1/140‑43 (MQ=255) cGGCATCCCCGGTGTGCATACCGTGGAGCTCTATCGTGGCCTGGCGGGCTCTTCCATTCGCCACATCACCCCGCGTCATGAGCAAGGTGCCGGGTTCATGGCTGACGGCTATGCGCGCACCCGCGGCAAAC‑CCGGGGTATGCTtcatc < 8:319399/148‑1 (MQ=255) cGGCATCCCCGGTGTGCATACCGTGGAGCTCTATCGTGGCCTGGCGGGCTCTTCCATTCGCCACATCACCCCGCGTCATGAGCAAGGTGCCGGGTTCATGGCTGACGGCTATGCGCGCACCCGCGGCAAAC‑CCGGGGTATGCTtca < 6:349492/146‑1 (MQ=255) cGGCATCCCCGGGGTGCATACCGTGGTGCTCTATCGTGGCCTGGCGTGCTCTTCCATTCGCCACATCACCGCGCGTCATGAGCAAGGTGCCTTGTTCATGGCTGACGGCTATGCGCGCACCCGCGGCAAAC‑CCTGGGTATGCTtcat < 1:90101/147‑1 (MQ=255) ggCATCCCCGGTGTGCATACCGTGGAGCTCTATCGTGGCCTGGCGGGCTCTTCCATTCGCCACATCACCCCGCGTCATGAGCAAGGTGCCGGGTTCATGGCTGACGGCTATGCGCGCACCCGCGGCAAAC‑CCGGGGTATGCTtcatcat < 2:195592/149‑1 (MQ=255) cATCCCCGGTGTGCATACCGTGGAGCTCTATAGTGGCCTGGCGGGCTCTTCCATTCGCCACATCACCCCGCGTCATGAGCAAGGTGCCGGGTTCATGGCTGACGGCTATGCGCGCACCCGCGGCAAAC‑CCGGGGt > 3:155870/1‑135 (MQ=255) cATCCCCGGTGTGCATACCGTGGAGCTCTATAGTGGCCTGGCGGGCTCTTCCATTCGCCACATCACCCCGCGTCATGAGCAAGGTGCCGGGTTCATGGCTGACGGCTATGCGCGCACCCGCGGCAAAC‑CCGGGGt < 4:155870/135‑1 (MQ=255) tCCCCGGTGTGCATACCGTGGAGCTCTATCGTGGCCTGGCGGGCTCTTCCATTCGCCACATCACCCCGCGGCATGAGCAAGGTGCCGGGTTCATGGCTGACGGCTATGCGCGCACCCGCGGCAAAC‑CCGGTGTCTGCTTCATCATCACt > 2:192495/1‑149 (MQ=255) cccGGTGTGCATACCGTGGAGCTCTATCGTGGCCTGGCGGGCTCTTCCATTCGCCACATCACCCCGCGTCATGAGCAAGGTGCCGGGTTCATGGCTGACGGCTATGCGCGCACCCGCGGCAAAC‑CCGGGGTATGCTTCATCATCACTg < 8:108164/148‑1 (MQ=255) tgCATACCGTGGAGCTCTATCGTGGCCTGGCGGGCTCTTCCATTCGCGACATCACCCCGCGTCATGAGCAAGGTGCCGGGTTCATGGCTGACGGCTATGCGCGCACCCGCGGCAAAC‑CCGGGGTATGCTTCATCATCACTGGCCCGGGc < 4:306116/149‑1 (MQ=255) gAGCTCTATCGTGGCCTGGCGGGCTCTTCCATTCGCCACATCACCCCGCGTCATGAGCAAGGTGCCGGGTTCATGGCTGACGGCTATGCGCGCACCCGCGGCAAAC‑CCGGGGTATGCTTCATCATCACTGGCCCGGGCATGACCAatat < 7:67305/149‑1 (MQ=255) aGCTCTATCGTGGCCTGGCGGGCTCTTCCATTCGCCACATCACCCCGCGTCATGAGCAAGGTGCCGGGTTCATGGCTGACGGCTATGCGCGCACCCGCGGCAAAC‑CCGGGGTATGCTTCATCATCACTGGCCCGGGCATGACCAATATc > 3:275527/1‑149 (MQ=255) ctctATCGTGGCCTGGCGGGCTCTTCCATTCGCCACATCACCCCGCGTCATGAGCAAGGTGCCGGGTTCATGGCTGACGGCTATGCGCGCACCCGCGGCAAAC‑CCGGGGTATGCTTCATCATCACTGGCCCGGGCATGACCAATATcac < 2:26989/149‑1 (MQ=255) tATCGTGGCCTGGCGGGCTCTTCCATTCGCCACATCACCCCGCGTCATGAGCAAGGTGCCGGGTTCATGGCTGACGGCTATGCGCGCACCCGCGGCAAAC‑CCGGGGTATGCTTCATCATCACTGGCCCGGGCATGACCAATATcaccac > 4:44211/1‑149 (MQ=255) gggCTCTTCCATTCGCCACATCACCCCGCGTCATGAGCAAGGTGCCGGGTTCATGGCTGACGGCTATGCGCGCACCCGCGGCAAAC‑CCGGGGTATGCTTCATCATCACTGGCCCGGGc < 6:261959/118‑1 (MQ=255) gggCTCTTCCATTCGCCACATCACCCCGCGTCATGAGCAAGGTGCCGGGTTCATGGCTGACGGCTATGCGCGCACCCGCGGCAAAC‑CCGGGGTATGCTTCATCATCACTGGCCCGGGc > 5:261959/1‑118 (MQ=255) ctctTCCATTCGCCACATCACCCCGCGTCATGAGCAAGGTGCCGGGTTCATGGCTGACGGCTATGCGCGCACCCGCGGCAAAC‑CCGGGGTATGCTTCATCATCACTGGCCCGGGCATGACCAATATCACCACTGCCATGGGCCAGGcc > 1:323049/1‑148 (MQ=255) ttCCATTCGCCACATCACCCCGCGTCATGAGCAAGGTGCCGGGTTCATGGCTGACGGCTATGCGCGCACCCGCGGCAAAC‑CCGGGGTATGCTTCATCATCACTGGCCCGGGCATGACCAATATCACCACTGCCATGGGCCAg > 7:167130/1‑142 (MQ=255) ttCCATTCGCCACATCACCCCGCGTCATGAGCAAGGTGCCGGGTTCATGGCTGACGGCTATGCGCGCACCCGCGGCAAAC‑CCGGGGTATGCTTCATCATCACTGGCCCGGGCATGACCAATATCACCACTGCCATGGGCCAg < 8:167130/142‑1 (MQ=255) ttCCATTCGCCACATCACCCCGCGTCATGAGCAAGGTGCCGGGTTCATGGCTGACGGCTATGCGCGCACCCGCGGCAAAC‑CCGGGGTATGCTTCATCATCACTGGCCCGGGCATGACCAATATCACCACTGCCATGGGCCAGGCCTATg > 1:126683/1‑149 (MQ=255) ttCCATTCGCCACATCACCCCGCGGCATGAGCAAGGTGCCGGGTTCATGGCTGACGGCTATGCGCGCACCCGCGGCAAAC‑CCggg < 4:238090/85‑1 (MQ=255) cATTCGCCACATCACCCCGCGTCATGAGCAAGGTGCCGGGTTCATGGCTGACGGCTATGCGCGCACCCGCGGCAAAC‑CCGGGGTATGCTTCATCATCACTGGCCCGGGCATGACCAATATCACCACTGCCATGGGCCAGGCCTATGcc > 8:295915/1‑148 (MQ=255) cATTCGCCACATCACCCCGCGTCATGAGCAAGGTGCCGGGTTCATGGCTGACGGCTATGCGCGCACCCGCGGCAAAC‑CC‑GGGTATGCTTCATCATCACTGGCCCGGGCATGACCAATATCACCACTGCCATGGGCCAGGCCTATGCCGa > 6:191927/1‑149 (MQ=255) aTTCGCCACATCACCCCGCGTCATGAGCAAGGTGCCGGGTTCATGGCTGACGGCTATGCGCGCACCCGCGGCAAAC‑CCGGGGTATGCTTCATCATCACTGGCCCGGGCATGACCAATATCACCACTGCCATGGGCCAGGCCTATGCCGa > 5:185617/1‑149 (MQ=255) cacaTCACCCCGCGTCATGAGCAAGGTGCCGGGTTCATGGCTGACGGCTATGCGCGCACCCGCGGCAAAC‑CCGGGGTATGCTtcatcat < 5:318723/89‑1 (MQ=255) cacaTCACCCCGCGTCATGAGCAAGGTGCCGGGTTCATGGCTGACGGCTATGCGCGCACCCGCGGCAAAC‑CCGGGGTATGCTtcatcat > 6:318723/1‑89 (MQ=255) cccGCGTCATGAGCAAGGTGCCGGGTTCATGGCTGACGGCTATGCGCGCACCCGCGGCAAAC‑CCGGGGTATGCTTCATCATCACTGGCCCGGGCATGACCAATATCACCACTGCCATGGGCCAGGCCTATGCCGACTCGATCCCGATg > 2:299757/1‑148 (MQ=255) cgcgTCATGAGCAAGGTGCCGGGTTCATGGCTGACGGCTATGCGCGCACCCGCGGCAAAC‑CCGGGGTATGCTTCATCATCACTGGCCCGGGCATGACCAATATCACCACTGCCATGGGCCAGGCCTATGCCGACTCGATCCCGATGCTg < 4:296734/149‑1 (MQ=255) cgTCATGAGCAAGGTGCCGGGTTCATGGCTGACGGCTATGCGCGCACCCGCGGCAAAC‑CCGGGGTATGCTTCATCATCACTGGCCCGGGCATGACCAATATCACCACTGCCATGGGCCAGGCCTATGCCGACTCGATCCCGATGCTGGt < 4:275527/149‑1 (MQ=255) aTGAGCAAGGTGCCGGGTTCATGGCTGACGGCTATGCGCGCACCCGCGGCAAAC‑CCGGGGTATGCTTCATCATCACTGGCCCGGGCATGACCAATATCACCACTGCCATGGGCCAGGCCTATGCCGACTCGATCCCGATGCTGGTGAtt > 7:296019/1‑149 (MQ=255) gAGCAAGGTGCCGGGTTCATGGCTGACGGCTATGCGCGCACCCGCGGCAAAC‑CCGGGGTATGCTTCATCATCACTGGCCCGGGCATGACCAATATCACCACTGCCATGGGCCAGGCCTATGc > 5:166176/1‑122 (MQ=255) gAGCAAGGTGCCGGGTTCATGGCTGACGGCTATGCGCGCACCCGCGGCAAAC‑CCGGGGTATGCTTCATCATCACTGGCCCGGGCATGACCAATATCACCACTGCCATGGGCCAGGCCTATGc < 6:166176/122‑1 (MQ=255) aGCAAGGTGCCGGGTTCATGGCTGACGGCTATGCGCGCACCCGCGGCAAACGCCGGGGTATGCTTCATCATCACTGGCCCGGGCATGACCAATATCACCACTGCCATGGGCCAGGCCTATGCCGACTCGATCCCGATGCTGGTGATTTc > 1:258941/1‑149 (MQ=255) gCAAGGTGCCGGGTTCATGGCTGACGGCTATGCGCGCACCCGCGGCAAAC‑CC‑GGGTATGCTTCATCATCACTGGCCCGGGCATGACCAATATCACCACTGCCATGGGCCAGGCCTATGCCGACTCGATCCCGATGCTGGTGATTTCCa < 5:191927/148‑1 (MQ=255) cAAGGTGCCGGGTTCATGGCTGACGGCTATGCGCGCACCCGCGGCAAAC‑CCGGGGTATGATTCATCATCACTGGCCCGGGCATGACCAATATCACCACTGCCATGGGCCAGGCCTATGCCGACTCCAGCGCGATGCTGGTGATTTCCAg > 8:275478/1‑149 (MQ=255) gTGCCGGGTTCATGGCTGACGGCTATGCGCGCACCCGCGGCAaacccggcaccttgctcatgacgcggggtgatgtggcgaatggaagagcccgccaggccacgatagagctccacggtatgcacaccggggatgccgaa < 2:176763‑M2/140‑99 (MQ=255) gTGCCGGGTTCATGGCTGACGGCTATGCGCGCACCCGCGGCAaacccggcaccttgctcatgacgcggggtgatgtggcgaatggaagagcccgccaggccacgatagagctccacggtatgcacaccggggatgccgaa > 1:176763‑M2/1‑42 (MQ=255) ccGTGTTCATGGCTGACGGCTATGCGCGCACCCGCGGCAAAC‑CCGGGGTATGCTTCATCATCACTGGCCCGGGCATGACCAATATCACCACTGCCATGGGCCAGGCCTATGCCGACTCGATCCCGATGCTGGTGATTTCCAGCGTGCAg < 7:84460/149‑1 (MQ=255) ccGGGTTtgccgcgggtgcgcgcatagccgtcagccatgaacccggcaccttgctcatgacgcggggtgatgtggcgaatggaagagcccgccaggccacgatagagctccacggtatgcacaccggggatgccgaagacatgatcgac > 2:254224‑M1/1‑7 (MQ=255) ccGGGTTtgccgcgggtgcgcgcatagccgtcagccatgaacccggcaccttgctcatgacgcggggtgatgtggcgaatggaagagcccgccaggccacgatagagctccacggtatgcacaccggggatgccgaagacatgatcgac < 3:296734‑M1/149‑143 (MQ=255) ccGGGTTCATGGCTGACGGCTATGCGCGCACCCGCGGCAaacccggcaccttgctcatgacgcggggtgatgtggcgaatggaagagcccgccaggccccgatagagctccacggtatgaacaccggggatgccgaagacatgatcgac < 4:184779‑M2/149‑111 (MQ=255) ccGGGTTCATGGCTGACGGCTATGCGCGCACCCGCGGCAAAC‑CCGGGGTATGCTTCATCATCACTGGCCCGGGCATGACCAATATCACCACTGCCATGGGCCAGGCCTATGCCGACTCGATCCCGATGCTGGTGATTTCCAGCGTGCAg < 1:299757/149‑1 (MQ=255) | CGAAGTACTGGTCAAACTCCTTGAAGGCTATGGCGTCGATCATGTCTTCGGCATCCCCGGTGTGCATACCGTGGAGCTCTATCGTGGCCTGGCGGGCTCTTCCATTCGCCACATCACCCCGCGTCATGAGCAAGGTGCCGGGTTCATGGCTGACGGCTATGCGCGCACCCGCGGCAAAC‑CCGGGGTATGCTTCATCATCACTGGCCCGGGCATGACCAATATCACCACTGCCATGGGCCAGGCCTATGCCGACTCGATCCCGATGCTGGTGATTTCCAGCGTGCAG > NC_002947/1589226‑1589511 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |