| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 2976103 = | 47 (0.870) | 4 (0.080) | 3/250 | NT | 7.9% | coding (39/816 nt) | PP_2603 | hypothetical protein |
| ? | NC_002947 | 2976148 = | 48 (0.920) | coding (84/816 nt) | PP_2603 | hypothetical protein | |||||
GCGCACACTGGCGCTGATCGAAGCGATACGACAGGCAGCCCAAAGCGGTCGGGCTTGCGCGCCCGCGCACATTGGCTGATACAACCTTACTATTGCTGGTGATGATAAATGACTGATCGAATTTTTTCCCTCGCGGCCCTGACGGTGCTCGAGCTGTCTCCACCGGACATGGTCGAGGTCGCCGCCCGAGCGGGTTACAGCCATGTCGGCCTACGGCTGGTGCCAGCCACCGAACAGGAGCGGCATTTCCCGTTGGTTGCCGATGCCGAACTGCGTCGGCAAACCCAGGCGCGC > NC_002947/2975957‑2976250 | gcaggatctccaggtcgagcaccttgatgcccgtgtcgcgcaggcgcgcctgggtttgccgacgcagttcggcatcggcaaccaacgggaaatgccgctcctgttcggtggctggcaccagccgtaggccgacatggctgtaacccGCt < 4:222729‑M1/3‑1 (MQ=255) cgcTGATCGAAGCGATACGACAGGCAGCCCAAAGCGGTCGGGCTTGCGCGCCCGCGCACATTGGCTGATACAACCTTACTATTGCTGGTGATGATAAATGACTGATCGAATTTTTTCCCTCGCGGCCCTGACGGTGCTCGAGCTGtctc < 3:100517/149‑1 (MQ=255) gcTGATCGAAGCGATACGACAGGCAGCCCAAAGCGGTCGGGCTTGCGCGCCCGCGCACATTGGCTGATACAACCTTACTATTGCTGGTGATGATAAATGACTGATCGAATTTTTTCCCTCGCGGCCCTGACGGTGCTCGAGCTGTCTcc > 2:224040/1‑149 (MQ=255) cTGATCGAAGCGATACGACAGGCAGCCCAAAGCGGTCGGGCTTGCGCGCCCGCGCACATTGGCTGATACAACCTTACTATTGCTGGTGATGATAAATGACTGATCGAATTTTTTCCCTCGCGGCCCTGACGGTGCTCGAGCt < 5:188284/142‑1 (MQ=255) cTGATCGAAGCGATACGACAGGCAGCCCAAAGCGGTCGGGCTTGCGCGCCCGCGCACATTGGCTGATACAACCTTACTATTGCTGGTGATGATAAATGACTGATCGAATTTTTTCCCTCGCGGCCCTGACGGTGCTCGAGCt > 6:188284/1‑142 (MQ=255) aTCGAAGCGATACGACAGGCAGCCCAAAGCGGTCGGGCTTGCGCGCCCGCGCACATTGGCTGATACAACCTTACTATTGCTGGTGATGATAAATGACTGATCGAATTTTTTCCCTCGCGGCCCTGACGGTGCTCGAGCTGTCTCCACCg < 5:167427/149‑1 (MQ=255) tCGAAGCGATACGACAGGCAGCCCAAAGCGGTCGGGCTTGCGCGCCCGCGCACATTGGCTGATACAACCTTACTATTGCTGGTGATGATAAATGACTGATCGAATTTTTTCCCTCGCGGCCCTGACGGTGCTCGAGCTGTCTCCACCgg < 6:44175/149‑1 (MQ=255) gAAGCGATACGACAGGCAGCCCAAAGCGGTCGGGCTTGCGCGCCCGCGCACATTGGCTGATACAACCTTACTATTGCTGGTGATGATAAATGACTGATCGAATTTTTTCCCTCGCGGCCCTGACGGTGCTCGAGCTGt < 5:239974/138‑1 (MQ=255) gAAGCGATACGACAGGCAGCCCAAAGCGGTCGGGCTTGCGCGCCCGCGCACATTGGCTGATACAACCTTACTATTGCTGGTGATGATAAATGACTGATCGAATTTTTTCCCTCGCGGCCCTGACGGTGCTCGAGCTGt > 6:239974/1‑138 (MQ=255) gAAGCGATACGACAGGCAGCCCAAAGCGGTCGGGCTTGCGCGCCCGCGCACATTGGCTGATACAACCTTACTATTGCTGGTGATGATAAATGACTGATCGAATTTTTTCCCTCGCGGCCCTGACGGTGCTCGAGCTGTCTCCACCGGa > 7:190647/1‑148 (MQ=255) gCGATACGACAGGCAGCCCAAAGCGGTCGGGCTTGCGCGCCCGCGCACATTGGCTGATACAACCTTACTATTGCTGGTGATGATAAATGACTGATCGAATTTTTTCCCTCGCGGCCCTGACGGTGCTCGAGCTGTCTCCACCGGACATg > 8:1381/1‑149 (MQ=255) cGATACGACAGGCAGCCCAAAGCGGTCGGGCTTGCGCGCCCGCGCACATTGGCTGATACAACCTTACTATTGCTGGTGATGATAAATGACTGATCGAATTTTTTCCCTCGCGGCCCTGACGGTGCTCGAGCTGTCTCCACCGGACATgg > 4:147017/1‑149 (MQ=255) gACAGGCAGCCCAAAGCGGTCGGGCTTGCGCGCCCGCGCACATTGGCTGATACAACCTTACTATTGCTGGTGATGATAAATGACTGATCGAATTTTTTCCCTCGCGGCCCTGACGGTGCTCGAGCTGTCTCCACCGGACATGGTCGAgg > 7:63124/1‑149 (MQ=255) ccAAAGCGGTCGGGCTTGCGCGCCCGCGCACATTGGCTGATACAACCTTACTATTGCTGGTGATGATAAATGACTGATCGAATTTTTTCCCTCGCGGCCCTGACGGTGCTCGAGCTGTCTCCACCGGACATGGTCGAGGTcgcc < 6:259536/144‑1 (MQ=255) ccAAAGCGGTCGGGCTTGCGCGCCCGCGCACATTGGCTGATACAACCTTACTATTGCTGGTGATGATAAATGACTGATCGAATTTTTTCCCTCGCGGCCCTGACGGTGCTCGAGCTGTCTCCACCGGACATGGTCGAGGTcgcc > 5:259536/1‑144 (MQ=255) ccAAAGCGGTCGGGCTTGCGCGCCCGCGCACATTGGCTGATACAACCTTACTATTGCTGGTGATGATAAATGACTGATCGAATTTTTTCCCTCGCGGCCCTGACGGTGCTCGAGCTGTCTCCACCGGACATGGTCGAGGTCGCCGccc > 4:172003/1‑148 (MQ=255) aaaGCGGTCGGGCTTGCGCGCCCGCGCACATTGGCTGATACAACCTTACTATTGCTGGTGATGATAAATGACTGATCGAATTTTTTCCCTCGCGGCCCTGACGGTGCTCGAGCTGTCTCCACCGGACATGGTCGAGGTCGCCGCCCGAg > 7:230232/1‑149 (MQ=255) aaGCGGTCGGGCTTGCGCGCCCGCGCACATTGGCTGATACAACCTTACTATTGCTGGTGATGATAAATGACTGATCGAATTTTTTCCCTCGCGGCCCTGACGGTGCTCGAGCTGTCTCCACCGGACATGGTCGAGGTCGCCGCCCGAGc < 8:297807/149‑1 (MQ=255) cgcgcctgggtttgccgacgcagttcggcatcggcaaccaacgggaaatgccgctcctgttcggtggctggcaccagccgtaggccgacatggctgtaacccGCTCGAGCTGTCTCCACCGGACATGGTCGAGGTCGCCGCCCGAGCgg > 4:186116‑M1/103‑149 (MQ=255) cgcgcctgggtttgccgacgcagttcggcatcggcaaccaacgggaaatgccgctcctgttcggtggctggcaccagccgtaggccgacatggctgtaacccGCTCGAGCTGTCTCCACCGGACATGGTCGAGGTCGCCGCCCGAGCgg > 2:329400‑M1/103‑149 (MQ=255) ggTCGGGCTTGCGCGCCCGCGCACATTGGCTGATACAACCTTACTATTGCTGGTGATGATAAATGACTGATCGAATTTTTTCCCTCGCGGCCCTGACGGTGCTCGAGCTGTCTCCACCGGACATGGTCGAGGTCGCCGCCCGAGCGGGt < 8:190647/149‑1 (MQ=255) gggCTTGCGCGCCCGCGCACATTGGCTGATACAACCTTACTATTGCTGGTGATGATAAATGACTGATCGAATTTTTTCCCTCGCGGCCCTGACGGTGCTCGAGCTGTCTCCACCGGACATGGTCGAGGTCGCCGCCCGAGCGGGTTACa < 6:299006/149‑1 (MQ=255) ggtttgccgacgcagttcggcatcggcaaccaacgggaaatgccgctcctgttcggtggctggcaccagccgtaggccgacatggctgtaacccGCTCGAGCTGTCTCCACCGGACATGGTCGAGGTCGCCGCCCGAGCg > 1:134080‑M1/95‑140 (MQ=255) ggtttgccgacgcagttcggcatcggcaaccaacgggaaatgccgctcctgttcggtggctggcaccagccgtaggccgacatggctgtaacccGCTCGAGCTGTCTCCACCGGACATGGTCGAGGTCGCCGCCCGAGCg < 2:134080‑M1/46‑1 (MQ=255) cgcCCGCGCACATTGGCTGATACAACCTTACTATTGCTGGTGATGATAAATGACTGATCGAATTTTTTCCCTCGCGGCCCTGACGGTGCTCGAGCTGTCTCCACCGGACATGGTCGAGGTCGCCGCCCGAGCGGGTTACAGCCATGTCg < 7:1381/149‑1 (MQ=255) gcgcACATTGGCTGATACAACCTTACTATTGCTGGTGATGATAAATGACTGATCGAATTTTTTCCCTCGCGGCCCTGACGGTGCTCGAGCTGTCTCCACCGGACATGGTCGAGGTCGCCGCCCGAGCGGGTTACAGCCATGTCGGCCTa < 3:172003/149‑1 (MQ=255) gcACATTGGCTGATACAACCTTACTATTGCTGGTGATGATAAATGACTGATCGAATTTTTTCCCTCGCGGCCCTGACGGTGCTCGAGCTGTCTCCACCGGACATGGTCGAGGTCGCCGCCCGAGCGGGTTACAGCCATGTCGGCCTACg < 1:224040/149‑1 (MQ=255) ttGGCTGATACAACCTTACTATTGCTGGTGATGATAAATGACTGATCGAATTTTTTCCCTCGCGGCCCTGACGGTGCTCGAGCTGTCTCCACCGGACATGGTCGAGGTCGCCGCCCGAGCGGGTTACAGCCATg > 6:12355/1‑134 (MQ=255) ttGGCTGATACAACCTTACTATTGCTGGTGATGATAAATGACTGATCGAATTTTTTCCCTCGCGGCCCTGACGGTGCTCGAGCTGTCTCCACCGGACATGGTCGAGGTCGCCGCCCGAGCGGGTTACAGCCATg < 5:12355/134‑1 (MQ=255) tGATACAACCTTACTATTGCTGGTGATGATAAATGACTGATCGAATTTTTTCCCTCGCGGCCCTGACGGTGCTCGAGCTGTCTCCACCGGACATGGTCGAGGTCGCCGCCCGAGCGGGTTACAGCCATGTCGGCCTACGGCTGGTgc > 7:191435/1‑147 (MQ=255) tACAACCTTACTATTGCTGGTGATGATAAATGACTGATCGAATTTTTTCCCTCGCGGCCCTGACGGTGCTCGAGCTGTCTCCACCGGACATGGTCGAGGTCGCCGCCCGAGCGGGTTACAGcc < 6:223201/123‑1 (MQ=255) tACAACCTTACTATTGCTGGTGATGATAAATGACTGATCGAATTTTTTCCCTCGCGGCCCTGACGGTGCTCGAGCTGTCTCCACCGGACATGGTCGAGGTCGCCGCCCGAGCGGGTTACAGcc > 5:223201/1‑123 (MQ=255) aCTATTGCTGGTGATGATAAATGACTGATCGAATTTTTTCCCTCGCGGCCCTGACGGTGCTCGAGCTGTCTCCACCGGACATGGTCGAGGTCGCCGCCCGAGCGGGTTACAGCCATGTCGGCCTACGGCTGGTGCCAGCCACCGAACa < 3:147017/148‑1 (MQ=255) tATTGCTGGTGATGATAAATGACTGATCGAATTTTTTCCCTCGCGGCCCTGACGGTGCTCGAGCTGTCTCCACCGGACATGGTCGAGGTCGCCGCCCGAGCGGGTTACAGCCATGTCGGCCTACGGCTGGt < 8:167144/131‑1 (MQ=255) tATTGCTGGTGATGATAAATGACTGATCGAATTTTTTCCCTCGCGGCCCTGACGGTGCTCGAGCTGTCTCCACCGGACATGGTCGAGGTCGCCGCCCGAGCGGGTTACAGCCATGTCGGCCTACGGCTGGt > 7:167144/1‑131 (MQ=255) gatAAATGACTGATCGAATTTTTTCCCTCGCGGCCCTGACGGTGCTCGAGCTGTCTCCACCGGACATGGTCGAGGTCGCCGCCCGAGCGGGTTACAGCCATGTCGGCCTACGGCTGGTGCCAGCCACCGAACAGGAGCGGCATTTCCCg > 8:183913/1‑149 (MQ=255) gatAAATGACTGATCGAATTTTTTCCCTCGCGGCCCTGACGGTGCTCGAGCTGTCTCCACCGGACATGGTCGAGGTCGCCGCCCGAGCGGGTTACAGCCATGTCGGCCTACGGCTGGTGCCAGCCACCGAACAGGAGCGGCATTTCCCg > 8:285912/1‑149 (MQ=255) tAAATGACTGATCGAATTTTTTCCCTCGCGGCCCTGACGGTGCTCGAGCTGTCTCCACCGGACATGGTCGAGGTCGCCGCCCGAGCGGGTTACAGCCATGTCGGCCTACGGCTGGTGCCAGCCACCGAACAGGAGCGGCATTTCCCgtt < 8:191435/149‑1 (MQ=255) aaaTGACTGATCGAATTTTTTCCCTCGCGGCCCTGACGGTGCTCGAGCTGTCTCCACCGGACATGGTCGAGGTCGCCGCCCGAGCGGGTTACAGCCATGTCGGCCTACTGCTGGTGCCAGCCACCGAACAGGAGCGGCATTTCCCgttg > 7:133703/1‑149 (MQ=255) aaaTGACTGATCGAATTTTTTCCCTCGCGGCCCTGACGGTGCTCGAGCTGTCTCCACCGGACATGGTCGAGGTCGCCGCCCGAGCGGGTTACAGCCATGTCGGCCTACGGCTGGTGCCAGCCACCGAACAGGAGCGGCATTTCCCgttg > 5:193058/1‑149 (MQ=255) gATCGAATTTTTTCCCTCGCGGCCCTGACGGTGCTCGAGCTGTCTCCACCGGACATGGTCGAGGTCGCCGCCCGAGCGGGTTACAGCCATGTCGGCCTACGGCTGGTGCCAGCCACCGAACAGGAGCGGCATTTCCCGTTGGTtgccga > 5:284217/1‑149 (MQ=255) tCGAATTTTTTCCCTCGCGGCCCTGACGGTGCTCGAGCTGTCTCCACCGGACATGGTCGAGGTCGCCGCCCGAGCGGGTTACAGCCATGTCGGCCTACGGCTGGTGCCAGCCACCGAACAGGAGCGGCATTTCCCGTTGGTtgccgatg > 7:2959/1‑149 (MQ=255) gAATTTTTTCCCTCGCGGCCCTGACGGTGCTCGAGCTGTCTCCACCGGACATGGTCGAGGTCGCCGCCCGAGCGGGTTACAGCCATGTCGGCCTACGGCTGGTGCCAGCCACCGAACAGGAGCGGCATTTCCCGTTGGTtgccgatgcc > 8:185031/1‑149 (MQ=255) ttttttCCCTCGCGGCCCTGACGGTGCTCGAGCTGTCTCCACCGGACATGGTCGAGGTCGCCGCCCGAGCGGGTTACAGCCATGTCGGCCTACGGCTGGTGCCAGCCACCGAACAGGAGCGGCATTTCCCGTTGGTTGCCGATGCCGaa > 3:14141/1‑149 (MQ=255) tCCCTCGCGGCCCTGACGGTGCTCGAGCTGTCTCCACCGGACATGGTCGAGGTCGCCGCCCGAGCGGGTTACAGCCATGTCGGCCTACGGCTGGTGCCAGCCACCGAACAGGAGCGGCATTTCCCGTTGGTTGCCGATGCCGAACTGc < 7:185031/148‑1 (MQ=255) cccTCGCGGCCCTGACGGTGCTCGAGCTGTCTCCACCGGACATGGTCGAGGTCGCCGCCCGAGCGGGTTACAGCCATGTCGGCCTACGGCTGGTGCCAGCCACCGAACAGGAGCGGCATTTCCCGTTGGTTGCCGATGCCGAACTGCGt > 5:3288/1‑149 (MQ=255) ccTCGCGGCCCTGACGGTGCTCGAGCTGTCTCCACCGGACATGGTCGAGGTCGCCGCCCGAGCGGGTTACAGCCATGTCGGCCTACGGCTGGTGCCAGCCACCGAACAGGAGCGGCATTTCCCGTTGGTTGCCGATGCCGAACTGCGt < 8:194584/148‑1 (MQ=255) ccTCGCGGCCCTGACGGTGCTCGAGCTGTCTCCACCGGACATGGTCGAGGTCGCCGCCCGAGCGGGTTACAGCCATGTCGGCCTACGGCTGGTGCCAGCCACCGAACAGGAGCGGCATTTCCCGTTGGTTGCCGATGCCGAACTGCGTc < 5:170514/149‑1 (MQ=255) cTCGCGGCCCTGACGGTGCTCGAGCTGTCTCCACCGGACATGGTCGAGGTCGCCGCCCGAGCGGGTTACAGCCATGTCGGCCTACGGCTGGTGCCAGCCACCGAACAGGAGCGGCATTTCCCGTTGGTTGCCGATGCCGAACTGCGTCg < 7:183913/149‑1 (MQ=255) tCGCGGCCCTGACGGTGCTCGAGCTGTCTCCACCGGACATGGTCGAGGTCGCCGCCCGAGCGGGTTACAGCCATGTCGGCCTACGGCTGGTGCCAGCCACCGAACAGGAGCGGCATTTCCCgttggtt < 8:92612/128‑1 (MQ=255) tCGCGGCCCTGACGGTGCTCGAGCTGTCTCCACCGGACATGGTCGAGGTCGCCGCCCGAGCGGGTTACAGCCATGTCGGCCTACGGCTGGTGCCAGCCACCGAACAGGAGCGGCATTTCCCgttggtt > 7:92612/1‑128 (MQ=255) tGACGGTGCTCGAGCTGTCTCCACCGGACATGGTCGAGGTCGCCGCCCGAGCGGGTTACAGCCATGTCGGCCTACGGCTGGTGCCAGCCACCGAACAGGAGCGGCATTTCCCGTTGGTTGCCGATGCCGAACTGCGTCGGCAAACCCAg > 5:189077/1‑149 (MQ=255) aCGGTGCTCGAGCTGTCTCCACCGGACATGGTCGAGGTCGCCGCCCGAGCGGGTTACAGCCATGTCGGCCTACGGCTGGTGCCAGCCACCGAACAGGAGCGGCATTTCCCGTTGGTtgccgat < 4:206903/123‑1 (MQ=255) aCGGTGCTCGAGCTGTCTCCACCGGACATGGTCGAGGTCGCCGCCCGAGCGGGTTACAGCCATGTCGGCCTACGGCTGGTGCCAGCCACCGAACAGGAGCGGCATTTCCCGTTGGTtgccgat > 3:206903/1‑123 (MQ=255) ggTGCTCGAGCTGTCTCCACCGGACATGGTCGAGGTCGCCGCCCGAGCGGGTTACAGCCATGTCGGCCTACGGCTGGTGCCAGCCACCGAACAGGAGCGGCATTTCCCGTTGGTTGCCGATGCCGAACTGCGTCGGCAAACCCAGgcgc > 6:116931/1‑149 (MQ=255) ggTGCTCGAGCTGTCTCCACCGGACATGGTCGAGGTCGCCGCCCGAGCGGGTTACAGCCATGTCGGCCTACGGCTGGTGCCAGCCACCGAACAGGAGCGGCATTTCCCGTTGGTTGCCGATGCCGAACTGCGTCGGCAAACCCAGgcgc < 8:230232/149‑1 (MQ=255) ggTGCTCGAGCTGTCTCCACCGGACATGGTCGAGGTCGCCGCCCGAGCGGGTTACAGCCATGTCGGCCTACGGCTGGTGCCAGCCACCGAACAGGAGCGGCATTTCCCGTTGGTTGCCGATGCCGAACTGCGTCGGCAAACCCAGgcgc > 3:163321/1‑149 (MQ=255) tGCTCGAGCTGTCTCCACCGGACATGGTCGAGGTCGCCGCCCGAGCGGGTTACAGCCATGTCGGCCTACGGCTGGTGCCAGCCACCGAACAGGAGCGGCATTTCCCGTTGGTTGCCGATGCCGAACTGCGTCGGCAAACCCAGgcgcgc > 1:187646/1‑149 (MQ=255) | GCGCACACTGGCGCTGATCGAAGCGATACGACAGGCAGCCCAAAGCGGTCGGGCTTGCGCGCCCGCGCACATTGGCTGATACAACCTTACTATTGCTGGTGATGATAAATGACTGATCGAATTTTTTCCCTCGCGGCCCTGACGGTGCTCGAGCTGTCTCCACCGGACATGGTCGAGGTCGCCGCCCGAGCGGGTTACAGCCATGTCGGCCTACGGCTGGTGCCAGCCACCGAACAGGAGCGGCATTTCCCGTTGGTTGCCGATGCCGAACTGCGTCGGCAAACCCAGGCGCGC > NC_002947/2975957‑2976250 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |