New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3255679 = | 48 (0.890) | 4 (0.080) | 4/248 | NT | 8.0% | coding (59/2202 nt) | PP_2852 | sulfatase domain‑containing protein |
? | NC_002947 | 3255714 = | 46 (0.890) | coding (24/2202 nt) | PP_2852 | sulfatase domain‑containing protein |
GCCGCCCAGGCCAGCAGCACGGGCAGCGCCAGCCACCACGGCCTGCGGTGTAGCAGCACTATCAACAGGCTGCCGAGGGCGAGATCGGACAGGTAACCGAACGGGTTGGACCAACCCAGCATGGCGCGCGTACCCAGTGGGATCACCAGCACCAGAGCCGCCAAAGTGGCAAGCCGGGTGCTTGGGTGGTCGGACAGGTTCTTCACAAAAACTTCCCTTTTGCCATTAAATCGTCATGCATCTGTGCTTGATGATATCAGGCCAGGGCAGGGAAGGCGGCCAGTTACAAGGCTTGT > NC_002947/3255532‑3255827 | gccgggcctgtgcgaacgggcccggctttggttacaagccttgtaactggccgccttccctgccctggcctgatatcatcaagcacagatgcatgacgatttaatggcaaaagggaagtttttgtgaagaacctgtccgaccacccaAg < 6:1760‑M1/2‑1 (MQ=255) gccgggcctgtgcgaacgggcccggctttggttacaagccttgtaactggccgccttccctgccctggcctgatatcatcaagcacagatgcatgacgatttaatggcaaaagggaagtttttgtgaagaacctgtccgaccacccaAg > 5:1760‑M1/148‑149 (MQ=255) gccgggcccgttcgcacaggcccggctttggttacaagccttgtaactggccgccttccctgccctggcctgatatcatcaagcacagatgcatgacgatttaatggcaaaagggaagtttttgtgaagaacctgtccgaccacccaAg < 4:180451‑M1/2‑1 (MQ=255) gccgccCAGGCCAGCAGCACGGGCAGCGCCAGCCACCACGGCCTGCGGTGTAGCAGCACTATCAACAGGCTGCCGAGGGCGAGATCGGACAGGTAACCGAACGGGTTGGACCAACCCAGCATGGCGCGCGTACCCAGTGGGATcaccag > 7:203464/1‑149 (MQ=255) gccCAGGCCAGCAGCACGGGCAGCGCCAGCCACCACGGCCTGCGGTGTAGCAGCACTATCAACAGGCTGCCGAGGGCGAGATCGGACAGGTAACCGAACGGGTTGGACCAACCCAGCATGGCGCGCGTACCCAGTGGGATcaccagcac > 1:323156/1‑149 (MQ=255) cagcagCACGGGCAGCGCCAGCCACCACGGCCTGCGGTGTAGCAGCACTATCAACAGGCTGCCGAGGGCGAGATCGGACAGGTAACCGAACGGGTTGGCCCAACCCAGCATGGCGCGCGTACCCAGTGGGATCACCAGCACCAGAgccg > 5:62026/1‑149 (MQ=255) ggCAGCGCCAGCCACCACGGCCTGCGGTGTAGCAGCACTATCAACAGGCTGCCGAGGGCGAGATCGGCCAGGTACCCGAACGGGTTGGACCAACCCAGCATGGCGCGCGTACCCAGTGGGATCACCAGCACCAGAGCCGCCAAAGTgg > 7:159296/1‑148 (MQ=255) ggCAGCGCCAGCCACCACGGCCTGCGGTGTAGCAGCACTATCAACAGGCTGCCGAGGGCGAGATCGGACAGGTAACCGAACGGGTTGGACCAACCCAGCATGGCACGCGTACCCAGTGGGATCACCAGCACCAGAGCCGCCAAAGTGGc < 2:159856/149‑1 (MQ=255) aGCGCCAGCCACCACGGCCTGCGGTGTAGCAGCACTATCAACAGGCTGCCGAGGGCGAGATCGGACAGGTACCCGAACGGGTTGGACCCACCCAGCCTGGCGCGCGTACCCAGTGGGATCACCAGCACCAGAGCCGCCAAAGTGGCAAg > 7:155249/1‑149 (MQ=255) ccagccaCCACGGCCTGCGGTGTAGCAGCACTATCAACAGGCTGCCGAGGGCGAGATCGGACAGGTAACCGAACGGGTTGGACCAACCCAGCATGGCGCGCGTACCCAGTGGGATCACCAGCACCAGAGCCGCCAAAGTGGCAAGCCgg < 2:323156/149‑1 (MQ=255) ttacaagccttgtaactggccgccttccctgccctggcctgatatcatcaagcacagatgcatgacgatttaatggcaaaagggaagtttttgtgaagaacctgtccgaccacccaAGCACCAGAGCCGCCAAAGTGGCAAGCCGGGTg < 5:38431‑M1/33‑1 (MQ=255) caagccttgtaactggccgccttccctgccctggcctgatatcatcaagcacagatgcatgacgatttaatggcaaaagggaagtttttgtgaagaacctgtccgaccacccaAGCACCAGAGCCGCCAAAGTGGCAAGCCGGGTGCtt > 6:38431‑M1/114‑149 (MQ=255) cacGGCCTGCGGTGTAGCAGCACTATCAACAGGCTGCCGAGGGCGAGATCGGACAGGTAACCGAACGGGTTGGACCAACCCAGCATGGCGCGCGTACCCAGTGGGATCACCAGCACCAGAGCCGCCAAAGTGGCAAGCCGGGTGCTTgg < 8:203464/149‑1 (MQ=255) cGGCCTGCGGTGTAGCAGCACTATCAACAGGCTGCCGAGGGCGAGATCGGACAGGTAACCGAACGGGTTGGACCAACCCAGCATGGCGCGCGTACCCAGTGGGATCACCAGCACCAGAGCCGCCAAAGTGGCAAGCCGGGTGCTTGggt > 7:206353/1‑149 (MQ=255) ggTGTAGCAGCACTATCAACAGGCTGCCGAGGGCGAGATCGGACAGGTAACCGAACGGGTTGGACCAACCCAGCATGGCGCGCGTACCCAGTGGGATCACCAGCACCAGAGCCGCCAAAGTGGCAAGCCGGGTGCTTgg > 4:206495/1‑139 (MQ=255) ggTGTAGCAGCACTATCAACAGGCTGCCGAGGGCGAGATCGGACAGGTAACCGAACGGGTTGGACCAACCCAGCATGGCGCGCGTACCCAGTGGGATCACCAGCACCAGAGCCGCCAAAGTGGCAAGCCGGGTGCTTgg < 3:206495/139‑1 (MQ=255) gtAGCAGCACTATCAACAGGCTGCCGAGGGCGAGATCGGACAGGTAACCGAACGGGTTGGACCAACCCAGCATGGCGCGCGTACCCAGTGGGATCACCAGCACCAGAGCCGCCAAAGTGGCAAGCCGGGTGCTTGGGTGGTCGGa > 7:44985/1‑145 (MQ=255) gtAGCAGCACTATCAACAGGCTGCCGAGGGCGAGATCGGACAGGTAACCGAACGGGTTGGACCAACCCAGCATGGCGCGCGTACCCAGTGGGATCACCAGCACCAGAGCCGCCAAAGTGGCAAGCCGGGTGCTTGGGTGGTCGGa < 8:44985/145‑1 (MQ=255) cagcaCTATCAACAGGCTGCCGAGGGCGAGATCGGACAGGTAACCGAACGGGTTGGACCAACCCAGCATGGCGCGCGTACCCAGTGGGATCACCAGCACCAGAGCCGCCAAAGTGGCAAGCCGGGTGCTTGGGTGGTCGGACAGGttct > 4:309981/1‑149 (MQ=255) cagcaCTATCAACAGGCTGCCGAGGGCGAGATCGGACAGGTAACCGAACGGGTTGGACCAACCCAGCATGGCGCGCGTACCCAGTGGGATCACCAGCACCAGAGCCGCCAAAGTGGCAAGCCGGGTGCTTGGGTGGTCGGACAGGttct > 2:153238/1‑149 (MQ=255) agcaCTATCAACAGGCTGCCGAGGGCGAGATCGGACAGGTAACCGAACGGGTTGGACCAACCCAGCATGGCGCGCGTACCCAGTGGGATCACCAGCACCAGAGCCGCCAAAGTGGCAAGCCGGGTGCTTGGGTGGTCGGACAGGttctt > 2:220721/1‑149 (MQ=255) gcaCTATCAACAGGCTGCCGAGGGCGAGATCGGACAGGTAACCGAACGGGTTGGACCAACCCAGCATGGCGCGCGTACCCAGTGGGATCACCAGCACCAGAGCCGCCAAAGTGGCAAGCCGGGTGCTTGggtg < 5:219652/133‑1 (MQ=255) gcaCTATCAACAGGCTGCCGAGGGCGAGATCGGACAGGTAACCGAACGGGTTGGACCAACCCAGCATGGCGCGCGTACCCAGTGGGATCACCAGCACCAGAGCCGCCAAAGTGGCAAGCCGGGTGCTTGggtg > 6:219652/1‑133 (MQ=255) caCTATCAACAGGCTGCCGAGGGCGAGATCGGACAGGTAACCGAACGGGTTGGACCAACCCAGCATGGCGCGCGTACCCAGTGGGATCACCAGCACCAGAGCCGCCAAAGTGGCAAGCCGGGTGCTTGGGTGGTCGGACAGGTTCTTca > 1:112189/1‑149 (MQ=255) aCTATCAACAGGCTGCCGAGGGCGAGATCGGACAGGTAACCGAACGGGTTGGACCAACCCAGCATGGCGCGCGTACCCAGTGGGATCACCAGCACCAGAGCCGCCAAAGTGGCAAGCCGGGTGCTTGGGTGGTCGGACAGGTTCTTca > 8:82026/1‑148 (MQ=255) ctgccctggcctgatatcatcaagcacagatgcatgacgatttaatggcaaaagggaagtttttgtgaagaacctgtccgaccacccaAGCACCAGAGCCGCCAAAGTGGCAAGCCGGGTGCTTGggt < 2:193034‑M1/40‑1 (MQ=255) ctgccctggcctgatatcatcaagcacagatgcatgacgatttaatggcaaaagggaagtttttgtgaagaacctgtccgaccacccaAGCACCAGAGCCGCCAAAGTGGCAAGCCGGGTGCTTGggt > 1:193034‑M1/89‑128 (MQ=255) tCAACAGGCTGCCGAGGGCGAGATCGGACAGGTAACCGAACGGGTTGGACCAACCCAGCATGGCGCGCGTACCCAGTGGGATCACCAGCACCAGAGCCGCCAAAGTGGCAAGCCGGGTGCTTGGGTGGTCGGACAGGTTCTTCACaaa > 2:346849/1‑148 (MQ=255) tCAACAGGCTGCCGAGGGCGAGATCGGACAGGTAACCGAACGGGTTGGACCAACCCAGCATGGCGCGCGTACCCAGTGGGATCACCAGCACCAGAGCCGCCAAAGTGGCAAGCCGGGTGCTTGGGTGGTCGGACAGGTTCTTCACaaa > 8:31052/1‑148 (MQ=255) aCAGGCTGCCGAGGGCGAGATCGGACAGGTAACCGAACGGGTTGGACCAACCCAGCATGGCGCGCGTACCCAGTGGGATCACCAGCACCAGAGCCGCCAAAGTGGCAAGCCGGGTGCTTGGGTGGTCGGACAGGTTCTTCACAAAAACt > 7:251789/1‑149 (MQ=255) ccGAGGGCGAGATCGGACAGGTAACCGAACGGGTTGGACCAACCCAGCATGGCGCGCGTACCCAGTGGGATCACCAGCACCAGAGCCGCCAAAGTGGCAAGCCGGGTGCTTGGGTGGTCGGACAGGTTCTTCACAAAAACTTCCCtttt < 7:47062/149‑1 (MQ=255) ccGAGGGCGAGATCGGACAGGTAACCGAACGGGTTGGACCAACCCAGCATGGCGCGCGTACCCAGTGGGATCACCAGCACCAGAGCCGCCAAAGTGGCAAGCCGGGTGCTTGGGTGGTCGGACAGGTTCTTCACAAAAACTTCCCtttt < 1:220721/149‑1 (MQ=255) gcgggCGAGATCGGACAGGTAACCGAACGGGTTGGACCAACCCAGCATGGCGCGCGTACCCAGTGGGATCACCAGCACCAGAGCCGCCAAAGTGGCAAGCCGGGGGCTTGGGTGGTCGGACAGGTTCTTCACAAAAACTTCCCTTTTGc < 8:155249/147‑1 (MQ=255) gAGGGCGAGATCGGACAGGTAACCGAACGGGTTGGACCAACCCAGCATGGCGCGCGTACCCAGTGGGATCACCAGCACCAGAGCCGCCAAAGTGGCAAGCCGGGTGCTTGGGTGGTCGGACAGGTTCTTCACAAAAACCTc < 7:99551/141‑1 (MQ=255) gAGGGCGAGATCGGACAGGTAACCGAACGGGTTGGACCAACCCAGCATGGCGCGCGTACCCAGTGGGATCACCAGCACCAGAGCCGCCAAAGTGGCAAGCCGGGTGCTTGGGTGGTCGGACAGGTTCTTCACAAAAACATc > 8:99551/1‑141 (MQ=255) aGGGCGAGATCGGACAGGTAACCGAACGGGTTGGACCAACCCAGCATGGCGCGCGTACCCAGTGGGATCACCAGCACCAGAGCCGCCAAAGTGGCAAGCCGGGTGCTTGGGTGGTCGGACAGGTTCTTca > 4:166799/1‑130 (MQ=255) aGGGCGAGATCGGACAGGTAACCGAACGGGTTGGACCAACCCAGCATGGCGCGCGTACCCAGTGGGATCACCAGCACCAGAGCCGCCAAAGTGGCAAGCCGGGTGCTTGGGTGGTCGGACAGGTTCTTca < 3:166799/130‑1 (MQ=255) ggCGAGATCGGACAGGTAACCGAACGGGTTGGACCAACCCAGCATGGCGCGCGTACCCAGTGGGATCACCAGCACCAGAGCCGCCAAAGTGGCAAGCCGGGTGCTTGGGTGGTCGGACAGGTTCTTCACAAAAACTTCCCTTTTGCCAt > 1:198180/1‑149 (MQ=255) agaTCGGACAGGTAACCGAACGGGTTGGACCAACCCAGCATGGCGCGCGTACCCAGTGGGATCACCAGCACCAGAGCCGCCAAAGTGGCAAGCCGGGTGCTTGGGTGGTCGGACAGGTTCTTCACAAAAACTTCCCTTTTGCCATTaaa < 8:206353/149‑1 (MQ=255) aTCGGACAGGTAACCGAACGGGTTGGACCAACCCAGCATGGCGCGCGTACCCAGTGGGATCACCAGCACCAGAGCCGCCAAAGTGGCAAGCCGGGTGCTTGGGTGGTCGGACAGGTTCTTCACAAAAACTTCCCTTTTGCCATTAAAt < 2:265962/148‑1 (MQ=255) aTCGGACAGGTAACCGAACGGGTTGGACCAACCCAGCATGGCGCGCGTACCCAGTGGGATCACCAGCACCAGAGCCGCCAAAGTGGCAAGCCGGGTGCTTGGGTGGTCGGACAGGTTCTTCACAAAAACTTCCCTTTTGCCATTAAATc < 8:251789/149‑1 (MQ=255) ggACCGGTAACCGAACGGGTTGGACCAACCCAGCATGGCGCGCGTACCCAGGGGGATCACCAGCACCAGAGCCGCCAAAGTGGCAAGCCGGGTGCTTGGGTGGTCGGACAGGTTCTTCACAAAACCTTCCCTTTTGCCATTAAATCGTc < 8:159296/149‑1 (MQ=255) ggACAGGTAACCGAACGGGTTGGACCAACCCAGCATGGCGCGCGTACCCAGTGGGATCACCAGCACCAGAGCCGCCAAAGTGGCAAGCCGGGTGCTTGGGTGGTCGGACAGGTTCTTCACAAAAACTTCCCTTTTGCCATTAAATCGTc < 7:82026/149‑1 (MQ=255) gACAGGTAACCGAACGGGTTGGACCAACCCAGCATGGCGCGCGTACCCAGTGGGATCACCAGCACCAGAGCCGCCAAAGTGGCAAGCCGGGTGCTTGGGTGGTCGGACAGGTTCTTCACAAAAACTTCCCTTTTGCCATTAAATCGTCa < 2:112189/149‑1 (MQ=255) aGGTAACCGAACGGGTTGGACCAACCCAGCATGGCGCGCGTACCCAGTGGGATCACCAGCACCAGAGCCGCCAAAGTGGCAAGCCGGGTGCTTGGGTGGTCGGACAGGTTCTTCACAAAAACTTCCCTTTTGCCATTAAATCGTCATGc < 1:153238/149‑1 (MQ=255) tAACCGAACGGGTTGGACCAACCCAGCATGGCGCGCGTACCCAGTGGGATCACCAGCACCAGAGCCGCCAAAGTGGCAAGCCGGGTGCTTGGGTGGTCGGACAGGTTCTTCACAAAAACTTCCCTTTTGCCATTAAATCGTCATGCATc > 3:113152/1‑149 (MQ=255) ggTTGGACCAACCCAGCATGGCGCGCGTACCCAGTGGGATCACCAGCACCAGAGCCGCCAAAGTGGCAAGCCGGGTGCTTGGGTGGTCGGACAGGTTCTTCACAAAAACTTCCCTTTTGCCATTAAATCGTCATGCATCTGTGCTtgat < 1:346849/149‑1 (MQ=255) ggTTGGACCAACCCAGCATGGCGCGCGTACCCAGTGGGATCACCAGCACCAGAGCCGCCAAAGTGGCAAGCCGGGTGCTTGGGTGGTCGGACAGGTTCTTCACAAAAACTTCCCTTTTGCCATTAAATCGTCATGCATCTGTGCTtgat < 6:62026/149‑1 (MQ=255) aGCATGGCGCGCGTACCCAGTGGGATCACCAGCACCAGAGCCGCCAAAGTGGCAAGCCGGGAAGATGGGGGGTCGGGCAGGTTCTTCCCAAAAACATACCGTTTGCCATTAAATCCGCATGCATCAGTGCTTGAAGCTATGAGGCcagg > 1:99621/1‑149 (MQ=255) tGGCGCGCGTACCCAGTGGGATCACCAGCACCAGAGCCGCCAAAGTGGCAAGCCGGGTGCTTGGGTGGTCGGACAGGTTCTTCACAAAAACTTCCCTTTTGCCATTAAATCGTCATGCATCTGTGCTTGATGATATCAGGCcagggcag < 1:179976/149‑1 (MQ=255) ggCGCGCGTACCCAGTGGGATCACCAGCACCAGAGCCGCCAAAGTGGCAAGCCGGGTGCTTGGGTGGTCGGACAGGTTCTTCACAAAAACTTCCCTTTTGCCATTAAATCGTCATGCATCTGTGCTTGATGATATCAGGCcagggcagg > 3:185537/1‑149 (MQ=255) cgcgcgTACCCAGTGGGATCACCAGCACCAGAGCCGCCAAAGTGGCAAGCCGGGTGCTTGGGTGGTCGGACAGGTTCTTCACAAAAACTTCCCTTTTGCCATTAAATCGTCATGCATCTGTGCTTGATGATATCAGGCcagggcaggg > 1:186042/1‑148 (MQ=255) gcgTACCCAGTGGGATCACCAGCACCAGAGCCGCCAAAGTGGCAAGCCGGGTGCTTGGGTGGTCGGACAGGTTCTTCACAAAAACTTCCCTTTTGCCATTAAATCGTCATGCATCTGTGCTTGATGATATCAGGCCAGGGCAGGGAAgg > 5:17515/1‑149 (MQ=255) gcgTACCCAGTGGGATCACCAGCACCAGAGCCGCCAAAGTGGCAAGCCGGGTGCTTGGGTGGTCGGACAGGTTCTTCACAAAAACTTCCCTTTTGCCATTAAATCGTCATGCATCTGTGCTTGATGATATCAGGCCAGGGCAGGGAAgg > 6:207241/1‑149 (MQ=255) ccAGTGGGATCACCAGCACCAGAGCCGCCAAAGTGGCAAGCCGGGTGCTTGGGTGGTCGGACAGGTTCTTCACAAAAACTTCCCTTTTGCCATTAAATCGTCATGCATCTGTGCTTGATGATATCAGGCCAGGGCAGGGAAggcggc > 8:187427/1‑147 (MQ=255) aTCACCAGCACCAGAGCCGCCAAAGTGGCAAGCCGGGTGCTTGGGTGGTCGGACAGGTTCTTCACAAAAACTTCCCTTTTGCCATTAAATCGTCATGCATCTGTGCTTGATGATATCAGGCca < 8:104514/123‑1 (MQ=255) aTCACCAGCACCAGAGCCGCCAAAGTGGCAAGCCGGGTGCTTGGGTGGTCGGACAGGTTCTTCACAAAAACTTCCCTTTTGCCATTAAATCGTCATGCATCTGTGCTTGATGATATCAGGCca > 7:104514/1‑123 (MQ=255) tCACCAGCACCAGAGCCGCCAAAGTGGCAAGCCGGGTGCTTGGGTGGTCGGACAGGTTCTTCACAAAAACTTCCCTTTTGCCATTAAATCGTCATGCATCTGTGCTTGATGATATCAGGCCAGGGCAGGGAAGGCGGCCAGTTACAAgg > 7:139319/1‑149 (MQ=255) AGCACCAGAGCCGCCAAAGTGGCAAGCCGGGTGCTTGGGTGGTCGGACAGGTTCTTCACAAAAACTTCCCTTTTGCCATTAAATCGTCATGCATCTGTGCTTGATGATATCAGGCCAGGGCAGGGAAGGCGGCCAGTTACAAGGCTTGt > 2:99621‑M1/1‑149 (MQ=255) AGCACCAGAGCCGCCAAAGTGGCAAGCCGGGTGCTTGGGTGGTCGGACAGGTTCTTCACAAAAACTTCCCTTTTGCCATTAAATCGTCATGCATCTGTGCTTGATGATATCAGGCCAGGGCAGGGAAGGCGGCCAGTTACAAGGCTTGt > 2:198180‑M1/1‑149 (MQ=255) | GCCGCCCAGGCCAGCAGCACGGGCAGCGCCAGCCACCACGGCCTGCGGTGTAGCAGCACTATCAACAGGCTGCCGAGGGCGAGATCGGACAGGTAACCGAACGGGTTGGACCAACCCAGCATGGCGCGCGTACCCAGTGGGATCACCAGCACCAGAGCCGCCAAAGTGGCAAGCCGGGTGCTTGGGTGGTCGGACAGGTTCTTCACAAAAACTTCCCTTTTGCCATTAAATCGTCATGCATCTGTGCTTGATGATATCAGGCCAGGGCAGGGAAGGCGGCCAGTTACAAGGCTTGT > NC_002947/3255532‑3255827 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |