New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4803905 | 62 (1.150) | 4 (0.080) | 4/246 | NT | 6.4% | coding (624/1212 nt) | PP_4232 | cytochrome c family protein |
? | NC_002947 | = 4803924 | 59 (1.150) | coding (605/1212 nt) | PP_4232 | cytochrome c family protein |
TGTGGTGCACCACCGGGAACATCTCGTTGAACATGCTGCCCTGG‑‑GCGCTGATGCCGTGCTTGAGGAAGGTGGTCAGGTCCGGCTGGGTCCAGCCGCGCTCGGCCAGGTCCTGGGCCAGCAGGCTTGGCGCCAGGTAGCCACCCAGCAGGCCGCCGCTCAGGCGTTGGTCCTGCTGCAGCGCACCGATCGGGTTGCGCGGGGTATGGCATTCGCCACAATGGCCCAAGACCTCGACCATGTACTGGCCGCGCTGCCAGGCCGGGCTTTTGCCCTCGGTCGGCTGCAGTTGCACGCTCT > NC_002947/4803757‑4804053 | tgtgGTGCACCACCGGGAACATCTCGTTGAACATGCTGCCCTGG‑‑GCGCTGATGCCGTGCTTGAGGAAGGTGGTCAGGTCCGGCTGGGTCCAGCCGCGCTCGGCCAGGTCCTGGGCCAGCAGGCTTGGCGCCAGGTAGCCACCCAGCAGG > 2:169396‑M1/1‑149 (MQ=255) gtgCACCACCGGGAACATCTCGTTGAACATGCTGGCCTTGCACCACTGATGCCGTGCTTGAGGAAGGTGGTCAGGTCCGGCTGGGTCCAGCCGCGCTCGGCCAGGTCCTGGGCCAGCAGGCTTGGCGCCAGGTAGCCACCCAGCAGgc < 1:287791/148‑1 (MQ=255) accGGGAACATCTCGTTGAACATGCTGCCCTGG‑‑GCGCTGATGCCGTGCTTGAGGAAGGTGGTCAGGTCCGGCTGGGTCCAGCCGCGCTCGGCCAGGTCCTGGGCCAGCAGGCTTGGCGCCAGGTAGCCACCCAGCAGGCCGCCGCTCAg < 5:221379/149‑1 (MQ=255) accGGGAACATCTCGTTGAACATGCTGCCCTGG‑‑GCGCTGATGCCGTGCTTGAGGAAGGTGGTCAGGTCCGGCTGGGTCCAGCCGCGCTCGGCCAGGTCCTGGGCCAGCAGGCTTGGCGCCAGGTAGCCACCCAGCAGGCCGCCGCTCAg < 5:216355/149‑1 (MQ=255) cGGGAACATCTCGTTGAACATGCTGCCCTGG‑‑GCGCTGATGCCGTGCTTGAGGAAGGTGGTCAGGTCCGGCTGGGTCCAGCCGCGCTCGGCCAGGTCCTGGGCCAGCAGGCTTGGCGCCAGGTAGCCACCCAGCAGGCCGCCGCTCAGGc > 6:11656/1‑149 (MQ=255) gAACATCTCGTTGAACATGCTGCCCTGG‑‑GCGCTGATGCCGTGCTTGAGGAAGGTGGTCAGGTCCGGCTGGGTCCAGCCGCGCTCGGCCAGGTCCTGGGCCAGCAGGCTTGGCGCCAGGTAGCCACCCAGCAGGCCGCCGCTCAGGCGtt > 7:82434/1‑149 (MQ=255) aaCATCTCGTTGAACATGCTGCCCTGG‑‑GCGCTGATGCCGTGCTTGAGGAAGGTGGTCAGGTCCGGCTGGGTCCAGCCGCGCTCGGCCAGGTCCTGGGCCAGCAGGCTTGGCGCCAGGTAGCCACCCAGCAGGCCGCCGCTCAGGCGTTg < 3:56582/149‑1 (MQ=255) tctcGTTGAACATGCTGCCCTGG‑‑GCGCTGATGCCGTGCTTGAGGAAGGTGGTCAGGTCCGGCTGGGTCCAGCCGCGCTCGGCCAGGTCCTGGGCCAGCAGGCTTGGCGCCAGGTAGCCACCCAGCAGGaccaacgcctgagcggcggcc > 4:113845‑M1/1‑128 (MQ=255) gTTGAACATGCTGCCCTGG‑‑GCGCTGATGCCGTGCTTGAGGAAGGTGGTCAGGTCCGGCTGGGTCCAGCCGCGCTCGGCCAGGTCCTGGGCCAGCAGGCTTGGCGCCAGGTAGCCACCCAGCAGGCCGCCGCTCAGGCGTTGGTcctgct < 3:330102‑M2/149‑7 (MQ=255) gAACATGCTGCCCTGG‑‑GCGCTGATGCCGTGCTTGAGGAAGGTGGTCAGGTCCGGCTGGGTCCAGCCGCGCTCGGCCAGGTCCTGGGCCAGCAGGCTTGGCGCCAGGTAGCCACCCAGCAGGCCGCCGCTCAGGCGTTGGTcctgctg < 1:210527‑M2/147‑8 (MQ=255) aCATGCTGCCCTGG‑‑GCGCTGATGCCGTGCTTGAGGAAGGTGGTCAGGTCCGGCTGGGTCCAGCCGCGCTCGGCCAGGTCCTGGGCCAGCAGGCTTGGCGCCAGGTACCCACCCAGCAGGCCGCCGCTCAGGCGTTGGTCCTGCTGCAgc > 6:350055/1‑149 (MQ=255) cATGCTGCCCTGG‑‑GCGCTGATGCCGTGCTTGAGGAAGGTGGTCAGGTCCGGCTGGGTCCAGCCGCGCTCGGCCAGGTCCTGGGCCAGCAGGCTTGGCGCCAGGTAGCCACCCAGCAGGaccaacgcctgagcggcggcctgctgggtgg < 3:113845‑M1/149‑32 (MQ=255) ctgcCCTGG‑‑GCGCTGATGCCGTGCTTGAGGAAGGTGGTCAGGTCCGGCTGGGTCCAGCCGCGCTCGGCCAGGTCCTGGGCCAGCAGGCTTGGCGCCAGGTAGCCACCCAGCAGGCCGCCGCTCAGGCGTTGGTCCTGCTGCAGCGCAc < 5:61892/148‑1 (MQ=255) gcCCTGG‑‑GCGCTGATGCCGTGCTTGAGGAAGGTGGTCAGGTCCGGCTGGGTCCAGCCGCGCTCGGCCAGGTCCTGGGCCAGCAGGCTTGGCGCCAGGTAGCCACCCAGCAGGCCGCCGCTCAGGCGTTGGTCCTGCTGCAGCGCACCGa < 1:169396/149‑1 (MQ=255) cccTGG‑‑GCGCTGATGCCGTGCTTGAGGAAGGTGGTCAGGTCCGGCTGGGTCCAGCCGCGCTCGGCCAGGTCCTGGGCCAGCAGGCTCGGCGCCAGGTAGCCACCCAGCAGGaccaacgcctgagcggcggcctgctgggtg < 1:165968‑M1/141‑31 (MQ=255) cccTGG‑‑GCGCTGATGCCGTGCTTGAGGAAGGTGGTCAGGTCCGGCTGGGTCCAGCCGCGCTCGGCCAGGTCCTGGGCCAGCAGGCTCGGCGCCAGGTAGCCACCCAGCAGGaccaacgcctgagcggcggcctgctgggtg > 2:165968‑M1/1‑111 (MQ=255) ccTGG‑‑GCGCTGATGCCGTGCTTGAGGAAGGTGGTCAGGTCCGGCTGGGTCCAGCCGCGCTCGGCCAGGTCCTGGGCCAGCAGGCTTGGCGCCAGGTAGCCACCCAGCAGGCCGCCGCTCAGGCGTTGGTCCTGCTGCAGCGCACCGATc < 5:213733/149‑1 (MQ=255) gcgcTGATGCCGTGCTTGAGGAAGGTGGTCAGGTCCGGCTGGGTCCAGCCGCGCTCGGCCAGGTCCTGGGCCAGCAGGCTTGGCGCCAGGTAGCCACCCAGCAGGCCGCCGCTCAGGCGTTGGTCCTGCTGCAGCGCACCGATCGGGtt > 5:112728/1‑149 (MQ=255) gcgcTGATGCCGTGCTTGAGGAAGGTGGTCAGGTCCGGCTGGGTCCAGCCGCGCTCGGCCAGGTCCTGGGCCAGCAGGCTTGGCGCCAGGTAGCCACCCAGCAGGCCGCCGCTCAGGCGTTGGTCCTGCTGCAGCGCACCGATCGGGtt > 6:86783/1‑149 (MQ=255) gcTGATGCCGTGCTTGAGGAAGGTGGTCAGGTCCGGCTGGGTCCAGCCGCGCTCGGCCAGGTCCTGGGCCAGCAGGCTTGGCGCCAGGTAGCCACCCAGCAGGCCGCCGCTCAGGCGTTGGTCCTGCTGCAGCGCACCGATCGGGTTgc > 8:115049/1‑149 (MQ=255) tGATGCCGTGCTTGAGGAAGGTGGTCAGGTCCGGCTGGGTCCAGCCGCGCTCGGCCAGGTCCTGGGCCAGCAGGCTTGGCGCCAGGTAGCCACCCAGCAGGCCGCCGCTCAGGCGTTGGTCCTGCTGCAGCGCACCGATCGGGTTgcgc > 8:111352/1‑149 (MQ=255) gATGCCGTGCTTGAGGAAGGTGGTCAGGTCCGGCTGGGTCCAGCCGCGCTCGGCCAGGTCCTGGGCCAGCAGGCTTGGCGCCAGGTAGCCACCCAGCAGGCCGCCGCTCAGGCGTTGGTCCTGCTGCAGCGCACCGATCGGGTTGcgcg > 6:193040/1‑149 (MQ=255) tGCCGTGCTTGAGGAAGGTGGTCAGGTCCGGCTGGGTCCAGCCGCGCTCGGCCAGGTCCTGGGCCAGCAGGCTTGGCGCCAGGTAGCCACCCAGCAGGCCGCCGCTCAGGCGTTGGTCCTGCTGCAGCGCACCGATCGGGTTGCGCgg < 4:209657/148‑1 (MQ=255) tGCCGTGCTTGAGGAAGGTGGTCAGGTCCGGCTGGGTCCAGCCGCGCTCGGCCAGGTCCTGGGCCAGCAGGCTTGGCGCCAGGTAGCCACCCAGCAGGCCGCCGCTCAGGCGTTGGTCCTGCTGCAGCGCACCGATCGGGTTGCGCgg > 3:209657/1‑148 (MQ=255) gCCGTGCTTGAGGAAGGTGGTCAGGTCCGGCTGGGTCCAGCCGCGCTCGGCCAGGTCCTGGGCCAGCAGGCTTGGCGCCAGGTAGCCACCCAGCAGGCCGCCGCTCAGGCGTTGGTCCTGCTGCAGCGCACCGATCGGGTTGCGCgggg > 3:269811/1‑149 (MQ=255) gCCGTGCTTGAGGAAGGTGGTCAGGTCCGGCTGGGTCCAGCCGCGCTCGGCCAGGTCCTGGGCCAGCAGGCTTGGCGCCAGGTAGCCACCCAGCAGGCCGCCGCTCAGGCGTTGGTCCTGCTGCAGCGCACCGATCGGGTTGCGCggg < 1:293672/148‑1 (MQ=255) ccGTGCTTGAGGAAGGTGGTCAGGTCCGGCTGGGTCCAGCCGCGCTCGGCCAGGTCCTGGGCCAGCAGGCTTGGCGCCAGGTAGCCACCCAGCAGGCCGCCGCTCAGGCGTTGGTCCTGCTGCAGCGCACCGATCGGGTTGCGCGGGGt < 4:330102/149‑1 (MQ=255) tGCTTGAGGAAGGTGGTCAGGTCCGGCTGGGTCCAGCCGCGCTCGGCCAGGTCCTGGGCCAGCAGGCTTGGCGCCAGGTAGCCACCCAGCAGGCCGCCGCTCAGGCGTTGGTCCTGCTGCAGCGCACCGATCGGGTTGCGCGGGGTATg < 5:315675/149‑1 (MQ=255) ttGAGGAAGGTGGTCAGGTCCGGCTGGGTCCAGCCGCGCTCGGCCAGGTCCTGGGCCAGCAGGCTTGGCGCCAGGTAGCCACCCAGCAGGCCGCCGCTCAGGCGTTGGTCCTGCTGCAGCGCACCGATAGGGTTGCGCGGGGTATGGCa > 7:118218/1‑149 (MQ=255) gAAGGTGGTCAGGTCCGGCTGGGTCCAGCCGCGCTCGGCCAGGTCCTGGGCCAGCAGGCTTGGCGCCAGGTAGCCACCCAGCAGGCCGCCGCTCAGGCGTTGGTCCTGCTGCAGCGCACCGATCGGGTTGCGCGGGGTATGGCATTCGc > 5:31442/1‑149 (MQ=255) gAAGGTGGTCAGGTCCGGCTGGGTCCAGCCGCGCTCGGCCAGGTCCTGGGCCAGCAGGCTTGGCGCCAGGTAGCCACCCAGCAGGCCGCCGCTCAGGCGTTGGTCCTGCTGCAGCGCACCGATCGGGTTGCGCGGGGTATGGCATTCGc < 4:269811/149‑1 (MQ=255) tggtCAGGTCCGGCTGGGTCCAGCCGCGCTCGGCCAGGTCCTGGGCCAGCAGGCTTGGCGCCAGGTAGCCACCCAGCAGGCCGCCGCTCAGGCGTTGGTCCTGCTGCAGCGCACCGATCGGGTTGCGCGGGGTATGGCATTCGCCACaa > 6:117923/1‑149 (MQ=255) aGGTCCGGCTGGGTCCAGCCGCGCTCGGCCAGGTCCTGGGCCAGCAGGCTTGGCGCCAGGTAGCCACCCAGCAGGCCGCCGCTCAGTCGTTGGTCCTGCTGCAGCGCACCGATCGGGTTGCGCGGGGTATGGCATTCGCCACAATGGcc < 8:118218/149‑1 (MQ=255) cGGCTGGGTCCAGCCGCGCTCGGCCAGGTCCTGGGCCAGCAGGCTTGGCGCCAGGTAGCCACCCAGCAGGCCGCCGCTCAGGCGTTGGTCCTGCTGCAGCGCACCGATCGGGTTGCGCGGGGTATGGCATTCGCCACAATGGCCCAAg < 5:193040/148‑1 (MQ=255) ggTCCAGCCGCGCTCGGCCAGGTCCTGGGCCAGCAGGCTTGGCGCCAGGTAGCCACCCAGCAGGCCGCCGCTCAGGCGTTGGTCCTGCTGCAGCGCACCGATCGGGTTGCGCGGGGTATGGCATTCGCCACAATGGCCCAAGACCTCg < 2:210527/148‑1 (MQ=255) ggTCCAGCCGCGCTCGGCCAGGTCCTGGGCCAGCAGGCTTGGCGCCAGGTAGCCACCCAGCAGGCCGCCGCTCAGGCGTTGGTCCTGCTGCAGCGCACCGATCGGGTTGCGCGGGGTATGGCATTCGCCACAATGGCCCAAGACCTCg < 1:290093/148‑1 (MQ=255) gTCCAGCCGCGCTCGGCCAGGTCCTGGGCCAGCAGGCTTGGCGCCAGGTAGCCACCCAGCAGGCCGCCGCTCAGGCGTTGGTCCTGCTGCAGCGCACCGATCGGGTTGCGCGGGGTATGGCATTCGCCACAATGGCCCAAGACCTCGAc < 7:111352/149‑1 (MQ=255) tCCAGCCGCGCTCGGCCAGGTCCTGGGCCAGCAGGCTTGGCGCCAGGTAGCCACCCAGCAGGCCGCCGCTCAGGCGTTGGTCCTGCTGCAGCGCACCGATCGGGTTGCGCGGGGTATGGCATTCGCCACAATGGcc < 7:48783/136‑1 (MQ=255) tCCAGCCGCGCTCGGCCAGGTCCTGGGCCAGCAGGCTTGGCGCCAGGTAGCCACCCAGCAGGCCGCCGCTCAGGCGTTGGTCCTGCTGCAGCGCACCGATCGGGTTGCGCGGGGTATGGCATTCGCCACAATGGcc > 8:48783/1‑136 (MQ=255) tCCAGCCGCGCTCGGCCAGGTCCTGGGCCAGCAGGCTTGGCGCCAGGTAGCCACCCAGCAGGCCGCCGCTCAGGCGTTGGTCCTGCTGCAGCGCACCGATCGGGTTGCGCGGGGTATGGCATTCGCCACAATGGCCCAAGACCTCGAcc < 3:39284/149‑1 (MQ=255) tCCAGCCGCGCTCGGCCAGGTCCTGGGCCAGCAGGCTTGGCGCCAGGTAGCCACCCAGCAGGCCGCCGCTCAGGCGTTGGTCCTGCTGCAGCGCACCGATCGGGTTGCGCGGGGTATGGCATTCGCCACAATGGCCCAAGACCTCGAc > 4:39284/1‑148 (MQ=255) tCCAGCCGCGCTCGGCCAGGTCCTGGGCCAGCAGGCTTGGCGCCAGGTAGCCACCCAGCAGGCCGCCGCTCAGGCGTTGGTCCTGCTGCAGCGCACCGATCGGGTTGCGCGGGGTATGGCATTCGCCACAATGGCCCAAGACCTCGAc > 5:64493/1‑148 (MQ=255) cAGCCGCGCTCGGCCAGGTCCTGGGCCAGCAGGCTTGGCGCCAGGTAGCCACCCAGCAGGCCGCCGCTCAGGCGTTGGTCCTGCTGCAGCGCACCGATCGGGTTGCGCGGGGTATGGCATTCGCCACAATGGCCCAAGACCTCGACCAt > 4:319849/1‑149 (MQ=255) aGCCGCGCTCGGCCAGGTCCTGGGCCAGCAGGCTTGGCGCCAGGTAGCCACCCAGCAGGCCGCCGCTCAGGCGTTGGTCCTGCTGCAGCGCACCGATCGGGTTGCGCGGGGTATGGCATTCGCCACAATGGCCCAAGACCTCGACCATg > 2:219292/1‑149 (MQ=255) gcTCGGCCAGGTCCTGGGCCAGCAGGCTTGGCGCCAGGTAGCCACCCAGCAGGCCGCCGCTCAGGCGTTGGTCCTGCTGCAGCGCACCGATCGGGTTGCGCGGGGTATGGCATTCGCCACAATGGCCCAAGACCTCGACCATGTACTgg < 5:117923/149‑1 (MQ=255) cTCGGCCAGGTCCTGGGCCAGCAGGCTTGGCGCCAGGTAGCCACCCAGCAGGCCGCCGCTCAGGCGTTGGTCCTGCTGCAGCGCACCGATCGGGTTGCGCGGGGTATGGCATTCGCCACAATGGCCCAAGACCTCGACCATGTACTGGc > 5:278818/1‑149 (MQ=255) ggCCAGGTCCTGGGCCAGCAGGCTTGGCGCCAGGTAGCCACCCAGCAGGCCGCCGCTCAGGCGTTGGTCCTGCTGCAGCGCACCGATCGGGTTGCGCGGGGTATGGCATTCGCCACAATGGCCCAAGACCTCGACCATGTACTGGCcg < 1:219292/148‑1 (MQ=255) ccAGGTCCTGGGCCAGCAGGCTTGGCGCCAGGTAGCCACCCAGCAGGCCGCCGCTCAGGCGTTGGTCCTGCTGCAGCGCACCGATCGGGTTGCGCGGGGTATg > 3:323176/1‑103 (MQ=255) ccAGGTCCTGGGCCAGCAGGCTTGGCGCCAGGTAGCCACCCAGCAGGCCGCCGCTCAGGCGTTGGTCCTGCTGCAGCGCACCGATCGGGTTGCGCGGGGTATg < 4:323176/103‑1 (MQ=255) ccAGGTCCTGGGCCAGCAGGCTTGGCGCCAGGTAGCCACCCAGCAGGCCGCCGCTCAGGCGTTGGTCCTGCTGCAGCGCACCGATCGGGTTGCGCGGGGTATGGCATTCGCCACAATGGCCCAAGACCTCGACCATGTACTGGCCgcgc < 7:115049/149‑1 (MQ=255) ccAGGTCCTGGGCCAGCAGGCTTGGCGCCAGGTAGCCACCCAGCAGGCCGCCGCTCAGGCGTTGGTCCTGCTGCAGCGCACCGATCGGGTTGCGCGGGGTATGGCATTCGCCACAATGGCCCAAGACCTCGACCATGTACTGGCCgcgc > 8:206138/1‑149 (MQ=255) cAGGTCCTGGGCCAGAAGGCTTGGCGCCAGGTAGCCACCCAGCAGGCCGCCGATCAGGCGTTGGTGCTGCTGCAGAGCACCGATCGGGTTGCGGGGGGTATGGCATTGGCCACAATGGCCAAAGAGCTAGGCGATCTACTGGCcgcggt > 4:19856/1‑147 (MQ=255) gTCCTGGGCCAGCAGGCTTGGCGCCAGGTAGCCACCCAGCAGGCCGCCGCTCAGGCGTTGGTCCTGCTGCAGCGCACCGATCGGGTTGCGCGGGGTATGGCATTCGCCACAATGGCCCAAGACCTCGACCATGTACTGGCCGCGCTGc > 8:214650/1‑148 (MQ=255) cTGGGCCAGCAGGCTTGGCGCCAGGTAGCCACCCAGCAGGCCGCCGCTCAGGCGTTGGTCCTGCTGCAGCGCACCGATCGGGTTGCGCgggg < 7:6201/92‑1 (MQ=255) cTGGGCCAGCAGGCTTGGCGCCAGGTAGCCACCCAGCAGGCCGCCGCTCAGGCGTTGGTCCTGCTGCAGCGCACCGATCGGGTTGCGCgggg > 8:6201/1‑92 (MQ=255) ccAGCAGGCTTGGCGCCAGGTAGCCACCCAGCAGGCCGCCGCTCAGGCGTTGGTCCTGCTGCAGCGCACCGATCGGGTTGCGCGGGGTATGGCATTCGCCACAATGGCCCAAGACCTCGACCATGTACTGGCCGCGCTGCCAGGCCggg < 6:278818/149‑1 (MQ=255) agcagGCTTGGCGCCAGGTAGCCACCCAGCAGGCCGCCGCTCAGGCGTTGGTCCTGCTGCAGCGCACCGATCGGGTTGCGCGGGGTATGGCATTCGCCACAATGGCCCAAGACCTCGACCATGTACTGGCCGCGCTGCCAGGCCGGGCt > 2:266970/1‑149 (MQ=255) agGCTTGGCGCCAGGTAGCCACCCAGCAGGCCGCCGCTCAGGCGTTGGTCCTGCTGCAGCGCACCGATCGGGTTGCGCGGGGTATGGCATTCGCCACAATGGCCCAAGACCTCGACCATGTACTGGCCGCGCTGCCAGGCCGGGCtttt < 5:353210/149‑1 (MQ=255) agGCTTGGCGCCAGGTAGCCACCCAGCAGGCCGCCGCTCAGGCGTTGGTCCTGCTGCAGCGCACCGATCGGGTTGCGCGGGGTATGGCATTCGCCACAATGGCCCAAGACCTCGACCATGTACTGGCCGCGCTGCCAGGCCGGGCtttt < 6:112728/149‑1 (MQ=255) ggCTTGGCGCCAGGTAGCCACCCAGCAGGCCGCCGCTCAGGCGtt < 7:15283/45‑1 (MQ=255) ggCTTGGCGCCAGGTAGCCACCCAGCAGGCCGCCGCTCAGGCGtt > 8:15283/1‑45 (MQ=255) cTTGGCGCCAGGTAGCCACCCAGCAGGCCGCCGCTCAGGCGTTGGTCCTGCTGCAGCGCACCGATCGGGTTGCGCGGGGTATGGCATTCGCCACAATGGCCCAAGACCTCGACCATGTACTGGCCGCGCTGCCAGGCCGGGCTTTTGcc < 8:82434/149‑1 (MQ=255) gcgcCAGGTAGCCACCCAGCAGGCCGCCGCTCAGGCGTTGGTCCTGCTGCAGCGCACCGATCGGGTTGCGCGGGGTATGGCATTCGCCACAATGGCCCAAGACCTCGACCATGTACTGGCCGCGCTGCCAGGCCGGGCTTTTGCCCtcg < 7:206138/149‑1 (MQ=255) ccACCCAGCAGGCCGCCGCTCAGGCGTTGGTcctgctgggtggctacctggcgccaagcctgctggcccaggacctggccgagcgcggctggacccagccggacctgaccaccttcctcaagcacggcatcagcgcccagggcagcatg < 3:113845‑M2/149‑119 (MQ=255) ccACCCAGCAGGCCGCCGCTCAGGCGTTGGTCCTGCTGCAGCGCACCGATCGGGTTGCGCGGGGTATGGCATTCGCCACAATGGCCCAAGACCTCGACCATGTACTGGCCGCGCTGCCAGGCCGGGCTTTTGCCCTCGGTCGGCTGCAg > 8:218278/1‑149 (MQ=255) cACCCAGCAGGCCGCCGCTCAGGCGTTGGTcctgctgggtggctacctggcgccgagcctgctggcccaggacctggccgagcgcggctggacccagccggacctgaccaccttcctcaagcacggcatcagcgcccaggg > 2:165968‑M2/1‑30 (MQ=255) cACCCAGCAGGCCGCCGCTCAGGCGTTGGTcctgctgggtggctacctggcgccgagcctgctggcccaggacctggccgagcgcggctggacccagccggacctgaccaccttcctcaagcacggcatcagcgcccaggg < 1:165968‑M2/141‑112 (MQ=255) cACCCAGCAGGCCGCCGCTCAGGCGTTGGTCCTGCTGCAGCGCACCGATCGGGTTGCGCGGGGTATGGCATTCGCCACAATGGCCCAAGACCTCGACCATGTACTGGCAGCGCTGCCAGGCCGGGCTTTTGCCCTCGGTCGGCTGCAGt > 2:8592/1‑149 (MQ=255) aCCCAGCAGGCCGCCGCTCAGGCGTTGGTCCTGCTGCAGCGCACCGATCGGGTTGCGCGGGGTATGGCATTCGCCACAATGGCCCAAGACCTCGACCATGTACTGGCCGCGCTGCCAGGCCGGGCTTTTGCCCTCGGTCGGCTGCAGtt > 5:118700/1‑149 (MQ=255) aCCCAGCAGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGTCCTGCTGCAGCGCACCGATCGGGTTGCGCGGGGTATGGCATTCGCCACAATGGCCCAAGACCTCGACCATGTACTGGCCGCGCTGCCAGGCCGGGCTTTTGCCCTCGGTCGGCTGCAGtt < 5:350055/149‑1 (MQ=255) ccAGCAGGCCGCCGCTCAGGCGTTGGTCCTGCTGCAGCGCACCGATCGGGTTGCGCGGGGTATGGCATTCGCCACAATGGCCCAAGACCTCGACCATGTACTGGCCGCGCTGCCAGGCCGGGCTTTTGCCCTCGGTCGGCTGCa < 4:219192/144‑1 (MQ=255) ccAGCAGGCCGCCGCTCAGGCGTTGGTCCTGCTGCAGCGCACCGATCGGGTTGCGCGGGGTATGGCATTCGCCACAATGGCCCAAGACCTCGACCATGTACTGGCCGCGCTGCCAGGCCGGGCTTTTGCCCTCGGTCGGCTGCa > 3:219192/1‑144 (MQ=255) ccAGCAGGCCGCCGCTCAGGCGTTGGTCCTGCTGCAGCGCACCGATCGGGTTGCGCGGGGTATGGCATTCGCCACAATGGCCCAAGACCTCGACCATGTACTGGCCGCGCTGCCAGGCCGGGCTTTTGCCCTCGGTCGGCTGCAGTTGc < 1:277146/149‑1 (MQ=255) cagcagGaccaacgcctgagcggcggcctgctgggtggctacctggcgccaagcctgctggcccaggacctggccgagcgcggctggacccagccggacctgaccaccttcctcaagcacggcatcagcgcccagggcagcatgttc < 1:210527‑M1/147‑141 (MQ=255) agcagGaccaacgcctgagcggcggcctgctgggtggctacctggcgccaagcctgctggcccaggacctggccgagcgcggctggacccagccggacctgaccaccttcctcaagcacggcatcagcgcccagggcagcatgttcaac < 3:330102‑M1/149‑144 (MQ=255) gcagGCCGCCGCTCAGGCGTTGGTCCTGCTGCAGCGCACCGATCGGGTTGCGCGGGGTATGGCATTCGCCACAATGGCCCAAGACCTCGACCATGTACTGGCCGCGCTGCCAGGCCGGGCTTTTGTCCTCGGTCGGCTGCAGTTGCACg < 7:214650/149‑1 (MQ=255) ggCCGCCGCTCAGGCGTTGGTcctgctgggtggctacctggcgccaagcctgctggcccaggacctggccgagcgcggctggacccagccggacctgaccaccttcctcaagcacggcatcagcgcccagggcagcatgttcaacgaga > 4:113845‑M2/1‑21 (MQ=255) gccgccGCTCAGGCGTTGGTCCTGCTGCAGCGCACCGATCGGGTTGCGCGGGGTATGGCATTCGCCACAATGGCCCAAGACCTCGACCATGTACTGGCCGCGCTGCCAGGCCGGGCTTTTGCCCTCGGTCGGCTGCAGTTGCACGctct > 3:95071/1‑149 (MQ=255) | TGTGGTGCACCACCGGGAACATCTCGTTGAACATGCTGCCCTGG‑‑GCGCTGATGCCGTGCTTGAGGAAGGTGGTCAGGTCCGGCTGGGTCCAGCCGCGCTCGGCCAGGTCCTGGGCCAGCAGGCTTGGCGCCAGGTAGCCACCCAGCAGGCCGCCGCTCAGGCGTTGGTCCTGCTGCAGCGCACCGATCGGGTTGCGCGGGGTATGGCATTCGCCACAATGGCCCAAGACCTCGACCATGTACTGGCCGCGCTGCCAGGCCGGGCTTTTGCCCTCGGTCGGCTGCAGTTGCACGCTCT > NC_002947/4803757‑4804053 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |