| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 5816871 | 27 (0.500) | 6 (0.130) | 5/224 | NT | 19.9% | intergenic (+57/+72) | PP_5092/pilT | NLP/P60 protein/twitching motility protein |
| ? | NC_002947 | = 5816898 | 25 (0.540) | intergenic (+84/+45) | PP_5092/pilT | NLP/P60 protein/twitching motility protein | |||||
ACCTTGAGCAAGCCTTACTGGCAGAAGCACTACGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGC‑TG‑AGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTCCGCCGC > NC_002947/5816725‑5817017 | acCTTGAGCAAGCCTTACTGGCAGAAGCACTACGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGC‑TG‑AGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCGACCACACGTAtc > 7:37663‑M1/1‑147 (MQ=255) cTTGAGCAAGCCTTACTGGCAGAAGCACTACGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGC‑TG‑AGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAgcgc > 1:323951/1‑149 (MQ=255) aaGCCTTACTGGCAGAAGCACTACGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGC‑TG‑AGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGct > 4:176644/1‑148 (MQ=255) aGCCTTACTGGCAGAAGCACTACGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGC‑TG‑AGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAtgtgagctacgc > 8:223993‑M1/1‑137 (MQ=255) gCCTTACTGGCAGAAGCACTACGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGC‑TG‑AGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCtctc > 8:274404/1‑149 (MQ=255) ccTTACTGGCAGAAGCACTACGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGC‑TGTTGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCCCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCtctc > 1:98801/1‑149 (MQ=255) gCAGAAGCACTACGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGC‑TG‑AGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGc > 1:69580/1‑149 (MQ=255) gCAGAAGCACTACGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGC‑TG‑AGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGc > 3:34248/1‑149 (MQ=255) cAGAAGCACTACGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGC‑TG‑AGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCt < 8:267597/149‑1 (MQ=255) aCTACGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGC‑TG‑AGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAtgtgagctgcgcgcgagagcgacgcgctac < 3:262325‑M1/149‑31 (MQ=255) cTACGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGC‑TG‑AGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCCCGCCCCCAGGTAGCGCGTCGCGCGAGCGGGCCGCGCACCtacc < 1:311699‑M2/149‑5 (MQ=255) tACGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGC‑TG‑AGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACAtacct < 1:263859‑M2/149‑6 (MQ=255) cGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTTCCGAAAGAGCAGCAGC‑TG‑AGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACAtacctgt > 5:322734‑M2/1‑142 (MQ=255) cGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGC‑TG‑AGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACAtacctgt > 2:263859‑M2/1‑142 (MQ=255) cGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGC‑TG‑AGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACAtacctg > 2:69580‑M2/1‑142 (MQ=255) gtggtgGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGC‑TG‑AGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACAtacctgtg > 6:186240‑M2/1‑141 (MQ=255) gtggtgGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGC‑TG‑AGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACAtacctgtg > 3:176644‑M2/1‑141 (MQ=255) tggtggCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGC‑TG‑AGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTAtgtgagctgcgcgcgagagcgacgcgctacctgtgg < 5:344823‑M1/149‑37 (MQ=255) tggtggCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGC‑TG‑AGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACAtacctgtgg > 5:178218‑M2/1‑140 (MQ=255) tggtggCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGC‑TG‑AGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACAtacctgtgg > 2:48417‑M2/1‑140 (MQ=255) tggtggCCAAGCGGGCGCTGCCGAAAGAGCAGCAGC‑TG‑AGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAtgtgagctgcgcgcgagagcgacgcgctacctgtgg < 4:67903‑M1/149‑37 (MQ=255) gtggCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGC‑TG‑AGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCTTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTAtgtgagctgcgcgcgagagcgacgcgctacctgtggga < 4:296628‑M1/149‑39 (MQ=255) ccAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGC‑TG‑AGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAtgtgagctacgcgcgagagcgacgcgctacctgtgggagcgg < 7:223993‑M1/149‑43 (MQ=255) cAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCGTG‑AGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACAtacctgtgggagcgg < 1:201425‑M2/149‑16 (MQ=255) aaGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGC‑TG‑AGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACAtacctgtgggagcgggc > 7:274404‑M2/1‑132 (MQ=255) aaGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGC‑TG‑AGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACAtacctgtgggagcgggc > 2:113292‑M2/1‑132 (MQ=255) gCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGC‑TG‑AGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGgcgc < 2:323951/149‑1 (MQ=255) gTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGC‑TG‑AGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGccc < 2:30304/149‑1 (MQ=255) tgctgcCGAAAGAGCAGCAGC‑TG‑AGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTACCACACGTAGCGCGTCCCTCGCGCGCGCAGCTCACCAACCTGTGGGAGAGGGCGCGCCcg > 6:254568/1‑149 (MQ=255) ctgcCGAAAGAGCAGCAGC‑TG‑AGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCcgc < 2:98801/148‑1 (MQ=255) cGAAAGAGCAGCAGC‑TG‑AGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGCTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATAACTCTGGGAGCGGGCGCGCCCCCGaaac > 6:343911/1‑148 (MQ=255) aatcccagcagc‑TG‑AGTCTGGCCATGCGTTAAGCTTACCGGCGCTACCCGGTACGGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACCGGTCGCGGGTCGCTCTCGCGCGCAGCCCACAACCCGGTGGGCGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGc < 2:311699/144‑1 (MQ=255) gcagcagc‑TG‑AGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACAtacctgtgg > 5:327108‑M2/1‑112 (MQ=255) gcagcagc‑TG‑AGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACAtacctgtgg < 6:327108‑M2/121‑10 (MQ=255) agc‑TG‑AGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAgg < 1:101457/149‑1 (MQ=255) gCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACaa < 4:34248/146‑1 (MQ=255) cAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCATCTCACATACCTGTGTGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCtt < 5:254568/149‑1 (MQ=255) cgtactccTGATGGGCGCTTCCCGGCACCGGCCCCTTCGCGGGCCCGCCCGCTCCCACTGGTCCCGCGGCGCTCTCGCCCCAAGCCCAAATCCCTGGGGGCGGGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGa < 8:285867/141‑1 (MQ=255) cGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCTGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGAt < 4:284813/149‑1 (MQ=255) gTTAAGCTTATCGGGGCTATCCGGTACGGGCCCGTTCGCGGCCACGCCCGCTCCCACAGGTTGCGCTTCGCTCTCGCTAGCAGCTCACATAGCTGTGGTAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATc < 5:295628/149‑1 (MQ=255) ccccTTCCCGGGCACGCCCGCTCCCACCGGTCGCGCGGCGATCTCGCGCGAAGCTCACAAACCTGTGGGAGCGGGCTCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGcc < 5:186498/149‑1 (MQ=255) cccTTCGCTGGCACGCCCGCTCCCTCAGTTCCCGGTTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGccc < 8:37663/149‑1 (MQ=38) gcgGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCa > 4:123576/1‑149 (MQ=255) gCCCGCTCCCACAGGTAtgtgagctgcgcgcgagagcgacgcgctacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaaggggccggtaccggatagcgccgatcagcttaacgcttggccagactcagctgctgctctttcggcagcacccgctt > 2:113292‑M1/1‑17 (MQ=255) gCCCGCTCCCACAGGTAtgtgagctgcgcgcgagagcgacgcgctacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaaggggccggtaccggatagcgccgatcagcttaacgcttggccagactcagctgctgctctttcggcagcacccgctt > 7:274404‑M1/1‑17 (MQ=255) ccGCTCCCACAGGTAtgtgagctgcgcgcgagagcgacgcgctacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaaggggccggtaccggatagcgccgatcagcttaacgcttggccagactcacgctgctgctctttcggcagcacccgcttg < 1:201425‑M1/149‑135 (MQ=255) ccGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGTAGCTCACAtacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaaggggccggtaccggatagcgccgatcagcttaacgcttggccagactcagctgctgctctttcggcagcacccgcttgg < 7:223993‑M2/149‑108 (MQ=255) cTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGCTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGGCAGCATccc < 5:343911/149‑1 (MQ=255) tCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACAtacctgtgggagcgggcgcgcccgcgaaagggccggtaccggatagcgccgatcagcttaacgcttggccagactcagctgctgctctttcggcagcacccgcttggccac < 4:296628‑M2/149‑112 (MQ=255) ccACAGGTAtgtgagctgcgcgcgagagcgacgcgctacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaaggggccggtaccggatagcgccgatcagcttaacgcttggccagactcagctgctgctctttcggcagcacccgcttggccacca > 2:48417‑M1/1‑9 (MQ=255) ccACAGGTAtgtgagctgcgcgcgagagcgacgcgctacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaaggggccggtaccggatagcgccgatcagcttaacgcttggccagactcagctgctgctctttcggcagcacccgcttggccacca > 5:178218‑M1/1‑9 (MQ=255) ccACAGGTAtgtgagctgcgcgcgagagcgacgcgctacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaaggggccggtaccggatagcgccgatcagcttaacgcttggccagactcagctgctgc < 6:327108‑M1/121‑113 (MQ=255) ccACAGGTAtgtgagctgcgcgcgagagcgacgcgctacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaaggggccggtaccggatagcgccgatcagcttaacgcttggccagactcagctgctgc > 5:327108‑M1/1‑9 (MQ=255) ccACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACAtacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaaggggccggtaccggatagcgccgatcagcttaacgcttggccagactcagctgctgctctttcggcagcgcccgcttggccacca < 4:67903‑M2/149‑114 (MQ=255) ccACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACAtacctgtgggagcgggcgcgcccgcgaaggggccggtaccggatagcgccgatcagcttaacgcttggccagactcagctgctgctctttcggcagcacccgcttggccacca < 5:344823‑M2/149‑114 (MQ=255) ccACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCa > 4:125738/1‑139 (MQ=255) ccACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCa < 3:125738/139‑1 (MQ=255) ccACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATcccc < 3:123576/147‑1 (MQ=255) cacaGGTAtgtgagctgcgcgcgagagcgacgcgctacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaaggggccggtaccggatagcgccgatcagcttaacgcttggccagactcagctgctgctctttcggcagcacccgcttggccaccac > 6:186240‑M1/1‑8 (MQ=255) cacaGGTAtgtgagctgcgcgcgagagcgacgcgctacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaaggggccggtaccggatagcgccgatcagcttaacgcttggccagactcagctgctgctctttcggcagcacccgcttggccaccac > 3:176644‑M1/1‑8 (MQ=255) cacaGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACa > 6:70481/1‑84 (MQ=255) cacaGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACa < 5:70481/84‑1 (MQ=255) acaGGTAtgtgagctgcgcgcgagagcgacgcgctacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaaggggccggtaccggatagcgccgatcagcttaacgcttggccagactcagctgctgctctttcggcagcacccgcttggccaccacg > 2:263859‑M1/1‑7 (MQ=255) acaGGTAtgtgagctgcgcgcgagagcgacgcgctacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaaggggccggtaccggatagcgccgatcagcttaacgcttggccagactcagctgctgctctttcggaagcacccgcttggccaccacg > 5:322734‑M1/1‑7 (MQ=255) caGGTAtgtgagctgcgcgcgagagcgacgcgctacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaaggggccggtaccggatagcgccgatcagcttaacgcttggccagactcagctgctgctctttcggcagcacccgcttggccaccacg > 2:69580‑M1/1‑6 (MQ=255) aGGTAtgtgagctgcgcgcgagagcgacgcgctacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaaggggccggtaccggatagcgccgatcagcttaacgcttggccagactcagctgctgctctttcggcagcacccgcttggccaccacgta < 1:263859‑M1/149‑145 (MQ=255) aGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTccgcc > 3:231739/1‑149 (MQ=255) ggTAggtgcgcggcccgctcgcgcgacgcgctacctgggggcgggggcgtgcccgcgaaggggccggtaccggatagcgccgatcagcttaacgcttggccagactcagctgctgctctttcggcagcacccgcttggccaccacgtag < 1:311699‑M1/149‑146 (MQ=255) gTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACAtacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaaggggccggtaccggatagcgccgatcagcttaacgcttggccagactcagctgctgctctttcggcagcacccgcttggccaccacgtagt < 3:262325‑M2/149‑120 (MQ=255) gTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTCcgccgc < 2:201425/149‑1 (MQ=255) | ACCTTGAGCAAGCCTTACTGGCAGAAGCACTACGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGC‑TG‑AGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTCCGCCGC > NC_002947/5816725‑5817017 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |