New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1036529 | 44 (0.810) | 4 (0.080) | 4/242 | NT | 8.5% | coding (234/591 nt) | PP_0895 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | = 1036556 | 45 (0.890) | coding (261/591 nt) | PP_0895 | hypothetical protein |
GGCCGACTACCTGGCCAACTATGCCCGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCGCTGGACGACGGCAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGGCCTGCCGCTGGTGGATGT‑CGCGCCCGAATTCCAGCAGCCATTCCTGGCCCAGGGGCGCGACCCGGCCAGTGTGTACTACTTCGGTGAGTCGCTGGTGTTGCCGGCATACCGCGGACAGGGCCTGGGGGTTCGCTTCTTCATCGAGCGCGAGTCCTACGCACACAAACTGGCCGAGTTCGATTACTGCGCGTTCTGCGC > NC_002947/1036415‑1036702 | ggCCGACTACCTGGCCAACTATGCCCGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCGCTGGACGACGGCAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGGCCTGCCGCTGGTGGATGT‑CGCGCCCGAATTCCAGCAGCCATTCCTGGCCCAGg > 7:74384‑M2/1‑142 (MQ=255) ggCCGACTACCTGGCCAACTATGCCCGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCGCTGGACGACGGCAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGGCCTGCCGCTGGTGGATGT‑CGCGCCCGAATTCCAGCAGCCATTCCTGGCCCAGg < 8:74384‑M2/143‑2 (MQ=255) gCCGACTACCTGGCCAACTATGCCCGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCGCTGGATGACGGCAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGGCCTGCCGCTGGTGGATGT‑CGAGCCCGAATTCCAGCAGCCATTCCTGGCCCAGgggcgcga < 3:301661‑M2/149‑9 (MQ=255) cTGGCCAACTATGCCCGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCGCTGGACGACGGCAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGGCCTGCCGCTGGTGGATGTCCGCGCCCGAATTCCAGCAGCCATTCCTGGCCCAGGGGCGCGACCCGGCCa < 1:258882/149‑1 (MQ=255) gCCAACTATGCCCGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCGCTGGACGACGGCAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGGCCTGCCGCTGGTGGATGT‑CGCGCCCGAATTCCAGCAGCCATTCCTGGCCCAGGGGCGCGACCCGGCCAgtgt > 4:148617/1‑149 (MQ=255) aaCTATGCCCGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCGCTGGACGACGGCAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGGCCTGCCGCTGGTGGATGT‑CGCGCCCGAATTCCAGCAGCCATTCCTGGCCCAGGGGCGCGACCCGGCCAGTGTGta > 5:35659/1‑149 (MQ=255) aCTATGCCCGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCGCTGGACGACGGCAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGGCCTGCCGCTGGTGGATGT‑CGCGCCCGAATTCCAGCAGCCATTCCTGGCCCAGGGGCGCGACCCGGCCAGTGTGtac < 1:35293/149‑1 (MQ=255) tATGCCCGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCGCTGGACGACGGCAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGGCCTGCCGCTGGTGGATGT‑CGCGCCCGAATTCCAGCAGCCATTCCTGGCCCAGGGGCGCGACCCGGCCAGTGTGtacta > 2:19866/1‑149 (MQ=255) cccGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCGCTGGACGACGGCAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGGCCTGCCGCTGGTGGATGT‑CGCGCCCGAATTCCAGCAGCCATTCCTGGCCCAGGGGCGCGACCCGGCCAGTGTGTACTACTTc > 4:290161/1‑149 (MQ=255) ccGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCGCTGGACGACGGCAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGGCCTGCCGCTGGTGGATGT‑CGCGCCCGAATTCCAGCAGCCATTCCTGGCCCAGGGGCGCGACCCGGCCAGTGTGTACTACTTCg > 8:274231/1‑149 (MQ=255) ccGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCGCTGGACGACGGCAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGGCCTGCCGCTGGTGGATGT‑CGCGCCCGAATTCCAGCAGCCATTCCTGGCCCAGGGGCGCGACCCGGCCAGTGTGTACTACTTCg > 7:7951/1‑149 (MQ=255) ccGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCGCTGGACGACGGCAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGGCCTGCCGCTGGTGGATGT‑CGCGCCCGAATTCCAGCAGCCATTCCTGGCCCAGGGGCGCGACCCGGCCAGTGTGTACTACTTCg > 1:113372/1‑149 (MQ=255) ccGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCGCTGGACGACGGCAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGGCCTGCCGCTGGTGGATGT‑CGCGCCCGAATTCCAGCAGCCATTCCTGGCCCAGGGGCGCGACCCGGCCAGTGTGTACTACTTCg < 7:306463/149‑1 (MQ=255) gCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCGCTGGACGACGGCAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGGCCTGCCGCTGGTGGATGT‑CGCGCCCGAATTCCAGCAGCCATTCCTGGCCCAGGGGCGCGACCCGGCCAGTGTGTACTACTTCGGt < 5:212865/149‑1 (MQ=255) cGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCGCTGGACGACGGCAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGGCCTGCCGCTGGTGGATGT‑CGCGCCCGAATTCCAGCAGCCATTCCTGGCCCAGGGGCGCGACCCGGCCAGTGTGTACTACTTCGGTGa < 3:290161/147‑1 (MQ=255) cGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCGCTGGACGACGGCAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGGCCTGCCGCTGGTGGATGT‑CGCGCCCGAATTCCAGCAGCCATTCCTGGCCCAGGGGCGCGACCCGGCCAGTGTGTACTACTTCGGTGAGt > 2:261244/1‑149 (MQ=255) gcgcAGCCTGGTTGTGCTGGCGCTGGACGACGGCAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGGCCTGCCGCTGGTGGATGT‑CGCGCCCGAATTCCAGCAGCCATTCCTGGCCCAGGGGCGCGACCCGGCCAGTGTGTACTACTTc > 5:14002/1‑139 (MQ=255) gcgcAGCCTGGTTGTGCTGGCGCTGGACGACGGCAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGGCCTGCCGCTGGTGGATGT‑CGCGCCCGAATTCCAGCAGCCATTCCTGGCCCAGGGGCGCGACCCGGCCAGTGTGTACTACTTc < 6:14002/139‑1 (MQ=255) tGGCGCTGGACGACGGCAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGGCCTGCCGCTGGTGGATGT‑CGCGCCCGAATTCCAGCAGCCATTCCTGGCCCAGGGGCGCGACCCGGCCAGTGTGTACTACTTCGGTGAGTCGCTGGTGTTTACGGCATAc > 6:299059/1‑149 (MQ=255) tGGCGCTCGACGACGGCAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGGCCTGCCGCTGGTGGATGT‑CGCGCCCGAATTCCAGCAGCCATTCCTGCCCCAGGGGCGCGACCCCGCCAGTGTGTACTTCTTCGGTCAGTCGCTGGTGTTGCCGGCATAc > 6:264055/1‑149 (MQ=255) gcTGGACGACGGCAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGGCCTGCCGCTGGTGGATGT‑CGCGCCCGAATTCCAGCAGCCATTCCTGGCCCAGGGGCGCGACCCGGCCAGTGTGTACTACTTCGGTGAGTCGCTGGTGTTGCCGGCATACcgcg > 3:220345/1‑149 (MQ=255) gacgacGGCAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGGCCTGCCGCTGGTGGATGT‑CGCGCCCGAATTCCAGCAGCCATTCCTGGCCCAGGGGCGCGACCCGGCCAGTGTGTACTACTTCGGTGAGTCGCTGGTGTTGCCGGCATACCGCGGAc < 5:264055/148‑1 (MQ=255) acgacgGCAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGGCCTGCCGCTGGTGGATGT‑CGCGCCCGAATTCCAGCAGCCATTCCTGGCCCAGGGGCGCGACCCGGCCAGTGTGTACTACTTCGGTGAGTCGCTGGTGTTGCCGGCATACCGCGGACAg < 5:307644/149‑1 (MQ=255) acgGCAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGGCCTGCCGCTGGTGGATGT‑CGCGCCCGAATTCCAGCAGCCATTCCTGGCCCAGGGGCGCGACCCGGCCAGTGTGTACTACTTCGGTGAGTCGCTGGTGTTGCCGGCATACCGCGGACAGGGc > 6:293759/1‑149 (MQ=255) cAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGGCCTGCCGCTGGTGGATGT‑CGCGCCCGAATTCCAGCAGCCATTCCTGGCCCAGGGGCGCGACCCGGCCAGTGTGTACTACTTCGGTGAGTCGCTGGTGTTGCCGGCATACCGCGGACAGGGCCTgg < 8:7951/149‑1 (MQ=255) cAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGGCCTGCCGCTGGTGGATGT‑CGCGCCCGAATTCCAGCAGCCATTCCTGGCCCAGGGGCGCGACCCGGCCAGTGTGTACTACTTCGGTGAGTCGCTGGTGTTGCCGGCATACCGCGGACAGGGCCTgg < 1:261244/149‑1 (MQ=255) ggtCGGCGCCTCTACCGGCCTGCCGCTGGTGGATGT‑CGCGCCCGAATTCCAGCAGCCATTCCTGGCCCAGGGGCGCGACCCGGCCAGTGTGTACTACTTCGGTGAGTCGCTGGTGTTGCCGGCATACCGCGGACAGGGCCTGGGGGTTc < 5:293759/149‑1 (MQ=255) tCGGCGCCTCTACCGGCCTGCCGCTGGTGGATGT‑CGCGCCCGAATTCCAGCAGCCATTCCTGGCCCAGGGGCGCGACCCGGCCAGTGTGTACTACTTCGGTGAGTCGCTGGTGTTGCCGGCATACCGCGGACAGGGCCTGGGGGTTCGc < 3:148617/149‑1 (MQ=255) tCGGCGCCTCTACCGGCCTGCCGCTGGTGGATGT‑CGCGCCCGAATTCCAGCAGCCATTCCTGGCCCAGGGGCGCGACCCGGCCAGTGTGTACTACTTCGGTGAGTCGCTGGTGTTGCCGGCATACCGCGGACAGGGCCTGGGGGTTCGc < 2:113372/149‑1 (MQ=255) ggCGCCTCTACCGGCCTGCCGCTGGTGGATGG‑CGCGCCCGAATTCCAGCAGCCATTCCTGGCCCAGGGGCGCGACCCGGCCAGTGTGTACTACTTCGGTGAGTCGCTGGTGTTGCCGGCATACCGCGGACAGGGCCTGGGGGTTCGctt < 3:201832/149‑1 (MQ=255) catgtcccggccggGCGGTGGTGGAGGG‑CGGGCCCGAATTCCAGCAGCCATGCGTGGCGCCGGGGCGCTACGCGGCCAGTGTGTACTACTTCGGTGAGTCGCTGGTGTTGCCGGCATACCGCGGACAGGGCCTGGGGGTTCGCttcttc < 7:274231/143‑1 (MQ=255) ctctACCGGCCTGCCGCTGGTGGATGT‑CGCGCCCGAATTCCAGCAGCCATTCCTGGCCCAGGGGCGCGACCCGGCCAGTGTGTACTACTTCGGTGAGTCGCTGGTGTTGCCGGCATACCGCGGACAGGGCCTGGGGGTTCGCTTCTTCa > 7:240256/1‑149 (MQ=255) ccGGCCTGCCGCTGGTGGATGT‑CGCGCCCGAATTCCAGCAGCCATTCCTGGCCCAGGGGCGCGACCCGGCCAGTGTGTACTACTTCGGTGAGTCGCTGGTGTTGCCGGCATACCGCGGACAGGGCCTGGGGGTTCGCTTCTTCATc < 1:19866/146‑1 (MQ=255) cgtccTGCCGCTGGTGGATGT‑CGCGCCCGAATTCCAGCAGCCATTCCTGGCCCAGGGGCGCGACCCGGCCAGTGTGTACTACTTCGGTGAGTCGCTGGTGTTGCCGGCATACCGCGGACAGGGCCTGGGGGTTCGCTTCTTCATCGAgc < 7:286274/146‑1 (MQ=255) gCCTGCCGCTGGTGGATGT‑CGCGCCCGAATTCCAGCAGCCATTCCTGGCCCAGGGGCGCGACCCGGCCAGTGTGTACTACTTCGGTGAGTCGCTGGTGTTGCCGGCATACCGCGGACAGGGCCTGGGGGTTCGCTTCTTCATCGAgcgc < 8:240256/149‑1 (MQ=255) ccGCTGGTGGATGT‑CGCGCCCGAATTCCAGCAGCCATTCCTGGCCCAGGGGCGCGACCCGGCCAGTGTGTACTACTTCGGTGAGTCGCTGGTGTTGCCGGCATACCGCGGACAGGGCCTGGGGGTTCGCTTCTTCATCGAGCGCGAGt < 4:220345/148‑1 (MQ=255) ccGCTGGTGGATGT‑CGCGCCCGAATTCCAGCAGCCATTCCTGGCCCAGGGGCGCGACCCGGCCAGTGTGTACTACTTCGGTGAGTCGCTGGTGTTGCCGGCATACCGCGGACAGGGCCTGGGGGTTCGCTTCTTCATCGAGCGCGAGTc > 4:290782/1‑149 (MQ=255) gtggATGT‑CGCGCCCGAATTCCAGCAGCCATTCCTGGCCCAGGGGCGCGACCCGGCCAGTGTGTACTACTTCGGTGAGTCGCTGGTGTTGCCGGCATACCGCGGACAGGGCCTGGGGGTTCGCTTCTTCATCGAGCGCGAGTCCTACg < 6:35659/148‑1 (MQ=255) gATGT‑CGCGCCCGAATTCCAGCAGCCATTCCTGGCCCAGgggcgcgacatccaccagcggcaggccggtagaggcgccgaccaccttgccgtcgtccagcgccagcacaaccaggctgcgcccggagcgggcatagttggccaggtagt < 3:237409‑M2/149‑111 (MQ=255) tGT‑CGCGCCCGAATTCCAGCAGCCATTCCTGGCCCAGgggcgcgacatccaccagcggcaggccggtagaggcgccgaccaccttgccgtcgtccagcgccagcacaaccaggctgcgcccggagcgggcatagttggccaggtagtcg < 6:71996‑M2/149‑113 (MQ=255) gcgcCCGAATTCCAGCAGCCATTCCTGGCCCAGgggcgcgacatccaccagcggcaggccggtagaggcgccgaccaccttgccgtcgtccagcgccagcacaaccaggctgcgcccggagcgggcatagttggccaggtagtcggcct < 6:319905‑M2/149‑117 (MQ=255) gcgcCCGAATTCCAGCAGCCATTCCTGGCCCAGGGGCGCGACCCGGCCAGTGTGTACTACTTCGGTGAGTCGCTGGTGTTGCCGGCATACCGCGGACAGGGc < 3:106081/102‑1 (MQ=255) gcgcCCGAATTCCAGCAGCCATTCCTGGCCCAGGGGCGCGACCCGGCCAGTGTGTACTACTTCGGTGAGTCGCTGGTGTTGCCGGCATACCGCGGACAGGGc > 4:106081/1‑102 (MQ=255) ccGAATTCCAGCAGCCATTCCTGGCCCAGGGGCGCGACCCGGCCAGTGTGTACTACTTCGGTGAGTCGCTGGTGTTGCCGGCATACCGCGGACAGGGCCTGGGGGTTCGCTTCTTCATCGAGCGCGAGTCCTACGCACACAAACTGGcc < 4:301661/149‑1 (MQ=255) cGAATTCCAGCAGCCATTCCTGGCCCAGGGGCGCGACCCGGCCAGTGTGTACTACTTCGGTGAGTCGCTCGTGTTGCCCGCATACCGCGGACAGGGCCTGGGGGTTCGCTTCTTCATCGAGCGCGAGTCCTACGCACACAAACTGGcc > 8:24398/1‑148 (MQ=255) aTTCCAGCAGCCATTCCTGGCCCAGGGGCGCGACCCGGCCAGTGTGTACTACTTCGGTGAGTCGCTGGTGTTGCCGGCATACCGCGGACAGGGCCTGGGGGTTCGCTTCTTCATCGAGCGCGAGTCCTACGCACACAAACTGGCCGAGt > 6:322444/1‑149 (MQ=255) ttCCAGCAGCCATTCCTGGCCCAGGGGCGCGACCCGGCCAGTGTGTACTACTTCGGTGAGTCGCTGGTGTTGCCGGCATACCGCGGACAGGGCCTGGGGGTTCGCTTCTTCATCGAGCGCGAGTc < 6:182252/125‑1 (MQ=255) ttCCAGCAGCCATTCCTGGCCCAGGGGCGCGACCCGGCCAGTGTGTACTACTTCGGTGAGTCGCTGGTGTTGCCGGCATACCGCGGACAGGGCCTGGGGGTTCGCTTCTTCATCGAGCGCGAGTc > 5:182252/1‑125 (MQ=255) ccATTCCTGGCCCAGGGGCGCGACCCGGCCAGTGTGTACTACTTCGGTGAGTCGCTGGTGTTGCCGGCATACCGCGGACAGGGCCTGGGGGTTCGCTTCTTCATCGAGCGCGAGTCCTACGCACACAAACTGGCCGAGTTCGATTACt > 2:259716/1‑148 (MQ=255) ccATTCCTGGCCCAGGGGCGCGACCCGGCCAGTGTGTACTACTTCGGTGAGTCGCTGGTGTTGCCGGCATACCGCGGACAGGGCCTGGGGGTTCGCTTCTTCATCGAGCGCGAGTCCTACGCACACAAACTGGCCGAGTTCGATTACt < 1:259716/148‑1 (MQ=255) cTGGCCCAGgggcgcgacatccaccagcggcaggccggtagaggcgccgaccaccttgccgtcgtccagcgccagcacaaccaggctgcgcccggagcgggcatagttggccaggtagtcggcctcgtactccggggtgccgtcgtaa > 5:71996‑M2/1‑9 (MQ=255) gCCCAGGGGCGCGACCCGGCCAGTGTGTACTACTTCGGTGAGTCGCTGGTGTTGCCGGCATACCGCGGACAGGGCCTGGGGGTTCGCTTCTTCATCGAGCGCGAGTCCTACGCACACAAACTGGCCGAGTTCGATTACTGCGCGTTCt < 7:168274/148‑1 (MQ=255) ccAGGGGCGCGACCCGGCCAGTGTGTACTACTTCGGTGAGTCGCTGGTGTTGCCGGCATACCGCGGACAGGGCCTGGGGGTTCGCTTCTTCATCGAGCGCGAGTCCTACGCACACAAACTGGCCGAGTTCGATTACTGCGCGTTCTgcg > 6:181678/1‑149 (MQ=255) ccAGGGGCGCGACCCGGCCAGTGTGTACTACTTCGGTGAGTCGCTGGTGTTGCCGGCATACCGCGGACAGGGCCTGGGGGTTCGCTTCTTCATCGAGCGCGAGTCCTACGCACACAAACTGGCCGAGTTCGATTACTGCGCGTTCTgcg > 3:321810/1‑149 (MQ=255) cAGGGGCGCGACCCGGCCAGTGTGTACTACTTCGGTGAGTCGCTGGTGTTGCCGGCATACCGCGGACAGGGCCTGGGGGTTCGCTTCTTCATCGAGCGCGAGTCCTACGCACACAAACTGGCCGAGTTCGATTACTGCGCGTTCTgcgc < 5:322444/149‑1 (MQ=255) | GGCCGACTACCTGGCCAACTATGCCCGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCGCTGGACGACGGCAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGGCCTGCCGCTGGTGGATGT‑CGCGCCCGAATTCCAGCAGCCATTCCTGGCCCAGGGGCGCGACCCGGCCAGTGTGTACTACTTCGGTGAGTCGCTGGTGTTGCCGGCATACCGCGGACAGGGCCTGGGGGTTCGCTTCTTCATCGAGCGCGAGTCCTACGCACACAAACTGGCCGAGTTCGATTACTGCGCGTTCTGCGC > NC_002947/1036415‑1036702 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |