New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1092152 | 59 (1.090) | 3 (0.060) | 3/246 | NT | 5.3% | coding (535/909 nt) | PP_0947 | membrane protein |
? | NC_002947 | = 1092194 | 52 (1.020) | coding (577/909 nt) | PP_0947 | membrane protein |
CGCCGGAAGCGCTGGTGGGCACGGCAAACCAACCGGTGATTGCAGCGCGCATCTGGCTGTTCGTGATTGCCATCATTGCCCACAACATCCCCGAAGGTATGGCCATTGGTGTGTCGGCCGGGGGTGGCATGGCCGACGCCGACAGCCTGGCCATGGGCATTGCCTTGCAGGATGTGCCTGAGGGGCTGGTGATCGCGCTGGTGCTGGCAGGGGCGGGCATGCCGCGCTTCAAGGCCTTCCTGATCGGCGCAGCCTCAGGCTTGGTCGAGCCGCTGGCGGCGTTGAT > NC_002947/1092048‑1092333 | cGCCGGAAGCGCTGGTGGGCACGGCAAACCAACCGGTGATTGCAGCGCGCATCTGGCTGTTCGTGATTGCCATCATTGCCCACAACATCCCCGAAGGTATGGCCATTGGTGTGTCGGCCGGGGGTGGCATGGCCGACGCCGACAGCCt > 4:298907‑M2/1‑147 (MQ=255) ggAAGCGCTGGTGGGCACGGCAAACCAACCGGTGATTGCAGCGCGCATCTGGCTGTTCGTGATTGCCATCATTGCCCACAACATCCCCGAAGGTATGGCCATTGGTGTGTCGGCCGGGGGTGGCATGGCCGACGCCGACAGCCtggcca < 6:181569‑M2/149‑7 (MQ=255) aGCGCTGGTGGGCACGGCAAACCAACCGGTGATTGCAGCGCGCATCTGGCTGTTCGTGATTGCCATCATTGCCCACAACATCCCCGAAGGTATGGCCATTGGTGTGTCGGCCGGGGGTGGCATGGCCGACGCCGACAGCCTGGCCATgg < 5:57264/149‑1 (MQ=255) cgcTGGTGGGCACGGCAAACCAACCGGTGATTGCAGCGCGCATCTGGCTGTTCGTGATTGCCATCATTGCCCACAACATCCCCGAAGGTATGGCCATTGGTGTGTCGGCCGGGGGTGGCATGGCCGACGCCGACAGCCTGGCCATggg > 7:24926/1‑148 (MQ=255) gtggGCACGGCAAACCAACCGGTGATTGCAGCGCGCATCTGGCTGTTCGTGATTGCCATCATTGCCCACAACATCCCCGAAGGTATGGCCATTGGTGTGTCGGCCGGGGGTGGCATGGCCGACGCCGACAGCCTGGCCATGGGCATTGc < 5:107377/149‑1 (MQ=255) gCACGGCAAACCAACCGGTGATTGCAGCGCGCATCTGGCTGTTCGTGATTGCCATCATTGCCCACAACATCCCCGAAGGTATGGCCATTGGTGTGTCGGCCGGGGGTGGCATGGCCGACGCCGACAGCCTGGCCATGGGCATTGCCTTg > 4:292588/1‑149 (MQ=255) ggCAAACCAACCGGTGATTGCAGCGCGCATCTGGCTGTTCGTGATTGCCATCATTGCCCACAACATCCCCGAAGGTATGGCCATTGGTGTGTCGGCCGGGGGTGGCATGGCCGACGCCGACAGCCTGGCCATGGGCATTGCCTTGCAg > 6:114023/1‑148 (MQ=255) ccaaccGGTGATTGCAGCGCGCATCTGGCTGTTCGTGATTGCCATCATTGCCCACAACATCCCCGAAGGTATGGCCATTGGTGTGTCGGCCGGGGGTGGCATGGCCGACGCCGACAGCCTGGCCATGGGCATTGCCTTGCAGGATGTGc < 7:323716/149‑1 (MQ=255) ccaaccGGTGATTGCAGCGCGCATCTGGCTGTTCGTGATTGCCATCATTGCCCACAACATCCCCGAAGGTATGGCCATTGGTGTGTCGGCCGGGGGTGGCATGGCCGACGCCGACAGCCTGGCCATGGGCATTGCCTTGCAGGATGTGc < 3:323228/149‑1 (MQ=255) ccaaccGGTGATTGCAGCGCGCATCTGGCTGTTCGTGATTGCCATCATTGCCCACAACATCCCCGAAGGTATGGCCATTGGTGTGTCGGCCGGGGGTGGCATGGCCGACGCCGACAGCCTGGCCATGGGCATTGCCTTGCAGGATGTGc < 7:323723/149‑1 (MQ=255) ccaaccGGTGATTGCAGCGCGCATCTGGCTGTTCGTGATTGCCATCATTGCCCACAACATCCCCG‑AGGTATGGCCATTGGTGTGTCGGCCGGGGGTGGCATGGCCGACGCCGACAGCCTGGCCATGGGCATTGCCTTGCAGGATGTGcc > 7:11060/1‑149 (MQ=255) accGGTGATTGCAGCGCGCATCTGGCTGTTCGTGATTGCCATCATTGCCCACAACATCCCCGAAGGTATGGCCATTGGTGTGTCGGCCGGGGGTGGCATGGCCGACGCCGACAGCCTGGCCATGGGCATTGCCTTGCAGGATGTGCCt > 3:97229/1‑148 (MQ=255) tGATTGCAGCGCGCATCTGGCTGTTCGTGATTGCCATCATTGCCCACAACATCCCCGAAGGTATGGCCATTGGTGTGTCGGCCGGGGGTGGCATGGCCGACGCCGACAGCCTGGCCATGGGCATTGCCTTGCAGGATGTGCCTGAgggg < 7:319857/149‑1 (MQ=255) gccgcgcgcATCTGGCTGTTCGTGATTGCCATCATTGCCCACAACATCCCCGAAGGTATGGCCATTGGTGTGTCGGCCGGGGGTGGCATGGCCGACGCCGACAGCCTGGCCATGGGCATTGCCTTGCAGGATGTGCCTGAGGGGCTgg < 6:83031/145‑1 (MQ=255) cgcgcATCTGGCGGTTCGTGATTGCCATCATTGCCCACAACATCCCCGAAGGTATCGCCATTGGTGTGTCGGCGGGGGGTGGCATGGCCGACGCCGACAGCCTGGCCATGGGCATTGCCTTGCAGGATGTGCCTGAGGGGCTGGTGATc < 8:125437/149‑1 (MQ=255) aTCTGGCTGTTCGTGATTGCCATCATTGCCCACAACATCCCCGAAGGTATGGCCATTGGTGTGTCGGCCGGGGGTGGCATGGCCGACGCCGACAGCCTGGCCATGGGCATTGCCTTGCAGGATGTGCCTGAGGGGCTGGTGATCGCGCt > 2:282472/1‑149 (MQ=255) tGGCTGTTCGTGATTGCCATCATTGCCCACAACATCCCCGAAGGTATGGCCATTGGTGTGTCGGCCGGGGGTGGCATGGCCGACGCCGACAGCCTGGCCATGGGCATTGCCTTGCAGGATGTGCCTGAGGGGCTGGTGATCGCGCTGGt > 3:55111/1‑149 (MQ=255) ggCTGTTCGTGATTGCCATCATTGCCCACAACATCCCCGAAGGTATGGCCATTGGTGTGTCGGCCGGGGGTGGCATGGCCGACGCCGACAGCCTGGCCATGGGCATTGCCTTGCAGGATGTGCCTGAGGGGCTg < 5:344801/134‑1 (MQ=255) ggCTGTTCGTGATTGCCATCATTGCCCACAACATCCCCGAAGGTATGGCCATTGGTGTGTCGGCCGGGGGTGGCATGGCCGACGCCGACAGCCTGGCCATGGGCATTGCCTTGCAGGATGTGCCTGAGGGGCTg > 6:344801/1‑134 (MQ=255) cTGTTCGTGATTGCCATCATTGCCCACAACATCCCCGAAGGTATGGCCATTGGTGTGTCGGCCGGGGGTGGCATGGCCGACGCCGACAGCCTGGCCATGGGCATTGCCTTGCa > 1:100148/1‑113 (MQ=255) cTGTTCGTGATTGCCATCATTGCCCACAACATCCCCGAAGGTATGGCCATTGGTGTGTCGGCCGGGGGTGGCATGGCCGACGCCGACAGCCTGGCCATGGGCATTGCCTTGCa < 2:100148/113‑1 (MQ=255) ttCGTGATTGCCATCATTGCCCACAACATCCCCGAAGGTATGGCCATTGGTGTGTCGGCCGGGGGTGGCATGGCCGACGCCGACAGCCTGGCCATGGGCATTGCCTTGCAGGATGTGCCTGAGGGGCTGGTGATCGCGCTGGTGCTgg > 1:278908/1‑148 (MQ=255) ttCGTGATTGCCATCATTGCCCACAACATCCCCGAAGGTATGGCCATTGGTGTGTCGGCCGGGGGTGGCATGGCCGACGCCGACAGCCTGGCCATGGGCATTGCCTTGCAGGATGTGCCTGAGGGGCTGGTGATCGCGCTGGTGCTg < 5:181569/147‑1 (MQ=255) gTGATTGCCATCATTGCCCACAACATCCCCGAAGGTATGGCCATTGGTGTGTCGGCCGGGGGTGGCATGGCCGACGCCGACAGCCTGGCCATGGGCATTGCCTTGCAGGATGTGCCTGAGGGGCTGGTGATCGCGCTGGTGCTGGCAgg > 6:209555/1‑149 (MQ=255) gCCATCATTGCCCACAACATCCCCGAAGGTATGGCCATTGGTGTGTCGGCCGGGGGTGGCATGGCCGACGCCGACAGCCTGGCCATGGGCATTGCCTTGCAGGATGTGCCTGAGGGGCTGGTGATCGCGCTGGTGCTGGCAGgggcgg < 3:217989/148‑1 (MQ=255) gCCCACAACATCCCCGAAGGTATGGCCATTGGTGTGTCGGCCGGGGGTGGCATGGCCGACGCCGACAGCCTGGCCATGGGCATTGCCTTGCAGGATGTGCCTGAGGGGCTGGTGATCGCGCTGGTGCTGGCAGGGGCGGGCATGCcgcg > 3:25563/1‑149 (MQ=255) ccACAACATCCCCGAAGGTATGGCCATTGGTGTGTCGGCCGGGGGTGGCATGGCCGACGCCGACAGCCTGGCCATGGGCATTGCCTTGCAGGATGTGCCTGAGGGGCTGGTGATCGCGCTGGTGCTGGCAGGGGCGGGCATGcc < 2:277289/144‑1 (MQ=255) ccACAACATCCCCGAAGGTATGGCCATTGGTGTGTCGGCCGGGGGTGGCATGGCCGACGCCGACAGCCTGGCCATGGGCATTGCCTTGCAGGATGTGCCTGAGGGGCTGGTGATCGCGCTGGTGCTGGCAGGGGCGGGCATGcc > 1:277289/1‑144 (MQ=255) ccACAACATCCCCGAAGGTATGGCCATTGGTGTGTCGGCCGGGGGTGGCATGGCCGACGCCGACAGCCTGGCCATGGGCATTGCCTTGCAGGATGTGCCTGAGGGGCTGGTGATCGCGCTGGTGCTGGCAGGGGCGGGCATGCCGCGCt > 1:133928/1‑149 (MQ=255) cacaACATCCCCGAAGGTATGGCCATTGGTGTGTCGGCCGGGGGTGGCATGGCCGACGCCGACAGCCTGGCCATGGGCATTGCCTTGCAGGATGTGCCTGAGGGGCTGGTGATCGCGCTGGTGCTGGCAGGGGCGGGCATGCCGCGCt > 6:29407/1‑148 (MQ=255) acaacaTCCCCGAAGGTATGGCCATTGGTGTGTCGGCCGGGGGTGGCATGGCCGACGCCGACAGCCTGGCCATGGGCATTGCCTTGCAGGATGTGCCTGAGGGGCTGGTGATCGCGCTGGTGCTGGCAGGGGCGGGCATGCCGCGCTTc < 2:249478/149‑1 (MQ=255) acaacaTCCCCGAAGGTATGGCCATTGGTGTGTCGGCCGGGGGTGGCATGGCCGACGCCGACAGCCTGGCCATGGGCATTGCCTTGCAGGATGTGCCTGAGGGGCTGGTGATCGCGCTGGTGCTGGCAGGGGCGGGAATGCCGCGCtt > 4:173209/1‑148 (MQ=255) aTCCCCGAAGGTATGGCCATTGGTGTGTCGGCCGGGGGTGGCATGGCCGACGCCGACAGCCTGGCCATGGGCATTGCCTTGCAGGATGTGCCTGAGGGGCTGGTGATCGCGCTGGTGCTGGCAGGGGCGGGCATGCCGCGCTTCAAGGc > 7:3284/1‑149 (MQ=255) aTCCCCGAAGGTATGGCCATTGGTGTGTCGGCCGGGGGTGGCATGGCCGACGCCGACAGCCTGGCCATGGGCATTGCCTTGCAGGATGTGCCTGAGGGGCTGGTGATCGCGCTGGTGCTGGCAGGGGCGGGCATGCCGCGCTTCAAGGc < 2:278908/149‑1 (MQ=255) cccGAAGGTATGGCCATTGGTGTGTCGGCCGGGGGTGGCATGGCCGACGCCGACAGCCTGGCCATGGGCATTGCCTTGCAGGATGTGCCTGAGGGGCTGGTGATCGCGCTGGTGCTGGCAGGGGCGGGCATGCCGCGCTTCAAGGCCt < 3:292588/148‑1 (MQ=255) ccGAAGGTATGGCCATTGGTGTGTCGGCCGGGGGTGGCATGGCCGACGCCGACAGCCTGGCCATGGGCATTGCCTTGCAGGATGTGCCTGAGGGGCTGGTGATCGCGCTGGTGCTGGCAGgggcgg > 4:15752/1‑126 (MQ=255) ccGAAGGTATGGCCATTGGTGTGTCGGCCGGGGGTGGCATGGCCGACGCCGACAGCCTGGCCATGGGCATTGCCTTGCAGGATGTGCCTGAGGGGCTGGTGATCGCGCTGGTGCTGGCAGgggcgg < 3:15752/126‑1 (MQ=255) ccGAAGGTATGGCCATTGGTGTGTCGGCCGGGGGTGGCATGGCCGACGCCGACAGCCTGGCCATGGGCATTGCCTTGCAGGATGTGCCTGAGGGGCTGGTGATCGCGCTGGTGCTGGCAGGGGCGGGCATGCCGCGCTTCAAGGCCTTc > 3:85519/1‑149 (MQ=255) ccGAAGGTATGGCCATTGGTGTGTCGGCCGGGGGTGGCATGGCCGACGCCGACAGCCTGGCCATGGGCATTGCCTTGCAGGATGTGCCTGAGGGGCTGGTGATCGCGCTGGTGCTGGCAGGGGCGGGCATGCCGCGCTTCAAGGCCTTc > 2:111010/1‑149 (MQ=255) aaGGTATGGCCATTGGTGTGGCGGCCGGGGGTGGCATGGCCGACGCCGACAGCCTGGCCATGGGCATTGCCTTGCAGGATGTGCCTGAGGGGCTGGTGATCGCGCTGGTGCTGGCAGGGGCGGGCATGCCGCGCTTCAAGGCCTTCCTg < 5:114023/149‑1 (MQ=255) ggTATGGCCATTGGTGTGTCGGCCGGGGGTGGCATGGCCGACGCCGACAGCCtggccataccttcggggatgttgtgggcaatgatggcaatcacgaacagccagatgcgcgctgcaatcaccggttggtttgccgtgcccaccagcgc < 1:149269‑M2/149‑98 (MQ=255) tATGGCCATTGGTGTGTCGGCCGGGGGTGGCATGGCCGACGCCGACAGCCtggccataccttcggggatgttgtgggcaatgatggcaatcacgaacagccagatgcgcgctgcaatcaccggttggtttgccgtgcccaccagcgctt < 7:57728‑M2/149‑100 (MQ=255) aTGGCCATTGGTGTGTCGGCCGGGGGTGGCATGGCCGACGCCGACAGCCTGGCCATGGGCATTGCCTTGCAGGATGTGCCTGAGGGGCTGGTGATCGCGCTGGTGCTGGCa < 7:281146/111‑1 (MQ=255) aTGGCCATTGGTGTGTCGGCCGGGGGTGGCATGGCCGACGCCGACAGCCTGGCCATGGGCATTGCCTTGCAGGATGTGCCTGAGGGGCTGGTGATCGCGCTGGTGCTGGCa > 8:281146/1‑111 (MQ=255) tGGCCATTGGTGTGTCGGCCGGGGGTGGCATGGCCGACGCCGACAGCCtggccataccttcggggatgttgtgggcaatgatggcaatcacgaacagccagatgcgcgctgcaatcaccggttggtttgccgtgcccaccagcgcttc > 2:149269‑M2/1‑48 (MQ=255) tGGCCATTGGTGTGTCGGCCGGGGGTGGCATGGCCGACGCCGACAGCCTGGCCATGGGCATTGCCTTGCAGGATGTGCCTGAGGGGCTGGTGATCGCGCTGGTGCTGGCAGGGGCGGGCATGCCGCGCTTCAAGGCCTTCCTGATCGgc < 5:29407/149‑1 (MQ=255) ggCCATTGGTGTGTCGGCCGGGGGTGGCATGGCCGACGCCGACAGCCTGGCCATGGGCATTGCCtt < 6:257454/66‑1 (MQ=255) ggCCATTGGTGTGTCGGCCGGGGGTGGCATGGCCGACGCCGACAGCCTGGCCATGGGCATTGCCtt > 5:257454/1‑66 (MQ=255) aTTGGTGTGTCGGCCGGGGGTGGCATGGCCGACGCCGACAGCCTGGCCATGGGCATTGCCTTGCAGGATGTGCCTGAGGGGCTGGTGATCGCGCTGGTGCTGGCAGGGGCGGGCATGCCGCGCTTCAAGGCCTTCCTGATCGGCGCAGc < 4:25563/149‑1 (MQ=255) gtgtCGGCCGGGGGTGGCATGGCCGACGCCGACAGCCTGGCCATGGGCATTGCCTTGCAGGATGTGCCTGAGGGGCTGGTGATCGCGCTGGTGCTGGCAGGGGCGGGCATGCCGCGCTTCAAGGCCTTCCTGATCGGCGCAGCCTCAgg > 3:131015/1‑149 (MQ=255) gtCGGCCGGGGGTGGCATGGCCGACGCCGACAGCCTGGCCATGGGCATTGCCTTGCAGGATGTGCCTGAGGGGCTGGTGATCGCGCTGGTGCTGGCAGGGGCGGGCATGCCGCGCTTCAAGGCCTTCCTGATCGGCGCAGCCTCAGGCt > 3:132015/1‑149 (MQ=255) gtCGGCCGGGGGTGGCATGGCCGACGCCGACAGCCTGGCCATGGGCATTGCCTTGCAGGATGTGCATGAGGGGCTGGTGATCGCGCTGGTGCTGCAAGTGGCGGTCATGCCGCGCTTCAAGTCCTTCCAGATCGACGCAGCCTCAGGCt > 8:277172/1‑149 (MQ=255) ggCCGGGGGTGGCATGGCCGACGCCGACAGCCTGGCCATGGGCATTGCCTTGCAGGATGTGCCTGAGGGGCTGGTGATCGCGCTGGTGCTGGCAGGGGCGGGCATGCCGCGCTTCAAGGCCTTCCTGATCGGCGCAGCCTCAGGCTTg < 4:55111/148‑1 (MQ=255) ggCCGGGGGTGGCATGGCCGACGCCGACAGCCTGGCCATGGGCATTGCCTTGCAGGATGTGCCTGAGGGGCTGGTGATCGCGCTGGTGCTGGCAGGGGCGGGCATGCCGCGCTTCAAGGCCTTCCTGATCGGCGCAGCCTCAGGCTTg < 8:11060/148‑1 (MQ=255) gggTGGCATGGCCGACGCCGACAGCCTGGCCATGGGCATTGCCTTGCAGGATGTGCCTGAGGGGCTGGTGATCGCGCTGGTGCTGGCAGGGGCGGGCATGCCGCGCTTCAAGGCCTTCGTGATCGGCGCAGCCTCAGGCTTGGTCGAGc < 4:132015/149‑1 (MQ=255) cATGGCCGACGCCGACAGCCTGGCCATGGGCATTGCCTTGCAGGATGTGCCTGAGGGGCTGGTGATCGCGCTgg < 6:290756/74‑1 (MQ=255) cATGGCCGACGCCGACAGCCTGGCCATGGGCATTGCCTTGCAGGATGTGCCTGAGGGGCTGGTGATCGCGCTgg > 5:290756/1‑74 (MQ=255) gacgccgacAGCCTGGCCATGGGCATTGCCTTGCAGGATGTGCCTGAGGGGCTGGTGATCGCGCTGGTGCTGGCAGGGGCGGGCATGCCGCGCTTCAAGGCCTTCCTGATCGGCGCAGCCTCAGGCTTGGTCGAGCCGCTGGCGGCGtt < 4:85519/149‑1 (MQ=255) gccgacAGCCTGGCCATGGGCATTGCCTTGCAGGATGTGCCTGAGGGGCTGGTGATCGCGCTGGTGCTGGCAGGGGCGGGCATGCCGCGCTTCAAGGCCTTCCTGATCGGCGCAGCCTCAGGCTTGGTCGAGCCGCTGGCGGCGTTGAt < 4:97229/149‑1 (MQ=255) | CGCCGGAAGCGCTGGTGGGCACGGCAAACCAACCGGTGATTGCAGCGCGCATCTGGCTGTTCGTGATTGCCATCATTGCCCACAACATCCCCGAAGGTATGGCCATTGGTGTGTCGGCCGGGGGTGGCATGGCCGACGCCGACAGCCTGGCCATGGGCATTGCCTTGCAGGATGTGCCTGAGGGGCTGGTGATCGCGCTGGTGCTGGCAGGGGCGGGCATGCCGCGCTTCAAGGCCTTCCTGATCGGCGCAGCCTCAGGCTTGGTCGAGCCGCTGGCGGCGTTGAT > NC_002947/1092048‑1092333 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |