New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 2326433 | 37 (0.680) | 5 (0.100) | 4/246 | NT | 12.2% | coding (871/1962 nt) | PP_2045 | metallo‑beta‑lactamase family protein |
? | NC_002947 | = 2326453 | 37 (0.720) | coding (851/1962 nt) | PP_2045 | metallo‑beta‑lactamase family protein |
CACCAGCGATTGGTCCAGGTAATGGGCCCACACTTTCGGATCGCGCACCAGGGCCCCGCGCAGCGTCAGTACGTTGTGCTGCACATGGGTGGCGTTCTCGGCCATGCACAGTGCCCTGAGCGCCGGGAAATAAATGTTCATTTCCGCCGGCGCCTCGGTGCCCGGGGTCAGCTGGAACTCCACCTCCACGCCGCTCAGGGTCATGCGTTGCAGCGGTTGGCTGATTTCGAGCGTCGGCGCGATGAGGCTGACAGTGGCATTGGCCGGCACGCCCTTGCCCAGTCCGGCATCC > NC_002947/2326308‑2326599 | cACCAGCGATTGGTCCAGGTAATGGGCCCACACTTTCGGATCGCGCACCAGGGCCCCGCGCAGCGTCAGTACGTTGTGCTGCACATGGGTGGCGTTCTCGGCCATGCACAGTGCCCTGAGCGCCGGGAAATAAATGTTCATTTCCGccg > 4:271237‑M2/1‑146 (MQ=255) cAGCGATTGGTCCAGGTAATGGGCCCACACTTTCGGATCGCGCACCAGGGCCCCGCGCAGCGTCAGTACGTTGTGCTGCACATGGGTGGCGTTCTCGGCCATGCACAGTGCCCTGAGCGCCGGGAAATAAATGTTCATTTCCGccggcg < 2:98501‑M2/149‑7 (MQ=255) cGATTGGTCCAGGTAATGGGCCCACACTTTCGGATCGCGCACCAGGGCCCCGCGCAGCGTCAGTACGTTGTGCTGCACATGGGTGGCGTTCTCGGCCATGCACAGTGCCCTGAGCGCCGGGAAATAAATGTTCATTTCCGCCGGCGCCt < 3:24285/149‑1 (MQ=255) cAGGTAATGGGCCCACACTTTCGGATCGCGCACCAGGGCCCCGCGCAGCGTCAGTACGTTGTGCTGCACATGGGTGGCGTTCTCGGCCATGCACAGTGCCCTGAGCGCCGGGAAATAAATGTTCATTTCCGCCGGCGCCTCGGTGCCCg < 1:98501/149‑1 (MQ=255) ggTAATGGGCCCACACTTTCGGATCGCGCACCAGGGCCCCGCGCAGCGTCAGTACGTTGTGCTGCACATGGGTGGCGTTCTCGGCCATGCACAGTGCCCTGAGCGCCGGGAAATAAATGTTCATTTCCGCCGGCGCCTc > 8:165223/1‑139 (MQ=255) ggTAATGGGCCCACACTTTCGGATCGCGCACCAGGGCCCCGCGCAGCGTCAGTACGTTGTGCTGCACATGGGTGGCGTTCTCGGCCATGCACAGTGCCCTGAGCGCCGGGAAATAAATGTTCATTTCCGCCGGCGCCTc < 7:165223/139‑1 (MQ=255) ggTAATGGGCCCACACTTTCGGATCGCGCACCAGGGCCCCGCGCAGCGTCAGTACGTTGTGCTGCACATGGGTGGCGTTCTCGGCCATGCACAGTGCCCTGAGCGCCGGGAAATAAATGTTCATTTCCGCCGGCGCCTCGGTGCCCggg < 1:248247/149‑1 (MQ=255) tAATGGGCCCACACTTTCGGATCGCGCACCAGGGCCCCGCGCAGCGTCAGTACGTTGTGCTGCACATGGGTGGCGTTCTCGGCCATGCACAGTGCCCTGAGCGCCGGGAAATAAATGTTCATTTCCGCCGGCGCCTCGGTGCCCGGGGt < 1:91922/149‑1 (MQ=255) tCGCGCACCAGGGCCCCGCGCAGCGTCACTACGTTGTGCTGCACATGGGTGGCGTTCTCGGCCATGCACAGTGCCCTGAGCGCCGGGAAATAAATGTTCATTTCCGCCGGCGCCTCGGTGCCCGGGGTCAGCTGGAActccacctccac > 1:196564/1‑149 (MQ=255) cccGCGCAGCGTCAGTACGTTGTGCTGCACATGGGTGGCGTTCTCGGCCATGCACAGTGACCTGAGCGCCGGGAAATAAATGTTCATTTCCGCCGGCGCCTCGGTGCCCGGGGTCAGCTGGAACTCCACCTCCACGCCGCTCAGGGTCa > 7:68871/1‑149 (MQ=255) cGTTGTGCTGCACATGGGTGGCGTTCTCGGCCATGCACAGTGCCCTGAGCGCCGGGAAATAAATGTTCATTTCCGCCGGCGCCTCGGTGCCCGGGGTCAGCTGGAACTCCACCTCCACGCCGCTCAGGGTCATGCGTTGCAGCGGTTgg > 2:242739/1‑149 (MQ=255) gTTGTGCTGCACATGGGTGGTGTTCTCGGCCATGCACAGTGCCCTGAGCGCCGGGAAATAAATGTTCATTTCCGCCGGCGCCTCGGTGCCCGGGGTCAGCTGGAACTCCACCTCCACGCCGCTCAGGGTCATGCGTTGCTGCGGTTGGc > 8:53431/1‑149 (MQ=255) ctgcACATGGGTGGCGTTCTCGGCCATGCACAGTGCCCTGAGCGCCGGGAAATAAATGTTCATTTCCGCCGGCGCCTCGGTGCCCGGGGTCAGCTGGAACTCCACCTCCACGCCGCTCAGGGTCATGCGTTGCAGCGGTTGGCt < 8:54060/144‑1 (MQ=255) ctgcACATGGGTGGCGTTCTCGGCCATGCACAGTGCCCTGAGCGCCGGGAAATAAATGTTCATTTCCGCCGGCGCCTCGGTGCCCGGGGTCAGCTGGAACTCCACCTCCACGCCGCTCAGGGTCATGCGTTGCAGCGGTTGGCt > 7:54060/1‑144 (MQ=255) cacaTGGGTGGCGTTCTCGGCCATGCACAGTGCCCTGAGCGCCGGGAAATAAATGTTCATTTCCGCCGGCGCCTCGGTGCCCGGGGTCAGCTGGAACTCCACCTCCACGCCGCTCAGGGTCATGCGTTGCAGCGGTTGGCTGATTTc > 5:65831/1‑147 (MQ=255) caTGGGTGGCGTTCTCGGCCATGCACAGTGACCTGAGCGCCGGGAAATAAATGTTCATTTCCGCCGGCGCCTCGGTGCCCGGGGTCAGCTGGAACTCCACCTCCACGCCGCTCAGGGTCATGCGTTGCAGCGGTTGGCTGATTTCGAGc < 8:68871/149‑1 (MQ=255) aTGGGTGGCGTTCTCGGCCATGCACAGTGCCCTGAGCGCCGGGAAATAAATGTTCATTTCCGCCGGCGCCTCGGTGCCCGGGGTCAGCTGGAACTCCACCTCCACGCCGCTCAGGGTCATGCGTTGCAGCGGTTGGCTGATTTCGAGCg > 2:343459/1‑149 (MQ=255) gggTGGCGTTCTCGGCCATGCACAGTGCCCTGAGCGCCGGGAAATAAATGTTCATTTCCGCCGGCGCCTCGGTGCCCGGGGTCAGCTGGAACTCCACCTCCACGCCGCTCAGGGTCATGCGTTGCAGCGGTTGGCTGATTTCGAGCGTc > 1:50241/1‑149 (MQ=255) gggTGGCGTTCTCGGCCATGCACAGTGCCCTGAGCGCCGGGAAATAAATGTTCATTTCCGCCGGCGCCTCGGCGCCCGGGGTCAGCTGGAACTCCACCTCCACGCCGCTCAGGGTCATGCGTTGCAGCGGTTGGCTGATTTCGAGCGTc > 8:230416/1‑149 (MQ=255) tcGGCCATGCACAGTGCCCTGAGCGCCGGGAAATAAATGTTCATTTCCGCCGGCGCCTCGGTGCCCGGGGTCAGCTGGaa < 8:303481/80‑1 (MQ=255) tcGGCCATGCACAGTGCCCTGAGCGCCGGGAAATAAATGTTCATTTCCGCCGGCGCCTCGGTGCCCGGGGTCAGCTGGaa > 7:303481/1‑80 (MQ=255) tcGGCCATGCACAGTGCCCTGAGCGCCGGGAAATAAATGTTCATTTCCGCCGGCGCCTCGGTGCCCGGGGTCAGCTGGAACTCCACCTCCACGCCGCTCAGGGTCATGCGTTGCAGCGGTTGGCTGATTTCGAGCGTCGGCGCGATGAg > 6:237663/1‑149 (MQ=255) ggCCATGCACAGTGCCCTGAGCGCCGGGAAATAAATGTTCATTTCCGCCGGCGCCTCGGTGCCCGGGGTCAGCTGGAACTCCACCTCCACGCCGCTCAGGGTCATGCGTTGCAGCGGTTGGCTGATTTCGAGCGTCGGCGCGATGAGGc > 5:102658/1‑149 (MQ=255) aTGCACAGTGCCCTGAGCGCCGGGAAATAAATGTTCATTTCCGCCGGCGCCTCGGTGCCCGGGGTCAGCTGGAACTCCACCTCCACGCCGCTCAGGGTCATGCGTTGCAGCGGTTGGCTGATTTCGAGCGTCGGCGCGATGAGGCTGa > 4:4942/1‑148 (MQ=255) acaGTGCCCTGAGCGCCGGGAAATAAATGTTCATTTCCGCCGGCGCCTCGGTGCCCGGGGTCAGCTGGAACTCCACCTCCACGCCGCTCAGGGTCATGCGTTGCAGCGGTTGGCTGa < 6:94865/117‑1 (MQ=255) acaGTGCCCTGAGCGCCGGGAAATAAATGTTCATTTCCGCCGGCGCCTCGGTGCCCGGGGTCAGCTGGAACTCCACCTCCACGCCGCTCAGGGTCATGCGTTGCAGCGGTTGGCTGATTTCGAGCGTCGGCGCGATGAGGCTGACAGTg < 3:4942/149‑1 (MQ=255) acaGTGCCCTGAGCGCCGGGAAATAAATGTTCATTTCCGCCGGCGCCTCGGTGCCCGGGGTCAGCTGGAACTCCACCTCCACGCCGCTCAGGGTCATGCGTTGCAGCGGTTGGCTGATTTCGAGCGTCGGCGCGATGAGGCTGACAGTg < 1:242739/149‑1 (MQ=255) acaGTGCCCTGAGAGCCGGGAAATAAATGTTCATTTCCGCCGGCGCCTCGGTGCCCGGGGTCAGCTGGAACTCCACCTCCACGCCGCTCAGGGTCATGCGTTGCAGCGGTTGGCTGa > 5:94865/1‑117 (MQ=255) caGTGCCCTGAGCGCCGGGAAATAAATGTTCATTTCCGCCGGCGCCTCGGTGCCCGGGGTCAGCTGGAACTCCACCTCCACGCCGCTCAGGGTCATGCGTTGCAGCGGTTGGCTGATTTCGAGCGTCGgcg > 8:144993/1‑131 (MQ=255) caGTGCCCTGAGCGCCGGGAAATAAATGTTCATTTCCGCCGGCGCCTCGGTGCCCGGGGGCAGCTGGAACTCCACCTCCACGCCGCTCAGGGTCATGCGTTGCAGCGGTTGGCTGATTTCGAGCGTCGgcg < 7:144993/131‑1 (MQ=255) aGTGCCCTGAGCGCCGGGAAATAAATGTTCATTTCCGCCGGCGCCTCGGTGCCCGGGGTCAGCTGGAACTCCACCTCCACGCCGCTCAGGGTCATGCGTTGCAGCGGTTGGCTGATTTCGAGCGTCGGCGCGATGAGGCTGACAGTgg > 2:266029/1‑148 (MQ=255) cTGAGCGCCGGGAAATAAATGTTCATTTCCGccggcgctcagggcactgtgcatggccgagaacgccacccatgtgcagcacaacgtactgacgctgcgcggggccctggtgcgcgatccgaaagtgtgggcccattacctggaccaat < 5:48669‑M2/149‑119 (MQ=255) cTGAGCGCCGGGAAATAAATGTTCATTTCCGccggcgctcagggcactgtgcatggccgagaacgccacccatgtgcagcacaacgtactgacgctgcgcggggccctggtgcgcgatccgaaagtgtgggcccattacct < 1:56613‑M2/141‑111 (MQ=255) cTGAGCGCCGGGAAATAAATGTTCATTTCCGccggcgctcagggcactgtgcatggccgagaacgccacccatgtgcagcacaacgtactgacgctgcgcggggccctggtgcgcgatccgaaagtgtgggcccattacct > 2:56613‑M2/1‑31 (MQ=255) cTGAGCGCCGGGAAATAAATGTTCATTTCCGCCGGCGCCTCGGTGCCCGGGGTCAGCTGGAACTCCACCTCCACGCCGCTCAGGGTCATGCGTTGCAGCGGTTGGCTGATTTCGAGCGTCGGCGCGATGAGGCTGACAGTGGCATTGGc > 1:224580/1‑149 (MQ=255) cTGAGCGCCGGGAAATAAATGTTCATTTCCGCCGGCGCCTCGGCGCCCGGGGTCAGCTGGAACTCCACCTCCACGCCGCTCAGGGTCATGCGTTGCAGCGGTTGGCTGATTTCGAGCGTCGGCGCGATGAGGCTGACAGTGGCATTGGc < 7:230416/149‑1 (MQ=255) tGAGCGCCGGGAAATAAATGTTCATTTCCGccggcgctcagggcactgtgcatggccgagaacgccacccatgtgcagcacaacgtactgacgctgcgcggggccctggtgc < 2:213171‑M2/112‑83 (MQ=255) tGAGCGCCGGGAAATAAATGTTCATTTCCGccggcgctcagggcactgtgcatggccgagaacgccacccatgtgcagcacaacgtactgacgctgcgcggggccctggtgc > 1:213171‑M2/1‑30 (MQ=255) aGCGCCGGGAAATAAATGTTCATTTCCGCCGGCGCCTCGGTGCCCGGGGTCAGCTGGAACTCCACCTCCACGCCGCTCAGGGTCATGCGTTGCAGCGGTTGGCTGATTTCGAGCGTCGGCGCGATGAGGCTGACAGTGGCATTGGGCg < 2:50241/148‑1 (MQ=255) gcCGGGAAATAAATGTTCATTTCCGCCGGCGCCTCGGTGCCCGGGGTCAGCTGGAACTCCACCTCCACGCCGCTCAGGGTCATGCGTTGCAGCGGt < 4:300275/96‑1 (MQ=255) gcCGGGAAATAAATGTTCATTTCCGCCGGCGCCTCGGTGCCCGGGGTCAGCTGGAACTCCACCTCCACGCCGCTCAGGGTCATGCGTTGCAGCGGt > 3:300275/1‑96 (MQ=255) ataaatGTTCATTTCCGCCGGCGCCTCGGTGCCCGGGGTCAGCTGGAACTCCACCTCCACGCCGCTCAGGGTCATGCGTTGCAGCGGTTGGCTGATTTCGAGCGTCGGCGCGATGAGGCTGACAGTGGCATTGGCCGGCACGCCCTTGc > 3:105980/1‑149 (MQ=255) ttCATTTCCGCCGGCGCCTCGGTGCCCGGGGTCAGCTGGAACTCCACCTCCACGCCGCTCAGGGTCATGCGTTGCAGCGGTTGGCTGATTTCGAGCGTCGGCGCGATGAGGCTGACAGTGGCATTGGCCGGCACGCCCTTGCCCAGTc < 6:102658/148‑1 (MQ=255) cATTTCCGCCGGCGCCTCGGTGCCCGGGGTCAGCTGGAACTCCACCTCCACGCCGCTCAGGGTCATGCGTTGCAGCGGTTGGCTGATTTCGAGCGTCGGCGCGATGAGGCTGACAGTGGCATTGGCCGGCACGCCCtt < 4:203949/138‑1 (MQ=255) cATTTCCGCCGGCGCCTCGGTGCCCGGGGTCAGCTGGAACTCCACCTCCACGCCGCTCAGGGTCATGCGTTGCAGCGGTTGGCTGATTTCGAGCGTCGGCGCGATGAGGCTGACAGTGGCATTGGCCGGCACGCCCtt > 3:203949/1‑138 (MQ=255) aTTTCCGCCGGCGCCTCGGTGCCCGGGGTCAGCTGGAACTCCACCTCCACGCCGCTCAGGGTCATGCGTTGCAGCGGTTGGCTGATTTCGAGCGTCGGCGCGATGAGGCTGACAGTGGCATTGGCCGGCACGCCCTTGCCCAGTCCgg > 1:93045/1‑148 (MQ=255) tttCCGCCGGCGCCTCGGTGCCCGGGGTCAGCTGGAACTCCACCTCCTCGCCGCTCAGGGTCATGCGTTGCAGCGGTTGGCTGATTTGGAGCGTCGGCGCGATGAGGCTGACAGTGGCATTGGCCGGCACGCCCTTGCCCAGTCCGGCa < 6:296656/149‑1 (MQ=255) cgccgGCGCCTCGGTGCCCGGGGTCAGCTGGAACTCCACCTCCACGCCGCTCAGGGTCATGCGTTGCAGCGGTTGGCTGATTTCGAGCGTCGGCGCGATGAGGCTGACAGTGGCATTGGCCGGCACGCCCTTGCCCAGTCCGGCATcc < 2:93045/148‑1 (MQ=255) | CACCAGCGATTGGTCCAGGTAATGGGCCCACACTTTCGGATCGCGCACCAGGGCCCCGCGCAGCGTCAGTACGTTGTGCTGCACATGGGTGGCGTTCTCGGCCATGCACAGTGCCCTGAGCGCCGGGAAATAAATGTTCATTTCCGCCGGCGCCTCGGTGCCCGGGGTCAGCTGGAACTCCACCTCCACGCCGCTCAGGGTCATGCGTTGCAGCGGTTGGCTGATTTCGAGCGTCGGCGCGATGAGGCTGACAGTGGCATTGGCCGGCACGCCCTTGCCCAGTCCGGCATCC > NC_002947/2326308‑2326599 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |