| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 2502274 | 59 (1.090) | 3 (0.060) | 3/250 | NT | 5.4% | coding (713/1089 nt) | PP_2195 | putrescine‑binding protein |
| ? | NC_002947 | = 2502317 | 49 (0.940) | coding (756/1089 nt) | PP_2195 | putrescine‑binding protein | |||||
ACCTGCTCAGCCAGCTGCAGCCGTCGATCAGCTACGTTGCCAACGGCCGGCAGATCAACGACCTGGCCAATGGCAGCGTGTGCCTGGCATTGACCTACAACGGTGATGCCGCGATGGCCGCCGACCAGGCCCGGCGTGCCGGCAAGCCGTTCGAGGTGATCTACCGCATCCCCCGCGAAGGCACGCTGGTATGGCAGGACAACCTGGTCATCCCCAAGGACGCCCCGCACCCCGAGGCCGCACGGGCGTTCATCGCCTTCATGCTCAAGCCAGAGTCGGTGGCAGCGCTGA > NC_002947/2502172‑2502462 | aCCTGCTCAGCCAGCTGCAGCCGTCGATCAGCTACGTTGCCAACGGCCGGCAGATCAACGACCTGGCCAATGGCAGCGTGTGCCTGGCATTGACCTACAACGGTGATGCCGCGATGGCCGCCGACCAGGCCCGGCGTGCCGGCAAGccg > 5:343908‑M2/1‑146 (MQ=255)aCCTGCTCAGCCAGCTGCAGCCGTCGATCAGCTACGTTGCCAACGGCCGGCAGATCAACGACCTGGCCAATGGCAGCGTGTGCCTGGCATTGACCTACAACGGTGATGCCGCGATGGCCGCCGACCAGGCCCGGCGTGCCGGCAAGccg < 1:189899‑M2/149‑4 (MQ=255) cTGCTCAGCCAGCTGCAGCCGTCGATCAGCTACGTTGCCAACGGCCGGCAGATCAACGACCTGGCCAATGGCAGCGTGTGCCTGGCATTGACCTACAACGGTGATGCCGCGATGGCCGCCGACCAGGCCCGGCGTGCCGGCAAGccgtt < 5:128668‑M2/149‑6 (MQ=255) agccagcTGCAGCCGTCGATCAGCTACGTTGCCAACGGCCGGCAGATCAACGACCTGGCCAATGGCAGCGTGTGCCTGGCATTGACCTACAACGGTGATGCCGCGATGGCCGCCGACCAGGCCCGGCGTGCCGGCAAGCCGTTCGAgg < 6:128668/148‑1 (MQ=255) agccagcTGCAGCCGTCGATCAGCTACGTTGCCAACGGCCGGCAGATCAACGACCTGGCCAATGGCAGCGTGTGCCTGGCATTGACCTACAACGGTGATGCCGCGATGGCCGCCGACCAGGCCCGGCGTGCCGGCAAGCCGTTCGAgg < 3:197509/148‑1 (MQ=255) agccagcTGCAGCCGTCGATCAGCTACGTTGCCAACGGCCGGCAGATCAACGACCTGGCCAATGGCAGCGTGTGCCTGGCATTGACCTACAACGGTGATGCCGCGATGGCCGCCGACCAGGCCCGGCGTGCCGGCAAGCCGTTCGAg < 8:7762/147‑1 (MQ=255) gccagcTGCAGCCGTCGATCAGCTACGTTGCCAACGGCCGGCAGATCAACGACCTGGCCAATGGCAGCGTGTGCCTGGCATTGACCTACAACGGTGATGCCGCGATGGCCGCCGACCAGGCCCGGCGTGCCCGCAAGCCGTTCGAGGt > 8:83590/1‑148 (MQ=255) ccagcTGCAGCCGTCGATCAGCTACGTTGCCAACGGCCGGCAGATCAACGACCTGGCCAATGGCAGCGTGTGCCTGGCATTGACCTACAACGGTGATGCCGCGATGGCCGCCGACCAGGCCCGGCGTGCCGGCAAGCCGTTCGAGGTGa > 2:154702/1‑149 (MQ=255) ccagcTGCAGCCGTCGATCAGCTACGTTGCCAACGGCCGGCAGATCAACGACCTGGCCAATGGCAGCGTGTGCCTGGCATTGACCTACAACGGTGATGCCGCGATGGCCGCCGACCAGGCCCGGCGTGCCGGCAAGCCGTTCGAGGTGa < 1:338646/149‑1 (MQ=255) cTGCAGCCGTCGATCAGCTACGTTGCCAACGGCCGGCAGATCAACGACCTGGCCAATGGCAGCGTGTGCCTGGCATTGACCTACAACGGTGATGCCGCGATGGCCGCCGACCAGGCCCGGCGTGCCGGCAAGCCGTTCGAGGTGATCTa > 1:277659/1‑149 (MQ=255) cAGCCGTCGATCAGCTACGTTGCCAACGGCCGGCAGATCAACGACCTGGCCAATGGCAGCGTGTGCCTGGCATTGACCTACAACGGTGATGCCGCGATGGCCGCCGACCAGGCCCGGCGTGCCGGCAAGCCGTTCGAGGTGATCTAcc < 7:83590/148‑1 (MQ=255) cAGCCGTCGATCAGCTACGTTGCCAACGGCCGGCAGATCAACGACCTGGCCAATGGCAGCGTGTGCCTGGCATTGACCTACAACGGTGATGCCGCGATGGCCGCCGACCAGGCCCGGCGTGCCGGCAAGCCGTTCGAGGTGATCTAc < 8:287844/147‑1 (MQ=255) aGCCGTCGATCAGCTACGTTGCCAACGGCCGGCAGATCAACGACCTGGCCAATGGCAGCGTGTGCCTGGCATTGACCTACAACGGTGATGCCGCGATGGCCGCCGACCAGGCCCGGCGTGCCGGCAAGCCGTTCGAGGTGATCTACCg > 4:326591/1‑148 (MQ=255) gCTACGTTGCCAACGGCCGGCAGATCAACGACCTGGCCAATGGCAGCGTGTGCCTGGCATTGACCTACAACGGTGATGCCGCGATGGCCGCCGACCAGGCCCGGCGTGCCGGCAAGCCGTTCGAGGTGATCTACCGCATCCCCcgcg > 1:308060/1‑147 (MQ=255) gCTACGTTGCCAACGGCCGGCAGATCAACGACCTGGCCAATGGCAGCGTGTGCCTGGCATTGACCTACAACGGTGATGCCGCGATGGCCGCCGACCAGGCCCGGCGTGCCGGCAAGCCGTTCGAGGTGATCTACCGCATCCCCCGCGaa < 7:259354/149‑1 (MQ=255) cGTTGCCAACGGCCGGCAGATCAACGACCTGGCCAATGGCAGCGTGTGCCTGGCATTGACCTACAACGGTGATGCCGCGATGGCCGCCGACCAGGCCCGGCGTGCCGGCAAGCCGTTCGAGGTGATCTACCGCATCCCCCGCGAAGGCa < 7:297378/149‑1 (MQ=255) ccAACGGCCGGCAGATCAACGACCTGGCCAATGGCAGCGTGTGCCTGGCATTGACCTACAACGGTGATGCCGCGATGGCCGCCGACCAGGCCCGGCGTGCCGGCAAGCCGTTCGAGGTGATCTACCGCATCCCCCGCGAAGGCACGCTg < 2:189899/149‑1 (MQ=255) cAACGGCCGGCAGATCAACGACCTGGCCAATGGCAGCGTGTGCCTGGCATTGACCTACAACGGTGATGCCGCGATGGCCGCCGACCAGGCCCGGCGTGCCGGCAAGCCGTTCGAGGTGATCTACCGCATCCCCCGCGAAGGCACGCTg > 3:111944/1‑148 (MQ=255) cAACGGCCGGCAGATCAACGACCTGGCCAATGGCAGCGTGTGCCTGGCATTGACCTACAACGGTGATGCCGCGATGGCCGCCGACCAGGCCCGGCGTGCCGGCAAGCCGTTCGAGGTGATCTACCGCATCCCCCGCGAAGGCACGCTg < 4:111944/148‑1 (MQ=255) aaCGGCCGGCAGATCAACGACCTGGCCAATGGCAGCGTGTGCCTGGCATTGACCTACAACGGTGATGCCGCGATGGCCGCCGACCAGGCCCGGCTTGCCGGCACGccgg < 1:192339‑M2/109‑5 (MQ=255) aaCGGCCGGCAGATCAACGACCTGGCCAATGGCAGCGTGTGCCTGGCATTGACCTACAACGGTGATGCCGCGATGGCCGCCGACCAGGCCCGGCTTGCCGGCACGccgg > 2:192339‑M2/1‑105 (MQ=255) aaCGGCCGGCAGATCAACGACCTGGCCAATGGCAGCGTGTGCCTGGCATTGACCTACAACGGTGATGCCGCGATGGCCGCCGACCAGGCCCGGCGTGCCGGCAAGCCGTTCGAGGTGATCTACCGCATCCCCCGCGAAGGCACGCTgg > 4:93948/1‑148 (MQ=255) cggccggcAGATCAACGACCTGGCCAATGGCAGCGTGTGCCTGGCATTGACCTACAACGGTGATGCCGCGATGGCCGCCGACCAGGCCCGGCGTGCCGGCAAGCCGTTCGAGGTGATCTACCGCATCCCCCGCGAAGGCACGCTGGTAt < 1:154702/149‑1 (MQ=255) ggccggcAGATAAACGACCTGGCCAATGGCAGCGTGTGCCTGGCATTGACCTACAACGGTGATGCCGCGATGGCCGCCGACCAGGCCCGGCGTGCCGGCAAGCCGTTCGAGGTGATCTACCGCATCCCCCGCGAAGGCACGCTGGAATg > 6:227853/1‑149 (MQ=255) ggcAGATCAACGACCTGGCCAATGGCAGCGTGTGCCTGGCATTGACCTACAACGGTGATGCCGCGATGGCCGCCGACCAGGCCCGGCGTGCCGGCAAGCCGTTCGAGGTGATGTACCGCATCCCCCGCGAAGCCACGCTGGTATGGCAg > 7:71942/1‑149 (MQ=255) ggcAGATCAACGACCTGGCCAATGGCAGCGTGTGCCTGGCATTGACCTACAACGGTGATGCCGCGATGGCCGCCGACCAGGCCCGGCGTGCCGGCAAGCCGTTCGAGGTGATCTACCGCATCCCCCGCGAAGGCACGCTGGTATGGCAg < 6:147256/149‑1 (MQ=255) gATCAACGACCTGGCCAATGGCAGCGTGTGCCTGGCATTGACCTACAACGGTGATGCCGCGATGGCCGCCGACCAGGCCCGGCGTGCCGGCAAGCCGTTCGAGGTGATCTACCGCATCCCCCGCGAAGGCAc < 8:28505/132‑1 (MQ=255) gATCAACGACCTGGCCAATGGCAGCGTGTGCCTGGCATTGACCTACAACGGTGATGCCGCGATGGCCGCCGACCAGGCCCGGCGTGCCGGCAAGCCGTTCGAGGTGATCTACCGCATCCCCCGCGAAGGCAc > 7:28505/1‑132 (MQ=255) aTCAACGACCTGGCCAATGGCAGCGTGTGCCTGGCATTGACCTACAACGGTGATGCCGCGATGGCCGCCGACCAGGCCCGGCGTGCCGGCAAGCCGTTCGAGGTGATCTACCGCATCCCCCGCGAAGGCACGCTGGTATGGCAGGACaa > 4:130068/1‑149 (MQ=255) gACCTGGCCAATGGCAGCGTGTGCCTGGCATTGACCTACAACGGTGATGCCGCGATGGCCGCCGACCAGGCCCGGCGTGCCGGCAAGCCGTTCGAGGTGATCTACCGCATCCCCCGCGAAGGCACGCTGGTATGGCAGGACAACCTGGt > 2:16099/1‑149 (MQ=255) cAATGGCAGCGTGTGCCTGGCATTGACCTACAACGGTGATGCCGCGATGGCCGCCGACCAGGCCCGGCGTGCCGGCAAGCCGTTCGAGGTGATCTAcc > 7:233061/1‑98 (MQ=255) cAATGGCAGCGTGTGCCTGGCATTGACCTACAACGGTGATGCCGCGATGGCCGCCGACCAGGCCCGGCGTGCCGGCAAGCCGTTCGAGGTGATCTAcc < 8:233061/98‑1 (MQ=255) cAATGGCAGCGTGTGCCTGGCATTGACCTACAACGGTGATGCCGCGATGGCCGCCGACCAGGCCCGGCGTGCCGGCAAGCCGTTCGAGGTGATCTACCGCATCCCCCGCGAAGGCACGCTGGTATGGCAGGACAACCTGGTCATcccc > 5:124248/1‑148 (MQ=255) cAATGGCAGCGTGTGCCTGGCATTGACCTACAACGGTGATGCCGCGATGGCCGCCGACCAGGCCCGGCGTGCCGGCAAGCCGTTCGAGGTGATCTACCGCATCCCCCGCGAAGCCACGCTGGTATGGCAGGACAACATGGACATcccc > 8:84294/1‑148 (MQ=255) aaTGGCAGCGTGTGCCTGGCATTGACCTACAACGGTGATGCCGCGATGGCCGCCGACCAGGCCCGGCGTGCCGGCAAGCCGTTCGAGGTGATCTACCGCATCCCCCGCGAAGGCACGCTGGTATGGCAGGACAACCTGGTCATCCCCaa < 2:277659/149‑1 (MQ=255) cGTGTGCCTGGCATTGACCTACAACGGTGATGCCGCGATGGCCGCCGACCAGGCCCGGCGTGCCGGCAAGCCGTTCGAGGTGATCTACCGCATCCCCCGCGAAGGCACGCTGGTATGGCAGGACAACCTGGTCATCCCCAAGGACGccc < 3:93948/149‑1 (MQ=255) cGTGTGCCTGGCATTGACCTACAACGGTGATGCCGCGATGGCCGCCGACCAGGCCCGGCGTGCCGGCAAGCCGTTCGAGGTGATCTACCGCATCCCCCGCGAAGGCACGCTGGTATGGCAGGACAACCTGGTCATCCCCAAGGACGccc < 1:171480/149‑1 (MQ=255) tGGCATTGACCTACAACGGTGATGCCGCGATGGCCGCCGACCAGGCCCGGCGTGCCGGCAAGCCGTTCGAGGTGATCTACCGCATCCCCCGCGAAGGCACGCTGGTATGGCAGGACAACCTGGTCATCCCCAAGGACGCCCCGCAcccc > 3:180196/1‑149 (MQ=255) gCATTGACCTACAACGGTGATGCCGCGATGGCCGCCGACCAGGCCCGGCGTGCCGGCAAGCCGTTCGAGGTGATCTACCGCATCCCCCGCGAAGGCACGCTGGTATGGCAGGACAACCTGGTCATCCCCAAGGACGCCCCGCACCCCGa < 3:326591/149‑1 (MQ=255) aCCTACAACGGTGATGCCGCGATGGCCGCCGACCAGGCCCGGCGTGCCGGCAAGCCGTTCGAGGTGATCTACCGCATCCCCCGCGAAGGCACGCTGGTATGGCAGGACAACCTGGTCATCCCCAAGGACGCCCCGCACCCCGAGGCCg > 1:16521/1‑148 (MQ=255) cTACAACGGTGATGCCGCGATGGCCGCCGACCAGGCCCGGCGTGCCGGCAAGCCGTTCGAGGTGATCTACCGCATCCCCCGCGAAGGCACGCTGGTATGGCAGGACAACCTGGTCATCCCCAAGGACGCCCCGCACCCCGAGGCCGCAc > 1:102270/1‑149 (MQ=255) cTACAACGGTGATGCCGCGATGGCCGCCGACCAGGCCCGGCGTGCCGGCAAGCCGTTCGAGGTGATCTACCGCATCCCCCGCGAAGGCACGCTGGTATGGCAGGACAACCT‑GTCATCCCCAAGGACGCCCCGCACCCCGAGGCCGCACg > 7:323161/1‑149 (MQ=255) tACAACGGTGATGCCGCGATGGCCGCCGACCAGGCCCGGCGTGCCGGCAAGccgttgtaggtcaatgccaggcacacgctgccattggccaggtcgttgatctgccggccgttggcaacgtagctgatcgacggctgcagctggctgag < 8:98455‑M2/149‑99 (MQ=255) tACAACGGTGATGCCGCGATGGCCGCCGACCAGGCCCGGCGTGCCGGCAAGCCGTTCGAGGTGATCTACCGCATCCCCCGCGAAGGCACGCTGGTATGGCAGGACAACCTgg > 1:34968/1‑112 (MQ=255) tACAACGGTGATGCCGCGATGGCCGCCGACCAGGCCCGGCGTGCCGGCAAGCCGTTCGAGGTGATCTACCGCATCCCCCGCGAAGGCACGCTGGTATGGCAGGACAACCTgg < 2:34968/112‑1 (MQ=255) aCAACGGTGATGCCGCGATGGCCGCCGACCAGGCCCGGCGTGCCGGCCAGccg > 7:311466‑M2/1‑50 (MQ=255) aCAACGGTGATGCCGCGATGGCCGCCGACCAGGCCCGGCGTGCCGGCAAGccg < 8:311466‑M2/53‑4 (MQ=255) cAACGGTGATGCCGCGATGGCCGCCGACCAGGCCCGGCGTGCCGGCAAGCCGTTCGAGGTGATCTACCGCATCCCCCGCGAAGGCACGCTGGTATGGCAGGACAACCTGGTCATCCCCAAGGACGCCCCGCACCCCGAGGCCGCACgg < 3:130068/148‑1 (MQ=255) cGGTGATGCCGCGATGGCCGCCGACCAGGCCCGGCGTGCCGGCAAGccgttgtaggtcaatgccaggcacacgctgccattggccaggtcgttgatctgccggccgttggcaacgtagctgatcgacggctgcagctggctgagcaggt < 5:207136‑M2/149‑104 (MQ=255) ggTGATGCCGCGATGGCCGCCGACCAGGCCCGGCGTGCCGGCAAGccgttgtaggtcaatgccaggcacacgctgccattggccaggtcgttgatctgccggccgttggcaacgtagctgatcgacggctgcagctggctgagcaggtt > 6:207136‑M2/1‑45 (MQ=255) aTGCCGCGATGGCCGCCGACCAGGCCCGGCGTGCCGGCAAGCCGTTCGAGGTGATCTACCGCATCCCCCGCGAAGGCACGCTGGTATGGCAGGACAACCTGGTCATCCCCAAGGACGCCCCGCACCCCGAGGCCGCACGGGCGTTCATc > 1:208629/1‑149 (MQ=255) ccGCGATGGCCGCCGACCAGGCCCGGCGTGCCGGCAAGCCGTTCGAGGTGATCTACCGCATCCCCCGCGAAGGCACGCTGGTATGGCAGGACAACCTgg < 4:258408/99‑1 (MQ=255) cgcgATGGCCGCCGACCAGGCCCGGCGTGCCGGCAAGCCGTTCGAGGTGATCTACCGCATCCCCCGCGAAGGCACGCTGGTATGGCAGGACAACCTGGTCATCCCCAAGGACGCCCCGCACCCCGAGGCCGCACGGGCGTTCATCGCCt > 2:51250/1‑149 (MQ=255) cgATGGCCGCCGACCAGGCCCGGCGTGCCGGCAAGCCGTTCGAGGTGATCTACCGCATCCCCCGCGAAGGCACGCTGGTATGGCAGGACAACCTGGTCATCCCCAAGGACGCCCCGCACCCCGAGGCCGCACGGGCGTTCATCGCCTTc < 4:180196/149‑1 (MQ=255) aTGGCCGCCGACCAGGCCCGGCGTGCCGGCAAGCCGTTCGAGGTGATCTACCGCATCCCCCGCGAAGGCACGCTGGTATGGCAGGACAACCTGGTCATCCCCAAGGACGCCCCGCACCCCGAGGCCGCACGGGCGTTCATCGCCTTCAt < 1:51250/149‑1 (MQ=255) cgccgACCAGGCCCGGCGTGCCGGCAAGCCGTTCGAGGTGATCTACCGCATCCCCCGCGAAGGCACGCTGGTATGGCAGGACAACCTGCTCATCCCCAAGGACGCCCCGCACCCCGAGGCCGCACGGGCGTTCATCGCCTTCATGCTc > 4:63362/1‑148 (MQ=255) aCCAGGCCCGGCGTGCCGGCAAGCCGTTCGAGGTGATCTACCGCATCCCCCGCGAAGGCACGCTGGTATGGCAGGACAACCTGGTCATCCCCAAGGACGCCCCGCACCCCGAGGCCGCACGGGCGTTCATCGCCTTCATGCTCAAGCCa < 6:124248/149‑1 (MQ=255) cacggccGGCGTGCCGGCAAGGCGTTCGCTGTGATCTACCGCATCCCCCGCGAAGGCACGCTGGTATGGCAGGACAACCTGGTCATCCCCAAGGACGCCCCGCACCCCGAGGCCGCACGGGCGTTCATCGCCTTCATGCTCAAGCCaga < 7:84294/144‑1 (MQ=255) aGGCCCGGCGTGCCGGCAAGCCGTTCGAGGTGATCTACCGCATCCCCCGCGAAGGCACGCTGGTATGGCAGGACAACCTGGTCATCCCCAAGGACGCCCCGCACCCCGAGGCCGCACGGGCGTTCATCGCCTTCATGCTCAAGCCagag > 1:304983/1‑149 (MQ=255) ccGGCGTGCCGGCAAGCCGTTCGAGGTGATCTACCGCATCCCCCGCGAAGGCACGCTGGTATGGCAGGACAACCTGGTCATCCCCAAGGACGCCCCGCACCCCGAGGCCGCACGGGCGTTCATCGCCTTCATGCTCAAGCCAGAGTCgg < 2:16521/149‑1 (MQ=255) ggCGTGCCGGCAAGCCGTTCGAGGTGATCTACCGCATCCCCCGCGAAGGTACGCTGGTATGGCAGGACAACCTGGTCATCCCCAAGGACGCCCCGCACCCCGAGGCCGCACGGGCGTTCATCGCCTTCATGCTCAAGCCAGAGTCGGTg < 2:308060/149‑1 (MQ=255) tGCCGGCAAGCCGTTCGAGGTGATCTACCGCATCCCCCGCGAAGGCACGCTGGTATGGCAGGACAACCTGGTCATCCCCAAGGACGCCCCGCACCCCGAGGCCGCACGGGCGTTCATCGCCTTCATGCTCAAGCCAGAGTCGGTGGCAg < 5:227853/149‑1 (MQ=255) cAAGCCGTTCGAGGTGATCTACCGCATCCCCCGCGAAGGCACGCTGGTATGGCAGGACAACCTGGTCATCCCCAAGGACGCCCCGCACCCCGAGGCCGCACGGGCGTTCATCGCCTTCATGCTCAAGCCAGAGTCGGTGGCAGCGCTGa < 1:16099/149‑1 (MQ=255) | ACCTGCTCAGCCAGCTGCAGCCGTCGATCAGCTACGTTGCCAACGGCCGGCAGATCAACGACCTGGCCAATGGCAGCGTGTGCCTGGCATTGACCTACAACGGTGATGCCGCGATGGCCGCCGACCAGGCCCGGCGTGCCGGCAAGCCGTTCGAGGTGATCTACCGCATCCCCCGCGAAGGCACGCTGGTATGGCAGGACAACCTGGTCATCCCCAAGGACGCCCCGCACCCCGAGGCCGCACGGGCGTTCATCGCCTTCATGCTCAAGCCAGAGTCGGTGGCAGCGCTGA > NC_002947/2502172‑2502462 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |