New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2711295 = | 48 (0.890) | 3 (0.060) | 3/254 | NT | 6.1% | intergenic (‑42/+101) | PP_2374/metH | hypothetical protein/cobalamin‑dependent methionine synthase |
? | NC_002947 | 2711385 = | 46 (0.870) | intergenic (‑132/+11) | PP_2374/metH | hypothetical protein/cobalamin‑dependent methionine synthase |
GGGAAATCAGAGGCAATCAGGGACAGTGTAGGCAATGGTTGTGAGGTTGCCCGTACCGGCCTCTTCGCGGGGAAACCCGTTCCAACAGGTAAATGACTGCCCTTGAGGGCTGTGTCATACCTGTGTGGGCAAGCCCGCGAAGAAGCCAGCGCAGTCGTTTAGCTGTCATACCCCAGGTTAGGCGCCAGCCAGCGCTCGCTCACGCTGATATCCTGGCCTTTGCGTGCGCTGTAACGCTCGATCTGGTCCTTGTCGACCTTGCCTACGGCAAAATACTTCGCCTGCGGGTGGGCGAA > NC_002947/2711238‑2711533 | gggAAATCAGAGGCAATCAGGGACAGTGTAGGCAATGGTTGTGAGGTTGCCCGTACCGGCCTCTTCGCGGGGAAACCCGTTCCAACAGGTAAATGACTGCCCTTGAGGGCTGTGTCATACCTGTGTGGGCAAGCCCGCGAAGAAGCCAg > 2:165933/1‑149 (MQ=255) agagGCAATCAGGGACAGTGTAGGCAATGGTTGTGAGGTTGCCCGTACCGGCCTCTTCGCGGGGAAACCCGTTCCAACAGGTAAATGACTGCCCTTGAGGGCTGTGTCATACCTGTGTGGGCAAGCCCGCGAAGAAGCCAGCGCAGTc < 1:165933/148‑1 (MQ=255) ggCAATCAGGGACAGTGTAGGCAATGGTTGTGAGGTTGCCCGTACCGGCCTCTTCGCGGGGAAACCCGTTCCAACAGGTAAATGACTGCCCTTGAGGGCTGTGTCATACCTGTGTGGGCAAGCCCGCGAAGAAGCCAGCGCAGTCGttt < 8:44136/149‑1 (MQ=255) aGGGACAGTGTAGGCAATGGTTGTGAGGTTGCCCGTACCGGCCTCTTCGCGGGGAAACCCGTTCCAACAGGTAAATGACTGCCCTTGAGGGCTGTGTCATACCTGTGTGGGCAAGCCCGCGAAGAAGCCAGCGCAGTCGTTTAGCTGt < 4:248341/148‑1 (MQ=255) aGGGACAGTGTAGGCAATGGTTGTGAGGTTGCCCGTACCGGCCTCTTCGCGGGGAAACCCGTTCCAACAGGTAAATGACTGCCCTTGAGGGCTGTGTCATACCTGTGTGGGCAAGCCCGCGAAGAAGCCAGCGCAGTCGTTTAGCTGTc < 6:220119/149‑1 (MQ=255) cAGTGTAGGCAATGGTTGTGAGGTTCCCCGTACCGGCCTCTTCGCGGGGAACCCCGTTCCAACAGGTAAATGACTGCCCTTGAGGGCTGTGTCATATCTGTGTGGGCAAGCCCGCGAAGAAGCCAGCGCAGTCGTTTAGCTGTCATAcc < 1:258205/149‑1 (MQ=255) aGTGTAGGCAATGGTTGTGAGGTTGCCCGTACCGGCCTCTTCGCGGGGAAACCCGTTCCAACAGGTAAATGACTGCCCTTGAGGGCTGTGTCATACCTGTGTGGGCAAGCCCGCGAAGAAGCCAGCGCAGTCGTTTAGCTGTCATAccc > 3:23435/1‑149 (MQ=255) gCAATGGTTGTGAGGTTGCCCGTACCGGCCTCTTCGCGGGGAAACCCGTTCCAACAGGTAAATGACTGCCCTTGAGGGCTGTGTCATACCTGTGTGGGCAAGCCCGCGAAGAAGCCAGCGCAGTCGTTTa < 2:118506/130‑1 (MQ=255) gCAATGGTTGTGAGGTTGCCCGTACCGGCCTCTTCGCGGGGAAACCCGTTCCAACAGGTAAATGACTGCCCTTGAGGGCTGTGTCATACCTGTGTGGGCAAGCCCGCGAAGAAGCCAGCGCAGTCGTTTAGCTGTCATACCCCAGGt > 2:293404/1‑147 (MQ=255) ggTTGTGAGGTTGCCCGTACCGGCCTCTTCGCGGGGAAACCCGTTCCAACAGGTAAATGACTGCCCTTGAGGGCTGTGTCATACCTGTGTGGGCAAGCCCGCGAAGAAGCCAGCGCAGTCGTTTAGCTGTCATACCCCAGGTTAGgcgc > 6:167976/1‑149 (MQ=255) gTTGTGAGGTTGCCCGTACCGGCCTCTTCGCGGGGAAACCCGTTCCAACAGGTAAATGACTGCCCTTGAGGGCTGTGTCATACCTGTGTGGGCAAGCCCGCGAAGAAGCCAGCGCAGTCGTTTAGCTGTCATACCCCAGGTTAGgcgc < 3:110001/148‑1 (MQ=255) gtgtgAGGTGGCCCGTACCGGCCTCTTCGCGGGGAAACCCGTGCCAACAGGTAAATGACTGCCCTTGAGGGCGGTGTCATACCTGTGTGGGCAAGCCCGCGAAGAAGCCAGCGCAGTCGTTTAGCTGTCATACCCCAGGTTAGGCgcca < 8:299706/148‑1 (MQ=255) tgAGGTTGCCCGTACCGGCCTCTTCGCGGGGAAACCCGTTCCAACAGGTAAATGACTGCCCTTGAGGGCTGTGTCATACCTGTGTGGGCAAGCCCGCGAAGAAGCCAgc > 5:83298/1‑109 (MQ=255) tgAGGTTGCCCGTACCGGCCTCTTCGCGGGGAAACCCGTTCCAACAGGTAAATGACTGCCCTTGAGGGCTGTGTCATACCTGTGTGGGCAAGCCCGCGAAGAAGCCAgc < 6:83298/109‑1 (MQ=255) ccGTACCGGCCTCTTCGCGGGGAAACCCGTTCCAACAGGTAAATGACTGCCCTTGAGGGCTGTGTCATACCTGTGTGGGCAAGCCCGCGAAGAAGCCAGCGCAGTCGTTTAGCTGTCATACCCCAGGTTAGGCGccagccag < 2:182110/142‑1 (MQ=255) ccGTACCGGCCTCTTCGCGGGGAAACCCGTTCCAACAGGTAAATGACTGCCCTTGAGGGCTGTGTCATACCTGTGTGGGCAAGCCCGCGAAGAAGCCAGCGCAGTCGTTTAGCTGTCATACCCCAGGTTAGGCGccagccag > 1:182110/1‑142 (MQ=255) cGGCCTCTTCGCGGGGAAACCCGTTCCAACAGGTAAATGACTGCCCTTGAGGGCTGTGTCATACCTGTGTGGGCAAGCCCGCGAAGAAGCCAGCGCAGTCGTTTTGCTGTCATACCCCAGGTTAGgcgc > 5:226723/1‑129 (MQ=255) cGGCCTCTTCGCGGGGAAACCCGTTCCAACAGGTAAATGACTGCCCTTGAGGGCTGTGTCATACCTGTGTGGGCAAGCCCGCGAAGAAGCCAGCGCAGTCGTTTAGCTGTCATACCCCAGGTTAGgcgc < 6:226723/129‑1 (MQ=255) cGGCCTCTTCGCGGGGAAACCCGTTCCAACAGGTAAATGACTGCCCTTGAGGGCTGTGTCATACCTGTGTGGGCAAGCCCGCGAAGAAGCCAGCGCAGTCGTTTAGCTGTCATACCCCAGGTTAGGCGCCAGCCAGCGCTCGCTCACGc > 8:124282/1‑149 (MQ=255) cGGCCTCTTCGCGGGGAAACCCGTTCCAACAGGTAAATGACTGCCCTTGAGGGCTGTGTCATACCTGTGTGGGCAAGCCCGCGAAGAAGCCAGCGCAGTCGTTTAGCTGTCATACCCCAGGTTAGGCGCCAGCCAGCGCTCGCTCACGc > 4:242047/1‑149 (MQ=255) gcttcttcgcgggcttgcccacacaggtatgacacagccctcaagggcagtcatttacctgttggaacgggtttccccgcgaagaggccCGCGCAGTCGGTTAGCTGTCATACCCCAGGTTAGGCGCCCGCCAGCGCTCGCTCCCGCt > 7:271036‑M2/90‑148 (MQ=255) GCCTCTTCGCGGGGAAACCCGTTCCAACAGGTAAATGACTGCCCTTGAGGGCTGTGTCATACCTGTGTGGGCAAGCCCGCGAAGAAGCCAGCGCAGTCGTTTAGCTGTCATACCCCAGGTTAGGCGCCAGCCAGCGCTCGCTCACGCt < 5:338565‑M1/148‑1 (MQ=255) cttcgcgggcttgcccacacaggtatgacacagccctcaagggcagtcatttacctgttggaacgggtttccccgcgaagaggccAGCGCAGTCGTTTAGCTGTCATACCCCAGGTTAGGCGCCAGCCAGCGCTCGCTCACGCTGatat > 2:27384‑M2/86‑149 (MQ=255) ttCGCGGGGAAACCCGTTCCAACAGGTAAATGACTGCCCTTGAGGGCTGTGTCATACCTGTGTGGGCAAGCCCGCGAAGAAGCCAGCGCAGTCGTTTAGCTGTCATACCCCAGGTTAGgc < 7:247787/120‑1 (MQ=255) ttCGCGGGGAAACCCGTTCCAACAGGTAAATGACTGCCCTTGAGGGCTGTGTCATACCTGTGTGGGCAAGCCCGCGAAGAAGCCAGCGCAGTCGTTTAGCTGTCATACCCCAGGTTAGgc > 8:247787/1‑120 (MQ=255) ttCGCGGGGAAACCCGTTCCAACAGGTAAATGACTGCCCTTGAGGGCTGTGTCATACCTGTGTGGGCAAGCCCGCGAAGAAGCCAGCGCAGTCGTTTAGCTGTCATACCCCAGGTTAGGCGCCAGCCAGCGCTCGCTCACGCTGata < 5:62035/147‑1 (MQ=255) cgcgggcttgcccacacaggtatgacacagccctcaagggcagtcatttacctgttggaacgggtttccccgcgaagaggccAGCGCAGTCGTTTAGCTGTCATACCCCAGGTTAGCCGCCAGCCAGCGCTCGCTCACGCTGATATc < 1:27384‑M2/65‑1 (MQ=255) cgGGGAAACCCGTTCCAACAGGTAAATGACTGCCCTTGAGGGCTGTGTCATACCTGTGTGGGCAAGCCCGCGAAGAAGCCAGCGCAGTCGTTTAGCTGTCATACCCCAGGTTAGGCGCCAGCCAGCGCTCGCTCACGCTGATATCCTgg < 4:23435/149‑1 (MQ=255) aCCCGTTCCAACAGGTAAATGACTGCCCTTGAGGGCTGTGTCATACCTGTGTGGGCAAGCCCGCGAAGAAGCCAGCGCAGTCGTTTAGCTGTCATACCCCAGGTTAGGCGCCAGCCAGCGCTCGCTCACGCTGATATCCTGGCCTTtgc < 3:242047/149‑1 (MQ=255) aCCCGTTCCAACAGGTAAATGACTGCCCTTGAGGGCTGTGTCATACCTGTGTGGGCAAGCCCGCGAAGAAGCCAGCGCAGTCGTTTAGCTGTCATACCCCAGGTTAGGCGCCAGCCAGCGCTCGCTCACGCTGATATCCTGGCCTTtgc < 1:186770/149‑1 (MQ=255) cccGTTCCAACAGGTAAATGACTGCCCTTGAGGGCTGTGTCATACCTGTGTGGGCAAGCCCGCGAAGAAGCCAGCGCAGTCGTTTAGCTGTCATACCCCAGGTTAGGCGCCAGCCAGCGCTCGCTCACGCTGATATCCTGGCCTTtgcg > 5:56913/1‑149 (MQ=255) ccGTTCCAACAGGTAAATGACTGCCCTTGAGGGCTGTGTCATACCTGTGTGGGCAAGCCCGCGAAGAAGCCAGCGCAGTCGTTTAGCTGTCATACCCCAGGTTAGGCGCCAGCCAGCGCTCGCTCACGCTGATATCCTGGCCTTtgcgt > 3:298929/1‑149 (MQ=255) ccGTTCCAACAGGTAAATGACTGCCCTTGAGGGCTGTGTCATACCTGTGTGGGCAAGCCCGCGAAGAAGCCAGCGCAGTCGTTTAGCTGTCATACCCCAGGTTAGGCGCCAGCCAGCGCTCGCTCACGCTGATATCCTGGCCTTtgcgt < 6:56913/149‑1 (MQ=255) cAACAGGTAAATGACTGCCCTTGAGGGCTGTGTCATACCTGTGTGGGCAAGCCCGCGAAGAAGCCAGCGCAGTCGTTTAGCTGTCATACCCCAGATTAGGCGCCAGCCAGCGCTCGCTCACGCTGATATCCTGGCCTTTGCGTGCGCTg > 8:37323/1‑149 (MQ=255) cTGCCCTTGAGGGCTGTGTCATACCTGTGTGGGCAAGCCCGCGAAGAAGCCAGCGCAGTCGTTTAGCTGTCATACCCCAGGTTAGGCGCCAGCCAGCGCTCGCTCACGCTGATATCCTGGCCTTTGCGTGCGCTGTAACGCTCGATCTg > 8:99299/1‑149 (MQ=255) cccTTGAGGGCTGTGTCATACCTGTGTGGGCAAGCCCGCGAAGAAGCCAGCGCAGTCGTTTAGCTGTCATACCCCAGGTTAGGCGCCAGCCAGCGCTCGCTCACGCTGATATCCTGGCCTTTGCGTGCGCTGTAACGCTCGAt < 1:164619/143‑1 (MQ=255) cccTTGAGGGCTGTGTCATACCTGTGTGGGCAAGCCCGCGAAGAAGCCAGCGCAGTCGTTTAGCTGTCATACCCCAGGTTAGGCGCCAGCCAGCGCTCGCTCACGCTGATATCCTGGCCTTTGCGTGCGCTGTAACGCTCGAt > 2:164619/1‑143 (MQ=255) cTTGAGGGCTGTGTCATACCTGTGTGGGCAAGCCCGCGAAGAAGCCAGCGCAGTCGTTTAGCTGTCATACCCCAGGTTAGGCGCCAGCCAGCGCTCGCTCACGCTGATATCCTGGCCTTTGCGTGCGCTGTAACGCTCGATCTGGTCCt > 8:42517/1‑149 (MQ=255) gCTGTGTCATACCTGTGTGGGCAAGCCCGCGAAGAAGCCAGCGCAGTCGTTTAGCTGTCATACCCCAGGTTAGGCGCCAGCCAGCGCTCGCTCACGCTGATATCCTGGCCTTTGCGTGCGCTGTAACGCTCGATCTGGTCCTTGTCGAc > 6:190545/1‑149 (MQ=255) cTGTGTCATACCTGTGTGGGCAAGCCCGCGAAGAAGCCAGCGCAGTCGTTTAGCTGTCTTACCCCAGGTTAGGCGCCAGCCAGCGCTCGCTCACGCTGATATCCTGGCCTTTGCGTGCGCTGTAACGCTCGATCTGGTCCTTGTCGAcc > 5:266200/1‑149 (MQ=255) ccTGTGTGGGCAAGCCCGCGAAGAAGCCAGCGCAGTCGTTTAGCTGTCATACCCCAGGTTAGGCGCCAGCCAGCGCTCGCTCACGCTGATATCCTGGCCTTTGCGTGCGCTGTAACGCTCGATCTGGTCCTTGTCGACCTTGCCTACgg < 7:124282/149‑1 (MQ=255) ccTGTGTGGGCAAGCCCGCGAAGAAGCCAGCGCAGTCGTTTAGCTGTCATACCCCAGGTTAGGCGCCAGCCAGCGCTCGCTCACGCTGATATCCTGGCCTTTGCGTGCGCTGTAACGCTCGATCTGGTCCTTGTCGACCTTGCCTACg < 4:298929/148‑1 (MQ=255) ccTGTGTGGGCAAGCCCGCGAAGAAGCCAGCGCAGTCGTTTAGCTGTCATACCCCAGGTTAGGCGCCAGCCAGCGCTCGCTCACGCTGATATCCTGGCCTTTGCGTGCGCTGTAACGCTCGATCTGGTCCTTGTCGACCTTGCCTACg < 5:190545/148‑1 (MQ=255) cTGTGTGGGCAAGCCCGCGAAGAAGCCAGCGCAGTCGTTTAGCTGTCATACCCCAGGTTAGGCGCCAGCCAGCGCTCGCTCACGCTGATATCCTGGCCTTTGCGTGCGCTGTAACGCTCGATCTGGTCCTTGTCGACCTTGCCTACgg > 8:71482/1‑148 (MQ=255) tgGGCAAGCCCGCGAAGAAGCCAGCGCAGTCGTTTAGCTGTCATACCCCAGGTTAGGCGCCAGCCAGCGCTCGCTCACGCTGATATCCTGGCCTTTGCGTGCGCTGTAACGCTCGATCTGGTCCTTGTCGACCTTGCCTACGGCaaaa < 5:167976/148‑1 (MQ=255) tgGGCAAGCCCGCGAAGAAGCCAGCGCAGTCGTTTAGCTGTCATACCCCAGGTTAGGCGCCAGCCAGCGCTCGCTCACGCTGATATCCTGGCCTTTGCGTGCGCTGTAACGCTCGATCTGGTCCTTGTCGACCTTGCCTACGGCaaaa > 1:68069/1‑148 (MQ=255) ggCAAGCCCGCGAAGAAGCCAGCGCAGTCGTTTAGCTGTCATACCCCAGGTTAGGCGCCAGCCAGCGCTCGCTCACGCTGATATCCTGGCCTTTGCGTGCGCTGTAACGCTCGATCTGGTCCTTGTCGACCTTGCCTACGGCAAAATAc > 4:209417/1‑149 (MQ=255) ggCAAGCCCGCGAAGAAGCCAGCGCAGTCGTTTAGCTGTCATACCCCAGGTTAGGCGCCAGCCAGCGCTCGCTCACGCTGATATCCTGGCCTTTGCGTGCGCTGTAACGCTCGATCTGGTCCTTGTCGACCTTGCCTACGGCAAAATAc > 8:58648/1‑149 (MQ=255) gCAAGCCCGCGAAGAAGCCAGCGCAGTCGTTTAGCTGTCATACCCCAGGTTAGGCGCCAGCCAGCGCTCGCTCACGCTGATATCCTGGCCTTTGCGTGCGCTGTAACGCTCGATCTGGTCCTTGTCGACCTTGCCTACGGCAAAATACt > 7:160917/1‑149 (MQ=255) gCAAGCCCGCGAAGAAGCCAGCGCAGTCGTTTAGCTGTCATACCCCAGGTTAGGCGCCAGCCAGCGCTCGCTCACGCTGATATCCTGGCCTTTGCGTGCGCTGTAACGCTCGATCTGGTCCTTGTCGACCTTGCCTACGGCAAAATACt < 1:293404/149‑1 (MQ=255) aaGCCCGCGAAGAAGCCAGCGCAGTCGTTTAGCTGTCATACCCCAGGTTAGGCGCCAGCCAGCGCTCGCTCACGCTGATATCCTGGCCTTTGCGTGCGCTGTAACGCTCGATCT‑GTCCTTGTCGACCTTGCCTACGGCAAAATACTTCg > 2:103291/1‑149 (MQ=255) gcgAAGAAGCCAGCGCAGTCGTTTAGCTGTCATACCCCAGGTTAGGCGCCAGCCAGCGCTCGCTCACGCTGATATCCTGGCCTTTGCGTGCGCTGTAACGCTCGATCTGGTCCTTGTCGACCTTGCCTACGGCAAAATACTTCGCCTGc > 8:74348/1‑149 (MQ=255) gaagaaGCCAGCGCAGTCGTTTAGCTGTCATACCCCAGGTTAGGCGCCAGCCAGCGCTCGCTCACGCTGATATCCTGGCCTTTGCGTGCGCTGTAACGCTCGATCTGGTCCTTGTCGACCTTGCCTACGGCAAAATACTTCGCCTGCgg < 7:42517/149‑1 (MQ=255) agCCAGCGCAGTCGTTTAGCTGTCATACCCCAGGTTAGGCGCCAGCCAGCGCTCGCTCACGCTGATATCCTGGCCTTTGCGTGCGCTGTAACGCTCGATCTGGTCCTTGTCGACCTTGCCTACGGCAAAATACTTCGCCTGCGGGTgg < 6:338565/148‑1 (MQ=255) gccAGCGCAGTCGTTTAGCTGTCATACCCCAGGTTAGGCGCCAGCCAGCGCTCGCTCACGCTGATATCCTGGCCTTTGCGTGCGCTGTAACGCTCGATCTGGTCCTTGTCGACCTTGCCTACGGCAAAATACTTCGCCTGCGGGTGGGc > 6:215747‑M2/4‑149 (MQ=255) aGCGCAGTCGTTTAGCTGTCATACCCCAGGTTAGGCGCCAGCCAGCGCTCGCTCACGCTGATATCCTGGCCTTTGCGTGCGCTGTAACGCTCGATCTGGTCCTTGTCGACCTTGCCTACGGCAAAATACTTCGCCTGCGGGTGGGCGaa < 2:68069/149‑1 (MQ=255) | GGGAAATCAGAGGCAATCAGGGACAGTGTAGGCAATGGTTGTGAGGTTGCCCGTACCGGCCTCTTCGCGGGGAAACCCGTTCCAACAGGTAAATGACTGCCCTTGAGGGCTGTGTCATACCTGTGTGGGCAAGCCCGCGAAGAAGCCAGCGCAGTCGTTTAGCTGTCATACCCCAGGTTAGGCGCCAGCCAGCGCTCGCTCACGCTGATATCCTGGCCTTTGCGTGCGCTGTAACGCTCGATCTGGTCCTTGTCGACCTTGCCTACGGCAAAATACTTCGCCTGCGGGTGGGCGAA > NC_002947/2711238‑2711533 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |