New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3529386 = | 58 (1.070) | 3 (0.060) | 3/246 | NT | 5.3% | coding (1203/3102 nt) | dnaEB | error‑prone DNA polymerase |
? | NC_002947 | 3529437 = | 53 (1.040) | coding (1254/3102 nt) | dnaEB | error‑prone DNA polymerase |
TGTCGCGCGAGCGCAACGAGCCGCCGGACATCGACGTGGACTTCGAGCACGACCGGCGCGAGGAGGTGATCCAGTATGTGTTCCGTCGCTATGGCCGGCACCGGGCGGCGCTCACTGCGGTAGTCAACACCTACCATGCCGCCGGTGCGGTGCGGGATGTGGCGCGGGCGCTGGGGCTACCTGCCGATCAGGTGGATGCCCTGGCCAAATGTTGTGGTCGCTGGAGCGATCGCATACCCGATGACCAGCGCCTGGCCGAGGCCGGTTTCGAAGCGGGCAGCCCTTCGCTGCGGCGG > NC_002947/3529289‑3529584 | tGTCGCGCGAGCGCAACGAGCCGCCGGACATCGACGTGGACTTCGAGCACGACCGGCGCGAGGAGGTGATCCAGTATGTGTTCCGTCGCTATGGCCGGCACCGGGCGGCGCTCACTGCGGTAGTCAACACCTACCATGCCGCcggtgcg > 5:352002/1‑149 (MQ=255) tcctggggtatgcaatcgctccagcgaccacaacatttggccagggcatgcacgtgatcggcaggtagccccagcgcccgcgccacatcccgctccGCACCGGGCGGCGCTGACTGCGGTATTCAACACCTACCATGCCGCcgttgcgg > 4:92762‑M1/97‑149 (MQ=255) cgcgAGCGCAACGAGCCGCCGGACATCGACGTGGACTTCGAGCACGACCGGCGCGAGGAGGTGATCCAGTATGTGTTCCGTCGCTATGGCCGGCACCGGGCGGCGCTCACTGCGGTAGTCAACACCTACCATGCCGCCGgtgcggtgcg > 6:344637/1‑149 (MQ=255) gcgAGCGCAACGAGCCGCCGGACATCGACGTGGACTTCGAGCACGACCGGCGCGAGGAGGTGATCCAGTATGTGTTCCGTCGCTATGGCCGGCACCGGGCGGCGCTCACTGCGGTAGTCAACACCTACCATGCCGCCGGtgcggtgcgg > 7:88170/1‑149 (MQ=255) cgAGCGCAACGAGCCGCCGGACATCGACGTGGACTTCGAGCACGACCGGCGCGAGGAGGTGATCCAGTATGTGTTCCGTCGCTATGGCCGGCACCGGGCGGCGCTCACTGCGGTAGTCAACACCTACCATGCCGCCGGTGCGGTGCggg < 7:7155/149‑1 (MQ=255) gAGCGCAACGAGCCGCCGGACATCGACGTGGACTTCGAGCACGACCGGCGCGAGGAGGTGATCCAGTATGTGTTCCGTCGCTATGGCCGGCACCGGGCGGCGCTCACTGCGGTAGTCAACACCTACCATGCCGCCGGTGCGGTGCGGGa < 6:352002/149‑1 (MQ=255) cAACGAGCCGCCGGACATCGACGTGGACTTCGAGCACGACCGGCGCGAGGAGGTGATCCAGTATGTGTTCCGTCGCTATGGCCGGCACCGGGCGGCGCGCACTGCGGTAGTCAACACCTACCATGCCGCCGGTGCGGTGCGGGATGTgg < 6:106351/149‑1 (MQ=255) aGCCGCCGGACATCGACGTGGACTTCGAGCACGACCGGCGCGAGGAGGTGATCCAGTATGTGTTCCGTCGCTATGGCCGGCACCGGGCGGCGCTCACTGCGGTAGTCAACACCTACCATGCCGCCGGTGCGGTGCGGGATGTGGCGCgg < 8:88170/149‑1 (MQ=255) gacgGACATCGACGTGTAATTCGAGCACGACCGGCGAGAGGAGGTGATCCATTATTTGTTCCGTCGATATCGCCGGCACCGGGCGGCGCTCACTGCGGTAGTCAACACCTACCATGACGCCGGTGCGGTGCGGGATGTTGAGAGGgcgc > 8:72362/3‑149 (MQ=255) ggACATCGACGTGGACTTCGAGCACGACCGGCGCGAGGAGGTGATCCAGTATGTGTTCCGTCGCTATGGCCGGCACCGGGCGGCGCTCACTGCGGTAGTCAACACCTACCATGCCGCCGGTGCGGTGCGGGATGTGGCGCGGGCGCTgg > 4:289600/1‑149 (MQ=255) gACGTGGACTTCGAGCACGACCGGCGCGAGGAGGTGATCCAGTATGTGTTCCGTCGCTATGGCCGGCACCGGGCGGCGCTCACTGCGGTAGTCAACACCTACCATGCCGCCGGTGCGGTGCGGGATGTGGCGCGGGCGCTg < 5:82677/141‑1 (MQ=255) gACGTGGACTTCGAGCACGACCGGCGCGAGGAGGTGATCCAGTATGTGTTCCGTCGCTATGGCCGGCACCGGGCGGCGCTCACTGCGGTAGTCAACACCTACCATGCCGCCGGTGCGGTGCGGGATGTGGCGCGGGCGCTg > 6:82677/1‑141 (MQ=255) gACGTGGACTTCGAGCACGACCGGCGCGAGGAGGTGATCCAGTATGTGTTCCGTCGCTATGGCCGGCACCGGGCGGCGCTCACTGCGGTAGTCAACACCTACCATGCCGCCGGTGCGGTGCGGGATGTGGCGCGGGCGCTGGGGCTAcc > 5:248662/1‑149 (MQ=255) gACGTGGACTTCGAGCACGACCGGCGCGAGGAGGTGATCCAGTATGTGTTCCGTCGCTATGGCCGGCACCGGGCGGCGCTCACTGCGGTAGTCAACACCTACCATGCCGCCGGTGCGGTGCGGGATGTGGCGCGGGCGCTGGGGCTAc < 6:340325/148‑1 (MQ=255) aCGTGGACTTCGAGCACGACCGGCGCGAGGAGGTGATCCAGTATGTGTTCCGTCGCTATGGCCGGCACCGGGCGGCGCTCACTGCGGTAGTCAACACCTACCATGCCGCCGGTGCGGTGCGGGATGTGGCGCGGGCGCTGGGGCTAcc < 3:60663/148‑1 (MQ=255) aCGTGGACTTCGAGCACGACCGGCGCGAGGAGGTGATCCAGTATGTGTTCCGTCGCTATGGCCGGCACCGGGCGGCGCTCACTGCGGTAGTCAACACCTACCATGCCGCCGGTGCGGTGCGGGATGTGGCGCGGGCGCTGGGGCTAcc > 4:60663/1‑148 (MQ=255) ggACTTCGAGCACGACCGGCGCGAGGAGGTGATCCAGTATGTGTTCCGTCGCTATGGCCGGCACCGGGCGGCGCTCACTGCGGTAGTCAACACCTACCATGCCGCCGGTGCGGTGCGGGATGTGGCGCGGGCGCTGGGGCTACCTGcc > 5:118405/1‑148 (MQ=255) ttCGAGCACGACCGGCGCGAGGAGGTGATCCAGTATGTGTTCCGTCGCTATGGCCGGCACCGGGCGGCGCTCACTGCGGTAGTCAACACCTACCATGCCGCCGGTGCGGTGCGGGATGTGGCGCGGGCGCTGGGGCTACCTGCCGAt > 5:92890/1‑147 (MQ=255) ttCGAGCACGACCGGCGCGAGGAGGTGATCCAGTATGTGTTCCGTCGCTATGGCCGGCACCGGGCGGCGCTCACTGCGGTAGTCAACACCTACCATGCCGCCGGTGCGGTGCGGGATGTGGCGCGGGCGCTGGGGCTACCTGCCGAt > 5:180903/1‑147 (MQ=255) cGAGCACGACCGGCGCGAGGAGGTGATCCAGTATGTGTTCCGTCGCTATGGCCGGCACCGGGCGGCGCTCACTGCGGTAGTCAACACCTACCATGCCGCCGGTGCGGTGCGGGATGTGGCGCGGGCGCTGGGGCTACCTGCCGATCAgg > 5:137702/1‑149 (MQ=255) gAGCACGACCGGCGCGAGGAGGTGATCCAGTATGTGTTCCGTCGCTATGGCCGGCACCGGGCGGCGCTCACTGCGGTAGTCAACACCTACCATGCCGCCGGTGCGGTGCGGGATGTGGCGCGGGCGCTGGGGCTACCTGCCGATCAGGt > 5:215759/1‑149 (MQ=255) gCACGACCGGCGCGAGGAGGTGATCCAGTATGTGTTCCGTCGCTATGGCCGGCACCGGGCGGCGCTCACTGCGGTAGTCAACACCTACCATGCCGCCGGTGCGGTGCGGGATGTGGCGCGGgcgc > 6:169758/1‑125 (MQ=255) gCACGACCGGCGCGAGGAGGTGATCCAGTATGTGTTCCGTCGCTATGGCCGGCACCGGGCGGCGCTCACTGCGGTAGTCAACACCTACCATGCCGCCGGTGCGGTGCGGGATGTGGCGCGGgcgc < 5:169758/125‑1 (MQ=255) gCACGACCGGCGCGAGGAGGTGATCCAGTATGTGTTCCGTCGCTATGGCCGGCACCGGGCGGCGCTCACTGCGGTAGTCAACACCTACCATGCCGCCGGTGCGGTGCGGGATGTGGCGCGGGCGCTGGGGCTACCTGCCGATCAGGTgg < 7:174452/149‑1 (MQ=255) gCACGACCGGCGCGAGGAGGTGATCCAGTATGTGTTCCGTCGCTATGGCCGGCACCGGGCGGCGCTCACTGCGGTAGTCAACACCTACCATGCCGCCGGTGCGGTGCGGGATGTGGCGCGGGCGCTGGGGCTACCTGCCGATCAGGTg > 8:174452/1‑148 (MQ=255) cGGCGCGAGGAGGTGATCCAGTATGTGTTCCGTCGCTATGGCCGGCACCGGGCGGCGCTCACTGCGGTAGTCAACACCTACCATGCCGCCGGTGCGGTGCGGGATGTGGCGCGGGCGCTGGGGCTACCTGCCGATCAGGTGGATGCCCt < 3:289600/149‑1 (MQ=255) gcgcGAGGAGGTGATCCAGTATGTGTTCCGTCGCTATGGCCGGCACCGGGCGGCGCTCACTGCGGTAGTCATCACCTACCATGCCGCCGGTGCGGTGCGGGATGTGGCGCGGGCGCTGGGGCTACCCGCCGATCAGGTGGATGCCCTgg < 7:50603/149‑1 (MQ=255) gcgcGAGGAGGTGATCCAGTATGTGTTCCGTCGCTATGGCCGGCACCGGGCGGCGCTCACTGCGGTAGTCAACACCTACCATGCCGCCGGTGCGGTGCGGGATGTGGCGCGGGCGCTGGGGCTACCTGCCGATCAGGTGGATGCCCTgg > 7:262224/1‑149 (MQ=255) ggTGATCCAGTATGTGTTCCGTCGCTATGGCCGGCACCGGGCGGCGCTCACTGCGGTAGTCAACACCTACCATGCCGCCGGTGCGGTGCGGGATGTGGCGCGGGCGCTGGGGCTACCTGCCGATCAGGTGGATGCCCTGGCCAAAtgtt > 3:150942/1‑149 (MQ=255) tGATCCAGTATGTGTTCCGTCGCTATGGCCGGCACCGGGCGGCGCTCACTGCGGTAGTCAACACCTACCATGCCGCCGGTGCGGTGCGGGATGTGGCGCGGGCGCTGGGGCTACCTGCCGATCAGGTGGATGCCCTGGCCAAAtgttgt < 6:165132/149‑1 (MQ=255) aTCCAGTATGTGTTCCGTCGCTATGGCCGGCACCGGGCGGCGCTCTCTGCGGTAGTCAACACCTACCATGCCGCCGGTGCGGTGCGGGATGTGGCGCGGGCGCTGGGGCTACCTGCCGATCAGGTGGATGCCCTgg < 2:82707/136‑1 (MQ=255) aTCCAGTATGTGTTCCGTCGCTATGGCCGGCACCGGGCGGCGCTCCCTGCGGTAGTCAACACCTACCATGCCGCCGGTGCGGTGCGGGATGTGGCGCGGGCGCTGGGGCTACCTGCCGATCAGGTGGATGCCCTgg > 1:82707/1‑136 (MQ=255) tCCAGTATGTGTTCCGTCGCTATGGCCGGCACCGGGCGGCGCTCACTGCGGTAGTCAACACCTACCATGCCGCCGGTGCGGTGCGGGATGTGGCGCGGGCGCTGGGGCTACCTGCCGATCAGGTGGATGCCCTGGCCAAATGTTGTGGt < 4:150942/149‑1 (MQ=255) tATGTGTTCCGTCGCTATGGCCGGCACCGGGCGGCGCTCACTGCGGTAGTCAACACCTACCATGCCGCCGGTGCGGTGCGGGATGTGGCGCGGGCGCTGGGGCTACCTGCCGATCAGGTGGATGCCCTGGCCAAATGTTGTGGTCGCTg < 6:180903/149‑1 (MQ=255) ttCCGTCGCTATGGCCGGCACCGGGCGGCGCTCACTGCGGTAGTCAACACCTACCATGCCGCCGGTGCGGTGCGGGATGTGGCGCGGGCGCTggg < 3:308296/95‑1 (MQ=255) ttCCGTCGCTATGGCCGGCACCGGGCGGCGCTCACTGCGGTAGTCAACACCTACCATGCCGCCGGTGCGGTGCGGGATGTGGCGCGGGCGCTggg > 4:308296/1‑95 (MQ=255) ccGTCGCTATGGCCGGCACCGGGCGGCGCTCACTGCGGTAGTCAACACCTACCATGCCGCCGGTGCGGTGCGGGATGTGGCGCGGGCGCTGGGGCTACCTGCCGATCAGGTGGATGCCCTGGCCAAATGTTGTGGTCGCTGGAGCGATc > 5:218309/1‑149 (MQ=255) gTCGCTATGGCCGGCACCGGGCGGCGCTCACTGCGGTAGTCAACACCTACCATGCCGCCGGTGCGGTGCGGGATGTGGCGCGGGCGCTGGGGCTACCTGCCGATCAGGTGGATGCCCTGGCCAAATGTTGTGGTCGCTGGAGCGATCGc < 6:137702/149‑1 (MQ=255) ggCCGGCACCGGGCGGCGCTCACTGCGGTAGTCAACACCTACCATGCCGCCGGTGCGGTGCGGGATGTGGCGCGGGCGCTGGGGCTACCTGCCGATCAGGTGGATGCCCTGGCCAAATGTTGTGGTCGCTGGAGCGATCGCATACCCGa > 8:35332/1‑149 (MQ=255) gCCGGCACCGGGCGGCGCTCACTGCGGTAGTCAACACCTACCATGCCGCCGGTGCGGTGCGGGATGTGGCGCGGGCGCTGGGGCTACCTGCCGATCAGGTGGATGCCCTGGCCAAATGTTGTGGTCGCTGGAGCGATCGCATACCCGa < 1:132206/148‑1 (MQ=255) gCCGGCACCGGGCGGCGCTCACTGCGGTAGTCAACACCTACCATGCCGCCGGTGCGGTGCGGGATGTGGCGCGGGCGCTGGGGCTACCTGCCGATCAGGTGGATGCCCTGGCCAAATGTTGTGGTCGCTGGAGCGATCGCATACCCGa < 2:188441/148‑1 (MQ=255) ccgcaacggcggcatggtaggtgttgaataccgcagtcagcgccgcccggtgcGGAGCGGGATGTGGCGCGGGCGCTGGGGCTACCTGCCGATCACGTGCATGCCCTGGCCAAATGTTGTGGTCGCTGGAGCGATTgcataccccagga > 4:92762‑M2/54‑144 (MQ=255) cGGCACCGGGCGGCGCTCACTGCGGTAGTCAACACCTACCATGCCGCCGGTGCGGTGCGGGATGTGGCGCGGGCGCTGGGGCTACCTGCCGATCAGGTGGATGCCCTGGCCAAATGTTGTGGTCGCTGGAGCGATCGCATACCCGATGa > 1:62199/1‑149 (MQ=255) ggCACCGGGCGGCGCTCACTGCGGTAGTCAACACCTACCATGCCGCCGGTGCGGTGCGGGATGTGGCGCGGGCGCTGGGGCTACCTGCCGATCAGGTGGATGCCCTGGCCAAATGTTGTGGTCGCTGGAGCGATCGCATACCCGATGAc < 6:92890/149‑1 (MQ=255) GCACCGGGCGGCGCTCACTGCGGTAGTCAACACCTACCATGCCGCCGGTGCGGTGCGGGATGTGGCGCGGGCGCTGGGGCTACCTGCCGATCAGGTGGATGCCCTGGCCAAATGTTGTGGTCGCTGGAGCGATCGCATACCCGATGAcc > 8:262224‑M1/1‑149 (MQ=255) CACCGGGCGGCGCTCACTGCGGTAGTCAACACCTACCATGCCGCCGGTGCGGTGCGGGATGTGGCTCGGGCGCTGGGGCTACCTGCCGATCAGGTGGATGCCCTGGCCAAATGTTGTGGTCGCTGGAGCGATCGCATACCCGATGACCa > 6:118405‑M1/1‑149 (MQ=255) cggcggcatggtaggtgttgactaccgcagtgagcgccgcccggtgcGGTGCGGGATGTGGCGCGGGCGCTGGGGCTACCTGCCGATCAGGTg > 2:54636‑M2/48‑93 (MQ=255) cggcggcatggtaggtgttgactaccgcagtgagcgccgcccggtgcGGTGCGGGATGTGGCGCGGGCGCTGGGGCTACCTGCCGATCAGGTg < 1:54636‑M2/46‑1 (MQ=255) GGGCGGCGCTCACTGCGGTAGTCAACACCTACCATGCCGCCGGTGCGGTGCGGGATGTGGCGCGGGCGCTGGGGCTACCTGCCGATCAGGTGGATGCCCTGGCCAAATGTTGTGGTCGCTGGAGCGATCGCATACCCGATGACCAgcgc < 6:57424‑M1/149‑1 (MQ=255) cggcgCTCACTGCGGTAGTCAACACCTACCATGCCGCCGGTGCGGTGCGGGATGTGGCGCGGGCGCTGGGGCTACCTGCCGATCAGGTGGATGCCCTGGCCAAATGTTGTGGTCGCTGGAGCGATCGCATACCCGATGACCAGCGCCTg > 6:299196/1‑149 (MQ=255) gcgcTCACTGCGGTAGTCAACACCTACCATGCCGCCGGTGCGGTGCGGGATGTGGCGCGGGCGCTGGGGCTACCTGCCGATCAGGTGGATGCCCTGGCCAAATGTTGTGGTCGCTGGAGCGATCGCATACCCGATGACCAGCGCCTGGc < 7:72362/149‑1 (MQ=255) cgcTCACTGCGGTAGTCAACACCTACCATGCCGCCGGTGCGGTGCGGGATGTGGCGCGGGCGCTGGGGCTACCTGCCGATCAGGTGGa < 8:207798/88‑1 (MQ=255) cgcTCACTGCGGTAGTCAACACCTACCATGCCGCCGGTGCGGTGCGGGATGTGGCGCGGGCGCTGGGGCTACCTGCCGATCAGGTGGa > 7:207798/1‑88 (MQ=255) tGCGGTAGTCAACACCTACCATGCCGCCGGTGCGGTGCGGGATGTGGCGCGGGCGCTGGGGCTACCTGCCGATCAGGTGGATGCCCTGGCCAAATGTTGTGGTCGCTGGAGCGATCGCATACCCGATGACCAGCGCCTGGCCGAGGCCg > 8:22843/1‑149 (MQ=255) tGCGGTAGTCAACACCTACCATGCCGCCGGTGCGGTGCGGGATGTGGCGAGGGCGCTGGGGCTACCTGCCGATCAGGTGGATGCCCTGGCCAAATGTTGTGGTCGCTGGAGCGATCGCATACCCGATGACCAGCGCCTGGCCGAGGcag > 1:298733/1‑147 (MQ=255) cacCTACCATGCCGCCGGTGCGGTGCGGGATGTGGCGCGGGCGCTGGGGCTACCTGCCGATCAGGTGGATGCCCTGGCCAAATGTTGTGGTCGCTGGAGCGATCGCATACCCGATGACCAGCGCCTGGCCGAGGCCGGTTTCGAAGCgg < 2:62199/149‑1 (MQ=255) acCTACCATGCCGCCGGTGCGGTGCGGGATGTGGCGCGGGCGCTGGGGCTACCTGCCGATCAGGTGGATGCCCTGGCCAAATGTTGTGGTCGCTGGAGCGATCGCATACCCGATGACCAGCGCCTGGCCGAGGCCGGTTTCGAAGCggg > 3:267706/1‑149 (MQ=255) cTACCATGCCGCCGGTGCGGTGCGGGATGTGGCGCGGGCGCTGGGGCTACCTGCCGATCAGGTGGATGCCCTGGCCAAATGTTGTGGTCGCTGGAGCGATCGCATACCCGATGACCAGCGCCTGGCCGAGGCCGGTTTCGAAGCggg > 4:208789/1‑147 (MQ=255) tACCATGCCGCCGGTGCGGTGCGGGATGTGGCGCGGGCGCTGGGGCTACCTGCCGATCAGGTGGATGCCCTGGCCAAATGTTGTGGTCGCTGGAGCGATCGCATACCCGATGACCa > 4:160910/1‑116 (MQ=255) tACCATGCCGCCGGTGCGGTGCGGGATGTGGCGCGGGCGCTGGGGCTACCTGCCGATCAGGTGGATGCCCTGGCCAAATGTTGTGGTCGCTGGAGCGATCGCATACCCGATGACCa < 3:160910/116‑1 (MQ=255) tACCATGCCGCCGGTGCGGTGCGGGATGTGGCGCGGGCGCTGGGGCTACCTGCCGATCAGGTGGATGCCCTGGCCAAATGTTGTGGTCGCTGGAGCGATCGCATACCCGATGACCAGCGCCTGGCCGAGGCCGGTTTCGAAGCGGGCAg > 8:158408/1‑149 (MQ=255) tgcGGTGCGGGATGTGGCGCGGGCGCTGGGGCTACCTGCCGATCAGGTGGATGCCCTGGCCAAATGTTGTGGTCGCTGGAGCGATCGCATACCCGATGACCAGCGCCTGGCCGAGGCCGGTTTCGAAGCGGGCAGCCCTTCGCTgcggc < 6:218309‑M2/146‑1 (MQ=255) cGGTGCGGGATGTGGCGCGGGCGCTGGGGCTACCTGCCGATCAGGTGGATGCCCTGGCCAAATGTTGTGGTCGCTGGAGCGATCGCATACCCGATGACCAGCGCCTGGCCGAGGCCGGTTTCGAAGCGGGCAGCCCTTCGCTGcggcgg < 6:215759‑M2/148‑1 (MQ=255) | TGTCGCGCGAGCGCAACGAGCCGCCGGACATCGACGTGGACTTCGAGCACGACCGGCGCGAGGAGGTGATCCAGTATGTGTTCCGTCGCTATGGCCGGCACCGGGCGGCGCTCACTGCGGTAGTCAACACCTACCATGCCGCCGGTGCGGTGCGGGATGTGGCGCGGGCGCTGGGGCTACCTGCCGATCAGGTGGATGCCCTGGCCAAATGTTGTGGTCGCTGGAGCGATCGCATACCCGATGACCAGCGCCTGGCCGAGGCCGGTTTCGAAGCGGGCAGCCCTTCGCTGCGGCGG > NC_002947/3529289‑3529584 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |