New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4316090 | 42 (0.780) | 3 (0.060) | 3/248 | NT | 6.3% | coding (173/1554 nt) | PP_3788 | non‑ribosomal peptide synthetase |
? | NC_002947 | = 4316107 | 49 (0.950) | coding (190/1554 nt) | PP_3788 | non‑ribosomal peptide synthetase |
ACTTCTCGCTGGTCGAATACATCGAGCGTATCATCCACCGCTACCCATCGAATGCAGCGGCATTCGACGAGGACCAGCGCTTGACCTACAGCGAACTAAGGATCGAACTGCTCACACTGCACGCTCGGCTGCATGAACTCGGCGTGCGCAGCGGGGATGTGGTTGCGGTGAATGCGACAGTGCAACTGCGCTATCCCGTCGTTGTCCTGGGGTTACTGCTCGCTGGCCTGGTCTACTTGCCAATCGCCGCAGCTCTGCCGCCTGAGCGCAAGCGGGCGATCTGC > NC_002947/4315967‑4316250 | aCTTCTCGCTGGTCGAATACATCGAGCGTATCATCCACCGCTACCCATCGAATGCAGCGGCATTCGACGAGGACCAGCGCTTGACCTACAGCGAACTAAGGATCGAACTGCTCACACTGCACGCTCGGCTGCATGAACTCGGCGTgcg > 4:63977/1‑148 (MQ=255) gAATACATCGAGCGTATCATCCACCGCTACCCATCGAATGCAGCGGCATTCGACGAGGACCAGCGCTTGACCTACAGCGAACTAAGGATCGAACTGCTCACACTGCACGCTCGGCTGCATGAACTCGGCGTGCGCAGCGGGGATGTGGt > 1:296864/1‑149 (MQ=255) aTCGAGCGTATCATCCACCGCTACCCATCGAATGCAGCGGCATTCGACGAGGACCAGCGCTTGACCTACAGCGAACTAAGGATCGAACTGCTCACACTGCACGCTCGGCTGCATGAACTCGGCGTGCGCAGCGGGGATGTGGTTGCGGt < 2:239828/149‑1 (MQ=255) gcGAGCGTATCATCCACCGCTACCCATCGAATGCAGCGGCATTCGACGAGGACCAGCGCTTGACCTACAGCGAACTAAGGATCGAACTGCTCACACTGCACGCTCGGCTGCATGAACTCGGCGTGCGCAGCGGGGATGTGGTTGCGGTg < 8:317679/148‑1 (MQ=255) gCGTATCATCCACCGCTACCCATCGAATGCAGCGGCATTCGACGAGGACCAGCGCTTGACCTACAGCGAACTAAGGATCGAACTGCTCACACTGCACGCTCGGCTGCATGAACTCGGCGTGCGCAGCGGGGATGTGGTTGCGGTGAATg > 3:129212/1‑149 (MQ=255) tATCATCCACCGCTACCCATCGAATGCAGCGGCATTCGACGAGGACCAGCGCTTGACCTACAGCGAACTAAGGATCGAACTGCTCACACTGCACGCTCGGCTGCATGAACTCGGCGTGCGCAGCGGGGATGTGGTTGCGGTGAATGCGa > 5:41300/1‑149 (MQ=255) atcCACCGCTACCCATCGAATGCAGCGGCATTCGACGAGGACCAGCGCTTGACCTACAGCGAACTAAGGATCGAACTGCTCACACTGCACGCTCGGCTGCATGAACTCGGCGTGCGCAGCGGGGATGTGGTTGCGGTGAATGCGACAGt > 2:185170/1‑149 (MQ=255) atcCACCGCTACCCATCGAATGCAGCGGCATTCGACGAGGACCAGCGCTTGACCTACAGCGAACTAAGGATCGAACTGCTCACACTGCACGCTCGGCTGCATGAACTCGGCGTGCGCAGCGGGGATGTGGTTGCGGTGAATGCGACAGt > 7:322526/1‑149 (MQ=255) tcCACCGCTACCCATCGAATGCAGCGGCATTCGACGAGGACCAGCGCTTGACCTACAGCAAACTAAGGATCGAACTGCTCACACTGCACGCTCGGCTGCATGAACTCGGCGTGCGCAGCGGGGAtgtg > 3:261715/1‑128 (MQ=255) tcCACCGCTACCCATCGAATGCAGCGGCATTCGACGAGGACCAGCGCTTGACCTACAGCAAACTAAGGATCGAACTGCTCACACTGCACGCTCGGCTGCATGAACTCGGCGTGCGCAGCGGGGAtgtg < 4:261715/128‑1 (MQ=255) aCCGCTACCCATCGAATGCAGCGGCATTCGACGAGGACCAGCGCTTGACCTACAGCGAACTAAGGATCGAACTGCTCACACTGCACGCTCGGCTGCATGAACTCGGCGTGCGCAGCGGGGATGTGGTTGCGGTGAATGCGACAGTGCaa < 6:41300/149‑1 (MQ=255) aaTGCAGCGGCATTCGACGAGGACCAGCGCTTGACCTACAGCGAACTAAGGATCGAACTGCTCACACTGCACGCTCGGCTGCATGAACTCGGCGTGCGCAGCGGGGATGTGGTTGCTGTGAATGCGACAGTGCAACTGCGCTATCCcgt > 8:27962/1‑149 (MQ=255) aTGCAGCGGCATTCGACGAGGACCAGCGCTTGACCTACAGCGAACTAAGGATCGAACTGCTCACACCGCACGCTCGGCTGCATGAACTCGGCGTGCGCAGCGGGGATGTGGTTGCGGTGAATGCGACAGTGCAACTGCGCTATCCcgtc < 3:165212/149‑1 (MQ=255) cAGCGGCATTCGACGAGGACCAGCGCTTGACCTACAGCGAACTAAGGATCGAACTGCTCACACTGCACGCTCGGCTGCATGAACTCGGCGTGCGCAGCGGGGATGTGGTTGCGGTGAATGCGACAGTGCAACTGCGCTATCCCGTCGtt < 4:129212/149‑1 (MQ=255) ggCATTCGACGAGGACCAGCGCTTGACCTACAGCGAACTAAGGATCGAACTGCTCACACTGCACGCTCGGCTGCATGAACTCGGCGTGCGCAGCGGGGATGTGGTTGCGGTGAATGCGACAGTGCAACTGCGCTATCCCGTCGTTGTcc < 7:27962/149‑1 (MQ=255) cATTCGACGAGGACCAGCGCTTGACCTACAGCGAACTAAGGATCGAACTGCTCACACTGCACGCTCGGCTGCATGAACTCGGCGTGCGCAGCGGGGATGTGGTTGCGGTGAATGCGACAGTGCAACTGCGCTATCCCGTCGTTGTCCTg > 7:58577/1‑149 (MQ=255) aTTCGACGAGGACCAGCGCTTGACCTACAGCGAACTAAGGATCGAACTGCTCACACTGCACGCTCGGCTGCATGAACTCGGCGTGCGCAGCGGGGATGTGGTTGCGGTGAATGCGACAGTGCAACTGCGCTATCCCGTCGTTGTCCTgg < 3:63977/149‑1 (MQ=255) ttCGACGAGGACCAGCGCTTGACCTACAGCGAACTAAGGATCGAACTGCTCACACTGCACGCTCGGCTGCATGAACTCGGCGTGCGCAGCGGGGATGTGGTTGCGGTGAATGCGACAGTGCAACTGCGCTATCCCGTCGTTGTCCTggg > 6:50218/1‑149 (MQ=255) gaGGACCAGCGCTTGACCTACAGCGAACTAAGGATCGAACTGCTCACACTGCACGCTCGGCTGCATGAACTCGGCGTGCGCAGCGGGGATGTGGTTGCGGTGAATGCGACAGTGCAACTgcgc > 8:286893/1‑123 (MQ=255) gaGGACCAGCGCTTGACCTACAGCGAACTAAGGATCGAACTGCTCACACTGCACGCTCGGCTGCATGAACTCGGCGTGCGCAGCGGGGATGTGGTTGCGGTGAATGCGACAGTGCAACTgcgc < 7:286893/123‑1 (MQ=255) gaGGACCAGCGCTTGACCTACAGCGAACTAAGGATCGAACTGCTCACACTGCACGCTCGGCTGCATGAACTCGGCGTGCGCAGCGGGGATGTGGTTGCGGTGAATGCGACAGTGCAACTGCGCTATCCCGTCGTTGTCCTGGGGTTACt > 5:159302/1‑149 (MQ=255) gaGGACCAGCGCTTGACCTACAGCGAACTAAGGATCGAACTGCTCACACTGCACGCTCGGCTGCATGAACTCGGCGTGCGCAGCGGGGATGTGGTTGCGGTGAATGCGACAGTGCAACTGCGCTATCCCGTCGTTGTCCTGGGGTTACt > 2:235021/1‑149 (MQ=255) gcTTGACCTACAGCGAACTAAGGATCGAACTGCTCACACTGCACGCTCGGCTGCATGAACTCGGCGTGCGCAGCGGGGATGTGGTTGCGGTGAATGCGACAGTGCAACTGCGCTATCCCGTCGTTGTCCTGGGGTTACTGCTCGCTGGc > 7:144610/1‑149 (MQ=255) gACCTACAGCGAACTAAGGATCGAACTGCTCACACTGCACGCTCGGCTGCATGAACTCGGCGTGCGCAGCGGGGATGTGGTTGCGGTGAATGCGACAGTGCAACTGCGCTATCCCGTCGTTGTCCTGGGGTTACTGCTCGCTGGCCTg < 8:322526/148‑1 (MQ=255) gACCTACAGCGAACTAAGGATCGAACTGCTCACACTGCACGCTCGGCTGCATGAACTCGGCGTGCGCAGCGGGGATGTGGTTGCGGTGAATGCGACAGTGCAACTGCGCTATCCCGTCGTTGTCCTGGGGTTACTGCTCGCTGGCCTg < 8:58577/148‑1 (MQ=255) aCCTACAGCGAACTAAGGATCGAACTGCTCACACTGCACGCTCGGCTGCATGAACTCGGCGTGCGCAGCGGGGATGTGGTTGCGGTGAATGCGACAGTGCAACTGCGCTATCCCGTCGTTGTCCTGGGGTTACTGCTCGCTGGCCTGGt < 2:296864/149‑1 (MQ=255) cTACAGCGAACTAAGGATCGAACTGCTCACACTGCACGCTCGGCTGCATGAACTCGGCGTGCGCAGCGGGGATGTGGTTGCGGTGAATGCGACAGTGCAACTGCGCTATCCCGTCGTTGTCCTGGGGTTACTGCTCGCTGGCCTGGTc > 6:177164/1‑148 (MQ=255) cTACAGCGAACTAAGGATCGAACTGCTCACACTGCACGCTCGGCTGCATGAACTCGGCGTGCGCAGCGGGGATGTGGTTGCGGTGAATGCGACAGTGCAACTGCGCTATCCCGTCGTTGTCCTGGGGTTACTGCTCGCTGGCCTGGTc > 7:49289/1‑148 (MQ=255) tACAGCGAACTAAGGATCGAACTGCTCACACTGCACGCTCGGCTGCATGAACTCGGCGTGCGCAGCGGGGATGTGGTTGCGGTGAATGCGACAGTGCAACTGCGCTATCCCGTCGTTGTCCTGGGGTTACTGCTCGCTGGCCTGGTCTa > 5:74718/1‑149 (MQ=255) aGCGAACTAAGGATCGAACTGCTCACACTGCACGCTCGGCTGCATGAACTCGGCGTGCGCAGCGGGGATGTGGTTGTGGTGAATGCGACAGTGCAACTGCGCTATCCCGTCGTTGTCCTGGGGTTACTGCTCGCTGGCCTGGTCTACtt < 8:50248/149‑1 (MQ=255) aGCGAACTAAGGATCGAACTGCTCACACTGCACGCTCGGCTGCATGAACTCGGCGTGCGCAGCGGGGATGTGGTTGCGGTGAATGCGACAGTGCAACTGCGCTATCCcgtc > 8:172066/1‑111 (MQ=255) aGCGAACTAAGGATCGAACTGCTCACACTGCACGCTCGGCTGCATGAACTCGGCGTGCGCAGCGGGGATGTGGTTGCGGTGAATGCGACAGTGCAACTGCGCTATCCCGTCGTTGTCCTGGGGTTACTGCTCGCTGGCCTGGTCTACtt > 6:231091/1‑149 (MQ=255) aaCTAAGGATCGAACTGCTCACACTGCACGCTCGGCTGCATGAACTCGGCGTGCGCAGCGGGGATGTGGTTGCGGTGAATGCGACAGTGCAACTGCGCTATCCCGTCGTTGTCCTGGGGTTACTGCTCGCTGGCCTGGTCTACTTGcc > 2:130499/1‑148 (MQ=255) ggATCGAACTGCTCACACTGCACGCTCGGCTGCATGAACTCGGCGTGCGCAGCGGGGATGTGGTTGCGGTGAATGCGACAGTGCAACTGCGCTATCCCGTCGTTGTCCTGGGGTTACTGCTCGCTGGCCTGGTCTACTTGCCAATcgcc < 5:50218/149‑1 (MQ=255) gATCGAACTGCTCACACTGCACGCTCGGCTGCATGAACTCGGCGTGCGCAGCGGGGATGTGGTTGCGGTGAATGCGACAGTGCAACTGCGCTATc < 4:283637/95‑1 (MQ=255) gAACTGCTCACACTGCACGCTCGGCTGCATGAACTCGGCGTGCGCAGCGGGGATGTGGTTGCGGTGAATGCGACAGTGCAACTGCGCTATCCCGTCGTTGTCCTGGGGTTACTGCTCGCTGGCCTGGTCTACTTGCCAATCGCCGCAg < 6:74718/148‑1 (MQ=255) aaCTGCTCACACTGCACGCTCGGCTGCATGAACTCGGCGTGCGCAGCGGGGATGTGGTTGCGGTGAATGCGACAGTGCAACTGCGCTATCCCGTCGTTGTCCTGGGGTTACTGCTCGCTGGCCTGGTCTACTTGCCAATCGCCGCAGct > 1:219406/1‑149 (MQ=255) aaCTGCTCACACTGCACGCTCGGCTGCATGAACTCGGCGTGCGCAGCGGGGATGTGGTTGCGGTGAATGCGACAGTGCAACTGCGCTATCCCGTCGTTGTCCTGGGGTTACTGCTCGCTGGCCTGGTCTACTTGCCAATCGCCGCAGct > 1:224183/1‑149 (MQ=255) aaCTGCTCACACTGCACGCTCGGCTGCATGAACTCGGCGTGCGCAGCGGGGATGTGGTTGCGGTGAATGCGACAGTGCAACTGCGCTATCCCGTCGTTGTCCTGGGGTTACTGCTCGCTGGCCTGGTCTACTTGCCAATCGCCGCAGct > 2:8358/1‑149 (MQ=255) aaCTGCTCACACTGCACGCTCGGCTGCATGAACTCGGCGTGCGCAGCGGGGATGTGGTTGCGGTGAATGCGACAGTGCAACTGCGCTATCCCGTCGTTGTCCTGGGGTTACTGCTCGCTGGCCTGGTCTACTTGCCAATCGCCGCAGc > 6:114683/1‑148 (MQ=255) acTGCACGCTCGGCTGCATGAACTCGgcgtgcagtgtgagcagttcgatccttagttcgctgtaggtcaagcgcgggtcctcgtcgaatgccgctgcattcgatgggt < 5:350132‑M2/108‑83 (MQ=255) cTGCACGCTCGGCTGCATGAACTCGgcgtgcagtgtgagcagttcgatccttagttcgctgtaggtcaagcgctggtcctcgtcgaatgccgctgcattcgatgggtagcggtggat > 2:201559‑M2/1‑25 (MQ=255) cTGCACGCTCGGCTGCATGAACTCGgcgtgcagtgtgagcagttcgatccttagttcgctgtaggtcaagcgctggtcctcgtcgaatgccgctgcattcgatgggtagcggtggat < 1:201559‑M2/117‑93 (MQ=255) cACGCTCGGCTGCATGAACTCGGCGTGCGCAGCGGGGATGTGGTTGCGGTGAATGCGACAGTGCAACTGCGCTATCCCGTCGTTGTCCTGGGGTTACTGCTCGCTGGCCTGGTCTACTTGCCAATCGCCGCAGCTCTGCCGCCTGAgcg > 3:202047/1‑149 (MQ=255) tCGGCTGCATGAACTCGGCGTGCGCAGCGGGGATGTGGTTGCGGTGAATGCGACAGTGCAACTGCGCTATCCCGTCGTTGTCCTGGGGTTACTGCTCGCTGGCCTGGTCTACTTGCCAATCGCCGCAGCTCTGCCGCCTGAGCGCAAGc > 7:209124/1‑149 (MQ=255) tCGGCTGCATGAACTCGGCGTGCGCAGCGGGGATGTGGTTGCGGTGAATGCGACAGTGCAACTGCGCTATCCCGTCGTTGTCCTGGGGTTACTGCTCGCTGGCCTGGTCTACTTGCCAATCGCCGCAGCTCTGCCGCCTGAGCGCAAGc > 3:252701/1‑149 (MQ=255) tCGGCTGCATGAACTCGGCGTGCGCAGCGGGGATGTGGTTGCGGTGAATGCGACAGTGCAACTGCGCTATCCCGTCGTTGTCCTGGGGTTACTGCTCGCTGGCCTGGTCTACTTGCCAATCGCCGCAGCTCTGCCGCCTGAGCGCAAGc > 8:37796/1‑149 (MQ=255) ggCTGCATGAACTCGGCGTGCGCAGCGGGGATGTGGTTGCGGTGAATGCGACAGTGCAACTGCGCTATCCCGTCGTTGTCCTGGGGTTACTGCTCGCTGGCCTGGTCTACTTGCCAATCGCCGCAGCTCTGCCGCCTGAGCGCAAGCgg > 6:134837/1‑149 (MQ=255) ggCTGCATGAACTCGGCGTGCGCAGCGGGGATGTGGTTGCGGTGAATGCGACAGTGCAACTGCGCTATCCCGTCGTTGTCCTGGGGTTACTGCTCGCTGGCCTGGTCTACTTGCCAATCGCCACAGCTCTGCCGCCTGAGCGCAAGCgg < 1:185170/149‑1 (MQ=255) gCTGCATGAACTCGGCGTGCGCAGCGGGGATGTGGTTGCGGTGAATGCGACAGTGCAACTGCGCTATCCCGTCGTTGTCCTGGGGTTACTGCTCGCTGGCCTGGTCTACTTGCCAATCGCCGCAGCTCTGCCGCCTGAGCGCAAGCggg < 8:209124/149‑1 (MQ=255) gCTGCATGAACTCGGCGTGCGCAGCGGGGATGTGGTTGCGGTGAATGCGACAGTGCAACTGCGCTATCCCGTCGTTGTCCTGGGGTTACTGCTCGCTGGCCTGGTCTACTTGCCAATCGCCGCAGCTCTGCCGCCTGAGCGCAAGCggg < 5:114683/149‑1 (MQ=255) tGCATGAACTCGGCGTGCGCAGCGGGGATGTGGTTGCGGTGAATGCGACAGTGCAACTGCGCTATCCCGTCGTTGTCCTGGGGTTACTGATCGCTGGACTGGTCTACTTGCCAATCGCCGCAGCTCTGCCGCCTGAGCGCAAGCGGGc > 7:215014/1‑148 (MQ=255) aaCTCGGCGTGCGCAGCGGGGATGTGGTTGCGGTGAATGCGACAGTGCAACTGCGCTATCCCGTCGTTGTCCTGGGGTTACTGCTCGCTGGCCTGGTCTACTTGCCAATCGCCGCAGCTCTGCCGCCTGAGCGCAAGCGGGCGATCTGc < 1:235021/149‑1 (MQ=255) | ACTTCTCGCTGGTCGAATACATCGAGCGTATCATCCACCGCTACCCATCGAATGCAGCGGCATTCGACGAGGACCAGCGCTTGACCTACAGCGAACTAAGGATCGAACTGCTCACACTGCACGCTCGGCTGCATGAACTCGGCGTGCGCAGCGGGGATGTGGTTGCGGTGAATGCGACAGTGCAACTGCGCTATCCCGTCGTTGTCCTGGGGTTACTGCTCGCTGGCCTGGTCTACTTGCCAATCGCCGCAGCTCTGCCGCCTGAGCGCAAGCGGGCGATCTGC > NC_002947/4315967‑4316250 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |