Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 4,082,777 | A→T | 5.4% | N241I (AAT→ATT) | PP_3592 → | RpiR family transcriptional regulator |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 4,082,777 | 0 | A | T | 5.4% | 230.6 / 2.2 | 74 | N241I (AAT→ATT) | PP_3592 | RpiR family transcriptional regulator |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (36/34); new base T (2/2); total (38/36) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.76e-01 |
CTGCTGGGCCGTGCCGAAGACAGCGCCCTGGTGGTGTTCGAGGCGCGCCGTTATTCCCGCCATGCCCTGATGCTGTGCCAGAAGGCGCGC‑GAGGCTGGCATTGCGGTCACCCTGGTGACCGACACCTTCTGTGACTGGGCGGATGCCAATGCCGACGAGGTGTTCCGCATCCCCACCGAGTTCAACCTGTTCTGGGAATCCACCTCG‑ACGATGCTGTCGTGGGTGCATCTGAT‑GGTCAACGAGGTCTGCAAGAAGCTCGGACCGGATGTTGAAAAACGCTTGGAAGCAACTGCCG > NC_002947/4082629‑4082923 | ctgctgGGCCGTGCCGAAGACAGCGCCCTGGTGGTGTTCGAGGCGCGCCGTTATTCCCGCCATGCCCTGATGCTGTGCCAGAAGGCGCGC‑GAGGCTGGCATTGCGGTCACCCTGGTGACCGACACCTTCTGTGACTGGGCGGATGCCaa < 7:10403/149‑1 (MQ=255) tgctgGGCCGTGCCGAAGACAGCGCCCTGGTGGTGTTCGAGGCGCGCCGTTATTCCCGCCATGCCCTGATGCTGTGCCAGAAGGCGCGC‑GAGGCTGGCATTGCGGTCACCCTGGTGACCGACACCTTCTGTGACTGGGCGGATGCCAAt > 8:293339/1‑149 (MQ=255) tgGGCCGTGCCGAAGACAGCGCCCTGGTGGTGTTCGAGGCGCGCCGTTATTCCCGCCATGCCCTGATGCTGTGCCAGAAGGCGCGC‑GAGGCTGGCATTGCGGTCACCCTGGTGACCGACACCTTCTGTGACTGGGCGGATGCCAATGcc < 2:73816/149‑1 (MQ=255) gCCGTGCCGAAGACAGCGCCCTGGTGGTGTTCGAGGCGCGCCGTTATTCCCGCCATGCCCTGATGCTGTGCCAGAAGGCGCGC‑GAGGCTGGCATTGCGGTCACCCTGGTGACCGACACCTTCTGTGACTGGGCGGATGCCAATGCcgac > 6:36805/1‑149 (MQ=255) ccGTGCCGAAGACAGCGCCCTGGTGGTGTTCGAGGCGCGCCGTTATTCCCGCCATGCCCTGATGCTGTGCCAGAAGGCGCGC‑GAGGCTGGCATTGCGGTCACCCTGGTGACCGACACCTTCTGTGACTGGGCGGATGCCAATGCcgac > 3:145492/1‑148 (MQ=255) aaGACAGCGCCCTGGTGGTGTTCGAGGCGCGCCGTTATTCCCGCCATGCCCTGATGCTGTGCCAGAAGGCGCGC‑GAGGCTGGCATTGCGGTCACCCTGGTGACCGACACCTTCTGTGACTGGGCGGATGCCAATGCCGACGAGGTGTTc < 4:118656/149‑1 (MQ=255) aGACAGCGCCCTGGTGGTGTTCGAGGCGCGCCGTTATTCCCGCCATGCCCTGATGCTGTGCCAGAAGGCGCGC‑GAGGCTGGCATTGCGGTCACCCTGGTGACCGACACCTTCTGTGACTGGGCGGATGCCAATGCCGACGAGGTGTTcc < 4:149339/149‑1 (MQ=255) gACAGCGCCCTGGTGGTGTTCGAGGCGCGCCGTTATTCCCGCCATGCCCTGATGCTGTGCCAGAAGGCGCGC‑GAGGCTGGCATTGCGGTCACCCTGGTGACCGACACCTTCTGTGACTGGGCGGATGCCAATGCCGACGAGGTGTTc > 6:312364/1‑147 (MQ=255) gACAGCGCCCTGGTGGTGTTCGAGGCGCGCCGTTATTCCCGCCATGCCCTGATGCTGTGCCAGAAGGCGCGC‑GAGGCTGGCATTGCGGTCACCCTGGTGACCGACACCTTCTGTGACTGGGCGGATGCCAATGCCGACGAGGTGTTc < 5:312364/147‑1 (MQ=255) aGCGCCCTGGTGGTGTTCGAGGCGCGCCGTTATTCCCGCCATGCCCTGATGCTGTGCCAGAAGGCGCGC‑GAGGCTGGCATTGCGGTCACCCTGGTGACCGACACCTTCTGTGACTGGGCGGATGCCAATGCCGACGAGGTGTTc > 6:38419/1‑144 (MQ=255) aGCGCCCTGGTGGTGTTCGAGGCGCGCCGTTATTCCCGCCATGCCCTGATGCTGTGCCAGAAGGCGCGC‑GAGGCTGGCATTGCGGTCACCCTGGTGACCGACACCTTCTGTGACTGGGCGGATGCCAATGCCGACGAGGTGTTc < 5:38419/144‑1 (MQ=255) aGCGCCCTGGTGGTGTTCGAGGCGCGCCGTTATTCCCGCCATGCCCTGATGCTGTGCCAGAAGGCGCGC‑GAGGCTGGCATTGCGGTCACCCTGGTGACCGACACCTTCTGTGACTGGGCGGATGCCAATGCCGACGAGGTGTTCCGCAt < 4:145492/149‑1 (MQ=255) cgcCCTGGTGGTGTTCGAGGCGCGCCGTTATTCCCGCCATGCCCTGATGCTGTGCCAGAAGGCGCGC‑GAGGCTGGCATTGCGGTCACCCTGGTGACCGACACCTTCTGTGACTGGGCGGATGCCAATGCCGACGAGGTGTTCCGCATcc > 4:280537/1‑149 (MQ=255) ccTGGTGGTGTTCGAGGCGCGCCGTTATTCCCGCCATGCCCTGATGCTGTGCCAGAAGGCGCGC‑GAGGCTGGCATTGCGGTCACCCTGGTGACCGACACCTTCTGTGACTGGGCGGATGCCAATGCCGACGAGGTGTTCCGCATCCCCa > 6:181052/1‑149 (MQ=255) tggtggTGTTCGAGGCGCGCCGTTATTCCCGCCATGCCCTGATGCTGTGCCAGAAGGCGCGC‑GAGGCTGGCATTGCGGTCACCCTGGTGACCGACACCTTCTGTGACTGGGCGGATGCCAATGCCGACGAGGTGTTCCGCATCCCCAcc > 4:244718/1‑149 (MQ=255) gtggtgTTCGAGGCGCGCCGTTATTCCCGCAATGCCCTGATGCTGTGCCAGAAGGCGCGC‑GATGCTGGCATTGCGGTCACCCTGGTGACCGACACCTTCTGTGACTGGGCGGATGCCAATGCCGACGAGGTGTTCCGCATCCCCACCGa < 3:41979/149‑1 (MQ=255) ggtgTTCGAGGCGCGCCGTTATTCCCGCCATGCCCTGATGCTGTGCCAGAAGGCGCGC‑GAGGCTGGCATTGCGGTCACCCTGGTGACCGACACCTTCTGTGACTGGGCGGATGCCAATGCCGACGAGGTGTTCCGCATCCCCACCGAGt > 5:250700/1‑149 (MQ=255) gtgtTCGAGGCGCGCCGTTATTCCCGCCATGCCCTGATGCTGTGCCAGAAGGCGCGC‑GAGGCTGGCATTGCGGTCACCCTGGTGACCGACACCTTCTGTGACTGGGCGGATGCCAATGCCGACGAGGTGTTCCGCATCCCCACCGAGt < 3:31806/148‑1 (MQ=255) gtTCGAGGCGCGCCGTTATTCCCGCCATGCCCTGATGCTGTGCCAGAAGGCGCGC‑GAGGCTGGCATTGCGGTCACCCTGGTGACCGACACCTTCTGTGACTGGGCGGATGCCAATGCCGACGAGGTGTTCCGCATc > 7:193211/1‑136 (MQ=255) gtTCGAGGCGCGCCGTTATTCCCGCCATGCCCTGATGCTGTGCCAGAAGGCGCGC‑GAGGCTGGCATTGCGGTCACCCTGGTGACCGACACCTTCTGTGACTGGGCGGATGCCAATGCCGACGAGGTGTTCCGCATc < 8:193211/136‑1 (MQ=255) cGAGGCGCGCCGTTATTCCCGCCATGCCCTGATGCTGTGCCAGAAGGCGCGCGGAGGCTGGCATTGCGGTCACCCTGGTGACCGACACCTTCTGTGACTGGGCGGATGCCAATGCCGACGAGGTGTTCCGCATCCCCACCGAGTTCGAc > 1:90174/1‑149 (MQ=255) cGAGGCGCGCCGTTATTCCCGCCATGCCCTGATGCTGTGCCAGAAGGCGCGC‑GAGGCTGGCATTGCGGTCACCCTGGTGACCGACACCTTCTGTGACTGGGCGGATGCCAATGCCGACGAGGTGTTCCGCATCCCCACCGAGTTCAAc < 3:168351/148‑1 (MQ=255) gcgcCGTTATTCCCGCCATGCCCTGATGCTGTGCCAGAAGGCGCGC‑GAGGCTGGCATTGCGGTCACCCTGGTGACCGACACCTTCTGTGACTGGGCGGATGCCAATGCCGACGAGGTGTTCCGCATCCCCACCGAGTTCAACCTGTTCt < 3:280537/149‑1 (MQ=255) gcgcCGTTATTCCCGCCATGCCCTGATGCTGTGCCAGAAGGCGCGC‑GAGGCTGGCATTGCGGTCACCCTGGTGACCGACACCTTCTGTGACTGGGCGGATGCCAATGCCGACGAGGTGTTCCGCATCCCCACCGAGTTCAACCTGTTCt > 6:222714/1‑149 (MQ=255) cgcCGTTATTCCCGCCATGCCCTGATGCTGTGCCAGAAGGCGCGC‑GAGGCTGGCATTGCGGTCACCCTGGTGACCGACACCTTCTGTGACTGGGCGGATGCCAATGCCGACGAGGTGTTCCGCATCCCCACCGAGTTCAACCTGTTCTg < 7:293339/149‑1 (MQ=255) gcCGTTATTCCCGCCATGCCCTGATGCTGTGCCAGAAGGCGCGC‑GAGGCTGGCATTGCGGTCACCCTGGTGACCGACACCTTCTGTGACTGGGCGGATGCCAATGCCGACGAGGTGTTCCGCATCCCCACCGAGTTCAACCTGTTCTgg < 1:133310/149‑1 (MQ=255) ttATTCCCGCCATGCCCTGATGCTGTGCCAGAAGGCGCGC‑GAGGCTGGCATTGCGGTCACCCTGGTGACCGACACCTTCTGTGACTGGGCGGATGCCAATGCCGACGAGGTGTTCCGCATCCCCACCGAGTTCAACCTGTTCTgg < 8:176971/145‑1 (MQ=255) ttATTCCCGCCATGCCCTGATGCTGTGCCAGAAGGCGCGC‑GAGGCTGGCATTGCGGTCACCCTGGTGACCGACACCTTCTGTGACTGGGCGGATGCCAATGCCGACGAGGTGTTCCGCATCCCCACCGAGTTCAACCTGTTCTgg > 7:176971/1‑145 (MQ=255) ttCCCGCCATGCCCTGATGCTGTGCCAGAAGGCGCGC‑GAGGCTGGCATTGCGGTCACCCTGGTGACCGACACCTTCTGTGACTGGGCGGATGCCAATGCCGACGAGGTGTTCCGCATCCCCACCGAGTTCAACCTGTTCTGGGAATCCa < 6:250700/149‑1 (MQ=255) tCCCGCCATGCCCTGATGCTGTGCCAGAAGGCGCGC‑GAGGCTGGCATTGCGGTCACCCTGGTGACCGACACCTTCTGTGACTGGGCGGATGCCAATGCCGACGAGGTGTTCCGCATCCCCACCGAGTTCAACCTGTTCTGGGAATCCAc > 3:211554/1‑149 (MQ=255) ccGCCATGCCCTGATGCTGTGCCAGAAGGCGCGC‑GAGGCTGGCATTGCGGTCACCCTGGTGACCGACACCTTCTGTGACTGGGCGGATGCCAATGCCGACGAGGTGTTCCGCATCCCCACCGAGTTCAACCTGTTCTGGGAATCCACCt > 2:267296/1‑149 (MQ=255) ccATGCCCTGATGCTGTGCCAGAAGGCGCGC‑GAGGCTGGCATTGCGGTCACCCTGGTGACCGACACCTTCTGTGACTGGGCGGATGCCAATGCCGACGAGGTGTTCCGCATCCCCACCGAGTTCAACCTGTTCTGGGAATCCACCTcg‑a < 3:244718/149‑1 (MQ=255) aTGCCCTGATGCTGTGCCAGAAGGCGCGC‑GAGGCTGGCATTGCGGTCACCCTGGTGACCGACACCTTCTGTGACTGGGCGGATGCCAATGCCGACGAGGTGTTCCGCATCCCCACCGAGTTCAACCTGTTCTGGGAATCCACCTcg‑acg < 5:222714/149‑1 (MQ=255) tgCCAGAAGGCGCGC‑GAGGCTGGCATTGCGGTCACCCTGGTGACCGACACCTTCTGTGACTGGGCGGATGCCATTGCCGACGAGGTGTTCCGCATCCCCACCGAGTTCAACCTGTTCTGGGAATCCACCTCG‑ACGATGCTGTCGTgg > 6:161724/1‑147 (MQ=255) tgCCAGAAGGCGCGC‑GAGGCTGGCATTGCGGTCACCCTGGTGACCGACACCTTCTGTGACTGGGCGGATGCCATTGCCGACGAGGTGTTCCGCATCCCCACCGAGTTCAACCTGTTCTGGGAATCCACCTCG‑ACGATGCTGTCGTgg < 5:156725/147‑1 (MQ=255) tgCCAGAAGGCGCGC‑GAGGCTGGCATTGCGGTCACCCTGGTGACCGACACCTTCTGTGACTGGGCGGATGCCATTGCCGACGAGGTGTTCCGCATCCCCACCGAGTTCAACCTGTTCTGGGAATCCACCTCG‑ACGATGCTGTCGTgg < 5:161724/147‑1 (MQ=255) tgCCAGAAGGCGCGC‑GAGGCTGGCATTGCGGTCACCCTGGTGACCGACACCTTCTGTGACTGGGCGGATGCCATTGCCGACGAGGTGTTCCGCATCCCCACCGAGTTCAACCTGTTCTGGGAATCCACCTCG‑ACGATGCTGTCGTgg > 6:156725/1‑147 (MQ=255) tgCCAGAAGGCGCGC‑GAGGCTGGCATTGCGGTCACCCTGGTGACCGACACCTTCTGTGACTGGGCGGATGCCAATGCCGACGAGGTGTTCCGCATCCCCACCGAGTTCAACCTGTTCTGGGAATCCACCTCG‑ACGATGCTGTCGTgg < 4:211554/147‑1 (MQ=255) ccAGAAGGCGCGC‑GAGGCTGGCATTGCGGTCACCCTGGTGACCGACACCTTCTGTGACTGGGCGGATGCCAATGCCGACGAGGTGTTCCGCATCCCCACCGAGTTCAACCTGTTCTgg > 1:149238/1‑118 (MQ=255) ccAGAAGGCGCGC‑GAGGCTGGCATTGCGGTCACCCTGGTGACCGACACCTTCTGTGACTGGGCGGATGCCAATGCCGACGAGGTGTTCCGCATCCCCACCGAGTTCAACCTGTTCTgg < 2:149238/118‑1 (MQ=255) ggCGCGC‑GAGGCTGGCATTGCGGTCACCCTGGTGACCGACACCTTCTGTGACTGGGCGGATGCCAATGCCGACGAGGTGTTCCGCATCCCCACCGAGTTCAACCTGTTCTGGGAATCCACCTCG‑ACGATGCTGTCGTGGGTGCATCTGa < 5:181052/149‑1 (MQ=255) gcgcgc‑GAGGCTGGCATTGCGGTCACCCTGGTGACCGACACCTTCTGTGACTGGGCGGATGCCAATGCCGACGAGGTGTTCCGCATCCCCACCGAGTTCAACCTGTTCTGGGAATCCACCTCG‑ACGATGCTGTCGTGGGTGCATCTGAt < 6:342690/149‑1 (MQ=255) cgc‑gAGGCTGGCATTGCGGTCACCCTGGTGACCGACACCTTCTGTGACTGGGCGGATGCCAATGCCGACGAGGTGTTCCGCATCCCCACCGAGTTCAACCTGTTCTGGGAATCCACCTCG‑ACGATGCTGTCGTGGGTGCATCTGAT‑gg > 6:107578/1‑148 (MQ=255) tGGCATTGCGGTCACCCTGGTGACCGACACCTTCTGTGACTGGGCGGATGCCAATGCCGACGAGGTGTTCCGCATCCCCACCGAGTTCAACCTGTTCTGGGAATCCACCTCG‑ACGATGCTGTCGTGGGTGCATCTGAT‑GGTCAACGAgg > 6:333784/1‑149 (MQ=255) tGGCATTGCGGTCACCCTGGTGACCGACACCTTCTGTGACTGGGCGGATGCCAATGCCGACGAGGTGTTCCGCATCCCCACCGAGTTCAACCTGTTCTGGGAATCCACCTCG‑ACGATGCTGTCGTGGGTGCATCTGAT‑GGTCAACGAgg > 2:41333/1‑149 (MQ=255) gCATTGCGGTCACCCTGGTGACCGACACCTTCTGTGACTGGGCGGATGCCAATGCCGACGAGGTGTTCCGCATCCCCACCGAGTTCAAGCTGTTCTGGGAATCCACCTCG‑ACGATGCTGTCGTGGGTGCATCTGAT‑GGTCAACGAGGTc > 7:236164/1‑149 (MQ=255) gCATTGCGGTCACCCTGGTGACCGACACCTTCTGTGACTGGGCGGATGCCAATGCCGACGAGGTGTTCCGCATCCCCACCGAGTTCAACCTGTTCTGGGAATCCACCTCG‑ACGATGCTGTCGTGGGTGCATCTGAT‑GGTCAACGAGGTc < 4:71265/149‑1 (MQ=255) ggTCACCCTGGTGACCGACACCTTCTGTGACTGGGCGGATGCCAATGCCGACGAGGTGTTCCGCATCCCCACCGAGTTCAACCTGTTCTGGGAATCCACCTCG‑ACGATGCTGTCGTGGGTGCATCTGAT‑GGTCAACGa > 1:137887/1‑138 (MQ=255) gTCACCCTGGTGACCGACACCGTCTGTGACGGGGCGGATGCCAATGCAGACGAGGTGTTCCGCATCCCCACCGAGTTCAACCTTTTCTGGGAATCCACCTAG‑ACGATGCTGTCGTGGGTGCATCTGAT‑GTTCAACGAGGTCTGCaagaa < 4:319059/149‑1 (MQ=255) aCCCTGGTGACCGACACCTTCTGTGACTGGGCGGATGCCAATGCCGACGAGGTGTTCCGCATCCCCACCGAGTTCAACCTGTTCTGGGAATCCACCTc > 5:226968/1‑98 (MQ=255) aCCCTGGTGACCGACACCTTCTGTGACTGGGCGGATGCCAATGCCGACGAGGTGTTCCGCATCCCCACCGAGTTCAACCTGTTCTGGGAATCCACCTc < 6:226968/98‑1 (MQ=255) ccTGGTGACCGACACCTTCTGTGACTGGGCGGATGCCAATGCCGACGAGGTGTTCCGCATCCCCACCGAGTTCAACCTGTTCTGGGAATCCACCTCG‑ACGATGCTGTCGTGGGTGCATCTGAT‑GGTCAACGAGGTCTGCAAGAAGCTCg < 5:333784/149‑1 (MQ=255) ccTGGTGACCGACACCTTCTGTGACTGGGCGGATGCCAATGCCGACGAGGTGTTCCGCATCCCCACCGAGTTCAACCTGTTCTGGGAATCCACCTCG‑ACGATGCTGTCGTGGGTGCATCTGAT‑GGTCAACGAGGTCTGCAAGAAGCTCg > 4:337570/1‑149 (MQ=255) cTGGTGACCGACACCTTCTGTGACTGGGCGGATGCCAATGCCGACGAGGTGTTCCGCATCCCCACCGAGTTCAACCTGTTCTGGGAATCCACCTCG‑ACGATGCTGTCGTGGGTGCATCTGAT‑GGTCAACGAGGTCTGCAAGAAGCTCg > 8:202729/1‑148 (MQ=255) gTGACCGACACCTTCTGTGACTGGGCGGATGCCAATGCCGACGAGGTGTTCCGCATCCCCACCGAGTTCAACCTGTTCTGGGAATCCACCTCGTTCGATGCTGTCGTGGGTGCATCTGAT‑GGTCAACGAGGTCTGCAAGAAGCTCGGAc < 1:267296/149‑1 (MQ=255) tGACCGACACCTTCTGTGACTGGGCGGATGCCAATGCCGACGAGGTGTTCCGCATCCCCACCGAGTTCAACCTGTTCTGGGAATCCACCTCG‑ACGATGCTGTCGTGGGTGCATCTGAT‑GGTCAACGAGGTCTGCAAGAAGCTCGGACCg < 5:107578/149‑1 (MQ=255) ccGACACCTTCTGTGACTGGGCGGATGCCAATGCCGACGAGGTGTTCCGCATCCCCACCGAGTTCAACCTGTTCTGGGAATCCACCTCG‑ACGATGCTGTCGTGGGTGCATCTGATCGGTCAACGAGGTCTGCAAGAAGCTCGGACCGGa < 1:41333/149‑1 (MQ=255) cGACACCTTCTGTGACTGGGCGGATGCCAATGCCGACGAGGTGTTCCGCATCCCCACCGAGTTCAACCTGTTCTGGGAATCCACCTCG‑ACGCTGCTGTCGTCGGTGCATCTGAT‑GGTCAACGAGGTCTGCAAGAAGCTCGGAGCGGATg > 6:75390/1‑149 (MQ=255) cGACACCTTCTGTGACTGGGCGGATGCCAATGCCGACGAGGTGTTCCGCATCCCCACCGAGTTCAACCTGTTCTGGGAATCCACCTCG‑ACGATGCTGTCGTGGGTGCATCTGAT‑GGTCAACGAGGTCTGCAAGAAGCTCGGAcc > 5:170554/1‑144 (MQ=255) cGACACCTTCTGTGACTGGGCGGATGCCAATGCCGACGAGGTGTTCCGCATCCCCACCGAGTTCAACCTGTTCTGGGAATCCACCTCG‑ACGATGCTGTCGTGGGTGCATCTGAT‑GGTCAACGAGGTCTGCAAGAAGCTCGGAcc < 6:170554/144‑1 (MQ=255) acacCTTCTGTGACTGGGCGGATGCCAATGCCGACGAGGTGTTCCGCATCCCCACCGAGTTCAACCTGTTCTGGGAATCCACCTCG‑ACGATGCTGTCGTGGGTGCAt < 1:114604/107‑1 (MQ=255) acacCTTCTGTGACTGGGCGGATGCCAATGCCGACGAGGTGTTCCGCATCCCCACCGAGTTCAACCTGTTCTGGGAATCCACCTCG‑ACGATGCTGTCGTGGGTGCAt > 2:114604/1‑107 (MQ=255) cTTCTGTGACTGGGCGGATGCCAATGCCGACGAGGTGTTCCGCATCCCCACCGAGTTCAACCTGTTCTGGGAATCCACCTCG‑ACGATGCTGTCGTGGGTGCATCTGAT‑GGTCAACGAGGTCTGCAAGAAGCTCGGACCGGATGTTGaa > 7:266347/1‑148 (MQ=255) cTTCTGTGACTGGGCGGACACCAATGCCGACGAGGTGTTCCGCATCCCCACCGAGTTCAACCTGTTCTGGGAATCCACCTCG‑ACGATGCTGTCGTGGGTGCATCTGAT‑GGTCAACGAGGTCTGCaagaag < 7:66103/130‑1 (MQ=255) cTTCTGTGACTGGGCGGACACCAATGCCGACGAGGTGTTCCGCATCCCCACCGAGTTCAACCTGTTCTGGGAATCCACCTCG‑ACGATGCTGTCGTGGGTGCATCTGAT‑GGTCAACGAGGTCTGCaagaag > 8:66103/1‑130 (MQ=255) cTGTGACTGGGCGGATGCCAATGCCGACGAGGTGTTCCGCATCCCCACCGAGTTCAACCTGTTCTGGGAATCCACCTCG‑ACGATGCTGTCGTGGGTGCATCTGAT‑GGTCAACGAGGTCTGc < 4:135899/121‑1 (MQ=255) tgACTGGGCGGATGCCAATGCCGACGAGGTGTTCCGCATCCCCACCGAGTTCAACCTGTTCTGGGAATCCACCTCG‑ACGATGCTGTCGTGGGTGCATCTGAT‑GGTCAACGAGGTCTGCAAGAAGCTCGGACCGGATGTTGAAAAACg < 5:36805/147‑1 (MQ=255) aCTGGGCGGATGCCAATGCCGACGAGGTGTTCCGCATCCCCACCGAGTTCAACCTGTTCTGGGAATCCACCTCG‑ACGATGCTGTCGTGGGTGCATCTGAT‑GGTCAACGAGGTCTGCAAGAAGCTCGGACCGGATGTTGAAAAACGCTTg > 7:267456/1‑149 (MQ=255) ccAATGCCGACGAGGTGTTCCGCATCCCCACCGAGTTCAACCTGTTCTGGGAATCCACCTCG‑ACGATGCTGTCGTGGGTGCATCTGAT‑GGTCAACGAGGTCTGCAAGAAGCTCGGACCGGATGTTGAAAAACGCTTGGAAGCAACTGcc > 3:174225/1‑149 (MQ=255) cAATGCCGACGAGGTGTTCCGCATCCCCACCGAGTTCAACCTGTTCTGGGAATCCACCTCG‑ACGATGCTGTCGTGGGTGCATCTGAT‑GGTCAACGAGGTCTGCAAGAAGCTCGGACCGGATGtt > 7:147087/1‑124 (MQ=255) cAATGCCGACGAGGTGTTCCGCATCCCCACCGAGTTCAACCTGTTCTGGGAATCCACCTCG‑ACGATGCTGTCGTGGGTGCATCTGAT‑GGTCAACGAGGTCTGCAAGAAGCTCGGACCGGATGtt < 8:147087/124‑1 (MQ=255) cAATGCCGACGAGGTGTTCCGCATCCCCACCGAGTTCAACCTGTTCTGGGAATCCACCTCG‑ACGATGCTGTCGTGGGTGCATCTGAT‑GGTCAACGAGGTCTGCAAGAAGCTCGGACCGGATGTTGAAAAACGCTTGGAAGCAACTGCCg > 4:30836/1‑149 (MQ=255) cAATGCCGACGAGGTGTTCCGCATCCCCACCGAGTTCAACCTGTTCTGGGAATCCACCTCG‑ACGATGCTGTCGTGGGTGCATCTGAT‑GGTCAACGAGGTCTGCAAGAAGCTCGGACCGGATGTTGAAAAACGCTTGGAAGCAACTGCCg > 4:201607/1‑149 (MQ=255) cAATGCCGACGAGGTGTTCCGCATCCCCACCGAGTTCAACCTGTTCTGGGAATCCACCTCG‑ACGATGCTGTCGTGGGTGCATCTGAT‑GGTCAACGAGGTCTGCAAGAAGCTCGGACCGGATGTTGAAAAACGCTTGGAAGCAACTGCCg > 3:160915/1‑149 (MQ=255) cAATGCCGACGAGGTGTTCAGCATCCCCACCGAGTTCAACCTGTTCTGGGAATCCACCTCG‑ACGATGCTGTCGTGGGTGCATCTGAT‑GGTCAACGAGGTCTGCAAGAAGCTCGGACCGGATGTTGAAAAAAGCTTGGAAGCAACTGCCg > 4:328010/1‑149 (MQ=255) | CTGCTGGGCCGTGCCGAAGACAGCGCCCTGGTGGTGTTCGAGGCGCGCCGTTATTCCCGCCATGCCCTGATGCTGTGCCAGAAGGCGCGC‑GAGGCTGGCATTGCGGTCACCCTGGTGACCGACACCTTCTGTGACTGGGCGGATGCCAATGCCGACGAGGTGTTCCGCATCCCCACCGAGTTCAACCTGTTCTGGGAATCCACCTCG‑ACGATGCTGTCGTGGGTGCATCTGAT‑GGTCAACGAGGTCTGCAAGAAGCTCGGACCGGATGTTGAAAAACGCTTGGAAGCAACTGCCG > NC_002947/4082629‑4082923 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |