| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,439,786 | C→G | 5.0% | L232L (CTC→CTG) | PP_3934 → | LysR family transcriptional regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,439,786 | 0 | C | G | 5.0% | 253.7 / 2.8 | 79 | L232L (CTC→CTG) | PP_3934 | LysR family transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (38/37); new base G (2/2); total (40/39) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.00e-01 | |||||||||||
GCATATCTGGCCCTGGCTGGCACACCGCAACATCCGGAAGACCTGGATGGACACACCTTGATCCTGCATACCGCGCCACGCATCCTCAAGGCCTGGCACTTTTGCCACAATGACCAGATCACCAGCCTTCGCCCCAGGCCCA‑‑GGCTCCGCCTGGGCTCAGGAGGCGCGGTGTACCACAGCACCCTGGCCGGCGCCGGCATCGCTCGCCTTGCCGCCTGGGTCGGCGAAGCACAGGTCAAGGCCGGCCGCCTGGTGCGGGTGTGCCCGCAGTACCGCTTGACGTCCAGTAGCGGC > NC_002947/4439640‑4439933 | gCATATCTGGCCCTGGCTGGCACACCGGATCATCCGGAAGAACTGGATGGAAACACCGTGATCCTTCATACCGCGCCACGCATCCTCAAGGCCTGGCACTTTTGCCACAATGACCAGATCACCAGCCTTCGCCCCAGGCCCA‑‑GGCTCCg < 7:135786/149‑1 (MQ=255) cATATCTGGCCCTGGCTGGCACACCGCAACATCCGGAAGACCTGGATGGACACACCTTGATCCTGCATACCGCGCCACGCATCCTCAAGGCCTGGCACTTTTGCCACAATGACCAGATCACCAGCCTTCGCCCCAGGCCCA‑‑GGCTCCGc < 2:317854/149‑1 (MQ=255) tGGCCCTGGCTGGCACACCGCAACATCCGGAAGACCTGGATGGACACACCTTGATCCTGCATACCGCGCCACGCATCCTCAAGGCCTGGCACTTTTGCCACAATGACCAGATCACCAGCCTTCGCCCCAGGCCCA‑‑GGCTCCGCCTGGGc > 2:222786/1‑149 (MQ=255) tGGCCCTGGCTGGCACACCGCAACATCCGGAAGACCTGGATGGACACACCTTGATCCTGCATACCGCGCCACGCATCCTCAAGGCCTGGCACTTTTGCCACAATGACCAGATCACCAGCCTTCGCCCCAGGCCCA‑‑GGCTCCGCCTGGGc > 6:172722/1‑149 (MQ=255) gCCCTGGCTGGCACACCGCAACATCCGGAAGACCTGGATGGACACACCTTGATCCTGCATACCGCGCCACGCATCCTCAAGGCCTGGCACTTTTGCCACAATGACCAGATCACCAGCCTTCGCCCCAGGCCCA‑‑GGCTCCGCCTggg < 5:279015/146‑1 (MQ=255) ccTGGCTGGCACACCGCAACATCCGGAAGACCTGGATGGACACACCTTGATCCTGCATACCGCGCCACGCATCCTCAAGGCCTGGCACTTTTGCCACAATGACCAGATCACCAGCCTTCGCCCCAGGCCCA‑‑GGCTCCGCCTGGGCTCag > 6:138418/1‑149 (MQ=255) tggctggcACACCGCAACATCCGGAAGACCTGGATGGACACACCTTGATCCTGCATACCGCGCCACGCATCCTCAAGGCCTGGCACTTTTGCCACAATGACCAGATCACCAGCCTTCGCCCCAGGCCCA‑‑GGCTCCGCCTGGGCTCag > 1:317720/1‑147 (MQ=255) ggctggcACACCGCAACATCCGGAAGACCTGGATGGACACACCTTGATCCTGCATACCGCGCCACGCATCCTCAAGGCCTGGCACTTTTGCCACAATGACCAGATCACCAGCCTTCGCCCCAGGCCCA‑‑GGCTCCGCCTGGGCTCaggag > 8:31061/1‑149 (MQ=255) acacCGCAACATCCGGAAGACCTGGATGGACACACCTTGATCCTGCATACCGCGCCACGCATCCTCAAGGCCTGGCACTTTTGCCACAATGACCAGATCACCAGCCTTCGCCCCAGGCCCA‑‑GGCTCCGCCTGGGCTCAGGAGGCGCGgt > 3:325488/1‑149 (MQ=255) gCAACATCCGGAAGACCTGGATGGACACACATTGATCCTGCATACCGCGCCACGCATCCTCAAGGCCTGGCACTTTTGCCACAATGACCAGATCACCAGCCTTCGCCCCAGGCCCA‑‑GGCTCCGCCTGGGCTCAGGAGGCGCGGTGTAc > 5:26913/1‑148 (MQ=255) aTCCGGAAGACCTGGATGGACACACCTTGATCCTGCATACCGCGCCACGCATCCTCAAGGCCTGGCACTTTTGCCACAATGACCAGATCACCAGCCTTCGCCCCAGGCCCA‑‑GGCTCCGCCTGGGCTCAGGAGGCGCGGTGTACcac > 7:257789/1‑146 (MQ=255) aTCCGGAAGACCTGGATGGACACACCTTGATCCTGCATACCGCGCCACGCATCCTCAAGGCCTGGCACTTTTGCCACAATGACCAGATCACCAGCCTTCGCCCCAGGCCCA‑‑GGCTCCGCCTGGGCTCAGGAGGCGCGGTGTACcac < 8:257789/146‑1 (MQ=255) ggAAGACCTGGATGGACACACCTTGATCCTGCATACCGCGCCACGCATCCTCAAGGCCTGGCACTTTTGCCACAATGACCAGATCACCAGCCTTCGCCCCAGGCCCA‑‑GGCTCCGCCTGGGCTCAGGAGGCGCGGTGTACCACAGCAccc > 8:3230/1‑149 (MQ=255) aaGACCTGGATGGACACACCTTGATCCTGCATACCGCGCCACGCATCCTCAAGGCCTGGCACTTTTGCCACAATGACCAGATCACCAGCCTTCGCCCCAGGCCCA‑‑GGCTCCGCCTGGGCTCAGGAGGCGCGGTGTACCACAGCACCCTg < 7:31061/149‑1 (MQ=255) aCCTGGATGGACACACCTTGATCCTGCATACCGCGCCACGCATCCTCAAGGCCTGGCACTTTTGCCACAATGACCAGATCACCAGCCTTCGCCCCAGGCCCA‑‑GGCTCCGCCTGGGCTCAGGAGGCGCGGTGTACCACAGCACCCTGgcc > 3:123261/1‑149 (MQ=255) ggatggaCACACCTTGATCCTGCATACCGCGCCACGCATCCTCAAGGCCTGGCACTTTTGCCACAATGACCAGATCACCAGCCTTCGCCCCAGGCCCA‑‑GGCTCCGCCTGGGCTCAGGAGGCGCGGTGTACCACAGCACCCTGgccggcg > 5:284266/1‑149 (MQ=255) gatggaCACACCTTGATCCTGCATACCGCGCCACGCATCCTCAAGGCCTGGCACTTTTGCCACAATGACCAGATCACCAGCCTTCGCCCCAGGCCCA‑‑GGCTCCGCCTGGGCTCAGGAGGCGCGGTGTACCACAGCACCCTGgccggcgc < 2:317720/149‑1 (MQ=255) gaCACACCTTGATCCTGCATACCGCGCCACGCATCCTCAAGGCCTGGCACTTTTGCCACAATGACCAGATCACCAGCCTTCGCCCCAGGCCCA‑‑GGCTCCGCCTGGGCTCAGGAGGCGCGGTGTACCACAGCACCCTGgccggcgccgg < 6:20123/148‑1 (MQ=255) acacacCTTGATCCTGCATACCGCGCCACGCATCCTCAAGGCCTGGCACTTTTGCCACAATGACCAGATCACCAGCCTTCGCCCCAGGCCCA‑‑GGCTCCGCCTGGGCTCAGGAGGCGCGGTGTACCACAGCACCCTGgc < 4:61065/138‑1 (MQ=255) acacacCTTGATCCTGCATACCGCGCCACGCATCCTCAAGGCCTGGCACTTTTGCCACAATGACCAGATCACCAGCCTTCGCCCCAGGCCCA‑‑GGCTCCGCCTGGGCTCAGGAGGCGCGGTGTACCACAGCACCCTGgc > 3:61065/1‑138 (MQ=255) acacacCTTGATCCTGCATACCGCGCCACGCATCCTCAAGGCCTGGCACTTTTGCCACAATGACCAGATCACCAGCCTTAGCCCCAGGCCCA‑‑GGCTCCGCCTGGGCTCAGGAGGCGCGGTGTACCACAGCACCCTGGCCGGCGCCGGCa > 4:184595/1‑149 (MQ=255) cacacCTTGATCCTGCATACCGCGCCACGCATCCTCAAGGCCTGGCACTTTTGCCACAATGACCAGATCACCAGCCTTCGCCCCAGGCCCA‑‑GGCTCCCCCTGGGCTCAGGAGGCGCCGTGAACCACAGCACCCACGCCGCCGCCGGCAt > 5:309819/1‑149 (MQ=255) cacCTTGATCCTGCATACCGCGCCACGCATCCTCAAGGCCTGGCACTTTTGCCACAATGACCAGATCACCAGCCTTCGCCCCAGGCCCA‑‑GGCTCCGCCTGGGCTCAGGAGGCGCGGTGTACCACAGCACCCTGGCCGGCGCCGGCAtcg < 5:138418/149‑1 (MQ=255) cTTGATCCTGCATACCGCGCCACGCATCCTCAAGGCCTGGCACTTTTGCCACAATGACCAGATCACCAGCCTTCGCCCCAGGCCCA‑‑GGCTCCGCCTGGGCTCAGGAGGCGCGGTGTACcac > 6:166535/1‑121 (MQ=255) cTTGATCCTGCATACCGCGCCACGCATCCTCAAGGCCTGGCACTTTTGCCACAATGACCAGATCACCAGCCTTCGCCCCAGGCCCA‑‑GGCTCCGCCTGGGCTCAGGAGGCGCGGTGTACcac < 5:166535/121‑1 (MQ=255) cTTGATCCTGCATACCGCGCCACGCATCCTCAAGGCCTGGCACTTTTGCCACAATGACCAGATCACCAGCCTTCGCCCCAGGCCCA‑‑GGCTCCGCCTGGGCTCAGGAGGCGCGGTGTACCACAGCACCCTGGCCGGCGCCGGCAtcgctc > 2:266879/1‑149 (MQ=255) gATCCTGCATACCGCGCCACGCATCCTCAAGGCCTGGCACTTTTGCCACAATGACCAGATCACCAGCCTTCGCCCCAGGCCCA‑‑GGCTCCGCCTGGGCTCAGGAGGCGCGGTGTACCACAGCACCCTGGCCGGCGCCGGCAtcgctcgc < 5:76859/148‑1 (MQ=255) tCCTGCATACCGCGCCACGCATCCTCAAGGCCTGGCACTTTTGCCACAATGACCAGATCACCAGCCTTCGCCCCAGGCCCA‑‑GGCTCCGCCTGGGCTCAGGAGGCGCGGTGTACCACAGCACCCTGGCCGGCGCCGGCATCGCTCGCCtt > 2:287317/1‑149 (MQ=255) ccTGCATACCGCGCCACGCATCCTCAAGGCCTGGCACTTTTGCCACAATGACCAGATCACCAGCCTTCGCCCCAGGCCCA‑‑GGCTCCGCCTGGGCTCAGGAGGCGCGGTGTACCACAGCACCCTGGCCGGCGCCGGCAtcgc > 6:193980/1‑141 (MQ=255) ccTGCATACCGCGCCACGCATCCTCAAGGCCTGGCACTTTTGCCACAATGACCAGATCACCAGCCTTCGCCCCAGGCCCA‑‑GGCTCCGCCTGGGCTCAGGAGGCGCGGTGTACCACAGCACCCTGGCCGGCGCCGGCAtcgc < 5:193980/141‑1 (MQ=255) cTGCATACCGCGCCACGCATCCTCAAGGCCTGGCACTTTTGCCACAATGACCAGATCACCAGCCTTCGCCCCAGGCCCA‑‑GGCTCCGCCTGGGCTCAGGAGGCGCGGTGTACCACAGCACCCTGGCCGGCGCCGGCATCGCTCGCCTTgc > 1:95923/1‑149 (MQ=255) cTGCATACCGCGCCACGCATCCTCAAGGCCTGGCACTTTTGCCACAATGACCAGATCACCAGCCTTCGCCCCAGGCCCA‑‑GGCTCCGCCTGGGCTCAGGAGGCGCGGTGTACCACAGCACCCTGGCCGGCGCCGGCATCGCTCGCCTTgc > 6:55510/1‑149 (MQ=255) cTGCATACCGCGCCACGCATCCTCAAGGCCTGGCACTTTTGCCACAATGACCAGATCACCAGCCTTCGCCCCAGGCCCA‑‑GGCTCCGCCTGGGCTCAGGAGGCGCGGTGTACCACAGCACCCTGGCCGGCGCCGGCATCGCTCGCCTTgc > 5:58427/1‑149 (MQ=255) ccGCGCCACGCATCCTCAAGGCCTGGCACTTTTGCCACAATGACCAGATCACCAGCCTTCGCCCCAGGCCCA‑‑GGCTCCGCCTGGGCTCAGGAGGCGCGGTGTACCACAGCACCCTGGCCGGCGCCGGCATCGCTCGCCTTGCCGCCTgg > 6:210456/1‑149 (MQ=255) 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tCAAGGCCTGGCACTTTTGCCACAATGACCAGATCACCAGCCTTCGCCCCAGGCCCAGGGGCTCCGCCTGGGCTCAGGAGGCGCGGTGTACCACAGCACCCTGGCCGGCGCCGGCATCGCTCGCCTTGCCGCCTGGGTCGGCGAAGca > 1:267696/1‑148 (MQ=255) aaGGCCTGGCACTTTTGCCACAATGACCAGATCACCAGCCTTCGCCCCAGGCCCA‑‑GGCTCCGCCTGGGCTCAGGAGGCGCGGTGTACCACAGCACCCTGGCCGGCGCCGGCATCGCTCGCCTTGCCGCCTGGGTCGGCGAAGCACAg < 5:210456/147‑1 (MQ=255) aaGGCCTGGCACTTTTGCCACAATGACCAGATCACCAGCCTTCGCCCCAGGCCCA‑‑GGCTCCGCCTGGGCTCAGGAGGCGCGGTGTACCACAGCACCCTGGCCGGCGCCGGCATCGCTCGCCTTGCCGCCTGGGTCGGCGAAGCACAg < 4:35300/147‑1 (MQ=255) aGGCCTGGCACTTTTGCCACAATGACCAGATCACCAGCCTTCGCCCCAGGCCCA‑‑GGCTCCGCCTGGGCTCAGGAGGCGCGGTGTACCACAGCACCCTGGCCGGCGCCGGCATCGCTCGCCTTGCCGCCTGGGTCGGCGAAGCACAGGTc < 4:75395/149‑1 (MQ=255) ggCCTGGCACTTTTGCCACAATGACCAGATCACCAGCCTTCGCCCCAGGCCCA‑‑GGCTCCGCCTGGGCTCAGGAGGCGCGGTGTACCACAGCACCCTGGCCGGCGCCGGCATCGCTCGCCTTGCCGCCTGGGTCGGCGaa < 4:204568/139‑1 (MQ=255) ggCCTGGCACTTTTGCCACAATGACCAGATCACCAGCCTTCGCCCCAGGCCCA‑‑GGCTCCGCCTGGGCTCAGGAGGCGCGGTGTACCACAGCACCCTGGCCGGCGCCGGCATCGCTCGCCTTGCCGCCTGGGTCGGCGaa > 3:204568/1‑139 (MQ=255) ccTGGCACTTTTGCCACAATGACCAGATCACCAGCCTTAGCCCCAGGCCCA‑‑GGCTCCGCCTGGGCTCAGGAGGCGCGGTGTACCACAGCACCCTGGCCGGCGCCGGCAGCGCTCGCCTTGCCGCCTGGGTCGGCGAAGCACAGGTCAAg < 3:184595/149‑1 (MQ=255) ctcgCACTTTTGCCACAATGCCCCGATCACCAGCCTTCGCCCCAGGCCCA‑‑GGCTCCGCCTGGGCTCAGGAGGCGCGGTGTACCACAGCACCCTGGCCGGCGCCGGCATCGCTCGCCTTGCCGCCTGGGTCGGCGAAGCACAGGTCAAgg < 7:261679/146‑1 (MQ=255) tttaGCCACAATGACCAGATCACCAGCCTTCGCCCCAGGCCCA‑‑GGCTCCGCCTGGGCTCAGGAGGCGCCGTGTACCACAGCACCCTGGCCGGCGCCGGCATCGCTCGCCTTGCCGCCTGGGTCGGCGAAGCACAGGTCAAGgccggccg > 3:227453/1‑149 (MQ=255) tttGCCACAATGACCAGATCACCAGCCTTCGCCCCAGGCCCA‑‑GGCTCCGCCTGGGCTCAGGAGGCGCGGTGTACCACAGCACCCTGGCCGGCGCCGGCATCGCTCGCCTTGCCGCCTGGGTCGGCGAAGcac > 2:47532/1‑132 (MQ=255) tttGCCACAATGACCAGATCACCAGCCTTCGCCCCAGGCCCA‑‑GGCTCCGCCTGGGCTCAGGAGGCGCGGTGTACCACAGCACCCTGGCCGGCGCCGGCATCGCTCGCCTTGCCGCCTGGGTCGGCGAAGcac < 1:47532/132‑1 (MQ=255) ccACAATGACCAGATCACCAGCCTTCGCCCCAGGCCCA‑‑GGCTCCGCCTGGGCTCAGGAGGCGCGGTGTACCACAGCACCCTGGCCGGCGCCGGCATCGCTCGCCTTGCCGCCTGGGTCGGCGAAGcac > 8:186614/1‑128 (MQ=255) cacaATGACCAGATCACCAGCCTTCGCCCCAGGCCCA‑‑GGCTCCGCCTGGGCTCAGGAGGCGCGGTGTACCACAGCACCCTGGCCGGCGCCGGCATCGCTCGCCTTGCCGCCTGGGTCGGCGAAGCACAGGTCAAGGCCGGCCGCCTGGt > 2:339752/1‑149 (MQ=255) acaATGACCAGATCACCAGCCTTCGCCCCAGGCCCA‑‑GGCTCCGCCTGGGCTCAGGAGGCGCGGTGTACCACAGCACCCTGGCCGGCGCCGGCATCGCTCGCCTTGCCGCCTGGGTCGGCGAAGCACAGGTCAAggccg < 1:251832/138‑1 (MQ=255) acaATGACCAGATCACCAGCCTTCGCCCCAGGCCCA‑‑GGCTCCGCCTGGGCTCAGGAGGCGCGGTGTACCACAGCACCCTGGCCGGCGCCGGCATCGCTCGCCTTGCCGCCTGGGTCGGCGAAGCACAGGTCAAggccg > 2:251832/1‑138 (MQ=255) acaATGACCAGATCACCAGCCTTCGCCCCAGGCCCA‑‑GGCTCCGCCTGGGCTCAGGAGGCGCGGTGTACCACAGCACCCTGGCCGGCGCCGGCATCGCTCGCCTTGCCGCCTGGGTCGGCGAAGCACAGGTCAAggc < 8:3387/136‑1 (MQ=255) acaATGACCAGATCACCAGCCTTCGCCCCAGGCCCA‑‑GGCTCCGCCTGGGCTCAGGAGGCGCGGTGTACCACAGCACCCTGGCCGGCGCCGGCATCGCTCGCCTTGCCGCCTGGGTCGGCGAAGCACAGGTCAAggc > 7:3387/1‑136 (MQ=255) aaTGACCAGATCACCAGCCTTCGCCCCAGGCCCA‑‑GGCTCCGCCTGGGCTCAGGAGGCGCGGTGTACCACAGCACCCTGGCCGGCGCCGGCATCGCTCGCCTTGCCGCCTGGGTCGGCGAAGCACAGGTCAAGGCCGGCCGCCTGGTGCg > 7:181915/1‑149 (MQ=255) aTGACCAGATCACCAGCCTTCGCCCCAGGCCCA‑‑GGCTCCGCCTGGGCTCAGGAGGCGCGGTGTACCACAGCACCCTGGCCGGCGCCGGCATCGCTCGCCTTGCCGCCTGGGTCGGCGAAGCACAGGTCAAGGCCGGCCGCCTGGTGCgg < 8:181915/149‑1 (MQ=255) aTGACCAGATCACCAGCCTTCGCCCCAGGCCCA‑‑GGCTCCGCCTGGGCTCAGGAGGCGCGGTGTACCACAGCACCCTGGCCGGCGCCGGCATCGCTCGCCTTGCCGCCTGGGTCGGCGAAGCACAGGTCAAGGCCGGCCGCCTGGTGCgg < 7:77093/149‑1 (MQ=255) aTGACCAGATCACCAGCCTTCGCCCCAGGCCCA‑‑GGCTCCGCCTGGGCTCAGGAGGCGCGGTGTACCACAGCACCCTGGCCGGCGCCGGCATCGCTCGCCTTGCCGCCTGGGTCGGCGAAGCACAGGTCAAGGCCGGCCGCCTGGTGCgg < 4:123261/149‑1 (MQ=255) aGATCACCAGCCTTCGCCCCAGGCCCA‑‑GGCTCCGCCTGGGCTCAGGAGGCGCGGTGTACCACAGCACCCTGGCCGGCGCCGGCATCGCTCGCCTTGCCGCCTGGGTCGGCGAAGCACAGGTCAAGGCCGGCCGCCTGGTGCGGGTGTGc > 6:34647/1‑149 (MQ=255) 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(MQ=255) ctcctgagccca‑‑ggcGGAGCCTGGGC‑CTGG‑GGCGCGGTGTACCACAGCACCCTGGCCGGCGCCGGCATCGCTCGCCTTGCCGCCTGGGTCGGCGAAGCACAGGTCAAGGCCGGCCGCCTGGTGCGGGTGTGCCCGCAGTACCGCTTGAc < 3:181287/142‑1 (MQ=255) ccccAGGCCCA‑‑GGCTCCGCCTGGGCTCAGGAGGCGCGGTGTACCACAGCACCCTGGCCGGCGCCGGCATCGCTCGCCTTGCCGCCTGGGTCGGCGAAGCACAGGTCAAGGCCGGCCGCCTGGTGCGGGTGTGCCCGCAGTACCGCTTGa < 5:55510/149‑1 (MQ=255) ccccAGGCCCA‑‑GGCTCCGCCTGGGCTCAGGAGGCGCGGTGTACCACAGCACCCTGGCCGGCGCCGGCATCGCTCGCCTTGCCGCCTGGGTCGGCGAAGCACAGGTCAAGGCCGGCCGCCTGGTGCGGGTGTGCCCGCAGTACCGCTTGa < 1:266879/149‑1 (MQ=255) cccaggccca‑‑ggCTCCGCCTGGGCTCAGGAGGCGCGGTGTACCACAGCACCCTGGCCGGCGCCGGCATCGCTCGCCTTGCCGCCTGGGTCGGCGAAGCACAGGTCAAGGCCGGCCGCCTGGTGCGGGTGTGCCCGCAGTACCGCTTGAc > 5:163271/1‑149 (MQ=255) cccaggccca‑‑ggCTCCGCCTGGGCTCAGGAGGCGCGGTGTACCACAGCACCCTGGCCGGCGCCGGCATCGCTCGCCTTGCCGCCTGGGTCGGCGAAGCACAGGTCAAGGCCGGCCGCCTGGTGCGGGTGTGCCCGCAGTACCGCTTGAc < 1:339752/149‑1 (MQ=255) cccaggccca‑‑ggCTCCGCCTGGGCTCAGGAGGCGCGGTGTACCACAGCACCCTGGCCGGCGCCGGCATCGCTCGCCTTGCCGCCTGGGTCGGCGAAGCACAGGTCAAGGCCGGCCGCCTGGTGCGGGTGTGCCCGCAGTACCGCTTGAc < 8:315568/149‑1 (MQ=255) tgagccca‑‑ggcGGAGCCTGGGCTCAGGAGGCGCGGTGTACCACAGCACCCTGGCCGGCGCCGGCATCGCTCGCCTTGCCGCCTGGGTCGGCGAAGCACAGGTCAAGGCCGGCCGCCTGGTGCgg < 7:259360/121‑1 (MQ=255) tgagccca‑‑ggcGGAGCCTGGGCTCAGGAGGCGCGGTGTACCACAGCACCCTGGCCGGCGCCGGCATCGCTCGCCTTGCCGCCTGGGTCGGCGAAGCACAGGTCAAGGCCGGCCGCCTGGTGCgg > 8:259360/4‑124 (MQ=255) aggccca‑‑ggcTCCGCCTGGGCTCAGGAGGCGCGGTGTACCACAGCACCCTGGCCGGCGCCGGCATCGCTCGCCTTGCCGCCTGGGTCGGCGAAGCACAGGTCAAGGCCGGCCGCCTGGTGCGGGTGTGCCCGCAGTACCGCTTGACGTc < 2:95923/149‑1 (MQ=255) ccca‑‑ggcGGAGCCTGGGCTCAGGAGGCGCGGTGTACCACAGCACCCTGGCCGGCGCCGGCATCGCTCGCCTTGCCGCCTGGGTCGGCGAAGCACAGGTCAAGGCCGGCCGCCTGGTGCGGGTGTGCCCGCAGTACCGCTTGACGTCCAg > 8:24999/1‑149 (MQ=255) ca‑‑ggcTCCGCCTGGGCTCAGGAGGCGCGGTGTACCACAGCACCCTGGCCGGCGCCGGCATCGCTCGCCTTGCCGCCTGGGTCGGCGAAGCACAGGTCAAGGCCGGCCGCCTGGTGCGGGTGTGCCCGCAGTACCGCTTGACGTCCAGTa < 8:47619/149‑1 (MQ=255) tCCGCCTGGGCTCAGGAGGCGCGGTGTACCACAGCACCCTGGCCGGCGCCGGCATCGCTCGCCTTGCCGCCTGGGTCGGCGAAGCACAGGTCAAGGCCGGCCGCCTGGTGCGGGTGTGCCCGCAGTACCGCTTGACGTCCAGTAGCGGc > 5:332035/1‑149 (MQ=255) ccGCCTGGGCTCAGGAGGCGCGGTGTACCACAGCACCCTGGCCGGCGCCGGCATCGCTCGCCTTGCCGCCTGGGTCGGCGAAGCACAGGTCAAGGCCGGCCGCCTGGTGCGGGTGTGCCCGCAGTACCGCTTGACGTCCAGTAGCGGc > 8:86944/1‑148 (MQ=255) | GCATATCTGGCCCTGGCTGGCACACCGCAACATCCGGAAGACCTGGATGGACACACCTTGATCCTGCATACCGCGCCACGCATCCTCAAGGCCTGGCACTTTTGCCACAATGACCAGATCACCAGCCTTCGCCCCAGGCCCA‑‑GGCTCCGCCTGGGCTCAGGAGGCGCGGTGTACCACAGCACCCTGGCCGGCGCCGGCATCGCTCGCCTTGCCGCCTGGGTCGGCGAAGCACAGGTCAAGGCCGGCCGCCTGGTGCGGGTGTGCCCGCAGTACCGCTTGACGTCCAGTAGCGGC > NC_002947/4439640‑4439933 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |