Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 4,778,459 | T→G | 9.5% | I270L (ATC→CTC) | pvdD ← | non‑ribosomal peptide synthetase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 4,778,459 | 0 | T | G | 9.5% | 214.0 / 12.4 | 74 | I270L (ATC→CTC) | pvdD | non‑ribosomal peptide synthetase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (38/28); new base G (5/2); total (44/30) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.92e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.47e-01 |
GTTGGCGATCGGTACGCCCACGCGCACCTGGGGCTGGCCGCTGTAGCGGTGCAGCAAGGTCTGGAACGATGCCAGCAACAGCATGAACAAGGTTACACCCTGGGCATTGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGATTGGTCGGCAGGCTGAGCACCGGTTGCTCCCCGCCGAGGGTGTCCTTCCAGTAAGCCAGCTGCCGCGCCTGCTCACCCGCTTCCATCCAGTTG > NC_002947/4778313‑4778604 | gTTGGCGATCGGTACGCCCACGCGCACCTGGGGCTGGCCGCTGTAGCGGTGCAGCAAGGTCTGGAACGATGCCAGCAACAGCATGAACAAGGTTACACCCTGGGCATTGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGAtct > 4:66860/1‑149 (MQ=255) gCGATCGGTACGCCCACGCGCACCTGGGGCTGGCCGCTGTAGCGGTGCAGCAAGGTCTGGAACGATGCCAGCAACAGCATGAACAAGGTTACACCCTGGGCATTGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGAt > 5:62374/1‑149 (MQ=255) gATCGGTACGCCCACGCGCACCTGGGGCTGGCCGCTGTAGCGGTGCAGCAAGGTCTGGAACGATGCCAGCAACAGCATGAACAAGGTTACACCCTGGGCATTGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGc > 4:263797/1‑149 (MQ=255) aTCGGTACGCCCACGCGCACCTGGGGCTGGCCGCTGTAGCGGTGCAGCAAGGTCTGGAACGATGCCAGCAACAGCATGAACAAGGTTACACCCTGGGCATTGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGAtct > 2:334481/1‑142 (MQ=255) aTCGGTACGCCCACGCGCACCTGGGGCTGGCCGCTGTAGCGGTGCAGCAAGGTCTGGAACGATGCCAGCAACAGCATGAACAAGGTTACACCCTGGGCATTGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGAtct < 1:334481/142‑1 (MQ=255) gTACGCCCACGCGCACCTGGGGCTGGCCGCTGTAGCCGTGCAGCAAGGACACGAACGATGCCAGCAACACCATCAACAACCTTACACCCTCGACAATCGCCAACCCCTTCAGCGACAGAAGAAACAAGGCAACCAACAAAATGCCCAcc > 6:280980/1‑149 (MQ=255) tACGCCCACGCGCACCTGGGGCTGGCCGCTGTAGCGGTGCAGCAAGGTCTGGAACGATGCCAGCAACAGCATGAACAAGGTTACACCCTGGGCATTGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCAccc > 5:28551/1‑149 (MQ=255) gCCCACGCGCACCTGGGGCTGGCCGCTGTAGCGGTGCAGCAAGGTCTGGAACGATGCCAGCAACAGCATGAACAAGGTTACACCCTGGGCATTGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCcgcg > 6:332829/1‑149 (MQ=255) gCCCACGCGCACCTGGGGCTGGCCGCTGTAGCGGTGCAGCAAGGTCTGGAACGATGCCAGCAACAGCATGAACAAGGTTACACCCTGGGCATTGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGAGATCGATGccgtgtt < 4:39068/146‑6 (MQ=255) gCCCACGCGCACCTGGGGCTGGCCGCTGTAGCGGTGCAGCAAGGTCTGGAACGATGCCAGCAACAGCATGAACAAGGTTACACCCTGGGCATTGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGAGATCGATGccgtgtt > 3:39068/1‑141 (MQ=255) cccACGCGCACCTGGGGCTGGCCGCTGTAGCGGTGCAGCAAGGTCTGGAACGATGCCAGCAACAGCATGAACAAGGTTACACCCTGGGCATTGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCcgcgc < 5:332829/149‑1 (MQ=255) ccACGCGCACCTGGGGCTGGCCGCTGTAGCGGTGCAGCAAGGTCTGGAACGATGCCAGCAACAGCATGAACAAGGTTACACCCTGGGCATTGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCcgcgcg > 3:143801/1‑149 (MQ=255) ccACGCGCACCTGGGGCTGGCCGCTGTAGCGGTGCAGCAAGGTCTGGAACGATGCCAGCAACAGCATGAACAAGGTCACACCCTGGGCATTGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCcgcgcg > 3:167560/1‑149 (MQ=255) cACGCGCACCTGGGGCTGGCCGCTGTAGCGGTGCAGCAAGGTCTGGAACGATGCCAGCAACAGCATGAACAAGGTTACACCCTGGGCATTGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACCCGGCATCGATCTCGATGCCCACCCgcgcgc < 1:205532/149‑1 (MQ=255) cACGCGCACCTGGGGCTGGCCGCTGTAGCGGTGCAGCAAGGTCTGGAACGATGCCAGCAACAGCATGAACAAGGTTACACCCTGGGCATTGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCgcgcgc < 6:42862/149‑1 (MQ=255) ccTGGGGCTGGCCGCTGTAGCGGTGCAGCAAGGTCTGGAACGATGCCAGCAACAGCATGAACAAGGTTACACCCTGGGCATTGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCg < 6:28551/149‑1 (MQ=255) cTGGCCGCTGTAGCGGTGCAGCAAGGTCTGGAACGATGCCAGCAACAGCATGAACAAGGTTACACCCTGGGCATTGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGgcg > 6:212074/1‑149 (MQ=255) ggCCGCTGTAGCGGTGCAGCAAGGTCTGGAACGATGCCAGCAACAGCATGAACAAGGTTACACCCTGGGCATTGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGcc > 6:56384/1‑149 (MQ=255) cGCTGTAGCGGTGCAGCAAGGTCTGGAACGATGCCAGCAACAGCATGAACAAGGTTACACCCTGGGCATTGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGAtctc > 2:163918/1‑112 (MQ=255) cGCTGTAGCGGTGCAGCAAGGTCTGGAACGATGCCAGCAACAGCATGAACAAGGTTACACCCTGGGCATTGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGAtctc < 1:163918/112‑1 (MQ=255) cGCTGTAGCGGTGCAGCAAGGTCTGGAACGATGCCAGCAACAGCATGAACAAGGTTACACCCTGGGCATTGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCAcc > 7:37412/1‑149 (MQ=255) gcaAGGTCTGGAACGATGCCAGCAACAGCATGAACAAGGTTACACCCTGGGCATTGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGcaaccg > 7:225587/1‑144 (MQ=255) gcaAGGTCTGGAACGATGCCAGCAACAGCATGAACAAGGTTACACCCTGGGCATTGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGAt < 2:173223/147‑1 (MQ=255) gcaAGGTCTGGAACGATGCCAGCAACAGCATGAACAAGGTTACACCCTGGGCATTGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGAt > 1:173223/1‑147 (MQ=255) gcaAGGTCTGGAACGATGCCAGCAACAGCATGAACAAGGTCACACCCTGGGCATTGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGATTg < 4:167560/149‑1 (MQ=255) caAGGTCTGGAACGATGCCAGCAACAGCATGAACAAGGTTACACCCTGGGCATTGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGATTgg > 1:33838/1‑149 (MQ=255) aaGGTCTGGAACGATGCCAGCAACAGCATGAACAAGGTTACACCCTGGGCATTGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGATTGGt > 4:297908/1‑149 (MQ=255) aGGTCTGGAACGATGCCAGCAACAGCATGAACAAGGTTACACCCTGGGCATTGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGATTGGTc < 5:56384/149‑1 (MQ=255) gTCTGGAACGATGCCAGCAACAGCATGAACAAGGTTACACCCTGGGCATTGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGATTGGTCgg < 6:66950/149‑1 (MQ=255) tCTGGAACGATGCCAGCAACAGCATGAACAAGGTTACACCCTGGGCATTGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGATTGGTCGGc < 5:280980/149‑1 (MQ=255) cTGGAACGATGCCAGCAACAGCATGAACAAGGTTACACCCTGGGCATTGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGATTGGTCgg > 8:137435/1‑147 (MQ=255) gAACGATGCCAGCAACAGCATGAACAAGGTTACACCCTGGGCATTGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGATTGGTCGGCAGGc < 6:62374/149‑1 (MQ=255) gAACGATGCCAGCAACAGCATGAACAAGGTTACACCCTGGGCATTGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGATAGGTCGGCAGGc > 1:173555/1‑149 (MQ=255) gATGCCAGCAACAGCATGAACAAGGTTACACCCTGGGCATTGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGATTGGTCGGCAGGCTGAg > 2:15536/1‑149 (MQ=255) aTGCCAGCAACAGCATGAACAAGGTTACACCCTGGGCATTGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCAccggccgg < 3:298100/125‑1 (MQ=255) aTGCCAGCAACAGCATGAACAAGGTTACACCCTGGGCATTGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCAccggccgg > 4:298100/1‑125 (MQ=255) ccAGCAACAGCATGAACAAGGTTACACCCTGGGCATTGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGATTGGTCGGCAGGCTGAGCAc < 3:66860/148‑1 (MQ=255) cAACAGCATGAACAAGGTTACACCCTGGGCATTGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGATTGGTCGGCAGGCTGAGCACCGGtt > 1:141450/1‑149 (MQ=255) gCATGAACAAGGTTACACCCTGGGCATTGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCAccggcc > 6:337615/1‑111 (MQ=255) gCATGAACAAGGTTACACCCTGGGCATTGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCAccggcc < 5:337615/111‑1 (MQ=255) aTGAACAAGGTTACACCCTGGGCATTGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGATTGGTCgg > 1:143487/1‑125 (MQ=255) aTGAACAAGGTTACACCCTGGGCATTGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGATTGGTCgg < 2:143487/125‑1 (MQ=255) tGAACAAGGTTACACCCTGGGCATTGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGATTGGTCGGCAGGCTGAGCACCGGTTGCTCCccg < 4:143801/149‑1 (MQ=255) tGAACAAGGTTACACCCTGGGCATTGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGATTGGTCGGCAGGCTGAGCACCGGTTGCTCCccg > 1:299180/1‑149 (MQ=255) aGGGTACACCCTGGGCATTGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGATTGGTCGGCAGGCTGAGCACCGGTTGCTCCCCGCCGAgg < 7:137435/149‑1 (MQ=255) ggTTACACCCTGGGCATTGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGATTGGTCGGCAGGCTGAGCACCGGTTGCTCCCCGCCGAggg > 5:342521/1‑149 (MQ=255) acCCTGGGCATTGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGATTGGTCGGCAGGCTGAGCACCGGTTGCTCCCCGCCGAGGGTGTCCt > 2:257354/1‑149 (MQ=255) ccTGGGCATTGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGATTGGTCGGCAGGCTGAGCACCGGTTGCTCCCCGCCGAGGGTGTCCTTc > 3:27098/1‑149 (MQ=255) cTGGGCATTGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGATTGGTCGGCAGGCTGAGCACCGGTTGCTCCCCGCCGAGGGTGTCCTTcc < 1:257354/149‑1 (MQ=255) tGGGCATTGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGATTGGTCGGCAGGCTGAGCACCGGTTGCt > 4:258207/1‑127 (MQ=255) tGGGCATTGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGATTGGTCGGCAGGCTGAGCACCGGTTGCt < 3:258207/127‑1 (MQ=255) gggCATTGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGATTGGTCGGCAGGCTGAGCACCGGTTGCTCCCCGCCGAGGGTGTCCTTc < 5:141372/146‑1 (MQ=255) gggCATTGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGATTGGTCGGCAGGCTGAGCACCGGTTGCTCCCCGCCGAGGGTGTCCTTc > 6:141372/1‑146 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ccAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGATTGGTCGGCAGGCTGAGCACCGGTTGCTCCCCGCCGAGGGTGTCCTTCCAGTAAGCCAGc > 2:260626/1‑149 (MQ=255) ccAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGATTGGTCGGCAGGCTGAGCACCGGTTGCTCCCCGCCGAGGGTGTCCTTCCAGTAAGCCAGc < 6:342521/149‑1 (MQ=255) cAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGATTGGTCGGCAGGCTGAGCACCGGTTGCTCCCCGCCGAGGGTGTCCTTCCAGTAAGCCAGCt > 6:226071/1‑149 (MQ=255) aaCGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGATTGGTCGGCAGGCTGAGCACCGGTTGCTCCCCGCCGAGGGTGTCCTTCCAGTACGCCAGCTg > 8:63259/1‑149 (MQ=255) gCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGATTGGTCGGCAGGCTGAGCACCGGTTGCTCCCCGCCGAGGGTGTCCTTTCAGTAAGCCAGCTGCcg > 7:1797/1‑149 (MQ=255) cTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGATTGGTCGGCAGGCTGAGCACCGGTTGCTCCCCGCCGAGGGTGTCCTTCCAGTAAGCCAGCTGCcgcg > 7:271906/1‑149 (MQ=255) gACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGATTGGTCGGCAGGCTGAGCACCGGTTGCTCCCCGCCGAGGGTGTCCTTCCAGTAAGCCAGCTGCCGCGCCTGCTc < 5:212074/149‑1 (MQ=255) gcaACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGATTGGTCGGCAGGCTGAGCACCGGTTGCTCCCCGCCGAGGGTGTCCTTCCAGTAAGCCAGCTGCCGCGCCTGCTCACCCGCt > 8:236944/1‑149 (MQ=255) gcaACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGATTGGTCGGCAGGCTGAGCACCGGTTGCTCCCCGCCGAGGGTGTCCTTCCAGTAAGCCAGCTGCCGCGCCTGCTCACCCGCt < 2:299180/149‑1 (MQ=255) caACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGATTGGTCGGCAGGCTGAGCACCGGTTGCTCCCCGCCGAGGGTGTCCTTCCAGTAAGCCAGCTGCCGCGCCTGCTCACCCGCtt > 7:74614/1‑149 (MQ=255) caACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGATTGGTCGGCAGGCTGAGCACCGGTTGCTCCCCGCCGAGGGTGTCCTTCCAGTAAGCCAGCTGCCGCGCCTGCTCACCCGCtt > 8:159970/1‑149 (MQ=255) gtgggCATCGAGATCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGATTGGTCGGCAGGCTGAGCACCGGTTGCTCCCCGCCGAGGGTGTCCTTCCAGTAAGCCAGCTGCCGCGCCTGCTCACCCGCt < 6:96450/142‑1 (MQ=255) gtgggCATCGAGATCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGATTGGTCGGCAGGCTGAGCACCGGTTGCTCCCCGCCGAGGGTGTCCTTCCAGTAAGCCAGCTGCCGCGCCTGCTCACCCGCt > 5:96450/4‑145 (MQ=255) gtgggCATCGAGATCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGATTGGTCGGCAGGCTGAGCACCGGTTGCTCCCCGCCGAGGGTGTCCTTCCAGTAAGCCAGCTGCCGCGCCTGCTCACCCGCTtcc > 4:262060/4‑148 (MQ=255) cacGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGATTGGTCGGCAGGCTGAGCACCGGTTGCTCCCCGCCGAGGGTGTCCTTCCAGTAAGCCAGCTGCCGCGCCTGCTCACCCGCTtcca > 7:158307/1‑149 (MQ=255) tgggCATCGAGATCGATGCCGACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGATTGGTCGGCAGGCTGAGCACCGGTTGCTCCCCGCCGAGGGTGTCCTTCCAGTAAGCCAGCTGCCGCGCCTGCTCACCCGCTtccat > 8:237136/3‑149 (MQ=255) tgggCATCGAGATCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGATTGGTCGGCAGGCTGAGCACCGGTTGCTCCCCGCCGAGGGTGTCCTTCCAGTAAGCCAGCTGCCGCGCCTGCTCACCCGCTtccat > 3:298713/3‑149 (MQ=255) acGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGATTGGTCGGCAGGCTGAGCACCGGTTGCT‑CCCGCCGAGGGTGTCCTTCCAGTAAGCCAGCTGCCGCGCCTGCTCACCCGCTtccatc > 4:299359/1‑149 (MQ=255) cGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGATTGGTCGGCAGGCTGAGCACCGGTTGCTCCCCGCCGAGGGTGTCCTTCCAGTAAGCCAGCTGCCGCGCCTGCTCACCCTCTtccatc < 8:37412/149‑1 (MQ=255) cATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGATTGGTCGGCAGGCTGAGCACCGGTTGCTCCCCGCCGAGGGTGTCCTTCCAGTAAGCCAGCTGCCGCGCCTGCTCACCCGCTTCCATCCAg < 7:159970/149‑1 (MQ=255) cGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGATTGGTCGGCAGGCTGAGCACCGGTTGCTCCCCGCCGAGGGTGTCCTTCCAGTAAGCCAGCTGCCGCGCCTGCTCACCCGCTTCCATCCAGTTg > 2:73462/1‑149 (MQ=255) | GTTGGCGATCGGTACGCCCACGCGCACCTGGGGCTGGCCGCTGTAGCGGTGCAGCAAGGTCTGGAACGATGCCAGCAACAGCATGAACAAGGTTACACCCTGGGCATTGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGATTGGTCGGCAGGCTGAGCACCGGTTGCTCCCCGCCGAGGGTGTCCTTCCAGTAAGCCAGCTGCCGCGCCTGCTCACCCGCTTCCATCCAGTTG > NC_002947/4778313‑4778604 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |