| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,039,652 | G→T | 7.8% | I284I (ATC→ATA) | PP_4446 ← | group II intron‑encoding maturase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,039,652 | 0 | G | T | 7.8% | 229.6 / 4.6 | 73 | I284I (ATC→ATA) | PP_4446 | group II intron‑encoding maturase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (34/33); new base T (2/4); total (36/37) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.74e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.48e-01 | |||||||||||
GCTGGCTACGACGTTTGAGGGCTTGCCGCCATAAACGGCAGACCGCCGAACGAAAACCACCCAGACGTGTCAGGTTTCCCGGCACCGCGTGGTAATTGAAGTAACCGCTCACCACCCG‑TGTGAGCCATTGCCCTTGAACCCAGATGGGTTCATGACGTCGGTGTTTCAGCTCATCCCGCATGGCCAGCAGCATCGCACGCATTCGCTTCTTGACCGTCAGTCGCAGTATTTGAAACCCACCGCTTCTGTTGGTACTACAACAGTGCGTGAAGCCCAGGAAGTCAAACGT > NC_002947/5039510‑5039798 | gCTGGCTACGACGTTTGAGGGCTTGCCGCCATAAACGGCAGACCGCCGAACGAAAACCACCCAGACGTGTCAGGTTTCCCGGCACCGCGTGGTAATTGAAGTAACCGCTCACCACCCG‑TGTGAGCCATTGCCCTTGAACCCAGATGGGt < 8:33191/149‑1 (MQ=255) gCTACGACGTTTGAGGGCTTGCCGCCATAAACGGCAGACCGCCGAACGAAAACCACCCAGACGTGTCAGGTTTCCCGGCACCGCGTGGTAATTGAAGTAACCGCTCACCACCCG‑TGTGAGCCATTGCCCTTGAACCCAGATGGGTTCa < 5:176855/148‑1 (MQ=255) gCTACGACGTTTGAGGGCTTGCCGCCATAAACGGCAGACCGCCGAACGAAAACCACCCAGACGTGTCAGGTTTCCCGGCACCGCGTGGTAATTGAAGTAACCGCTCACCACCCG‑TGTGAGCCATTGCCCTTGAACCCAGATGGGTTCAt < 1:231428/149‑1 (MQ=255) cTACGACGTTTGAGGGCTTGCCGCCATAAACGGCAGACCGCCGAACGAAAACCACCCAGACGTGTCAGGTTTCCCGGCACCGCGTGGTAATTGAAGTAACCGCTCACCACCCG‑TGTGAGCCATTGCCCTTGAACCCATCTGGGTTCaag < 7:304173/149‑3 (MQ=255) cgacgTTTGAGGGCTTGCCGCCATAAACGGCAGACCGCCGAACGAAAACCACCCAGACGTGTCAGGTTTCCCGGCACCGCGTGGTAATTGAAGTAACCGCTCACCACCCG‑TGTGAGCGATTGCCCTTGAACCCAGATGGGTTCATGACg > 5:284807/1‑149 (MQ=255) gacgTTTGAGGGCTTGCCGCCATAAACGGCAGACCGCCGAACGAAAACCACCCAGACGTGTCAGGTTTCCCGCAACCGCGTGCTAATTGAAGTAACCGCTCACCACCCG‑TGTCAGCAATAGCCCTTCAACCAATATGCGTTCATGACGt > 4:213454/1‑149 (MQ=255) acgTTTGAGGGCTTGCCGCCATAAACGGCAGACCGCCGAACGAAAACCACCCAGACGTGTCAGGTTTCCCGGCACCGCGTGGTAATTGAAGTAACCGCTCACCACCCG‑TGTGAGCCATTGCCCTTGAACCCATCTGGGTTCaagggcaa < 6:65838/149‑8 (MQ=255) tGAGGGCTTGCCGCCATAAACGGCAGACCGCCGAACGAAAACCACCCAGACGTGTCAGGTTTCCCGGCACCGCGTGGTAATTGAAGTAACCGCTCACCACCCG‑TGTGAGCCATTGCCCTTGAACCCAGATGGGTTCATGACGTCGgtgt > 5:199454/1‑149 (MQ=255) gtcTTGGCGCCATAAACGGCAGACCGCCGTAGGAAATCCACCCAGTCGTGTCAGGTTTCCCTGCACCGCGTGGTAATTGAAGTAACCGCTCACCACCCG‑TGTGATCAATTGCCCTTGAACCCAGATGGGTTCATGACGTCGCTGtttg < 3:213454/146‑2 (MQ=255) ggCTTGCCGCCATAAACGGCAGACCGCCGAACGAAAACCACCCAGACGTGTCAGGTTTCCCGGCACCGCGTGGTAATTGAAGTAACCGCTCACCACCCG‑TGTGAGCCATTGCCCTTGAACCCAGATGGGTTCATGACGTCGGTGttt > 2:98701/1‑147 (MQ=255) ggCTTGCCGCCATAAACGGCAGACCGCCGAACGAAAACCACCCAGACGTGTCAGGTTTCCCGGCACCGCGTGGTAATTGAAGTAACCGCTCACCACCCG‑TGTGAGCCATTGCCCTTGAACCCAGATGGGTTCATGACGTCGGTGttt > 7:68314/1‑147 (MQ=255) gCTTGCCGCCATAAACGGCAGACCGCCGAACGAAAACCACCCAGACGTGTCAGGTTTCCCGGCACCGCGTGGTAATTGAAGTAACCGCTCACCACCCG‑TGTGAGCAATTGCCCTTGAACCCAGATGGGTTCATGACGTCGGTGTTTCAg < 6:284807/149‑1 (MQ=255) cTTGCCGCCATAAACGGCAGACCGCCGAACGAAAACCACCCAGACGTGTCAGGTTTCCCGGCACCGCGTGGTAATTGAAGTAACCGCTCACCACCCG‑TGTGAGCCATTGCCCTTGAACCCAGATGGGTTCATGACGTCGGTGTTTCAGc < 4:235628/149‑1 (MQ=255) cTTGCCGCCATAAACGGCAGACCGCCGAACGAAAACCACCCAGACGTGTCAGGTTTCCCGGCACCGCGTGGTAATTGAAGTAACCGCTCACCACCCG‑TGTGAGCCATTGCCCTTGAACCCAGATGGGTTCATGACGTCGGTGTTTCAGc < 7:32662/149‑1 (MQ=255) ttGCCGCCATAAACGGCAGACCGCCGAACGAAAACCACCCAGACGTGTCAGGTTTCCCGGCACCGCGTGGTAATTGAAGTAACCGCTCACCACCCG‑TGTGAGCCATTGCCCTTGAACCCAGATGGGTTCATGACGTCGgtg > 6:186513/1‑141 (MQ=255) ttGCCGCCATAAACGGCAGACCGCCGAACGAAAACCACCCAGACGTGTCAGGTTTCCCGGCACCGCGTGGTAATTGAAGTAACCGCTCACCACCCG‑TGTGAGCCATTGCCCTTGAACCCAGATGGGTTCATGACGTCGgtg < 5:186513/141‑1 (MQ=255) gccgccATAAACGGCAGACCGCCGAACGAAAACCACCCAGACGTGTCAGGTTTCCCGGCACCGCGTGGTAATTGAAGTAACCGCTCACCACCCG‑TGTGAGCCATTGCCCTTGAACCCAGATGGGTTCATGACGTCGGTGTTTCAGCTCa > 8:2075/1‑149 (MQ=255) ccgccATAAACGGCAGACCGCCGAACGAAAACCACCCAGACGTGTCAGGTTTCCCGGCACCGCGTGGTAATTGAAGTAACCGCTCACCACCCG‑TGTGAGCCATTGCCCTTGAACCCAGATGGGTTCATGACGTCGGTGTTTCAGCTCAt < 8:49337/149‑1 (MQ=255) gccATAAACGGCAGACCGCCGAACGAAAACCACCCAGACGTGTCAGGTTTCCCGGCACCGCGTGGTAATTGAAGTAACCGCTCATCACCCG‑TGTGAGCCATTGCCCTTGAACCCAGATGGGTTCATGACGTCGGTGTTTCAGCTCATcc < 1:104118/149‑1 (MQ=255) aTAAACGGCAGACCGCCGAACGAAAACCACCCAGACGTGTCAGGTTTCCCGGCACCGCGTGGTAATTGAAGTAACCGCTCACCACCCG‑TGTGAGCCATTGCCCTTGAACCCAGATGGGTTCATGACGTCGGTGTTTCAGCTCATCCCg > 4:69127/1‑148 (MQ=255) aaaCGGCAGACCGCCGAACGAAAACCACCCAGACGTGTCAGGTTTCCCGGCACCGCGTGGTAATTGAAGTAACCGCTCACCACCCG‑TGTGAGCCATTGCCCTTGAACCCAGATGGGTTCATGACGTCGgt > 1:312055/1‑130 (MQ=255) aaaCGGCAGACCGCCGAACGAAAACCACCCAGACGTGTCAGGTTTCCCGGCACCGCGTGGTAATTGAAGTAACCGCTCACCACCCG‑TGTGAGCCATTGCCCTTGAACCCAGATGGGTTCATGACGTCGgt < 2:312055/130‑1 (MQ=255) ggCAGACCGCCGAACGAAAACCACCCAGACGTGTCAGGTTTCCCGGCACCGCGTGGTAATTGAAGTAACCGCTCACCACCCG‑TGTGAGCCATTGCCCTTGAACCCAGATGGGTTCATGACGTCGGTGTTTCAGCTCATCCCGCATGGcc < 8:250467/149‑1 (MQ=255) ggCAGACCGCCGAACGAAAACCACCCAGACGTGTCAGGTTTCCCGGCACCGCGTGGTAATTGAAGTAACCGCTCACCACCCG‑TGTGAGCCATTGCCCTTGAACCCAGATGGGTTCATGACGTCGGTGTTTCAGCTCATCCCGCATGGc > 7:250467/1‑148 (MQ=255) aGACCGCCGAACGAAAACCACCCAGACGTGGCAGGTTTCCCGGCACCGCGTGGTAATTGAAGTAACCGCTCACCACCCG‑TGTGAGCCATTGCCCTTGAACCCATCTGGGTTCaa < 3:31792/114‑2 (MQ=255) aGACCGCCGAACGAAAACCACCCAGACGTGGCAGGTTTCCCGGCACCGCGTGGTAATTGAAGTAACCGCTCACCACCCG‑TGTGAGCCATTGCCCTTGAACACATCTGGGTTCaa > 4:31792/1‑113 (MQ=255) ccgAACGACAACCACCCCGACGTGTCCGGGTTCCCGGCACCGCGGGGTAATTGAAGTAACCGCTCACCACCCG‑TGTGAGCCATTGCCCATGAACCCATCTGGGTTCa < 8:262367/107‑1 (MQ=255) ccgAACGAAAACCACCCAGACGTGTCAGGTTTCCCGGCACCGCGTGGTAATTGAAGTAACCGCTCACCACCCG‑TGTGAGCCATTGCCCTTGAACCCAGATGGGTTCATGACGTCGGTGTTTCAGCTCATCCCGCATGGCCAGCAGCATc < 6:199454/149‑1 (MQ=255) gaacgaaAACCACCCAGACGTGTCAGGTTTCCCGGCACCGCGTGGTAATTGAAGTAACCGCTCACCACCCG‑TGTGAGCCATTGCCCTTGAACCCAGATGGGTTCATGACGTCGGTGTTTCAGCTCATCCCGCATGGCCAGCAGCATcgc < 8:68314/149‑1 (MQ=255) acgaaAACCACCCAGACGTGTCAGGTTTCCCGGCACCGCGTGGTAATTGAAGTAACCGCTCACCACCCG‑TGTGAGCCATTGCCCTTGAACCCAGATGGGTTCATGACGTCGGTGTTTCAGCTCATCCCGCATGGCCAGCAGCATcgcac > 3:72608/1‑149 (MQ=255) ccaccCAGACGTGTCAGGTTTCCCGGCACCGCGTGGTAATTGAAGTAACCGCTCACCACCCG‑TGTGAGCCATTGCCCTTGAACCCAGATGGGTTCATGACGTCGGTGTTTCAGCTCATCCCGCATGGACAGCAGCATCGCACGCATTCg > 1:126651/1‑149 (MQ=255) ccAGACGTGTCAGGTTTCCCGGCACCGCGTGGTAATTGAAGTAACCGCTCACCCCCCG‑GGTGAGCCCTTGCCCTTGAACCCAGATGGGTTCATGACGTCGGTGTTTCAGCTCATCCCGCATGGCCAGCAGCAACGCACGCAGTCGctt > 2:249029/1‑148 (MQ=255) ccAGACGTGTCAGGTTTCCCGGCACCGCGTGGTAATTGAAGTAACCGCTCACCACCCG‑TGTGAGCCATTGCCCTTGAACCCAGATGGGTTCATGACGTCGGTGTTTCAGCTCATCCCGCATGGCCAGCAGCATCGCACGCATTCGcttc > 2:102826/1‑149 (MQ=255) aGACGTGTCAGGTTTCCCGGCACCGCGTGGTAATTGAAGTAACCGCTCACCACCCG‑TGTGAGCCATTGCCCTTGAACCCAGATGGGTTCATGACGTCGGTGTTTCAGCTCATCCCGCATGGCCAGCAGCATCGCACGCATTCGcttctt > 3:93324/1‑149 (MQ=255) gtgtCAGGTTTCCCGGCACCGCGTGGTAATTGAAGTAACCGCTCACCACCCG‑TGTGAGCCATTGCCCTTGAACCCAGATGGGTTCATGACGTCGGTGTTTCAGCTCATCCCGCATGGCCAGCAGCATCGCACGCATTCGCTTCTTGAcc < 5:226581/149‑1 (MQ=255) gtgtCAGGTTTCCCGGCACCGCGTGGTAATTGAAGTAACCGCTCACCACCCG‑TGTGAGCCATTGCCCTTGAACCCAGATGGGTTCATGACGTCGGTGTTTCAGCTCATCCCGCATGGCCAGCAGCATCGCACGCATTCGCTTCTTGAcc > 2:161725/1‑149 (MQ=255) gtCAGGTTTCCCGGCACCGCGTGGTAATTGAAGTAACCGCTCACCACCCGATGTGAGCCATTGCCCTTGAACCCAGATGGGTTCATGACGTCGGTGTTTCAGCTCATCCCGCATGGCCAGCAGCATCGCACGCATTCGCTTCTTGACCg > 1:85536/1‑149 (MQ=255) gtCAGGTTTCCCGGCACCGCGTGGTAATTGAAGTAACCGCTCACCACCCG‑TGTGAGCCATTGCCCTTGAACCCAGATGGGTTCATGACGTCGGTGTTTCAGCTCATCCCGCATGGCCAGCAGCATCGCACGCATTCGCTTCTTGACCGt > 5:35143/1‑149 (MQ=255) aGGTTTCCCGGCACCGCGTGGTAATTGAAGTAACCGCTCACCACCCG‑TGTGAGCCATTGCCCTTGAACCCAGATGGGTTCATGACGTCGGTGTTTCAGCTCATCCCGCATGGCCAGCAGCATCGCACGCATTCGCTTCTTGAGCGTCAg > 4:17705/1‑149 (MQ=255) ggTTTCCCGGCACCGCGTGGTAATTGAAGTAACCGCTCACCACCCG‑TGTGAGCCATTGCCCTTGAACCCAGATGGGTTCATGACGTCGGTGTTTCAGCTCATCCCGCATGGCCAGCAGCATc < 1:39358/122‑1 (MQ=255) ggTTTCCCGGCACCGCGTGGTAATTGAAGTAACCGCTCACCACCCG‑TGTGAGCCATTGCCCTTGAACCCAGATGGGTTCATGACGTCGGTGTTTCAGCTCATCCCGCATGGCCAGCAGCATc > 2:39358/1‑122 (MQ=255) gTTTCCCGGCACCGCGTGGTAATTGAAGTAACCGCTCACCACCCG‑TGTGAGCCATTGCCCTTGAACCCAGATGGGTTCATGACGTCGGTGTTTCAGCTCATCCCGCATGGCCAGCAGCATCGCACGCATTCGCTTCTTGACCgggccca > 5:47324/1‑143 (MQ=255) gTTTCCCGGCACCGCGTGGTAATTGAAGTAACCGCTCACCACCCG‑TGTGAGCCATTGCCCTTGAACCCAGATGGGTTCATGACGTCGGTGTTTCAGCTCATCCCGCATGGCCAGCAGCATCGCACGCATTCGCTTCTTGACCGTCAGTc > 7:314679/1‑149 (MQ=255) tttCCCGGCACCGCGTGGTAATTGAAGTAACCGCTCACCACCCG‑TGTGAGCCATTGCCCTTGAACCCAGATGGGTTCATGACGTCGGTGTTTCAGCTCATCCCGCATGGCCAGCAGCATCGCACGCATTCGCTTCTTGACCGTCAGTCg > 4:62169/1‑149 (MQ=255) cccGGCACCGCGTGGTAATTGAAGTAACCGCTCACCACCCG‑TGTGAGCCATTGCCCTTGAACCCAGATGGGTTCATGACGTCGGTGTTTCAGCTCATCCCGCATGGCCAGCAGCATCGCACGCATTCGCTTCTTGACCGTCAGTCGCa < 7:2075/148‑1 (MQ=255) ccGGCACCGCGTGGTAATTGAAGTAACCGCTCACCACCCG‑TGTGAGCCATTGCCCTTGAACCCAGATGGGTTCATGACGTCGGTGTTTCAGCTCATCCCGCATGGCCAGCAGCATCGCACGCATTCGCTTCTTGACCGTCAGTCGCAGt < 8:314679/149‑1 (MQ=255) cGGCACCGCGTGGGAATTGAAGTAACCGCTCACCACCCG‑TGTGAGCCATTGCCCTTGAACCCAGATGGGTTCATGACGTCGGTGTTTCAGCTCATCCCGCATGGCCAGCAGCATCGCACGCATTCGCTTCTTGACCGTCAGTCGCAGTa > 3:13553/1‑149 (MQ=255) cACCGCGTGGTAATTGAAGTAACCGCTCACCACCCG‑TGTGAGCCATTGCCCTTGAACCCAGATGGGTTCATGACGTCGGTGTTTCAGCTCATCCCGCATGGCCAGCAGCATCGCACGCATTCGCTTCTTGACCGTCAGTCGCAGTAttt < 3:69127/149‑1 (MQ=255) ccGCGTGGTAATTGAAGTAACCGCTCACCACCCG‑TGTGAGCCATTGCCCTTGAACCCAGATGGGTTCATGACGTCGGTGTTTCAGCTCATCCCGCATGGCCAGCAGCATCGCACGCATTCGCTTCTTGACCGTCAGTCGCAGTATTTGa < 4:72608/149‑1 (MQ=255) aTTGAAGTAACCGCTCACCACCCG‑TGTGAGCCATTGCCCTTGAACCCAGATGGGTTCATGACGTCGGTGTTTCAGCTCATCCCGCATGG‑CACCAGCATCGCACGCATTCGCTTCTTGACCGTCAGTCGCAGTATTTGAAACCCACCGCt > 7:166621/1‑149 (MQ=255) aaGTAACCGCTCACCACCCG‑TGTGAGCCATTGCCCTTGAACCCAGATGGGTTCATGACGTCGGTGTTTCAGc > 6:321610/1‑72 (MQ=255) aaGTAACCGCTCACCACCCG‑TGTGAGCCATTGCCCTTGAACCCAGATGGGTTCATGACGTCGGTGTTTCAGc < 5:321610/72‑1 (MQ=255) gTAACCGCTCACCACCCG‑TGTGAGCCATTGCCCTTGAACCCAGATGGGTTCATGACGTCGGTGTTTCAGCTCATCCCGCATGGCTAGCAGCATCGCACGCATTCGCTTCTTGACCGTCAGTCGCAGTATTTGAAACCCACCGCTTCTGt < 1:102826/149‑1 (MQ=255) cGCTCACCACCCG‑TGTGAGCCATTGCCCTTGAACCCAGATGGGTTCATGACGTCGGTGTTTCAGCTCATCCCGCATGGCCAGCAGCATCGCACGCATTCGCTTCTTGACCGTCAGTCGCAGTATTTGAAACCCACCGCTTCTGTTGGta > 7:260090/1‑149 (MQ=255) gCTCACCACCCG‑TGTGAGCCATTGCCCTTGAACCCAGATGGGTTCATGACGTCGGTGTTTCAGCTCATCCCGCATGGCCAGCAGCATCGCACGCATTCGCTTCTTGACCGTCAGTCGCAGTATTTGAAACCCACCGCTTCTGTTGGtac < 4:93324/149‑1 (MQ=255) caccCG‑TGTGAGCCATTGCCCTTGAACCCAGATGGGTTCATGACGTCGGTGTTTCAGCTCATCCCGCATGGCCAGCAGCATCGCACGCATTCGCTTCTTGACCGTCAGTCGCAGTATTTGAAACCCACCGCTTCTGTTGGTACTacaac < 2:85536/149‑1 (MQ=255) caccCG‑TGTGAGCCATTGCCCTTGAACCCAGATGGGTTCATGACGTCGGTGTTTCAGCTCATCCCGCATGGCCAGCAGCATCGCACGCATTCGCTTCTTGACCGTCAGTCGCAGTATTTGAAACCCACCGCTTCTGTTGGTACTacaa > 4:240205/1‑148 (MQ=255) accCG‑TGTGAGCCATTGCCCTTGAACCCAGATGGGTTCATGACGTCGGTGTTTCAGCTCATCCCGCATGGCCAGCAGCATCGCACGCATTCGCTTCTTGACCGTCAGTCGCAGTATTTGAAACCCACCGCTTCTGTTGGTACTacaaca < 3:62169/149‑1 (MQ=255) cccG‑TGTGAGCCATTGCCCTTGAACCCAGATGGGTTCATGACGTCGGTGTTTCAGCTCATCCCGCATGGCCAGCAGCATCGCACGCATTCGCTTCTTGACCGTCAGTCGCAGTATTTGAAACCCACCGCTTCTGTTGGTACTACAACAg > 8:123675/1‑149 (MQ=255) ccG‑TGTGAGCCATTGCCCTTGAACCCAGATGGGTTCATGACGTCGGTGTTTCAGCTCATCCCGCATGGCCAGCAGCATCGCACGCATTCGCTTCTTGACCGTCAGTCGCAGTATTTGAAACCCACCGCTTCTGTTGGTACTACAACAGt > 2:58967/1‑149 (MQ=255) ccG‑TGTGAGCCATTGCCCTTGAACCCAGATGGGTTCATGACGTCGGTGTTTCAGCTCATCCCGCATGGCCAGCAGCATCGCACGCATTCGCTTCTTGACCGTCAGTCGCAGTATTTGAAACCCACCGCTTCTGTTGGTACTACAACAGt < 3:240205/149‑1 (MQ=255) g‑tgtGAGCCATTGCCCTTGAACCCAGATGGGTTCATGACGTCGGTGTTTCAGCTCATCCCGCATGGCCAGCAGCATCGCACGCATTCGCTTCTTGACCGTCAGTCGCAGTATTTGAAACCCACCGCTTCTGTTGGTACTACAACAGTGc < 6:221697/149‑1 (MQ=255) tggtgAGCCATTGCCCTTGAACCCAGATGGGTTCATGACGTCGGTGTTTCAGCTCATCCCGCATGGCCAGCAGCATCGCACGCATTCGCTTCTTGACCGTCAGTCGCAGTATTTGAAACCCACCGCTTCTGTTGGTACTACAACAGTGc < 2:150127/147‑1 (MQ=255) aGCCATTGCCCTTGAACCCAGATGGGTTCATGACGTCGGTGTTTCAGCTCATCCCGCATGGCCAGCAGCATAGCACGCATTCGCTTCTTGACCGTCAGTCGCAGTATTTGAAACCCACCGCTTCTCTTCGTACTACAACAGTTCGTGaa > 8:155800/1‑149 (MQ=255) gCCATTGCCCTTGAACCCAGATGGGTTCATGACGTCGGTGTTTCAGCTCATCCCGCATGGCCAGCAGCATCGCACGCATTCGCTTCTTGACCGTCAGTCGCAGTATTTGAAACCCACCGCTTCTGTTGGTACTACAACAGTGCGTGAAg < 6:35143/149‑1 (MQ=255) aTTGCCCTTGAACCCAGATGGGTTCATGACGTCGGTGTTTCAGCTCATCCCGCATGGCCAGCAGCATCGCACGCATTCGCTTCTTGACCGTCAGTCGCAGTATTTGAAACCCACCGCTTCTGTTGGTACTACAACAGTGCGTGAAGcc > 5:84858/1‑148 (MQ=255) cccTTGAACCCAGATGGGTTCATGACGTCGGTGTTTCAGCTCATCCCGCATGGCCAGCAGCATCGCACGCATTCGCTTCTTGACCGTCAGTCGCAGTATTTGAAACCCACCGCTTCTGTTGGTACTACATCAGTGCGTGAAGCCCAgg < 2:126651/148‑1 (MQ=255) cccTTGAACCCAGATGGGTTCATGACGTCGGTGTTTCAGCTCATCCCGCATGGCCAGCAGCATCGCACGCATTCGCTTCTTGACCGTCAGTCGCAGTATTTGAAACCCACCGCTTCTGTTGGTACTACAACAGTGCGTGAAGCCCAgg < 4:13553/148‑1 (MQ=255) ccTTGAACCCAGATGGGTTCATGACGTCGGTGTTTCAGCTCATCCCGCATGGCCAGCAGCATCGCACGCATTCGCTGCTTGACCGTCAGTCGCAGTAGTTGAAACCCACCGCTTCTGTTGGTACTACAACAGTGCGTGAAGCCCAGGa < 8:58277/148‑1 (MQ=255) aCCCAGATGGGTTCATGACGTCGGTGTTTCAGCTCATCCCGCATGGCCAGCAGCATCGCACGCATTCGCTTCTTGACCGTCAGTCGCAGTATTTGAAACCCACCGCTTCTGTTGGTACTACAACAGTGCGTGAAGCCCAGGAAGTCaaa > 1:345534/1‑149 (MQ=255) cccAGATGGGTTCATGACGTCGGTGTTTCAGCTCATCCCGCATGGCCAGCAGCATCGCACGCATTCGCTTCTTGACCGTCAGTCGCAGTATTTGAAACCCACCGCTTCTGt > 8:167855/1‑111 (MQ=255) cccAGATGGGTTCATGACGTCGGTGTTTCAGCTCATCCCGCATGGCCAGCAGCATCGCACGCATTCGCTTCTTGACCGTCAGTCGCAGTATTTGAAACCCACCGCTTCTGt < 7:167855/111‑1 (MQ=255) aGATGGGTTCATGACGTCGGTGTTTCAGCTCATCCCGCATGGCCAGCAGCATCGCACGCATTCGCTTCTTGACCGTCAGTCGCAGTATTTGAAACCCACCGCTTCTGTTGGTACTACAACAGAGCCTGAATCACAGGAAGTCAAACGt > 8:141790/1‑148 (MQ=255) | GCTGGCTACGACGTTTGAGGGCTTGCCGCCATAAACGGCAGACCGCCGAACGAAAACCACCCAGACGTGTCAGGTTTCCCGGCACCGCGTGGTAATTGAAGTAACCGCTCACCACCCG‑TGTGAGCCATTGCCCTTGAACCCAGATGGGTTCATGACGTCGGTGTTTCAGCTCATCCCGCATGGCCAGCAGCATCGCACGCATTCGCTTCTTGACCGTCAGTCGCAGTATTTGAAACCCACCGCTTCTGTTGGTACTACAACAGTGCGTGAAGCCCAGGAAGTCAAACGT > NC_002947/5039510‑5039798 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |