Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 5,090,049 | G→C | 9.3% | G296G (GGC→GGG) ‡ | astA‑II ← | arginine N‑succinyltransferase subunit alpha |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,090,049 | 0 | G | C | 9.3% | 192.2 / 7.4 | 64 | G296G (GGC→GGG) ‡ | astA‑II | arginine N‑succinyltransferase subunit alpha |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (29/29); new base C (3/3); total (32/32) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.77e-01 |
TTGCCAGACCTCAAACCGCGACCAGGCGCACGCTGGCGCCCTCACCCACGCCCAGCGCGTCGGCTGCTGCCACGCTCAGGCTGACCGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCAGGTCCAGCA‑ACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGATCTTCACCGGCACCACCCGGCTCTGGGCGATCGAGCGGATGCCAGAGGTGCGCGCATGCAGGGTCGGGCCGCCGTCGAAGATGTCGATGTAGTGCTCG > NC_002947/5089907‑5090196 | ttGCCAGACCTCAAACCGCGACCAGGCGCACGCTGGCGCCCTCACCCACGCCCAGCGCGTCGGCTGCTGCCACGCTCAGGCTGACCGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCAGGTCCAGCA‑ACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCg < 2:238846/146‑1 (MQ=255) ttGCCAGACCTCAAACCGCGACCAGGCGCACGCTGGCGCCCTCACCCACGCCCAGCGCGTCGGCTGCTGCCACGCTCAGGCTGACCGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCAGGTCCAGCA‑ACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTg > 1:23778/1‑149 (MQ=255) gCCAGACCTCAAACCGCGACCAGGCGCACGCTGGCGCCCTCACCCACGCCCAGCGCGTCGGCTGCTGCCACGCTCAGGCTGACCGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCAGGTCCAGCA‑ACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAgg > 6:115361/1‑141 (MQ=255) gCCAGACCTCAAACCGCGACCAGGCGCACGCTGGCGCCCTCACCCACGCCCAGCGCGTCGGCTGCTGCCACGCTCAGGCTGACCGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCAGGTCCAGCA‑ACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAgg < 5:115361/141‑1 (MQ=255) ccAGACCTCAAACCGCGACCCGGCGCACGCTGGCGCCCTCCCCCACGCCCAGCGAGTCGGCTGCTGCCACGCTCAGGCTGCCCGGCTTGCCAGGCGCCCAGTCCACGTCCAGCA‑ACCCAGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGGTGca > 4:323386/1‑148 (MQ=255) ccAGACCTCAAACCGCGACCAGGCGCACGCTGGCGCCCTCACCCACGCCCAGCGCGTCGGCTGCTGCCACGCTCAGGCTGACCGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCAGGTCCAGCA‑ACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGcac > 4:85641/1‑149 (MQ=255) cAGACCTCAAACCGCGACCAGGCGCACGCTGGCGCCCTCACCCACGCCCAGCGCGTCGGCTGCTGCCACGCTCAGGCTGACCGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCAGGTCCAGCA‑ACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACGGCCTGTTGcagg < 1:322904/149‑3 (MQ=255) aGACCTCAAACCGCGACCAGGCGCACGCTGGCGCCCTCACCCACGCCCAGCGCGTCGGCTGCTGCCACGCTCAGGCTGACCGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCAGGTCCAGCA‑ACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACGGCCTGTTGcag > 6:109001/1‑146 (MQ=255) aGACCTCAAACCGCGACCAGGCGCACGCTGGCGCCCTCACCCACGCCCAGCGCGTCGGCTGCTGCCACGCTCAGGCTGACCGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCAGGTCCAGCA‑ACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACGGCCTGTTGcag < 5:109001/147‑2 (MQ=255) aGACCTCAAACCGCGACCAGGCGCACGCTGGCGCCCTCACCCACGCCCAGCGCGTCGGCTGCTGCCACGCTCAGGCTGACCGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCAGGTCCAGCA‑ACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCacac > 2:230233/1‑149 (MQ=255) gACCTCAAACCGCGACCAGGCGCACGCTGGCGCCCTCACCCACGCCCAGCGCGTCGGTTGCTGCCACGCTCAGGCTGACCGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCAGGTCCAGCA‑ACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACAcc < 4:259762/149‑1 (MQ=255) gACCTCAAACCGCGACCAGGCGCACGCTGGCGCCCTCACCCACGCCCAGCGCGTCGGCTGCTGCCACGCTCAGGCTGACCGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCAGGTCCAGCA‑ACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACAcc < 1:230233/149‑1 (MQ=255) tCAAACCGCGACCAGGCGCACGCTGGCGCCCTCACCCACGCCCAGCGCGTCGGCTGCTGCCACGCTCAGGCTGACCGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCAGGTCCAGCA‑ACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACGGCCTGTTGcag > 8:9574/1‑141 (MQ=255) tCAAACCGCGACCAGGCGCACGCTGGCGCCCTCACCCACGCCCAGCGCGTCGGCTGCTGCCACGCTCAGGCTGACCGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCAGGTCCAGCA‑ACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACGGCCTGTTGcag < 7:9574/142‑2 (MQ=255) tCAAACCGCGACCAGGCGCACGCTGGCGCCCTCACCCACGCCCAGCGCGTCGGCTGCTGCCACGCTCAGGCTGACCGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCAGGTCCAGCA‑ACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAgg > 1:82643/1‑148 (MQ=255) cAAACCGCGACCAGGCGCACGCTGGCGCCCTCACCCACGCCCAGCGCGTCGGCTGCTGCCACGCTCAGGCTGACCGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCAGGTCCAGCA‑ACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTa > 8:99519/1‑149 (MQ=255) aaCCGCGACCAGGCGCACGCTGGCGCCCTCACCCACGCCCAGCGCGTCGGCTGCTGCCACGCTCAGGCTGACCGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCAGGTCCAGCA‑ACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACg > 4:128491/1‑149 (MQ=255) aCCGCGACCAGGCGCACGCTGGCGCCCTCACCCACGCCCAGCGCGTCGGCTGCTGCCACGCTCAGGCTGACCGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCAGGTCCAGCA‑ACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACgg < 5:197944/149‑1 (MQ=255) ccGCGACCAGGCGCACGCTGGCGCCCTCACCCACGCCCAGCGCGTCGGCTGCTGCCACGCTCAGGCTGACCGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCAGGTCCAGCA‑ACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACggg > 8:6311/1‑149 (MQ=255) gCTGGCGCCCTCACCCACGCCCAGCGCGTCGGCTGCTGCCACGCTCAGGCTGACCGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCAGGTCCAGCA‑ACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCg > 3:303742/1‑149 (MQ=255) cTCACCCACGCCCAGCGCGTCGGCTGCTGCCACGCTCAGGCTGACCGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCAGGTCCAGCA‑ACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCTTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCtt < 1:241094/149‑1 (MQ=255) cccACGCCCAGCGCGTCGGCTGCTGCCACGCTCAGGCTGACCGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCAGGTCCAGCA‑ACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGAt < 5:2309/149‑1 (MQ=255) ccACGCCCAGCGCGTCGGCTGCTGCCACGCTCAGGCTGACCGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCAGGTCCAGCA‑ACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGATc > 8:166901/1‑149 (MQ=255) ccACGCCCAGCGCGTCGGCTGCTGCCACGCTCAGGCTGACCGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCAGGTCCAGCA‑ACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGATc > 1:317254/1‑149 (MQ=255) cccAGCGCGTCGGCTGCTGCCACGCTCAGGCTGACCGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCAGGTCCAGCA‑ACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGATCTTCAc < 3:134823/149‑1 (MQ=255) cccAGCGCGTCGGCTGCTGCCACGCTCAGGCTGACCGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCAGGTCCAGCA‑ACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCAGCCGTTGACCGGGGCCTCTTCGATCTTCAc > 7:252139/1‑149 (MQ=255) cAGCGCGTCGGCTGCTGCCACGCTCAGGCTGACCGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCAGGTCCAGCA‑ACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGATCTTCACCg < 3:273093/149‑1 (MQ=255) gcgTCGGCTGCTGCCACGCTCAGGCTGACCGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCAGGTCCAGCA‑ACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGATCTTCACCGGcac < 3:85641/149‑1 (MQ=255) gTCGGCTGCTGCCACGCTCAGGCTGACCGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCAGGTCCAGCA‑ACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGATCTTCACCGGcacca < 7:99519/149‑1 (MQ=255) tgcCACGCTCAGGCTGACCGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCAGGTCCAGCA‑ACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGATCTTCACCGGCACCACCCGGctct > 4:161063/1‑149 (MQ=255) ccACGCTCAGTCTGCCCGGCTTGCCAGTCGCGCATTCGAGGTCCAGCA‑ACAGCGCGGGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGATCTTCACCGGCACCACGCGGCTCTg < 6:233019/148‑1 (MQ=255) cACGCTCAGGCTGACCGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCAGGTCCAGCA‑ACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGATCTTCACCGGCACCACCCGGCTCTggg < 3:128491/149‑1 (MQ=255) cGCTCAGGCTGACCGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCAGGTCCAGCA‑ACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGATCTTCACCGGCACCACCCGGCTCTGGGCg < 4:303742/149‑1 (MQ=255) cTCAGGCTGACCGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCAGGTCCAGCA‑ACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGATCTTCACCGGCACCACCCGGCTCTGGGCGAt > 5:43332/1‑149 (MQ=255) aGGCTGACCGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCAGGTCCAGCA‑ACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGATCTTCACCGGCACCACCCGGCTCTGGGCGATc > 1:44050/1‑147 (MQ=255) aGGCTGACCGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCAGGTCCAGCA‑ACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGATCTTCACCGGCACCACCCGGCTCTGGGCGATc < 6:351345/147‑1 (MQ=255) gCTGACCGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCAGGTCCAGCA‑ACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGATCTTCACCGGCACCACCCGGCTCTGGGCGATCGAGc < 2:82643/149‑1 (MQ=255) cGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCACGTCCAGCA‑ACACCGCGCGGTAGTCCTCCAACACGCCGTTGGACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCGCTTCGATCTTCACCGGCACCACCCGGCTCTGGGCGATCGAGCGGATGc < 3:323386/149‑1 (MQ=255) gCTTGCCAGGCACCCAGTCCAGGTCCAGCAGACACCCCGCGGTATTCATGCAACAGGCCGTTGCACACCAGTTACGGCCGCCCGCCTTTGCCCGGGGCCTCTTCGATATTCCCGGGCCCCACCCGGATCTGGGCGAGGGACCGCATGc > 1:205741/1‑148 (MQ=255) tGCCAGGCACCCAGTCCAGGTCCAGCA‑ACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGATCTTCACCGGCACCACCCGGCTCTGGGCGATCGAGCGGATGCCaga < 3:179051/148‑1 (MQ=255) tGCCAGGCACCCAGTCCAGGTCCAGCA‑ACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGATCTTCACCGGCACCACCCGGCTCTGGGCGATCGAGCGGATGCCa > 4:179051/1‑146 (MQ=255) gCCAGGCACCCAGTCCAGGTCCAGCA‑ACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGATCTTCACCGGCACCACCCGGCTCTGGGCGATCGAGCGGATGCCagag < 5:180432/148‑1 (MQ=255) cAGGCACCCAGTCCAGGTCCAGCA‑ACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCttt > 4:72917/1‑82 (MQ=255) cAGGCACCCAGTCCAGGTCCAGCA‑ACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCttt < 3:72917/82‑1 (MQ=255) gCACCCAGTCCAGGTCCAGCA‑ACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGATCTTCACCGGCACCACCCGGCTCTGGGCGATCGAGCGGATGCCAGAGGTgcgc > 3:72020/1‑149 (MQ=255) gCACCCAGTCCAGGTCCAGCA‑ACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGATCTTCACCGGCACCACCCGGCTCTGGGCGATCGAGCGGATGCCAGAGGTgcgc < 7:166901/149‑1 (MQ=255) gtccaggtccagCA‑ACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGATCTTCACCGGCACCACCCGGCTCTGGGCGATCGAGCGGATGCCAGAGGTGCGCGCATg > 2:317917/1‑147 (MQ=255) caggtccagCA‑ACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGATCTTCACCGGCACCACCCGGCTCTGGGCGATCGAGCGGATGCCAGAGGTGCGCGCATGCAgg < 2:23778/148‑1 (MQ=255) cagCA‑ACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGATCTTCACCGGCACCACCCGGCTCTGGGCGATCGAGCGGATGCCagag > 4:44861/1‑127 (MQ=255) cagCA‑ACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGATCTTCACCGGCACCACCCGGCTCTGGGCGATCGAGCGGATGCCagag < 3:44861/127‑1 (MQ=255) cagCA‑ACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGATCTTCACCGGCACCACCCGGCTCTGGGCGATCGAGCGGATGCCAGAGGTGCGCGCATGCAGGGTCGGgc > 4:209827/1‑149 (MQ=255) cagCA‑ACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGATCTTCACCGGCACCACCCGGCTCTGGGCGATCGAGCGGATGCCAGAGGTGCGCGCATGCAGGGTCGGgc < 2:317254/149‑1 (MQ=255) cA‑ACACCGCGCGGTAGACCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTACGATCTTCACCGCCACCACCCGGCTCTGCGCGATCGAGCGGATGCCAGAGGTGCGCGCATGCAGGGTc > 6:186137/1‑142 (MQ=255) cctccgcgcgcgGTAGTCCTGCAACCGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCGGCGTGTGAGCGGGGCCTCTTCGATCTTCACCGGCACCACCGGGCTCTGGGCGATCGAGCGGATGCCAGAGGTGCGCGGATGCAGGGTc < 5:186137/136‑1 (MQ=255) cgcgcgGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGATCTTCACCGGCACCACCCGGCTCTGGGCGATCGAGCGGATGCCAGAGGTGCGCGCATGCAGGGTCGGGCCGCCGTCg > 5:206091/1‑148 (MQ=255) ggTAGTCCTGCACCTGGCCGTTGCACCCCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGATCTTCACCGGCACCACCCGGCTCTGGGCGATCGTCCGGATGCCAGAGGTGCGCGCATGCAGGGTCGGGCCGCCGTCGAAGATg < 8:252139/149‑1 (MQ=255) tgtGCAACGGCCTGTTACACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGATCTTCACCGGCACCACCCGGCTCTGGGCGATCGAGCGGATGCCAGAGGTGCGCGCATGCAGGGTCGGGCCGCCGTCGAAGATGTCGATg > 2:163611/3‑149 (MQ=255) cTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGATCTTCACCGGCACCACCCGGCTCTGGGCGATCGa < 3:127151/93‑1 (MQ=255) cTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGATCTTCACCGGCACCACCCGGCTCTGGGCGATCGa > 4:127151/1‑93 (MQ=255) cTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGATCTTCACCGGCACCACCCGGCTCTGGGCGATCGAGCGGATGCCAGAGGTGCGCGCATGCAGGGTCGGGCCGCCGTCGAAGATGTCGATg > 5:74345/1‑148 (MQ=255) tGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGATCTTCACCGGCACCACCCGGCTCTGGGCGATCGAGCGGATGCCAGAGGTGCGCGCATGCAGGGTCGGGCCGCCGTCGAAGATGTCGATg > 1:60980/1‑147 (MQ=255) tGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGATCTTCACCGGCACCACCCGGCTCTGGGCGATCGAGCGGATGCCAGAGGTGCGCGCATGCAGGGTCGGGCCGCCGTCGAAGATGTCGATg > 5:131700/1‑147 (MQ=255) gCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGATCTTCACCGGCACCACCCGGCTCTGGGCGATCGAGCGGATGCCAGAGGTGCGCGCATGCAGGGTCGGGCCGCCGTCGAAGATGTCGATGTAg > 4:114266/1‑149 (MQ=255) cAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGATCTTCACCGGCACCACCCGGCTCTGGGCGATCGAGCGGATGCCAGAGGTGCGCGCATGCAGGGTCGGGCCGCCGTCGAAGATGTCGATGTa < 1:317917/147‑1 (MQ=255) cAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGATCTTCACCGGCACCACCCGGCTCTGGACGATCGAGCGGATGCCAGAGGTGCGCGCATGCAGGGTCGGGCCGCCGTCGAAGATGTCGATGTAg < 1:276642/148‑1 (MQ=255) aGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGATCTTCACCGGCACCACCCGGCTCTGGGCGATCGAGCGGATGCCAGAGGTGCGCGCATGCAGGGTCGGGCCGCCGTCGAAGATGTCGATGTAGTGCTc < 7:6311/149‑1 (MQ=255) ggCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGATCTTCACCGGCACCACCCGGCTCTGGGCGATCGAGCGGATGCCAGAGGTGCGCGCATGCAGGGTCGGGCCGCCGTCGAAGATGTCGATGTAGTGCTCg < 4:72020/149‑1 (MQ=255) | TTGCCAGACCTCAAACCGCGACCAGGCGCACGCTGGCGCCCTCACCCACGCCCAGCGCGTCGGCTGCTGCCACGCTCAGGCTGACCGGCTTGCCAGGCACCCAGTCCAGGTCCAGCA‑ACACCGCGCGGTAGTCCTGCAACAGGCCGTTGCACACCAGGTACGGGCGCCCGCCTTTGACCGGGGCCTCTTCGATCTTCACCGGCACCACCCGGCTCTGGGCGATCGAGCGGATGCCAGAGGTGCGCGCATGCAGGGTCGGGCCGCCGTCGAAGATGTCGATGTAGTGCTCG > NC_002947/5089907‑5090196 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |