Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 5,182,059 | G→T | 8.6% | intergenic (‑117/+37) | PP_4560 ← / ← csbD | ribonuclease BN/stress response protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,182,059 | 0 | G | T | 8.6% | 155.8 / 4.4 | 57 | intergenic (‑117/+37) | PP_4560/csbD | ribonuclease BN/stress response protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (29/23); new base T (3/2); total (32/25) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.23e-01 |
GGGGCAAGCCGCGCAGGTCGGGGAAAATCATAGCGTCTCCTTTCGCCGCTTGATCGTTACACAG‑GCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCT‑TGACCTGCTGCGCCTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGCCCGCAGCTTTTCGTTGTCGGTCACCTTG > NC_002947/5181912‑5182204 | ggggCAAGCCGCGCAGGTCGGGGAAAATCATAGCGTCTCCTTTCGCCGCTTGATCGTTACACAG‑GCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTcgc > 7:36567/1‑149 (MQ=255) ggggCAAGCCGCGCAGGTCGGGGAAAATCATAGCGTCTCCTTTCGCCGCTTGATCGTTACACAG‑GCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTcgc < 6:107684/149‑1 (MQ=255) gggCAAGCCGCGCAGGTCGGGGAAAATCATAGCGTCTCCTTTCGCCGCTTGATCGTTACACAG‑GCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTcgcg > 5:221522/1‑149 (MQ=255) ggCAAGCCGCGCAGGTCGGGGAAAATCATAGCGTCTCCTTTCGCCGCTTGATCGTTACACAG‑GCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCgg < 1:11955/149‑1 (MQ=255) ggCAAGCCGCGCAGGTCGGGGAAAATCATAGCGTCTCCTTTCGCCGCTTGATCGTTACACAG‑GCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCgg < 8:36567/149‑1 (MQ=255) gcAGGTCGGGGAAAATCATAGCGTCTCCTTTCGCCGCTTGATCGTTACACAG‑GCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTATTCGCGGGTTCAccc > 3:263180/1‑147 (MQ=255) gccGGGTAAAAGCATAGCGTCTCCTTTCGCCGCTTCTTCGTTACACTGCGTATATCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGagaa < 1:284208/147‑1 (MQ=255) gTCGGGGAAAATCATAGCGTCTCCTTTCGCCGCTTGATCGTTACACAG‑GCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCTCGGGTGAACCCGcgaag < 5:252171/149‑1 (MQ=255) gTCGGGGAAAATCATAGCGTCTCCTTTCGCCGCTTGATCGTTACACAG‑GCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCATCCGagaag < 7:167652/149‑1 (MQ=255) gTCGGGGAAAATCATAGCGTCTCCTTTCGCCGCTTGATCGTTACACAG‑GCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCgag > 7:201628/1‑146 (MQ=255) tCGGGGAAAATCATAGCGTCTCCTTTCGCCGCTTGATCGTTACACAG‑GCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGagaaga < 2:83769/149‑1 (MQ=255) taaaaTCATAGCGTCTCCTTTCGCCGCTTTATCGTTACACAG‑GCACGTCTAATAGACCGGGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACTAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAGAATAGGCCg < 6:45277/148‑1 (MQ=255) aaaaTCATAGCGTCTCCTTTCGCCGCTTGATCGTTACACAG‑GCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGGcctg > 2:90615/1‑147 (MQ=255) aaaaTCATAGCGTCTCCTTTCGCCGCTTGATCGTTACACAG‑GCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGGCCgg > 8:66622/1‑149 (MQ=255) aaaTCATAGCGTCTCCTTTCGCCGCTTGATCGTTACACAG‑GCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGGCCgg < 8:201628/148‑1 (MQ=255) gTCTCCTTTCGCCGCTTGATCGTTACACAG‑GCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCTCGGGTGAACCCGCGAagag < 8:156078/133‑1 (MQ=255) gTCTCCTTTCGCCGCTTGATCGTTACACAG‑GCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCTCGGGTGAACCCGCGAagag > 7:156078/1‑133 (MQ=255) atctcCTTTCGCCGCTTGATCGTTACACAG‑GCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACCAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGGCCGGCACCGCCtcaa < 3:204202/148‑1 (MQ=255) tctcCTTTCGCCGCTTGATCGTTACACAG‑GCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGGCCGGCACCGCCtcaag < 5:171077/149‑1 (MQ=255) ccTTTCGCCGCTTGATCGTTACACAG‑GCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCAACCGAGAAGAGGCCGGCACCGCCtcaagtc > 3:134171/1‑148 (MQ=255) cTTTCGCCGCTTGATCGTTACACAG‑GCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGGCCGGCACCGCCtcaa > 4:204202/1‑144 (MQ=255) ccgcTTGATCGTTACACAG‑GCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGcttc > 2:93970/1‑149 (MQ=255) aTCGTTACACAG‑GCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTcgc > 3:322466/1‑97 (MQ=255) aTCGTTACACAG‑GCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTcgc < 4:322466/97‑1 (MQ=255) aTCGTTACACAG‑GCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGGCCGACACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCg > 3:13486/1‑149 (MQ=255) gTTACACAG‑GCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGGCCg < 8:199124/116‑1 (MQ=255) gTTACACAG‑GCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGGCCg > 7:199124/1‑116 (MQ=255) gTTACACAG‑GCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCAt > 4:145776/1‑149 (MQ=255) ttACACAG‑GCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTTAAGAATTTGCTTAGTAATAAGTCCCGGCCTCTTCGCGTGTTCACCCGAGAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATc < 7:66622/149‑1 (MQ=255) ttACACAG‑GCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCAt > 6:186199/1‑148 (MQ=255) tACACAG‑GCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATcc > 7:93888/1‑149 (MQ=255) acaG‑GCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCtt > 2:70989/1‑148 (MQ=255) aG‑GCAATTCTAATAGACCTTGCCCGAGCTGTGCTGCTCGCGGCGGTGGTTTAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGGCTCTTCGCGGTTTCACCCTATAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTcac < 3:285972/149‑1 (MQ=255) atAATAGACCGTGCCCGAGCTTTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAATAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGATAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGTCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTccc < 4:263180/147‑1 (MQ=255) aaTAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCt‑t > 6:301844/1‑148 (MQ=255) aTAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCT‑TGa < 1:93970/149‑1 (MQ=255) tAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCT‑TGAc > 3:234500/1‑149 (MQ=255) aCCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGGc > 3:36902/1‑92 (MQ=255) ccGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCGTCAACGCATGCTTGACATTTCGCA‑TGACCatctgctcg > 8:280956/1‑146 (MQ=255) cTGTGCTGCTCCGGGCCGTGGTTTAAGAATTTGCTTACTAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCT‑TGACCTGCTgcgc < 6:348224/143‑1 (MQ=255) cTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAGAACAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCT‑TGACCTGCTgcgc > 5:348224/1‑143 (MQ=255) tgctCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCT‑TGACCTGCTGcgcctc > 3:139057/1‑140 (MQ=255) tcctCCGGGCCGTTGTTGAAGAATTTGCTTACTAATATGGGCCGGCCTCTTGGCGGTTTCACCCTTTATGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCT‑TGACCTGCTGcgcctc < 4:139057/138‑1 (MQ=255) ccGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCT‑TGACCTGCTGCGCCTCGCCTTTGAGCTCCt > 7:287955/1‑149 (MQ=255) cGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCT‑TGACCTGCTGCGCCTCGCCTTTGAGCTCCTGCgcc > 6:140005/1‑149 (MQ=255) tGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCT‑TGACCTGCTGCGCCTCGCCTTTGa > 2:251403/1‑136 (MQ=255) tGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCT‑TGACCTGCTGCGCCTCGCCTTTGa < 1:251403/136‑1 (MQ=255) tGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCT‑TGACCTGCTGCGCCTCGCCTTTGAGCTCCTGCgcctt < 5:301844/149‑1 (MQ=255) aagaaTTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCAACCGAGAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCT‑TGACCTGCTGCGCCTCGCCTTTGAGCTCCTGCgccttgcctt < 4:134171/148‑1 (MQ=255) agaaTTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCT‑TGACCTGCTGCGCCTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCg > 5:110102/1‑149 (MQ=255) gaaTTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTCTGACCTGCTGCGCCTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCg < 1:70989/149‑1 (MQ=255) tttGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCT‑TGACCTGCTGCGCCTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGccc > 5:117519/1‑149 (MQ=255) cGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCT‑TGACCTGCTGCGCCTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGCCCGCAGCttt < 3:145776/149‑1 (MQ=255) gAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCGCCCGAGAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCT‑TGACCTGCTGCGCCTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGCCCGCAGCtttt > 2:188982/1‑149 (MQ=255) aTAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCT‑TGACCTGCTGCGCCTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGCCCGCAGCTTTTCg < 6:117519/149‑1 (MQ=255) ggCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCT‑TGACCTGCTGCGCCTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGCCCGCAGCTTTTCGTTGTCGGt > 3:97289/1‑148 (MQ=255) cgtctTCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCT‑TGACCTGCTGCGCCTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGCCCGCAGCTTTTCGTTGTCGGTCAc < 5:186199/147‑1 (MQ=255) ctctTCTCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCT‑TGACCTGCTGCGCCTCGCCgtt > 4:333647/1‑100 (MQ=37) ctctTCTCGGGTGAACCCGCGAAGAGACCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCT‑TGACCTGCTGCGCCTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGCCCGCAGCTTTTCGTTGTCGGTCAcc > 1:10668/1‑149 (MQ=255) ctctTCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTGCACCGCATCCTTCACATTTCCCT‑TGACCTGCTGCGCCTCGCCTGTGAGCTCATGCGCCTTGCCTTCGGCCCGCCGCTGTGCGTTGTCGGTCTcc > 8:288179/1‑149 (MQ=255) tctTCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCT‑TGACCTGCTGCGCCTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGCCCGCAGCTTTTCGTTGTCGGTCACCt > 2:158901/1‑149 (MQ=255) ttCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCT‑TGACCTGCTGCGCCTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGCCCGCAGCTTTTCGTTGTCGGTCACCTTg > 1:18237/1‑149 (MQ=255) cgcgGGTTCACCCGAGAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCT‑TGACCTGCTGCGCCTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGCCCGCAGCTTTTCGTTGTCGGTCACCtt < 6:110102/146‑1 (MQ=255) | GGGGCAAGCCGCGCAGGTCGGGGAAAATCATAGCGTCTCCTTTCGCCGCTTGATCGTTACACAG‑GCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCT‑TGACCTGCTGCGCCTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGCCCGCAGCTTTTCGTTGTCGGTCACCTTG > NC_002947/5181912‑5182204 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |