Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 5,182,998 | T→A | 9.2% | K246* (AAG→TAG) ‡ | PP_4563 ← | hypothetical protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,182,998 | 0 | T | A | 9.2% | 182.9 / 8.4 | 65 | K246* (AAG→TAG) ‡ | PP_4563 | hypothetical protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (29/30); new base A (3/3); total (32/33) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.72e-01 |
GTGGCGAGCAGCTGGACTTCCGCAACTTCGTACAGGCGTAAGGCCGTCAGGCTTTCTCGATGCGATCGTCATGGATGACGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGC‑ACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCTTCC‑AGGCGCGCCATGATCTGCTCTTGCAGGGTGTCCGCCAGGGCGGCGCCTACCGGCTGCAGGCTCAGTGAAATCTTGCCGTCCTGGCGCACT > NC_002947/5182851‑5183146 | gTGGCGAGCAGCTGGACTTCCGCAACTTCGTACAGGCGTAAGGCCGTCAGGCTTTCTCGATGCGATCGTCATGGATGACGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTg > 1:132602/1‑149 (MQ=255) tGGCGAGCAGCTGGACTTCCGCAACTTCGTACAGGCGTAAGGCCGTCAGGCTTTCTCGATGCGATCGTCATGGATGACGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGc < 7:56992/149‑1 (MQ=255) ggCGAGCAGCTGGACTTCCGCAACTTCGTACAGGCGTAAGGCCGTCAGGCTTTCTCGATGCGATCGTCATGGATGACGATCAGGCCCTGCTTGAAGAACCCGCCAATGGCCTTCTTGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCt > 1:282435/1‑149 (MQ=255) cGAGCAGCTGGACTTCCGCAACTTCGTACAGGCGTAAGGCCGTCAGGCTTTCTCGATGCGATCGTCATGGATGACGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGa < 5:345910/149‑1 (MQ=255) cGAGCAGCTGGACTTCCGCAACTTCGTACAGGCGTAAGGCCGTCAGGCTTTCTCGATGCGATCGTCATGGATGACGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGa < 3:252362/149‑1 (MQ=255) agcTGGACTTCCGCAACTTCGTACAGGCGTAAGGCCGTCAGGCTTTCTCGATGCGATCGTCATGGATGACGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGATCAGCAAGCTGTTCaa < 7:57472/148‑1 (MQ=255) agcTGGACTTCCGCAACTTCGTACAGGCGTAAGGCCGTCAGGCTTTCTCGATGCGATCGTCATGGATGACGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAAc < 2:272370/149‑1 (MQ=255) gcTGGACTTCCGCAACTTCGTACAGGCGTAAGGCCGTCAGGCTTTCTCGATGCGATCGTCATGGATGACGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACg > 7:21781/1‑149 (MQ=255) cTTCCGCAACTTCGTACAGGCGTAAGGCCGTCAGGCTTTCTCGATGCGATCGTCATTGATGACGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGt < 5:2517/149‑1 (MQ=255) ccGCAACTTCGTACAGGCGTAAGGCCGTCAGGCTTTCTCGATGCGATCGTCATGGATGACGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAgg > 7:169151/1‑144 (MQ=255) ccGCAACTTCGTACAGGCGTAAGGCCGTCAGGCTTTCTCGATGCGATCGTCATGGATGACGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAgg < 8:169151/144‑1 (MQ=255) ccGCAACTTCGTACAGGCGTAAGGCCGTCAGGCTTTCTCGATGCGATCGTCATGGATGACGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCAc > 1:12718/1‑149 (MQ=255) gCAACTTCGTACAGGCGTAAGGCCGTCAGGCTTTCTCGATGCGATCGTCATGGATGACGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCActc < 6:332457/149‑1 (MQ=255) aaCTTCGTACAGGCGTAAGGCCGTCAGGCTTTCTCGATGCGATCGTCATGGATGACGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCtt < 2:282435/149‑1 (MQ=255) cGTACAGGCGTAAGGCCGTCAGGCTTTCTCGATGCGATCGTCATGGATGACGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTc < 1:4652/147‑1 (MQ=255) aGGCGTAAGGCCGTCAGGCTTTCTCGATGCGATCGTCATGGATGACGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGC‑ACAcc > 6:17491/1‑149 (MQ=255) aGGCGTAAGGCCGTCAGGCTTTCTCGATGCGATCGTCATGGATGACGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGC‑ACAcc < 8:21781/149‑1 (MQ=255) tAAGGCCGTCAGGCTTTCTCGATGCGATCGTCATGGATGACGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGC‑ACACCCCCaa < 7:135729/149‑1 (MQ=255) ccGTCAGGCTTTCTCGATGCGATCGTCATGGATTACGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCAGCCAATGGCCTTCTTGAAGTTGCACTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGAAGGGTCACTCTTGTCGC‑ACAACCCCAacacac > 3:157906/1‑147 (MQ=255) gTCAGGCTTTCTCGATGCGATCGTCATGGATGACGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGC‑ACACCCCCAACACCCCg > 8:35066/1‑149 (MQ=255) aGGCTTTCTCGATGCGATCGTCATGGATGACGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGC‑ACACCCCCAACACCCCGCCt > 7:313002/1‑149 (MQ=255) cTTTCTCGATGCGATCGTCATGGATGACGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGC‑ACACCCCCat > 7:1188/1‑135 (MQ=255) cTTTCTCGATGCGATCGTCATGGATGACGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGC‑ACACCCCCat < 8:1188/136‑2 (MQ=255) gATGCGATCGTCATGGATGACGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGC‑ACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCtt < 8:313002/146‑1 (MQ=255) gATGCGATCGTCATGGATGACGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGC‑ACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCtt < 5:17491/146‑1 (MQ=255) aTGCGATCGTCATGGATGACGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGC‑ACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCTTCC‑Ag < 2:132602/149‑1 (MQ=255) aTGCGATCGTCATGGATGACGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGC‑ACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCTTCC‑Ag < 5:45611/149‑1 (MQ=255) gCGATCGTCATGGATGACGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGC‑ACACCCCCACCACCCCGCCTTCGGCTTCC‑AGgc > 8:41317/1‑149 (MQ=255) gATCGTCATGGATGACGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGC‑ACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCTTCC‑AGgcgc < 3:313289/149‑1 (MQ=255) gTCATGGATGACGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGC‑ACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCTTCC‑AGGCGCGcc < 5:81872/148‑1 (MQ=255) tCATGGATGACGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGc > 2:70071/1‑82 (MQ=255) tCATGGATGACGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGc < 1:70071/82‑1 (MQ=255) tCATGGATGACGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGC‑ACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCTTCC‑AGGCGCGCCAt > 7:22412/1‑149 (MQ=255) gATGACGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGC‑ACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCTTCC‑AGGCGCGCCATGATc < 8:22412/148‑1 (MQ=255) gATGACGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGC‑ACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCTTCC‑AGGCGCGCCATGATCt > 4:35744/1‑149 (MQ=255) gATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGATCAGCAAGCTGTTCAAc > 8:227845/1‑79 (MQ=38) gATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGATCAGCAAGCTGTTCAAc < 7:227845/79‑1 (MQ=38) ccTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTGATGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGAAGGGTCACTCTTGTCGC‑ACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCTTCC‑AGGCGCGCCATGATCTGCTCTTGCAGGgtg > 4:53250/1‑149 (MQ=255) ccTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGC‑ACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCTTCC‑AGGCGCGCCATGATCTGCTCTTGCAgg > 4:290153/1‑146 (MQ=255) ccTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGC‑ACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCTTCC‑AGGCGCGCCATGATCTGCTCTTGCAgg < 3:290153/146‑1 (MQ=255) ccTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGC‑ACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCTTCC‑AGGCGCGCCATGATCTGCTCTTGCAGGgtg > 3:163669/1‑149 (MQ=255) gAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGTTCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGC‑ACACCCCCAACACCCCGGCTTCGGCTTCCAAGGCGCGCCATGATCTGCTCTTGCAGGGTGTcc < 1:41846/146‑1 (MQ=255) gAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGC‑ACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCTTCC‑AGGCGCGCCATGATCTGCTCTTGCAGGGTGTcc > 2:41846/1‑145 (MQ=255) gAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGC‑ACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCTTCC‑AGGCGCGCCATGATCTGCTCTTGCAGGGTGTcc > 4:164412/1‑145 (MQ=255) gAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGC‑ACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCTTCC‑AGGCGCGCCATGATCTGCTCTTGCAGGGTGTcc < 3:164412/145‑1 (MQ=255) caacCCGCCAATGGCCTTCTTGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGC‑ACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCTTCC‑AGGCGCGCCATGATCTGCTCTTGCAGGGTGTCCGCCAggg < 7:152127/149‑1 (MQ=255) ccGCCAATGGCCTTCTTGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGC‑ACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCTTCC‑AGGCGCGCCATGATCTGCTCTTGCAGGGTGTCCGc > 4:37135/1‑140 (MQ=255) ccGCCAATGGCCTTCTTGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGC‑ACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCTTCC‑AGGCGCGCCATGATCTGCTCTTGCAGGGTGTCCGc < 3:37135/140‑1 (MQ=255) tcttcttGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGC‑ACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCTTCC‑AGGCGCGCCATGATCTGCTCTTGCAGGGTGTCCGCCAGGGCGGCGCCTACCGGc > 3:115663/2‑149 (MQ=255) ttcttGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGC‑ACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCTTCC‑AGGCGCGCCATGATCTGCTCTTGCAGGGTGTCCGCCAGGGCGGCGCCTACCGGCTg > 1:323281/1‑149 (MQ=255) ttcttGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGC‑ACACCCCCAACAACCCGCCTTCGGATTAC‑AGGCTCGCCATGATATGCTCTTGCAGGGTGTCCGCATCGGCTGCGCCTACAGGCt > 1:227391/1‑148 (MQ=255) tGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGC‑ACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCTTCC‑AGGCGCGCCATGATCTGCTCTTGCAGGGTGTCCGCCAGGGCGGCGCCTAc < 2:54764/139‑1 (MQ=255) tGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGC‑ACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCTTCC‑AGGCGCGCCATGATCTGCTCTTGCAGGGTGTCCGCCAGGGCGGCGCCTAc > 1:54764/1‑139 (MQ=255) gTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGC‑ACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCTTCC‑AGGCGCGCCATGATCTGCTCTTGCAgg < 2:264821/112‑1 (MQ=255) gTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGC‑ACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCTTCC‑AGGCGCGCCATGATCTGCTCTTGCAgg > 1:264821/1‑112 (MQ=255) ttGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGC‑ACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCTTCC‑AGGCGCGCCATGATCTGCTCTTGCAGGGTGTCCGCCAGGGCGGCGCCTACCGGCTGCAGGCTCAg > 5:278332/1‑149 (MQ=255) cctgcGTTGATCAGCAAGCTGTTCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGC‑ACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCTTCC‑AGGCGCGCCATGATCTGCTCTTGCAGGGTGTCCGCCAGGGCGGCGCCTACCGGCTGCAGGCTCAGTGAAATCtt > 4:239915/5‑149 (MQ=255) tGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGC‑ACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCTTCC‑AGGCGCGCCATGATCTGCTCTTGCAGGGTGTCCGCCAGGGCGGCGCCTACCGGCTGCAGGCTCAGTGAAATCTTg > 7:122502/1‑149 (MQ=255) ctgcGTTGATCAGCAAGCTGTTCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGC‑ACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCTTCC‑AGGCGCGCCATGATCTGCTCTTGCAGGGTGTCCGCCAGGGCGGCGCCTACCGGCTGCAgg > 3:210065/4‑134 (MQ=255) ctgcGTTGATCAGCAAGCTGTTCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGC‑ACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCTTCC‑AGGCGCGCCATGATCTGCTCTTGCAGGGTGTCCGCCAGGGCGGCGCCTACCGGCTGCAgg < 4:210065/131‑1 (MQ=255) aCGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGC‑ACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCTTCC‑AGGCGCGCCATGATCTGCTCTTGCAGGGTGTCCGCCAGGGCGGCGCCTACCGGCTGCAGGCTCAGTGAAATCTTGcc < 3:35744/149‑1 (MQ=255) ttGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGC‑ACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCTTCC‑AGGCGCGCCATGATCTGCTCTTGCAGGGTGTCCGCCAGGGCGGCGCCTACCGGCTGCAGGCTCAGTGAAATCTTGCCGTc < 2:12718/149‑1 (MQ=255) aaCAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGC‑ACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCTTCC‑AGGCGCGCCATGATCTGCTCTTGCAGGGTGTCCGCCAgg > 8:6805/1‑105 (MQ=255) aaCAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGC‑ACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCTTCC‑AGGCGCGCCATGATCTGCTCTTGCAGGGTGTCCGCCAgg < 7:6805/105‑1 (MQ=255) cAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGCAACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCTTCC‑AGGCGCGCCATGATCTGCTATTGCAGGGTGTCCGCCAGGGCGGCGCCTACCGGCTGCAGGCTCAGTGAAATCTTGCCGTCCTgg > 1:51125/1‑149 (MQ=255) tGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGC‑ACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCTTCC‑AGGCGCGCCATGATCTGCTCTTGCAGGGTGTCCGCCAGGGCGGCGCCTACCGGCTGCAGGCTCAGTGAAATCTTGCCGTCCTGGCGCACt > 6:126397/1‑149 (MQ=255) | GTGGCGAGCAGCTGGACTTCCGCAACTTCGTACAGGCGTAAGGCCGTCAGGCTTTCTCGATGCGATCGTCATGGATGACGATCAGGCCCTGCTTGAACAACCCGCCAATGGCCTTCTTGAAGTTGCCCTTGCTGACGTTGAACAGCTTGCTGATCAACGCAGGGTCACTCTTGTCGC‑ACACCCCCAACACCCCGCCTTCGGCTTCC‑AGGCGCGCCATGATCTGCTCTTGCAGGGTGTCCGCCAGGGCGGCGCCTACCGGCTGCAGGCTCAGTGAAATCTTGCCGTCCTGGCGCACT > NC_002947/5182851‑5183146 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |