| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 443,435 | G→C | 5.1% | V143L (GTG→CTG) | bioC → | malonyl‑ACP O‑methyltransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 443,435 | 0 | G | C | 5.1% | 260.9 / 3.2 | 79 | V143L (GTG→CTG) | bioC | malonyl‑ACP O‑methyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (39/36); new base C (2/2); total (41/38) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.53e-01 | |||||||||||
GTCATGTCAAGGGTGGGGCGCAGTATCACGTGGTTGGCGACGCCGAGCGT‑TTGCCGCTGCGCGATGCCAGTGTCGACCTGGTGTTTTCCAG‑CCTGGCGGTGCAGTGGTGCGATCAGTTCGCCAGTGTGCTGGCCGAGGCGCAGCGGGTGCTGCGCCCAGGTGGAGTACTGGCCTTCAGCAGCCTGTGCGTGGGCACCCTCGACGAACTGCGCGCCAGCTGGCAGGCGGTGGATGGCCTGGTGCATGTAAACCGCTTCCGCCGTTTCGAAGACTATCAGCGCCTGTGCG > NC_002947/443289‑443576 | gTCATGTCAAGGGTGGGGCGCAGTATCACGTGGTTGGCGACGCCGAGCGT‑TTGCCGCTGCGCGATGCCAGTGTCGACCTGGTGTTTTCCAGCCCTGGCGGTGCAGTGGTGCGATCAGTTCGCCAGTGTGCTGGCCGAGGCGCAGCGGGt < 1:95214/149‑1 (MQ=255)gTCATGTCAAGGGTGGGGCGCAGTATCACGTGGTTGGCGACGCCGAGCGT‑TTGCCGCTGCGCGATGCCAGTGTCGACCTGGTGTTTTCCAG‑CCTGGCGGTGCAGTGGTGCGATCAGTTCGCCAGTGTGCTGGCCGAGGCGCAGCGGGtg < 7:115510/149‑1 (MQ=255) aTGTCAAGGGTGGGGCGCAGTATCACGTGGTTGGCGACGCCGAGCGT‑TTGCCGCTGCGCGATGCCAGTGTCGACCTGGTGTTTTCCAG‑CCTGGCGGTGCAGTGGTGCGATCAGTTCGCCAGTGTGCTGGCCGAGGCGCAGCGGGtgct < 8:57172/148‑1 (MQ=255) gTCAAGGGTGGGGCGCAGTATCACGTGGTTGGCGACGCCGAGCGT‑TTGCCGCTGCGCGATGCCAGTGTCGACCTGGTGTTTTCCAG‑CCTGGCGGTGCAGTGGTGCGATCAGTTCGCCAGTGTGCTGGCCGAGGCGCAGCGGGTGCTgcg > 1:319432/1‑149 (MQ=255) tCAAGGGTGGGGCGCAGTATCACGTGGTTGGCGACGCCGAGCGT‑TTGCCGCTGCGCGATGCCAGTGTCGACCTGGTGTTTTCCAG‑CCTGGCGGTGCAGTGGTGCGATCAGTTCGCCAGTGTGCTGGCCGAGGCGCAGCGGGTGCTgcgc > 6:81241/1‑149 (MQ=255) tCAAGGGTGGGGCGCAGTATCACGTGGTTGGCGACGCCGAGCGT‑TTGCCGCTGCGCGATGCCAGTGTCGACCTGGTGTTTTCCAG‑CCTGGCGGTGCAGTGGTGCGATCAGTTCGCCAGTGTGCTGGCCGAGGCGCAGCGGGTGCTgcgc < 1:326192/149‑1 (MQ=255) aaGGGTGGGGCGCAGTATCACGTGGTTGGCGACGCCGAGCGT‑TTGCCGCTGCGCGATGCCAGTGTCGACCTGGTGTTTTCCAG‑CCTGGCGGTGCAGTGGTGCGATCAGTTCGCCAGTGTGCTGGCCGAGGCGCAGCGGGTGCTGCGcc > 3:54011/1‑148 (MQ=255) aaGGGTGGGGCGCAGTATCACGTGGTTGGCGACGCCGAGCGT‑TTGCCGCTGCGCGATGCCAGTGTCGACCTGGTGTTTTCCAG‑CCTGGCGGTGCAGTGGTGCGATCAGTTCGCCAGTGTGCTGGCCGAGGCGCAGCGGGTGCTGCGcc > 5:219632/1‑148 (MQ=255) aaGGGTGGGGCGCAGTATCACGTGGTTGGCGACGCCGAGCGT‑TTGCCGCTGCGCGATGCCAGTGTCGACCTGGTGTTTTCCAG‑CCTGGCGGTGCAGTGGTGCGATCAGTTCGCCAGTGTGCTGGCCGAGGCGCAGCGGGTGCAGCGcc > 8:66070/1‑148 (MQ=255) aGGGTGGGGCGCAGTATCACGTGGTTGGCGACGCCGAGCGT‑TTGCCGCTGCGCGATGCCAGTGTCGACCTGGTGTTTTCCAG‑CCTGGCGGTGCAGTGGTGCGATCAGTTCGCCAGTGTGCTGGCCGAGGCGCAGCGGGTGCTGCGCCCa < 1:150882/149‑1 (MQ=255) gggTGGGGCGCAGTATCACGTGGTTGGCGACGCCGAGCGT‑TTGCCGCTGCGCGATGCCAGTGTCGACCTGGTGTTTTCCAG‑CCTGGCGGTGCAGTGGTGCGATCAGTTCGCCAGTGTGCTGGCCGAGGCGCAGCGGGTGCTGCGCCCAg > 7:296260/1‑149 (MQ=255) gTGGGGCGCAGTATCACGTGGTTGGCGACGCCGAGCGT‑TTGCCGCTGCGCGATGCCAGTGTCGACCTGGTGTTTTCCAG‑CCTGGCGGTGCAGTGGTGCGATCAGTTCGCCAGTGTGCTGGCCGAGGCGCAGCGGGTGCTGCGCCCAGGt < 5:12304/149‑1 (MQ=255) ggCGCAGTATCACGTGGTTGGCGACGCCGAGCGT‑TTGCCGCTGCGCGATGCCAGTGTCGACCTGGTGTTTTCCAG‑CCTGGCGGTGCAGTGGTGCGATCAGTTCGCCAGTGTGCTGGCCGGGGCGCAGCACCCGCTGCGcctcg < 1:224591/143‑4 (MQ=255) ggCGCAGTATCACGTGGTTGGCGACGCCGAGCGT‑TTGCCGCTGCGCGATGCCAGTGTCGACCTGGTGTTTTCCAG‑CCTGGCGGTGCAGTGGTGCGATCAGTTCGCCAGTGTGCTGGCCGGGGCGCAGCACCCGCTGCGcctcg > 2:224591/1‑140 (MQ=255) gcgcAGTATCACGTGGTTGGCGACGCCGAGCGT‑TTGCCGCTGCGCGATGCCAGTGTCGACCTGGTGTTTTCCAG‑CCTGGCGGTGCAGTGGTGCGATCAGTTCGCCAGTGTGCTGGCCGAGGCGCAGCGGGTGCTGCGCCCAGGTGGAg > 2:126115/1‑148 (MQ=255) cgcAGTATCACGTGGTTGGCGACGCCGAGCGT‑TTGCCGCTGCGCGATGCCAGTGTCGACCTGGTGTTTTCCAG‑CCTGGCGGTGCAGTGGTGCGATCAGTTCGCCAGTGTGCTGGCCGAGGCGCAGCGGGTGCTGCGCCCAGGTGGAGTa > 3:159317/1‑149 (MQ=255) aGTATCACGTGGTTGGCGACGCCGAGCGT‑TTGCCGCTGCGCGATGCCAGTGTCGACCTGGTGTTTTCCAG‑CCTGGCGGTGCAGTGGTGCGATCAGTTCGCCAGTGTGCTGGCCGAGGCGCAGCGGGTGCTGCGCCCAGGTGGAGTACTg < 4:159317/149‑1 (MQ=255) tATCACGTGGTTGGCGACGCCGAGCGTGTTGCCGCTGCGCGATGCCAGTGTCGACCTGGTGTTTTCCAG‑CCTGGCGGTGCAGTGGTGCGATCAGTTCGCCAGTGTGCTGGCCGAGGCGCAGCGGGTGCTGCGCCCAGGTGGAGTACTgg > 1:15082/1‑149 (MQ=255) tCACGTGGTTGGCGACGCCGAGCGT‑TTGCCGCTGCGCGATGCCAGTGTCGACCTGGTGTTTTCCAG‑CCTGGCGGTGCAGTGGTGCGATCAGTTCGCCAGTGTGCTGGCCGAGGCGCAGCGGGTGCTGCGCCCAGGTGGAGTACTGGcc < 7:192426/148‑1 (MQ=255) aCGTGGTTGGCGACGCCGAGCGT‑TTGCCGCTGCGCGATGCCAGTGTCGACCTGGTGTTTTCCAG‑CCTGGCGGTGCAGTGGTGCGATCAGTTCGCCAGTGTGCTGGCCGAGGCGCAGCGGGTGCTGCGCCCAGGTGGAGTACTGGCCtt > 3:190320/1‑148 (MQ=255) aCGTGGTTGGCGACGCCGAGCGT‑TTGCCGCTGCGCGATGCCAGTGTCGACCTGGTGTTTTCCAG‑CCTGGCGGTGCAGTGGTGCGATCAGTTCGCCAGTGTGCTGGCCGAGGCGCAGCGGGTGCTGCGCCCAGGTGGAGTACTGGCCTTc < 5:81241/149‑1 (MQ=255) gTGGTTGGCGACGCCGAGCGT‑TTGCCGCTGCGCGATGCCAGTGTCGACCTGGTGTTTTCCAG‑CCTGGCGGTGCAGTGGTGCGATCAGTTCGCCAGTGTGCTGGCCGAGGCGCAGCGGGTGCTGCGCCCAGGTGGAGTACTGGCCTTcag > 5:339317/1‑149 (MQ=255) tGGTTGGCGACGCCGAGCGT‑TTGCCGCTGCGCGATGCCAGTGTCGACCTGGTGTTTTCCAG‑CCTGGCGGTGCAGTGGTGCGATCAGTTCGCCAGTGTGCTGGCCGAGGCGCAGCGGGTGCTGCGCCCAGGTGGAGTACTg > 6:88281/1‑140 (MQ=255) tGGTTGGCGACGCCGAGCGT‑TTGCCGCTGCGCGATGCCAGTGTCGACCTGGTGTTTTCCAG‑CCTGGCGGTGCAGTGGTGCGATCAGTTCGCCAGTGTGCTGGCCGAGGCGCAGCGGGTGCTGCGCCCAGGTGGAGTACTg < 5:88281/140‑1 (MQ=255) ttGGCGACGCCGAGCGT‑TTGCCGCTGCGCGATGCCAGTGTCGACCTGGTGTTTTCCAG‑CCTGGCGGTGCAGTGGTGCGATCAGTTCGCCAGTGTGCTGGCCGAGGCGCAGCGGGTGCTGCGCCCAGGTGGAGTACTGGCCTTCagcagc < 8:296260/149‑1 (MQ=255) tGGCGACGCCGAGCGT‑TTGCCGCTGCGCGATGCCAGTGTCGACCTGGTGTTTTCCAG‑CCTGGCGGTGCAGTGGTGCGATCAGTTCGCCAGTGTGCTGGCCGAGGCGCAGCGGGTGCTGCGCCCAGGTGGAGTACTGGCCTTCagcagc > 2:193519/1‑148 (MQ=255) tGGCGACGCCGAGCGT‑TTGCCGCTGCGCGATGCCAGTGTCGACCTGGTGTTTTCCAG‑CCTGGCGGTGCAGTGGTGCGATCAGTTCGCCAGTGTGCTGGCCGAGGCGCAGCGGGTGCTGCGCCCAGGTGGAGTACTGGCCTTCagcagc < 1:193519/148‑1 (MQ=255) ggCGACGCCGAGCGT‑TTGCCGCTGCGCAATGCCAGTGTCGACCTGGCGTTTTCCAG‑CCTGGCGGTGCAGTGGTGCGATCAGTTCGCCAGTGTGCTGGCCGAGGCGCAGCGGGTGCTGCGCCCAGGTGGAGTACTGGCCTTCAGCAGCCt > 5:17552/1‑149 (MQ=255) gCGACGCCGAGCGT‑TTGCCGCTGCGCGATGCCAGTGTCGACCTGGTGTTTTCCAG‑CCTGGCGGTGCAGTGGTACGATCAGTTCGCCAGTGTGCTGGCCGAGGCGCAGCGGGTGCTGCGCCCAGGTGGAGTACTGGCCTTCAGCAGCCtg > 2:164320/1‑149 (MQ=255) gCGACGCCGAGCGT‑TTGCCGCTGCGCAATGCCAGTGTCGACCTGGCGTTTTCCAG‑CCTGGCGGTGCAGTGGTGCGATCAGTTCGCCAGTGTGCTGGCCGAGGCGCAGCGGGTGCTGCGCCCAGGTGGAGTACTGGCCTTCAGCAGCCt < 6:17552/148‑1 (MQ=255) gCGACGCCGAGCGA‑TTGCCGCTGCGCGATGCCAGTGTCGACCTGGTGTTTTCCAG‑CCTGGCGGTGCAGTGGTGCGATCAGTTCGCCAGTGTGCTGGCCGGGGCGCAGCACCCGCTGCGcctcg < 8:83021/123‑4 (MQ=255) gCGACGCCGAGCGA‑TTGCCGCTGCGCGATGCCAGTGTCGACCTGGTGTTTTCCAG‑CCTGGCGGTGCAGTGGTGCGATCAGTTCGCCAGTGTGCTGGCCGGGGCGCAGCACCCGCTGCGcctcg > 7:83021/1‑120 (MQ=255) cGACGCCGAGCGT‑TTGCCGCTGCGCGATGCCAGTGTCGACCTGGTGTTTTCCAG‑CCTGGCGGTGCAGTGGTGCGATCAGTTCGCCAGTGTGCTGGCCGAGGCGCAGCGGGTGCTGCGCCCAGGTGGAGTACTGGCCTTCAGCAGCCtgt < 2:319432/149‑1 (MQ=255) ccGAGCGT‑TTGCCGCTGCGCGATGCCAGTGTCGACCTGGTGTTTTCCAG‑CCTGGCGGTGCAGTGGTGCGATCAGTTCGCCAGTGTGCTGGCCGAGGCGCAGCGGGTGCTGCGCCCAGGTGGAGTACTGGCCTTCAGCAGCCTGTGCGTg < 4:190320/149‑1 (MQ=255) cGAGCGT‑TTGCCGCTGCGCGATGCCAGTGTCGACCTGGTGTTTTCCAG‑CCTGGCGGTGCAGTGGTGCGATCAGTTCGCCAGTGTGCTGGCCGAGGCGCAGCGGGTGCTGCGCCCAGGTGGAGTACTGGCCTTCAGCAGCCTGTGCGTgg < 2:206185/149‑1 (MQ=255) cGAGCGT‑TTGCCGCTGCGCGATGCCAGTGTCGACCTGGTGTTTTCCAG‑CCTGGCGGTGCAGTGGTGCGATCAGTTCGCCAGTGTGCTGGCCGAGGCGCAGCGGGTGCTGCGCCCAGGTGGAGTACTGGCCTTCAGCAGCCTGTGCGTgg < 7:66070/149‑1 (MQ=255) cGAGCGT‑TTGCCGCTGCGCGATGCCAGTGTCGACCTGGTGTTTTCCAG‑CCTGGCGGTGCAGTGGTGCGATCAGTTCGCCAGTGTGCTGGCCGAGGCGCAGCGGGTGCTGCGCCCAGGTGGAGTACTGGCCTTCAGCAGCCTGTGCGTgg < 5:75536/149‑1 (MQ=255) cGAGCGT‑TTGCCGCTGCGCGATGCCAGTGTCGACCTGGTGTTTTCCAG‑CCTGGCGGTGCAGTGGTGCGATCAGTTCGCCAGTGTGCTGGCCGAGGCGCAGCGGGTGCTGCGCCCAGGTGGAGTACTGGCCTTCAGCAGCCTGTGCGTgg > 4:184338/1‑149 (MQ=255) cgATGCCAGTGTCGACCTGGTGTTTTCCAG‑CCTGGCGGTGCAGTGGTGCGATCAGTTCGCCAGTGTGCTGGCCGAGGCGCAGCGGGTGCTGCGCCCAGGTGGAGTACTGGCCTTCAGCAGCCTGTGCGTGGGCACCCTCGACGAACTgc > 3:308264/1‑149 (MQ=255) gCCAGTGTCGACCTGGTGTTTTCCAG‑CCTGGCGGTGCAGTGGTGCGATCAGTTCGCCAGTGTGCTGGCCGAGGCGCAGCGGGTGCTGCGCCCAGGTGGAGTACTGGCCTTCAGCAGCCTGTGCGTGGGCACCCTCGACGAACTgcgcgc > 3:126642/1‑149 (MQ=255) cAGTGTCGACCTGGTGTTTTCCAG‑CCTGGCGGTGCAGTGGTGCGATCAGTTCGCCAGTGTGCTGGCCGAGGCGCAGCGGGTGCTGCGCCCAGGTGGAGTACTGGCCTTCAGCAGCCTGTGCGTGGGCACCCTCGACGAACTgcgcgc > 8:190482/1‑147 (MQ=255) cAGTGTCGACCTGGTGTTTTCCAG‑CCTGGCGGTGCAGTGGTGCGATCAGTTCGCCAGTGTGCTGGCCGAGGCGCAGCGGGTGCTGCGCCCAGGTGGAGTACTGGCCTTCAGCAGCCTGTGCGTGGGCACCCTCGACGAACTgcgcgc > 8:195452/1‑147 (MQ=255) aGTGTCGACCTGGTGTTTTCCAG‑CCTGGCGGTGCAGTGGTGCGATCAGTTCGCCAGTGTGCTGGCCGAGGCGCAGCGGGTGCTGCGCCCAGGTGGAGTACTGGCCTTCAGCAGCCTGTGCGTGGGCACCCTCGACGAACTGCGCGCCAg > 1:185423/1‑149 (MQ=255) tCGACCTGGTGTTTTCCAG‑CCTGGCGGTGCAGTGGTGCGATCAGTTCGCCAGTGTGCTGGCCGAGGCGCAGCGGGTGCTGCGCCCAGGTGGAGTACTGGCCTTCAGCAGCCTGTGCGTGGGCACCCTCGACGAACTGCGCGCCAGCTgg > 5:136927/1‑149 (MQ=255) tGGTGTTTTCCAG‑CCTGGCGGTGCAGTGGTGCGATCAGTTCGCCAGTGTGCTGGCCGAGGCGCAGCGGGTGCTGCGCCCAGGTGGAGTACTGGCCTTCAGCAGCCTGTGCGTGGGCACCCTCGACGAACTGCGCGCCAGCTGGCAGGCg > 8:32304/1‑149 (MQ=255) ggTGTTTTCAAG‑CCTGGCGGTGCAGTGGTGCGATCAGTTCGCCAGTGTGCTGGCCGAGGCGCAGCGGGTGCTGCGCCCAGGTGGAGTACTGGCCTTCAGCAGCCTGTGCGTGGGCACCCTCGACGAACTGCGCGCCAGCTGGCAGGCgg > 4:143333/1‑149 (MQ=255) gtgtTTTCCAG‑CCTGGCGGTGCAGTGGTGCGATCAGTTCGCCAGTGTGCTGGCCGAGGCGCAGCGGGTGCTGCGCCCAGGTGGAGTACTGGCCTTCAGCAGCCTGTGCGTGGGCACCCTCGACGAACTGCGCGCCAGCTGGCAGGCGGt < 7:32304/149‑1 (MQ=255) ttttCCAG‑CCTGGCGGTGCAGTGGTGCGATCAGTTCGCCAGTGTGCTGGCCGAGGCGCAGCGGGTGCTGCGCCCAGGTGGAGTACTGGCCTTCAGCAGCCTGTGCGTGGGCACCCTCGACGAACTGCGCGCCAGCTGGCa < 6:310132/140‑1 (MQ=255) ttttCCAG‑CCTGGCGGTGCAGTGGTGCGATCAGTTCGCCAGTGTGCTGGCCGAGGCGCAGCGGGTGCTGCGCCCAGGTGGAGTACTGGCCTTCAGCAGCCTGTGCGTGGGCACCCTCGACGAACTGCGCGCCAGCTGGCa > 5:310132/1‑140 (MQ=255) ttttCCAG‑CCTGGCGGTGCAGTGGTGCGATCAGTTCGCCAGTGTGCTGGCCGAGGCGCAGCGGGTGCTGCGCCCAGGTGGAGTACTGGCCTTCAGCAGCCTGTGCGTGGGCACCCTCGACGAACTGCGCGCCAGCTGGCAGGCGGTgg < 1:126115/148‑1 (MQ=255) ttttCCAG‑CCTGGCGGTGCAGTGGTGCGATCAGTTCGCCAGTGTGCTGGCCGAGGCGCAGCGGGTGCTGCGCCCAGGTGGAGTACTGGCCTTCAGCAGCCTGTGCGTGGGCACCCTCGACGAACTGCGCGCCAGCTGGCAGGCGGTGGa < 6:219632/149‑1 (MQ=255) tCCAG‑CCTGGCGGTGCAGTGGTGCGATCAGTTCGCCAGTGTGCTGGCCGAGGCGCAGCGGGTGCTGCGCCCAGGTGGAGTACTGGCCTTCAGCAGCCTGTGCGTGGGCACCCTCGACGAACTGCGCGCCAGCTGGCAGGCGGTGGATg < 6:339317/148‑1 (MQ=255) cAG‑CCTGGCGGTGCAGTGGTGCGATCAGTTCGCCAGTGTGCTGGCCGAGGCGCAGCGGGTGCTGCGCCCAGGTGGAGTACTGGCCTTCAGCAGCCTGTGCGTGGGCACCCTCGACGAACTGCGCGCCAGCTGGCAGGCGGTGGATGGcc > 6:54580/1‑149 (MQ=255) cAG‑CCTGGCGGTGCAGTGGTGCGATCAGTTCGCCAGTGTGCTGGCCGAGGCGCAGCGGGTGCTGCGCCCAGGTGGAGTACTGGCCTTCAGCAGCCTGTGCGTGGGCACCCTCGACGAACTGCGCGCCAGCTGGCAGGCGGTGGATGGc < 2:15082/148‑1 (MQ=255) g‑CCTGGCGGTGCAGTGGTGCGATCAGTTCGCCAGTGTGCTGGCCGAGGCGCAGCGGGTGCTGCGCCCAGGTGGAGTACTGGCCTTCAGCAGCCTGTGCGTGGGCACCCTCGACGAACTGCGCGCCAGCTGGCAGGCGGTGGATGGCCTg < 4:126642/149‑1 (MQ=255) g‑CCTGGCGGTGCAGTGGTGCGATCAGTTCGCCAGTGTGCTGGCCGAGGCGCAGCGGGTGCTGCGCCCAGGTGGAGTACTGGCCTTCAGCAGCCTGTGCGTGGGCACCCTCGACGAACTGCGCGCCAGCTGGCAGGCGGTGGATGGCCTg > 3:284130/1‑149 (MQ=255) ccTGGCGGTGCAGTGGTGCGATCAGTTCGCCAGTGTGCTGGCCGAGGCGCAGCGGGTGCTGCGCCCAGGTGGAGTACTGGCCTTCAGCAGCCTGTGCGTGGGCACCCTCGACGAACTGCGCGCCAGCTGGCAGGCGGTGGATGGCCTgg < 3:184338/149‑1 (MQ=255) cTGGCGGTGCAGTGGTGCGATCAGTTCGCCAGTGTGCTGGCCGAGGCGCAGCGGGTGCTGCGCCCAGGTGGAGTACTGGCCTTCAGCAGCCTGTGCGTGGGCACCCTCGACGAACTGCGCGCCAGCTGGCAGGCGGTGGATGGCCTGGt > 2:51593/1‑149 (MQ=255) cGGTGCAGTGGTGCGATCAGTTCGCCAGTGTGCTGGCCGAGGCGCAGCGGGTGCTGCGCCCAGGTGGAGTACTGGCCTTCAGCAGCCTGTGCGTGGGCACCCTCGACGAACTGCGCGCCAGCTGGCAGGCGGTGGATGGCCTGGTGCAt < 4:54011/149‑1 (MQ=255) gTGCAGTGGTGCGATCAGTTCGCCAGTGTGCTGGCCGAGGCGCAGCGGGTGCTGCGCCCAGGTGGAGTACTGGCCTTCAGCAGCCTGTGCGTGGGCACCCTCGACGAACTGCGCGCCAGCTGGCAGGCGGTGGATGGCCTGGTGCATGt < 4:308264/149‑1 (MQ=255) gtggtgCGATCAGTTCGCCAGTGTGCTGGCCGAGGCGCAGCGGGTGCTGCGCCCAGGTGGAGTACTGGCCTTCAGCAGCCTGTGCGTGGGCACCCTCGACGAACTGCGCGCCAGCTGGCAGGCGGTGGATGGCCTGGTGCATGTAAAcc > 4:112994/1‑149 (MQ=255) tggtgCGATCAGTTCGCCAGTGTGCTGGCCGAGGCGCAGCGGGTGCTGCGCCCAGGTGGAGTACTGGCCTTCAGCAGCCTGTGCGTGGGCACCCTCGACGATCTGCGCGCCAGCTGGCAGGCGGTGGATGGCCTGGTGCATGTAAAc < 1:246282/147‑1 (MQ=255) tggtgCGATCAGTTCGCCAGTGTGCTGGCCGAGGCGCAGCGGGTGCTGCGCCCAGGTGGAGTACTGGCCTTCAGCAGCCTGTGCGTGGGCACCCTCGACGAACTGCGCGCCAGCTGGCAGGCGGTGGATGGCCTGGTGCATGTAAAc > 2:246282/1‑147 (MQ=255) gtgCGATCAGTTCGCCAGTGTGCTGGCCGAGGCGCAGCGGGTGCTGCGCCCAGGTGGAGTACTGGCCTTCAGCAGCCTGTGCGTGGGCACCCTCGACGAACTGCGCGCCAGCTGGCAGGCGGTGGATGGCCTGGTGCATGTAAACCGCt < 4:284130/149‑1 (MQ=255) gtgCGATCAGTTCGCCAGTGTGCTGGCCGAGGCGCAGCGGGTGCTGCGCCCAGGTGGAGTACTGGCCTTCAGCAGCCTGTGCGTGGGCACCCTCGACGAACTGCGCGCCAGCTGGCAGGAGGTGGATGGCCTGGTGCATGTAAACCGCt > 1:236210/1‑149 (MQ=255) gTTCGCCAGTGTGCTGGCCGAGGCGCAGCGGGTGCTGCGCCCAGGTGGAGTACTGGCCTTCAGCAGCCTGTGCGTGGGCACCCTCGACGAACTGCGCGCCAGCTGGCAGGCGGTGGATGGcc > 4:308439/1‑122 (MQ=255) gTTCGCCAGTGTGCTGGCCGAGGCGCAGCGGGTGCTGCGCCCAGGTGGAGTACTGGCCTTCAGCAGCCTGTGCGTGGGCACCCTCGACGAACTGCGCGCCAGCTGGCAGGCGGTGGATGGcc < 3:308439/122‑1 (MQ=255) gCTGGCCGAGGCGCAGCGGGTGCTGCGCCCAGGTGGAGTACTGGCCTTCAGCAGCCTGTGCGTGGGCACCCTCGACGAACTGCGCGCCAGCTGGCAGGCGGTGGATGGCCTGGTGCATGTAAACCGCTTCCGCCGTTTCGAAGACTAt > 5:253623/1‑148 (MQ=255) cTGGCCGAGGCGCAGCGGGTGCTGCGCCCAGGTGGAGTACTGGCCTTCAGCAGCCTGTGCGTGGGCACCCTCGACGAACTGCGCGCCAGCTGGCAGGCGGTGGATGGCCTGGTGCATGTAAACCGCTTCCGCCGttt < 2:92992/137‑1 (MQ=255) cTGGCCGAGGCGCAGCGGGTGCTGCGCCCAGGTGGAGTACTGGCCTTCAGCAGCCTGTGCGTGGGCACCCTCGACGAACTGCGCGCCAGCTGGCAGGCGGTGGATGGCCTGGTGCATGTAAACCGCTTCCGCCGttt > 1:92992/1‑137 (MQ=255) cTGGCCGAGGCGCAGCGGGTGCTGCGCCCAGGTGGAGTACTGGCCTTCAGCAGCCTGTGCGTGGGCACCCTCGACGAACTGCGCGCCAGCTGGCAGGCGGTGGATGGCCTGGTGCATGTAAACCGCTTCCGCCGTTTCGAAGACTATCa < 5:54580/149‑1 (MQ=255) cTGGCCGAGGCGCAGCGGGTGCTGCGCCCAGGTGGAGTACTGGCATTCAGCAGCCTGTGCGTGGGCACACTCGACGAACTGCGCGCCAGCTGGCAGGCGGTGGATGGCCTGGTGCAAGTAAACCGCTTCCGCCGTTTCGAAGACTAt > 2:276546/1‑147 (MQ=255) gCCGAGGCGCAGCGGGTGCTGCGCCCAGGTGGAGTACTGGCCTTCAGCAGCCTGTGCGTGGGCACCCTCGACGAACTGCGCGCCAGCTGGCAGGCGGTGGATGGCCTgg < 6:249509/109‑1 (MQ=255) gCCGAGGCGCAGCGGGTGCTGCGCCCAGGTGGAGTACTGGCCTTCAGCAGCCTGTGCGTGGGCACCCTCGACGAACTGCGCGCCAGCTGGCAGGCGGTGGATGGCCTgg > 5:249509/1‑109 (MQ=255) ccGAGGCGCAGCGGGTGCTGCGCCCAGGTGGAGTACTGGCCTTCAGCAGCCTGTGCGTGGGCACCCTCGACGAACTGCGCGCCAGCTGGCAGGCGGTGGATGCCCTGGTGCATGTAAACCGCTTCCGCCGTTTCGAAGACTATCAgcgc < 1:250867/149‑1 (MQ=255) cGAGGCGCAGCGGGTGCTGCGCCCAGGTGGAGTACTGGCCTTCAGCAGCCTGTGCGTGGGCACCCTCGACGAACTGCGCGCCAGCTGGCAGGCGGTGGATGGCCTGGTGCATGTAAACCGCTTCCGCCGTTTCGAAGACTATCAGCGcc > 2:175275/1‑149 (MQ=255) cGAGGCGCAGCGGGTGCTGCGCCCAGGTGGAGTACTGGCCTTCAGCAGCCTGTGCGTGGGCACCCTCGACGAACTGCGCGCCAGCTGGCAGGCGGTGGATGGCCTGGTGCATGTAAACCGCTTCCGCCGTTTCGAAGACTATCAGCGcc > 3:165454/1‑149 (MQ=255) gcAGCGGGTGCTGCGCCCAGGTGGAGTACTGGCCTTCAGCAGCCTGTGCGTGGGCACCCTCGACGAACTGCGCGCCAGCTGGCAGGCGGTGGATGGCCTGGTGCATGTAAACCGCTTCCGCCGTTTCGAAGACTATCAGCGCCTGTgcg < 1:175275/149‑1 (MQ=255) cAGCGGGTGCTGCGCCCAGGTGGAGTACTGGCCTTCAGCAGCCTGTGCGTGGGCACCCTCGACGAACTGCGCGCCAGCTGGCAGGCGGTGGATGGCCTGGTGCATGTAAACCGCTTCCGCCGTTTCGAAGACTATCAGCGCCTGTgcg > 2:168735/1‑148 (MQ=255) | GTCATGTCAAGGGTGGGGCGCAGTATCACGTGGTTGGCGACGCCGAGCGT‑TTGCCGCTGCGCGATGCCAGTGTCGACCTGGTGTTTTCCAG‑CCTGGCGGTGCAGTGGTGCGATCAGTTCGCCAGTGTGCTGGCCGAGGCGCAGCGGGTGCTGCGCCCAGGTGGAGTACTGGCCTTCAGCAGCCTGTGCGTGGGCACCCTCGACGAACTGCGCGCCAGCTGGCAGGCGGTGGATGGCCTGGTGCATGTAAACCGCTTCCGCCGTTTCGAAGACTATCAGCGCCTGTGCG > NC_002947/443289‑443576 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |