Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 5,329,091 | T→C | 6.1% | A43A (GCA→GCG) | PP_4689 ← | heme/hemin ABC transporter substrate‑binding protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,329,091 | 0 | T | C | 6.1% | 192.1 / 2.4 | 65 | A43A (GCA→GCG) | PP_4689 | heme/hemin ABC transporter substrate‑binding protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (36/25); new base C (2/2); total (38/27) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.35e-01 |
GCCCACCAGCACATCCGGGCGCAGGCTGAGGATGCCTTCGGCCGACAGTTGCCGCTGATAACCCACACTGGGCAAGGCTTTCAACGAGGCCGGGTGCTGACTGGTAGTGTCCACACCGACCAGGTGCGCTTCACCTCCCAATGCGGTTATCC‑ACTCGCTCAAGGCGCCACCCGCGCTGACCCAGCGTTGCGGCAGCTCGGCTGCCAAGGCTTGGGTAGAGAGCACAAGGCTTGCACACAGAGCGAGAAAAGCAGCTGGACGGCGCATCATCGGGTTCCTTCTGAAGGCG > NC_002947/5328950‑5329238 | gCCCACCAGCACATCCGGGCGCAGGCTGAGGATGCCTTCGGCCGACAGTTGCCGCTGATAACCCACACTGGGCAAGGCTTTCAACGAGGCCGGGTGCTGACTGGTAGTGTCCACACCGACCAGGTGCGCTTCACCTCCCAATGCGGTTa > 8:198792/1‑149 (MQ=255) ccaccaGCACATCCGGGCGCAGGCTGAGGATGCCTTCGGCCGACAGTTGCCGCTGATAACCCACACTGGGCAAGGCTTTCAACGAGGCCGGGTGCTGACTGGTAGTGTCCACACCGACCAGGTGCGCTTCACCTCCCAATGCGGTTATc < 7:200917/149‑1 (MQ=255) accaGCACATCCGGGCGCAGGCTGAGGATGCCTTCGGCCGACAGTTGCCGCTGATAACCCACACTGGGCAAGGCTTTCAACGAGGCCGGGTGCTGACTGGTAGTGTCCACACCGACCAGGTGCGCTTCACCTCCCAATGCg < 1:116333/141‑1 (MQ=255) accaGCACATCCGGGCGCAGGCTGAGGATGCCTTCGGCCGACAGTTGCCGCTGATAACCCACACTGGGCAAGGCTTTCAACGAGGCCGGGTGCTGACTGGTAGTGTCCACACCGACCAGGTGCGCTTCACCTCCCAATGCg > 2:116333/1‑141 (MQ=255) accaGCACATCCGGGCGCAGGCTGAGGATGCCTTCGGCCGACAGTTGCCGCTGATAACCCACACTGGGCAAGGCTTTCAACGAGGCCGGGTGCTGACTGGTAGTGTCCACACCGACCAGGTGCGCTTCACCTCCCAATGCGGTTATcc > 3:130127/1‑148 (MQ=255) gCACATCCGGGCGCAGGCTGAGGATGCCTTCGGGCGACAGTTGCCGCTGATAACCCACACTGGGCAAGGCTTTCAACGAGGCCGGGTGCTGACTGGTAGTGTCCACACCGACCAGGTGCGCTTCACCTCCCAATGCGGTTATCC‑ACTCg > 7:205524/1‑149 (MQ=255) cacaTCCGGGCGCAGGCTGAGGATGCCTTCGGCCGACAGTTGCCGCTGATAACCCACACTGGGCAAGGCTTTCAACGAGGCCGGGTGCTGACTGGTAGTGTCCACACCGACCAGGTGCGCTTCACCTCCCAATGCGGTTATCC‑ACTCGc < 3:225787/149‑1 (MQ=255) cGGGCGCAGGCTTAGGATGCCTTCGGCCGACAGTTGCCGCTGATAACCCACACTGGGCAAGGCTTTCAACTAGGCCGGGTGCTGACTGGTAGTGTCAACACCGACCAGGTGCGCTTCACCTCCCAATGCGGTTATCC‑ACTCGCTCAAgg < 5:175124/149‑1 (MQ=255) aGGCTGAGGATGCCTTCGGCCGACAGTTGCCGCTGTTAACCCACACTGGGCAAGGCTTTCAACGAGGCCGGGTGCTGACTGGTAGTGTCCACACCGACCAGGTGCGCTTCACCTCCCAATGCGGTTATCC‑ACTCGCTCAAGGCGCCAcc > 5:309198/1‑149 (MQ=255) aGGATGCCTTCGGCCGACAGTTGCCGCTGATAACCCACACTGGGCAAGGCTTTCAAGGAGGCCGGGTGCTGACTGGTAGTGTCCACACCGACCAGGTGCGCTTCACCTCCCAATGCGGTTATCC‑ACTCGCTCAAGGCGCCACCcgcg < 3:332683/147‑1 (MQ=255) aGGATGCCTTCGGCCGACAGTTGCCGCTGATAACCCACACTGGGCAAGGCTTTCAACGAGGCCGGGTGCTGACTGGTAGTGTCCACACCGACCAGGTGCGCTTCACCTCCCAATGCGGTTATCC‑ACTCGCTCAAGGCGCCACCCGCGCt < 8:250056/149‑1 (MQ=255) gATGCCTTCGGCCGACAGTTGCCGCTGATAACCCACACTGGGCAAGGCTTTCAACGAGGCCGGGTGCTGACTGGTAGTGTCCACACCGACCAGGTGCGCTTCACCTCCCAATGCGGTTATCC‑a > 2:156433/1‑123 (MQ=255) gATGCCTTCGGCCGACAGTTGCCGCTGATAACCCACACTGGGCAAGGCTTTCAACGAGGCCGGGTGCTGACTGGTAGTGTCCACACCGACCAGGTGCGCTTCACCTCCCAATGCGGTTATCC‑a < 1:156433/123‑1 (MQ=255) aTGCCTTCGGCCGACAGTTGCCGCTGATAACCCACACTGGGCAAGGCTTTCAACGAGGCCGGGTGCTGACTGGTAGTGTCCACACAGACCAGGTGCGCTTCACCTCCCAATGCGGTTATCC‑ACTCGCTCAAGGCGCACCCCGCGCTGAc > 4:252492/1‑149 (MQ=255) cTTCGGCCGACAGTTGCCGCTGATAACCCACACTGGGCAAGGCTTTCAACGAGGCCGGGTGCTGACTGGTAGTGTCCACACCGACCAGGTGCGCTTCACCTCCCAATGCGGTTATCC‑ACTCGCTCAAGGCGCCACCCGCGCTGACCCAg > 8:306287/1‑149 (MQ=255) cTTCGGCCGACAGTTGCCGCTGATAACCCACACTGGGCAAGGCTTTCAACGAGGCCGGGTGCTGACTGGTAGTGTCCACACCGACCAGGTGCGCTTCACCTCCCAATGCGGTTATCC‑ACTCGCTCAAGGCGCCACCCGCGCTGACCCAg > 5:173970/1‑149 (MQ=255) ttCGGCCGACAGTTGCCGCTGATAACCCACACTGGGCAAGGCTTTCAACGAGGCCGGGTGCTGACTGGTAGTGTCCACACCGACCAGGTGCGCTTCACCTCCCAATGCGGTTATCC‑ACTCGCTCAAGGCGGCCCCCGCGCTGCCCCAGc > 8:258096/1‑149 (MQ=255) ggCCGACAGTTGCCGCTGATAACCCACACTGGGCAAGGCTTTCAACGAGGCCGGGTGCTGACTGGTAGTGTCCACACCGACCAGGTGCGCTTCACCTCCCAATGCGGTTATCC‑ACTCGCTCAAGGCGCCACCCGCGCTGACCCAGCGtt < 4:130127/149‑1 (MQ=255) gCCGACAGTTGCCGCTGATAACCCACACTGGGCAAGGCTTTCAACGAGGCCGGGTGCTGACTGGTAGTGTCCACACCGACCAGGTGCGCTTCACCTCCCAATGCGGTTATCC‑ACTCGCTCAAGGCGCCACCCGCGCTGACCCAGCGTTg > 4:229894/1‑149 (MQ=255) ccGACAGTTGCCGCTGATAACCCACACTGGGCAAGGCTTTCAACGAGGCCGGGTGCTGACTGGTAGTGTCCACACCGACCAGGTGCGCTTCACCTCCCAATGCGGTTATCC‑ACTCGCTCAAGGCGCCACCCGCGCTGACCCAGCGTTGc < 3:196582/149‑1 (MQ=255) gACAGTTGCCGCTGTTAACCCACACTGGGCAAGGCTTTCAACGAGGCCGGGTGCTGACTGGTAGTGTCCACACCGACCAGGTGCGCTTCACCTCCCAATGCGGTTATCC‑ACTCGCTCAAGGCGCCACCCGCGCTGACCCAGCGTTGCgg < 6:309198/149‑1 (MQ=255) tAACCCACACTGGGCAAGGCTTTCAACGAGGCCGGGTGCTGACTGGTAGTGTCCACACCGACCAGGTGCGCTTCACCTCCCAATGCGGTTATCC‑ACTCGCTCAAGGCGCCACCCGCGCTGACCCAGCGTTGCGGCAGCTCGGCTGCCaa < 3:229894/149‑1 (MQ=255) ccACACTGGGCAAGGCTTTCAACGAGGCCGGGTGCTGACTGGTAGTGTCCACACCGCCCAGGTGCGCTTCACCTCCCAATGCGGTTATCC‑ACTCGCTCAAGTCGCAACCCGAGCTGACCCAGCGTTGCGGCAGCTCGGCTCCCAAGGCt > 4:67557/1‑149 (MQ=255) cacTGGGCAAGGCTTTCAACGAGGCCGGGTGCTGACTGGTAGTGTCCACACCGACCAGGTGCGCTTCACCTCCCAATGCGGTTATCC‑ACTCGCTCAAGGCGCCACCCGCGCTGACCCAGCGTTGCGGCAGCTCGGCTGCCAAGGCTTgg < 5:212810/149‑1 (MQ=255) gggCAAGGCTTTCAACGAGGCCGGGTGCTGACTGGTAGTGTCCACACCGACCAGGTGCGCTTCACCTCCCAACGCGGTTATCC‑ACTCGCTCAAGGCGCCACCCGCGCTGACCCAGCGTTGCGGCAGCTCGGCTGCCAAGGCTTGGGt < 2:96295/147‑1 (MQ=255) gggCAAGGCTTTCAACGAGGCCGGGTGCTGACTGGTAGTGTCCACACCGACCAGGTGCGCTTCACCTCCCAACGCGGTTATCC‑ACTCGCTCAAGGCGCCACCCGCGCTGACCCAGCGTTGCGGCAGCTCGGCTGCCAAGGCTTGGGt > 1:96295/1‑147 (MQ=255) ggCAAGGCTTTCAACGAGGCCGGGTGCTGACTGGTAGTGTCCACACCGACCAGGTGCGCTTCACCTCCCAATGCGGTTATCC‑ACTCGCTCAAGGCGCCACCCGCGCTGACCCAGCGTTGCGGCAGCTCGGCTGCCAAGGCTTGGGTa < 6:173970/147‑1 (MQ=255) tttCAACGAGGCCGGGTGCTGACTGGTAGTGTCCACACCGACCAGGTGCGCTTCACCTCCCAACGCGGTTATCC‑ACTCGCTCAAGGCGCCACCCGCGCTGACCCAGCGTTGCGGCAGCTCGGCt > 2:286028/1‑124 (MQ=255) tttCAACGAGGCCGGGTGCTGACTGGTAGTGTCCACACCGACCAGGTGCGCTTCACCTCCCAACGCGGTTATCC‑ACTCGCTCAAGGCGCCACCCGCGCTGACCCAGCGTTGCGGCAGCTCGGCt < 1:286028/124‑1 (MQ=255) tCAACGAGGCCGGGTGCTGACTGGTAGTGTCCACACCGACCAGGTGCGCTTCACCTCCCAATGCGGTTATCC‑ACTCGCTCAAGGCGCCACCCGCGCTGACCCAGCGTTGCGGCAGCTCGGCTGCCAAGGCTTGGGTAGAGAGCACAAgg > 3:326507/1‑149 (MQ=255) cAACGAGGCCGGGTGCTGACTGGTAGTGTCCACACCGACCAGGTGCGCTTCACCTCCCAATGCGGTTATCC‑ACTCGCTCAAGGCGCCACCCGCGCTGACCCAGCGTTGCGGCAGCTCGGCTGCCAAGGCTTGGGTAGAGAGCACAAgg < 7:198792/148‑1 (MQ=255) aaCGAGGCCGGGTGCTGACTGGTAGTGTCCACACCGACCAGGTGCGCTTCACCTCCCAATGCGGTTATCC‑ACTCGCTCAAGGCGCCACCCGCGCTGACCCAGCGTTGCGGCAGCTCGGCTGCCAAGGCTTGGGTAGAGAGCACAAGGCt > 2:261663/1‑149 (MQ=255) aaCGAGGCCGGGTGCTGACTGGTAGTGTCCACACCGACCAGGTGCGCTTCACCTCCCAATGCGGTTATCC‑ACTCGCTCAAGGCGCCACCCGCGCTGACCCAGCGTTGCGGCAGCTCGGCTGCCAAGGCTTGGGTAGAGAGCACAAGGCt > 6:130056/1‑149 (MQ=255) gCCGGGTGCTGACTGGTAGTGTCCACACCGACCAGGTGCGCTTCACCTCCCAATGCGGTTATCC‑ACTCGCTCAAGGCGCCACCCGCGCTGACCCAGCGTTGCGGCAGCTCGGCTGCCAAGGCTTGGGTAGAGAGCACAAGGCTTGcaca > 7:154310/1‑149 (MQ=255) gCCGGGTGCTGACTGGTAGTGTCCACACCGACCAGGTGCGCTTCACCTCCCAATGCGGTTATCC‑ACTCGCTCAAGGCGCCACCCGCGCTGACCCAGCGTTGCGGCAGCTCGGCTGCCAAGGCTTGGGTAGAGAGCACAAGGCTTGcaca > 3:135115/1‑149 (MQ=255) gggTGCTGACTGGTAGTGTCCACACCGACCAGGTGCGCTTCACCTCCCAATGCGGTTATCC‑ACTCGCTCAAGGCGCCACCCGCGCTGACCCAGCGTTGCGGCAGCTCGGCTGCCAAGGCTTGGGTAGAGAGCACAAGGCTTGcaca > 6:207451/1‑146 (MQ=255) gTGCTGACTGGTAGTGTCCACACCGACCAGGTGCGCTTCACCTCCCAATGCGGTTATCC‑ACTCGCTCAAGGCGCCACCCGCGCTGACCCAGCGTTGCGGCAGCTCGGCTGCCAAGGCTTGGGTAGAGAGCACAAGGCTTGCACACagag > 6:17953/1‑149 (MQ=255) tGCTGACTGGTAGTGTCCACACCGACCAGGTGCGCTTCACCTCCCAATGCGGTTATCC‑ACTCGCTCAAGGCGCCACCCGCGCTGACCCAGCGTTGCGGCAGCTCGGCTGCCAAGGCTTGGGTAGAGAGCACAAGGCTTGCACACAGAGc < 3:89755/149‑1 (MQ=255) cTGACTGGTAGTGTCCACACCGACCAGGTGCGCTTCACCTCCCAATGCGGTTATCC‑ACTCGCTCAAGGCGCCACCCGCGCTGACCCAGCGTTGCGGCAGCTCGGCTGCCAAGGCTTGGGTAGAGAGCACAAGGCTTGCACACAGAGCga < 8:154310/149‑1 (MQ=255) tGACTTGTAGTGTCCACACAGACCAGGTGCGCTTCAACTCCCAATGCGGTTATCC‑ACTCGCTCAAGGCGCCACCCGCGCTGACCCAGCGTTGCGGCAGCTCGGCTGCCAAGGCTTGGGTAGAGAGCACAAGGCTTGCACACAGAGCgag < 3:252492/149‑1 (MQ=255) tGACTGGTAGTGTCCACACCGACCAGGTGCGCTTCACCTCCCAATGCGGTTATCC‑ACTCGCTCAAGGCGCCACCCGCGCTGACCCAGCGTTGCGGCAGCTCGGCTGCCAAGGCTTGGGTAGAGAGCACAAGGCTTGCACACAGAGc > 8:35592/1‑146 (MQ=255) aCTGGTAGTGTCCACACCGACCAGGTGCGCTTCACCTCCCAATGCGGTTATCC‑ACTCGCTCAAGGCGCCACCCGCGCTGACCCAGCGTTGCGGCAGCTCGGCTGCCCAGGCTTGGGTAGAGAGCACAAGGCTTGCACACAGAGCgaga > 8:251210/1‑148 (MQ=255) tGGTAGTGTCCACACCGACCAGGTGCGCTTCACCTCCCAATGCGGTTATCCGACACGCTCAAGGCGCCACCCGCGATGACCCAGCGTTGCGGCAGCTCGGATGCCAAGGCTTGGGTAGAGAGCACAAGCCTTCCACACAGAGCGAGaa > 1:85360/1‑148 (MQ=255) gTAGTGTCCACACCGACCAGGTGCGCTTCACCTCCCAATGCGGTTATCC‑ACTCGCTCAAGGCGCCACCCGCGCTGACCCAGCGTTGCGGCAGCTCGGCTGCCAAGGCTTGGGTAGAGAGCACAAGGCTTGCACACAGAGCGAGaaaa < 5:17953/147‑1 (MQ=255) gTAGTGTCCACACCGACCAGGTGCGCTTCACCTCCCAATGCGGTTATCC‑ACTCGCTCAAGGCGCCACCCGCGCTGACCCAGCGTTGCGGCAGCTCGGCTGCCAAGGCTTGGGTAGAGAGCACAAGGCTTGCACACAGAGCGAGAAAag > 4:328861/1‑148 (MQ=255) tAGTGTCCACACCGACCAGGTGCGCTTCACCTCCCAATGCGGTTATCC‑ACTCGCTCAAGGCGCCACCCGCGCTGACCCAGCGTTGCGGCAGCTCGGCTGCCAAGGCTTGGGTAGAGAGCACAAGGCTTGCACACAGAGCGAGAAAag > 7:84323/1‑147 (MQ=255) tCCACACCGACCAGGTGCGCTTCACCTCCCAATGCGGTTATCC‑ACTCGCTCAAGGCGCCACCCGCGCTGACCCAGCGTTGCGGCAGCTCGGCTGCCAAGGCTTGGGTAGAGAGCACAAGGCTTGCACACAGAGCGAGAAAAGCAGCTgg > 4:96444/1‑149 (MQ=255) acacCGACCAGGTGCGCTTCACCTCCCAATGCGGTTATCC‑ACTTGCTCAAGGCGCCACCCGCGCTGACCCAGCGTTGCGGCAGCTCGGCTGCCAAGGCTTGGGTAGAGAGCACAAGGCTTGCACACAGAGCGAGAAAAGCAGCTGGACg > 6:258722/1‑149 (MQ=255) acacCGACCAGGTGCGCTTCACCTCCCAATGCGGTTATCC‑ACTCGCTCAAGGCGCCACCCGCGCTGACCCAGCGTTGCGGCAGCTCGGCTGCCAAGGCTTGGGTAGAGAGCACAAGGCTTGCACACAGAGCGAGAAAAGCAGCTGGACg > 1:116504/1‑149 (MQ=255) acacCGACCAGGTGCGCTTCACCTCCCAATGCGGTTATCC‑ACTCGCTCAAGGCGCCACCCGCGCTGACCCAGCGTTGCGGCAGCTCGGCTGCCAAGGCTTGGGTAGAGAGCACAAGGCTTGCACACAGAGCGAGAAAAGCAGCTGGACg > 6:142129/1‑149 (MQ=255) cacCGACCAGGTGCGCTTCACCTCCCAATGCGGTTATCC‑ACTCGCTCAAGGCGCCACCCGCGCTGACCCAGCGTTGCGGCAGCTCGGCTGCCAAGGCTTGGGTAGAGAGCACAAGGCTTGCACACagag < 7:172263/129‑1 (MQ=255) cacCGACCAGGTGCGCTTCACCTCCCAATGCGGTTATCC‑ACTCGCTCAAGGCGCCACCCGCGCTGACCCAGCGTTGCGGCAGCTCGGCTGCCAAGGCTTGGGTAGAGAGCACAAGGCTTGCACACagag > 8:172263/1‑129 (MQ=255) cGACCAGGTGCGCTTCACCTCCCAATGCGGTTATCC‑ACTCGCTCAAGGCGCCACCCGCGCTGACCCAGCGTTGCGGCAGCTCGGCTGCCAAGGCTTGGGTAGAGAGCACAAGGCTTGCACACAGAGCGAGAAAAGCAGCTGGACGgcgc < 2:85360/149‑1 (MQ=255) cGACCAGGTGCGCTTCACCTCCCAATGCGGTAATCC‑ACTCGCTCAAGGCGCCACCCGCGCTGACCCAGCGTTGCGGCAGCTCGGCTGCCAAGGCTTGGGTAGAGAGCACAAGGCTTGCACACAGAGCgag < 2:86631/130‑1 (MQ=255) cGACCAGGTGCGCTTCACCTCCCAATGCGGTAATCC‑ACTCGCTCAAGGCGCCACCCGCGCTGACCCAGCGTTGCGGCAGCTCGGCTGCCAAGGCTTGGGTAGAGAGCACAAGGCTTGCACACAGAGCgag > 1:86631/1‑130 (MQ=255) ggTGCGCTTCACCTCCCAATGCGGTTATCC‑ACTCGCTCAAGGCGCCACCCGCGCTGACCCAGCGTTGCGGCAGCTCGGCTGCCAAGGCTTGGGTAGAGAGCACAAGGCTTGCACACAGAGCGAGAAAAGCAGCTGGACGGCGCatcatc > 1:8836/1‑149 (MQ=255) tGCGCTTCACCTCCCAATGCGGTTATCC‑ACTCGCTCAAGGCGCCACCCGCGCTGACCCAGCGTTGCGGCAGCTCGGCTGCCAAGGCTTGGGTAGAGAGCACAAGGCTTGCACACAGAGCGAGAAAAGCAGCTGGACGGCGCATCATCgg < 8:205524/149‑1 (MQ=255) cgcTTCACCTCCCAATGCGGTTATCC‑ACTCGCTCAAGGCGCCACCCGCGCTGACCCAGCGTTGCGGCAGCTCGGCTGCCAAGGCTTGGGTAGAGAGCACAAGGCTTGCACACAGAGCGAGAAAAGCAGCTGGACGGCGCATCATCggg < 4:326507/148‑1 (MQ=255) gcTTCACCTCCCAATGCGGTTATCC‑ACTCGCTCAAGGCGCCACCCGCGCTGACCCAGCGTTGCGGCAGCTCGGCTGCCAAGGCTTGGGTAGAGAGCACAAGGCTTGCACACAGAGCGAGAAAAGCAGCTGGACGGCGCATCATCGGGtt < 4:135115/149‑1 (MQ=255) aCCTCCCAATGCGGTTATCC‑ACTCGCTCAAGGCGCCACCCGCGCTGACCCAGCGTTGCGGCAGCTCGGCTGCCAAGGCTTGGGTAGAGAGCACAAGGCTTGCACACAGAGCGAGAAAAGCAGCTGGACGGCGCATCATCGGGTTCCTTc < 3:67557/149‑1 (MQ=255) cTCCCAATGCGGTTATCC‑ACTCGCTCAAGGCGCCACCCGCGCTGACCCAGCGTTGCGGCAGCTCGGCTGCCAAGGCTTGGGTAGAGAGCACAAGGCTTGCACACAGAGCGAGAAAAGCAGCTGGACGGCGCATCATCGGGTTCCTTCt > 2:198409/1‑148 (MQ=255) tCCCAATGCGGTTATCC‑ACTCGCTCAAGGCGCCACCCGCGCTGACCCAGCGTTGCGGCAGCTCGGCTGCCAAGGCTTGGGTAGAGAGCACAAGGCTTGCACACAGAGCGAGAAAAGCAGCTGGACGGCGCATCATCGGGTTCCTTCTg > 7:170331/1‑148 (MQ=255) ccAATGCGGTTATCC‑ACTCGCTCAAGGCGCCACCCGCGCTGACCCAGCGTTGCGGCAGCTCGGCTGCCAAGGCTTGGGTAGAGAGCACAAGGCTTGCACACAGAGCGAGAAAAGCAGCTGGACGGCGCATCATCGGGTTCCTTCTGAAg > 8:145510/1‑149 (MQ=255) aaTGCGGTTATCC‑ACTCGCTCAAGGCGCCACCCGCGCTGACCCAGCGTTGCGGCAGCTCGGCTGCCAAGGCTTGGGTAGAGAGCACAAGGCTTGCACACAGAGCGAGAAAAGCAGCTGGACGGCGCATCATCGGGTTCCTTCTGAAGGc > 2:276307/1‑149 (MQ=255) aTGCGGTTATCC‑ACTCGCTCAAGGCGCCACCCGCGCTGACCCAGCGTTGCGGCAGCTCGGCTGCCAAGGCTTGGGTAGAGAGCACAAGGCTTGCACACAGAGCGAGAAAAGCAGCTGGACGGCGCATCATCGGGTTCCTTCTGAAGGCg > 3:263010/1‑149 (MQ=255) | GCCCACCAGCACATCCGGGCGCAGGCTGAGGATGCCTTCGGCCGACAGTTGCCGCTGATAACCCACACTGGGCAAGGCTTTCAACGAGGCCGGGTGCTGACTGGTAGTGTCCACACCGACCAGGTGCGCTTCACCTCCCAATGCGGTTATCC‑ACTCGCTCAAGGCGCCACCCGCGCTGACCCAGCGTTGCGGCAGCTCGGCTGCCAAGGCTTGGGTAGAGAGCACAAGGCTTGCACACAGAGCGAGAAAAGCAGCTGGACGGCGCATCATCGGGTTCCTTCTGAAGGCG > NC_002947/5328950‑5329238 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |