Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 5,461,652 | G→A | 5.7% | A198T (GCG→ACG) | PP_4798 → | membrane‑bound lytic murein transglycosylase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,461,652 | 0 | G | A | 5.7% | 214.4 / 2.1 | 70 | A198T (GCG→ACG) | PP_4798 | membrane‑bound lytic murein transglycosylase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (28/38); new base A (2/2); total (30/40) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.79e-01 |
TGGCGTGGACCGCCAGGTGCTGGTCGCGGTGTGGGGCATGGAAAGCAACTTCGGCCAGTTCCAGGGCAGCAAGTCGGTGATCCGCTCGCTGGCCACTTTGGCCTATGAGGGCCGCCGCCCACAGTTCGCCCAGGATCAGCTGATTGCCGCGCTGCAGATCATCCAGCATGGTGACATCCAGCCTGAAGCCATGCGTGGCTCGTGGGCCGGCGCCATGGGCCAGACCCAGTTCATCCCGACCACCTACAACACCCATGCCGTGGACTTCGACGGCGATGGCCGCCGCGACATCTGG > NC_002947/5461504‑5461798 | tGGCGTGGACCGCCAGGTGCTGGTCGCGGTGTGGGGCATGGAAAGCAACTTCGTCCAGTTCCAGGGCAGCAAGTCGGTGATCCGCTCGCTGGCCACTTTGGCCTATGAGGGCCGCCGCCCACAGTTCGCCCAGGATCAGCTGATTGCcg < 8:264442/149‑1 (MQ=255) tGGACCGCCAGGTGCTGGTCGCGGTGTGGGGCATGGAAAGCAACTTCGGCCAGTTCCAGGGCAGCAAGTCGGTGATCCGCTCGCTGGCCACTTTGGCCTATGAGGGCCTCCGCCCACAGTTCGCCCAGGATCAGCTGATTGCCGCGCTg < 6:337865/149‑1 (MQ=255) tGGACCGCCAGGTGCTGGTCGCGGTGTGGGGCATGGAAAGCAACTTCGGCCAGTTCCAGGGCAGCAAGTCGGTGATCCGCTCGCTGGCCACTTTGGCCTATGAGGGCCGCCGCCCACAGTTCGCCCAGGATCAGCTGATTGCCGCGCTg < 6:120803/149‑1 (MQ=255) tGGACCGCCAGGTGCTGGTCGCGGTGTGGGGCATGGAAAGCAACTTCGGCCAGTTCCAGGGCAGCAAGTCGGTGATCCGCTCGCTGGCCACTTTGGCCTATGAGGGCCGCCGCCCACAGTTCGCCCAGGATCAGCTGATTGCCGCGCTg < 3:267790/149‑1 (MQ=255) aCCGCCAGGTGCTGGTCGCGGTGTGGGGCATGGAAAGCAACTTCGGCCAGTTCCAGGGCAGCAAGTCGGTGATCCGCTCGCTGGCCACTTTGGCCTATGAGGGCCGCCGCCCACAGTTCGCCCAGGATCAGCTGATTGCCGCGCTg > 7:266330/1‑146 (MQ=255) cGCCAGGTGCTGGTCGCGGTGTGGGGCATGGAAAGCAACTTCGGCCAGTTCCAGGGCAGCAAGTCGGTGATCCGCTCGCTGGCCACTTTGGCCTATGAGGGCCGCCGCCCACAGTTCGCCCAGGATCAGCTGATTGCCGCGCTg > 5:347542/1‑144 (MQ=255) cGCCAGGTGCTGGTCGCGGTGTGGGGCATGGAAAGCAACTTCGGCCAGTTCCAGGGCAGCAAGTCGGTGATCCGCTCGCTGGCCACTTTGGCCTATGAGGGCCGCCGCCCACAGTTCGCCCAGGATCAGCTGATTGCCGCGCTg > 6:136901/1‑144 (MQ=255) gCCAGGTGCTGGGCGCGGGGTGGGGCATGGAAATCAACTTCGGCCAGTTCCAGGGCAGCAAGTCGGTGATCCGCTCGCTGGCCACTTTGGCCTATGCGGGCCGCCGCCCACAGTTCGCCCAGGATCAGCTGATTGCCGCGCTGCAGatc < 8:184638/149‑1 (MQ=255) aGGTGCTGGTCGCGGTGTGGGGCATGGAAAGCAACTTCGGCCAGTTCCAGGGCAGCAAGTCGGTGATCCGCTCGCTGGCCACTTTGGCCTATGAGGGCCGCCGCCCACAGTTCGCCCAGGATCAGCTGATTGCCGCGCTGCAGatcatc < 3:171578/149‑1 (MQ=255) tCGCGGTGTGGGGCATGGAAAGCAACTTCGGCCAGTTCCAGGGCAGCAAGTCGGTGATCCGCTCGCTGGCCACTTTGGCCTATGAGGGCCGCCGCCCACAGTTCGCCCAGGATCAGCTGATTGCCGCGCTGCAGATCATCCAGCATGGt > 2:330938/1‑149 (MQ=255) cgGTGTGGGGCATGGAAAGCAACTTCGGCCAGTTCCAGGGCAGCAAGTCGGTGATCCGCTCGCTGGCCACTTTGGCCTATGAGGGCCGCCGCCCACAGTTCGCCCAGGATCAGCTGATTGCCGCGCTGCAGATCATCCAGCATGGTGAc < 3:25616/149‑1 (MQ=255) tgGGGCATGGAAAGCAACTTCGGCCAGTTCCAGGGCAGCAAGTCGGTGATCCGCTCGCTGGCCACTTTGGCCTATGAGGGCCGCCGCCCACAGTTCGCCCAGGATCAGCTGATTGCCGCGCTGCAGATCATCCAGCATGGTGACATcc < 7:39709/148‑1 (MQ=255) tgGGGCATGGAAAGCAACTTCGGCCAGTTCCAGGGCAGCAAGTCGGTGATCCGCTCGCTGGCCACTTTGGCCTATGAGGGCCGCCGCCCACAGTTCGCCCAGGATCAGCTGATTGCCGCGCTGCAGATCATCCAGCATGGTGACATc > 5:213696/1‑147 (MQ=255) gggCATGGAAAGCAACTTCGGCCAGTTCCAGGGCAGCAAGTCGGTGATCCGCTCGCTGGCCACTTTGGCCTATGAGGGCCGCCGCCCACAGTTCGCCCAGGATCAGCTGATTGCCGCGCTGCAGATCATCCAGCATGGTGACATCCAg < 7:167079/148‑1 (MQ=255) gggCATGGAAAGCAACTTCGGCCAGTTCCAGGGCAGCAAGTCGGTGATCCGCTCGCTGGCCACTTTGGCCTATGAGGGCCGCCGCCCACAGTTCGCCCAGGATCAGCTGATTGCCGCGCTGCAGATCATCCAGCATGGTGACATCCAg < 7:57808/148‑1 (MQ=255) ggCATGGAAAGCAACTTCGGCCAGTTCCAGGGCAGCAAGTCGGTGATCCGCTCGCTGGCCACTTTGGCCTATGAGGGCCGCCGCCCACAGTTCGCCCAGGATCAGCTGATTGCCGCGCTGCAGATCATCCAGCATGGTGACATCCAGcc < 1:204927/149‑1 (MQ=255) gCATGGAAAGCAACTTCGGCCAGTTCCAGGGCAGCAAGTCGGTGATCCGCTCGCTGGCCACTTTGGCCTATGAGGGCCGCCGCCCACAGTTCGCCCAGGATCAGCTGATTGCCGCGCTGCAGatcat < 3:279699/127‑1 (MQ=255) gCATGGAAAGCAACTTCGGCCAGTTCCAGGGCAGCAAGTCGGTGATCCGCTCGCTGGCCACTTTGGCCTATGAGGGCCGCCGCCCACAGTTCGCCCAGGATCAGCTGATTGCCGCGCTGCAGatcat > 4:279699/1‑127 (MQ=255) tGGAAAGCAACTTCGGCCAGTTCCAGGGCAGCAAGTCGGTGATCCGCTCGCTGGCCACTTTGGCCTATGAGGGCCGCCGCCCACAGTTCGCCCAGGATCAGCTGATTGCCGCGCTGCAGATCATCCAGCATGGTGACATCCAGCCTGaa < 1:335672/149‑1 (MQ=255) ggAAAGCAACTTCGGCCAGTTCCAGGGCAGCAAGTCGGTGATCCGCTCGCTGGCCACTTTGGCCTATGAGGGCCGCCGCCCACAGTTCGCCCAGGATCAGCTGATTGCCGCGCTGCAGATCATCCAGCATGGTGACATCCAGCCTGAAg > 6:293724/1‑149 (MQ=255) aaaGCAACTTCGGCCAGTTCCAGGGCAGCAAGTCGGTGATCCGCTCGCTGGCCACTTTGGCCTATGAAGGCCGCCGCCCACAGTTCGCCCAGGATCAGCTGATTGCCGCGCTGCAGATCATCCAGCATGGTGACATCCAGCCTGAAGc > 1:1964/1‑148 (MQ=255) aaGCAACTTCGGCCAGTTCCAGGGCAGCAAGTCGGTGATCCGCTCGCTGGCCACTTTGGCCTATGAGGGCCGCCGCCCACAGTTCGCCCAGGATCAGCTGATTGCCACGCTGCAGATCATCCAGCATGGTGACATCCAGCCTGAAGCCa > 3:302948/1‑149 (MQ=255) aGCAACTTCGGCCAGTTCCAGGGCAGCAAGTCGGTGATCCGCTCGCTGGCCACTTTGGCCTATGAGGGCCGCCGCCCACAGTTCGCCCAGGATCAGCTGATTGCCGCGCTGCAGATCATCCAGCATGGTGACATCCAGCCTGAAGCCAt > 6:30896/1‑149 (MQ=255) cAACTTCGGCCAGTTCCAGGGCAGCAAGTCGGTGATCCGCTCGCTGGCCACTTTGGCCTATGAGGGCCGCCGCCCACAGTTCGCCCAGGATCAGCTGATTGCCGCGCTGCAGATCATCCAGCATGGTGACATCCAGCCTGAAGCCATGc > 3:67795/1‑149 (MQ=255) aCTTCGGCCAGTTCCAGGGCAGCAAGTCGGTGATCCGCTCGCTGGCCACTTTGGCCTATGAGGGCCGCCGCCCACAGTTCGCCCAGGATCAGCTGATTGCCGCGCTGCAGATCATCCAGCATGGTGACATCCAGCCTGAAGCCATGCGt < 8:50356/149‑1 (MQ=255) tCGGCCAGTTCCAGGGCAGCAAGTCGGTGATCCGCTCGCTGGCCACTTTGGCCTATGAGGGCCGCCGCCCACAGTTCGCCCAGGATCAGCTGATTGCCGCGCTGCAGATCATCCAGCATGGTGACATCCAGCCTGAAGCCATGCGTGGc > 5:151195/1‑149 (MQ=255) cGGCCAGTTCCAGGGCAGCAAGTCGGTGATCCGCTCGCTGGCCACTTTGGCCTATGAGGGCCGCCGCCCACAGTTCGCCCAGGATCAGCTGATTGCCGCGCTGCAGATCATCCAGCATGGTGACATCCAGCCTGAAGCCATGCGTgg < 2:270115/147‑1 (MQ=255) gCCAGTTCCAGGGCAGCAAGTCGGTGATCCGCTCGCTGGCCACTTTGGCCTATGAGGGCCGCCGCCCACAGTTCGCCCAGGATCAGCTGATTGCCGCGCTGCAGATCATCCAGCATGGTGACATCCAGCCTGAAGCCAt < 4:58921/139‑1 (MQ=255) gCCAGTTCCAGGGCAGCAAGTCGGTGATCCGCTCGCTGGCCACTTTGGCCTATGAGGGCCGCCGCCCACAGTTCGCCCAGGATCAGCTGATTGCCGCGCTGCAGATCATCCAGCATGGTGACATCCAGCCTGAAGCCAt > 3:58921/1‑139 (MQ=255) ggCAGCAAGTCGGTGATCCGCTCGCTGGCCACTTTGGCCTATGAGGGCCGCCGCCCACAGTTCGCCCAGGATCAGCTGATTGCCGCGCTGCAGATCATCCAGCATGGTGACATCCAGCCTGAAGCCATGCGTGGCTCGTGGGCCGgcgc > 7:268932/1‑149 (MQ=255) gcaAGTCGGTGATCCGCTCGCTGGCCACTTTGGCCTATGAGGGCCGCCGCCCACAGTTCGCCCAGGATCAGCTGATTGCCGCGCTGCAGATCATCCAGCATGGTGACATCCAGCCTGAAGCCATGCGTGGCTCGTGGGCCGGCGCCATg > 2:76570/1‑149 (MQ=255) gcaAGTCGGTGATCCGCTCGCTGGCCACTTTGGCCTATGAGGGCCGCCGCCCACAGTTCGCCCAGGATCAGCTGATTGCCGCGCTGCAGATCATCCAGCATGGTGACATCCAGCCTGAAGCCATGCGTGGCTCGTGGGCCGGCGCCATg > 2:71661/1‑149 (MQ=255) caAGTCGGTGATCCGCTCGCTGGCCACTTTGGCCTATGAGGGCCGCCGCCCACAGTTCGCCCAGGATCAGCTGATTGCCGCGCTGCAGATCATCCAGCATGGTGACATCCAGCCTGAAGCCATGCGTGGCTCGTGGGCCGGCGCCATgg < 6:213696/149‑1 (MQ=255) caAGTCGGTGATCCGCTCGCTGGCCACTTTGGCCTATGAGGGCCGCCGCCCACAGTTCGCCCAGGATCAGATGATTGCCGCGCTGCAGATCATCCAGCATGGTGACATCCAGCCTGAAGCCATGCGTGGCTCGTGGGCCGGCGCCATgg < 7:220416/149‑1 (MQ=255) ggTGATCCGCTCGCTGGCCACTTTGGCCTATGAGGGCCGCCGCCCACAGTTCGCCCAGGATCAGCTGATTGCCGCGCTGCAGATCATCCAGCATGGTGACATCCAGCCTGAAGCCATGCGTGGCTCGTGGGCCGGCGCCATGGGCCAGa < 5:30896/149‑1 (MQ=255) tGATCCGCTCGCTGGCCACTTTGGCCTATGAGGGCCGCCGCCCACAGTTCGCCCAGGATCAGCTGATTGCCGCGCTGCAGATCATCCAGCATGGTGACATCCAGCCTGAAGCCATGCGTGGCTCGTGGGCCGGCGCCATGGGCCAGAcc < 4:253105/149‑1 (MQ=255) gATCCGCTCGCTGGCCACTTTGGCCTATGAGGGCCGCCGCCCACAGTTCGCCCAGGATCAGCTGATTGCCGCGCTGCAGATCATCCAGCATGGTGACATCCAGCCTGAAGCCATGCGTGGCTCGTGGGCCGGCGCCATGGGCCAGAcc > 5:151138/1‑148 (MQ=255) tCCGCTCGCTGGCCACTTTGGCCTATGAGGGCCGCCGCCCACAGTTCGCCCAGGATCAGCTGATTGCCGCGCTGCAGATCATCCAGCATGGTGACATCCAGCCTGAAGCCATGCGTGGCTCGTGGGCCGGCGCCATGGGCCAGACCCAg < 5:136901/149‑1 (MQ=255) cgctcgctGGCCACTTTGGCCTATGAGGGCCGCCGCCCACAGTTCGCCCAGGATCAGCTGATTGCCGCGCTGCAGATCATCCAGCATGGTGACATCCAGCCTGAAGCCATGCGTGGCTCGTGGGCCGGCGCCATGGGCCAGACCCAGt < 4:67795/148‑1 (MQ=255) gctcgctGGCCACTTTGGCCTATGAGGGCCGCCGCCCACAGTTCGCCCAGGATCAGCTGATTGCCGCGCTGCAGATCATCCAGCATGGTGACATCCAGCCTGAAGCCATGCGTg > 7:239936/1‑114 (MQ=255) gctcgctGGCCACTTTGGCCTATGAGGGCCGCCGCCCACAGTTCGCCCAGGATCAGCTGATTGCCGCGCTGCAGATCATCCAGCATGGTGACATCCAGCCTGAAGCCATGCGTg < 8:239936/114‑1 (MQ=255) gctcgctGGCCACTTTGGCCTATGAGGGCCGCCGCCCACAGTTCGCCCAGGATCAGCTGATTGCCACGCTGCAGATCATCCAGCATGGTGACATCCAGCCTGAAGCCATGCGTGGCTCGTGGGCCGGCGCCATGGGCCAGACCCAGTTc < 4:302948/149‑1 (MQ=255) gctGGCCACTTTGGCCTATGAGGGCCGCCGCCCACAGTTCGCCCAGGATCAGCTGATTGCCGCGCTGCAGATCATCCAGCATGGTGACATCCAGCCTGAAGCCATGCGTGGCTCGTGGGCCGGCGCCATGGGCCAGACCCAGTTCATcc < 6:151195/149‑1 (MQ=255) ctGGCCACTTTGGCCTATGAGGGCCGCCGCCCACAGTTCGCCCAGGATCAGCTGATTGCCGCGCTGCAGATCATCCAGCATGGTGACATCCAGCCTGAAGCCATGTGTGGCTCGTGGGCCGGCGCCATGGGCCAGACCCAGTTCATccc < 6:347542/149‑1 (MQ=255) cTTTGGCCTATGAGGGCCGCCGCCCACAGTTCGCCCAGGATCAGCTGATTGCCGCGCTGCAGATCATCCAGCATGGTGACATCCAGCCTGAAGCCATGCGTGGCTCGTGGGCCGGCGCCATGGGCCAGACCCAGTTCATCCCGaccacc < 1:76570/149‑1 (MQ=255) cTTTGGCCTATGAGGGCCGCCGCCCACAGTTCGCCCAGGATCAGCTGATTGCCGCGCTGCAGATCATCCAGCATGGTGACATCCAGCCTGAAGCCATGCGTGGCTCGTGGGCCGGCGCCATGGGCCAGACCCAGTTCATCCCGaccacc < 1:71661/149‑1 (MQ=255) tGGCCTATGAGGGCCGCCGCCCACAGTTCGCCCAGGATCAGCTGATTGCCGCGCTGCAGATCATCCAGCATGGt > 4:251955/1‑74 (MQ=255) tGGCCTATGAGGGCCGCCGCCCACAGTTCGCCCAGGATCAGCTGATTGCCGCGCTGCAGATCATCCAGCATGGt < 3:251955/74‑1 (MQ=255) gCCTATGAGGGCCGCCGCCCACAGTTCGCCCAGGATCAGCTGATTGCCACGCTGCAGATCATCCAGCATGGTGACATCCAGCCTGAAGCCATGCGTGGCTCGTGGGCCGGCGCCATGGGCCAGACCCAGTTCATCCCGACCACCTacaa > 8:242556/1‑149 (MQ=255) tATGAGGGCCGCCGCCCACAGTTCGCCCAGGATCAGCTGATTGCCGCGCTGCAGATCATCCAGCATGGTGACATCCAGCCTGAAGCCATGCGTGGCTCGTGGGCCGGCGCCATGGGCCAGACCCAGTTCATCCCGACCACCTACAacac > 8:20662/1‑149 (MQ=255) tGAGGGCCGCCGCCCACAGTTCGCCCAGGATCAGCTGATTGCCGCGCTGCAGATCATCCAGCATGGTGACATCCAGCCTGAAGCCATGCGTGGCTCGTGGGCCGGCGCCATGGGCCAGACCCAGTTCATCCCGac < 8:127501/135‑1 (MQ=255) tGAGGGCCGCCGCCCACAGTTCGCCCAGGATCAGCTGATTGCCGCGCTGCAGATCATCCAGCATGGTGACATCCAGCCTGAAGCCATGCGTGGCTCGTGGGCCGGCGCCATGGGCCAGACCCAGTTCATCCCGac > 7:127501/1‑135 (MQ=255) gggCCGCCGCCCACAGTTCGCCCAGGATCAGCTGATTGCCGCGCTGCAGATCATCCAGCATGGTGACATCCAGCCTGAAGCCATGCGTGGCTCGTGGGCCGGCGCCATGGGCCAGACCCAGTTCATCCCGACCACCTACAACACCCATg > 6:300836/1‑149 (MQ=255) ccgccgccCACAGTTCGCCCAGGATCAGCTGATTGCCGCGCTGCAGATCATCCAGCATGGTGACATCCAGCCTGAAg < 8:80258/77‑1 (MQ=255) ccgccgccCACAGTTCGCCCAGGATCAGCTGATTGCCGCGCTGCAGATCATCCAGCATGGTGACATCCAGCCTGAAg > 7:80258/1‑77 (MQ=255) gccgccCACAGTTCGCCCAGGATCAGCTGATTGCCACGCTGCAGATCATCCAGCATGGTGACATCCAGCCTGAAGCCATGCGTGGCTCGTGGGCCGGCGCCATGGGCCAGACCCAGTTCATCCCGACCACCTACAACACCCATGCCGTg < 7:242556/149‑1 (MQ=255) cgccCACAGTTCGCCCAGGATCAGCTGATTGCCGCGCTGCAGATCATCCAGCATGGTGACATCCAGCCTGAAGCCATGCGTGGCTCGTGGGCCGGCGCCATGGGCCAGACCCAGTTCATCCCGACCACCTACAACACCCATGCCGTGGa < 7:20662/149‑1 (MQ=255) cccACAGTTCGCCCAGGATCAGCTGATTGCCGCGCTGCAGATCATCCAGCATGGTGACATCCAGCCTGAAGCCATGCGTGGCTCGTGGGCCGGCGCCATGGGCCAGACCCAGTTCATCCCGACCACCTACAACACCCATGCCGTGGCCt > 7:59225/1‑149 (MQ=255) gTTCGCCCAGGATCAGCTGATTGCCGCGCTGCAGATCATCCAGCATGGTGACATCCAGCCTGAAGCCATGCGTGGCTCGTGGGCCGGCGCCATGGGCCAGACCCAGTTCATCCCGACCACCTACAACACCCATGCCGTGGACTTCGACg > 7:263656/1‑149 (MQ=255) gCCCAGGATCAGCTGATTGCCGCGCTGCAGATCATCCAGCATGGTGACATCCAGCCTGAAGCCATGCGTGGCTCGTGGGCCGGCGCCATGGGCCAGACCCAGTTCATCCCGACCACCTACAACACCCATGCCGTGGACTTCGACGGCg < 5:293724/148‑1 (MQ=255) ccAGGATCAGCTGATTGCCGCGCTGCAGATCATCCAGCATGGTGACATCCAGCCTGAAGCCATGCGTGGCTCGTGGGCCGGCGCCATGGGCCAGACCCAGTTCATccc < 7:86395/108‑1 (MQ=255) ccAGGATCAGCTGATTGCCGCGCTGCAGATCATCCAGCATGGTGACATCCAGCCTGAAGCCATGCGTGGCTCGTGGGCCGGCGCCATGGGCCAGACCCAGTTCATccc > 8:86395/1‑108 (MQ=255) aGGATCAGCTGATTGCCGCGCTGCAGATCATCCAGCATGGTGACATCCAGCCTGAAGCCATGCGTGGCTCGTGGGCCGGCGCCATTTTTAATACTCATTTCATCACGACCAACTACAACACCCATGCCGTGGACTTCGACGGCGATGgc < 2:1964/149‑1 (MQ=255) ggATCAGCTGATTGCCGCGCTGCAGATCATCCAGCATGGTGACATCTAGCCTGAAGCCATGCGTGGCTCGTGGGCCGGCGCCATGGGCCAGACCCAGTTCATCCCGACCACCTACAACACCCATGCCGTGGACTTCGACGGCGATGgcc < 7:306993/149‑1 (MQ=255) ggATCAGCTGATTGCCGCGCTGCAGATCATCCAGCATGGTGACATCCAGCCTGAAGCCATGCGTGGCTCGTGGGCCGGCGCCATGGGCCAGACCCAGTTCATCCCGACCACCTACAACACCCATGCCGTGGACTTCGACGGCGATGgcc < 6:151138/149‑1 (MQ=255) aGCTGATTGCCGCGCTGCAGATCATCCAGCATGGTGACATCCAGCCTGAAGCCATGCGTGGCTCGTGGGCCGGCGCCATGGGCCAGACCCAGTTCATCCCGACCACCTACAACACCCATGCCGTGGACTTCGACGGCGATGGCcgccgc < 8:263656/149‑1 (MQ=255) gCTGATTGCCGCGCTGCAGATCATCCAGCATGGTGACATCCAGCCTGAAGCCATGCGTGGCTCGTGGGCCGGCGCCATGGGCCAGACCCAGTTCATCCCGACCACCTACAACACCCATGCCGTGGACTTCGACGGCGATGGCcgccgc > 1:113141/1‑148 (MQ=255) tGATTGCCGCGCTGCAGATCATCCAGCATGGTGACATCCAGCCTGAAGCCATGCGTGGCTCGTGGGCCGGCGCCATGCGCCAGACCCAGTTCATCCCGACCACCTACAACACCCATGCCGTGGACTTCGACGGCGATGGCCGCCGCGa > 1:109729/1‑148 (MQ=255) ccGCGCTGCAGATCATCCAGCATGTTGCCATCCCGCCTGAAGCCCTGCGTGGCTCGTGGGCCGGCGCCATGGGCAAGACCCAGTTCATCCCGACCACCTACACCACCCATGCCGTGGACTTCGACTGCGATGGCCGCCGCGACATCTg < 8:266330/148‑1 (MQ=255) ccGCGCTGCAGATCATCCAGCATGGTGACATCCAGCCTGAAGCCATGCGTGGCTCGTGGGCCGGCGCCATGGGCCAGACCCAGTTCATCCCGACCACCTACAACACCCATGCCGTGGACTTCGACGGCGATGGCCGCCGCGACATCTgg < 8:268932/149‑1 (MQ=255) ccGCGCTGCAGATCATCCAGCATGGTGACATCCAGCCTGAAGCCATGCGTGGCTCGTGGGCCGGCGCCATGGGCCAGACCCAGTTCATCCCGACCACCTACAACACCCATGCCGTGGACTTCGACGGCGATGGCCGCCGCGACATCTg > 6:324965/1‑148 (MQ=255) | TGGCGTGGACCGCCAGGTGCTGGTCGCGGTGTGGGGCATGGAAAGCAACTTCGGCCAGTTCCAGGGCAGCAAGTCGGTGATCCGCTCGCTGGCCACTTTGGCCTATGAGGGCCGCCGCCCACAGTTCGCCCAGGATCAGCTGATTGCCGCGCTGCAGATCATCCAGCATGGTGACATCCAGCCTGAAGCCATGCGTGGCTCGTGGGCCGGCGCCATGGGCCAGACCCAGTTCATCCCGACCACCTACAACACCCATGCCGTGGACTTCGACGGCGATGGCCGCCGCGACATCTGG > NC_002947/5461504‑5461798 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |