Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 5,688,520 | T→A | 6.5% | Q149L (CAG→CTG) | pilJ ← | twitching motility protein PilJ |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,688,520 | 0 | T | A | 6.5% | 187.0 / 2.9 | 61 | Q149L (CAG→CTG) | pilJ | twitching motility protein PilJ |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (29/28); new base A (2/2); total (31/30) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.21e-01 |
CGAGCCAAGGATGCGTTCGGCCAGCAACAGCTGGCGCTGGGCCACCGCAACCTGATTGGCCGGGGCACCGCTCTGCAGCAGGATCTCGACCACTTTTTCGTATTCCACCTGCAGCTGCGGCACGGTCTCGGCCAGGGTCGCTGCCACCTGGT‑GCAGCGACAGCACGGTCTGCTCGCTGGCCAGGATGATGTCGGTGTTCTTGCGCAGGTTT‑TCCCAGTCGCGGCGTACCGATTCCATCTCGTCACGCACCGCAGGTGGCGCAGGCGGCAGGCCAGTGGACTTGTCACCCTGGCG > NC_002947/5688372‑5688665 | cGAGCCAAGGATGCGTTCGGCCAGCAACAGCTGGCGCTGGGCCACCGCAACCTGATTGGCCGGGGCACCGCTCTGCAGCAGGATCTCGACCACTTTTTCGTATTCCACCTGCAGCTGCGGCACGGTCTCGGCCAGGGTCGCTGCCACCt > 5:63947/1‑149 (MQ=255) cGAGCCAAGGATGCGTTCGGCCAGCAACAGCTGGCGCTGGGCCACCGCAACCTGATTGGCCGGGGCACCGCTCTGCAGCAGGATCTCGACCACTTTTTCGTATTCCACCTGCAGCTGCGGCACGGTCTCGGCCAGGGTCGCTGCCACCt < 7:284907/149‑1 (MQ=255) ccAAGGATGCGTTCGGCCAGCAACAGCTGGCGCTGGGCCACCGCAACCTGATTGGCCGGGGCACCGCTCTGCAGCAGGATCTCGACCACTTTTTCGTATTCCACCTGCAGCTGCGGCACGGTCTCGGCCAGGGTCGCTGCCACCTGGT‑g > 3:189253/1‑149 (MQ=255) ggATGCGTTCGGCCAGCAACAGCTGGCGCTGGGCCACCGCAACCTGATTGGCCGGGGCACCGCTCTGCAGCAGGATCTCGACCACTTTTTCGTATTCCACCTGCAGCTGCGGCACGGTCTCGGCCAGGGTCGCTGCCACCTGGT‑GCAGc > 1:6299/1‑149 (MQ=255) ggATGCGTTCGGCCAGCAACAGCTGGCGCTGGGCCACCGCAACCTGATTGGCCGGGGCACCGCTCTGCAGCAGGATCTCGACCACTTTTTCGTATTCCACCTGCAGCTGCGGCACGGTCTCGGCCAGGGTCGCTGCCACCTGGT‑GCAGc < 5:291308/149‑1 (MQ=255) gATGCGTTCGGCCAGCAACAGCTGGCGCTGGGCCACCGCAACCTGATTGGCCGGGGCACCGCTCTGCAGCAGGATCTCGACCACTTTTTCGTATTCCACCTGCAGCTGCGGCACGGTCTCGGCCAGGGTCGCTGCCACCTGGT‑GCAGCg < 3:112527/149‑1 (MQ=255) gATGCGTTCGGCCAGCAACAGCTGGCGCTGGGCCACCGCAACCTGATTGGCCGGGGCACCGCTCTGCAGCAGGATCTCGACCACTTTTTCGTATTCCACCTGCAGCTGCGGCACGGTCTCGGCCAGGGTCGCTGCCACCTGGT‑GCAGCg < 4:189253/149‑1 (MQ=255) aTGCGTTCGGCCAGCAACAGCTGGCGCTGGGCCACCGCAACCTGATTGGCCGGGGCACCGCTCTGCAGCAGGATCTCGACCACTTTTTCGTATTCCACCTGCAGCTGCGGCACGGTCTCGGCCAGGGTCGCTGCCACCTGGT‑GCAGCGa > 3:43568/1‑149 (MQ=255) tGCGTTCGGCCAGCAACAGCTGGCGCTGGGCCACCGCAACCTGATTGGCCGGGGCACCGCTCTGCAGCAGGATCTCGACCACTTTTTCGTATTCCACCTGCAGCTGCGGCACGGTCTCGGCCAGGGTCGCTG‑CACCAGGTGGCAGCGAc < 3:124787/149‑1 (MQ=255) gTTCGGCCAGCAACAGCTGGCGCTGGGCCACCGCAACCTGATTGGCCGGGGCACCGCTCTGCAGCAGGATCTCGACCACTTTTTCGTATTCCACCTGCAGCTGCGGCACGGTCTCGGCCAGGGTCGCTGCCACCTGGT‑GCAGCGACAg > 8:167447/1‑148 (MQ=255) gTTCGGCCAGCAACAGCTGGCGCTGGGCCACCGCAACCTGATTGGCCGGGGCACCGCTCTGCAGCAGGATCTCGACCACTTTTTCGTATTCCACCTGCAGCTGCGGCACGGTCTCGGCCAGGGTCGCTGCCACCTGGT‑GCAGCGACAg > 7:33478/1‑148 (MQ=255) gTTCGGCCAGCAACAGCTGGCGCTGGGCCACCGCAACCTGATTGGCCGGGGCACCGCTCTGCAGCAGGATCTCGACCACTTTTTCGTATTCCACCTGCAGCTGCGGCACGGTCTCGGCCAGGGTCGCTGCCACCTGGT‑GCAGCGACAGc > 3:42433/1‑149 (MQ=255) ttCGGCCAGCAACAGCTGGCGCTGGGCCACCGCAACCTGATTGGCCGGGGCACCGCTCTGCAGCAGGATCTCGACCACTTTTTCGTATTCCACCTGCAGCTGCGGCACGGTCTCGGCCAGGGTCGCTGCCACCTGGT‑GCAGCGACAGCa < 1:172271/149‑1 (MQ=255) gCCAGCAACAGCTGGCGCTGGGCCACCGCAACCTGATTGGCCGGGGCACCGCTCTGCAGCAGGATCTCGACCACTTTTTCGTATTCCACCTGCAGCTGCGGCACGGTCTCGGCCAGGGTCGCTGCCACCTGGT‑GCAGCGACAGCACGGt > 3:160971/1‑149 (MQ=255) gCAACAGCTGGCGCTGGGCCACCGCAACCTGATTGGCCGGGGCACCGCTCTGCAGCAGGATCTCGACCACTTTTTCGTATTCCACCTGCAGCTGCGGCACGGTCTCGGCCAGGGTCGCTGCCACCTGGT‑GCAGCGACAGCACGGTCTGc > 3:412/1‑149 (MQ=255) cAACAGCTGGCGCTGGGCCACCGCAACCTGATTGGCCGGGGCACCGCTCTGCAGCAGGATCTCGACCACTTTTTCGTATTCCACCTGCAGCTGCGGCACGGTCTCGGCCAGGGTCGCTGCCACCTGGT‑GCAGCGACAGCACGGTCTGCt > 2:199754/1‑149 (MQ=255) cAACAGCTGGCGCTGGGCCACCGCAACCTGATTGGCCGGGGCACCGCTCTGCAGCAGGATCTCGACCACTTTTTAGTATTCCACCTGCAGCTGCGGCACGGTCTCGGCCAGGGTCGCTGCCACCTGGT‑GCAGCGACAGCACGGTCTGCt > 6:1325/1‑149 (MQ=255) ggCCACCGCAACCTGATTGGCCGGGGCACCGCTCTGCAGCAGGATCTCGACCACTTTTTCGTATTCCACCTGCAGCTGCGGCACGGTCTCGGCCAGGGTCGCTGCCACCTGGT‑GCAGCGACAGCACGGTCTGCTCGCTGGCCAGgatga > 4:24458/1‑149 (MQ=255) ggCCACCGCAACCTGATTGGCCGGGGCACCGCTCTGCAGCAGGATCTCGACCACTTTTTCGTATTCCACCTGCAGCTGCGGCACGGTCTCGGCCAGGGTCGCTGCCACCTGGT‑GCAGCGACAGCACGGTCTGCTCGCTGGCCAGgat < 3:257493/147‑1 (MQ=255) ccGCAACCTGATTGGCCGGGGCACCGCTCTGCAGCAGGATCTCGACCACTTTTTCGTATTCCACCTGCAGCTGCGGCACGGTCTCGGCCAGGGTCGCTGCCACCTGGT‑GCAGCGACAGCACGGTCTGCTCGCTGGCCAGGATGATGTCg < 4:160971/149‑1 (MQ=255) ccTGATTGGCCGGGGCACCGCTCTGCAGCAGGATCTCGACCACTTTTTCGTATTCCACCTGCAGCTGCGGCACGGTCTCGGCCAGGGTCGCTGCCACCTGGT‑GCAGCGACAGCACGGTCTGCTCGCTGGCCAGGATGATGTCGGTGTTc < 4:412/149‑1 (MQ=255) ccTGATTGGCCGGGGCACCGCTCTGCAGCAGGATCTCGACCACTTTTTCGTATTCCACCTGCAGCTGCGGCACGGTCTCGGCCAGGGTCGCTGCCACCTGGT‑GCAGCGACAGCACGGTCTGCTCGCTGGCCAGGATGATGTCGGTGTTc < 7:167447/149‑1 (MQ=255) cTGATTGGCCGGGGCACCGCTCTGCAGCAGGATCTCGACCACTTTTTCGTATTCCACCTGCAGCTGCGGCACGGTCTCGGCCAGGGTCGCTGCCACCTGGT‑GCAGCGACAGCACGGTCTGCTCGCTGGCCAgg < 4:219348/133‑1 (MQ=255) cTGATTGGCCGGGGCACCGCTCTGCAGCAGGATCTCGACCACTTTTTCGTATTCCACCTGCAGCTGCGGCACGGTCTCGGCCAGGGTCGCTGCCACCTGGT‑GCAGCGACAGCACGGTCTGCTCGCTGGCCAgg > 3:219348/1‑133 (MQ=255) cTGATTGGCCGGGGCACCGCTCTGCAGCAGGATCTCGACCACTTTTTCGTATTCCACCTGCAGCTGCGGCACGGTCTCGGCCAGGGTCGCTGCCACCTGGT‑GCAGCGACAGCACGGTCTGCTCGCTGGCCAGGATGATGTCGGTGTTCt > 8:291623/1‑149 (MQ=255) tGATTGGCCGGGGCACCGCTCTGCAGCAGGATCTCGACCACTTTTTCGTATTCCACCTGCAGCTGCGGCACGGTCTCGGCCAGGGTCGCTGCCACCTGGT‑GCAGCGACAGCACGGTCTGCTCGCTGGCCAGGATGATGTCGGTGTTCtt > 5:289049/1‑149 (MQ=255) aTTGGCCGGGGCACCGCTCTGCAGCAGGATCTCGACCACTTTTTCGTATTCCACCTGCAGCTGCGGCACGGTTTCGGCCAGGGTCGCTGCCACCTGGT‑GCAGCGACAGCACGGt > 5:11146/1‑114 (MQ=255) aTTGGCCGGGGCACCGCTCTGCAGCAGGATCTCGACCACTTTTTCGTATTCCACCTGCAGCTGCGGCACGGTTTCGGCCAGGGTCGCTGCCACCTGGT‑GCAGCGACAGCACGGt < 6:11146/114‑1 (MQ=255) aTTGGCCGGGGCACCGCTCTGCAGCAGGATCTCGACCACTTTTTCGTATTCCACCTGCAGCTGCGGCACGGTCTCGGCCAGGGTCGCTGCCACCTGGT‑GCAGCGACAGCACGGTCTGCTCGCTGGCCAGGATGATGTCGGTGTTCTTgc > 5:7934/1‑149 (MQ=255) ccGGGGCACCGCTCTGCAGCAGGATCTCGACCACTTTTTCGTATTCCACCTGCAGCTGCGGCACGGTCTCGGCCAGGGTCGCTGCCACCTGGT‑GCAGCGACAGCACGGTCTGCTCGCTGGCCAGGATGATGTCGGTGTTCTTGCGCAgg < 2:6299/149‑1 (MQ=255) gCACCGCTCTGCAGCAGGATCTCGACCACTTTTTCGTATTCCACCTGCAGCTGCGGCACGGTCTCGGGCAGGGTCGCTGCCACCTGGT‑GCAGCGACAGCACGGTCTGCTCGCTGGCCAGGATGATGTCGGTGTTCTTGCGCAGGTTT‑Tc < 5:316044/149‑1 (MQ=255) cACCGCTCTGCAGCAGGATCTCGACCACTTTTTCGTATTCCACCTGCAGCTGCGGCACGGTCTCGGCCAGGGTCGCTGCCACCTGGT‑GCAGCGACAGCACGGTCTGCTCGCTGGCCAGGATGATGTCGGTGTTCTTGCGCAGGTTT‑Tcc < 8:33478/149‑1 (MQ=255) cACCGCTCTGCAGCAGGATCTCGACCACTTTTTCGTATTCCACCTGCAGCTGCGGCACGGTCTCGGCCAGGGTCGCTGCCACCTGGT‑GCAGCGACAGCACGGTCTGCTCGCTGGCCAGGATGATGTCGGTGTTCTTGCGCAGGTTT‑Tcc < 4:42433/149‑1 (MQ=255) ccGCTCTGCAGCAGGATCTCGACCACTTTTTCGTATTCCACCTGCAGCTGCGGCACGGTCTCGGCCAGGGTCGCTGCCACCTGGT‑GCAGCGACAGCACGGTCTGCTCGCTGGCCAGGATGATGTCGGTGTTCTTGCGCAGGTTT‑TCCCa < 3:24458/149‑1 (MQ=255) ctctGCAGCAGGATCTCGACCACTTTTTCGTATTCCACCTGCAGCTGCGGCACGGCCTCGGCCAGGGTCGCTGCCACCTGGT‑GCAGCGACAGCACGGTCTGCTCGCTGGCCAGGATGATGTCGGTGTTCTTGCGCAGGTTT‑TCCCAGTc > 5:321131/1‑149 (MQ=255) gcagGATCTCGACCACTTTTTCGTATTCCACCTGCAGCTGCGGCACGGTCTCGGCCAGGGTCGCTGCCACCTGGT‑GCAGCGACAGCACGGTCTGCTCGCTGGCCAGGATGATGTCGGTGTTCTTGCGCAGGTTT‑TCCCAGTCgcggcg > 3:273536/1‑148 (MQ=255) cagGATCTCGACCACTTTTTCGTATTCCACCTGCAGCTGCGGCACGGTCTCGGCCAGGGTCGCTGCCACCTGGT‑GCAGCGACAGCACGGTCTGCTCGCTGGCCAGGATGATGTCGGTGTTCTTGCGCAGGTTT‑TCCCAGTCGCGGCGTa > 3:19844/1‑149 (MQ=255) gACCACTTTTTCGTATTCCACCTGCAGCTGCGGCACGGTCTCGGCCAGGGTCGCTGCCACCTGGT‑GCAGCGACAGCACGGTCTGCTCGCTGGCCAGGATGATGTCGGTGTTCTTGCGCAGGTTT‑TCCCAGTCGCGGCGTACCGa < 6:289049/144‑1 (MQ=255) gACCACTTTTTCGTATTCCACCTGCAGCTGCGGCACGGTCTCGGCCAGGGTCGCTGCCACCTGGT‑GCAGCGACAGCACGGTCTGCTCGCTGGCCAGGATGATGTCGGTGTTCTTGCGCAGGTTT‑TCCCAGTCGCGGCGTACCGATTcc > 3:282184/1‑148 (MQ=255) gACCACTTTTTCGTATTCCACCTGCAGCTGCGGCACGGTCTCGGCCAGGGTCGCTGCCACCTGGT‑GCAGCGACAGCACGGTCTGCTCGCTGGCCAGGATGATGTCGGTGTTCTTGCGCAGGTTT‑TCCCAGTCGCGGCGTACCGATTcc < 4:282184/148‑1 (MQ=255) aCCACTTTTTCGTATTCCACCTGCAGCTGCGGCACGGTCTCGGCCAGGGTCGCTGCCACCTGGT‑GCAGCGACAGCACGGTCTGCTCGCTGGCCAGGATGATGTCGGTGTTCTTGCGCAGGTTT‑TCCCAGTCGCGGCGTACCGATTCCAt < 4:43568/149‑1 (MQ=255) aCCACTTTTTCGTATTCCACCTGCAGCTGCGGCACGGTCTCGGCCAGGGTCGCTGCCACCTGGT‑GCAGCGACAGCACGGTCTGCTCGCTGGCCAGGATGATGTCGGTGTTCTTGCGCAGGTTT‑TCCCAGTCGCGGCGTACCGATTCCAt < 7:291623/149‑1 (MQ=255) aCCACTTTTTCGTATTCCACCTGCAGCTGCGGCACGGTCTCGGCCAGGGTCGCTGCCACCTGGT‑GCAGCGACAGCACGGTCTGCTCGCTGGCCAGGATGATGTCGGTGTTCTTGCGCAGGTTT‑TCCCAGTCGCGGCGTACCGATTCCAt < 6:63947/149‑1 (MQ=255) cACTTTTTCGTATTCCACCTGCAGCTGCGGCACGGTCTCGGCCAGGGTCGCTGCCACCTGGT‑GCAGCGACAGCACGGTCTGCTCGCTGGCCAGGATGATGTCGGTGTTCTTGCGCAGGTTT‑TCACAGTCGCGGCGTACCGATTCCAtc > 8:14406/1‑148 (MQ=255) cGTATTCCACCTGCAGCTGCGGCACGGTCTCGGCCAGGGTCGCTGCCACCTGGT‑GCAGCGACAGCACGGTCTGCTCGCTGGCCAGGATGATGTCGGTGTTCTTGCGCAGGTTT‑TCCCAGTCGCGGCGTACCGATTcc < 8:323709/137‑1 (MQ=255) cGTATTCCACCTGCAGCTGCGGCACGGTCTCGGCCAGGGTCGCTGCCACCTGGT‑GCAGCGACAGCACGGTCTGCTCGCTGGCCAGGATGATGTCGGTGTTCTTGCGCAGGTTT‑TCCCAGTCGCGGCGTACCGATTcc > 7:323709/1‑137 (MQ=255) gTATTCCACCTGCAGCTGCGGCACGGTCTCGGCCAGGGTCGCTGCCACCTGGT‑GCAGCGACAGCACGGTCTGCTCGCTGGCCAGGATGATGTCGGTGTTCTTGCGCAGGTTT‑TCCCAGTCGCGGCGTACCGATTCCATCTCGTCACGCa > 4:334663/1‑149 (MQ=255) tCCACCTGCAGCTGCGGCACGGTCTCGGCCAGGGTCGCTGCCACCTGGT‑GCAGCGACAGCACGGTCTGCTCGCTGGCCAGGATGATGTCGGTGTTCTTGCGCAGGTTT‑TCCCAGTCGCGGCGTACCGATTCCATCTCGTCACGCACCg > 2:24194/1‑148 (MQ=255) ccTGCAGCTGCGGCACGGTCTCGGCCAGGGTCGCTGCCACCTGGT‑GCAGCGACAGCACGGTCTGCTCGCTGGCCAGGATGATGTCGGTGTTCTTGCGCAGGTTT‑TCCCAGTCGCGGCGTACCGATTCCATCTCGTCACGCACCGCAGGt > 3:308762/1‑149 (MQ=255) cttcAGCTGCGGCACGGTCTCGGCCAGGGTCGCTGCCACCTGGT‑GCAGCGACAGCACGGTCTGCTCTCTGGCCAGGATGATGTCGGTGTTCTTGCGCAGGTTT‑TCCCAGTCGCGGCGTACCGATTCCATCTCGTCACGCACCGCAGGTg < 5:1325/146‑1 (MQ=255) cTGCAGCTGCGGCACGGTCTCGGCCAGGGTCGCTGCCACCTGGT‑GCAGCGACAGCACGGTCTGCTCGCTGGCCAGGATGATGTCGGTGTTCTTGCGCAGGTTTACCCCAGTCGCGGCGTACCGATTCCATCTCGTCACGCACCGCAGGt < 1:244936/149‑1 (MQ=255) cAGCTGCGGCACGGTCTCGGCCAGGGTCGCTGCCACCTGGT‑GCAGCGACAGCACGGGCTGCTCGCTGGCCAGGATGATGTCGGTGTTCTTGCGCAGGTTT‑TCCCAGTCGCGGCGTACCGATTCCATCTCGTCACGCACCGCAGGTGgc < 6:174030/148‑1 (MQ=255) tGCGGCACGGTCTCGGCCAGGGTCGCTGCCACCTGGT‑GCAGCGACAGCACGGTCTGCTCGCTGGCCAGGATGATGTCGGTGTTCTTGCGCAGGTTT‑TCCCAGTCGCGGCGTACCGATTCCATCTCGTCACGCACCGCAGGTGGCGCAgg > 2:29064/1‑149 (MQ=255) cACGGTCTCGGCCAGGGTCGCTGCCACCTGGT‑GCAGCGACAGCACGGTCTGCTCGCTGGCCAGGATGATGTCGGTGTTCTTg < 4:68484/82‑1 (MQ=255) cACGGTCTCGGCCAGGGTCGCTGCCACCTGGT‑GCAGCGACAGCACGGTCTGCTCGCTGGCCAGGATGATGTCGGTGTTCTTg > 3:68484/1‑82 (MQ=255) ggCCAGGGTCGCTGCCACCTGGT‑GCAGCGACAGCACGGTCTGCTCGCTGGCCAGGATGATGTCGGTGTTCTTGCGCAGGTTT‑TCCCAGTCGCGGCGTACCGATTCCATCTCGTCACGCACCGCAGGTGGCGCAGGCGGCAGGCCAGTg < 4:19844/148‑1 (MQ=255) ggCCAGGGTCGCTGCCACCTGGT‑GCAGCGACAGCACGGTCTGCTCGCTGGCCAGGATGATGTCGGTGTTCTTGCGCAGGTTT‑TCCCAGTCGCGGCGTACCGATTCCATCTCGTCACGCACCGCAGGTGGCGCAGGCGGCAGGCCAGTg > 8:61577/1‑148 (MQ=255) aGGGTCGCTGCCACCTGGT‑GCAGCGACAGCACGGTCTGCTCGCTGGCCAGGATGATGTCGGTGTTCTTGCGCAGGTTT‑TCCCAGTCGCGGCGTACCGATTCCATCTCGTCACGCACCGCAGGTGGCGCAGGCGGCAGGCCAGTGGACtt < 4:308762/149‑1 (MQ=255) tgTCGCTG‑CACCAGGTGGCAGCGACAGCACGGTCTGCTCGCTGGCCAGGATGATGTCGGTGTTCTTGCGCAGGTTT‑TCCCAGTCGCGGCGTACCGATTCCATCTCGTCACGCACCGCAGGTGGCGCAg > 4:169131/2‑128 (MQ=255) tgTCGCTG‑CACCAGGTGGCAGCGACAGCACGGTCTGCTCGCTGGCCAGGATGATGTCGGTGTTCTTGCGCAGGTTT‑TCCCAGTCGCGGCGTACCGATTCCATCTCGTCACGCACCGCAGGTGGCGCAg < 3:169131/127‑1 (MQ=255) tCGCTG‑CACCAGGTGGCAGCGACAGCACGGTCTGCTCGCTGGCCAGGATGATGTCGGTGTTCTTGCGCAGGTTT‑TCCCAGTCGCGGCGTACCGATTCCATCTCGTCACGCACCGCAGGTGGCGCAGGCGGCAGGCCAGTGGACTTGTCa > 3:545/1‑149 (MQ=255) gCCACCTGGG‑GCAGCGCCAGCACGGTCTGCTCGCTGGCCAGGATGATGTCGGTGTTCTTGCGCAGGTTT‑TCCCAGTCGCGGCGTACCTATTCCATCTCGTCACGCACCGCAGGTGGCGCTGGCGGCAGGCCAGTGGACtt < 8:215985/140‑1 (MQ=255) aCCTGGT‑GCAGCGACAGCACGGTCTGCTCGCTGGCCAGGATGATGTCGGTGTTCTTGCGCAGGTTT‑TCCCAGTCGCGGCGTACCGATTCCATCTCGTCACGCACCGCAGGTGGCGCAGGCGGCAGGCCAGTGGACTTGTCACCCTGgcg > 4:105670/1‑149 (MQ=255) | CGAGCCAAGGATGCGTTCGGCCAGCAACAGCTGGCGCTGGGCCACCGCAACCTGATTGGCCGGGGCACCGCTCTGCAGCAGGATCTCGACCACTTTTTCGTATTCCACCTGCAGCTGCGGCACGGTCTCGGCCAGGGTCGCTGCCACCTGGT‑GCAGCGACAGCACGGTCTGCTCGCTGGCCAGGATGATGTCGGTGTTCTTGCGCAGGTTT‑TCCCAGTCGCGGCGTACCGATTCCATCTCGTCACGCACCGCAGGTGGCGCAGGCGGCAGGCCAGTGGACTTGTCACCCTGGCG > NC_002947/5688372‑5688665 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |