| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,793,000 | A→C | 5.1% | C111G (TGC→GGC) | gltD ← | glutamate synthase subunit beta |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,793,000 | 0 | A | C | 5.1% | 256.7 / 3.4 | 78 | C111G (TGC→GGC) | gltD | glutamate synthase subunit beta |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (34/40); new base C (2/2); total (36/42) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.94e-01 | |||||||||||
CCGGGCCGGCGCCGATGATGGCAACGCGCTTGCCGGTTGGCTTGACCTTGGACATGTCCGGACGCCAGCCCATGGCGAAGGCGGTGTCGGTGATGTACTTCTCCACCGAGCCGATGGTCACCGCGCCGAAACCGTCGTTCAGGGTGCAGGCACCCTCGCACAGGCGGTCTTGCGGGCAAACACGGCCGCATACTTCCGGCAGGGTGTTGGTCTGGTGCGACAGTTCCGCC‑GCGGCCAGGATGTTGCCTTCGGAGACCAGCTTCAACCAGTTGGGGATGAAGTTGTGTACCGGGCAC > NC_002947/5792853‑5793148 | ccgggccggCGCCGATGATGGCAACGCGCTTGCCGGTTGGCTTGACCTTGGACATGTCCGGACGCCAGCCCATGGCGAAGGCGGTGTCGGTGATGTACTTCTCCACCGAGCCGATGGTCACCGCGCCGAAACCGTCGTTCAGGGTGCAg < 7:320565/149‑1 (MQ=255) ggCGCCGATGATGGCAACGCGCTTGCCGGTTGGCTTGACCTTGGACATGTCCGGACGCCAGCCCATGGCGAAGGCGGTGTCGGTGATGTACTTCTCCACCGAGCCGATGGTCACCGCGCCGAAACCGTCGTTCAGGGTGCAGGCACCCt < 3:173474/149‑1 (MQ=255) atgatgGCAACGCGCTTGCCGGTTGGCTTGACATTGGACATGTCCGGACGCCAGCCCATGGCGAAGGCGGTGTCGGTGATGTACTTCTCCACCGAGCCGATGGTCACCGCGCCGAAACCGTCGTTCAGGGTGCAGGCACCCTCGCACAg > 3:74210/1‑149 (MQ=255) tgatgGCAACGCGCTTGCCGGTTGGCTTGACCTTGGACATGTCCGGACGCCAGCCCATGGCGAAGGCGGTGTCGGTGATGTACTTCTCCACCGAGCCGATGGTCACCGCGCCGAAACCGTCGTTCAGGGTGCAGGCACCCTCGCACAgg < 5:190725/149‑1 (MQ=255) tgatgGCAACGCGCTTGCCGGTTGGCTTGACCTTGGACATGTCCGGACGCCAGCCCATGGCGAAGGCGGTGTCGGTGATGTACTTCTCCACCGAGCCGATGGTCACCGCGCCGAAACCGTCGTTCAGGGTGCAGGCACCCTCGCACAgg > 3:289288/1‑149 (MQ=255) atgGCAACGCGCTTGCCGGTTGGCTTGACCTTGGACATGTCCGGACGCCAGCCCATGGCGAAGGCGGTGTCGGTGATGTACTTCTCCACCGAGCCGATGGTCACCGCGCCGAAACCGTCGTTCAGGGTGCAGGCACCCTCGCACAGGCg < 3:303743/149‑1 (MQ=255) tgGCAACGCGCTTGCCGGTTGGCTTGACCTTGGACATGTCCGGACGCCAGCCCATGGCGAAGGCGGTGTCGGTGATGTACTTCTCCACCGAGCCGATGGTCACCGCGCCGAAACCGTCGTTCAGGGTGCAGGCACCCTCGCACAGGCgg > 6:347085/1‑149 (MQ=255) tgGCAACGCGCTTGCCGGTTGGCTTGACCTTGGACATGTCCGGACGCCAGCCCATGGCGAAGGCGGTGTCGGTGATGTACTTCTCCACCGAGCCGATGGTCACCGCGCCGAAACCGTCGTTCAGGGTGCAGGCACCCTCGCACAGGCg < 2:30188/148‑1 (MQ=255) ggCAACGCGCTTGCCGGTTGGCTTGACCTTGGACATGTCCGGACGCCAGCCCATGGCGAAGGCGGTGTCGGTGATGTACTTCTCCACCGAGCCGATGGTCACCGCGCCGAAACCGTCGTTCAGGGTGCAGGCACCCTCGCACAGGCGGt > 2:300164/1‑149 (MQ=255) gCAACGCGCTTGCCGGTTGGCTTGACCTTGGACATGTCCGGACGCCAGCCCATGGCGAAGGCGGTGTCGGTGATGTACTTCTCCACCGAGCCGATGGTCACCGCGCCGAAACCGTCGTTCAGGGTGCAGGCACCCTCGCACAGGCGGTc > 6:120838/1‑149 (MQ=255) aaCGCGCTTGCCGGTTGGCTTGACCTTGGACATGTCCGGACGCCAGCCCATGGCGAAGGCGGTGTCGGTGATGTACTTCTCCACCGAGCCGATGGTCACCGCGCCGAAACCGTCGTTCAGGGTGCAGGCACCCTCGCACAGGCGGTCtt > 6:266296/1‑149 (MQ=255) aaCGCGCTTGCCGGTTGGCTTGACCTTGGACATGTCCGGACGCCAGCCCATGGCGAAGGCGGTGTCGGTGATGTACTTCTCCACCGAGCCGATGGTCACCGCGCCGAAACCGTCGTTCAGGGTGCAGGCACCCTCGCACAGGCGGTCtt > 7:70238/1‑149 (MQ=255) cgcgCTTGCCGGTTGGCTTGACCTTGGACATGTCCGGACGCCAGCCCATGGCGAAGGCGGTGTCGGTGATGTACTTCTCCACCGAGCCGATGGTCACCGCGCCGAAACCGTCGTTCAGGGTGCAGGCACCCTCGCACAGGCGGTCTTGc > 5:50353/1‑149 (MQ=255) cgcgCTTGCCGGTTGGCTTGACCTTGGACATGTCCGGACGCCAGCCCATGGCGAAGGCGGTGTCGGTGATGTACTTCTCCACCGAGCCGATGGTCACCGCGCCGAAACCGTCGTTCAGGGTGCAGGCACCCTCGCACAGGCGGTCTTGc < 4:157482/149‑1 (MQ=255) cgcgCTTGCCGGTTGGCTTGACCTTGGACATGTCCGGACGCCAGCCCATGGCGAAGGCGGTGTCGGTGATGTACTTCTCCACCGAGCCGATGGTCACCGCGCCGAAACCGTCGTTCAGGGTGCAGGCACCCTCGCACAGGCGGTCTTGc < 5:282960/149‑1 (MQ=255) gcgcTTGCCGGTTGGCTTGACCTTGGACATGTCCGGACGCCAGCCCATGGCGAAGGCGGTGTCGGTGATGTACTTCTCCACCGAGCCGATGGTCACCGCGCCGAAACCGTCGTTCAGGGTGCAGGCACCCTCGCACAGGCGGTCTTGCg < 4:289288/149‑1 (MQ=255) ttGCCGGTTGGCTTGACCTTGGACATGTCCGGACGCCAGCCCATGGCGAAGGCGGTGTCGGTGATGTACTTCTCCACCGAGCCGATGGTCACCGCGCCGAAACCGTCGTTCAGGGTGCAGGCACCCTc < 8:145537/128‑1 (MQ=255) ttGCCGGTTGGCTTGACCTTGGACATGTCCGGACGCCAGCCCATGGCGAAGGCGGTGTCGGTGATGTACTTCTCCACCGAGCCGATGGTCACCGCGCCGAAACCGTCGTTCAGGGTGCAGGCACCCTc > 7:145537/1‑128 (MQ=255) cGGTTGGCTTGACCTTGGACATGTCCGGACGCCAGCCCATGGCGAAGGCGGTGTCGGTGATGTACTTCTCCACCGAGCCGATGGTCACCGCGCCGAAACCGTCGTTCAGGGTGCAGGCACCCTCGCACAGGCGGTCTTGCGGGCAAaca > 5:150131/1‑149 (MQ=255) gTTGGCTTGACCTTGGACATGTCCGGACGCCAGCCCATGGCGAAGGCGGTGTCGGTGATGTACTTCTCCACCGAGCCGATGGTCACCGCGCCGAAACCGTCGTTCAGGGTGCAGGCACCCTCGCACAGGCGGTCTTGCGGGCAAACACg > 2:22499/1‑149 (MQ=255) tGGCTTGACCTTGGACATGTCCGGACGCCAGCCCATGGCGAAGGCGGTGTCGGTGATGTACTTCTCCACCGAGCCGATGGTCACCGCGCCGAAACCGTCGTTCAGGGTGCAGGCACCCTCGCACAGGCGGTCTTGCGGGCAAACACgg < 1:5522/148‑1 (MQ=255) cTTGACCTTGGACATGTCCGGACGCCAGCCCATGGCGAAGGCGGTGTCGGTGATGTACTTCTCCACCGAGCCGATGGTCACCGCGCCGAAACCGTCGTTCAGGGTGCAGGCACCCTCGCACAGGCGGTCTTGCGGGCAAACACGGCCg > 7:42119/1‑148 (MQ=255) cTTGACCTTGGACATGTCCGGACGCCAGCCCATGGCGAAGGCGGTGTCGGTGATGTACTTCTCCACCGAGCCGATGGTCACCGCGCCGAAACCGTCGTTCAGGGTGCAGGCACCCTCGCACAGGCGGTCTTGCGGGCAAACACGGCCGc < 5:266296/149‑1 (MQ=255) cTTGACCTTGGACATGTCCGGACGCCAGCCCATGGCGAAGGCGGTGTCGGTGATGTACTTCTCCACCGAGCCGATGGTCACCGCGCCGAAACCGTCGTTCAGGGTGCAGGCACCCTCGCACAGGCGGTCTTGCGGGCAAACACGGCCGc < 1:300164/149‑1 (MQ=255) gACCTTGGACATGTCCGGACGCCAGCCCATGGCGAAGGCGGTGTCGGTGATGTACTTCTCCACCGAGCCGATGGTCACCGCGCCGAAACCGTCGTTCAGGGTGCAGGCACCCTCGCACAGGCGGTCTTGCGGGCAAACACGGCCGCAt < 6:50353/148‑1 (MQ=255) ttGGACATGTCCGGACGCCAGCCCATGGCGAAGGCGGTGTCGGTGATGTACTTCTCCACCGAGCCGATGGTCACCGCGCCGAAACCGTCGTTCAGGGTGCAGGCACCCTCGCACAGGCGGTCTTGCGGGCAAACACGGCCGCATACTTc > 7:272580/1‑149 (MQ=255) ggACATGTCCGGACGCCAGCCCATGGCGAAGGCGGTGTCGGTGATGTACTTCTCCACCGAGCCGATGGTCACCGCGCCGAAACCGTCGTTCAGGGTGCAGGCACCCTCGCACAGGCGGTCTTGCGGGCAAACACGGCCGCATACTTcc < 2:185416/148‑1 (MQ=255) gACATGTCCGGACGCCAGCCCATGGCGAAGGCGGTGTCGGTGATGTACTTCTCCACCGAGCCGATGGTCACCGCGCCGAAACCGTCGTTCAGGGTGCAGGCACCCTCGCACAGGCGGTCTTGCGGGCAAACACGGCCGCATACTTCCgg < 5:120838/149‑1 (MQ=255) cATGTCCGGACGCCAGCCCATGGCGAAGGCGGTGTCGGTGATGTACTTCTCCACCGAGCCGATGGTCACCGCGCCGAAACCGTCGTTCAGGGTGCAGGCACCCTCGCACAGGCGGTCTTGCGGGCAAACACGGCCGCATACTTCCGGCa < 3:293853/149‑1 (MQ=255) aTGTCCGGACGCCAGCCCATGGCGAAGGCGGTGTCGGTGATGTACTTCTCCACCGAGCCGATGGTCACCGCGCCGAAACCGTCGTTCAGGGTGCAGGCACCCTCGCACAGGCGGTCTTGCGGGCAAACACGGCCGCATACTTc > 2:276271/1‑143 (MQ=255) aTGTCCGGACGCCAGCCCATGGCGAAGGCGGTGTCGGTGATGTACTTCTCCACCGAGCCGATGGTCACCGCGCCGAAACCGTCGTTCAGGGTGCAGGCACCCTCGCACAGGCGGTCTTGCGGGCAAACACGGCCGCATACTTc < 1:276271/143‑1 (MQ=255) tGTCCGGACGCCAGCCCATGGCGAAGGCGGTGTCGGTGATGTACTTCTCCACCGAGCCGATGGTCACCGCGCCGAAACCGTCGTTCAGGGTGCAGGCACCCTCGCACAGGCGGTCTTGCGGGCAAACACGGCCGCATACTTCCGGCAgg < 6:193087/149‑1 (MQ=255) gTCCGGACGCCAGCCCATGGCGAAGGCGGTGTCGGTGATGTACTTCTCCACCGAGCCGATGGTCACCGCGCCGAAACCGTCGTTCAGGGTGCAGGCAc > 3:245895/1‑98 (MQ=255) gTCCGGACGCCAGCCCATGGCGAAGGCGGTGTCGGTGATGTACTTCTCCACCGAGCCGATGGTCACCGCGCCGAAACCGTCGTTCAGGGTGCAGGCAc < 4:245895/98‑1 (MQ=255) cGGACGCCAGCACATGGCGAAGGCGGTGTCGGTGATGTACTTCTCCACCGAGCCGATGGTCACCGCGCCGAAACCGTCGTTCAGGGTGCAGGCACCCTCGCACAGGCGGTCTTGCGGGCAAACACGGCCGCATACTTCCGGCAGGgtgt > 4:103778/1‑149 (MQ=255) ggACGCCAGCCCATGGCGAAGGCGGTGTCGGTGATGTACTTCTCCACCGAGCCGATGGTCACCGCGCCGAAACCGTCGTTCAGGGTGCAGGCACCCTCGCACAGGCGGTCTTGCGGGCAAACACGGCCGCATACTTCCGGCAGGGTGtt > 7:42581/1‑149 (MQ=255) gACGCCAGCCCATGGCGAAGGCGGTGTCGGTGATGTACTTCTCCACCGAGCCGATGGTCACCGCGCCGAAACCGTCGTTCAGGGTGCAGGCACCCTCGCACAGGCGGTCTTGCGGGCAAACACGGCCGCATACTTCCTGCAGGGTGTTg < 8:56281/149‑1 (MQ=255) cAGCCCATGGCGAAGGCGGTGTCGGTGTTGTACTTCTCCACCGAGCCGATGGTCACCGCGCCGAAACCGTCGTTCAGGGTGCAGGCACCCTCGCACAGGCGGTCTTGCGGGCAAACACGGCCGCATACTTc < 8:159147/131‑1 (MQ=255) cAGCCCATGGCGAAGGCGGTGTCGGTGGTGTACTTCTCCACCGAGCCGATGGTCACCGCGCCGAAACCGTCGTTCAGGGTGCAGGCACCCTCGCACAGGCGGTCTTGCGGGCAAACACGGCCGCATACTTc > 7:159147/1‑131 (MQ=255) cAGCCCATGGCGAAGGCGGTGTCGGTGATGTACTTCTCCACCGAGCCGATGGTCACCGCGCCGAAACCGTCGTTCAGGGTGCAGGCACCCTCGCACAGGCGGTCTTGCGGGCAAACACGGCCGCATACTTCCGGCAGGGTGTTGGTCTg < 8:70238/149‑1 (MQ=255) gCGAAGGCGGTGTCGGTGATGTACTTCTCCACCGAGCCGATGGTCACCGCGCCGAAACCGTCGTTCAGGGTGCAGGCACCCTCGCACAGGCGGTCTTGCGGGCAAACACGGCCGCATACTTCCGGCAGGGTGTTGGTCTGGTGCGACAg > 6:97088/1‑149 (MQ=255) cGAAGGCGGTGTCGGTGATGTACTTCTCCACCGAGCCGATGGTCACCGCGCCGAAACCGTCGTTCAGGGTGCAGGCACCCTCGCACAGGCGGGCTTGCGGGCAAACACGGCCGCATACTTCCGGCAGGGTGTTGGTCTGGTGCGACAGt < 4:235212/149‑1 (MQ=255) tCGGTGATGTACTTCTCCACCGAGCCGATGGTCACCGCGCCGAAACCGTCGTTCAGGGTGCAGGCACCCTCGCACAGGCGGTCTTGCGGGCAAACACGGCCGCATACTTCCGGCAGGGTGTTGGTCTGGTGCGACAGTTCCGCC‑GCgg < 6:150131/148‑1 (MQ=255) gTACTTCTCCACCGAGCCGATGGTCACCGCGCCGAAACCGTCGTTCAGGGTGCAGGCACCCTCGCACAGGCGGTCTTGCGGGCAAACACGGCCGCATACTTCCGGCAGGGTGTTGGTCTGGTGCGACAGTTCCGCC‑GCGGCCAGGATGt > 4:208915/1‑149 (MQ=255) aCTTCTCCACCGAGCCGATGGTCACCGCGCCGAAACCGTCGTTCAGGGTGCAGGCACCCTCGCACAGGCGGTCTTGCGGGCAAACACGGCCGCATACTTCCGGCAGGGTGTTGGTCTGGTGCGACAGTTCCGCC‑GCGGCCAGGATGTTg > 5:278329/1‑149 (MQ=255) ctcCACCGAGCCGATGGTCACCGCGCCGAAACCGTCGTTCAGGGTGCAGGCACCCTCGCACAGGCGGTCTTGCGGGCAAACACGGCCGCATACTTCCGGCAGGGTGTTGGTCTGGTGCGACAGTTCCGCC‑GCGGCCAGGATGTTGCCtt > 4:321277/1‑149 (MQ=255) tcCACCGAGCCGATGGTCACCGCGCCGAAACCGTCGTTCAGGGTGCAGGCACCCTCGCACAGGCGGTCTTGCGGGCAAACACGGCCGCATACTTCCGGCAGGGTGTTGGTCTGGTGCGACAGTTCCGCC‑GCGGCCAGGATGTTGCCTTc < 8:272580/149‑1 (MQ=255) tcCACCGAGCCGATGGTCACCGCGCCGAAACCGTCGTTCAGGGTGCAGGCAACCTCGCACAGGCGGTCTTGCGGGCAAACACGGCCGCATACTTCCGGCAGGGTGTTGGTCTGGTGCGACAGTTCCGCC‑GCGGCCAGGATGTTGCCTTc > 1:259313/1‑149 (MQ=255) aTGGTCACCGCGCCGAAACCGTCGTTCAGGGTGCAGGCACCCTCGCACAGGCGGTCTTGCGGGCAAACACGGCCGCATACTTCCGGCAGGGTGTTGGTCTGGTGCGACAGTTCCGCC‑GCGGCCAGGATGTTGCCTTCGGAGACCAGCtt > 3:257348/1‑149 (MQ=255) tGGTCACCGCTCCGAAACCGTCGTTCAGGGTGCAGGCACCCTCGCACAGGCGGTCTTGCGGGCAAACACGGCCGCATACTTCCGGCAGGGTGTTGGTCTGGTGCGACAGTTCCGCC‑GCGGCCAGGATGTTGCCTTCGGAGACCAGCTTc < 5:347085/149‑1 (MQ=255) tCACCGCGCCGAAACCGTCGTTCAGGGTGCAGGCACCCTCGCACAGGCGGTCTTGCGGGCAAACACGGCCGCATACTTCCGGCAGGGTGTTGGTCTGGTGCGACAGTTCCGCC‑GCGGCCAGGATGTTGCCTTCGGAGACCAGCTTCAAc > 6:118298/1‑149 (MQ=255) cACCGCGCCGAAACCGTCGTTCAGGGTGCAGGCACCCTCGCACAGGCGGTCTTGCGGGCAAACACGGCCGCATACTTCCGGCAGGGTGTTGGTCTGGTGCGACAGTTCCGCC‑GCGGcc < 4:157924/118‑1 (MQ=255) cACCGCGCCGAAACCGTCGTTCAGGGTGCAGGCACCCTCGCACAGGCGGTCTTGCGGGCAAACACGGCCGCATACTTCCGGCAGGGTGTTGGTCTGGTGCGACAGTTCCGCC‑GCGGcc > 3:157924/1‑118 (MQ=255) aCCGCGCCGAAACCGTCGTTCAGGGTGCAGGCACCCTCGCACAGGCGGTCTTGCGGGCAAACACGGCCGCATACTTCCGGCAGGGTGTTGGTCTGGTGCGACAGTTCCGCC‑GCGGCCAGGATGTTGCCTTCGGAGACCAGCTTCAAcc < 5:97088/148‑1 (MQ=255) ccGCGCCGAAACCGTCGTTCAGGGTGCAGGCACCCTCGCACAGGCGGTCTTGCGGGCAAACACGGCCGCATACTTCCGGCAGGGTGTTGGTCTGGTGCGACAGTTCCGCC‑GCGGCCAGGATGTTGCCTTCGGAGACCAGCTTCAACCAg > 8:315178/1‑149 (MQ=255) ccGCGCCGAAACCGTCGTTCAGGGTGCAGGCACCCTCGCACAGGCGGTCTTGCGGGCAAACACGGCCGCATACTTCCGGCAGGGTGTTGGTCTGGTGCGACAGTTCCGCC‑GCGGCCAGGATGTTGCCTTCGGAGACCAGCTTCAACCAg > 4:17094/1‑149 (MQ=255) gcgcCGAAACCGTCGTTCAGGGTGCAGGCACCCTCGCACAGGCGGTCTTGCGGGCAAACACGGCCGCATACTTCCGGCAGGGTGTTGGTCTGGTGCGACAGTTCCGCC‑GCGGCCAGGATGTTGCCTTCGGAGACCAGCTTCAACCAGtt > 5:233393/1‑149 (MQ=255) cgcCGAAACCGTCGTTCAGGGTGCAGGCACCCTCGCACAGGCGGTCTTGCGGGCAAACACGGCCGCATACTTCCGGCAGGGTGTTGGTCTGGTGCGACAGTTCCGCC‑GCGGCCAGGATGTTGCCTTCGGAGACCAGCTTCAACCAGTTg > 6:76320/1‑149 (MQ=255) ccGAAACCGTCGTTCAGGGTGCAGGCACCCTCGCACAGGCGGTCTTGCGGGCAAACACGGCCGCATACTTCCGGCAGGGTGTTGGTCTGGTGCGACAGTTCCGCC‑GCGGCCAGGATGTTGCCTTCGGAGACCAGCTTCAACCAGTTggg < 6:278329/149‑1 (MQ=255) cGAAACCGTCGTTCAGGGTGCAGGCACCCTCGCACAGGCGGTCTTGCGGGCAAACACGGCCGCATACTTCCGGCAGGGTGTTGGTCTGGTGCGACAGTTCCGCC‑GCGGCCAGGATGTTGCCTTCGGAGACCAGCTTCAACCAGTTggg > 7:247444/1‑148 (MQ=255) gAAACCGTCGTTCAGGGTGCAGGCACCCTCGCACAGGCGGTCTTGCGGGCAAACACGGCCGCATACTTCCGGCAGGGTGTTGGTCTGGTGCGACAGTTCCGCC‑GCGGCCAGGATGTTGCCTTCGGAGACCAGCTTCAACCAGTTGGGGa < 7:315178/149‑1 (MQ=255) cgtcgtTCAGGGTGCAGGCACCCTCGCACAGGCGGTCTTGCGGGCAAACACGGCCGCATACTTCCGGCAGGGTGTTGGTCTGGTGCGACAGTTCCGCC‑GCGGCCAGGATGTTGCCTTCGGAGACCAGCTTCAACCAGTTGGGGATGAAg > 7:32127/1‑149 (MQ=255) tgtgcgaGGGTGCCTGCACCCTCGCACAGGCGGTCTTGCGGGCAAACACGGCCGCATACTTCCGGCAGGGTGTTGGTCTGGTGCGACAGTTCCGCC‑GCGGCCAGGATGTTGCCTTCGGAGACCAGCTTCAACCAGTTg < 2:77055/132‑1 (MQ=255) tgtgcgaGGGTGCCTGCACCCTCGCACAGGCGGTCTTGCGGGCAAACACGGCCGCATACTTCCGGCAGGGTGTTGGTCTGGTGCGACAGTTCCGCC‑GCGGCCAGGATGTTGCCTTCGGAGACCAGCTTCAACCAGTTg > 1:77055/7‑138 (MQ=255) tcgtTCAGGGTGCAGGCACCCTCGCACAGGCGGTCTTGCGTGCAAACACGGCCGCATACTTCCGGCAGGGTTTTGGTCTGGTGCGACAGTTCCGCC‑GCGGCGAGGATGTTGCCTTCGGAGACCAGCTTCAACCAGTTGGGGATGAAGtt < 3:103778/149‑1 (MQ=255) tcgtTCAGGGTGCAGGCACCCTCGCACAGGCGGTCTTGCGGGCAAACACGGCCGCATACTTCCGGCAGGGTGTTGGTCTGGTGCGACAGTTCCGCC‑GCGGCCAGGATGTTGCCTTCGGAGACCAGCTTCAACCAGTTGGGGATGAAGtt < 8:32127/149‑1 (MQ=255) tcgtTCAGGGTGCAGGCACCCTCGCACAGGCGGTCTTGCGGGCAAACACGGCCGCATACTTCCGGCAGGGTGTTGGTCTGGTGCGACAGTTCCGCC‑GCGGCCAGGATGTTGCCTTCGGAGACCAGCTTCAACCAGTTGGGGATGAAGtt < 3:321277/149‑1 (MQ=255) tcgtTCAGGGTGCAGGCACCCTCGCACAGGCGGTCTTGCGGGCAAACACGGCCGCATACTTCCGGCAGGGTGTTGGTCTGGTGCGACAGTTCCGCC‑GCGGCCAGGATGTTGCCTTCGGAGACCAGCTTCAACCAGTTGGGGATGAAGtt < 2:259313/149‑1 (MQ=255) gtTCAGGGTGCAGGCACCCTCGCACAGGCGGTCTTGCGGGCAAACACGGCCGCATACTTCCGGCAGGGTGTTGGTCTGGTGCGACAGTTCCGCC‑GCGGCCAGGATGTTGCCTTCGGAGACCAGCTTCAACCAGTTGGGGATGAAGTtgt < 5:118298/149‑1 (MQ=255) gtTCAGGGTGCAGGCACCCTCGCACAGGCGGTCTTGCGGGCAAACACGGCCGCATACTTCCGGCAGGGTGTTGGTCTGGTGCGACAGTTCCGCC‑GCGGCCAGGATGTTGCCTTCGGAGACCAGCTTCAACCAGTTGGGGATGAAGTtgt < 3:208915/149‑1 (MQ=255) gtTCAGGGTGCAGGCACCCTCGCACAGGCGGTCTTGCGGGCAAACACGGCCGCATACTTCCGGCAGGGTGTTGGTCTGGTGCGACAGTTCCGCC‑GCGGCCAGGATGTTGCCTTCGGAGACCAGCTTCAACCAGTTGGGGATGAAGTtgt < 1:22499/149‑1 (MQ=255) gcgaGGGTGCCTGCACCCTCGCACAGGCGGTCTTGCGGGCAAACACGGCCGCATACTTCCGACAGGGTGTTGGTCTGGTGCGACAGTTCCGCC‑GCGGCCAGGATGTTGCCTTCGGAGACCAGCTTCa < 3:291167/124‑1 (MQ=255) gcgaGGGTGCCTGCACCCTCGCACAGGCGGTCTTGCGGGCAAACACGGCCGCATACTTCCGACAGGGTGTTGGTCTGGTGCGACAGTTCCGCC‑GCGGCCAGGATGTTGCCTTCGGAGACCAGCTTCa > 4:291167/4‑127 (MQ=255) tCAGTGTGCAGGCACCCTCGCACAGTCTGTCTTGCGGGCAAACACGTCCGCATACTTCCGGCAGGGTGTTTGTCTGGTGCTACAGTTCCGCCAGCGGCCAGGATGTTGCCTTCGGAGACCAGCGTCAACCAGTTGGGGATGAAGTtgt < 1:95245/148‑1 (MQ=255) tCAGGGTGCAGGCACCCTCGCACAGGCGGTCTTGCGGGCAAACACGGCCGCATACTTCCGGCAGGGTGTTGGTCTGGTGCGACAGTTCCGCC‑GCGGCCAGGATGTTGCCTTCGGAGACCAGCTTCAACCAGTTGGGGATGAAGtt < 3:27590/145‑1 (MQ=255) tCAGGGTGCAGGCACCCTCGCACAGGCGGTCTTGCGGGCAAACACGGCCGCATACTTCCGGCAGGGTGTTGGTCTGGTGCGACAGTTCCGCC‑GCGGCCAGGATGTTGCCTTCGGAGACCAGCTTCAACCAGTTGGGGATGAAGtt > 4:27590/1‑145 (MQ=255) ggTGCAGGCACCCTCGCACAGGCGGTCTTGCGGGCAAACACGGCCGCATACTTCCGGCAGGGTGTTGGTCTGGTGCGACAGTTCCGCC‑GCGGCCAGGATGTTGCCTTCGGAGACCAGCTTCAACCAGTTGGGGATGAAGTTGTGTACCg < 5:76320/149‑1 (MQ=255) gTGCAGGCACCCTCGCACAGGCGGTCTTGCGGGCAAACACGGCCGCATACTTCCGGCAGGGTGTTGGTCTGGTGCGACAGTTCCGCC‑GCGGCCAGGATGTTGCCTTCGGAGACCAGCTTCAACCAGTTGGGGATGAAGTTGTGTACCgg > 3:115260/1‑149 (MQ=255) aGGCACCCTCGCACAGGCGGTCTTGCGGGCAAACACGGCCGCATACTTCCGGCAGGGTGTTGGTCTGGTGCGACAGTTccg < 3:288395/81‑1 (MQ=255) aGGCACCCTCGCACAGGCGGTCTTGCGGGCAAACACGGCCGCATACTTCCGGCAGGGTGTTGGTCTGGTGCGACAGTTccg > 4:288395/1‑81 (MQ=255) aGGCACCCTCGCACAGGCGGTCTTGCGGGCAAACACGGCCGCATACTTCCGGCAGGGTGTTGGTCTGGTGCGACAGTTCCGCC‑GCGGCCAGGATGTTGCCTTCGGAGACCAGCTTCAACCAGTTGGGGATGAAGTTGTGTACCGGGCAc > 8:13126/1‑149 (MQ=255) | CCGGGCCGGCGCCGATGATGGCAACGCGCTTGCCGGTTGGCTTGACCTTGGACATGTCCGGACGCCAGCCCATGGCGAAGGCGGTGTCGGTGATGTACTTCTCCACCGAGCCGATGGTCACCGCGCCGAAACCGTCGTTCAGGGTGCAGGCACCCTCGCACAGGCGGTCTTGCGGGCAAACACGGCCGCATACTTCCGGCAGGGTGTTGGTCTGGTGCGACAGTTCCGCC‑GCGGCCAGGATGTTGCCTTCGGAGACCAGCTTCAACCAGTTGGGGATGAAGTTGTGTACCGGGCAC > NC_002947/5792853‑5793148 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |