Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 5,795,437 | C→G | 5.6% | V821V (GTG→GTC) | gltB ← | L‑glutamate synthase subunit alpha |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,795,437 | 0 | C | G | 5.6% | 281.9 / 6.3 | 89 | V821V (GTG→GTC) | gltB | L‑glutamate synthase subunit alpha |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (41/43); new base G (2/3); total (43/46) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.79e-01 |
GCGACAGTGCACCCAGCGAGATACCCGCCGAGTCG‑AAACGCTTGAGAATCGCCTCCAGCGGCTCGACCTGCTCCAGCGCCAGCGGCTGGTCGGCCACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATT‑CGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCG > NC_002947/5795295‑5795582 | gCGACAGTGCACCCAGCGAGATACCCGCCGAGTCG‑AAACGCTTGAGAATCGCCTCCAGCGGCTCGACCTGCTCCAGCGCCAGCGGCTGGTCGGCCACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGc > 7:200170/1‑149 (MQ=255) aCAGTGCACCCAGCGAGATACCCGCCGAGTCG‑AAACGCTTGAGAATCGCCTCCAGCGGCTCGACCTGCTCCAGCGCCAGCGGCTGGTCGGCCACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTGGACCAGCgcc < 5:293390/149‑3 (MQ=255) aCAGTGCACCCAGCGAGATACCCGCCGAGTCG‑AAACGCTTGAGAATCGCCTCCAGCGGCTCGACCTGCTCCAGCGCCAGCGGCTGGTCGGCCACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCgtg < 8:219314/149‑1 (MQ=255) cACCCAGCGAGATACCCGCCGAGTCG‑AAACGCTTGAGAATCGCCTCCAGCGGCTCGACCTGCTCCAGCGCCAGCGGCTGGTCGGCCACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTAt > 1:309944/1‑149 (MQ=255) ccAGCGAGATACCCGCCGAGTCGAAAACGCTTGAGAATCGCCTCCAGCGGCTCGACCTGCTCCAGCGCCAGCGGCTGGTCGGCCAGTTTCCCCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGGGTATTc > 7:46704/1‑149 (MQ=255) ccAGCGAGATACCCGCCGAGTCG‑AAACGCTTGAGAATCGCCTCCAGCGGCTCGACCTGCTCCAGCGCCAGCGGCTGGTCGGCCACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTcc < 5:110152/149‑1 (MQ=255) cAGCGAGATACCCGCCGAGTCG‑AAACGCTTGAGAATCGCCTCCAGCGGCTCGACCTGCTCCAGCGCCAGCGGCTGGTCGGCCACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCt < 1:248100/149‑1 (MQ=255) aGCGAGATACCCGCCGAGTCG‑AAACGCTTGAGAATCGCCTCCAGCGGCTCGACCTGCTCCAGCGCCAGCGGCTGGTCGGCCACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCtt > 4:160551/1‑149 (MQ=255) aGCGAGATACCCGCCGAGTCG‑AAACGCTTGAGAATCGCCTCCAGCGGCTCGACCTGCTCCAGCGCCAGCGGCTGGTCGGCCACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCtt < 1:253600/149‑1 (MQ=255) gCGAGATACCCGCCGAGTCG‑AAACGCTTGAGAATCGCCTCCAGCGGCTCGACCTGCTCCAGCGCCAGCGGCTGGTCGGCCACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTg < 4:218183/149‑1 (MQ=255) cGAGATACCCGCCGAGTCG‑AAACGCTTGAGAATCGCCTCCAGCGGCTCGACCTGCTCCAGCGCCAGCGGCTGGTCGGCCACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGa < 3:191015/149‑1 (MQ=255) cGAGATACCCGCCGAGTCG‑AAACGCTTGAGAATCGCCTCCAGCGGCTCGACCTGCTCCAGCGCCAGCGGCTGGTCGGCCACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGa < 1:69517/149‑1 (MQ=255) aCCCGCCGAGTCG‑AAACGCTTGAGAATCGCCTCCAGCGGCTCGACCTGCTCCAGCGCCAGCGGCTGGTCGGCCACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTgg > 3:224030/1‑149 (MQ=255) aCCCGCCGAGTCG‑AAACGCTTGAGAATCGCCTCCAGCGGCTCGACCTGCTCCAGCGCCAGCGGCTGGTCGGCCACTTTCACCATGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTCGTGTATTCCTTGAACTTgg > 5:290532/1‑149 (MQ=255) cccGCCGAGTCG‑AAACGCTTGAGAATCGCCTCCAGCGGCTCGACCTGCTCCAGCGCCAGCGGCTGGTCGGCCACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGc < 3:72023/149‑1 (MQ=255) ccgccgAGTCG‑AAACGCTTGAGAATCGCCTCCAGCGGCTCGACCTGCTCCAGCGCCAGCGGCTGGTCGGCCACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCg > 8:234281/1‑149 (MQ=255) ccgccgAGTCG‑AAACGCTTGAGAATCGCCTCCAGCGGCTCGACCTGCTCCAGCGCCAGCGGCTGGTCGGCCACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCg > 2:158035/1‑149 (MQ=255) ccgccgAGTCG‑AAACGCTTGAGAATCGCCTCCAGCGGCTCGACCTGCTCCAGCGCCAGCGGCTGGTCGGCCACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCg < 8:46704/149‑1 (MQ=255) cG‑AAACGCTTGAGAATCGCCTCCAGCGGCTCGACCTGCTCCAGCGCCAGCGGCTGGTCGGCCACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGccc > 8:224566/1‑149 (MQ=255) ataggCTTGAGCATCGCCTCCAGCGGCTCGACCTGCTCCAGCGCCAGCGGCTGGTCGGCGACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCctg < 6:290532/145‑1 (MQ=255) aaaCGCTTGAGAATCGCCTCCAGCGGCTCGACCTGCTCCAGCGCCAGCGGCTGGTCGGCCACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCctg < 7:234281/149‑1 (MQ=255) ttGAGAATCGCCTCCAGCGGCTCGACCTGCTCCAGCGCCAGCGGCTGGTCGGCCACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGca > 8:132792/1‑148 (MQ=255) ttGAGAATCGCCTCCAGCGGCTCGACCTGCTCCAGCGCCAGCGGCTGGTCGGCCACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGca > 2:234765/1‑148 (MQ=255) agaATCCCCTCCAGCGGCTCGACCTGCTCCAGCGCCAGCGGCTGGTCGGCCACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGACTCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGc < 6:145110/149‑1 (MQ=255) tCGCCTCCAGCGGCTCGACCTGCTCCAGCGCCAGCGGCTGGTCGGCCACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCt > 8:302015/1‑149 (MQ=255) cTCCAGCGGCTCGACCTGCTCCAGCGCCAGCGGCTGGTCGGCCACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCa < 6:226685/149‑1 (MQ=255) cTCCAGCGGCTCGACCTGCTCCAGCGCCAGCGGCTGGTCGGCCACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCa < 7:302015/149‑1 (MQ=255) ccAGCGGCTCGACCTGCTCCAGCGCCAGCGGCTGGTCGGCCACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAgg > 1:257238/1‑149 (MQ=255) cAGCGGCTCGACCTGCTCCAGCGCCAGCGGCTGGTCGGCCACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAgg < 2:309944/148‑1 (MQ=255) gCGGCTCGACCTGCTCCAGCGCCAGCGGCTGGTCGGCCACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGgtg < 4:224030/149‑1 (MQ=255) gCTCGACCTGCTCCAGCGCCAGCGGCTGGTCGGCCACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTg < 7:132792/149‑1 (MQ=255) cTCGACCTGCTCCAGCGCCAGCGGCTGGTCGGCCACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGa < 1:158035/149‑1 (MQ=255) gACCTGCTCCAGCGCCAGCGGCTGGTCGGCCACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGAcc < 1:234765/148‑1 (MQ=255) aCCTGCTCCAGCGCCAGCGGCTGGTCGGCCACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCAc > 6:249410/1‑149 (MQ=255) cTGCTCCAGCGCCAGCGGCTGGTCGGCCACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTccac > 6:228381/1‑78 (MQ=255) gCTCCAGCGCCAGCGGCTGGTCGGCCACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTcc > 6:166583/1‑149 (MQ=255) cagcgccagcgGCTGGTCGGCCACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCggg < 3:46370/148‑1 (MQ=255) cagcgccagcgGCTGGTCGGCCACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGt > 5:113402/1‑149 (MQ=255) cagcgccagcgGCTGGTCGGCCACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGt > 5:66706/1‑149 (MQ=255) cagcgccagcgGCTGGTCGGCCACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGt > 3:312176/1‑149 (MQ=255) agcgccagcgGCTGGTCGGCCACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGtt < 1:183146/149‑1 (MQ=255) gcgccagcgGCTGGTCGGCCACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTg < 6:66706/149‑1 (MQ=255) gcgccagcgGCTGGTCGGCCACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTg > 7:204636/1‑149 (MQ=255) ccagcgGCTGGTCGGCCACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGt > 7:48038/1‑144 (MQ=255) ccagcgGCTGGTCGGCCACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGt < 8:48038/144‑1 (MQ=255) agcgGCTGGTCGGCCACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGc < 2:257238/149‑1 (MQ=255) gcgGCTGGTCGGCCACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCg < 7:224566/149‑1 (MQ=255) gcgGCTGGTCGGCAACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACATGGCGTACTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCg > 2:228816/1‑149 (MQ=255) cgGCTGGTCGGCCACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGt < 5:249410/149‑1 (MQ=255) gcACTTTTACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACTCCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTTATCTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGgtg < 2:147148/112‑1 (MQ=255) ccACTTTTACCTTGAGCAAGTCACGAATCATAGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGAGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGgtg > 1:147148/1‑113 (MQ=255) cACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATT‑CGCCa > 4:268653/1‑148 (MQ=255) cACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATT‑CGCCa < 3:268653/148‑1 (MQ=255) cACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATT‑CGCCAc > 2:1373/1‑149 (MQ=255) cACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATT‑CGCCAc > 2:156350/1‑149 (MQ=255) tttCACCTTGAGCAAGTCACGAATAATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATT‑CGCCACCGt > 3:213049/1‑149 (MQ=255) ttCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATT‑CGCCACCGTg > 2:177626/1‑149 (MQ=255) tCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATT‑CGCCACCGTg > 4:34381/1‑148 (MQ=255) aCCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATT‑CGCCa > 2:206819/1‑141 (MQ=255) aCCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATT‑CGCCa < 1:206819/141‑1 (MQ=255) 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cACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATT‑CGCCACCGTg > 8:55713/1‑133 (MQ=255) cACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATT‑CGCCACCGTg < 7:55713/133‑1 (MQ=255) aCGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGt > 7:14087/1‑110 (MQ=255) aCGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGt < 8:14087/110‑1 (MQ=255) aCGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATT‑CGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGc > 8:216615/1‑149 (MQ=255) cGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATTCCGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGc < 1:177626/149‑1 (MQ=255) atcGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGt < 4:235801/109‑1 (MQ=255) atcGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGt > 3:235801/1‑109 (MQ=255) tcGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATT‑c > 2:152259/1‑115 (MQ=255) tcGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATT‑c < 1:152259/115‑1 (MQ=255) tcGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATT‑CGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGc < 1:156350/149‑1 (MQ=255) gACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATT‑CGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCt < 4:312176/148‑1 (MQ=255) ccGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATT‑CGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATc < 1:1373/149‑1 (MQ=255) cGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATT‑CGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCg > 2:156659/1‑149 (MQ=255) ccacgcTGGTGGACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATT‑CGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCgg > 8:221050/4‑149 (MQ=255) cacgcTGGTGGACCAGTGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATT‑CGCCACCGTGGACGaa > 3:23456/3‑121 (MQ=255) cacgcTGGTGGACCAGTGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATT‑CGCCACCGTGGACGaa < 4:23456/119‑1 (MQ=255) cTGGTGGACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATT‑CGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTgc < 7:221050/149‑1 (MQ=255) cTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATT‑CGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTgc < 5:166583/149‑1 (MQ=255) tGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATT‑CGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCgg > 3:97449/1‑143 (MQ=255) tGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATT‑CGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCgg < 4:97449/143‑1 (MQ=255) ggTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATT‑CGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTgcgc < 3:34381/149‑1 (MQ=255) gTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATT‑CGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTgcgcg > 6:64285/1‑149 (MQ=255) gTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATT‑CGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTgcgcg > 8:24331/1‑149 (MQ=255) caccaGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTg < 5:14814/90‑1 (MQ=255) caccaGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTg > 6:14814/1‑90 (MQ=255) | GCGACAGTGCACCCAGCGAGATACCCGCCGAGTCG‑AAACGCTTGAGAATCGCCTCCAGCGGCTCGACCTGCTCCAGCGCCAGCGGCTGGTCGGCCACTTTCACCTTGAGCAAGTCACGAATCATCGACACCGGGCGCTGGTCCACCAGCGTGGTGTATTCCTTGAACTTGGCGTAGTCGCCCTGCTGCACAGCCGCTTGCAGGGTGTTGACCACGTCCGGGTTGTAGGCGTGGTATT‑CGCCACCGTGGACGAACTTCAGCAGGCCACCTTGCTGGATCGGCTTGCGCG > NC_002947/5795295‑5795582 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |