Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 5,987,563 | C→T | 6.3% | R215R (CGC→CGT) | kefB‑III → | glutathione‑regulated potassium/H+ antiporter |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,987,563 | 0 | C | T | 6.3% | 235.1 / 4.4 | 80 | R215R (CGC→CGT) | kefB‑III | glutathione‑regulated potassium/H+ antiporter |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (34/40); new base T (2/3); total (36/44) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.07e-01 |
GCCTTGGTACCGCTGCTGGCCGCCAGTGGCCCAGACACCAGCCAAGGCGACAGCCTGCAACACGGCCTGAAGGTATTCGCCAGCATCGCCGTGGTGATCATCGGCGGTCGCTACCTGTTGCGCCCGGTGTTCCGCACCGTGGCCCGCACGGGCCTGCCGGAAGTGTCTACTGCCACCGCACTGCTGGTAGTGATCGGCACCGCCTGGCTGATGGAAGAAGCGGGTATCTCCATGGCCCTTGGCGCTTTCCTCGCCGGCCTGCTGCTGGCCGACTCGGAATACCGTCACGAGC > NC_002947/5987417‑5987708 | gCCTTGGTACCGCTGCTGGCCGCCAGTGGCCCAGACACCAGCCAAGGCGACAGCCTGCAACACGGCCTGAAGGTATTCGCCAGCATCGCCGTGGTGATCATCGGCGGTCGCTACCTGTTGCGCCCGGTGTTCCGCACCGTGGCCCGCat > 6:85749/1‑148 (MQ=255) ccTTGGTACCGCTGCTGGCCGCCAGTGGCCCAGACACCAGCCAAGGCGACAGCCTGCAACACGGCCTGAAGGTATTCGCCAGCATCGCCGTGGTGATCATCGGCGGTCGCTACCTGTTGCGCCCGGTGTTCCGCACCGTGGCCCGCACg > 7:30853/1‑149 (MQ=255) cTTGGTACCGCTGCTGGCCGCCAGTGGCCCAGACACCAGCCAAGGCGACAGCCTGCAACACGGCCTGAAGGTATTCGCCAGCATCGCCGTGGTGATCATCGGCGGTCGCTACCTGTTGCGCCCGGTGTTCCGCACCGTGGCCCGCACgg > 4:211619/1‑149 (MQ=255) cTTGGTACCGCTGCTGGCCGCCAGTGGCCCAGACACCAGCCAAGGCGACAGCCTGCAACACGGCCTGAAGGTATTCGCCAGCATCGCCGTGGTGATCATCGGCGGTCGCTACCTGTTGCGCCCGGTGTTCCGCACCGTGGCCCGCACgg < 2:259253/149‑1 (MQ=255) ttGGTACCGCTGCTGGCCGCCAGTGGCCCAGACACCAGCCAAGGCGACAGCCTGCAACACGGCCTGAAGGTATTCGCCAGCATCGCCGTGGTGATCATCGGCGGTCGCTACCTGTTGCGCCCGGTGTTCCGCACCGTGGCCCGCACggg > 1:9033/1‑149 (MQ=255) gTACCGCTGCTGGCCGCCAGTGGCCCAGACACCAGCCAAGGCGACAGCCTGCAACACGGCCTGAAGGTATTCGCCAGCATCGCCGTGGTGATCATCGGCGGTCGCTACCTGTTGCGCCCGGTGTTCCGCACCGTGGCCCGCACGGGCCt < 3:52109/149‑1 (MQ=255) gTACCGCTGCTGGCCGCCAGTGGCCCAGACACCAGCCAAGGCGACAGCCTGCAACACGGCCTGAAGGTATTCGCCAGCATCGCCGTGGTGATCATCGGCGGTCGCTACCTGTTGCGCCCGGCGTTCCGCACCGTGGCCCGTGCGGGcca < 1:190100/149‑2 (MQ=255) ctgGCCGCCAGTGGCCCAGACACCAGCCAAGGCGACAGCCTGCAACACGGCCTGAAGGTATTCGCCAGCATCGCCGTGGTGATCATCGGCGGTCGCTACCTGTTGCGCCCGGTGTTCCGCACCGTGGCCCGTGCGGGccacg > 6:324881/1‑139 (MQ=255) ctgGCCGCCAGTGGCCCAGACACCAGCCAAGGCGACAGCCTGCAACACGGCCTGAAGGTATTCGCCAGCATCGCCGTGGTGATCATCGGCGGTCGCTACCTGTTGCGCCCGGTGTTCCGCACCGTGGCCCGTGCGGGccacg < 5:324881/142‑4 (MQ=255) ctgGCCGCCAGTGGCCCAGACACCAGCCAAGGCGACAGCCTGCAACACGGCCTGAAGGTATTCGCCAGCATCGCCGTGGTGATCATCGGCGGTCGCTACCTGTTGCGCCCGGTGTTCCGCACCGTGGCCCGCACGGGCCTGCCGGaa < 3:211619/147‑1 (MQ=255) ggCCGCCAGTGGCCCAGACACCAGCCAAGGCGACAGCCTGCAACACGGCCTGAAGGTATTCGCCAGCATCGCCGTGGTGATCATCGGCGGTCGCTACCTGTTGCGCCCGGTGTTCCGCACCGTGGCCCGCACGGGCCTGCCGGAAgtgt < 7:138305/149‑1 (MQ=255) gccgccAGTGGCCCAGACACCAGCCAAGGCGACAGCCTGCAACACGGCCTGAAGGTATTCGCCAGCATCGCCGTGTTGATCAACGTCGTACCCTAAAAATTAATAAAAATTCTACGCACCGTGGCCCGCACGGGCCTGCAGGAAGTGTc > 6:130186/1‑149 (MQ=255) gccgccAGTGGCCCAGACACCAGCCAAGGCGACAGCCTGCAACACGGCCTGAAGGTATTCGCCAGCATCGCCGTGGTGATCATCGGCGGTCGCTACCTGTTGCGCCCGGTGTTCCGCACCGTGGCCCGCACGGGCCTGCCGGAAgtgt < 3:87936/148‑1 (MQ=255) gccgccAGTGGCCCAGACACCAGCCAAGGCGACAGCCTGCAACACGGCCTGAAGGTATTCGCCAGCATCGCCGTGGTGATCATCGGCGGTCGCTACCTGTTGCGCCCGGTGTTCCGCACCGTGGCCCGCACGGGCCTGCCGGAAGTGTc < 2:6448/149‑1 (MQ=255) gccgccAGTGGCCCAGACACCAGCCAAGGCGACAGCCTGCAACACGGCCTGAAGGTATTCGCCAGCATCGCCGTGGTGATCATCGGCGGTCGCTACCTGTTGCGCCCGGTGTTCCGCACCGTGGCCCGCACGGGCCTGCCGGAAGTGTc > 3:246595/1‑149 (MQ=255) cgccAGTGGCCCAGACACCAGCCAAGGCGACAGCCTGCAACACGGCCTGAAGGTATTCGCCAGCATCGCCGTGTAGATCAACGTCGTACCCTAAAAATTAAAAAAAAAATTACGCACCGTGGCCCGCACGGGCCTGCCGGAAGTGTCTa > 4:324469/1‑149 (MQ=255) ggCCCAGACACCAGCCAAGGCGACAGCCTGCAACACGGCCTGAAGGTATTCGCCAGCATCGCCGTGGTGATCATCGGCGGTCGCTACCTGTTGCGCCCGGTGTTCCGCACCGTGGCCCGCACGGGCCTGCCGGAAGTGTCTACTGCCAc > 3:126670/1‑149 (MQ=255) gCCCAGACACCAGCCAAGGCGACAGCCTGCAACACGGCCTGAAGGTATTCGCCAGCATCGCCGTGGTGATCATCGGCGGTCGCTACCTGTTGCGCCCGGTGTTCCGCACCGTGGCCCGCACGGGCCTGCCGGAAGTGTCTACTGCCAc < 6:43384/148‑1 (MQ=255) ccAGACACCAGCCAAGGCGACAGCCTGCAACACGGCCTGAAGGTATTCGCCAGCATCGCCGTGGTGATCATCGGCGGTCGCTACCTGTTGCGCCCGGTGTTCCGCACCGTGGCCCGCACGGGCCTGCCGGAAGTGTCTACTGCCACCg > 3:94066/1‑148 (MQ=255) ccAGACACCAGCCAAGGCGACAGCCTGCAACACGGCCTGAAGGTATTCGCCAGCATCGCCGTGGTGATCATCGGCGGTCGCTACCTGTTGCGCCCGGTGTTCCGCACCGTGGCCCGCACGGGCCTGCCGGAAGTGTCTACTGCCACCg > 1:108291/1‑148 (MQ=255) gtcacGAGCCAAGGCGAGAGCCTGCAACACGGCCTGAAGGTATTCGCCAGGATCGGCGTGGTGATCATCGGCGGTAGCTACCTGTTGCGCCCGGTGTTCCGCACGGTGGCCCGGACGGGCCTGCCGGAAGTGTCTACTGCCACCGCAct < 4:126670/147‑1 (MQ=255) gACACCAGCCAAGGCGACAGCCTGCAACACGGCCTGAAGGTATTCGCCAGCATCGCCGTGGTGATCATCGGCGGTCGCTACCTGTTGCGCCCGGTGTTCCGCACCGTGGCCCGCACGGGCCTGCCGGAAGTGTCTACTGCCACCGCAct < 2:99495/149‑1 (MQ=255) acCAGCCAAGGCGACAGCCTGCAACACGGCCTGAAGGTATTCGCCAGCATCGCCGTGGTGATCATCGGCGGTCGCTACCTGTTGCGCCCGGTGTTCCGCACCGTGGCCCGCACGGGCCTGCCGGAAGTGTCTACTGCCACCGCActgct > 1:145562/1‑149 (MQ=255) cAGCCAAGGCGACAGCCTGCAACACGGCCTGAAGGTATTCGCCAGCATCGCCGTGGTGATCATCGGCGGTCGCTACCTGTTGCGCCCGGTGTTCCGCACCGTGGCCCGCACgg < 6:285829/113‑1 (MQ=255) cAGCCAAGGCGACAGCCTGCAACACGGCCTGAAGGTATTCGCCAGCATCGCCGTGGTGATCATCGGCGGTCGCTACCTGTTGCGCCCGGTGTTCCGCACCGTGGCCCGCACgg > 5:285829/1‑113 (MQ=255) cAGCCAAGGCGACAGCCTGCAACACGGCCTGAAGGTATTCGCCAGCATCGCCGTGGTGATCATCGGCGGTCGCTACCTGTTGCGCCCGGTGTTCCGCACCGTGGCCCGCACGGGCCTGCCGGAAGTGTCTACTGCCACCGCACTGCTgg > 3:295529/1‑149 (MQ=255) cAGCCAAGGCGACAGCCTGCAACACGGCCTGAAGGTATTCGCCAGCATCGCCGTGGTGATCATCGGCGGTCGCTACCTGTTGCGCCCGGTGTTCCGCACCGTGGCCCGCACGGGCCTGCCGGAAGTGTCTACTGCCACCGCACTGCTgg < 4:295529/149‑1 (MQ=255) cAGCCAAGGCGACAGCCTGCAACACGGCCTGAAGGTATTCGCCAGCATCGCCGTGGTGATCATCGGCGGTCGCTACCTGTTGCGCCCGGTGTTCCGCACCGTGGCCCGCACGGGCCTGCCGGAAGTGTCTACTGACACCGCACTGCTgg > 5:74168/1‑149 (MQ=255) ccAAGGCGACAGCCTGCAACACGGCCTGAAGGTATTCGCCAGCATCGCCGTGGTGATCATCGGCGGTCGCTACCTGTTGCGCCCGGTGTTCCGCACCGTGGCCCGCACGGGCCTGCCGGAAGTGTCTACTGCCACCGCACTGCTGGTAg < 6:72632/149‑1 (MQ=255) ccAAGGCGACAGCCTGCAACACGGCCTGAAGGTATTCGCCAGCATCGCCGTGGTGATCATCGGCGGTCGCTACCTGTTGCGCCCGGTGTTCCGCACCGTGGCCCGCACGGGCCTGCCGGAAGTGTCTACTGCCACCGCACTGCTGGTAg > 4:204948/1‑149 (MQ=255) cAAGGAGACAGCCTGCAACACGGCCTGAAGGTATTCGCCAGCATCGCCGTGGTGATCATCGGCGGTCGCTACCTGTTGCGCCCGGTGTTCCGCACCGTGGCCCGCACGGGCCTGCCGGAAGTGTCTACTGCCACCGCACTGCTGGTAGt < 7:188878/149‑1 (MQ=255) cGACAGCCTGCAACACGGCCTGAAGGTATTCGCCAGCATCGCCGTGGTGATCATCGGCGGTCGCTACCTGTTGCGCCCGGTGTTCCGCACCGTGGCCCGCACGGGCCTGCCGGAAGTGTCTACTGCCACCGCACTGCTGGTAGTGATCg < 8:30853/149‑1 (MQ=255) aGCCTGCAACACGGCCTGAAGGTATTCGCCAGCATCGCCGTGTAGATCAACGACGTAACCTAAAAATTAAAAAAAAAAATACGCACCGTGGCCAGCACGGGCCTGCCGCAAGTGTCTACTGCCACCGCACTGCTCGTAGTGATCGGCAc > 8:201806/1‑149 (MQ=255) ccTGCAACACGGCCTGAAGGTATTCGCCAGCATCGCCGTGGTGATCATCGGCGGTCGCTACCTGTTGCGCCCGGTGTTCCGCACCGTGGCCCGTGCGGGccacgg > 7:90260/1‑101 (MQ=255) ccTGCAACACGGCCTGAAGGTATTCGCCAGCATCGCCGTGGTGATCATCGGCGGTCGCTACCTGTTGCGCCCGGTGTTCCGCACCGTGGCCCGTGCGGGccacgg < 8:90260/105‑5 (MQ=255) cAACACGGCATGAAGGTATTCGCCAGCATCGCCGTGGTGATCATCGGCGGTCGCTACCTGTTGCGCCCGGTGTTCCGCACCGTGGCCCGCACGGGCCTGCCGGAAGTGTCTACTGCCACCGCACTGCTGGTAGTGATCGGCACCGCCTg < 3:324469/149‑1 (MQ=255) aaCACGGCCTGAAGGTATTCGCCAGCATCGCCGTGGTGATCATCGGCGGTCGCTACCTGTTGCGCCCGGTGTTCCGCACCGTGGCCCGCACGGGCCTGCCGGAAGTGTCTACTGCCACCGCACTGCTGGTAGTGATCGGCACCGCCTgg < 4:246595/149‑1 (MQ=255) cacGGCCTGAAGGTATTCGCCAGCATCGCCGTGGTGATCATCGGCGGTCGCTACCTGTTGCGCCCGGTGTTCCGCACCGTGGCCCGCACGGGCCTGCCGGAAGTGTCTACTGCCACCGCACTGCTGGTAGTGATCGGCACCGCCTGGCt < 2:108291/149‑1 (MQ=255) acGGCCTGAAGGTATTCGCCAGCATCGCCGTGGTGATCATCGGCGGTCGCTACCTGTTGCGCCCGGTGTTCCGCACCGTGGCCCGCACGGGCCTGCCGGAAGTGTCTACTGCCACCGCACTGCTGGTAGTGATCGGCACCGCCTGGCt > 6:223252/1‑148 (MQ=255) cGGCCTGAAGGTATTCGCCAGCATCGCCGTGGTGATCATCGGCGGACGCTACCAGTTGCGCCCGATGTTCCGCACCGTGGCCCGCACCGGCCTGCCGGAAGTGTCTCCTGCCACCGCACTGCAGGTAGTGATCGGCACCGCCTGGCTGa > 4:278575/1‑149 (MQ=255) ggCCTGAAGGTATTCGCCAGCATCGCCGTGGTGATCATCGGCGGTCGCTACCTGTTGCGCCCGGTGTTCCGCACCGTGGCCCGCACGGGCCTGCCGGAAGTGTCTACTGCCACCGCACTGCTGGTAGTGATCGGCACCGCCTGGCTGAt < 3:204948/149‑1 (MQ=255) aaGGTATTCGCCAGCATCGCCGTGGTGATCATCGGCGGTCGCTACCTGTTGCGCCCGGTGTTCCGCACCGTGGCCCGCACGGGCCTGCCGGAAGTGTCTACTGCCACCGCACTGCTGGTAGTGATCGGCACCGCCTGGCTGATGgaa < 2:243097/147‑1 (MQ=255) ggTATTCGCCAGCATCGCCGTGGTGATCATCGGCGGTCGCTACCTGTTGCGCCCGGTGTTCCGCACCGTGGCCCGCACGGGCCTGCCGGAAGTGTCTACTGCCACCGCActgc < 6:193921/113‑1 (MQ=255) ggTATTCGCCAGCATCGCCGTGGTGATCATCGGCGGTCGCTACCTGTTGCGCCCGGTGTTCCGCACCGTGGCCCGCACGGGCCTGCCGGAAGTGTCTACTGCCACCGCActgc > 5:193921/1‑113 (MQ=255) ttCGCCAGCATCGCCGTGGTGATCATCGGCGGTCGCTACCTGTTGCGCCCGGTGTTCCGCACCGTGGCCCGCACGGGCCTGCCGGAAGTGTCTACTGCCACCGCACTGCTGGTAGTGATCGGCACCGCCTGGCTGATGGAAGAAGCgg < 5:223252/148‑1 (MQ=255) ttCGCCAGCATCGCCGTGGTGATCATCGGCGGTCGCTACCTGTTGCGCCCGGTGTTCCGCACCGTGGCCCGCACGGGCCTGCCGGAAGTGTCTACTGCCACCGCACTGCTGGTAGTGATCGGCACCGCCTGGCTGATGGAAGAAGCgg < 5:164871/148‑1 (MQ=255) ttCGCCAGCATCGCCGTGGTGATCATCGGCGGTCGCTACCTGTTGCGCCCGGTGTTCCGCACCGTGGCCCGCACGGGCCTGCCGGAAGTGTCTACTGCCACCGCACTGCTGGTAGTGATCGGCACCGCCTGGCTGATGGAAGAAGCgg < 4:94066/148‑1 (MQ=255) gCCAGCATCGCCGTGGTGATCATCGGCGGTCGCTACCTGTTGCGCCCGGTGTTCCGCACCGTGGCCCGCACGGGCCTGCCGGAAGTGTCTACTGCCACCGCACTGCTGGTAGTGATCGGCACCGCCTGGCTGATGGAAGAAGCGGGTAt > 8:267653/1‑149 (MQ=255) gCCAGCATCGCCGTGGTGATCATCGGCGGTCGCTACCTGTTGCGCCCGGTGTTCCGCACCGTGGCCCGCACGGGCCTGCCGGAAGTGTCTACTGCCACCGCACTGCTGGTAGTGATCGGCACCGCCTGGCTGATGGAAGAAGCGGGTAt > 3:70511/1‑149 (MQ=255) ccAGCATCGCCGTGGTGATCATCGGCGGTCGCTACCTGTTGCGCCCGGTGTTCCGCACCGTGGCCCGCACGGGCCTGCCGGAAGTGTCTACTGCCACCGCACTGCTGGTAGTGATCGGCACCGCCTGGCTGATGGAAGAAGCGGGTAtc < 2:9033/149‑1 (MQ=255) gCATCGCCGTGGTGATCATCGGCGGTCGCTACCTGTTGCGCCCGGTGTTCCGCACCGTGGCCCGCATGGGCCTGCCGGAAGTGTCTACTGCCACCGCACTGCTGGTAGTGATCGGCACCGCCTGGCTGATGGAAGAAGCGGGTATCTcc < 5:85749/149‑1 (MQ=255) cATCGCCGTGGTGATCATCGGCGGTCGCTACCTGTTGCGCCCGGTGTTCCGCACCGTGGCCCGCACGGGCCTGCCGGAAGTGTCTACTGCCACCGCACTGCTGGTAGTGATCGGCACCGCCTGGCTGATGGAAGAAGCGGGTATCTCCa < 4:70511/149‑1 (MQ=255) aTCGCCGTGGTGATCATCGGCGGTCGCTACCTGTTGCGCCCGGTGTTCCGCACCGTGGCCCGCACGGGCCTGCCGGAAGTGTCTACTGCCACCGCACTGCTGGTAGTGATCGGCACCGCCTGGCTGATgg < 5:270400/130‑1 (MQ=255) aTCGCCGTGGTGATCATCGGCGGTCGCTACCTGTTGCGCCCGGTGTTCCGCACCGTGGCCCGCACGGGCCTGCCGGAAGTGTCTACTGCCACCGCACTGCTGGTAGTGATCGGCACCGCCTGGCTGATgg > 6:270400/1‑130 (MQ=255) ccGTGGTGATCATCGGCGGTCGCTACCTGTTGCGCCCGGTGTTCCGCACCGTGGCCCGCACGGGCCTGCCGGAAGTGTCTACTGCCACCGCACTGCTGGTAGTGATCGGCACCGCCTGGCTGATGGAAGAAGCGGGTATCTCCATGGcc < 4:120227/149‑1 (MQ=255) gtgATCATCGGCGGTCGCTACCTGTTGCGCCCGGTGTTCCGCACCGTGGCCCGCACGGGCCTGCCGGAAGTGTCTACTGCCACCGCACTGCTGGTAGTGATCGGCACCGCCTGTCTGATGGAAGAAGCGGGTATCTCCATGGCCCTTg < 3:278575/148‑1 (MQ=255) tgATCATCGGCGGTCGCTACCTGTTGCGCCCGGTGTTCCGCACCGTGGCCCGCACGGGCCTGCCGGAAGTGTCTACTGCCACCGCACTGCTGGTAGTGATCGGCACCGCCTGGCTGATGGAAGAAGCGGGTATCTCCATGGCCCTTGgc > 2:346166/1‑149 (MQ=255) gATCATCGGCGGTCGCTACCTGTTGCGCCCGGTGTTCCGCACCGTGGCCCGCACGGGCCTGCCGGAAGTGTCTACTGCCACCGCACTGCTGGTAGTGATCGGCACCGCCTGGCTGATGGAAGAAGCgg < 7:171343/128‑1 (MQ=255) gATCATCGGCGGTCGCTACCTGTTGCGCCCGGTGTTCCGCACCGTGGCCCGCACGGGCCTGCCGGAAGTGTCTACTGCCACCGCACTGCTGGTAGTGATCGGCACCGCCTGGCTGATGGAAGAAGCgg > 8:171343/1‑128 (MQ=255) gATCATCGGCGGTCGCTACCTGTTGCGCCCGGTGTTCCGCACCGTGGCCCGCACGGGCCTGCCGGAAGTGTCTACTGCCACCGCACTGCTGGTAGTGATCGGCACCGCCTGGCTGATGGAAGAAGCGGGTATCTCCATGGCCCTTGgcg > 3:268155/1‑149 (MQ=255) tcatcGGCGGTCGCTACCTGTTGCGCCCGGTGTTCCGCACCGTGGCCCGCACGGGCCTGCCGGAAGTGTCTACTGCCACCGCACTGCTGGTAGTGATCGGCACCGCCt < 8:89440/108‑1 (MQ=255) tcatcGGCGGTCGCTACCTGTTGCGCCCGGTGTTCCGCACCGTGGCCCGCACGGGCCTGCCGGAAGTGTCTACTGCCACCGCACTGCTGGTAGTGATCGGCACCGCCt > 7:89440/1‑108 (MQ=255) catcGGCGGTCGCTACCTGTTGCGCCCGGTGTTCCGCACCGTGGCCCGCACGGGCCTGCCGGAAGTGTCTACTGCCACCGCACTGCTGGTAGTGATCGGCACCGCCTg > 2:197777/1‑108 (MQ=255) catcGGCGGTCGCTACCTGTTGCGCCCGGTGTTCCGCACCGTGGCCCGCACGGGCCTGCCGGAAGTGTCTACTGCCACCGCACTGCTGGTAGTGATCGGCACCGCCTg < 1:197777/108‑1 (MQ=255) atcGGCGGTCGCTACCTGTTGCGCCCGGTGTTCCGCACCGTGGCCCGCACGGGCCTGCCGGAAGTGTCTACTGCCACCGCACTGCTGGTAGTGATCGGCACCGCCTGGCTGATGGAAGAAGCGGGTATCTCCATGGCCCTTGGCGCtt > 4:121140/1‑148 (MQ=255) tcGGCGGTCGCTACCTGTTGCGCCCGGTGTTCCGCACCGTGGCCCGCACGGGCCTGCCGGAAGTGTCTACTGCCACCGCACTGCTGGTAGTGATCGGCACCGCCTGGCTGATGGAAGAAGCGGGTATCTCCATGGCCCTTGGCGCttt < 7:183630/148‑1 (MQ=255) tcGGCGGTCGCTACCTGTTGCGCCCGGTGTTCCGCACCGTGGCCCGCACGGGCCTGCCGGAAGTGTCTACTGCCACCGCACTGCTGGTAGTGATCGGCACCGCCTGGCTGATGGAAGAAGCGGGTATCTCCATGGCCCTTGGCGCTTTc > 3:152620/1‑149 (MQ=255) tcGGCGGTCGCTACATGTTGCGCCCGGTGTTCCGCACCGTGGCCCGCACGGGCCTGCCGGAAGTGTCTACTGCCACCGCACTGCTGGTAGTGATCGGCACCGCCTGGCTGATGGAAGAAGCGGGTATCTCCATGGCCCTTGGCGCttt > 8:183630/1‑148 (MQ=255) ggTCGCTACCTGTTGCGCCCGGTGTTCCGCACCGTGGCCCGCACGGGCCTGCCGGAAGTGTCTACTGCCACCGCACTGCTGGTAGTGATCGGCACCGCCTGGCTGATGGAAGAAGCGGGTATCTCCATGGCCCTTGGCGCTTTCCTCGc < 4:249405/149‑1 (MQ=255) cGCTACCTGTTGCGCCCGGTGTTCCGCACCGTGGCCCGCACGGGCCTGCCGGAAGTGTCTACTGCCACCGCACTGCTGGTAGTGATCGGCACCGCCTGGCTGATGGAAGAAGCGGGTATCTCCATGGCCCTTGGCGCTTTCCTCGCCgg > 7:114961/1‑149 (MQ=255) gTTGCGCCCGGTGTTCCGCACCGTGGCCCGCACGGGCCTGCCGGAAGTGTCTACTGCCACCGCACTGCTGGTAGTGATCGGCACCGCCTGGCTGATGGAAGAAGCgg < 6:303085/107‑1 (MQ=255) gTTGCGCCCGGTGTTCCGCACCGTGGCCCGCACGGGCCTGCCGGAAGTGTCTACTGCCACCGCACTGCTGGTAGTGATCGGCACCGCCTGGCTGATGGAAGAAGCgg > 5:303085/1‑107 (MQ=255) gcgcCCGGTGTTCCGCACCGTGGCCCGCACGGGCCTGCCTGATGTTTCTACTGCCACCGCACTGCTGGTAGTGATCGGCACCGCCTGGCTGATGGAAGAAGCGTGTATCTCCATGGCCCTTGGCGCTTTCCTCGCCGGCatgctgctg < 6:74168/148‑1 (MQ=255) cgcCCGGTGTTCCGCACCGTGGCCCGCACGGGCCTGCCGGAAGTGTCTACTGCCACCGCACTGCTGGTAGTGATCGGCACCGCCTGGCTGATGGAAGAAGCGGGTATCTCCATGGCCCTTGGCGCTTTCCTCGCCGGCCTGCTGCTGGc < 4:268155/149‑1 (MQ=255) gcacGGTGTTCCGCACAGTGGCCCGCACGGGCCTGCCGCAAGTGTCTACTGCCACCGCACAGCAGGTAGTGATCGGCACCGCCTGGCTGATGGAAGAAGCGGGTATCTCCAAGGACCTTGGCGCTTTCCTCGCCGGCCTCCTCCTGGcc > 6:141742/4‑149 (MQ=255) ccGGTGTTCCGCACCGTGGCCCGCACGGGCCTGGCGGAAGTGTCTACTGCCACCGCACTGCTGTGAGTGTTGGGCACGGGCTGGCTGATGGAAGAAGCGGGTATCTCCATGGCCCTTGGCGCTTTCCTCGCCGGCCTGCTGCTGGCCGa < 7:201806/149‑1 (MQ=255) tgtTCCGCACCGTGGCCCGCACGGGCCTGCCGGAAGTGTCTACTGCCACCGCACTGCTGGTAGTGATCGGCACCGCCTGGCTGATGGAAGAAGCGGGTATCTCCATGGCCCTTGGCGCTTTCCTCGCCGGCCTGCTGCTGGCCGACTCg < 1:346166/149‑1 (MQ=255) cGCAGCGTGGCCCGCACGGGCCTGCCGGAAGTGTCTACTGCCACCGCACTGCTGGTAGTGATCGGCACCGCCTGGCTGATg < 7:2754/81‑1 (MQ=255) cACCGTGGCCCGCACGGGCCTGCCGGAAGTGTCTACTGCCACCGCACTGCTGGTAGTGATCGGCACCGCCTGGCTGATGGAAGAAGCGGGTATCTCCATGGCCCTTGGCGCTTTCCTCGCCGGCCTGCTGCTGGCCGACTCGGAATAcc < 5:130186/149‑1 (MQ=255) ccGCACGGGCCTGCCGGAAGTGTCTACTGCCACCGCACTGCTGGTAGTGATCGGCACCGCCTGGCTGATGGAAGAAGCGGGTATCTCCATGGCCCTTGGCGCTTTCCTCGCCGGCCTGCTGCTGGCCGACTCGGAATACCGTCACGAGc > 4:327558/1‑149 (MQ=255) | GCCTTGGTACCGCTGCTGGCCGCCAGTGGCCCAGACACCAGCCAAGGCGACAGCCTGCAACACGGCCTGAAGGTATTCGCCAGCATCGCCGTGGTGATCATCGGCGGTCGCTACCTGTTGCGCCCGGTGTTCCGCACCGTGGCCCGCACGGGCCTGCCGGAAGTGTCTACTGCCACCGCACTGCTGGTAGTGATCGGCACCGCCTGGCTGATGGAAGAAGCGGGTATCTCCATGGCCCTTGGCGCTTTCCTCGCCGGCCTGCTGCTGGCCGACTCGGAATACCGTCACGAGC > NC_002947/5987417‑5987708 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |