Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 508,220 | T→A | 5.5% | N264I (AAC→ATC) | estP ← | esterase EstP |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 508,220 | 0 | T | A | 5.5% | 218.4 / 2.2 | 73 | N264I (AAC→ATC) | estP | esterase EstP |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (36/32); new base A (2/2); total (38/35) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.59e-01 |
GTAATCGGCAATCAGCTGCTGACCCGCGATGGTCGGGTGGACCGAGTCGTTGAACAGCAGTTTGGTCGGGTCTGGCGTTGTGCCGTTGATCCCGTACACCGGGTTTTCCACGCAGCTATCGCCGCTATAGCAGGTGCCGACCAGGTTCTGGTCGCTGGCCAGGCCGAACTGACTGGGGCTGGCCAGCGCCTCGCTCAACAGCAAAGGGATGTTCAGTGGAATGATCTGGGCATCGATCTGCCCTAGCTGGCTGATCAGTGACTGGTTGAACGCAGCGGAGAGCAGTGACAGT > NC_002947/508075‑508366 | gTAATCGGCAATCAGCTGCTGACCCGCGATGGTCGGGTGGCCCGAGTCGTTGAACAGCAGTTTGGTCGGGTCTGGCGTTGTGCCGTTGATCCCGTACACCGGGTTTTCCACGCAGCTATCGCCGCTATAGCAGGTGCCGACCAGGTTCt > 5:162787/1‑149 (MQ=255) tAATCGGCAATCAGCTGCTGACCCGCGATGGTCGGGTGGACCGAGTCGTTGAACAGCAGTTTGGTCGGGTCTGGCGTTGTGCCGTTGATCCCGTACACCGGGTTTTCCACGCAGCTATCGCCGCTATAGCAGGTGCCGACCAGGTTCTg < 5:257901/149‑1 (MQ=255) tAATCGGCAATCAGCTGCTGACCCGCGATGGTCGGGTGGACCGAGGCGTTGAACAGCAGTTTGGTCGGGTCTGGCGTTGTGCCGTTGATCCCGTACACCGGGTTTTCCACGCAGCTATCGCCGCTATAGCAGGTGCCGACCAGGTTCTg < 5:318031/149‑1 (MQ=255) tCGGCAATCAGCTGCTGACCCGCGATGGGCGGGTGGACCGAGTCGTTGAACAGCAGTTTGGTCGGGTCTGGCGTTGTGCCGTTGATCCCGTACACCGGGTTTTCCACGCAGCTATCGCCGCTATAGCAGGTGCCGACCAGGTTCTGGTc < 7:112420/149‑1 (MQ=255) ggCAATCAGCTGCTGACCCGCGATGGTCGGGTGGACCGAGTCGTTGAACAGCAGTTTGGTCGGGTCTGGCGTTGTGCCGTTGATCCCGTACACCGGGTTTTCCACGCAGCTATCGCCGCTATAGCAGGTGCCGACCAGGTTCTGGTCGc > 8:231520/1‑149 (MQ=255) ggCAATCAGCTGCTGACCCGCGATGGTCGGGTGGACCGAGTCGTTGAACAGCAGTTTGGTCGGGTCTGGCGTTGTGCCGTTGATCCCGTACACCGGGTTTTCCACGCAGCTATCGCCGCTATAGCAGGTGCCGACCAGGTTCTGGTCGc > 5:151497/1‑149 (MQ=255) cAATCAGCTGCTGACCCGCGATGGTCGGGTGGACCGAGTCGTTGAACAGCAGTTTGGTCGGGTCTGGCGTTGTGCCGTTGATCCCGTACACCGGGTTTTCCACGCAGCTATCGCCGCTATAGCAGGTGCCGACCAGGTTCTGGTCGCTg < 7:231520/149‑1 (MQ=255) tCAGCTGCTGACCCGCGATGGTCGGGTGGACCGAGTCGTTGAACAGCAGTTTGGTCGGGTCTGGCGTTGTGCCGTTGATCCCGTACACCGGGTTTTCCACGCAGCTATCGCCGCTATAGCAGGTGCCGACCAGGTTCTGGTc < 8:241787/142‑1 (MQ=255) tCAGCTGCTGACCCGCGATGGTCGGGTGGACCGAGTCGTTGAACAGCAGTTTGGTCGGGTCTGGCGTTGTGCCGTTGATCCCGTACACCGGGTTTTCCACGCAGCTATCGCCGCTATAGCAGGTGCCGACCAGGTTCTGGTc > 7:241787/1‑142 (MQ=255) tCAGCTGCTGACCCGCGATGGTCGGGTGGACCGAGTCGTTGAACAGCAGTTTGGTCGGGTCTGGCGTTGTGCCGTTGATCCCGTACACCGGGTTTTCCACGCAGCTATCGCCGCTATAGCAGGTGCCGACCAGGTTCTGGTCGCTGGc > 5:336698/1‑148 (MQ=255) aGCTGCTGACCCGCGATGGTCGGGTGGACCGAGTCGTTGAACAGCAGTTTGGTCGGGTCTGGCGTTGTGCCGTTGATCCCGTACACCGGGTTTTCCACGCAGCTATCGCCGCTATAGCAGGTGCCGACCAGGtt < 1:254509/134‑1 (MQ=255) aGCTGCTGACCCGCGATGGTCGGGTGGACCGAGTCGTTGAACAGCAGTTTGGTCGGGTCTGGCGTTGTGCCGTTGATCCCGTACACCGGGTTTTCCACGCAGCTATCGCCGCTATAGCAGGTGCCGACCAGGtt > 2:254509/1‑134 (MQ=255) aGCTGCTGACCCGCGATGGTCGGGTGGACCGAGTCGTTGAACAGCAGTTTGGTCGGGTCTGGCGTTGTGCCGTTGATCCCGTACACCGGGTTTTCCACGCAGCTATCGCCGCTATAGCAGGTGCCGACCAGGTTCTGGTCGCTGGCCAg < 5:89500/149‑1 (MQ=255) gctgACCCGCGATGGTCGGGTGGACCGAGTCGTTGAACAGCAGTTTGGTCGGGTCTGGCGTTGTGCCGTTGATCCCGTACACCGGGTTTTCCACGCAGCTATCGCCGCTATAGCAGGTGCCGACCAGGTTCTGGTCGCTGGCCAGGcc > 5:332691/1‑148 (MQ=255) aCCCGCGATGGTCGGGTGGACCGAGTTGTTGAACAGCAGTTTGGTCGGGTCTGGCGTTGTGCCGTTGATCCCGTACACCGGGTTTTCCACGCAGCTATCGCCGCTATAGCAGGTGCCGACCAGGTTCTGGTCGCTGGCCAGGCCGAact < 7:292139/149‑1 (MQ=255) aCCCGCGATGGTCGGGTGGACCGAGTCGTTGAACAGCAGTTTGGTCGGGTCTGGCGTTGTGCCGTTGATCCCGTACACCGGGTTTTCCACGCAGCTATCGCCGCTATAGCAGGTGCCGACCAGGTTCTGGTCGCTGGCCAGGCCGAac < 5:107171/148‑1 (MQ=255) aCCCGCGATGGTCGGGTGGACCGAGTCGTTGAACAGCAGTTTGGTCGGGTCTGGCGTTGTGCCGTTGATCCCGTACACCGGGTTTTCCACGCAGCTATCGCCGCTATAGCAGGTGCCGACCAGGTTCTGGTCGCTGGCCAGGCCGAac < 6:151497/148‑1 (MQ=255) ccGCGATGGTCGGGTGGACCGAGTCGTTGAACAGCAGTTTGGTCGGGTCTGGCGTTGTGCCGTTGATCCCGTACACCGGGTTTTCCACGCAGCTATCGCCGCTATAGCAGGTGCCGACCAGGTTCTGGTCGCTGGCCAGccccagtcag > 1:62929/1‑142 (MQ=255) cgcgATGGTCGGGTGGACCGAGTCGTTGAACAGCAGTTTGGTCGGGTCTGGCGTTGTGCCGTTGATCCCGTACACCGGGTTTTCCACGCAGCTATCGCCGCTATAGCAGGTGCCGACCAGAACCTGGTCggc < 5:64250/132‑3 (MQ=255) cgcgATGGTCGGGTGGACCGAGTCGTTGAACAGCAGTTTGGTCGGGTCTGGCGTTGTGCCGTTGATCCCGTACACCGGGTTTTCCACGCAGCTATCGCCGCTATAGCAGGTGCCGACCAGAACCTGGTCggc > 6:64250/1‑130 (MQ=255) gATGGTCGGGTGGACCGAGTCGTTGAACAGCAGTTTGGTCGGGTCTGGCGTTGTGCCGTTGATCCCGTACACCGGGTTTTCCACGCAGCTATCGCCGCTATAGCAGGTGCCGACCAGGTTCTGGTCGCTGGCCAGGCCGAACTGACTgg > 2:200140/1‑149 (MQ=255) gATGGTCGGGTGGACCGAGTCGTTGAACAGCAGTTTGGTCGGGTCTGGCGTTGTGCCGTTGATCCCGTACACCGGGTTTTCCACGCAGCTATCGCCGCTATAGCAGGTGCCGACCAGGTTCTGGTCGCTGGCCAGGCCGAACTGACTgg < 6:332691/149‑1 (MQ=255) aGTCGTTGAACAGCAGTTTGGTCGGGTCTGGCGTTGTGCCGTTGATCCCGTACACCGGGTTTTCCACGCAGCTATCGCCGCTATAGCAGGTGCCGACCAGGTTCTGGTCGCTGGCCAGGCCGAac < 1:88794/125‑1 (MQ=255) aGTCGTTGAACAGCAGTTTGGTCGGGTCTGGCGTTGTGCCGTTGATCCCGTACACCGGGTTTTCCACGCAGCTATCGCCGCTATAGCAGGTGCCGACCAGGTTCTGGTCGCTGGCCAGGCCGAac > 2:88794/1‑125 (MQ=255) aGTCGTTGAACAGCAGTTTGGTCGGGTCTGGCGTTGTGCCGTTGATCCCGTACACCGGGTTTTCCACGCAGCTATCGCCGCTATAGCAGGTGCCGACCAGGTTCTGGTCGCTGGCCAGGCCGAACTGACTgg > 1:128425/1‑132 (MQ=255) aGTCGTTGAACAGCAGTTTGGTCGGGTCTGGCGTTGTGCCGTTGATCCCGTACACCGGGTTTTCCACGCAGCTATCGCCGCTATAGCAGGTGCCGACCAGGTTCTGGTCGCTGGCCAGGCCGAACTGACTgg < 2:128425/132‑1 (MQ=255) gTCGTTGAACAGCAGTTTGGTCGGGTCTGGCGTTGTGCCGTTGATCCCGTACACCGGTTTTTCCACGCAGCTATCGCCGCTATAGCAGGTGCCGACCAGGTTCTGGTCGCTGGCCAGGCCGAACTGACTGGGGCTGGCCAGCGCCTCGc < 4:24451/149‑1 (MQ=255) ttGAACAGCAGTTTGGTCGGGTCTGGCGTTGTGCCGTTGATCCCGTACACCGGGTTTTCCACGCAGCTATCGCCGCTATAGCAGGTGCCGACCAGGTTCTgg > 1:39198/1‑102 (MQ=255) ttGAACAGCAGTTTGGTCGGGTCTGGCGTTGTGCCGTTGATCCCGTACACCGGGTTTTCCACGCAGCTATCGCCGCTATAGCAGGTGCCGACCAGGTTCTgg < 2:39198/102‑1 (MQ=255) gAACAGCAGTTTGGTCGGGTCTGGCGTTGTGCCGTTGATCCCGTACACCGGGTTTTCCACGCAGCTATCGCCGCTATAGCAGGTGCCGACCAGGTTCTGGTCGCTGGCCAGGCCGAACTGACTGGGGCTGGCCAGCGCCTCGCTCAAc < 6:336698/148‑1 (MQ=255) aaCAGCAGTTTGGTCGGGTCTGGCGTTGTGCCGTTGATCCCGTACACCGGGTTTTCCACGCAGCTATCGCCGCTATAGCAGGTGCCGACCAGGTTCTGGTCGCTGGCCAGGCCGAACTGACTGGGGCTGGCCAGCGCCTCGCTCAACAg > 3:326517/1‑149 (MQ=255) cagcagTTTGGTCGGGTCTGGCGTTGTGCCGTTGATCCCGTACACCGGGTTTTCCACGCAGCTATCGCCGCTATAGCAGGTGCCGACCAGGTTCTGGTCGCTGGCCAGGCCGAACTGACTGGGGCTGGCCAGCGCCTCGCTCAACAGc > 3:143413/1‑148 (MQ=255) gcagTTTGGTCGGGTCTGGCGTTGTGCCGTTGATCCCGTACACCGGGTTTTCCACGCAGCTATCGCCGCTATAGCAGGTGCCGACCAGGTTCTGGTCGCTGGCCAGGCCGAACTGACTGGGGCTGGCCAGCGCCTCGCTCAACAGCa > 2:203425/1‑147 (MQ=255) tGGTCGGGTCTGGCGTTGTGCCGTTGATCCCGTACACCGGGTTTTCCACGCAGCTATCGCCGCTATAGCAGGTGCCGACCAGGTTCTGGTCGCTGGCCAGGCCGAACTGACTGGGGCTGGCCAGCGCCTCGCTCAACAGCAAAGGGAt < 1:200140/148‑1 (MQ=255) gTCGGGTCTGGCGTTGTGCCGTTGATCCCGTACACCGGGTTTTCCACGCAGCTATCGCCGCTATAGCAGGTGCCGACCAGGTTCTGGTCGCTGGCCAGGCCGAACTGACTGGGGCTGGCCAGCGCCTCGCTc > 7:18998/1‑132 (MQ=255) gTCGGGTCTGGCGTTGTGCCGTTGATCCCGTACACCGGGTTTTCCACGCAGCTATCGCCGCTATAGCAGGTGCCGACCAGGTTCTGGTCGCTGGCCAGGCCGAACTGACTGGGGCTGGCCAGCGCCTCGCTc < 8:18998/132‑1 (MQ=255) tCGGGTCTGGCGTTGTGCCGTTGATCCCGTACACCGGGTTTTCCACGCAGCTATCGCCGCTATAGCAGGTGCCGACCAGGTTCTGGTCGCTGGCCAGGCCGAACTGACTGGGGCTGGCCAGCGCCTCGCTCAACAGCAAAGGGATGtt > 6:92865/1‑148 (MQ=255) gggTCTGGCGTTGTGCCGTTGATCCCGTACACCGGGTTTTCCACGCAGCTATCGCCGCTATAGCAGGTGCCGACCAGGTTCTGGTCGCTGGCCAGGCCGAACTGACTGGGGCTGGCCAGCGCCTCGTTCAACAGCAAAGGGATGTTCAg < 6:277888/149‑1 (MQ=255) gggTCTGGCGTTGTGCCGTTGATCCCGTACACCGGGTTTTCCACGCAGCTATCGCCGCTATAGCAGGTGCCGACCAGGTTCTGGTCGCTGGCCAGGCCGAACTGACTGGGGCTGGCCAGCGCCTCGCTCAACAGCAAAGGGATGTTCAg > 6:234515/1‑149 (MQ=255) gTCTGGCGTTGTGCCGTTGATCCCGTACACCGGGTTTTCCACGCAGCTATCGCCGCTATAGCAGGTGCCGACCAGGTTCTGGTCGCTGGCCAGGCCGAACTGACTGGGGCTGGCCAGCGCCTCGCTCAACAGCAAAGGGATGTTCAGTg > 7:316084/1‑149 (MQ=255) tGGCGTTGTGCCGTTGATCCCGTACACCGGGTTTTCCACGCAGCTATCGCCGCTATAGCAGGTGCCGACCAGGTTCTGGTCGCTGGCCAGGCCGAACTGACTGGGGCTGGCCAGCGCCTCGCTCAACAGCAAAGGGATGTTCAGTGGaa < 6:162787/149‑1 (MQ=255) gCGTTGTGCCGTTGATCCCGTACACCGGGTTTTCCACGCAGCTATCGCCGCTATAGCAGGTGCCGACCAGGTTCTGGTCGCTGGCCAGGCCGaa < 1:337247/94‑1 (MQ=255) gCGTTGTGCCGTTGATCCCGTACACCGGGTTTTCCACGCAGCTATCGCCGCTATAGCAGGTGCCGACCAGGTTCTGGTCGCTGGCCAGGCCGaa > 2:337247/1‑94 (MQ=255) gCGTTGTGCCGTTGATCCCGTACACCGGGTTTTCCACGCAGCTATCGCCGCTATAGCAGGTGCCGACCAGGTTCTGGTCGCTGGCCAGGCCGTACTGACTGGGGCTGGCCAGCGCCTCGCTCAACAGCAAAGGGATGTTCAGTGGaa < 5:92865/147‑1 (MQ=255) gCGTTGTGCCGTTGATCCCGTACACCGGGTTTTCCACGCAGCTATCGCCGCTATAGCAGGTGCCGACCAGGTTCTGGTCGCTGGCCAGGCCGAACTGACTGGGGCTGGCCAGCGCCTCGCTCAACAGCAAAGGGATGTTCAGTGGAATg < 7:114427/149‑1 (MQ=255) tgCCGTTGATCCCGTACACCGGGTTTTCCACGCAGCTATCGCCGCTATAGCAGGTGCCGACCAGGTTCTGGTCGCTGGCCAGGCCGAACTGACTGGGGCTGGCCAGCGCCTCGCTCAACAGCAAAGGGATGTTCAGTGGAATGATCTgg < 4:143413/149‑1 (MQ=255) ccGTTGATCCCGTACACCGGGTTTTCCACGCAGCTATCGCCGCTATAGCAGGTGCCGACCAGGTTCTGGTCGCTGGCCAGGCCGAACTGACTGGGGCTGGCCAGCGCCTCGCTCAACAGCAAAGGGATGTTCAGTGGAATGATCTggg > 5:234896/1‑148 (MQ=255) gATCCCGTACACCGGGTTTTCCACGCAGCTATCGCCGCTATAGCAGGTGCCGACCAGGTTCTGGTCGCTGGCCAGGCCGAACTGACTGGGGCTGGCCAGCGCCTCGCTCAACAGCAAAGGGATGTTCAGTGGAATGATCTGGGCATCGa > 2:176658/1‑149 (MQ=255) gATCCCGTACACCGGGTTTTCCACGCAGCTATCGCCGCTATAGCAGGTGCCGACCAGGTTCTGGTCGCTGGCCAGGCCGAACTGACTGGGGCTGGCCAGCGCCTCGCTCAACAGCAAAGGGATGTTCAGTGGAATGATCTGGGCATCGa > 2:31260/1‑149 (MQ=255) tCCCGTACACCGGGTTTTCCACGCAGCTATCGCCGCTATAGCAGGTGCCGACCAGGTTCTGGTCGCTGGCCAGGCCGAACTGACTGGGGCTGGCCAGCGCCTCGCTCAACAGCAAAGGGATGTTCAGTGGAATGATCTGGGCATCGATc > 4:15483/1‑149 (MQ=255) tCCCGTACACCGGGTTTTCCACGCAGCTATCGCCGCTATAGCAGGTGCCGACCAGGTTCTGGTCGCTGGCCAGGCCGAACTGACTGGGGCTGGCCAGCGCCTCGCTCAACAGCAAAGGGATGTTCAGTGGAATGATCTGGGCATCGATc > 6:174911/1‑149 (MQ=255) tCCCGTACACCGGGTTTTCCACGCAGCTATCGCCGCTATAGCAGGTGCCGACCAGGTTCTGGTCGCTGGCCAGGCCGAACTGACTGGGGCTGGCCAGCGCCTCGCTCAACAGCAAAGGGATGTTCAGTGGAATGATCTGGGCATCGATc > 4:10776/1‑149 (MQ=255) tCCCGTACACCGGGTTTTCCACGCAGCTATCGCCGCTATAGCAGGTGCCGACCAGGTTCTGGTCGCTGGCCAGGCCGAACTGACTGGGGCTGGCCAGCGCCTCGCTCAACAGCAAAGGGATGTTCAGTGGAATGATCTGGGCATCGATc > 8:101012/1‑149 (MQ=255) tCCCGTACACCGGGTTTTCCACGCAGCTATCGCCGCTATAGCAGGTGCCGACCAGGTTCTGGTCGCTGGCCAGGCCGAACTGACTGGGGCTGGCCAGCGCCTCGCTCAACAGAAAAGGGATGTTCAGTGGAATGATCTGGGCATCGATc > 7:263812/1‑149 (MQ=255) gTACACCGGGTTTTCCACGCAGCTATCGCCGCTATAGCAGGTGCCGACCAGGTTCTGGTCGCTGGCCAGGCCGAACTGACTGGGGCTGGCCAGCGCCTCGCTCAACAGCAAAGGGATGTTCAGTGGAATGATCTGGGCATCGATCTGcc > 6:343656/1‑149 (MQ=255) acCGGGTTTTCCACGCAGCTATCGCCGCTATAGCAGGTGCAGACCAGGTTCTGGTCGCTGGCCAGGCCGAACTGACTGGGGCTGCCCAGCGCATCGCTCAACAGCAAAGGGATGTTCAGTGGAATGATCTGGGCATCGATCTGCCCTAg > 8:180166/1‑149 (MQ=255) cGGGTTTTCCACGCAGCTATCGCCGCTATAGCAGGTGCCGACCAGGTTCTGGTCGCTGGCCAGGCCGAACTGACTGGGGCTGGCCAGCGCCTCGCTCAACAGCAAAGGGATGTTCAGTGGAATGATCTGGGCATCGATCTGCCCTAgct > 4:308442/1‑149 (MQ=255) ggTTTTCCACGCAGCTATCGCCGCTATAGCAGGTGCCGACCAGGTTCTGGTCGCTGGCCAGGCCGAACTGACTGGGGCTGGCCAGCGCCTCGCTCAACAGCAAAGGGATGTTCAGTGGAATGATCTGGGCATCGATCTGCCCTAgctgg < 4:326517/149‑1 (MQ=255) gTTTTCCACGCAGCTATCGACGCTATAGCACGTGCCGACCAGGTTCTGGTCGCAGGCCAGGCCGAACTGACTGGGGATGGACAGCGCCTCGCTCAAAAGCAAACGGATGATCAGTGGAATGATCTGGGCATCGATCTGCCCTAgctgga > 4:5008/1‑148 (MQ=255) ccACGCAGCTATCGCCGCTAAAGCAGGTGCCGACCAGGTTCTGGTCGCTGGCCAGGCCGAACTGACTGGGGCTGGCCAGCGCCTCGCTCAAAAGCAAAGGTATGTTCAGTGGAATGATCTGGGCATCGATCTGCCCTAGCTGGCTGAt < 8:125298/148‑1 (MQ=255) cACGCAGCTATCGCCGCTATAGCAGGTGCCGACCAGGTTCTGGTCGCTGGCCAGGCCGAACTGACTGGGGCTGGCCAGCGCCTCGCTCAACAGCAAAGGGATGTTCAGTGGAATGATCTGGGCATCGATCTGCCCTAGCTGGCTGATc < 5:234515/148‑1 (MQ=255) aGCTATCGCCGCTATAGCAGGTGCCGACCAGGTTCTGGTCGCTGGCCAGGCCGAACTGACTGGGGCTGGCCAGCGCCTCGCTCAACAGCAAAGGGATGTTCAGTGGAATGATCTGGGCATCGATCTGCCCTAGCTGGCTGATCAGTGAc > 8:24256/1‑149 (MQ=255) cTATCGCCGCTTTAGCAGGTGCCGTCCAGGGTCTTGTCGCTGGCCAGGCCTAACTGACTGGGGCTGGCCAGCGCCTCGCTCAACATCAATGGGATGTTCAGTGGAATGATCTGTGCATCGATCTGCCCTAGCTGGCTGATCAGTGACTg < 7:180166/149‑1 (MQ=255) tATCGCCGCTATAGCAGGTGCCGACCAGGTTCTGGTCGCTGGCCAGGCCGAACTGACTGGGGCTGGCCAGCGCCTCGCTCAACAGCAAAGGGATGTTCAGTGGAATGATCTg > 4:89381/1‑112 (MQ=255) tATCGCCGCTATAGCAGGTGCCGACCAGGTTCTGGTCGCTGGCCAGGCCGAACTGACTGGGGCTGGCCAGCGCCTCGCTCAACAGCAAAGGGATGTTCAGTGGAATGATCTg < 3:89381/112‑1 (MQ=255) aTCGCCGCTATAGCAGGTGCCGACCAGGTTCTGGTCGCTGGCCAGGCCGAACTGACTGGGGCTGGCCAGCGCCTCg > 7:203705/1‑76 (MQ=255) aTCGCCGCTATAGCAGGTGCCGACCAGGTTCTGGTCGCTGGCCAGGCCGAACTGACTGGGGCTGGCCAGCGCCTCg < 8:203705/76‑1 (MQ=255) ccgcTATAGCAGGTGCCGACCAGGTTCTGGTCGCTGGCCAGGCCGAACTGACTGGGGCTGGCCAGCGCCTCGCTCAACAGCAAAGGGATGTTCAGTGGAATGATCTGGGCATCGATCTGCCCTAGCTGGCTGATCAGTGACTGGTTGaa < 5:174911/149‑1 (MQ=255) gcTATAGCAGGTGCCGACCAGGTTCTGGTCGCTGGCCAGGCCGAACTGACTGGGGCTGGCCAGCGCCTCGCTCAACAGCAAAGGGATGTTCAGTGGAATGATCTGGGCATCGATCTGCCCTAGCTGGCTGATCAGTGACTGGTTGAACg < 6:234896/149‑1 (MQ=255) gcTATAGCAGGTGCCGACCAGGTTCTGGTCGCTGGCCAGGCCGAACTGACTGGGGCTGGCCAGCGCCTCGCTCAACAGCAAAGGGATGTTCAGTGGAATGATCTGGGCATCGATCTGCCCTAGCTGGCTGATCAGTGACTGGTTGAACg > 1:213027/1‑149 (MQ=255) aGGTGCCGACCAGGTTCTGGTCGCTGGCCAGGCCGAACTGACTGGGGCTGGCCAGCGCCTCGCTCAACAGCAAAGGGATGTTCAGTGGAATGATCTGGGCATCGATCTGCCCTAGCTGGCTGATCAGTGACTGGTTGAACGCAGCg > 8:191814/1‑146 (MQ=255) cagcGACCAGAACCTGGTCGCTGGCCAGGCCGAACTGACTGGGGCTGGCCAGCGCCTCGCTCAACAGCAAAGGGATGTTCAGTGGaa > 2:150381/4‑87 (MQ=255) cagcGACCAGAACCTGGTCGCTGGCCAGGCCGAACTGACTGGGGCTGGCCAGCGCCTCGCTCAACAGCAAAGGGATGTTCAGTGGaa < 1:150381/84‑1 (MQ=255) ggTTCTGGTCGCTGGCCAGGCCGAACTGACTGGGGCTGGCCAGCGCCTCGCTCAACAGCAAAGGGATGTTCAGTGGAATGATCTGGGCATCGATCTGCCCTAGCTGGCTGATCAGTGACTGGTTGAACGCAGCGGAGAGCAGTGACAGt < 1:203425/149‑1 (MQ=255) ggTTCTGGTCGCTGGCCAGGCCGAACTGACTGGGGCTGGCCAGCGCCTCGCTCAACAGCAAAGGGATGTTCAGTGGAATGATCTGGGCATCGATCTGCCCTAGCTGGCTGATCAGTGACTGGTTGAACGCAGCGGAGAGCAGTGACAGt < 1:176658/149‑1 (MQ=255) | GTAATCGGCAATCAGCTGCTGACCCGCGATGGTCGGGTGGACCGAGTCGTTGAACAGCAGTTTGGTCGGGTCTGGCGTTGTGCCGTTGATCCCGTACACCGGGTTTTCCACGCAGCTATCGCCGCTATAGCAGGTGCCGACCAGGTTCTGGTCGCTGGCCAGGCCGAACTGACTGGGGCTGGCCAGCGCCTCGCTCAACAGCAAAGGGATGTTCAGTGGAATGATCTGGGCATCGATCTGCCCTAGCTGGCTGATCAGTGACTGGTTGAACGCAGCGGAGAGCAGTGACAGT > NC_002947/508075‑508366 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |