| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 612,555 | T→G | 7.1% | K543Q (AAG→CAG) | dxs ← | 1‑deoxyxylulose‑5‑phosphate synthase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 612,555 | 0 | T | G | 7.1% | 261.3 / 9.0 | 84 | K543Q (AAG→CAG) | dxs | 1‑deoxyxylulose‑5‑phosphate synthase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (37/41); new base G (3/3); total (40/44) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.36e-01 | |||||||||||
AGGTGCAGAAGCGGCTTGAGCACTGCCTGGCTGGCAAGGAACTCACCCACCGCAGCGCCCGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGT‑GGCGTTGATCTGTTCGGCCACTTGCATGGCCTCGGCCAGTTGTACGCCGAACACCAGCAGGGCCACTTTTTCGCCCTGGCGGCGGACCACGCCCTTGCCGATCTCCAGTGGTTGCAGGTCTCC > NC_002947/612407‑612702 | aGGTGCAGAAGCGGCTTGAGCACTGCCTGGCTGGCAAGGAACTCACCCACCGCAGCGCCCGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCtt > 6:303609/1‑149 (MQ=255) ggTGCAGAAGCGGCTTGAGCACTGCCTGGCTGGCAAGGAACTCACCCACCGCAGCGCCCGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCtt > 2:165267/1‑148 (MQ=255) ggTGCAGAAGCGGCTTGAGCACTGCCTGGCTGGCAAGGAACTCACCCACCGCAGCGCCCGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCtt > 2:160137/1‑148 (MQ=255) gCAGAAGCGGCTTGAGCACTGCCTGGCTGGCAAGGAACTCACCCACCGCAGCGCCCGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGAc > 7:284307/1‑148 (MQ=255) gCAGAAGCGGCTTGAGCACTGCCTGGCTGGCAAGGAACTCACCCACCGCAGCGCCCGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGAc > 2:278635/1‑148 (MQ=255) cAGAAGCGGCTTGAGCACTGCCTGGCTGGCAAGGAACTCACCCACCGCAGCGCCCGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACg > 5:40026/1‑148 (MQ=255) aGAAGCGGCTTGAGCACTGCCTGGCTAGCAAGGAACTCACCCACCGCAGCGCCCGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGaa < 5:312690/149‑1 (MQ=255) cTTGAGCACTGCCTGGCTGGCAAGGAACTCACCCACCGCAGCGCCCGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCTTCGTCAAGCCGCTGGACGAGgcgctggt < 2:291804/149‑5 (MQ=255) gAGCACTGCCTGGCTGGCAAGGAACTCACCCACCGCAGCGCCCGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCg < 1:165267/148‑1 (MQ=255) gAGCACTGCCTGGCTGGCAAGGAACTCACCCACCGCAGCGCCCGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCg < 1:160137/148‑1 (MQ=255) aCTGCCTGGCTGGCAAGGACCTCAACCACCGCACCGCCCGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATCGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTCCCAGCTCTAGCACCAGCGCTTCGTCAAGCCGCTGGACGAGgcgctgg > 5:4243/1‑138 (MQ=255) aCTGCCTGGCTGGCAAGGAACTCACCCACCGCCGCGCCCGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCTTCGTCAAGCCGCTGGACGAGgcgctgg < 6:4243/141‑4 (MQ=255) tGCCTGGCTGGCAAGGAACTCACCCACCGCAGCGCCCGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGaa > 8:259922/1‑132 (MQ=255) tGCCTGGCTGGCAAGGAACTCACCCACCGCAGCGCCCGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGaa < 7:259922/132‑1 (MQ=255) tGCCTGGCTGGCAAGGAACTCACCCACCGCAGCGCCCGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCg > 2:100368/1‑149 (MQ=255) ctggctggCAAGGAACTCACCCACCGCAGCGCCCGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGT‑gg < 1:37526/149‑1 (MQ=255) gctggcAAGGAACTCACCCACCGCAGCGCCCGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGT‑GGCGt < 5:303609/149‑1 (MQ=255) gcAAGGAACTCACCCACCGCAGCGCCCGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGT‑GGCGTTGa < 1:100368/148‑1 (MQ=255) aaCTCACCCACCGCAGCGCCCGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGT‑GGCGTTGATCTGTTc < 1:278635/149‑1 (MQ=255) aCTCACCCACCGCAGCGCCCGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGT‑GGCGTTGATCTGTTCg > 4:121486/1‑149 (MQ=255) tCACCCACCGCAGCGCCCGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGT‑GGCGTTGATCTGTTCGGc > 2:277627/1‑149 (MQ=255) acccaccGCAGCGCCCGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGT‑GGCGTTGATCTGTTCGGCCa > 4:243133/1‑149 (MQ=255) acccaccGCAGCGCCCGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGT‑GGCGTTGATCTGTTCGGCCa > 4:118107/1‑149 (MQ=255) caccGCAGCGCCCGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGT‑GGCGTTGATCTGTTCGGCCACtt > 2:65200/1‑149 (MQ=255) accGCAGCGCCCGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGT‑GGCGTTGATCTGTTCGGCCACTTg < 3:118107/149‑1 (MQ=255) accGCAGCGCCCGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGT‑GGCGTTGATCTGTTCGGCCACTTg > 4:146479/1‑149 (MQ=255) ccGCAGCGCCCGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGT‑GGCGTTGATCTGTTCGGCCACTTGc < 1:277627/149‑1 (MQ=255) gCAGCGCCCGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGT‑GGCGTTGATCTGTTCGGCCACTTGCAt < 7:2054/149‑1 (MQ=255) aCCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCAGCGT‑GGCGTTGATCTGTTCGGCCACTTGCATGGCCTCGGCCAGtt < 6:40026/149‑1 (MQ=255) aCCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGT‑GGCGTTGATCTGTTCGGCCACTTGCATGGCCTCGGCCAGtt < 5:65679/149‑1 (MQ=255) ccATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGT‑GGCGTTGATCTGTTCGGCCACTTGCATGGCCTCGGCCAGTTg > 4:47251/1‑148 (MQ=255) atgatgGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGT‑GGCGTTGATCTGTTCGGCCACTTGCATGGCCTCGGCCAGTTGTAc > 3:89642/1‑149 (MQ=255) tgatgGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGT‑GGCGTTGATCTGTTCGGCCACTTGCa < 5:217177/129‑1 (MQ=255) tgatgGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGT‑GGCGTTGATCTGTTCGGCCACTTGCa > 6:217177/1‑129 (MQ=255) atgGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGT‑GGCGTTGATCTGTTCGGCCACTTGCATGGCCTCGGCCAGTTGTACGc < 8:284307/148‑1 (MQ=255) ggCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGT‑GGCGTTGATCTGTTCGGCCACTTGCATGGCCTCGGCCAGTTGTACGCCg > 2:300564/1‑148 (MQ=255) gTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGT‑GGCGTTg > 5:256113/1‑103 (MQ=255) gTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGT‑GGCGTTg < 6:256113/103‑1 (MQ=255) gTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGT‑GGCGTTGATCTGTTCGGCCACTTGCATGGCCTCGGCCAGTTGTACGCCGAaca > 5:166056/1‑149 (MQ=255) gTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGT‑GGCGTTGATCTGTTCGGCCACTTGCATGGCCTCGGCCAGTTGTACGCCGAaca > 7:97917/1‑149 (MQ=255) ttCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGT‑GGCGTTGATCTGTTCGGCCACTTGCATGGCCTCGGCCAGTTGt < 1:58932/133‑1 (MQ=255) ttCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGT‑GGCGTTGATCTGTTCGGCCACTTGCATGGCCTCGGCCAGTTGt > 2:58932/1‑133 (MQ=255) ttCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGT‑GGCGTTGATCTGTTCGGCCACTTGCATGGCCTCGGCCAGTTGTACGCCGAACACcag > 2:105282/1‑147 (MQ=255) ttCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGT‑GGCGTTGATCTGTTCGGCCACTTGCATGGCCTCGGCCAGTTGTACGCCGAACACcag > 5:16918/1‑147 (MQ=255) ttCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGT‑GGCGTTGATCTGTTCGGCCACTTGCATGGCCTCGGCCAGTTGTACGCCGAACACca < 8:18961/146‑1 (MQ=255) ttCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGT‑GGCGTTGATCTGTCCGGCCACTTGCATGGCCTCGGCCa < 4:111567/128‑1 (MQ=255) ttCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGT‑GGCGTTGATCTGTACGGCCACTTGCATGGCCTCGGCCa > 3:111567/1‑128 (MQ=255) gATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGT‑GGCGTTGATCTGTTCGGCCACTTGCATGGCCTCGGCCAGTTGTAc < 4:129200/132‑1 (MQ=255) gATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGT‑GGCGTTGATCTGTTCGGCCACTTGCATGGCCTCGGCCAGTTGTAc > 3:129200/1‑132 (MQ=255) aTGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGT‑GGCGTTGATCTGTTCGGCCACTTGCATGGCCTCGGCCAGTTGTACGCCGAACACCAGCAGGGc < 3:121486/149‑1 (MQ=255) aTGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGT‑GGCGTTGATCTGTTCGGCCACTTGCATGGCCTCGGCCAGTTGTACGCCGAACACCAGCAGGGc < 3:243133/149‑1 (MQ=255) aTGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGT‑GGCGTTGATCTGTTCGGCCACTTGCATGGCCTCGGCCAGTTGTACGCCGAACACCAGCAGGGc > 7:272147/1‑149 (MQ=255) ccAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGT‑GGCGTTGATCTGTTCGGCCACTTGCATGGCCTCGGCCAGTTGTACGCCGAACACCAGCAGGGCCACtttt < 1:51372/149‑1 (MQ=255) agcagcTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGT‑GGCGTTGATCTGTTCGGCCACTTGCATGGCCTCGGCCAGTTGTACGCCGAACACCAGCAGGGCCACTTTTTc < 3:276650/149‑1 (MQ=255) gcagcTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGT‑GGCGTTGATCTGTTCGGCCACTTGCATGGCCTCGGCCAGTTGTACGCCGAACACCAGCAGGGCCACTTTTTCg > 2:330635/1‑149 (MQ=255) cTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGT‑GGCGTTGATCTGTTCGGCCACTTGCATGGCCTCGGCCAGTTGTACGCCGAACACCAGCAGGGCCACTTTTTCGCCCt > 8:123692/1‑149 (MQ=255) aTGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGT‑GGCGTTGATCTGTTCGGCCACTTGCATGGCCTCGGCCAGTTGTACGCCGAACACCAGCAGGGCCACTTTTTCGCCCTggc > 8:251152/1‑149 (MQ=255) tGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGT‑GGCGTTGATCTGTTCGGCCACTTGCATGGCCTCGGCCAGTTGTACGCCGAACACCAGCAGGGCCACTTTTTCGCCCTggcg < 4:89642/149‑1 (MQ=255) 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aGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGT‑GGCGTTGATCTGTTCGGCCACTTGCATGGCCTCGGCCAGTTGTACGCCGAACACCAGCAGGGCCACTTTTTCGCCCTGGCGGCGGACCACGCCCTTGCCGAtctc < 6:16918/149‑1 (MQ=255) gcgcTTCGTCAAGCCGCTGGACGAGGCGCATGTCGACCACCGT‑GGCGTTGATCTGTTCgg > 1:274078/1‑60 (MQ=18) gcgcTTCGTCAAGCCGCTGGACGAGGCGCATGTCGACCACCGT‑GGCGTTGATCTGTTCgg < 2:274078/60‑1 (MQ=18) gcgcCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGT‑GGCGTTGATCTGTTCGGCCACTTGCATGGCCTCGGCCAGTTGTACGCCGAACACCAGCAGGGCCACTTTTTCGCCCTGGCGGCGGACCACGCCCTTGCCGAtctc > 5:306432/1‑148 (MQ=255) gcgcCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGT‑GGCGTTGATCTGTTCGGCCACTTGCATGGCCTCGGCCAGTTGTACGCCGAACACCAGCAGGGCCACTTTTTCGCCCTGGCGGCGGACCACGCCCTTGCCGAtctc > 3:7157/1‑148 (MQ=255) gcCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGT‑GGCGTTGATCTGTGCGGCCACTTGCATGGCCTCGGCCAGTTGTACGCCGAACACCAGCAGGGCCACTTTTTCGCCCTGGCGGCGGACCACGCCCTTGCCGAGCTCCAg < 4:338304/149‑1 (MQ=255) ccTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGT‑GGCGTTGATCTGTTCGGCCACTTGCATGGCCTCGGCCAGTTGTACGCCGAACACCAGCAGGGCCACTTTTTCGCCCTGGCGGCGGACCACGCCCTTGCCGATCTCCAGt < 3:317955/149‑1 (MQ=255) cTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGT‑GGCGTTGATCTGTTCGGCCACTTGCATGGCCTCGGCCAGTTGTACGCCGAACACCAGCAGGGCCACTTTTTCGCCCTGGCGGCGGACCACGCCCTTGCCGAt > 8:44112/1‑141 (MQ=255) cTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGT‑GGCGTTGATCTGTTCGGCCACTTGCATGGCCTCGGCCAGTTGTACGCCGAACACCAGCAGGGCCACTTTTTCGCCCTGGCGGCGGACCACGCCCTTGCCGAt < 7:44112/141‑1 (MQ=255) tCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGT‑GGCGTTGATCTGTTCGGCCACTTGCATGGCCTCGGCCAGTTGTACGCCGAACACCAGCAGGGCCACTTTTTCGCCCTGGCGGCGGACCACGCCCTTGCCGATCTCCAGTGGTTg < 7:251152/149‑1 (MQ=255) tCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGT‑GGCGTTGATCTGTTCGGCCACTTGCATGGCCTCGGCCAGTTGTACGCCGAACACCAGCAGGGCCACTTTTTCGCCCTGGCGGCGGACCACGCCCTTGCCGATCTCCAGTGGTTg < 4:32741/149‑1 (MQ=255) cAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGT‑GGCGTTGATCTGTTCGGCCACTTGCATGGCCTCGGCCAGTTGTACGCCGAACACCAGCAGGGCCACTTTTTCGCCCTGGCGGCGGACCACGCCCTTGCCGATCTCCAGTGGTTGc < 7:123692/148‑1 (MQ=255) aGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGT‑GGCGTTGATCTGTTCGGCCACTTGCATGGCCTCGGCCAGTTGTACGCCGAACACCAGCAGGGCCACTTTTTCGCCCTGGCGGCGGACCACGCCCTTGCCGATCTCCAGTGGTTGCAg < 3:47251/149‑1 (MQ=255) aGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGT‑GGCGTTGATCTGTTCGGCCACTTGCATGGCCTCGGCCAGTTGTACGCCGAACACCAGCAGGGCCACTTTTTCGCCCTGGCGGCGGACCACGCCCTTGCCGATCTCCAGTGGTTGCAg < 3:298000/149‑1 (MQ=255) aGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGT‑GGCGTTGATCTGTTCGGCCACTTGCATGGCCTCGGCCAGTTGTACGCCGAACACCAGCAGGGCCACTTTTTCGCCCTGGCGGCGGACCACGCCCTTGCCGATCTCCAGTGGTTGCAg < 6:201345/149‑1 (MQ=255) gCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGT‑GGCGTTGATCTGTTCGGCCACTTGCATGGCCTCGGCCAGTTGTACGCCGAACACCAGCAGGGCCACTTTTTCGCCCTGGCGGCGGACCACGCCCTTGCCGATCTCCAGTGGTTGCAgg > 8:21052/1‑149 (MQ=255) gCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGTGGGCGTTGATCTGTTCGGCCCCTTGCATGGCCTCGGCCAGTTATACGCCGAACACCAGCAGGGCCACTTTTTCGCCCTGGCGGCGGACCACGCCCTTGCCGATCTCCAGTg > 1:30925/1‑139 (MQ=255) gCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGT‑GGCGTTGATCTGTTCGGCCACTTGCATGGCCTCGGCCAGTTATACGCCGAACACCAGCAGGGCCACTTTTTCGCCCTGGCGGCGGACCACGCCCTTGCCGATCTCCAGTg < 2:30925/138‑1 (MQ=255) cTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGT‑GGCGTTGATCTGTTCGGCCACTTGCATGGCCTCGGCCAGTTGTACGCCGAACACCAGCAGGGCCACTTTTTCGCCCTGGCGGCGGACCACGCCCTTGCCGATCTCCAGTGGTTGCAGGtctc < 6:306432/149‑1 (MQ=255) ttGACGAAGCGCATGTCGACCACCGT‑GGCGTTGATCTGTTCGGCCACTTGCATGGCCTCGGCCAGTTGTACGCCGAACACCAGCAGGGCCACTTTCTCGCCCTGGCGGCGGACCACGCCCTTGCCGATCTCCAGTGGTTGCAGGTCTcc > 2:173629/1‑149 (MQ=255) | AGGTGCAGAAGCGGCTTGAGCACTGCCTGGCTGGCAAGGAACTCACCCACCGCAGCGCCCGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGT‑GGCGTTGATCTGTTCGGCCACTTGCATGGCCTCGGCCAGTTGTACGCCGAACACCAGCAGGGCCACTTTTTCGCCCTGGCGGCGGACCACGCCCTTGCCGATCTCCAGTGGTTGCAGGTCTCC > NC_002947/612407‑612702 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |