| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 687,721 | T→A | 7.2% | L196M (TTG→ATG) | ydgK → | Bcr/CflA family multidrug resistance transporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 687,721 | 0 | T | A | 7.2% | 193.0 / 3.3 | 64 | L196M (TTG→ATG) | ydgK | Bcr/CflA family multidrug resistance transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (29/30); new base A (2/3); total (31/33) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GGGGTGCTGGTGAACCTGGCCGGCTGGCAGTCGATCTTCCTTGCGCTGAGCCTGTTCAGTGCCGGCTGCCTGCTTGCGGTAAGCCTGGGCCTGCCGGAAAGCCTGCCCGAGCATATACCCCGCCAACCGCTGTCTGGCGCCTTGCGCCAGTACCTGCGGCTGCTGGCTGACCGGGTTTTTCTCGGCCATGCCCTGACCGGCGGTATCGCCATTGCCGGCATGTTCGCCTATATCGCCGGTTCACCTTTCGTGTTCATCAAACTGTATGGCGTGCCCGCTGAGCACTACGG > NC_002947/687580‑687869 | ggggtgCTGGTGAACCTGGCCGGCTGGCAGTCGATCTTCCTTGCGCTGAGCCTGTTCAGTGCCGGCTGCCTGCTTGCGGTAAGCCTGGGCCTGCCGGAAAGCCTGCCCGAGCATATACCCCGCCAACCGCTGTCTGGCGCCTTGCGCCa < 2:329815/149‑1 (MQ=255) tgCTGGTGAACCTGGCCGGCTGGCAGTCGATCTTCCTTGCGCTGAGCCTGTTCAGTGCCGGCTGCCTGCTTGCGGTAAGCCTGGGCCTGCCGGAAAGCCTGCCCGAGCATATACCCCGCCAACCGCTGTCTGGCGCAAGGCGCCAgaca < 2:335582/149‑4 (MQ=255) cTGGTGAACCTGGCCGGCTGGCAGTCGATCTTCCTTGCGCTGAGCCTGTTCAGTGCCGGCTGCCTGCTTGCGGTAAGCCTGGGCCTGCCGGAAAGCCTGCCCGAGCATATACCCCGCCAACCGCTGTCTGGCGCAAGGCGCCAgacag < 2:211009/148‑5 (MQ=255) ccTGGCCGGCTGGCAGTCGATCTTCCTTGCGCTGAGCCTGTTCAGTGCCGGCTGCCTGCTTGCGGTAAGCCTGGGTCTGCCGGAAAGCCTGCCCGAGCATATACCCCGCCAACCGCTGTCTGGCGCCTTGCGCCAGTACCTGCGgctgc > 6:9872/1‑149 (MQ=255) cTGGCCGGCTGGCAGTCGATCTTCCTTGCGCTGAGCCTGTTCAGTGCCGGCTGCCTGCTTGCGGTAAGCCTGGGCCTGCCGGAAAGCCTGCCCGAGCATATACCCCGCCAACCGCTGTCTGGCGCCTTGCGCCAGTACCTGCGgctgct < 7:272558/149‑1 (MQ=255) tGGCCGGCTGGCAGTCGATCTTCCTTGCGCTGAGCCTGTTCAGTGCCGGCTGCCTGCTTGCGGTAAGCCTGGGCCTGCCGGAAAGCCTGCCCGAGCATATACCCCGCCAACCGCTGTCTGGCGCCTTGCGCCAGTACCTGCGGctgctg > 6:285369/1‑149 (MQ=255) ggCCGGCTGGCAGTCGATCTTCCTTGCGCTGAGCCTGTTCAGTGCCGGCTGCCTGCTTGCGGTAAGCCTGGGCCTGCCGGAAAGCCTGCCCGAGCATATACCCCGCCAACCGCTGTCTGGCGCCTTGCGCCAGTACCTGCGGCTgctgg > 2:324685/1‑149 (MQ=255) ggCTGGCAGTCGATCTTCCTTGCGCTGAGCCTGTTCAGTGCCGGCTGCCTGCTTGCGGTAAGCCTGGGCCTGCCGGAAAGCCTGCCCGAGCATATACCCCGCCAACCGCTGTCTGGCGCCTTGCGCCAGTACCTGCGGCTGCTGGCTGa < 1:199567/149‑1 (MQ=255) gCTGGCAGTCGATCTTCCTTGCGCTGAGCCTGTTCAGTGCCGGCTGCCTGCTTGCGGTAAGCCTGGGCCTGCCGGAAAGCCTGCCCGAGCATATACCCCGCCAACCGCTGTCTGGCGCCTTgc < 8:77658/123‑1 (MQ=255) gCTGGCAGTCGATCTTCCTTGCGCTGAGCCTGTTCAGTGCCGGCTGCCTGCTTGCGGTAAGCCTGGGCCTGCCGGAAAGCCTGCCCGAGCATATACCCCGCCAACCGCTGTCTGGCGCCTTgc > 7:77658/1‑123 (MQ=255) gCTGGCAGTCGATCTTCCTTGCGCTGAGCCTGTTCAGTGCCGGCTGCCTGCTTGCGGTAAGCCTGGGCCTGCCGGAAAGCCTGCCCGAGCATATACCCCGCCAACCGCTGTCTGGCGCCTTGCGCCAGTACCTGCGGCTGCTGGCTGAc < 4:205745/149‑1 (MQ=255) tcattCGATCTTCCTTTCGCTGAGCCTGTTCAGTGCCGGCTGCCTTCTTGCGGTAAGCCTGGGCCTGCCGGAAAGCCTGCCCGAGCATATACCCCGCCAACCGCTGTCTGGCGCCTTGCGCCAGTACCTGCGGCTGCTGGCTGACCggg < 3:218024/145‑1 (MQ=255) gCAGTCGATCTTCCTTGCGCTGAGCCTGTTCAGTGCCGGCTGCCTGCTTGCGGTAAGCCTGGGCCTGCCGGAAAGCCTGCCCGAGCATATACCCCGCCAACCGCTGTCTGGCGCCTTGCGCCAGTACCTGCGGCTGCTGGCTGACCg < 6:109650/147‑1 (MQ=255) cAGTCGATCTTCCTTGCGCTGAGCCTGTTCAGTGCCGGCTGCCTGCTTGCGGTAAGCCTGGGCCTGCCGGAAAGCCTGCCCGAGCATATACCCCGCCAACCGCTGTCTGGCGCCTTGCGCCAGTACCTGCGGCTGCTGGCTGACCGGGt < 6:290852/149‑1 (MQ=255) tCGATCTTCCTTGCGCTGAGCCTGTTCAGTGCCGGCTGCCTGCTTGCGGTAAGCCTGGGCCTGCCGGAAAGCCTGCCCGAGCATATACCCCGCCAACCGCTGTCTGGCGCCTTGCGCCAGTACCTGCGGCTGCTGGCTGACCGGGttt < 2:258240/148‑1 (MQ=255) tCGATCTTCCTTGCGCTGAGCCTGTTCAGTGCCGGCTGCCTGCTTGCGGTAAGCCTGGGCCTGCCGGAAAGCCTGCCCGAGCATATACCCCGCCAACCGCTGTCTGGCGCCTTGCGCCAGTACCTGCGGCTGCTGGCTGACCGGGttt > 1:258240/1‑148 (MQ=255) ccTTGCGCTGAGCCTGTTCAGTGCCGGCTGCCTGCTTGCGGTAAGCCTGGGCCTGCCGGAAAGCCTGCCCGAGCATATACCCCGCCAACCGCTGTCTGGCGCCTTGCGCCAGTACCTGCGGCTGCTGGCTGACCGGGTTTTTCTCg < 2:180087/146‑1 (MQ=255) ccTTGCGCTGAGCCTGTTCAGTGCCGGCTGCCTGCTTGCGGTAAGCCTGGGCCTGCCGGAAAGCCTGCCCGAGCATATACCCCGCCAACCGCTGTCTGGCGCCTTGCGCCAGTACCTGCGGCTGCTGGCTGACCGGGTTTTTCTCGGc > 1:164600/1‑148 (MQ=255) gcTGAGCCTGTTCAGTGCCGGCTGCCTGCTTGCGGTAAGCCTGGGCCTGCCGGAAAGCCTGCCCGAGCATATACCCCGCCAACCGCTGTCTGGCGCCTTGCGCCAGTACCTGCGGCTGCTGGCTGACCGGGttt > 8:65846/1‑134 (MQ=255) gcTGAGCCTGTTCAGTGCCGGCTGCCTGCTTGCGGTAAGCCTGGGCCTGCCGGAAAGCCTGCCCGAGCATATACCCCGCCAACCGCTGGCTGGCGCCTTGCGCCAGTACCTGCGGCTGCTGGCTGACCGGGttt < 7:65846/134‑1 (MQ=255) tGAGCCTGTTCAGTGCCGGCTGCCTGCTTGCGGTAAGCCTGGGCCTGCCGGAAAGCCTGCCCGAGCATATACCCCGCCAACCGCTGTCTGGCGCCTTGCGCCAGTACCTGCGGCTGCTGGCTGACCGGGTTTTTCTCGGCCATGCCCt > 2:272690/1‑148 (MQ=255) ccTGTTCAGTGCCGGCTGCCTGCTTGCGGTAAGCCTGGGCCTGCCGGAAAGCCTGCCCGAGCAAAAACCCCGCCAACCGCTGTCTGGCGCCTTGCGCCAGTACCTGCGGCTGCTGGCTGACCGGGTTTTTCTCGGCCATGCCCTGACcg > 4:61839/1‑149 (MQ=255) tGTTCAGTGCCGGCTGCCTGCTTGCGGTAAGCCTGGGCCTGCCGGAAAGCCTGCCCGAGCATATACCCCGCCAACCGCTGTCTGGCGCCTTGCGCCAGTACCTGCGGCTGCTGGCTGACCGGGTTTTTCTCGGCCATGCCCTGACcggc > 4:193482/1‑149 (MQ=255) ttCAGTGCCGGCTGCCTGCTTGCGGTAAGCCTGGGCCTGCCGGAAAGCCTGCCCGAGCATATACCCCGCCAACCGCTGTCTGGCGCCTTgc < 1:74697/91‑1 (MQ=255) ttCAGTGCCGGCTGCCTGCTTGCGGTAAGCCTGGGCCTGCCGGAAAGCCTGCCCGAGCATATACCCCGCCAACCGCTGTCTGGCGCCTTgc > 2:74697/1‑91 (MQ=255) aGTGCCGGCTGCCTGCTTGCGGTAAGCCTGGGCCTGCCGGAAAGCCTGCCCGAGCATATACCCCGCCAACCGCTGTCTGGCGCCTTGCGCCAGTACCTGCGGCTGCTGGCTGACCGGGTTTTTCTCGGCCATGCCCTGACCGGCGGt < 5:340396/147‑1 (MQ=255) aGTGCCGGCTGCCTGCTTGCGGTAAGCCTGGGCCTGCCGGAAAGCCTGCCCGAGCATATACCCCGCCAACCGCTGTCTGGCGCCTTGCGCCAGTACCTGCGGCTGCTGGCTGACCGGGTTTTTCTCGGCCATGCCCTGACCGGCGGt > 6:340396/1‑147 (MQ=255) gTGCCGGCTGCCTGCTTGCGGTAAGCCTGGGTCTGCCGGAAAGCCTGCCCGAGCATATACCCCGCCAACCGCTGTCTGGCGCCTTGCGCCAGTACCTGCGGCTGCTGGCTGACCGGGTTTTTCTCGGCCATGCCCTGACCGGCGGTATc < 5:9872/149‑1 (MQ=255) gTGCCGGCTGCCTGCTTGCGGTAAGCCTGGGCCTGCCGGAAAGCCTGCCCGAGCATATACCCCGCCAACCGCTGTCTGGCGCCTTGCGCCAGTACCTGCGGCTGCTGGCTGACCGGGTTTTTCTCGGCCATGCCCTGACCGGCGGTATc > 7:23893/1‑149 (MQ=255) ccGGCTGCCTGCTTGCGGTAAGCCTGGGCCTGCCGGAAAGCCTGCCCGAGCATATACCCCGCCAACCGCTGTCTGGCGCCTTGCGCCAGTACCTGCGGCTGCTGGCTGACCGGGTTTTTCTCGGCCATGCCCTGACCGGCGGTATCGc > 2:56992/1‑148 (MQ=255) ccGGCTGCCTGCTTGCGGTAAGCCTGGGCCTGCCGGAAAGCCTGCCCGAGCATAAACCCCGCCAACCCCAGTAATGCGCCATGCGCCAGTACCTTCGGCTGCTGGCATCCCGGGGTTTTCAACGCCAAGCCCTTCCCGGCGGTAtacc > 1:263529/1‑145 (MQ=255) gCTGCCTGCTTGCGGTAAGCCTGGGCCTGCCGGAAAGCCTGCCCGAGCATATACCCCGCCAACCGCTGTCTGGCGCCTTGCGCCAGTACCTGCGGCTGCTGGCTGACCGGGTTTTTCTCGGCCATGCCCTGACCGGCGGTATCGCCAtt > 5:222168/1‑149 (MQ=255) ggTAAGCCTGGGCCTGCCGGAAAGCCTGCCCGAGCATATACCCCGCCAACCGCTGTCTGGCGCCTTGCGCCAGTACCTGCGGCTGCTGGCTGACCGGGTTTTTCTCGGCCAt < 6:88036/112‑1 (MQ=255) ggTAAGCCTGGGCCTGCCGGAAAGCCTGCCCGAGCATATACCCCGCCAACCGCTGTCTGGCGCCTTGCGCCAGTACCTGCGGCTGCTGGCTGACCGGGTTTTTCTCGGCCAt > 5:88036/1‑112 (MQ=255) tAAGCCTGGGCCTGCCGGAAAGCCTGCCCGAGCATATACCCCGCCAACCGCTGTCTGGCGCCTTGCGCCAGTACCTGCGGCTGCTGGCTGACCGGGTTTTTCTCGGCCATGcc > 5:41476/1‑113 (MQ=255) tAAGCCTGGGCCTGCCGGAAAGCCTGCCCGAGCATATACCCCGCCAACCGCTGTCTGGCGCCTTGCGCCAGTACCTGCGGCTGCTGGCTGACCGGGTTTTTCTCGGCCATGcc < 6:41476/113‑1 (MQ=255) aGCCTGGGCCTGCCGGAAAGCCTGCCCGAGCATATACCCCGCCAACCGCTGTCTGGCGCCTTGCGCCAGTACCTGCTGCTGCTGGCTGACCGGGTTTTTCTCGGCCATGCCCTGACCGGCGGTATCGCCATTGCCGGCATGTTCGCCt < 4:126746/148‑1 (MQ=255) cTGCCGGAAAGCCTGCCCGAGCATATACCCCGCCAACCGCTGTCTGGCGCCTTGCGCCAGTACCTGCGGCTGCTGGCTGACCGGGTTTTTCTCGGCCATGCCCTGACCGGCGGTATCGCCATTGCCGGCATGTTCGCCTATATCGCCgg < 1:272690/149‑1 (MQ=255) gCCGGAAAGCCTGCCCGAGCATATACCCCGCCAACCGCTGTCTGGCGCCTTGCGCCAGTACCTGCGGCTGCTGGCTGACCGGGTTTTTCTCGGCCATGCCCTGACCGGCGGTATCGCCATTGCCGGCATGTTCGCCTATATCGCCGGtt > 8:184933/1‑149 (MQ=255) ccGGAAAGCCTGCCCGAGCATATACCCCGCCAACCGCTGTCTGGCGCCTTGCGCCAGTACCTGCGGCTGCTGGCTGACCGGGTTTTTCTCGGCCATGCCCTGACCGGCGGTATCGCCATTGCCGGCATGTTCGCCTATATCGCCGGtt > 3:119063/1‑148 (MQ=255) ccGGAAAGCCTGCCCGAGCATATACCCCGCCAACCGCTGTCTGGCGCCTTGCGCCAGTACCTGCGGCTGCTGGCTGACCGGGTTTTTCTCGGCCATGCCCTGACCGGCGGTATCGCCATTGCCGGCATGTTCGCCTATATCGCCGGtt < 1:324685/148‑1 (MQ=255) ccGGAAAGCCTGCCCGAGCATATACCCCGCCAACCGCTGTCTGGCGCCTTGCGCCAGTACCTGCGGCTGCTGGCTGACCGGGTTTTTCTCGGCCATGCCCTGACCGGCGGTATCGCCATTGCCGGCATGTTCGCCTATATCGCCGGtt > 5:91517/1‑148 (MQ=255) ggAAAGCCTGCCCGAGCATATACCCCGCCAACCGCTGTCTGGCGCCTTGCGCCAGTACCTGCGGCTGCTGGCTGACCGGGTTTTTCTCGGCCATGCCCTGACCGGCGGTATCGCCATTGCCg < 2:155638/122‑1 (MQ=255) ggAAAGCCTGCCCGAGCATATACCCCGCCAACCGCTGTCTGGCGCCTTGCGCCAGTACCTGCGGCTGCTGGCTGACCGGGTTTTTCTCGGCCATGCCCTGACCGGCGGTATCGCCATTGCCg > 1:155638/1‑122 (MQ=255) ccTGCCCGAGCATATACCCCGCCAACCGCTGTCTGGCGCCTTGCGCCAGTACCTGCGGCTGCTGGCTGACCGGGTTTTTCTCGGCCATGCCCTGACCGGCGGTATCGCCATTGCCGGCATGTTCGCCTATATCGCCGGTTCACCTTTCg > 3:74189/1‑149 (MQ=255) gCCCGAGCATATACCCCGCCAACCGCTGTCTGGCGCCTTGCGCCAGTACCTGCGGCTGCTGGCTGACCGGGTTTTTCTCGGCCATGCCCTGACCGGCGGTATCGCCATTGCCGGCATGTTCGCCTATATCGCCGGTTCACCTTTCgtgt > 1:106034/1‑149 (MQ=255) ccGAGCATATACCCCGCCAACCGCTGTCTGGCGCCTTGCGCCAGTACCTGCGGCTGCTGGCTGACCGGGTTTTTCTCGGCCATGCCCTGACCGGCGGTATCGCCATTGCCGGCATGTTCGCCTATATCGCCGGTTCACCTTTCGTGTtc < 5:285369/149‑1 (MQ=255) atatACCCCGCCAACCGCTGTCTGGCGCCTTGCGCCAGTACCTGCGGCTGCTGGCTGACCGGGTTTTTCTCGGCCATGCCCTGACCGGCGGTATCGCCATTGCCGGCATGTTCGCCTATATCGCCGGTTCACCTTTCGTGTTCATCaaa < 2:263529/149‑1 (MQ=255) tataCCCCGCCAACCGCTGTCTGGCGCCTTGCGCCAGTACCTGCGGCTGCTGGCTGACCGGGTTTTTCTCGGCCATGCCCTGACCGGCGGTATCGCCATTGCCGGCATGTTCGCCTATATCGCCGGTTCACCTTTCGTGTTCATCAAAc > 2:62766/1‑149 (MQ=255) ataCCCCGCCAACCGCTGTCTGGCGCCTTGCGCCAGTACCTGCGGCTGCTGGCTGACCGGGTTTTTCTCGGCCATGCCCTGACCGGTGGTATCGCCATTGCCGGCATGTTCGCCtat < 8:290927/117‑1 (MQ=255) ataCCCCGCCAACCGCTGTCTGGCGCCTTGCGCCAGTACCTGCGGCTGCTGGCTGACCGGGTTTTTCTCGGCCATGCCCTGACCGGTGGTATCGCCATTGCCGGCATGTTCGCCtat > 7:290927/1‑117 (MQ=255) ataCCCCGCCAACCGCTGTCTGGCGCCTTGCGCCAGTACCTGCGGCTGCTGGCTGACCGGGTTTTTCTCGGCCATGCCCTGACCGGCGGTATCGCCATTGCCGGCATGTTCGCCTATATCGCCGGTTCACCTTTCGTGTTCATCAAACt > 7:194197/1‑149 (MQ=255) ccccGCCAACCGCTGTCTGGCGCCTTGCGCCAGTACCTGCGGCTGCTGGCTGACCGGGTTTTTCTCGGCCATGCCCTGACCGGCGGTATCGCCATTGCCGGCATGTTCGCCTATATCGCCGGTTCACCTTTCGTGTTCATCAAACTGTa < 1:62766/149‑1 (MQ=255) ccccGCCAACCGCTGTCTGGCGCCTTGCGCCAGTACCTGCGGCTGCTGGCTGACCGCGTTTTTCTCGGCCATGCCCTGACCGGCGGTATCGCCATTGCCGGCATGTTCGCCTATATCGCCGGTTCACCTTTAGTGTTAATCAAACTGTa > 7:107474/1‑149 (MQ=255) aaCCGCTGTCTGGCGCCTTGCGCCAGTACCTGCGGCTGCTGGCTGACCGGGTGTTTCTCGGCCATGCCCTGACCGGCGGTATCGCCATTGCCGGCATGTTCGCCTATATCGCCGGTTCACCTTTCGTGTTCATCAAACTGTATGGCGTg < 4:23299/149‑1 (MQ=255) cGCTGTCTGGCGCCTTGCGCCAGTACCTGCGGCTGCTGGCTGACCGGGTTTTTCTCGGCCATGCCCTGACCGGCGGTATCGCCATTGCCGGCATGTTCGCCTATATCGCCGGTTCACCTTTCGTGTTCATCAAACTGTATGGCGTGccc > 6:28389/1‑149 (MQ=255) gtacTGGCGCAAGGCGCCAGTACCTGCGGCTGCTGGCTGACCGGGTTTTTCTCGGCCATGCCCTGACCGGCGGTATCGCCATTGCCGGCATGTTCGCCTATATCGCCGGTTCACCTTTCGTGTTCATCAAACTGTATg < 7:232428/135‑1 (MQ=255) gtacTGGCGCAAGGCGCCAGTACCTGCGGCTGCTGGCTGACCGGGTTTTTCTCGGCCATGCCCTGACCGGCGGTATCGCCATTGCCGGCATGTTCGCCTATATCGCCGGTTCACCTTTCGTGTTCATCAAACTGTATg > 8:232428/4‑138 (MQ=255) gTCTGGCGCCTTGCGCCAGTACCTGCGGCTGCTGGCTGACCGGGTTTTTCTCGGCCATGCCCTGACCGGCGGTATCGCCATTGCCGGCATGTTCGCCTATATCGCCGGTTCACCTTTCGTGTTCATCAAACTGTATGGCGTGCCCGCTg < 3:193482/149‑1 (MQ=255) tCTGGCGCCTTGCGCCAGTACCTGCGGCTGCTGGCTGACCGGGTTTTTCTCGGCCATGCCCTGACCGGCGGTATCGCCATTGCCGGCATGTTCGCCTATATCGCCGGTTCACCTTTCGTGTTCATCAAACTGTATGGCGTGCCCGCTGa < 2:106034/149‑1 (MQ=255) tCTGGCGCCTTGCGCCAGTACCTGCGGCTGCTGGCTGACCGGGTTTTTCTCGGCCATGCCCTGACCGGCGGTATCGCCATTGCCGGCATGTTCGCCTATATCGCCGGTTCACCTTTCGTGTTCATCAAACTGTATGGCGTGCCCGCTGa < 2:164600/149‑1 (MQ=255) cTGGCGCCTTGCGCCAGTACCTGCGGCTGCTGGCTGACCGGGTTTTTCTCGGCCATGCCGTGACCGGCGGTATCGCCATTGCCGGCATGTTCGCCTATATCGCCGGTTCACCTTTCGTGTTCATCAAACTGTATGGCGTGCCCGCTGa < 3:61839/148‑1 (MQ=255) gcCTTGCGCCAGTACCTGCGGCTGCTGGCTGACCGGGTTTTTCTCGGCCATGCCCTGACCGGCGGTATCGCCATTGCCGGCATGTTCGCCTATATCGCCGGTTCACCTTTCGTGTTCATCAAACTGTATGGCGTGCCCGCTGAGCACTa > 7:142943/1‑149 (MQ=255) cTTGCGCCAGTACCTGCGGCTGCTGGCTGACCGGGTTTTTCTCGGCCATGCCCTGACCGGCGGTATCGCCATTGCCGGCATGTTCGCCTATATCGCCGGTTCACCTTTCGTGTTCATCAAACTGTATGGCGTGCCCGCTGAGCACTACg < 7:184933/149‑1 (MQ=255) ttGCGCCAGTACCTGCGGCTGCTGGCTGACCGGGTTTTTCTCGGCCATGCCCTGACCGGCGGTATCGCCATTGCCGGCATGTTCGCCTATATCGCCGGTTCACCTTTCGTGTTCATCAAACTGTATGGCGTGCCCGCTGAGCACTACgg > 3:221040/1‑149 (MQ=255) | GGGGTGCTGGTGAACCTGGCCGGCTGGCAGTCGATCTTCCTTGCGCTGAGCCTGTTCAGTGCCGGCTGCCTGCTTGCGGTAAGCCTGGGCCTGCCGGAAAGCCTGCCCGAGCATATACCCCGCCAACCGCTGTCTGGCGCCTTGCGCCAGTACCTGCGGCTGCTGGCTGACCGGGTTTTTCTCGGCCATGCCCTGACCGGCGGTATCGCCATTGCCGGCATGTTCGCCTATATCGCCGGTTCACCTTTCGTGTTCATCAAACTGTATGGCGTGCCCGCTGAGCACTACGG > NC_002947/687580‑687869 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |