| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,059,963 | A→C | 5.1% | I37L (ATC→CTC) | iciA → | chromosome initiation inhibitor |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,059,963 | 0 | A | C | 5.1% | 248.0 / 4.3 | 78 | I37L (ATC→CTC) | iciA | chromosome initiation inhibitor |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (38/36); new base C (2/2); total (40/38) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.15e-01 | |||||||||||
AACAAATAAAGCTCTTCACCCATTAGGAAAATCGATGTTCGACTACAAACTGCTGGCTGCCCTCGCGGCAGTGATCGAACAAGGCGGTTTCGAGCGTGCGGCGCAGGTGCTGGGCTT‑GTCGCAATCGGCGATTTCCCAGCGCATCAAGTTGCTTGAGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTGC‑T‑GGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGT > NC_002947/1059821‑1060099 | aaCAAATAAAGCTCTTCACCCATTAGGAAAATCGATGTTCGACTACAAACTGCTGGCTGCCCTCGCGGCAGTGATCGAACAAGGCGGTTTCGAGCGTGCGGCGCAGGTGCTGGGCTT‑GTCGCAATCGGCGATTTCCCAGCGCATCAAGt > 6:54775/1‑149 (MQ=255)aaCAAATAAAGCTCTTCACCCATTAGGAAAATCGATGTTCGACTACAAACTGCTGGCTGCCCTCGCGGCAGTGATCGAACAAGGCGGTTTCGAGCGTGCGGCGCAGGTGCTGGGCTT‑GTCGCAATCGGCGATTTCCCAGCGCATCAAGt < 3:195733/149‑1 (MQ=255)aaCAAATAAAGCTCTTCACCCATTAGGAAAATCGATGTTCGACTACAAACTGCTGGCTGCCCTCGCGGCAGTGATCGAACAAGGCGGTTTCGAGCGTGCGGCGCAGGTGCTGGGCTT‑GTCGCAATCGGCGATTTCCCAGCGCATCAAGt > 3:103632/1‑149 (MQ=255) aCAAATAAAGCTCTTCACCCATTAGGAAAATCGATGTTCGACTACAAACTGCTGGCTGCCCTCGCGGCAGTGATCGAACAAGGCGGTTTCGAGCGTGCGGCGCAGGTGCTGGGCTT‑GTCGCAATCGGCGATTTCCCAGCGCATCAAGtt > 6:280347/1‑149 (MQ=255) cAAATAAAGCTCTTCACCCATTAGGAAAATCGATGTTCGACTACAAACTGCTGGCTGCCCTCGCGGCAGTGATCGAACAAGGCGGTTTCGAGCGTGCGGCGCAGGTGCTGGGCTT‑GTCGCAATCGGCGATTTCCCAGCGCCTCAAgcaa > 3:6546/1‑146 (MQ=255) aaaTAAAGCTCTTCACCCATTAGGAAAATCGATGTTCGACTACAAACTGCTGGCTGCCCTCGCGGCAGTGATCGAACAAGGCGGTTTCGAGCGTGCGGCGCAGGTGCTGGGCTT‑GTCGCAATCGGCGATTTCCCAGCGCATCAAGTTGc > 2:245960/1‑149 (MQ=255) aTAAAGCTCTTCACCCATTAGGAAAATCGATGTTCGACTACAAACTGCTGGCTGCCCTCGCGGCAGTGATCGAACAAGGCGGTTTCGAGCGTGCGGCGCAGGTGCTGGGCTT‑GTCGCAATCGGCGATTTCCCAGCGCATCAAGTTGCtt > 7:228821/1‑149 (MQ=255) cACCCATTAGGAAAATCGATGTTCGACTACAAACTGCTGGCTGCCCTCGCGGCAGTGATCGAACAAGGCGGTTTCGAGCGTGCGGCGCAGGTGCTGGGCTT‑GTCGCAATCGGCGATTTCCCAGCGCATCAAGTTGCTTGAGGCGCgg < 4:64885/147‑1 (MQ=255) aCCCATTAGGAAAATCGATGTTCGACTACAAACTGCTGGCTGCCCTCGCGGCAGTGATCGAACAAGGCGGTTTCGAGCGTGCGGCGCAGGTGCTGGGCTT‑GTCGCAATCGGCGATTTCCCAGCGCCTCAAGCAACTTGATGCGCtggg < 4:6546/148‑2 (MQ=255) aCCCATTAGGAAAATCGATGTTCGACTACAAACTGCTGGCTGCCCTCGCGGCAGTGATCGAACAAGGCGGTTTCGAGCGTGCGGCGCAGGTGCTGGGCTT‑GTCGCAATCGGCGATTTCCCAGCGCATCAAGTTGCTTGAGGCGCGGGTc < 5:54775/149‑1 (MQ=255) cccATTAGGAAAATCGATGTTCGACTACAAACTGCTGGCTGCCCTCGCGGCAGTGATCGAACAAGGCGGTTTCGAGCGTGCGGCGCAGGTGCTGGGCTT‑GTCGCAATCGGCGATTTCCCAGCGCATCAAGTTGCTTGAGGCGCGGGTCg < 7:196965/149‑1 (MQ=255) cccATTAGGAAAATCGATGTTCGACTACAAACTGCTGGCTGCCCTCGCGGCAGTGATCGAACAAGGCGGTTTCGAGCGTGCGGCGCAGGTGCTGGGCTT‑GTCGCAATCGGCGATTTCCCAGCGCATCAAGTTGCTTGAGGCGCGGGTCg < 8:228821/149‑1 (MQ=255) ccATTAGGAAAATCGATGTTCGACTACAAACTGCTGGCTGCCCTCGCGGCAGTGATCGAACAAGGCGGTTTCGAGCGTGCGGCGCAGGTGCTGGGCTT‑GTCGCAATCGGCGATTTCCCAGCGCATCAAGTTGCTTGAGGCGCGGGTCgg > 4:19787/1‑149 (MQ=255) ggAAAATCGATGTTCGACTACAAACTGCTGGCTGCCCTCGCGGGAGTGATCGAACAAGGCGGTTTCGAGCGTGCGGCGCAGGTGCTGGGCTT‑GTCGCAATCGGCGATTTCCCCGCGCCTCAAGCAACTTGATgcgctg < 6:26486/138‑3 (MQ=255) ggAAAATCGATGTTCGACTACAAACTGCTGGCTGCCCTCGCGGCAGTGATCGAACAAGGCGGTTTCGAGCGTGCGGCGCAGGTGCTGGGCTT‑GTCGCAATCGGCGATTTCCCCGCGCCTCAAGCAACTTGATgcgctg > 5:26486/1‑136 (MQ=255) ggAAAATCGATGTTCGACTACAAACTGCTGGCTGCCCTCGCGGCAGTGATCGAACAAGGCGGTTTCGAGCGTGCGGCGCAGGTGCTGGGCTT‑GTCGCAATCGGCGATTTCCCAGCGCATCAAGTTGCTTGAGGCGCGGGTCGGCCAGcc < 6:109736/149‑1 (MQ=255) gAAAATCGATGTTCGACTACAAACTGCTGGCTGCCCTCGCGGCAGTGATCGAACAAGGCGGTTTCGAGCGTGCGGCGCAGGTGCTGGGCTT‑GTCGCAATCGGCGATTTCCCAGCGCATCAAGTTGCTTGAGGCGCGGGTCGGCCAGCCg > 2:140801/1‑149 (MQ=255) aaaTCGATGTTCGACTACAAACTGCTGGCTGCCCTCGCGGCAGTGATCGAACAAGGCGGTTTCGAGCGTGCGGCGCAGGTGCTGGGCTT‑GTCGCAATCGGCGATTTCCCAGCGCATCAAGTTGCTTGAGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGt < 3:121134/149‑1 (MQ=255) aaTCGATGTTCGACTACAAACTGCTGGCTGCCCTCGCGGCAGTGATCGAACAAGGCGGTTTCGAGCGTGCGGCGCAGGTGCTGGGCTT‑GTCGCAATCGGCGATTTCCCAGCGCATCAAGTTGCTTGAGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTg < 6:307656/149‑1 (MQ=255) gATGTTCGACTACAAACTGCTGGCTGCCCTCGCGGCAGTGATCGAACAAGGCGGTTTCGAGCGTGCGGCGCAGGTGCTGGGCTT‑GTCGCAATCGGCGATTTCCCAGCGCATCAAGTTGCTTGAGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTGC‑T‑gg > 2:306290/1‑149 (MQ=255) gATGTTCGACTACAAACTGCTGGCTGCCCTCGCGGCAGTGATCGAACAAGGCGGTTTCGAGCGTGCGGCGCAGGTGCTGGGCTT‑GTCGCAATCGGCGATTTCCCAGCGCATCAAGTTGCTTGAGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTGC‑T‑g < 4:103632/148‑1 (MQ=255) cGACTACAAACTGCTGGCTGCCCTCGCGGCAGTGATCGAACAAGGCGGTTTCGAGCGTGCGGCGCAGGTGCTGGGCTT‑GTCGCAATCGGCGATTTCCCAGCGCATCAAGTTGCTTGAGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTGC‑T‑GGTACGt < 3:19787/148‑1 (MQ=255) gACTACAAACTGCTGGCTGCCCTCGCGGCAGTGATCGAACAAGGCGGTTTCGAGCGTGCGGCGCAGGTGCTGGGCTT‑GTCGCAATCGGCGATTTCCCAGCGCATCAAGTTGCTTGAGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTGC‑T‑GGt < 7:299609/143‑1 (MQ=255) gACTACAAACTGCTGGCTGCCCTCGCGGCAGTGATCGAACAAGGCGGTTTCGAGCGTGCGGCGCAGGTGCTGGGCTT‑GTCGCAATCGGCGATTTCCCAGCGCATCAAGTTGCTTGAGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTGC‑T‑GGTACGTGc > 5:84705/1‑149 (MQ=255) gACTACAAACTGCTGGCTGCCCTCGCGGCAGTGATCGAACAAGGCGGTTTCGAGCGTGCGGCGCAGGTGCTGGGCTT‑GTCGCAATCGGCGATTTCCCAGCGCATCAAGTTGCTTGAGGCGCGCGTCGGCCAGACGGTGG‑T‑GGTaaga > 8:299609/1‑144 (MQ=255) cAAACTGCTGGCTGCCCTCGCGGCAGTGATCGAACAAGGCGGTTTCGAGCGTGCGGCGCAGGTGCTGGGCTT‑GTCGCAATCGGCGATTTCCCAGCGCATCAAGTTGCTTGAGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTGC‑T‑GGTACGTGCCTcgc > 8:199882/1‑149 (MQ=255) cAAACTGCTGGCTGCCCTCGCGGCAGTGATCGAACAAGGCGGTTTCGAGCGTGCGGCGCAGGTGCTGGGCTT‑GTCGCAATCGGCGATTTCCCAGCGCATCAAGTTGCTTGAGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTGC‑T‑GGTACGTGCCTcgc > 4:191540/1‑149 (MQ=255) ctgctgGCTGCCCTCGCGGCAGTGATCGAACAAGGCGGTTTCGAGCGTGCGGCGCAGGTGCTGGGCTT‑GTCGCAATCGGCGATTTCCCAGCGCATCAAGTTGCTTGAGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTGC‑T‑GGTACGTGc > 5:50661/1‑140 (MQ=255) ctgctgGCTGCCCTCGCGGCAGTGATCGAACAAGGCGGTTTCGAGCGTGCGGCGCAGGTGCTGGGCTT‑GTCGCAATCGGCGATTTCCCAGCGCATCAAGTTGCTTGAGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTGC‑T‑GGTACGTGc < 6:50661/140‑1 (MQ=255) ctgctgGCTGCCCTCGCGGCAGTGATCGAACAAGGCGGTTTCGAGCGTGCGGCGCAGGTGCTGGGCTT‑GTCGCAATCGGCGATTTCCCAGCGCATCAAGTTGCTTGAGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTGC‑T‑GGTACGTGCCTCgccgcc > 6:71959/1‑149 (MQ=255) gctgCCCTCGCGGCAGTGATCGAACAAGGCGGTTTCGAGCGTGCGGCGCAGGTGCTGGGCTT‑GTCGCAATCGGCGATTTCCCAGCGCATCAAGTTGCTTGAGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTGC‑T‑GGTACGTGCCTCGCCGCCCGgc < 5:155301/147‑1 (MQ=255) tCGCGGCAGTGATCGAACAAGGCGGTTTCGAGCGTGCGGCGCAGGTGCTGGGCTT‑GTCGCAATCGGCGATTTCCCAGCGCATCAAGTTGCTTGAGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTGC‑T‑GGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCg > 5:115235/1‑147 (MQ=255) tCGCGGCAGTGATCGAACAAGGCGGTTTCGAGCGTGCGGCGCAGGTGCTGGGCTT‑GTCGCAATCGGCGATTTCCCAGCGCATCAAGTTGCTTGAGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTGC‑T‑GGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCg > 4:240771/1‑147 (MQ=255) gcgGCAGTGATCGAACAAGGCGGTTTCGAGCGTGCGGCGCAGGTGCTGGGCTT‑GTCGCAATCGGCGATTTCCCAGCGCATCAAGTTGCTTGAGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTGC‑T‑GGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAg < 7:199882/148‑1 (MQ=255) cgGCAGTGATCGAACAAGGCGGTTTCGAGCGTGCGGCGCAGGTGCTGGGCTT‑GTCGCAATCGGCGATTTCCCAGCGCATCAAGTTGCTTGAGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTGC‑T‑GGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTc < 1:306290/149‑1 (MQ=255) gATCGAACAAGGCGGTTTCGAGCGTGCGGCGCAGGTGCTGGGCTT‑GTCGCAATCGGCGATTTCCCAGCGCATCAAGTTGCTTGAGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTGC‑T‑GGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGgccgc > 5:71229/1‑148 (MQ=255) aTCGAACAAGGCGGTTTCGAGCGTGCGGCGCAGGTGCTGGGCTT‑GTCGCAATCGGCGATTTCCCAGCGCATCAAGTTGCTTGAGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTTC‑T‑GGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCa < 1:245960/149‑1 (MQ=255) aTCGAACAAGGCGGTTTCGAGCGTGCGGCGCAGGTGCTGGGCTT‑GTCGCAATCGGCGATTTCCCAGCGCATCAAGTTGCTTGAGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTGC‑T‑GGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGgccgc > 8:324809/1‑147 (MQ=255) tCGAACAAGGCGGTTTCGAGCGTGCGGCGCAGGTGCTGGGCTTGGTCGCAATCGGCGATTTCCCAGCGCATCAAGTTGCTTGAGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTGC‑T‑GGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGgccgc > 1:240504/1‑147 (MQ=255) cGAACAAGGCGGTTTCGAGCGTGCGGCGCAGGTGCTGGGCTT‑GTCGCAATCGGCGATTTCCCAGCGCATCAAGTTGCTTGAGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTGC‑T‑GGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGc > 5:240891/1‑149 (MQ=255) gAACAAGGCGGTTTCGAGCGTGCGGCGCAGGTGCTGGGCTT‑GTCGCAATCGGCGATTTCCCAGCGCATCAAGTTGCTTGAGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTGC‑T‑GGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGc < 6:240891/148‑1 (MQ=255) aaCAAGGCGGTTTCGAGCGTGCGGCGCAGGTGCTGGGCTT‑GTCGCAATCGGCGATTTCCCAGCGCATCAAGTTGCTTGAGgcgc > 4:321996/1‑84 (MQ=255) aaCAAGGCGGTTTCGAGCGTGCGGCGCAGGTGCTGGGCTT‑GTCGCAATCGGCGATTTCCCAGCGCATCAAGTTGCTTGAGgcgc < 3:321996/84‑1 (MQ=255) aaGGCGGTTTCGAGCGTGCGGCGCAGGTGCTGGGCTT‑GTCGCAATCGGCGATTTCCCAGCGCATCAAGTTGCTTGAGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTGC‑T‑GGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACt > 6:42200/1‑148 (MQ=255) ggCGGTTTCGAGCGTGCGGCGCAGGTGCTGGGCTT‑GTCGCAATCGGCGATTTCCCAGCGCATCAAGTTGCTTGAGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTGC‑T‑GGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGaa < 5:7387/129‑1 (MQ=255) ggCGGTTTCGAGCGTGCGGCGCAGGTGCTGGGCTT‑GTCGCAATCGGCGATTTCCCAGCGCATCAAGTTGCTTGAGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTGC‑T‑GGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGaa > 6:7387/1‑129 (MQ=255) ggCGGTTTCGAGCGTGCGGCGCAGGTGCTGGGCTT‑GTCGCAATCGGCGATTTCCCAGCGCATCAAGTTGCTTGAGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTGC‑T‑GGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCaa > 1:233438/1‑149 (MQ=255) ggTTTCGAGCGTGCGGCGCAGGTGCTGGGCTT‑GTCGCAATCGGCGATTTCCCAGCGCATCAAGTTGCTTGAGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTGC‑T‑GGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCa > 1:40123/1‑149 (MQ=255) tttCGAGCGTGCGGCGCAGGTGCTGGGCTT‑GTCGCAATCGGCGATTTCCCAGCGCATCAAGTTGCTTGCGGCGCGGGTCGGGCAGCCGGTGCTT‑GGTACGTGCCTCGCCGCGCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCAt < 1:267668/149‑1 (MQ=255) tttCGAGCGTGCGGAGCATGTGCTGGGCTT‑GTCGCAATCGGCGATTTCCCAGCGCATCAAGTTGCTTGAGGCGCGGGTCGGCCAGACGGTGC‑TGGGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAATTCGGCAGCCAGCTAATCAACCAt < 1:263458/149‑1 (MQ=255) gAGCGTGCGGCGCAGGTGCTGGGCTT‑GTCGCAATCGGCGATTTCCCAGCGCATCAAGTTGCTTGAGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTGC‑T‑GGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCAtgtg > 5:217992/1‑147 (MQ=255) gAGCGTGCGGCGCAGGTGCTGGGCTT‑GTCGCAATCGGCGATTTCCCAGCGCATCAAGTTGCTTGAGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTGC‑T‑GGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTgc < 5:42200/148‑1 (MQ=255) aGCGTGCGGCGCAGGTGATGGGCTT‑GTAGCAATCGGCGATTTCCCAGCGCATCAAGATGCTTGAGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTGC‑T‑GGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTgcag > 6:74016/1‑149 (MQ=255) gCGTGCGGCGCAGGTGCTGGGCTT‑GTCGCAATCGGCGATTTCCCAGCGCATCAAGTTGCTTGAGGTGCGGGTCGGCCAGCCGGTGC‑T‑GGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTgcag > 2:291765/1‑148 (MQ=255) gcggcgCAGGTGCTGGGCTT‑GTCGCAATCGGCGATTTCCCAGCGCATCAAGTTGCTTGAGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTGC‑T‑GGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGt < 8:277574/149‑1 (MQ=255) gcggcgCAGGTGCTGGGCTT‑GTCGCAATCGGCGATTTCCCAGCGCATCAAGTTGCTTGAGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTGC‑T‑GGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGt > 8:185695/1‑149 (MQ=255) gcAGGTGCTGGGCTT‑GTCGCAATCGGCGATTTCCCAGCGCATCAAGTTGCTTGATGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTGC‑T‑GGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGcc > 2:242712/1‑149 (MQ=255) cAGGTGCTGGGCTT‑GTCGCAATCGGCGATTTCCCAGCGCATCAAGTTGCTTGAGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTGC‑T‑GGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCt < 6:217992/149‑1 (MQ=255) tGCTGGGCTT‑GTCGCAATCGGCGATTTCCCAGCGCATCAAGTTGCTTGAGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTGC‑T‑GGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGcgc > 6:189186/1‑147 (MQ=255) gCTGGGCTT‑GTCGCAATCGGCGATTTCCCAGCGCATCAAGTTGCTTGAGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTGC‑T‑GGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCg < 5:280347/149‑1 (MQ=255) ggCTT‑GTCGCAATCGGCGATTTCCCAGCGCATCAAGTTGCTTGAGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTGC‑T‑GGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGGCAGCTACTGAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAAc < 6:115235/148‑1 (MQ=255) ggCTT‑GTCGCAATCGGCGATTTCCCAGCGCATCAAGTTGCTTGAGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTGC‑T‑GGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAAc < 6:71229/148‑1 (MQ=255) cTT‑GTCGCAATCGGCGATTTCCCAGCGCATCAAGTTGCTTGAGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTGC‑T‑GGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAAcgc > 3:277406/1‑148 (MQ=255) tCGCAATCGGCGATTTCCCAGCGCATCAAGTTGCTTGAGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTGC‑T‑GGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGAcc < 5:71959/148‑1 (MQ=255) tCGCAATCGGCGATTTCCCAGCGCATCAAGTTGCTTGAGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTGC‑T‑GGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCt > 7:11247/1‑149 (MQ=255) tCGCAATCGGCGATTTCCCAGCGCATCAAGTTGCTTGAGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTGC‑T‑GGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCt < 1:242712/149‑1 (MQ=255) gCAATCGGCGATTTCCCAGCGCATCAAGTTGCTTGAGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTGC‑T‑GGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGAcc < 6:152176/146‑1 (MQ=255) gCAATCGGCGATTTCCCAGCGCATCAAGTTGCTTGAGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTGC‑T‑GGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGAcc > 5:152176/1‑146 (MQ=255) gCAATCGGCGATTTCCCAGCGCATCAAGTTGCTTGAGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTGC‑T‑GGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTg < 3:191540/148‑1 (MQ=255) aaTCGGCGATTTCCCAGCGCATCAAGTTGCTTGAGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTGC‑T‑GGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACTGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCt > 8:71433/1‑145 (MQ=255) aaTCGGCGATTTCCCAGCGCATCAAGTTGCTTGAGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTGC‑T‑GGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACTGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCt < 7:71433/145‑1 (MQ=255) aTCGGCGATTTCCCAGCGCATCAAGTTGCTTGAGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTGC‑T‑GGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAgc < 2:233438/149‑1 (MQ=255) ggCGATTTCCCAGCGCATCAAGTTGCTTGAGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTGC‑T‑GGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAgcgc > 8:199161/1‑148 (MQ=255) ggCGATTTCCCAGCGCATCAAGTTGCTTGAGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTGC‑T‑GGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAgcgc > 3:270559/1‑148 (MQ=255) ggCGATTTCCCAGCGCATCAAGTTGCTTGAGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTGC‑T‑GGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAgcgc > 4:237100/1‑148 (MQ=255) gCGATTTCCCAGCGCATCAAGTTGCTTGAGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTGC‑T‑GGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCa < 7:185695/149‑1 (MQ=255) gATTTCCCAGCGCATCAAGTTGCTTGAGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTGC‑T‑GGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAgg < 4:270559/149‑1 (MQ=255) aTTTCCCAGCGCATCAAGTTGCTTGAGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTGC‑T‑GGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGt < 2:40123/149‑1 (MQ=255) | AACAAATAAAGCTCTTCACCCATTAGGAAAATCGATGTTCGACTACAAACTGCTGGCTGCCCTCGCGGCAGTGATCGAACAAGGCGGTTTCGAGCGTGCGGCGCAGGTGCTGGGCTT‑GTCGCAATCGGCGATTTCCCAGCGCATCAAGTTGCTTGAGGCGCGGGTCGGCCAGCCGGTGC‑T‑GGTACGTGCCTCGCCGCCCGGCGCGACCGAAGTCGGCCGCCAGCTACTCAACCATGTGCAGCAGGTGCGCCTGCTCGAACGCGACCTGCAGCGCCAGGT > NC_002947/1059821‑1060099 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |