| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,069,829 | G→A | 6.8% | V331M (GTG→ATG) ‡ | aroP‑I → | aromatic amino acid transport protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,069,829 | 0 | G | A | 6.8% | 215.0 / 4.0 | 73 | V331M (GTG→ATG) ‡ | aroP‑I | aromatic amino acid transport protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (38/30); new base A (2/3); total (40/33) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.53e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.13e-01 | |||||||||||
GGCGACCATCCTCAATATCGTGGTGCTGACGGCTGCGCTGTCGGTGTACAACAGCTGTGTGTACGCCAATAGCCGTATGCTGTTTGGCCTGGCCAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCA‑GTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGC‑GACCGGCCTGTGCGTGCTGATCAATTACCTGATGCCGGGCGGGGCCTTTGGTTTGCTGATGGCGTTGGCAGTGTCCGCGTTGGTGATCAACTGGGCGAGCATCAGCATTACCCA > NC_002947/1069687‑1069977 | ggCGACCATCCTCAATATCGTGGTGCTGACGGCTGCGCTGTCGGTGTACAACAGCTGTGTGTACGCCAATAGCCGTATGCTGTATGGCCTGGCAAGCCAGGGCGATGCGCCGCTTCA‑GTTGCTGAAGGTGAGACGTAGCGGCGTGCCGc > 6:288735/1‑149 (MQ=255) gCGACCATCCTCAATATCGTGGTGCTGACGGCTGCGCTGTCGGTGTACAACAGCTGTGTGTACGCCAATAGCCGTATGCTGTTTGGCCTGGCCAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCA‑GTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGc < 2:73318/148‑1 (MQ=255) gACCATCCTCAATATCGTGGTGCTGACGGCTGCGCTGTCGGTGTACAACAGCTGTGTGTACGCCAATAGCCGTATGCTGTTTGGCCTGGCCAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCA‑GTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGa > 2:332219/1‑149 (MQ=255) gACCATCCTCAATATCGTGGTGCTGACGGCTGCGCTGTCGGTGTACAACAGCTGTGTGTACGCCAATAGCCGTATGCTGTTTGGCCTGGCCAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCA‑GTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCACGCCGCtac < 2:279441/149‑3 (MQ=255) gACCATCCTCAATATCGTGGTGCTGACGGCTGCGCTGTCGGTGTACAACAGCTGTGTGTACGCCAATAGCCGTATGCTGTTTGGCCTGGCCAGCCAGGGCGATACGCCGCGTCA‑GTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCACGCCGCtac < 4:122424/149‑3 (MQ=255) gACCATCCTCAATATCGTGGTGCTGACGGCTGCGCTGTCGGTGTACAACAGCTGTGTGTACGCCAATAGCCGTATGCTGTTTGGCCTGGCCAGCCAGGGCGATACGCCGCGTCA‑GTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCACGCCGCtac < 4:127341/149‑3 (MQ=255) aTCCTCAATATCGTGGTGCTGACGGCTGCGCTGTCGGTGTACAACAGCTGTGTGTTCGCCAATAGCAGTATGCTGTTTTGCATGGCCAGAAAGGGAGATGAGACGCGTCAGGTTGGT‑AAGGTGAGCAGTAGCGGCGTGCCGGTGACcgc > 6:252132/1‑149 (MQ=255) aaTATCGTGGTGCTGACGGCTGCGCTGTCGGTGTACAACAGCTGTGTGTACGCCAATAGCCGTATGCTGTTTGGCCTGGCCAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCA‑GTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGc > 4:100876/1‑149 (MQ=255) atatCGTGGTGCTGACGGCTGCGCTGTCGGTGTACAACAGCTGTGTGTACGCCAATAGCCGTATGCTGTTTGGCCTGGCCAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCA‑GTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGcc > 4:68622/1‑149 (MQ=255) tCGTGGTGCTGACGGCTGCGCTGTCGGTGTACAACAGCGGTGTGTACGCCAATAGCCGTATGCTGTTTGGCCTGGCCAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCA‑GTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCgt < 2:79321/148‑1 (MQ=255) gtggtgCTGACGGCTGCGCTGTCGGTGTACAACAGCTGTGTGTACGCCAATAGCCGTATGCTGTTTGGCCTGGCCAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCA‑GTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCgtgt < 3:68622/148‑1 (MQ=255) gtgCTGACGGCTGCGCTGTCGGTGTACAACAGCTGTGTGTACGCCAATAGCCGTATGCTGTTTGGCCTGGCCAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCA‑GTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGc > 2:243395/1‑149 (MQ=255) tGCGCTGTCGGTGTACAACAGCTGTGTGTACGCCAATAGCCGTATGCTGTTTGGCCTGGCCAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCA‑GTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGC‑GACCg > 1:6433/1‑149 (MQ=255) tGCGCTGTCGGTGTACAACAGCTGTGTGTACGCCAATAGCCGTATGCTGTTTGGCCTGGCCAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCA‑GTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGC‑GACCg > 1:11958/1‑149 (MQ=255) tGCGCTGTCGGTGTACAACAGCTGTGTGTACGCCAATAGCCGTATGCTGTTTGGCCTGGCCAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCA‑GTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGC‑GACCg > 6:25740/1‑149 (MQ=255) cgcTGTCGGTGTACAACAGCTGTGTGTACGCCAATAGCCGTATGCTGTTTGGCCTGGCCAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCA‑GTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGC‑GACCGGc < 4:107646/149‑1 (MQ=255) cTGTCGGTGTACAACAGCTGTGTGTACGCCAATAGCCGTATGCTGTTTGGCCTGGCCAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCA‑GTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGC‑GACCGGCCt < 6:250097/149‑1 (MQ=255) ggTGTACAACAGCTGTGTGTACGCCAATAGCCGTATGCTGTTTGGCCTGGCCAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCA‑GTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTCCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGC‑GACCGGCCTgtgc < 1:243395/148‑1 (MQ=255) tgtACAACAGCTGTGTGTACGCCAATAGCCGTATGCTGTTTGGCCTGGCCAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCA‑GTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGC‑GACCGGCCTgtgcgtg > 5:145895/1‑149 (MQ=255) tACAACAGCTGTGTGTACGCCAATAGCCGTATGCTGTTTGGCCTGGCCAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCA‑GTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGC‑GACCGGCCTgtgcgtgc < 6:145895/148‑1 (MQ=255) tACAACAGCTGTGTGTACGCCAATAGCCGTATGCTGTTTGGCCTGGCCAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCA‑GTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGC‑GACCGGCCTgtgcgtgc < 1:187375/148‑1 (MQ=255) tACAACAGCTGTGTGTACGCCAATAGCCGTATGCTGTTTGGCCTGGCCAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCA‑GTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGC‑GACCGGCCTGTGCGTGCt > 2:254791/1‑149 (MQ=255) aacaGCTGTGTGTACGCCAATAGCCGTATGCTGTTTGGCCTGGCCAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCA‑GTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGC‑GACCGGCCTGTGCGTGCTGAt > 6:77946/1‑149 (MQ=255) gtgtgtACGCCAATAGCCGTATGCTGTTTGGCCTGGCCAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCA‑GTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGC‑GACCGGCCTGTGCGTGCTGATCAATTAc > 3:282066/1‑149 (MQ=255) aCGCCAATAGCCGTATGCTGTTTGGCCTGGCCAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCA‑GTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGC‑GACCGGCCTGTGCGTGCTGATCAATTACCTGATg > 4:97784/1‑149 (MQ=255) gCCAATAGCCGTATGCTGTTTGGCCTGGCCAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCA‑GTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGC‑GACCGGCCTGTGCGTGCTGATCAATTACCTGATGcc > 4:75930/1‑149 (MQ=255) aaTATCCGTCTGCTGTTTGGCCGTGCCAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCA‑GTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCAGCTGACCGAGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGC‑GACCGGc < 2:207406/117‑1 (MQ=255) aaTAGCCGTATGCTGTTTGGCCTGGCCAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCA‑GTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCGGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGC‑GACCGGc > 1:207406/1‑117 (MQ=255) tAGCCGTATGCTGTTTGGCCTGGCCAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCA‑GTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGC‑GACCGGCCTGTGCGTGCTGATCAATTACCTGATGCcgggcg < 1:332219/149‑1 (MQ=255) tGCTGTTTGGCCTGGCCAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCA‑GTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGC‑GACCGGCCTGTGCGTGCTGATCAATTACCTGATGCCGGGCGGGGCCttt > 6:288109/1‑149 (MQ=255) tGCTGTTTGGCCTGGCCAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCA‑GTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGC‑GACCGGCCTGTGCGTGCTGATCAATTACCTGATGCCGGGCGGGGCCtt < 3:97784/148‑1 (MQ=255) tGCTGTTTGGCCTGGCCAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCA‑GTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGC‑GACCGGCCTGTGCGTGCTGATCAATTACCTGATGCCGGGCGGGGCCtt < 8:74740/148‑1 (MQ=255) gCTGTTTGGCCTGGCCAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCA‑GTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGC‑GACCGGCCTGTGCGTGCTGATCAATTACCTGATGCCGGGCGGGGCCTTTg > 6:158805/1‑149 (MQ=255) cggTTTGGCCTGGCCAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCA‑GTTGCGGCAGGTGAGCCGTAGCGGCGGGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGGCGGCCTTTGC‑GACCGGCCTGTGCGTGCTGATCAATTACCTGATGCCGGGCGGGGCCTTTg < 2:11958/146‑1 (MQ=255) cTGTTTGGCCTGGCCAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCA‑GTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGC‑GACCGGCCTGTGCGTGCTGATCAATTACCTGATGCCGGGCGGGGCCTTTg < 2:6433/148‑1 (MQ=255) tttGGCCTGGCCAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCA‑GTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGC‑GACCGGCCTGTGCGTGCTGATCAATTACCTGATGCCGGGCGGGGCCTTTGGtt < 5:77946/148‑1 (MQ=255) gcctggccAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCA‑GTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGC‑GACCGGCCTGTGCGTGCTGATCAATTACCTGATGCCGGGCGGGGCCTTTGGTTTGCt > 5:69594/1‑148 (MQ=255) cctggccAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCA‑GTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGC‑GACCGGCCTGTGCGTGCTGATCAATTACCTGATGCCGGGCGGGGCCTTTGGTTTGCTGa > 7:227436/1‑149 (MQ=255) ctggccAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCA‑GTTGGTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGC‑GACCGGCCTGTGCGTGCTGATGAATTACCTGATGCCGGGCGGGGCCTTGGGTgtggtggt > 4:112542/1‑147 (MQ=255) tggccAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCA‑GTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGC‑GACCGGCCTGTGCGTGCTGATCAATTACCTGATGCCGGGCGGGGCCTTTGGTTTGCTGATg > 1:319766/1‑149 (MQ=255) tggccAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCA‑GTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGC‑GACCGGCCTGTGCGTGCTGATCAATTACCTGATGCCGGGCGGGGCCTTTGGTTTGCTGATg > 1:28203/1‑149 (MQ=255) ggccAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCA‑GTTGGTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCGTTGC‑GACCGGCCTGTGCGTGCTGATCAATTACCTGATGCCGGGCGGGGCCTTTGGTTTGCTGATgg < 5:288735/149‑1 (MQ=255) gccagccaGGGCGATGCGCCGCGTCA‑GTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGC‑GACCGGCCTGTGCGTGCTGATCAATTACCTGATGCCGGGCGGGGCCTTTGGTTTGCTGATgg < 3:100876/148‑1 (MQ=255) gccagccaGGGCGATGCGCCGCGTCA‑GTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGC‑GACCGGCCTGTGCGTGCTGATCAATTACCTGATGCCGGGCGGGGCCTTTGGTTTGCTGATg < 1:254791/147‑1 (MQ=255) agccagGGCGATGCGCCGCGTCA‑GTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGC‑GACCGGCCTGTGCGTGCTGATCAATTACCTGATGCCGGGCGGGGCCTTTGGTTTGCTGATGGCGtt > 1:227568/1‑149 (MQ=255) agccagGGCGATGCGCCGCGTCA‑GTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGC‑GACCGGCCTGTGCGTGCTGATCAATTACCTGATGCCGGGCGGGGCCTTTGGTTTGCTGATGGCGtt < 6:69594/149‑1 (MQ=255) ccagGGCGATGCGCCGCGTCA‑GTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCttt < 1:182749/79‑1 (MQ=255) ccagGGCGATGCGCCGCGTCA‑GTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCttt > 2:182749/1‑79 (MQ=255) cagGGCGATGCGCCGCGTCA‑GTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGC‑GACCGGCCTGTGCGTGCTGATCAATTACCTGATGCCGGGCGGGGCCTTTGGTTTGCTGATGGCGTTgg > 3:242386/1‑148 (MQ=255) gggCGATGCGCCGCGTCA‑GTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGC‑GACCGGCCTGTGCGTGCTGATCAATTACCTGATGCCGGGCGGGGCCTTTGGTTTGCTGa < 7:287174/137‑1 (MQ=255) gggCGATGCGCCGCGTCA‑GTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGC‑GACCGGCCTGTGCGTGCTGATCAATTACCTGATGCCGGGCGGGGCCTTTGGTTTGCTGa > 8:287174/1‑137 (MQ=255) ggCGATGCGCCGCGTCA‑GTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGC‑GACCGGCCTGTGCGTGCTGATCAATTACCTGATGCCGGGCGGGGCCTTTGGTTTGCTGATGGCGTTGGCAgt < 2:28203/149‑1 (MQ=255) gATGCGCCGCGTCA‑GTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGc > 4:246792/1‑68 (MQ=255) gATGCGCCGCGTCA‑GTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGc < 3:246792/68‑1 (MQ=255) gccgcGTCA‑GTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGC‑GACCGGCCTGTGCGTGCTGATCAATTACCTGATGCCGGGCGGGGCCTTTGGTTTGCTGATGGCGTTGGCAGTGTCcgc < 2:298640/147‑1 (MQ=255) gccgcGTCA‑GTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGC‑GACCGGCCTGTGCGTGCTGATCAATTACCTGATGCCGGGCGGGGCCTTTGGTTTGCTGATGGCGTTGGCAGTGTCcgc > 1:298640/1‑147 (MQ=255) gccgcGTCA‑GTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGC‑GACCGGCCTGTGCGTGCTGATCAATTACCTGATGCCGGGCGGGGCCTTTGGTTTGCTGATGGCGTTGGCAGTGTCCGCGt > 3:14032/1‑149 (MQ=255) gcgTCA‑GTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGC‑GACCGGCCTGTGCGTGCTGATCAATTACCTGATGCCGGGCGGGGCCTTTGGTTTGCTGATGGCGTTGGCAGTGTCCGCGTTgg > 5:179537/1‑149 (MQ=255) cgTCA‑GTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGC‑GACCGGCCTGTGCGTGCTGATCAATTACCTGATGCCGGGCGGGGCCTTTGGTTTGCTGATGGCGTTGGCAGTGTCCGCGTTGGt < 5:158805/149‑1 (MQ=255) tCA‑GTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGC‑GACCGGCCTGTGCGTGCTGATCAATTACCTGATGCCGGGCGGGGCCTTTGGTTTGCTGATGGCGTTGGCAGTGTCCGCGTTGGTGa > 8:173628/1‑149 (MQ=255) a‑GTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGC‑GACCGGCCTGTGCGTGCTGATCAATTACCTGATGCCGGGCGGGGCCTTTGGTTTGCTGATGGCGTTGGCAGTGTCCGCGTTGGTGAt > 3:105531/1‑148 (MQ=255) a‑GTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGC‑GACCGGCCTGTGCGTGCTGATCAATTACCTGATGCCGGGCGGGGCCTTTGGTTTGCTGATGGCGTTGGCAGTGTCCGCGTTGGTGATc < 7:173628/149‑1 (MQ=255) gCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGC‑GACCGGCCTGTGCGTGCTGATCAATTACCTGATGCCGGGCGGGGCCTTTGGTTTGCTGATGGCGTTGGCAGTGTCCGCGTTGGTGATCAAc < 4:282066/148‑1 (MQ=255) gCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGC‑GACCGGCCTGTGCGTGCTGATCAATTACCTGATGCCGGGCGGGGCCTTTGGTTTGCTGATGGCGTTGGCAGTGTCCGCGTTGGTGATCAACt > 7:1015/1‑149 (MQ=255) tGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGCAGCCCGGCCTGTGCGTGCTGATCAATTACATGATGCCGGGCGGGGCCTTTGGTTTGCTGATGGCGTTGGCAGTGTCCGCGTTGGTGATCAACTg > 1:266974/1‑149 (MQ=255) aaGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGC‑GACCGGCCTGTGCGTGCTGATCAATTACCTGATGCCGGGCGGGGCCTTTGGTTTGCTGATGGCGTTGGCAGTGTCCGCGTTGGTGATCAACTggg < 2:319766/148‑1 (MQ=255) gAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGC‑GACCGGCCTGTGCGTGCTGATCAATTACCTGATGCCGGGCGGGGCCTTTGGTTTGCTGATGGCGTTGGCAGTGTCCGCGTTGGTGATCAACTGGGCg < 1:53354/145‑1 (MQ=255) gAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGC‑GACCGGCCTGTGCGTGCTGATCAATTACCTGATGCCGGGCGGGGCCTTTGGTTTGCTGATGGCGTTGGCAGTGTCCGCGTTGGTGATCAACTGGGCg > 2:53354/1‑145 (MQ=255) gCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGC‑GACCGGCCTGTGCGTGCTGATCAATTACCTGATGCCGGGCGGGGCCTTTGGTTTGCTGATGGCGTTGGCAGTGTCCGCGTTGGTGATCAACTGGGCGAGCAt > 5:121261/1‑148 (MQ=255) gtcaGCGGCACGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGC‑GACCGGCCTGTGCGTGCTGATCAATTACCTGATGCCGGGCGGGGCCTTTGGTTTGCTGATGGCGTTGGCAGTGTCCGCGTTGGTGATCAACTGGGCGAGCATCAg > 5:164459/4‑149 (MQ=255) gtcaGCGGCACGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGC‑GACCGGCCTGTGCGTGCTGATCAATTACCTGATGCCGGGCGGGGCCTTTGGTTTGCTGATGGCGTTGGCAGTGTCCGCGTTGGTGATCAACTGGGCGAGCATCAg > 2:188449/4‑149 (MQ=255) cGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGC‑GACCGGCCTGTGCGTGCTGATCAATTACCTGATGCCGGGCGGGGCCTTTGGTTTGCTGATGGCGTTGGCAGTGTCCGCGTTGGTGATCAACTGGGCGAGCATCAg > 3:142831/1‑149 (MQ=255) cGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGC‑GACCGGCCTGTGCGTGCTGATCAATTACCTGATGCCGGGCGGGGCCTTTGGTTTGCTGATGGCGTTGGCAGTGTCCGCGTTGGTGATCAACTGGGCGAGCATCAg < 4:142831/149‑1 (MQ=255) cggagTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGC‑GACCGGCCTGTGCGTGCTGATCAATTACCTGATTCCGGGAGGTGCATTTGGTTTGCTGATGGCGTTGGCAGTGTCCGCGTTGGTGATCAACTGGGCGAGCATCAGCATTa < 5:189003/149‑1 (MQ=255) cgTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGC‑GACCGGCCTGTGCGTGCTGATCAATTACCTGATGCCGGGCGGGGCCTTTGGTTTGCTGATGGCGTTGGCAGTGTCCGCGTTGGTGATCAACTGGGCGAGCATCAGCATTAccc < 5:288109/149‑1 (MQ=255) gTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGC‑GACCGGCCTGTGCGTGCTGATCAATTACCTGATGCCGGGCGGGGCCTTTGGTTTGCTGATGGCGTTGGCAGTGTCCGCGTTGGTGATCAACTGGGCGAGCATCAGCATTACCCa < 6:47010/149‑1 (MQ=255) gTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGC‑GACCGGCCTGTGCGTGCTGATCAATTACCTGATGCCGGGCGGGGCCTTTGGTTTGCTGATGGCGTTGGCAGTGTCCGCGTTGGTGATCAACTGGGCGAGCATCAGCATTACCCa > 1:6965/1‑149 (MQ=255) | GGCGACCATCCTCAATATCGTGGTGCTGACGGCTGCGCTGTCGGTGTACAACAGCTGTGTGTACGCCAATAGCCGTATGCTGTTTGGCCTGGCCAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCA‑GTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGC‑GACCGGCCTGTGCGTGCTGATCAATTACCTGATGCCGGGCGGGGCCTTTGGTTTGCTGATGGCGTTGGCAGTGTCCGCGTTGGTGATCAACTGGGCGAGCATCAGCATTACCCA > NC_002947/1069687‑1069977 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |