Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,089,216 | A→G | 5.9% | Q26R (CAG→CGG) | fumC‑I → | class 2 fumarate hydratase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,089,216 | 0 | A | G | 5.9% | 200.8 / 2.1 | 68 | Q26R (CAG→CGG) | fumC‑I | class 2 fumarate hydratase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (33/31); new base G (2/2); total (35/33) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.15e-01 |
CGCCTTGCAGTTGGCCAATTGCCGTCTGCTGCCTTCGATTTCTCCCGATGAACTGATGCAAGGATTTGATGATGAGTGATACCCGTATCGAGCGTGACAGCATGGGTGAGCTGCAGGTGCCGG‑‑‑CCCAGGCCCTCTACGGCGCCCAGACCCAGCGCGCGGTCGACAACTTCCCGATCAGCGGCCAGCGTATGCCGGCCCAGTTCATTCGTGCCTTGTTGCTGGCCAAGGCCGCTGCGGCCAAGGCCAACGTCGAACTGGAGCAACTGTCTGCCGGGCAGGGCCAGGCTAT > NC_002947/1089072‑1089360 | cGCCTTGCAGTTGGCCAATTGCCGTCTGCTGCCTTCGATTTCTCCCGATGAACTGATGCAAGGATTTGATGATGAGTGATACCCGTATCGAGCGTGACAGCATGGGTGAGCTGCAGGTGCCGG‑‑‑CCCAGGCCCTCTACGGCGCCCAGAcc < 8:78006/149‑1 (MQ=255) cTTGCAGTTGGCCAATTGCCGTCTGCTGCCTTCGATTTCTCCCGATGAACTGATGCAAGGATTTGATGATGAGTGATACCCGTATCGAGCGTGACAGCATGGGTGAGCTGCAGGTGCCGG‑‑‑CCCAGGCCCTCTACGGCGCCCAGACCCAg > 4:84147/1‑149 (MQ=255) cTTGCAGTTGGCCAATTGCCGTCTGCTGCCTTCGATTTCTCCCGATGAACTGATGCAAGGATTTGATGATGAGTGATACCCGTATCGAGCGTGACAGCATGGGTGAGCTGCAGGTGCCGG‑‑‑CCCAGGCCCTCTACGGCGCCCAGACCCAg > 2:148290/1‑149 (MQ=255) aGTTGGCCAATTGCCGTCTGCTGCCTTCGATTTCTCCCGATGAACTGATGCAAGGATTTGATGATGAGTGATACCCGTATCGAGCGTGACAGCATGGGTGAGCTGCAGGTGCCGG‑‑‑CCCAGGCCCTCTACGGCGCCCAGa > 1:65016/1‑139 (MQ=255) aGTTGGCCAATTGCCGTCTGCTGCCTTCGATTTCTCCCGATGAACTGATGCAAGGATTTGATGATGAGTGATACCCGTATCGAGCGTGACAGCATGGGTGAGCTGCAGGTGCCGG‑‑‑CCCAGGCCCTCTACGGCGCCCAGa < 2:65016/139‑1 (MQ=255) ttGGCCAATTGCCGTCTGCTGCCTTCGATTTCTCCCGATGAACTGATGCAAGGATTTGATGATGAGTGATACCCGTATCGAGCGTGACAGCATGGGTGAGCTGCAGGTGCCGG‑‑‑CCCAGGCCCTCTACGGCGCCCAGACCCAGCGCGCgg > 1:56814/1‑149 (MQ=255) gCCAATTGCCGTCTGCTGCCTTCGATTTCTCCCGATTAACTGATGCAAGGATTTGATGATGAGTGATACCCGTATCGAGCGTGACAGCATGGGTGAGCTGCAGGTGCCGG‑‑‑CCCAGGCCCTCTACGGCGCCCAGACCCAGCGCGCGGTc < 8:69848/148‑1 (MQ=255) aTTGCCGTCTGCTGCCTTCGATTTCTCCCGATGAACTGATGCAAGGATTTGATGATGAGTGATACCCGTATCGAGCGTGACAGCATGGGTGAGCTGCAGGTGCCGG‑‑‑CCCAGGCCCTCTACGGCGCCCAGACCCAGCGCGCGGTCGACaa < 2:300536/149‑1 (MQ=255) gCCGTCTGCTGCCTTCGATTTCTCCCGATGAACTGATGCAAGGATTTGATGATGAGTGATACCCGTATCGAGCGTGACAGCATGGGTGAGCTGCAGGTGTGGGGTACCCAGGCCCTCTACGGCGCCCAGACCCAGCGCGCGGTCGACaa > 1:115346/1‑149 (MQ=255) ccTTCGATTTCTCCCGATGAACTGATGCAAGGATTTGATGATGAGTGATACCCGTATCGAGCGTGACAGCATGGGTGAGCTGCAGGTGCCGG‑‑‑CCCAGGCCCTCTACGGCGCCCAGACCCAGCGCGCGGTCGCCAACTTCCCGATCAGCg > 8:113678/1‑149 (MQ=255) aTTTCTCCCGATGAACTGATGCAAGGATTTGATGATGAGTGATACCCGTATCGAGCGTGACAGCATGGGTGAGCTGCAGGTGCCGG‑‑‑CCCAGGCCCTCTACGGCGCCCAGACCCAGCGCGCGGTCGACAACTTCCCGATCAGCg < 8:45073/143‑1 (MQ=255) aTTTCTCCCGATGAACTGATGCAAGGATTTGATGATGAGTGATACCCGTATCGAGCGTGACAGCATGGGTGAGCTGCAGGTGCCGG‑‑‑CCCAGGCCCTCTACGGCGCCCAGACCCAGCGCGCGGTCGACAACTTCCCGATCAGCg > 7:45073/1‑143 (MQ=255) ctcCCGATGAACTGATGCAAGGATTTGATGATGAGTGATACCCGTATCGAGCGTGACAGCATGGGTGAGCTGCAGGTGCCGG‑‑‑CCCAGGCCCTCTACGGCGCCCAGACCCAGCGCGCGGTCGACAACTTCCCGATCAGCGGCCAGCGTa < 5:291315/148‑1 (MQ=255) aTGAACTGATGCAAGGATTTGATGATGAGTGATACCCGTATCGAGCGTGACAGCATGGGTGAGCTGCAGGTGCCGG‑‑‑CCCAGGCCCTCTACGGCGCCCAGACCCAGCGCGCGGTCGACAACTTCCCGATCAGCGGCCAGCGTATGCCGGc < 2:56814/149‑1 (MQ=255) gCAAGGATTTGATGATGAGTGATACCCGTATCGAGCGTGACAGCATGGGTGAGCTGCAGGTGCCGG‑‑‑CCCAGGCCCTCTACGGCGCCCAGACCCAGCGCGCGGTCGACAACTTcc > 5:22323/1‑114 (MQ=255) gCAAGGATTTGATGATGAGTGATACCCGTATCGAGCGTGACAGCATGGGTGAGCTGCAGGTGCCGG‑‑‑CCCAGGCCCTCTACGGCGCCCAGACCCAGCGCGCGGTCGACAACTTcc < 6:22323/114‑1 (MQ=255) gCAAGGATTTGATGATGAGTGATACCCGTATCGAGCGTGACAGCATGGGTGAGCTGCAGGTGCCGG‑‑‑CCCAGGCCCTCTACGGCGCCCAGACCCAGCGCGCGGTCGACAACTTCCCGATCAGCGGCCAGCGTATGCCGGCCCAGTTCAtt > 6:29815/1‑149 (MQ=255) cAAGGATTTGATGATGTGTGATTCCCGTATGGAGCGTGACAGGATGGGTGAGCTGCAGGTGCCGG‑‑‑GCCAGGCCCTCTAGGGCGCCCAGACCCAGCGGGCGTTCGACAACTTCCCGATCAGc < 2:249495/121‑1 (MQ=255) cAAGGATTTGATGATGAGTGATACCCGTATCGAGCGTGACAGCATGGGTGAGCTGCAGGTGCCGG‑‑‑CCCAGGCCCTCTACGGCGCCCGGACCCAGCGCGCGGTCGACAACTTCCCGATCAGCGGCCAGCGTATGCCGGCCCAGTTCATTc > 1:219767/1‑149 (MQ=255) cAAGGATTTGATGATGAGTGATACCCGTATCGAGCGTGACAGCATGGGTGAGCTGCAGGTGCCGG‑‑‑CCCAGGCCCTCTACGGCGCCCGGACCCAGCGCGCGGTCGACAACTTCCCGATCAGCGGCCAGCGTATGCCGGCCCAGTTCATTc < 2:219767/149‑1 (MQ=255) cAAGGATTTGATGATGAGTGATACCCGTATCGAGCGTGACAGCATGGGTGAGCTGCAGGTGCCGG‑‑‑CCCAGGCCCTCTACGGCGCCCGGACCCAGCGCGCGGTCGACAACTTCCCGATCAGCGGCCAGCGTATGCCGGCCCAGTTCATTc > 7:264774/1‑149 (MQ=255) cAAGGATTTGATGATGAGTGATACCCGTATCGAGCGTGACAGCATGGGTGAGCTGCAGGTGCCGG‑‑‑CCCAGGCCCTCTACGGCGCCCGGACCCAGCGCGCGGTCGACAACTTCCCGATCAGCGGCCAGCGTATGCCGGCCCAGTTCATTc < 8:264774/149‑1 (MQ=255) cAAGGATTTGATGATGAGTGAAACCCGAATCGAGCGTGACAGCATGGGTGAGCTGCAGGTGCCGG‑‑‑CCCAGGCCCTCTACGCCGCCCAGACCCAGCGCGCGGACGACAACTTCCCGCTAAGc > 1:249495/1‑121 (MQ=255) aGGATTTGATGATGAGTGATACCCGTATCGAGCGTGACAGCATGGGTGAGCTGCAGGTGCCGG‑‑‑CCCAGGCCCTCTACGGCGCCCAGACCCAGCGCGCGGTCGACAACTTCCCGATCAGCg < 2:66783/120‑1 (MQ=255) aGGATTTGATGATGAGTGATACCCGTATCGAGCGTGACAGCATGGGTGAGCTGCAGGTGCCGG‑‑‑CCCAGGCCCTCTACGGCGCCCAGACCCAGCGCGCGGTCGACAACTTCCCGATCAGCg > 1:66783/1‑120 (MQ=255) aGGATTTGATGATGAGTGATACCCGTATCGAGCGTGACAGCATGGGTGAGCTGCAGGTGCCGG‑‑‑CCCAGGCCCTCTACGGCGCCCAGACCCAGCGCGCGGTCGACAACTTCCCGATCAGCGGCCAGCGTATGCCgg > 6:24421/1‑135 (MQ=255) aGGATTTGATGATGAGTGATACCCGTATCGAGCGTGACAGCATGGGTGAGCTGCAGGTGCCGG‑‑‑CCCAGGCCCTCTACGGCGCCCAGACCCAGCGCGCGGTCGACAACTTCCCGATCAGCGGCCAGCGTATGCCgg < 5:24421/135‑1 (MQ=255) ggATTTGATGATGAGTGATACCCGTATCGAGCGTGACAGCATGGGTGAGCTGCAGGTGCCGG‑‑‑CCCAGGCCCTCTACGGCGCCCAGACCCAGCGCGCGGTCGACAACTTCCCGATCAGCGGCCAGCGTATGCCGGCCCAGTTCATTCGTg < 3:84147/149‑1 (MQ=255) atgatgaGTGATACCCGTATCGAGCGTGACAGCATGGGTGAGCTGCAGGTGCCGG‑‑‑CCCAGGCCCTCTACGGCGCCCAGACCCAGCGCGCGGTCGACAACTTCCCGATCAGCGGCCAGCGTATGCCGGCCCAGTTCATTCGTGCCttgt < 5:147781/148‑1 (MQ=255) gatgaGTGATACCCGTATCGAGCGTGACAGCATGGGTGAGCTGCAGGTGCCGG‑‑‑CCCAGGCCCTCTACGGCGCCCAGACCCAGCGCGCGGTCGACAACTTCCCGATCAGCGGCCAGCGTATGCCGGCCCAGTTCATTCGTGCCTTGTTGc > 3:244574/1‑149 (MQ=255) gaGTGATACCCGTATCGAGCGTGACAGCATGGGTGAGCTGCAGGTGCCGG‑‑‑CCCAGGCCCTCTACGGCGCCCAGACCCAGCGCGCGGTCGACAACTTCCCGATCAGCGGCCAGCGTATGCCGGCCCAGTTCATTCGTGCCTTGTTGCTgg > 5:321604/1‑149 (MQ=255) aGTGATACCCGTATCGAGCGTGACAGCATGGGTGAGCTGCAGGTGCCGG‑‑‑CCCAGGCCCTCTACGGCGCCCAGACCCAGCGCGCGGTCGACAACTTCCCGATCAGCGGCCAGCGTATGCCGGCCCAGTTCATTCGTGCCTTGTTGCTGGc > 2:131480/1‑149 (MQ=255) tGATACCCGTATCGAGCGTGACAGCATGGGTGAGCTGCAGGTGCCGG‑‑‑CCCAGGCCCTCTACGGCGCCCAGACCCAGCGCGCGGTCGACAACTTCCCGATCAGCGGCCAGCGTATGCCGGCCCAGTTCATTCGTGCCttgt > 2:186488/1‑140 (MQ=255) tGATACCCGTATCGAGCGTGACAGCATGGGTGAGCTGCAGGTGCCGG‑‑‑CCCAGGCCCTCTACGGCGCCCAGACCCAGCGCGCGGTCGACAACTTCCCGATCAGCGGCCAGCGTATGCCGGCCCAGTTCATTCGTGCCttgt < 1:186488/140‑1 (MQ=255) aTACCCGTATCGAGCGTGACAGCATGGGTGAGCTGCAGGTGCCGG‑‑‑CCCAGGCCCTCTACGGCGCCCAGACCCAGCGCGCGGTCGACAACTTCCCGATCAGCGGCCAGCGTATGCCGGCCCAGTTCATTCGTg < 6:317262/132‑1 (MQ=255) aTACCCGTATCGAGCGTGACAGCATGGGTGAGCTGCAGGTGCCGG‑‑‑CCCAGGCCCTCTACGGCGCCCAGACCCAGCGCGCGGTCGACAACTTCCCGATCAGCGGCCAGCGTATGCCGGCCCAGTTCATTCGTg > 5:317262/1‑132 (MQ=255) aTACCCGTATCGAGCGTGACAGCATGGGTGAGCTGCAGGTGCCGG‑‑‑CCCAGGCCCTCTACGGCGCCCAGACCCAGCGCGCGGTCGACAACTTCCCGATCAGCGGCCAGCGTATGCCGGCCCAGTTCATTCGTGCCTTGTTGCTGGCCaa < 7:167531/148‑1 (MQ=255) aTACCCGTATCGAGCGTGACAGCATGGGTGAGCTGCAGGTGCCGG‑‑‑CCCAGGCCCTCTACGGCGCCCAGACCCAGCGCGCGGTCGACAACTTCCCGATCAGCGGCCAGCGTATGCCGGCCCAGTTCATTCGTGCCTTGTTGCTGGCCAAg > 8:148401/1‑149 (MQ=255) tACCCGTATCGAGCGTGACAGCATGGGTGAGCTGCAGGTGCCGG‑‑‑CCCAGGCCCTCTACGGCGCCCAGACCCAGCGCGCGGTCGACAACTTCCCGATCAGCGGCCAGCGTATGCCGGCCCAGTTCATTCGTGCCTTGTTGCTGGCCAAgg < 2:115346/149‑1 (MQ=255) aCCCGTATCGAGCGTGACAGCATCGGTGAGCTGCAGGAGCCGG‑‑‑CCCAGGCCCTCTACGGCCCCCAGACCCAGCGCGCGGTCGACAACTTCCCGATCAGCGGCCAGCGTATGCCGGCCCAGTTCATTCGTGCCTTGTTGCTGGCCAAGGc > 5:28877/1‑149 (MQ=255) cccGTATCGAGCGTGACAGCATGGGTGAGCTGCAGGTGCCGG‑‑‑CCCAGGCCCTCTACGGCGCCCAGACCCAGCGCGCGGTCGACAACTTCCCGATCAGCGGCCAGCGTATGCCGGCCCAGTTCATTCGTGCCTTGTTGCTGGCCAAGGcc > 6:147409/1‑149 (MQ=255) ccGTATCGAGCGTGACAGCATGGGTGAGCTGCAGGTGCCGG‑‑‑CCCAGGCCCTCTACGGCGCCCAGACCCAGCGCGCGGTCGACAACTTCCCGATCAGCGGCCAGCGTATGCCGGCCCAGTTCATTCGTGCCTTGTTGCTGGCCAAGGCCg > 6:312067/1‑149 (MQ=255) ccGTATCGAGCGTGACAGCATGGGTGAGCTGCAGGTGCCGG‑‑‑CCCAGGCCCTCTACGGCGCCCAGACCCAGCGCGCGGTCGACAACTTCCCGATCAGCGGCCAGCGTATGCCGGCCCAGTTCATTCGTGCCTTGTTGCTGGCCAAGGCCg > 2:229858/1‑149 (MQ=255) ccGTATCGAGCGTGACAGCATGGGTGAGCTGCAGGTGCCGG‑‑‑CCCAGGCCCTCTACGGCGCCCAGACCCAGCGCGCGGTCGACAACTTCCCGATCAGCGGCCAGCGTATGCCGGCCCAGTTCATTCGTGCCTTGTTGCTGGCCAAGGCCg > 8:73017/1‑149 (MQ=255) ccGTATCGAGCGTGACAGCATGGGTGAGCTGCAGGTGCCGG‑‑‑CCCAGGCCCTCTACGGCGCCCAGACCCAGCGCGCGGTCGACAACTTCCCGATCAGCGGCCAGCGTATGCCGGCCCAGTTCATTCGTGCCTTGTTGCTGGCCAAGGCCg > 4:145552/1‑149 (MQ=255) tCGAGCGTGACAGCATGGGTGAGCTGCAGGTGCCGG‑‑‑CCCAGGCCCTCTACGGCGCCCAGACCCAGCGCGCGGTCGACAACTTCCCGATCAGCGGCCAGCGTATGCCGGCCCAGTTCATTCGTGCCTTGTTGCTGGCCAAGGCCGCTGCg > 6:123076/1‑149 (MQ=255) tCGAGCGTGACAGCATGGGTGAGCTGCAGGTGCCGG‑‑‑CCCAGGCCCTCTACGGCGCCCAGACCCAGCGCGCGGTCGACAACTTCCCGATCAGCGGCCAGCGTATGCCGGCCCAGTTCATTCGTGCCTTGTTGCTGGCCAAGGCCGCTGCg > 4:233777/1‑149 (MQ=255) gAGCGTGACAGCATGGGTGAGCTGCAGGTGCCGG‑‑‑CCCAGGCCCTCTACGGCGCCCAGACCCAGCGCGCGGTCGACAACTTCCCGATCAGCGGCCAGCGTATGCCGGCCCAGTTCATTCGTGCCTTGTTGCTGGCCAAGGCCGCTGCgg < 5:29815/148‑1 (MQ=255) gTGACAGCATGGGTGAGCTGCAGGTGCCGG‑‑‑CCCAGGCCCTCTACGGCGCCCAGACCCAGCGCGCGGTCGACAACTTCCCGATCAGCGGCCAGCGTATGCCGGCCCAGTTCATTCGTGCCTTGTTGCTGGCCAAGGCCGCTGCggccaag < 7:148401/149‑1 (MQ=255) aCAGCATGGGTGAGCTGCAGGTGCCGG‑‑‑CCCAGGCCCTCTACGGCGCCCAGACCCAGCGCGCGGTCGACAACTTCCCGATCAGCGGCCAGCGTATGCCGGCCCAGTTCATTCGTGCCTTGTTGCTGGCCAAGGCCGCTGCggccaaggcc < 1:148290/149‑1 (MQ=255) ggTGAGCTGCAGGTGCCGG‑‑‑CCCAGGCCCTCTACGGCGCCCAGACCCAGCGCGCGGTCGACAACTTCCCGATCAGCGGCCAGCGTATGCCGGCCCAGTTCATTCGTGCCTTGTTGCTGGCCAAGGCCGCTGCGGCCAAGGCCAACGTCg < 5:123076/148‑1 (MQ=255) aGCTGCAGGTGCCGG‑‑‑CCCAGGCCCTCTACGGCGCCCAGACCCAGCGCGCGGTCGACAACTTCCCGATCAGCGGCCAGCGTATGCCGGCCCAGTTCATTCGTGCCTTGTTGCTGGCCAAGGCCGCTGCGGCCAAGGCCAACGTCGAACt < 5:147409/148‑1 (MQ=255) cTGCAGGTGCCGG‑‑‑CCCAGGCCCTCTACGGCGCCCAGACCCAGCGCGCGGTCGACAACTTCCCGATCAGCGGCCAGCGTTTGCCGGCCCAGTTCATTCGTGcc < 3:77946/102‑1 (MQ=255) tGCAGGTGCCGG‑‑‑CCCAGGCCCTCTACGGCGCCCAGACCCAGCGCGCGGTCGACAACTTCCCGATCAGCGGCCAGCGTATGCCGGCCCAGt < 5:4053/90‑1 (MQ=255) tGCAGGTGCCGG‑‑‑CCCAGGCCCTCTACGGCGCCCAGACCCAGCGCGCGGTCGACAACTTCCCGATCAGCGGCCAGCGTATGCCGGCCCAGt > 6:4053/1‑90 (MQ=255) cAGGTGCCGG‑‑‑CCCAGGCCCTCTACGGCGCCCAGACCCAGCGCGCGGTCGACAACTTCCCGATCAGCGGCCAGCGTATGCCGGCCCAGTTCATTCGTGCCTTGTTGCTGGCCAAGGCCGCTGCggccaaggc > 6:124760/1‑131 (MQ=255) cAGGTGCCGG‑‑‑CCCAGGCCCTCTACGGCGCCCAGACCCAGCGCGCGGTCGACAACTTCCCGATCAGCGGCCAGCGTATGCCGGCCCAGTTCATTCGTGCCTTGTTGCTGGCCAAGGCCGCTGCggccaaggc < 5:124760/131‑1 (MQ=255) cAGGTGCCGG‑‑‑CCCAGGCCCTCTACGGCGCCCAGACCCAGCGCGCGGTCGACAACTTCCCGATCAGCGGCCAGCGTATGCCGGCCCAGTTCATTCGTGCCTTGTTGCTGGCCAAGGCCGCTGCGGCCAAGGCCAACGTCGAACTGGAg < 6:321604/147‑1 (MQ=255) aGGTGCCGG‑‑‑CCCAGGCCCTCTACGGCGCCCAGACCCAGCGCGCGGTCGACAACTTCCCGATCAGCGGCCAGCGTATGCCGGCCCAGTTCATTCGTGCCTTGTTGCTGGCCAAGGCCGCTGCGGCCAAGGCCAACGTCGAACTGGAGCaa < 3:233777/149‑1 (MQ=255) gTGCCGG‑‑‑CCCAGGCCCTCTACGGCGCCCAGACCCAGCGCGCGGTCGACAACTTCCCGATCAGCGGCCAGCGTATGCCGGCCCAGTTCATTCGTGCCTTGTTGCTGGCCTTGGCCGCAGCggccttggc < 6:307084/128‑6 (MQ=255) gTGCCGG‑‑‑CCCAGGCCCTCTACGGCGCCCAGACCCAGCGCGCGGTCGACAACTTCCCGATCAGCGGCCAGCGTATGCCGGCCCAGTTCATTCGTGCCTTGTTGCTGGCCTTGGCCGCAGCggccttggc > 5:307084/1‑123 (MQ=255) ccGG‑‑‑CCCAGGCCCTCTACGGCGCCCAGACCCAGCGCGCGGTCGACAACTTCCCGATCAGCGGCCAGCGTATGCCGGCCCAGTTCATTCGTGCCTTGTTGCTGGCCAAGGCCGCTGCGGCCAAGGCCAACGTCGAACTGGAGCAACTGt < 1:131480/148‑1 (MQ=255) g‑‑‑CCCAGGCCCTCTACGGCGCCCAGACCCAGCGCGCGGTCGACAACTTCCCGATCAGCGGCCAGCGTATGCCGGCCCAGTTCATTCGTGCCTTGTTGCTGGCCAAGGCCGCTGCGGCCAAGGCCAACGTCGAACTGGAGCAACTGTCTGc > 1:34055/1‑149 (MQ=255) ccAGGCCCTCTACGGCGCCCAGACCCAGCGCGCGGTCGACAACTTCCCGATCAGCGGCCAGCGTATTCCGGCCCAGTTCATTCGTGCCTTGTTGCTGGCCAAGGCCGCTGCGGCCAAGGCCAACCTCGAACTGGAGCAAATGTCAGCCg > 4:47590/1‑149 (MQ=255) ccTCTACGGCGCCCAGACCCAGCGCGCGGTCGACAACTTCCCGATCAGCGGCCAGCGTATGCCGGCCCAGTTCATTCGTGCCttgt < 6:76629/86‑1 (MQ=255) ccTCTACGGCGCCCAGACCCAGCGCGCGGTCGACAACTTCCCGATCAGCGGCCAGCGTATGCCGGCCCAGTTCATTCGTGCCttgt > 5:76629/1‑86 (MQ=255) tACGGCGCCCAGACCCAGCGCGCGGTCGACAACTTCCCGATCAGCGGCCAGCGTATGCCGGCCCAGTTCATTCGTGCCTTGTTGCTGGCCAAGGCCGCTGCGGCCAAGGCCAACGTCGAACTGGAGCAACTGTCTGCCGGGCAgg > 6:23542/1‑145 (MQ=255) tACGGCGCCCAGACCCAGCGCGCGGTCGACAACTTCCCGATCAGCGGCCAGCGTATGCCGGCCCAGTTCATTCGTGCCTTGTTGCTGGCCAAGGCCGCTGCGGCCAAGGCCAACGTCGAACTGGAGCAACTGTCTGCCGGGCAgg < 5:23542/145‑1 (MQ=255) aGACCCAGCGCGCGGTCGACAACTTCCCGATCAGCGGCCAGCGTATGCCGGCCCAGTTCATTCGTGCCTTGTTGCTGGCCAAGGCCGCTGCGGCCAAGGCCAACGTCGAACTGGAGCAACTGTCTGCCGGGCAGGGCCAGGCTAt > 7:173448/1‑145 (MQ=255) aGACCCAGCGCGCGGTCGACAACTTCCCGATCAGCGGCCAGCGTATGCCGGCCCAGTTCATTCGTGCCTTGTTGCTGGCCAAGGCCGCTGCGGCCAAGGCCAACGTCGAACTGGAGCAACTGTCTGCCGGGCAGGGCCAGGCTAt < 8:173448/145‑1 (MQ=255) | CGCCTTGCAGTTGGCCAATTGCCGTCTGCTGCCTTCGATTTCTCCCGATGAACTGATGCAAGGATTTGATGATGAGTGATACCCGTATCGAGCGTGACAGCATGGGTGAGCTGCAGGTGCCGG‑‑‑CCCAGGCCCTCTACGGCGCCCAGACCCAGCGCGCGGTCGACAACTTCCCGATCAGCGGCCAGCGTATGCCGGCCCAGTTCATTCGTGCCTTGTTGCTGGCCAAGGCCGCTGCGGCCAAGGCCAACGTCGAACTGGAGCAACTGTCTGCCGGGCAGGGCCAGGCTAT > NC_002947/1089072‑1089360 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |