| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,089,805 | G→C | 7.0% | Q222H (CAG→CAC) | fumC‑I → | class 2 fumarate hydratase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,089,805 | 0 | G | C | 7.0% | 238.3 / 2.2 | 76 | Q222H (CAG→CAC) | fumC‑I | class 2 fumarate hydratase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (35/35); new base C (3/3); total (38/38) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
ATCAATACGTGAAGACCGGTCGTACTCACCTGATGGACGCGATGCCCGTGCGCATGAGCCAGGTGCTGGATGGCTGGGCTGCGCAGATCAATGCTGCCAAGTCGCACATCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGCAGTTCGCTGTCGGTTTCGCTCGCCAGCTCAGTGGCCTGACCAAGGTCGAGTTCACGCCCGGCCAGAACCTGTTCGCACTGATCGGCTCGCAGGACACTGCCGTGGCTT > NC_002947/1089660‑1089953 | aTCAATACGTGAAGACCGGTCGTACTCACCTGATGGACGCGATGCCCGTGCGCATGAGCCAGGTGCTGGATGGCTGGGCTGCGCAGATCAATGCTGCCAAGTCGCACATCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGc > 2:11670/1‑149 (MQ=255) tCAATACGTGAAGACCGGTCGTACTCACCTGATGGACGCGATGCCCGTGCGCATGAGCCAGGTGCTGGATGGCTGGGCTGCGCAGATCAATGCTGCCAAGTCGCACATCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCg > 4:74104/1‑149 (MQ=255) aaTACGTGAAGACCGGTCGTACTCACCTGATGGACGCGATGCCCGTGCGCATGAGCCAGGTGCTGGATGGCTGGGCTGCGCAGATCAATGCTGCCAAGTCGCACATCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCgg < 4:109174/148‑1 (MQ=255) aaTACGTGAAGACCGGTCGTACTCACCTGATGGACGCGATGCCCGTGCGCATGAGCCAGGTGCTGGATGGCTGGGCTGCGCAGATCAATGCTGCCAAGTCGCACATCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCgg > 7:120977/1‑148 (MQ=255) tACGTGAAGACCGGTCGTACTCACCTGATGGACGCGATGCCCGTGCGCATGAGCCAGGTGCTGGATGGCTGGGCTGCGCAGATCAATGCTGCCAAGTCGCACATCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAAc < 5:14212/149‑1 (MQ=255) gAAGACCGGTCGTACTCACCTGATGGACGCGATGCCCGTGCGCATGAGCCAGGTGCTGGATGGCTGGGCTGCGCAGATCAATGCTGCCAAGTCGCACATCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCACGGCGGTTccgccc > 7:209603/1‑148 (MQ=255) gAAGACCGGTCGTACTCACCTGATGGACGCGATGCCCGTGCGCATGAGCAAGGTGCTGGATGGCTGGGCTGCGCAGATCAATGCTGCCAAGTCGCACATCGAAGGTGTGCTGCCGAACTTGCAGCCGCTGGCCCACTGAGGAAccgcct > 3:202882/1‑148 (MQ=255) aaGACCGGTCGTACTCACCTGATGGACGCGATGCCCGTGCGCATGAGCCAGGTGCTGGATGGCTGGGCTGCGCAGATCAATGCTGCCAAGTCGCACATCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGt < 6:331332/149‑1 (MQ=255) aaGACCGGTCGTACTCACCTGATGGACGCGATGCCCGTGCGCATGAGCCAGGTGCTGGATGGCTGGGCTGCGCAGATCAATGCTGCCAAGTCGCACATCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGt < 2:201715/149‑1 (MQ=255) aaGACCGGTCGTACTCACCTGATGGACGCGATGCCCGTGCGCATGAGCCAGGTGCTGGATGGCTGGGCTGCGCAGATCAATGCTGCCAAGTCGCACATCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGt < 8:120977/149‑1 (MQ=255) gACCGGTCGTACTCACCTGATGGACGCGATGCCCGTGCGCATGAGCCAGGTGCTGGATGGCTGGGCTGCGCAGATCAATGCTGCCAAGTCGCACATCGAAGGGGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCACGGCGGTTCCGCCCTgg < 7:151213/149‑1 (MQ=255) ccGGTCGTACTCACCTGATGGACGCGATGCCCGTGCGCATGAGCCAGGTGCTGGATGGCTGGGCTGCGCAGATCAATGCTGCCAAGTCGCACATCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCACGGCGGTTCCGCCCTgggc < 8:209603/149‑2 (MQ=255) cTCACCTGATGGACGCGATGCCCGTGCGCATGAGCCAGGTGCTGGATGGCTGGGCTGCGCAGATCAATGCTGCCAAGTCGCACATCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATc < 3:47897/149‑1 (MQ=255) tCACCTGATGGACGCGATGCCCGTGCGCATGAGCCAGGTGCTGGATGGCTGGGCTGCGCAGATCAATGCTGCCAAGTCGCACATCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATc > 8:166943/1‑148 (MQ=255) cACCTGATGGACGCGATGCCCGTGCGCATGAGCCAGGTGCTGGATGGCTGGGCTGCGCAGATCAATGCTGCCAAGTCGCACATCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCACGGCGGTTCCGCCCTgg > 8:112042/1‑136 (MQ=255) cACCTGATGGACGCGATGCCCGTGCGCATGAGCCAGGTGCTGGATGGCTGGGCTGCGCAGATCAATGCTGCCAAGTCGCACATCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCACGGCGGTTCCGCCCTgg < 7:112042/136‑1 (MQ=255) aCCTGATGGACGCGATGCCCGTGCGCATGAGCCAGGTGCTGGATGGCTGGGCTGCGCAGATCAATGCTGCCAAGTCGCACATCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAAc > 7:232977/1‑149 (MQ=255) gATGCCCGTGCGCATGAGCCAGGTGCTGGATGGCTGGGCTGCGCAGATCAATGCTGCCAAGTCGCACATCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGCAGt > 5:65744/1‑149 (MQ=255) aTGCCCGTGCGCATGAGCCAGGTGCTGGATGGCTGGGCTGCGCAGATCAATGCTGCCAAGTCGCACATCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGCAGtt < 1:11670/149‑1 (MQ=255) ccGTGCGCATGAGCCAGGTGCTGGATGGCTGGGCTGCGCAGATCAATGCTGCCAAGTCGCACATCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGCAGTTCg < 6:301718/147‑1 (MQ=255) ccGTGCGCATGAGCCAGGTGCTGGATGGCTGGGCTGCGCAGATCAATGCTGCCAAGTCGCACATCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGCAGTTCg > 5:301718/1‑147 (MQ=255) ccGTGCGCATGAGCCAGGTGCTGGATGGCTGGGCTGCGCAGATCAATGCTGCCAAGTCGCACATCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGCAGTTCGCt > 3:20757/1‑149 (MQ=255) ccGTGAGCATCAGCCAGGTGCTGGATGGCTGGTCTGCGCAGATCAATGCTGCCAAGTCGCACATCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGATGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGCAGTTCGCt > 6:125524/1‑149 (MQ=255) gTGCGCATGAGCCAGGTGCTGGATGGCTGGGCTGCGCAGATCAATGCTGCCAAGTCGCACATCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGCAGTTCGCTGt < 3:200672/149‑1 (MQ=255) gcATGTGCCAGGTGCTGGATGGCTGGGCTGCGCAGATCAATGCTGCCAAGTCGCACATCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGCAGTTCGCTGTCGGt > 2:2394/1‑149 (MQ=255) aTGAGCCAGGTGCTGGATGGCTGGGCTGCGCAGATCAATGCTGCCAAGTCGCACATCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGCAGTTCGCTGTCGGttt > 6:10250/1‑149 (MQ=255) ccAGGTGCTGGATGGCTGGGCTGCGCAGATCAATGCTGCCAAGTCGCACATCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGCAGTTCGCTGTCGGTTtcgctc < 3:200655/149‑1 (MQ=255) ccAGGTGCTGGATGGCTGGGCTGCGCAGATCAATGCTGCCAAGTCGCACATCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGCAGTTCGCTGTCGGTTtcgctc < 5:10250/149‑1 (MQ=255) aGGTGCTGGATGGCTGGGCTGCGCAGATCAATGCTGCCAAGTCGCACATCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGCAGTTCGCTGTCGGTTtcgctcgc < 7:166943/149‑1 (MQ=255) cTGGATGGCTGGGCTGCGCAGATCAATGCTGCCAAGTCGCACATCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGCAGTTCGCTGTCGGTTTCGCTCGCCAGc > 2:333622/1‑148 (MQ=255) tGGATGGCTGGGCTGCGCAGATCAATGCTGCCAAGTCGCACATCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGCAGTTCGCTGTCGGTTTCGCTCGCCAGCt > 5:78789/1‑148 (MQ=255) gATGGCTGGGCTGCGCAGATCAATGCTGCCAAGTCGCACATCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGCAGTTCGCTGTCGGTTTCGCTCGCCAGCTCa < 8:316575/148‑1 (MQ=255) gATGGCTGGGCTGCGCAGATCAATGCTGCCAAGTCGCACATCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGCAGTTCGCTGTCGGTTTCGCTCGCCAGCTCa < 3:74104/148‑1 (MQ=255) gATGGCTGGGCTGCGCAGATCAATGCTGCCAAGTCGCACATCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGCAGTTCGCTGTCGGTTTCGCTCGCCAGCTCAg > 6:67433/1‑149 (MQ=255) gctgggctgCGCAGATCAATGCTGCCAAGTCGCACATCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGCAGTTCGCTGTCGGTTTCGCTCGCCAGCTCAGTGGc < 1:2394/149‑1 (MQ=255) ctgggctgCGCAGATAAATGCTGCCAAGTCGCACATCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGAGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGCAGTTCGCTGTCGGTTTCGCTCGCCAGCTCAGTGGcc > 1:219814/1‑149 (MQ=255) tgggctgCGCAGATCAATGCTGCCAAGTCGCACATCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGCAGTTCGCTGTCGGTTTCGCTCGCCAGCTCAGTGGCCt > 4:55073/1‑149 (MQ=255) tCAATGCTGCCAAGTCGCACATCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGCAGTTCGCTGTCGGTTTCGCTCGCCAGCTCAGTGGCCTGACCAAGGTCGa < 6:65744/148‑1 (MQ=255) tCAATGCTGCCAAGTCGCACATCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGCAGTTCGCTGTCGGTTTCGCTCGCCAGCTCAGTGGCCTGACCAAGGTCGAg < 1:333622/149‑1 (MQ=255) ctgcCAAGTCGCACATCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGCAGTTCGCTGTCGGTTTCGCTCGCCAGCTCAGTGGCCTGACCAAGGTCGAGTTCAc < 5:67433/148‑1 (MQ=255) ctgcCAAGTCGCACATCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGCAGTTCGCTGTCGGTTTCGCTCGCCAGCTCAGTGGCCTGACCAAGGTCGAGTTCAc < 8:232977/148‑1 (MQ=255) ctgcCAAGTCGCACATCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGCAGTTCGCTGTCGGTTTCGCTCGCCAGCTCAGTGGCCTGACCAAGGTCGAGTACACg > 8:50178/1‑149 (MQ=255) gcCAAGTCGCACATCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGAAGTTCGCTGTCGCTTTCGCTCGCCCGCGCAGTGGCCTGACCAAGGTCGACTTAACGcc > 7:268929/1‑149 (MQ=255) ccAAGTCGCACATCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGCAGTTCGCTGTCGGTTTCGCTCGCCAGCTCAGTGGCCTGACCAAGGTCGAGTTCACGccc > 5:98978/1‑149 (MQ=255) aGTCGCACATCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGCAGTTCGCTGTCGGTTTCGCTCGCCAGCTCAGTGGCCTGACCAAGGTCGAGTTCACGCCCGGc < 6:78789/149‑1 (MQ=255) gTCGCACATCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGCAGTTCGCTGTCGGTTTCGCTCGCCAGCTCAGTGGCCt < 2:231729/123‑1 (MQ=255) gTCGCACATCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGCAGTTCGCTGTCGGTTTCGCTCGCCAGCTCAGTGGCCt > 1:231729/1‑123 (MQ=255) gCACATCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAAc < 2:162337/73‑1 (MQ=255) gCACATCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGCAGTTCGCTGTCGGTTTCGCTCGCCAGCTCAGTGGCCTGACCAAGGTCGAGTTCACGCCCGGCCAg > 1:319756/1‑148 (MQ=255) cacaTCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGCAGTTCGCTGTCGGTTTCGCTCGCCAGCTCAGTGGCCTGACCAAGGTCGAGTTCACGCCCgg < 5:69786/143‑1 (MQ=255) cacaTCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGCAGTTCGCTGTCGGTTTCGCTCGCCAGCTCAGTGGCCTGACCAAGGTCGAGTTCACGCCCgg > 6:69786/1‑143 (MQ=255) acaTCGAAGGTGGGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGCAGTTCGCTGTCGGTTTCGCTCGCCAGCTCAGTGGCCTGACCAAGGTCGAGTTCACGCCCGGCCAGAAc < 6:169008/149‑1 (MQ=255) aTCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGCAGTTCGCTGTCGGTTTCGCTCGCCAGCTCAGt > 7:98726/1‑111 (MQ=255) aTCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGCAGTTCGCTGTCGGTTTCGCTCGCCAGCTCAGt < 8:98726/111‑1 (MQ=255) tCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGCAGTTCGCTGTCGGTTTCGCTCGCCAGCTCAGTGGCCTGACCAAGGTCGAGTTCACGCCCGGCCAGAACCTg > 5:154573/1‑149 (MQ=255) tCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCAGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGCAGTTCGCTGTCGGTTTCGCTCGCCAGCTCAGTGGCCTGACCAAGGTCGAGTTCACGCCCGGCCAGAACCTg > 1:32000/1‑149 (MQ=255) gAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGCAGTTCGCTGTCGGTTTCGCTCGCCAGCTCAGTGGCCTGACCAAGGTCGAGTTCACGCCCGGCCAGAACCTGtt < 6:98978/149‑1 (MQ=255) aaGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGCAGTTCGCTGTCGGTTTCGCTCGCCAGCTCAGTGGCCTGACCAAGGTCGAGTTCACGCCCGGCCAGAACCTGTTc > 8:185398/1‑149 (MQ=255) aGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCg > 3:137884/1‑56 (MQ=255) aGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCg < 4:137884/56‑1 (MQ=255) aGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGCAGTTCGCTGTCGGTTTCGCTCGCCAGCTCAGTGGCCTGACCAATGTCGAGTACACGCCCGGCCAGAACCTGTTCg < 7:50178/149‑1 (MQ=255) tgctgcCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGGGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGCAGTTCGCTGTCGGTTTCGCTCGCCAGCTCAGTGGCCTGACCAAGGTCGAGTTCACGCCCGGCCAGCACCTGTTCGCACTg > 7:266144/1‑149 (MQ=255) gcCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGCAGTTCGCTGTCGGTTTCGCTCGCCAGCTCAGTGGCCTGACCAAGGTCGAGTTCACGCCCGGc > 7:110793/1‑127 (MQ=255) gcCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGCAGTTCGCTGTCGGTTTCGCTCGCCAGCTCAGTGGCCTGACCAAGGTCGAGTTCACGCCCGGc < 8:110793/127‑1 (MQ=255) ccGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGCAGTTCGCTGTCGGTTTCGCTCGCCAGCTCAGTGGCCTGACCAAGGTCGAGTTCACGCCCGGCCAGAACCTGTTCGCACTGATc < 2:32000/147‑1 (MQ=255) ccGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGCAGTTCGCTGTCGGTTTCGCTCGCCAGCTCAGTGGCCTGACCAAGGTCGAGTTCACGCCCGGCCAGAACCTGTTCGCACTGATCgg > 5:291019/1‑149 (MQ=255) cTTGCTGGCGCTGGGCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCGGGAGTTCGCTGTCGGTTTGGCTCGCCATCGCAGTGGCCTGACCAAGGTCGAGTTCACGCCCGGCCAGAACCTGTTCGCACTGATCGGCTCGc < 2:219814/149‑1 (MQ=255) gCAGGAGCTGGCCCAGGGCGGAACCGACGTGGGTACCGGCATCAACGACCATCCGCAGTTCGCTGTCGGTTTCGCTCGCCAGCTCAGTGGCCTGACCAAGGTCGAGTTCACGCCCGGCCAGAACCTGTTAGCACTGATCGGCTCGCAg < 8:268929/148‑1 (MQ=255) gcgcTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGCAGTTCGCTGTCGGTTTCGCTCGCCAGCTCAGTGGCCTGACCAAGGTCGAGTTCACGCCCGGCCAGAACCTGt < 7:12377/124‑1 (MQ=255) gcgcTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGCAGTTCGCTGTCGGTTTCGCTCGCCAGCTCAGTGGCCTGACCAAGGTCGAGTTCACGCCCGGCCAGAACCTGt > 8:12377/1‑124 (MQ=255) gcTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGCAGTTCGCTGTCGGTTTCGCTCGCCAGCTCAGTGGCCTGACCAAGGTCGAGTTCACGCCCGGCCAGAACCTGTTCGCACTGATCGGCTCGCAGGacac > 1:299897/1‑147 (MQ=255) gcTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGCAGTTCGCTGTCGGTTTCGCTCGCCAGCTCAGTGGCCTGACCAAGGTCGAGTTCACGCCCGGCCAGAACCTGTTCGCACTGATCGGCTCGCAGGacac < 2:299897/147‑1 (MQ=255) gcTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGCAGTTCGCTGTCGGTTTCGCTCGCCAGCTCAGTGGCCTGACCAAGGTCGAGTTCACGCCCGGCCAGAACCTGTTCGCACTGATCGGCTCGCAGGACACTg > 8:163242/1‑149 (MQ=255) ccAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGCAGTTCGCTGTCGGTTTCGCTCGCCAGCTCAGTGGCCTGACCAAGGTCGAGTTCACGCCCGGCCAGAACCTGTTCGCACTGATCGGCTCGCAGGACACTGCCGTgg > 5:54989/1‑149 (MQ=255) ccAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGCAGTTCGCTGTCGGTTTCGCTCGCCAGCTCAGTGGCCTGACCAAGGTCGAGTTCACGCCCGGCCAGAACCTGTTCGCACTGATCGGCTCGCAGGACACTGCCGTgg > 6:332438/1‑149 (MQ=255) cAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGCAGTTCGCTGTCGGTTTCGCTCGCCAGCTCAGTGGCCTGACCAAGGTCGAGTTCACGCCCGGCCAGAACCTGTTCGCACTGATCGGCTCGCAGGACACTGCCGTGGc < 4:20757/149‑1 (MQ=255) gggCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGCAGTTCGCTGTCGGTTTCGCTCGCCAGCTCAGTGGCCTGACCAAGGTCGAGTTCACGCCCGGCCAGAACCTGTTCGCACTGATCGGCTCGCAGGACACTGCCGTGGCtt > 2:274988/1‑149 (MQ=255) | ATCAATACGTGAAGACCGGTCGTACTCACCTGATGGACGCGATGCCCGTGCGCATGAGCCAGGTGCTGGATGGCTGGGCTGCGCAGATCAATGCTGCCAAGTCGCACATCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGCAGTTCGCTGTCGGTTTCGCTCGCCAGCTCAGTGGCCTGACCAAGGTCGAGTTCACGCCCGGCCAGAACCTGTTCGCACTGATCGGCTCGCAGGACACTGCCGTGGCTT > NC_002947/1089660‑1089953 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |