| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,158,920 | G→A | 6.7% | M351I (ATG→ATA) | gtsA → | mannose/glucose ABC transporter substrate‑binding protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,158,920 | 0 | G | A | 6.7% | 266.0 / 6.0 | 89 | M351I (ATG→ATA) | gtsA | mannose/glucose ABC transporter substrate‑binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (45/38); new base A (2/4); total (47/42) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.15e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.88e-01 | |||||||||||
TACAACATCGACTCGTTGGTGGTGTTCAAGCAGAACAACGCTGGCACCTCTGCTGGTCAGCAGGACATCGCCCGCAAGGTGTTGGGTGAGGACTTCCAGAAGGTCTTCAGCATCAACAAGGGTTCGATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTCAAACCTCCGCCAAGGACTTCCTGGCTGACGCCAAAACGGGCGGCCTGCAACCGAGCATGGCGCACAACATGGCCACCACGCTGGCCGTGCAGGGCGCGTTCTTCG > NC_002947/1158774‑1159065 | tACAACATCGACTCGTTGGTGGTGTTCAAGCAGAACAACGCTGGCACCTCTGCTGGTCAGCAGGACATCGCCCGCAAGGTGTTGGGTGAGGACTTCCAGAAGGTCTTCAGCATCAACAAGGGTTCGATCCCGGTACGCAACGACATg > 3:179131/1‑147 (MQ=255)tACAACATCGACTCGTTGGTGGTGTTCAAGCAGAACAACGCTGGCACCTCTGCTGGTCAGCAGGACATCGCCCGCAAGGTGTTGGGTGAGGACTTCCAGAAGGTCTTCAGCATCAACAAGGGTTCGATCCCGGTACGCAACGACATg < 4:179131/147‑1 (MQ=255) aaccTCGACTCGTTGGTGGTGTTCAAGCAGAACAACGCTGGCACCTCTGCTGGTCAGCATGACATCGCCCGAAAGGTGTTGGGTGAGGAGTTCCAGAAGGTCTTCAGCATCAACAAGGGTTCGATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGc < 4:18910/149‑1 (MQ=255) aacaTCGACTCGTTGGTGGTGTTCAAGCAGAACAACGCTGGCACCTCTGCTGGTCAGCAGGACATCGCCCGCAAGGTGTTGGGTGAGGACTTCCAGAAGGTCTTCAGCATCAACAAGGGTTCGATCCCGGTACGCAACGACATACTTGc > 6:199846/1‑149 (MQ=255) aacaTCGAATCGTTGGTCGTGTTCAACCAGAACAACGCAGGCACCTCTGCTGGACAGCAGGACATCGCCCGCAAGGTGTGCGGTGAGGACGTCCAGAAGGTCTTCAGCATCAACAAGGGTACGATCCCGGTACGCAACGACAAGATTGc > 4:294472/1‑149 (MQ=255) tCGACTCGTTGGTGGTGTTCAAGCAGAACAACGCTGGCACCTCTGCTGGTCAGCAGGACATCGCCCGCAAGGTGTTGGGTGAGGACTTCCAGAAGGTCTTCAGCATCAACAAGGGTTCGATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCGa > 2:145257/1‑148 (MQ=255) tCGACTCGTTGGTGGTGTTCAAGCAGAACAACGCTGGCACCTCTGCTGGTCAGCAGGACATCGCCCGCAAGGTGTTGGGTGAGGACTTCCAGAAGGTCTTCAGCATCAACAAGGGTTCGATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCGAc < 5:31739/149‑1 (MQ=255) aCTCGTTGGTGGTGTTCAAGCAGAACAACGCTGGCACCTCTGCTGGTCAGCAGGACATCGCCCGCAAGGTGTTGGGTGAGGACTTCCAGAAGGTCTTCAGCATCAACAAGGGTTCGATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATg > 1:209933/1‑149 (MQ=255) aCTCGTTGGTGGTGTTCAAGCAGAACAACGCTGGCACCTCTGCTGGTCAGCAGGACATCGCCCGCAAGGTGTTGGGTGAGGACTTCCAGAAGGTCTTCAGCATCAACAAGGGTTCGATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATg > 4:101244/1‑149 (MQ=255) gTTGGTGGTGTTCAAGCAGAACAACGCTGGCACCTCTGCTGGTCAGCAGGACATCGCCCGCAAGGTGTTGGGTGAGGACTTCCAGAAGGTCTTCAGCATCAACAAGGGTTCGATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATGGGc > 6:267342/1‑148 (MQ=255) gTTGGTGGTGTTCAAGCAGAACAACGCTGGCACCTCTGCTGGTCAGCAGGACATCGCCCGCAAGGTGTTGGGTGAGGACTTCCAGAAGGTCTTCAGCATCAACAAGGGTTCGATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATGGGc > 6:256282/1‑148 (MQ=255) gTTGGTGGTGTTCAAGCAGAACAACGCTGGCACCTCTGCTGGTCAGCAGGACATCGCCCGCAAGGTGTTGGGTGAGGACTTCCAGAAGGTCTTCAGCATCAACAAGGGTTCGATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATGGGc < 2:22930/148‑1 (MQ=255) ttGGTGGTGTTCAAGCAGAACAACGCTGGCACCTCTGCTGGTCAGCAGGACATCGCCCGCAAGGTGTTGGGTGAGGACTTCCAGAAGGTCTTCAGCATCAACAAGGGTTCGATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATGGGCaa < 4:239520/149‑1 (MQ=255) gtggtgTTCAAGCAGAACAACGCTGGCACCTCTGCTGGTCAGCAGGACAACGCCCGCAAGGTGTTGGGTGAGGACTTCCAGAAGGTCTTCAGCATCAACAAGGGTTCGATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTa < 3:161676/149‑1 (MQ=255) tggtgTTCAAGCAGAACAACGCTGGCACCTCTGCTGGTCAGCAGGACATCGCCCGCAAGGTGTTGGGTGAGGACTTCCAGAAGGTCTTCAGCATCAACAAGGGTTCGATCCCGGTACGCAACGACATACTTGCCCATGTCGGCAAGCAt < 5:199846/149‑1 (MQ=255) gtgtTCAAGCAGAACAACGCTGGCACCTCTGCTGGTCAGCAGGACATCGCCCGCAAGGTGTTGGGTGAGGACTTCCAGAAGGTCTTCAGCATCAACAAGGGTTCGATCCCGGTTCGCAACGACATACTTGCCCATGTCGGCAAGCATgt < 1:51825/149‑2 (MQ=255) gtgtTCAAGCAGAACAACGCTGGCACCTCTGCTGGTCAGCAGGACATCGCCCGCAAGGTGTTGGGTGAGGACTTCCAGAAGGTCTTCAGCATCAACAAGGGTTCGATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATgg > 1:295366/1‑149 (MQ=255) ttCAAGCAGAACAACGCTGGCACCTCTGCTGGTCAGCAGGACATCGCCCGCAAGGTGTTGGGTGAGGACTTCCAGAAGGTCTTCAGCATCAACAAGGGTTCGATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGttt > 6:144450/1‑149 (MQ=255) aaGCAGAACAACGCTGGCACCTCTGCTGGTCAGCAGGACATCGCCCGCAAGGTGTTGGGTGAGGACTTCCAGAAGGTCTTCAGCATCAACAAGGGTTCGATCCCGGTACGCAACGACATACTTGCCCATGTCGGCAAGCATgtcgttg < 5:255589/148‑7 (MQ=255) cAGAACAACGCTGGCACCTCTGCTGGTCAGCAGGACATCGCCCGCAAGGTGTTGGGTGAGGACTTCCAGAAGGTCTTCAGCATCAACAAGGGTTCGATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGc < 5:144450/149‑1 (MQ=255) cAGAACAACGCTGGCACCTCTGCTGGTCAGCAGGACATCGCCCGCAAGGTGTTGGGTGAGGACTTCCAGAAGGTCTTCAGCATCAACAAGGGTTCGATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGc < 8:11928/149‑1 (MQ=255) aacaacGCTGGCACCTCTGCTGGTCAGCAGGACATCGCCCGCAAGGTGTTGGGTGAGGACTTCCAGAAGGTCTTCGGCATCAACAAGGGTTCGATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCtg > 1:337959/1‑149 (MQ=255) aacaacGCTGGCACCTCTGCTGGTCAGCAGGACATCGCCCGCAAGGTGTTGGGTGAGGACTTCCAGAAGGTCTTCAGCATCAACAAGGGTTCGATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGc > 5:152367/1‑119 (MQ=255) aacaacGCTGGCACCTCTGCTGGTCAGCAGGACATCGCCCGCAAGGTGTTGGGTGAGGACTTCCAGAAGGTCTTCAGCATCAACAAGGGTTCGATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGc < 6:152367/119‑1 (MQ=255) tGGCACCTCTGCTGGTCAGCAGGACATCGCCCGCAAGGTGTTGGGTGAGGACTTCCAGAAGGTCTTCAGCATCAACAAGGGTTCGATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATgg < 5:58527/119‑1 (MQ=255) tGGCACCTCTGCTGGTCAGCAGGACATCGCCCGCAAGGTGTTGGGTGAGGACTTCCAGAAGGTCTTCAGCATCAACAAGGGTTCGATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATgg > 6:58527/1‑119 (MQ=255) tGGCACCTCTGCTGGTCAGCAGGACATCGCCCGCAAGGTGTTGGGTGAGGACTTCCAGAAGGTCTTCAGCATCAACAAGGGTTCGATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTCaaa > 2:141164/1‑149 (MQ=255) tGGCACCTCTGCTGGTCAGCAGGACATCGCCCGCAAGGTGTTGGGTGAGGACTTCCAGAAGGTCTTCAGCATCAACAAGGGTTCGATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTCaaa < 8:144055/149‑1 (MQ=255) ccTCTGCTGGTCAGCAGGACATCGCCCGCAAGGTGTTGGGTGAGGACTTCCAGAAGGTCTTCAGCATCAACAAGGGTTCGATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTCAAACCTcc < 3:101244/149‑1 (MQ=255) ctctGCTGGTCAGCAGGACATCGCCCGCAAGGTGTTGGGTGAGGACTTCCAGAAGGTCTTCAGCATCAACAAGGGTTCGATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTCAAACCt > 4:273867/1‑146 (MQ=255) ctctGCTGGTCAGCAGGACATCGCCCGCAAGGTGTTGGGTGAGGACTTCCAGAAGGTCTTCAGCATCAACAAGGGTTCGATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTCAAACCt < 3:273867/146‑1 (MQ=255) tgctgGTCAGCAGGACATCGCCCGCAAGGTGTTGGGTGAGGACTTCCAGAAGGTCTTCAGCATCAACAAGGGTTCGATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTCAAACCTcc < 8:6935/145‑1 (MQ=255) tgctgGTCAGCAGGACATCGCCCGCAAGGTGTTGGGTGAGGACTTCCAGAAGGTCTTCAGCATCAACAAGGGTTCGATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTCAAACCTcc > 7:6935/1‑145 (MQ=255) ctgGTCAGCAGGACATCGCCCGCAAGGTGTTGGGTGAGGACTTCCAGAAGGTCTTCAGCATCAACAAGGGTTCGATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTCAAACCTCCGCCaa < 1:141164/148‑1 (MQ=255) gTCAGCAGGACATCGCCCGCAAGGTGTTGGGTGAGGACTTCCAGAAGGTCTTCAGCATCAACAAGGGTTCGATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTCAAACCTCCGCCAAGGAc > 7:69616/1‑149 (MQ=255) agGACATCGCCCGCAAGGTGTTGGCTGACGACTTCCAGAAGTTCTTCAGCATCAACAACGGTTCCATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTCAAACCTCCGCCAAGGACTTCCTg < 4:220927/149‑1 (MQ=255) gACATCGCCCGCAAGGTGTTGGGTGAGGACTTCCAGAAGGTCTTCAGCATCAACAAGGGTTCGATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTCAAACCTCCGCCAAGGACTTCCTGGc > 2:264276/1‑149 (MQ=255) gACATCGCCCGCAAGGTGTTGGGTGAGGACTTCCAGAAGGTCTTCAGCATCAACAAGGGTTCGATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTCAAACCTCCGCCAAGGACTTCCTGGc > 4:259799/1‑149 (MQ=255) cATCGCCCGCAAGGTGTTGGGTGAGGACTTCCAGAAGGTCTTCAGCATCAACAAGGGTTCGATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTCAAACCTCCGCCAAGGACTTCCTGGCTg < 2:295366/149‑1 (MQ=255) tCGCCCGCAAGGTGTTGGGTGAGGACTTCCAGAAGGTCTTCAGCATCAACAAGGGTTCGATCCCGGTACGCAACGATATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTCAAACCTCCGCCAAGGACTTCCTGGCTGAc > 2:206525/1‑149 (MQ=255) tCGCCCGCAAGGTGTTGGGTGAGGACTTCCAGAAGGTCTTCAGCATCAACAAGGGTTCGATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTCAAACCTCCGCCAAGGACTTCCTGGCTGAc > 4:258703/1‑149 (MQ=255) ccGCAAGGTGTTGGGTGAGGACTTCCAGAAGGTCTTCAGCATCAACAAGGGTTCGATCCCGGTACGCAACGACATACTTGCCCATGTCGGCAAGCATgt < 1:307346/99‑2 (MQ=38) ccGCAAGGTGTTGGGTGAGGACTTCCAGAAGGTCTTCAGCATCAACAAGGGTTCGATCCCGGTACGCAACGACATACTTGCCCATGTCGGCAAGCATgt > 2:307346/1‑98 (MQ=38) aaGGTGTTGGGTGAGGACTTCCAGAAGGTCTTCAGCATCAACAAGGGTTCGATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTCAAACCTCCGCCAAGGACTTCCTGGCTGACGCCAAAAc < 1:264276/149‑1 (MQ=255) gggTGAGGACTTCCAGAAGGTCTTCAGCATCAACAAGGGTTCGATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTCAAACCTCCGCCAAGGACTTCCTGGCTGACGCCAAAACGggcggc < 4:280152/148‑1 (MQ=255) ggTGAGGACTTCCAGAAGGTCTTCAGCATCAACAAGGGTTCGATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTCAAACCTCCGCCAAGGACTTCCTGGCTGACGCCAAAACTGGCGGCCt > 6:259543/1‑149 (MQ=255) gTGAGGACTTCCAGAAGGTCTTCAGCATCAACAAGGGTTCGATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTCAAACCTCCGCCAAGGACTTCCTGGCTGACGCCAAAACGGGCGGCCTg > 5:31643/1‑149 (MQ=255) ggAGGACTTCCAGAAGGTCTTCAGCATCAACAAGGGTTCGATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTCAAACCTCCGCCAAGGACTTCCTGGCTGACGCCAAAACGGGCGGCCTg > 2:230806/2‑148 (MQ=255) aGGACTTCCAGAAGGTCTTCAGCATCAACAAGGGTTCGATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTCAAACCTCCGCCAAGGACTTCCTGGCTGACGCCAAAACGGGCGGCCTGCaa > 1:29449/1‑149 (MQ=255) ggACTTCCAGAAGGTCTTCAGCATCAACAAGGGTTCGATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTCAAACCTCCGCCAAGGACTTCCTGGCTGACGCCAAAACGGGCGGCCTGCAAc > 7:116751/1‑149 (MQ=255) gACTTCCAGAAGGTCTTCAGCATCAACAAGGGTTCGATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTCAAACCTCCGCCAAGGACTTCCTGGCTGACGCCAAAACGGGCGGCCTGCAAcc > 1:69532/1‑149 (MQ=255) gACTTCCAGAAGGTCTTCAGCATCAACAAGGGTTCGATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTCAAACCTCCGCCAAGGACTTCCTGGCTGACGCCAAAACGGGCGGCCTGCAAcc > 2:19239/1‑149 (MQ=255) gACTTCCAGAAGGTCTTCAGCATCAACAAGGGTTCGATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTCAAACCTCCGCCAAGGACTTCCTGGCTGACGCCAAAACGGGCGGCCTGCAAcc > 2:154787/1‑149 (MQ=255) gACTTCCAGAAGGTCTTCAGCATCAACAAGGGTTCGATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTCAAACCTCCGCCAAGGACTTCCTGGCTGACGCCAAAACGGGCGGCCTGCAAcc > 2:151991/1‑149 (MQ=255) ttCCAGAAGGTCTTCAGCATCAACAAGGGTTCGATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTCAAACCTCCGCCAAGGACTTCCTGGCTGACGCCAAAACGggc < 8:193033/135‑1 (MQ=255) ttCCAGAAGGTCTTCAGCATCAACAAGGGTTCGATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTCAAACCTCCGCCAAGGACTTCCTGGCTGACGCCAAAACGggc > 7:193033/1‑135 (MQ=255) cAGAAGGTCTTCAGCATCAACAAGGGTTCGATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTCAAACCTCCGCCAAGGACTTCCTGGCTGACGCCAAAACGGGCGGCCTGCAACCGAGCAt < 1:145257/149‑1 (MQ=255) gAAGGTCTTCAGCATCAACAAGGGTTCGATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTCAAACCTCCGCCAAGGACTTCCTGGCTGACGCCAAAACGGGCGGCCTGCAACCGAGCATgg > 4:125407/1‑149 (MQ=255) cggCATCAACAAGGGTTCGATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTCAAACCTCCGCCAAGGACTTCCTGGCTGACGCCAAAACGGGCGGCCTGCAACCGAGCATGGCGcaca < 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aacaaGGGTTCGATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTCAAACCTCCGCCAAGGACTTCCTGGCTGACGCCAAAACGGGCGGCCTGCAACCGAGCATGGCGCACAACATGGccac > 1:285456/1‑149 (MQ=255) acaaGGGTTCGATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTCAAACCTCCGCCAAGGACTTCCTGGCTGACGCCAAAACGGGCGGCCTGCAACCGAGCATGGCGCACAACATGGccac > 7:60529/1‑148 (MQ=255) gggTTTGATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTCAAACCTCCGCCAAGGACTTCCTGGCTGACGCCAAAACGGGCGGCCTGCAACCGAGCATGGCGCACAACATg > 5:152670/1‑139 (MQ=255) gggTTTGATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTCAAACCTCCGCCAAGGACTTCCTGGCTGACGCCAAAACGGGCGGCCTGCAACCGAGCATGGCGCACAACATg < 6:152670/139‑1 (MQ=255) gTTCGATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTCAAACCTCCGCCAAGGACTTCCTGGCTGACGCCAAAACGGGCGGCCTGCAACCGAGCATGGCGCACAACATGGCCACCACGCTg > 5:28653/1‑149 (MQ=255) ttCGATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTCAAACCTCCGCCAAGGACTTCCTGGCTGACGCCAAAACGGGCGGCCTGCAACCGAGCATGGCGcac > 4:290494/1‑130 (MQ=255) ttCGATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTCAAACCTCCGCCAAGGACTTCCTGGCTGACGCCAAAACGGGCGGCCTGCAACCGAGCATGGCGcac < 3:290494/130‑1 (MQ=255) gATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTCAAACCTCCGCCAAGGACTTCCTGGCTGACGCCAAAACGGGCGGCCTGCAACCGAGCATGGCGCACAACATGGCCACCACGCTGGCCg > 4:94541/1‑149 (MQ=255) aTCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTCAAACCTCCGCCAAGGACTTCCTGGCTGACGCCAAAACGGGCGGCCTGCAACCGAGc < 2:83217/117‑1 (MQ=255) aTCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTCAAACCTCCGCCAAGGACTTCCTGGCTGACGCCAAAACGGGCGGCCTGCAACCGAGc > 1:83217/1‑117 (MQ=255) ccGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTCAAACCTCCGCCAAGGACTTCCTGGCTGACGCCAAAACGGGCGGCCTGCAACCGAGCATGGCGCACAACATGGCCACCACGCTGGCCGTGCa < 5:256282/149‑1 (MQ=255) cGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTCAAACCTCCGCCAAGGACTTCCTGGCTGACGCCAAAACGGGCGGCCTGCAACCGAGCATGGCGCACAACATGGCCACCACGCTGGCCGTGCAg < 2:69532/149‑1 (MQ=255) ggTACGCAACGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTCAAACCTCCGCCAAGGACTTCCTGGCTGACGCCAAAACGGGCGGCCTGCAACCGAGCATGGCGCACAACATGGCCACCACGCTGGcc < 5:272931/142‑1 (MQ=255) ggTACGCAACGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTCAAACCTCCGCCAAGGACTTCCTGGCTGACGCCAAAACGGGCGGCCTGCAACCGAGCATGGCGCACAACATGGCCACCACGCTGGcc > 6:272931/1‑142 (MQ=255) ggTACGCAACGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTCAAACCTCCGCCAAGGACTTCCTGGCTGACGCCAAAACGGGCGGCCTGCAACCGAGCATGGCGCACAACATGGCCACCACGCTGGCCGTGCAgg < 1:151991/149‑1 (MQ=255) tagggaaCGACATGCTTGCCGACTTGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTCAAACCTCCGCCAAGGACTTCCTGGCTGACGCCAACACGGGCGGCGTGCAACCGAGCATGGCGCACAACATGGCCACCACGCTGGCCGTGCAGGgc < 3:294472/144‑1 (MQ=255) tACGCAACGATATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTCAAACCTCCGCCAAGGACTTCCTGGCTGACGCCAAAACGGGCGGCCTGCAACCGAGCATGGCGCACAACATGGCCACCACGCTGGCCGTGCAGGgc < 1:206525/149‑1 (MQ=255) gCAACGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTCAAACCTCCGCCAAGGACTTCCTGGCTGACGCCAAAACGGGCGGCCTGCAACCGAGCATGGCGCACAACATGGcc > 7:252393/1‑125 (MQ=255) gCAACGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTCAAACCTCCGCCAAGGACTTCCTGGCTGACGCCAAAACGGGCGGCCTGCAACCGAGCATGGCGCACAACATGGcc < 8:252393/125‑1 (MQ=255) aaCGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTCAAACCTCCGCCAAGGACTTCCTGGCTGACGCCAAAACGGGCGGCCTGCAACCGAGCATGGCGCACAACATGGCCACCACGCTGGCCGTGCAGGGCGCGtt > 3:79722/1‑149 (MQ=255) aaCGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTCAAACCTCCGCCAAGGACTTCCTGGCTGACGCCAAAACGGGCGGCCTGCAACCGAGCATGGCGCACAACATGGCCACCACGCTGGCCGTGCAGGGCGCGtt > 5:157754/1‑149 (MQ=255) aaCGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTCAAACCTCCGCCAAGGACTTCCTGGCTGACGCCAAAACGGGCGGCCTGCAACCGAGCATGGCGCACAACATGGCCACCACGCTGGCCGTGCAGGGCGCGtt > 6:346687/1‑149 (MQ=255) aCGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTCAAACCTCCGCCAAGGACTTCCTGGCTGACGCCAAAACGGGCGGCCTGCAACCGAGCATGGCGCACAACATGGCCACCACGCTGGCCGTGCAGGGCGCGttc < 3:258703/149‑1 (MQ=255) gACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTCAAACCTCCGCCAAGGACTTCCTGGCTGACGCCAAAACGGGCGGCCTGCAACCGAGCATGGCGCACAACATGGCCACCACGCTGGCCGTGCAGGGCGCGttctt < 2:29449/149‑1 (MQ=255) gACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTCAAACCTCCGCCAAGGACTTCCTGGCTGACGCCAAAACGGGCGGCCTGCAACCGAGCATGGCGCACAACATGGCCACCACGCTGGCCGTGCAGGGCGCGttctt < 1:230806/149‑1 (MQ=255) gACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTCAAACCTCCGCCAAGGACTTCCTGGCTGACGCCAAAACGGGCGGCCTGCAACCGAGCATGGCGCACAACATGGCCACCACGCTGGCCGTGCAGGGCGCGttcta > 1:294552/1‑148 (MQ=255) cATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTCAAACCTCCGCCAAGGACTTCCTGGCTGACGCCAAAACGGGCGGCCTGCAACCGAGCATGGCGCACAACATGGCCACCACGCTGGCCGTGCAGGGCGCGTTCTTCg < 6:31643/149‑1 (MQ=255) | TACAACATCGACTCGTTGGTGGTGTTCAAGCAGAACAACGCTGGCACCTCTGCTGGTCAGCAGGACATCGCCCGCAAGGTGTTGGGTGAGGACTTCCAGAAGGTCTTCAGCATCAACAAGGGTTCGATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTCAAACCTCCGCCAAGGACTTCCTGGCTGACGCCAAAACGGGCGGCCTGCAACCGAGCATGGCGCACAACATGGCCACCACGCTGGCCGTGCAGGGCGCGTTCTTCG > NC_002947/1158774‑1159065 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |