| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 138,952 | T→C | 6.8% | R518G (AGA→GGA) ‡ | kinB ← | alginate biosynthesis sensor protein KinB |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 138,952 | 0 | T | C | 6.8% | 214.3 / 4.3 | 73 | R518G (AGA→GGA) ‡ | kinB | alginate biosynthesis sensor protein KinB |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (33/35); new base C (3/2); total (36/37) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.74e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.96e-01 | |||||||||||
TTTCCTTGCACAGCGCGAGCCCCAGCCCAGCGCCGCCTTTCTTGCGACCTACCTGCACGAAAGGCTCGAAGATGCGCGCTTGTTGCCCATAGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGG‑TATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTCCAGCACTCGGTCCAACTGGGCGACGTCGGCCTGGATACGCGGTAGCGGCGGGTCCAGTTCCTTGATCAACTCGATCTGCTT > NC_002947/138805‑139096 | tttCCTTGCACAGCGCGAGCCCCAGCCCAGCGCCGCCTTTCTTGCGACCTACCTGCACGAAAGGCTCGAAGATGCGCGCTTGTTGCCCATAGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCCGTCTg > 1:213921/1‑149 (MQ=255)ctaccTTCCCCAGCGCTAGCCCCATCCCACCCCCGCCTTTCATGCTACATTCCTGAACTAAAGGCGCTAAGATGCTCGCTTGATGCCCATAGGAAATGCCCTCTCCTTTTTCCTCGACGCTGATGATAACCCGTTCTGCATGCCGTCTg < 4:251432/146‑1 (MQ=255) ttGCACAGCGCGAGCCCCAGCCCAGCGCCGCCTTTCTTGCGACCTACCTGCACGAAAGGCTCGAAGATGCGCGCTTGTTGCCCATAGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCCGTCTgggagg > 7:10426/1‑145 (MQ=255) cgcgAGCCCCAGCCCAGCGCCGCCTTTCTTGCGACCTACCTGCACGAAAGGCTCGAAGATGCGCGCTTGTTGCCCATAGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGa < 2:213921/149‑1 (MQ=255) gcgAGCCCCAGCCCAGCGCCGCCTTTCTTGCGACCTACCTGCACGAAAGGCTCGAAGATGCGCGCTTGTTGCCCATAGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGAt < 1:79180/149‑1 (MQ=255) gcgAGCCCCAGCCCAGCGCCGCCTTTCTTGCGACCTACCTGCACGAAAGGCTCGAAGATGCGCGCTTGTTGCCCATAGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCCAGACGGCATGCAg > 8:86081/1‑143 (MQ=255) gcgAGCCCCAGCCCAGCGCCGCCTTTCTTGCGACCTACCTGCACGAAAGGCTCGAAGATGCGCGCTTGTTGCCCATAGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCCAGACGGCATGCAg < 7:86081/143‑1 (MQ=255) cagcccagcGCCGCCTTTCATGCGACCTACCTGCACGAAAGGCTCGAAGATGCGCGCTTGTTGCCCATAGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGcgcccgc > 5:228240/1‑149 (MQ=255) cccagcGCCGCCTTTCTTGCGACCTACCTGCACGAAAGGCTCGAAGATGCGCGCTAGTTGCCCAAAGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCAGATCATCACCCGTTCTGCATGCCGTCTCGCATGCAGCCGGATGCGCCCGCCGt > 5:286014/1‑149 (MQ=255) ccagcGCCGCCTTTCTTGCGACCTACCTGCACGAAAGGCTCGAAGATGCGCGCTTGTTGCCCATAGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTTCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGtt < 2:245563/149‑1 (MQ=255) agcGCCGCCGTTCTTGCGCCCTACCTGCACGACAGGCTCGAAGATGCGCGCTTGTTGCCCATAGGAAATGCCCTCTCCGTTGGCCTCGACGCTGATGATCACCCTTTCTGCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTgg < 8:275812/149‑1 (MQ=255) cgccgcCTTTCTTGCGACCTACCTGCACGAAAGGCTCGAAGATGCGCGCTTGTTGCCCATAGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCg < 3:248921/149‑1 (MQ=255) gccgccTTTCTTGCGACCTACCTGCACGAAAGGCTCGAAGATGCGCGCTTGTTGCCCATAGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCgg > 8:267123/1‑149 (MQ=255) ttGCGACCTACCTGCACGAAAGGCTCGAAGATGCGCGCTTGTTGCACATAGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTATGCATGCCGTCTGTCATGAAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGT‑TATGGCGGAt > 6:261160/1‑149 (MQ=255) gCGACCTACCTGCACGAAAGGCTCGAAGATGCGCGCTTGTTGCCCATTGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGG‑TATGGCGGa < 6:286014/146‑1 (MQ=255) gCGACCTACCTGCACGAAAGGCTCGAAGATGCGCGCTTGTTGCCCATAGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGG‑TATGGCGGa > 6:74772/1‑146 (MQ=255) gCGACCTACCTGCACGAAAGGCTCGAAGATGCGCGCTTGTTGCCCATAGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGG‑TATGGCGGa < 7:267123/146‑1 (MQ=255) gCGACCTACCTGCACGAAAGGCTCGAAGATGCGCGCTTGTTGCCCATAGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGG‑TATGGCGGa < 5:74772/146‑1 (MQ=255) ctGCACGAAAGGCTCGAAGATGCGCGCTTGTTGCCCATAGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGCGACCGCCGATGGCGG‑TATGGAGGATGGCGTtatg > 8:221213/1‑147 (MQ=255) cACGAAAGGCTCGAAGATGCGCGCTTGTTGCCCATTGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGG‑TATGGCGGATGGCGTTGTgcagca < 2:339785/149‑1 (MQ=255) cACGAAAGGCTCGAAGATGCGCGCTTGTTGCCCATAGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGG‑TATGGCGGATGGCGTTGTgcagca < 5:261160/149‑1 (MQ=255) gAAAGGCTCGAAGATGCGCGCTTGTTGCCCATAGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGG‑TATGGCGGATGGCGtt < 1:282366/138‑1 (MQ=255) gAAAGGCTCGAAGATGCGCGCTTGTTGCCCATAGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGG‑TATGGCGGATGGCGtt > 2:282366/1‑138 (MQ=255) gCTCGAAGATGCGCGCTTGTTGCCCATAGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGG‑TATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTc > 2:72782/1‑148 (MQ=255) cTCGAAGATGCGCGCTTGTTGCCCATAGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGGCTATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTcc < 1:216524/149‑1 (MQ=255) cTCGAAGATGCGCGCTTGTTGCCCATAGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGGATATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTcc < 1:211576/149‑1 (MQ=255) cgggcTTGTTGCCCATAGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGG‑TATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCTGGTTGTCCAGCACTCGGTc < 6:228240/146‑1 (MQ=255) cgcgcTTGTTGCCCATAGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGG‑TATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTCCAGCACTCGGt < 6:122460/148‑1 (MQ=255) gcgcTTGTTGCCCATAGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGG‑TATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTCCAGCACTCGGTc > 1:158711/1‑148 (MQ=255) gttgCCCATAGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGG‑TATGGCGGATGGCGTTGTGcagcag > 6:141647/1‑124 (MQ=255) gttgCCCATAGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGG‑TATGGCGGATGGCGTTGTGcagcag < 5:141647/124‑1 (MQ=255) ttgCCCATAGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGG‑TATGGCGGATGGCGTtgt < 2:148981/116‑1 (MQ=255) ttgCCCATAGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGG‑TATGGCGGATGGCGTtgt > 1:148981/1‑116 (MQ=255) ttgCCCATAGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGG‑TATGGCGGATGGCGTtg > 1:124566/1‑115 (MQ=255) ttgCCCATAGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGG‑TATGGCGGATGGCGTtg < 2:124566/115‑1 (MQ=255) gCCCATAGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGG‑TATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTCCAGCACTCGGTCCAACTGGGc > 5:336257/1‑148 (MQ=255) ccATAGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGG‑TATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTCCAGCACTCGGTCCaa < 2:70240/140‑1 (MQ=255) ccATAGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGG‑TATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTCCAGCACTCGGTCCaa > 1:70240/1‑140 (MQ=255) aTAGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGG‑TATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTCCAGCACTCGGTCCAACTGGGCGACGt > 2:235320/1‑149 (MQ=255) aaTGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGG‑TATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTCCAGCACTCGGTCCAACTGGGCGACGTCGGCCt > 7:273415/1‑149 (MQ=255) cccTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGG‑TATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTCCAGCACTCGGTCCAACTGGGCGACGTCGGCCTGGAt < 2:158711/149‑1 (MQ=255) ccTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGG‑TATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTCCAGCACTCGGTCCAACTGGGCGACGTCGGCCTGGATa > 3:15336/1‑149 (MQ=255) ccTCTCCGTTGTCCTCGACGCCGATGATCACCCGTTCTGCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGG‑TATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTCCAGCACTCGGTCCAACTGGGCGACGTCGGCCTGGATa > 4:209135/1‑149 (MQ=255) ctctCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGG‑TATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTCCAGCACCCGGTCCAACTGGGCGACGTCGGCCTGGATAc > 2:34175/1‑149 (MQ=255) tcCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGG‑TATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTCCAGCACTCGGTCCAACTGGGCGACGTCGGCCTGGATAcgcg > 1:162423/1‑149 (MQ=255) ccGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGG‑TATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTCCAGCACTCGGTCCAACTGGGCGACGTCGGCCTGGATAcgcg < 4:15336/148‑1 (MQ=255) ccGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGG‑TATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTCCAGCACTCGGTCCAACTGGGCGACGTCGGCCTGGATACGCgg > 1:322150/1‑149 (MQ=255) cGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGG‑TATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTCCAGCACTCGGTCCAACTGGGCGACGTCGGCCTGGATAcgcg < 6:336257/147‑1 (MQ=255) tCCTCGACGCTGATGATCACCCGTGCTGCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGTATGCGCCCGCCGTTGGCGG‑TATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTCCAGCACTCGGTCCAACTGGGCGACGTCGGCCTGGATACGCGGTAgcgg < 8:197477/149‑1 (MQ=255) ccTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGATGGCGG‑TATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTCCAGCACTCGGTCCAACTGGGCGACGACGGCCTGCATACCCGGTAgcggc > 1:337085/1‑149 (MQ=255) tCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGG‑TATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTCCAGCACTCGGTCCAACTGGGCGACGTCGGCCTGGATACGCGGTAGcggcgg > 2:311339/1‑149 (MQ=255) gACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGG‑TATTGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTCCAGCACTCGGTCCAACTGGGCGACGTCGGCCTGGATACGCGGTAGcggcgg < 7:221213/147‑1 (MQ=255) gACGCCGATGATCACCCGTTCTGCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGG‑TATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTCCAGCACTCGGTCCAACTGGGCGACGTCGGCCTGGATACGCGGTAGcggcgg < 3:209135/147‑1 (MQ=255) atCACCCGTTCTGCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGG‑TTTGGCGGATGGCGTGGTGCAGCAGGTTGTCCAGCACTCGGTCCAACTGGGCGACGTCGGGCTGGATACGCTGTAGCGGCGGTTCCAGTTCCtt < 6:248416/149‑1 (MQ=255) tCACCCGTTCTGCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGG‑TATGTAGGATCGCGTTCTGCAGCAGGTTGTCCAGCACTCGGTCGAACTGGGCGACGTCGGCCTGGATACGCGGTAGCGGCGGGTGCCGTTACTTg > 5:219475/1‑149 (MQ=255) tCACCCGTTCTGCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGG‑TATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTCCAGCACTCGGTCCAACTGGGCGACGTCGGCCTGGATACGCGGTAGCGGCGGGTCCAGTTCCTTg < 2:162423/149‑1 (MQ=255) tCACCCGTTCTGCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGG‑TATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTCCAGCACTCGGTCCAACTGGGCGACGTCGGCCTGGATACGCGGTAGCGGCGGGTCCAGTTCCTTg < 7:274060/149‑1 (MQ=255) cACCCGTTCTGCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGG‑TATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTCCAGCACTCGGTCCAACTTGGCGACGTCGGCCTGGATACGCGGTAGCGGCGGGTCCAGTTCCTTGa > 3:182785/1‑149 (MQ=255) cACCCGTTCTGCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGG‑TATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTCCAGCACTCGGTCCAACTGGGCGACGTCGGCCTGGATACGCGGTAGCGGCGGGTCCAGTTCCTTg < 8:273415/148‑1 (MQ=255) aCCCGTTCTGCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGG‑TATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTCCAGCACTCGGTCCAACTGGGCGACGTCGGCCTGGATACGCGGTAGCGGCGGGTCCAGTTCCTTGa < 1:311339/148‑1 (MQ=255) cccGTTCTGCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGG‑TATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTCCAGCACTCg > 3:141769/1‑91 (MQ=255) cccGTTCTGCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGG‑TATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTCCAGCACTCg < 4:141769/91‑1 (MQ=255) cccGTTCTGCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGG‑TATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTCCAGCACTCGGTCCAACTCGGCGACGTCGGCCTGGATACGCGGTAGCGGCGGGTCCAGTTCCTTGATc < 4:182785/149‑1 (MQ=255) ccTGCATGCCAGACGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGG‑TATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTCCAGCACTCGGTCCAACTGGGCGACGTCGGCCTGGATACGCGGTAGCGGCGGGTCCAGTTCCTTGATCAACTc > 2:226775/2‑149 (MQ=255) cTGCATGCCAGACGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGG‑TATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTCCAGCACTCGGTCCAACTggg < 4:332025/96‑1 (MQ=255) cTGCATGCCAGACGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGG‑TATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTCCAGCACTCGGTCCAACTggg > 3:332025/1‑96 (MQ=255) gCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGG‑TATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTCCAGCACTCGGTCCAACTGGGCGACGTCGGCGTGGATACGCGGTAGCGGCGGGGCCAGTTCCTTGCTCAGCTCGAt > 7:294552/1‑149 (MQ=255) gCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGG‑TATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTCCAGCACTCGGTCCAACTGGGCGACGTCGGCCTGGATACGCGGTAGCGGCGGGt > 2:101156/1‑127 (MQ=255) gCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGG‑TATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTCCAGCACTCGGTCCAACTGGGCGACGTCGGCCTGGATACGCGGTAGCGGCGGGt < 1:101156/127‑1 (MQ=255) gCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGG‑TATGGCGGATGGCGTTGGGCAGCAGGTTGTCCAGCACTCGGTCCAACTGGGCGACGTCGGCCTGGATACGCGGTAGCGGCGGGTCCAGTTCCTTGATCAAc > 5:235461/1‑144 (MQ=255) gCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGG‑TATGGCGGATGGCGTTGCGCAGCAGGTTGTCCAGCACTCGGTCCAACTGGGCGACGTCGGCCTGGATACGCGGTAGCGGCGGGTCCAGTTCCTTGATCAAc < 6:235461/144‑1 (MQ=255) gCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGG‑TATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTCCAGCACTCGGTCCAACTGGGCGACGTCGGCCTGGATACGCGGTAGCGGCGGGTCCAGTTCCTTGATCAACTCGATCTGc > 1:249048/1‑149 (MQ=255) cGTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGG‑TATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTCCAGCACTCGGTCCAACTGGGCGACGTCGGCCTGGATACGCGGTAGCGGCGGGTCCAGTTCCTTGATCAACTCGATCTGCtt > 2:251125/1‑149 (MQ=255) | TTTCCTTGCACAGCGCGAGCCCCAGCCCAGCGCCGCCTTTCTTGCGACCTACCTGCACGAAAGGCTCGAAGATGCGCGCTTGTTGCCCATAGGAAATGCCCTCTCCGTTGTCCTCGACGCTGATGATCACCCGTTCTGCATGCCGTCTGGCATGCAGGCGGATGCGCCCGCCGTTGGCGG‑TATGGCGGATGGCGTTGTGCAGCAGGTTGTCCAGCACTCGGTCCAACTGGGCGACGTCGGCCTGGATACGCGGTAGCGGCGGGTCCAGTTCCTTGATCAACTCGATCTGCTT > NC_002947/138805‑139096 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |