Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 145,794 | T→C | 7.2% | V343A (GTG→GCG) | gltP → | glutamate/aspartate‑proton DAACS transporter |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 145,794 | 0 | T | C | 7.2% | 198.8 / 4.7 | 69 | V343A (GTG→GCG) | gltP | glutamate/aspartate‑proton DAACS transporter |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (35/29); new base C (3/2); total (38/31) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.64e-01 |
CGAAGTCGATCTGCTCGTTCGTGGTACCGACCGGCTATTCGTTCAACCTAGACGGTTCGACCCTGTACCAGAGCATCGCGGCGATCTTCATTGCCCAGTTGTACGGTATCGACCTGTCGTGGAGCCAGCAGCTGCTGCTGGTGCTGACCCTGATGGTCACTTCCAAAGGTATCGCGGGTGTGCCGGGCGTATCGTTCGTGGTACTGCTGGCCACCTTGGGCAGCGTGGGCATTCCGCTGGAAGGCCTGGCCTTCATCGCGGGCGTGGACCGCATCATGGACATGGCCCG > NC_002947/145653‑145941 | cGAAGTCGATCTGCTCGTTCGTGGTACCGACCGGCTATTCGTTCAACCTAGACGGTTCGACCCTGTACCAGAGCATCGCGGCGATCTTCATTGCCCAGTTGTACGGTATCGACCTGTCGTGGAGCCAGCAGCTGCTGCTGGTGCTGAcc > 2:42492/1‑149 (MQ=255) gTCGATCTGCTTGTTCGTGGTACCGACCGGCTATTCGTTCAACCTAGACGGTTCGACCCTGTACCAGAGCATCGCGGCGATCTTCATTGCCCAGTTGTACGGTATCGACCTGTCGTGGAGCCAGCAGCTGCTGCTGGTGCTGACCCTGa < 2:335051/149‑1 (MQ=255) cTCGTTCGTGGTACCGACCGGCTATTCGTTCAACCTAGACGGTTCGACCCTGTACCAGAGCATCGCGGCGATCTTCATTGCCCAGTTGTACGGTATCGACCTGTCGTGGAGCCAGCAGCTGCTGCTGGTGCTGACCCTGATGGTCAc < 5:241759/147‑1 (MQ=255) tcgttcgtGGTACCGACCGGCTATTCGTTCAACCTAGACGGTTCGACCCTGTACCAGAGCATCGCGGCGATCTTCATTGCCCAGTTGTACGGTATCGACCTGTCGTGGAGCAAGCAGCTGCTGCTGGTGCTGACCCTGATGGTCACtt > 3:102970/1‑148 (MQ=255) gttcgtGGTACCGACCGGCTATTCGTTCAACCTAGACGGTTCGCCCCAGTACCAGAGCATCGCGGCGCTCTTCATTGCCCAGTTGTACGGTATCGACCTGTCGTGGAGCCAGCAGCTGCTGCTGGTGCAGACCCTGATGGTCACTTcc > 3:250811/1‑148 (MQ=255) gtGGTACCGACCGGCTATTCGTTCAACCTAGACGGTTCGACCCTGTACCAGAGCATCGCGGCGATCTTCATTGCCCAGTTGTACGGTATCGACCTGTCGTGGAGCCAGCAGCTGCTGCTGGTGCTGACCCTGATGGTCACTTCCAAAg < 7:274087/148‑1 (MQ=255) ggTACCGACCGGCTATTCGTTCAACCTAGACGGTTCGACCCTGTACCAGAGCATCGCGGCGATCTTCATTGCCCAGTTGTACGGTATCGACCTGTCGTGGAGCCAGCAGCTGCTGCTGGTGCTGACCCTGATGGTCACTTCCAAAGGTa < 2:76951/149‑1 (MQ=255) cgaccgGCTATTCGTTCAACCTAGACGGTTCGACCCTGTACCAGAGCATCGCGGCGATCTTCATTGCCCAGTTGTACGGTATCGACCTGTCGTGGAGCCAGCAGCTGCTGCTGGTGCTGACCCTGATGGTCACTTCCAAAGGTATcgcg > 6:38337/1‑149 (MQ=255) gacccGCTATTCGTTCCACCTAGACGGTTCGACCCAGTACCAGAGCATCGCGGCGATCTTCATTGCCCAGTTGTACGGTATCGACCTGTCGTGGAGCCAGAAGCTGCTGCTGGTGCTGACCCTGATGGTCACTTCCAAAGGTATCGCgg < 4:42729/149‑1 (MQ=255) ccgGCTATTCGTTCAACCTAGACGGTTCGACCCTGTACCAGAGCATCGCGGCGATCTTCATTGCCCAGTTGTACGGTATCGACCTGTCGTGGAGCCAGCAGCTGCTGCTGGTGCTGACCCTGATGGTCACTTCCAAAGGTATCGCGGgt > 1:112515/1‑149 (MQ=255) cgGCTATTCGTTCAACCTAGACGGTTCGACCCTGTACCAGAGCATCGCGGCGATCTTCATTGCCCAGTTGTACGGTATCGACCTGTCGTGGAGCCAGCAGCTGCTGCTGGTGCTGACCCTGATGGTCACTTCCAAAGGTATCGCGGgtg > 3:201535/1‑149 (MQ=255) ggCTACTCGTTCAACCTAGACGGTTCGACACTCTACCATAGCATCGCTGCGATCTTCATTGACCAGTTCTACTGTATCGACCTGTCGTGGAGCCAGCAGCTGCTGCTGGTGCTTACCCTGATGGTCACTTCCAAAGGTATCTCGGgtgt < 4:223942/149‑1 (MQ=255) gCTATTCGTTCAACCTAGACGGTTCGACCCTGTACCAGAGCATCGCGGCGATCTTCATTGCCCAGTTGTACGGTATCGACCTGTCGTGGAGCCAGCAGCTGCTGCTGGTGCTGACCCTGATGGTCACTTCCAAAGGTATCGCGGGtgtg > 5:164206/1‑149 (MQ=255) cTATTCGTTCAACCTAGACGGTTCGACCCTGTACCAGAGCATCGCGGCGATCTTCATTGCCCAGTTGTACGGTATCGACCTGTCGTGGAGCCAGCAGCTGCTGCTGGTGCTGACCCTGATGGTCACTTc < 6:301652/129‑1 (MQ=255) cTATTCGTTCAACCTAGACGGTTCGACCCTGTACCAGAGCATCGCGGCGATCTTCATTGCCCAGTTGTACGGTATCGACCTGTCGTGGAGCCAGCAGCTGCTGCTGGTGCTGACCCTGATGGTCACTTc > 5:301652/1‑129 (MQ=255) ttCGTTCAACCTAGACGGTTCGACCCTGTACCAGAGCATCGCGGCGATCTTCATTGCCCAGTTGTACGGTATCGACCTGTCGTGGAGCCAGCAGCTGCTGCTGGTGCTGACCCTGATGGTCACTTCCAAAGGTATCGCGGGTGTGCCgg < 2:181145/149‑1 (MQ=255) ttCAACCTAGACGGTTCGACCCTGTACCAGAGCATCGCGGCGATCTTCATTGCCCAGTTGTACGGTATCGACCTGTCTTGGAGCCAGCAGCTGCTGCTGGTGCTGACCCTGa < 1:269409/112‑1 (MQ=255) ttCAACCTAGACGGTTCGACCCTGTACCAGAGCATCGCGGCGATCTTCATTGCCCAGTTGTACGGTATCGACCAGTCGTGGAGCCAGCAGCTGCTGATGGTGCTGACCCTGATGGTCACTTCCAAAGGTATCGCGGGTGTGCCGGGCg > 1:135358/1‑148 (MQ=255) aCCTAGACGGTTCGACCCTGTACCAGAGCATCGCGGCGATCTTCATTGCCCAGTTGTACGGTATCGACCTGTCGTGGAGCCAGCAGCTGCTGCTGGTGCTGACCCTGATGGTCACTTCCAAAGGTATCGCGGGTGTGCCGGGCGTAtcg > 5:274143/1‑149 (MQ=255) ccTAGACGGTTCGACCCTGTACCAGAGCATCGCGGCGATCTTCATTGCCCAGTTGTACGGTATCGACCTGTCGTGGAGCCAGCAGCTGCTGCTGGTGCTGACCCTGATGGTCACTTCCAAAGGTATCGCGGGTGTGCCGGGCGTAtcgt > 6:71690/1‑149 (MQ=255) aCGGTTCGACCCTGTACCAGAGCATCGCGGCGATCTTCATTGCCCAGTTGTACGGTATCGACCTGTCGTGGAGCCAGCAGCTGCTGCTGGTGCTGACCCTGATGGTCACTTCCAAAGGTATCGCGGGTGTGCCGGGCGTATCGTTCGTg < 5:71690/149‑1 (MQ=255) ggTTCGACCCTGTACCAGAGCATCGCGGCGATCTTCATTGCCCAGTTGTACGGTATCGACCTGTCGTGGAGCCAGCAGCTGCTGCTGGTGCTGACCCTGATGGTCACTTCCAAAGGTATCGCGGGTGTGCCGGGCGTATCGTTCGTgg > 6:11932/1‑148 (MQ=255) gACCCTGTACCAGAGCATCGCGGCGATCTTCATTGCCCAGTTGTACGGTATCGACCTGTCGTGGAGCCAGCAGCTGCTGCTGGTGCTGACCCTGATGGTCACTTCCAAAGGTATCGCGGGTGTGCCGGGCGTATCGTTCGTgg > 7:163426/1‑143 (MQ=255) gACCCTGTACCAGAGCATCGCGGCGATCTTCATTGCCCAGTTGTACGGTATCGACCTGTCGTGGAGCCAGCAGCTGCTGCTGGTGCTGACCCTGATGGTCACTTCCAAAGGTATCGCGGGTGTGCCGGGCGTATCGTTCGTgg < 8:163426/143‑1 (MQ=255) gACCCTGTACCAGAGCATCGCGGCGATCTTCATTGCCCAGTTGTACGGTATCGACCTGTCGTGGAGCCAGCAGCTGCTGCTGGTGCTGACCCTGATGGTCACTTCCAAAGGTATCGAGGGTGTGCCGGGCGTAt > 2:93400/1‑134 (MQ=255) gACCCTGTACCAGAGCATCGCGGCGATCTTCATTGCCCAGTTGTACGGTATCGACCTGTCGTGGAGCCAGCAGCTACTGCTGGTGCTGACCCTGATGGTCACTTCCAAAGGTATCGCGGGTGTGCCGGGCGTATCGTTCGTGGTActgc > 4:238917/1‑149 (MQ=255) cccTGTACCAGAGCATCGCGGCGATCTTCATTGCCCAGTTGTACGGTATCGACCTGTCGTGGAGCCAGCAGCTGCTGCTGGTGCTGACCCTGATGGTCACTTCCAAAGGTATCGCGGGAGTGCCGGGCGTATCGTTCGTGGTActgctg > 4:132679/1‑149 (MQ=255) ccTGTACCAGAGCATCGCGGCGATCTTCATTGCCCAGTTGTACGGTATCGACCTGTCGTGGAGCCAGCAGCTGCTGCTGGTGCTGACCCTGATGGTCACTTCCAAAGGTATCGCGGGTGTGCCGGGCGTATCGTTCGTGGTACTGCTgg > 6:276137/1‑149 (MQ=255) tGTACCAGAGCATCGCGGCGATCTTCATTGCCCAGTTGTACGGTATCGACCTGTCGTGGAGCCAGCAGCTGCTGCTGGTGCTGACCCTGATGGTCACTTCCAAAGGTATCGCGGGTGTGCCGGGCGTATCGTTCGTGGTActgctg < 8:183341/146‑1 (MQ=255) tGTACCAGAGCATCGCGGCGATCTTCATTGCCCAGTTGTACGGTATCGACCTGTCGTGGAGCCAGCAGCTGCTGCTGGTGCTGACCCTGATGGTCACTTCCAAAGGTATCGCGGGTGTGCCGGGCGTATCGTTCGTGGTActgctg > 7:183341/1‑146 (MQ=255) cAGAGCATCGCGGCGATCTTCATTGCCCAGTTGTACGGTATCGACCTGTCGTGGAGCCAGCAGCTGCTGCTGGTGCTGACCCTGATGGTCACTTCCAAAGGTATCGCGGGTGTGCCGGGCGTATCGTTCGTGGTACTGCTGGCCACCtt > 4:323948/1‑149 (MQ=255) agagCATCGCGGCGATCTTCATTGCCCAGTTGTACGGTATCGACCTGTCGTGGAGCCAGCAGCTGCTGCTGGCGCTGACCCTGATGGTCACTTCCAAAGGTATCGCGGGTGTGCCggg < 5:231074/118‑1 (MQ=255) agagCATCGCGGCGATCTTCATTGCCCAGTTGTACGGTATCGACCTGTCGTGGAGCCAGCAGCTGCTGCTGGCGCTGACCCTGATGGTCACTTCCAAAGGTATCGCGGGTGTGCCggg > 4:265991/1‑118 (MQ=255) agagCATCGCGGCGATCTTCATTGCCCAGTTGTACGGTATCGACCTGTCGTGGAGCCAGCAGCTGCTGCTGGCGCTGACCCTGATGGTCACTTCCAAAGGTATCGCGGGTGTGCCggg > 6:231074/1‑118 (MQ=255) agagCATCGCGGCGATCTTCATTGCCCAGTTGTACGGTATCGACCTGTCGTGGAGCCAGCAGCTGCTGCTGGCGCTGACCCTGATGGTCACTTCCAAAGGTATCGCGGGTGTGCCggg < 3:265991/118‑1 (MQ=255) agagCATCGCGGCGATCTTCATTGCCCAGTTGTACGGTATCGACCTGTCGTGGAGCCAGCAGCTGCTGCTGGCGATGACCCTGATGGTCACTTCCAAAGGTATCGCGGGTGTGCCggg > 4:261429/1‑118 (MQ=255) cATCGCGGCGATCTTCATTGCCCAGTTGTACGGTATCGACCTGTCGTGGAGCCAGAAGCTGCTGCTGGTGCTGACCCTGATGGTCACTTCCAAAGGTATCGCGGGTGTGCCTGGCGTATCGTTCGTGGTACTGCTGGCCACCTTggg > 8:311216/1‑147 (MQ=255) tCGCGGCGATCTTCATTGCCCAGTTGTACGGTATCGACCTGTCGTGGAGCCAGCAGCTGCTGCTGGTGCTGACCCTGATGGTCACTTCCAAAGGTATCGCGGGTGTGCCGGGCGTATCGTTCGTGGTACTGCTGGCCACCTTg < 3:148188/143‑1 (MQ=255) tCGCGGCGATCTTCATTGCCCAGTTGTACGGTATCGACCTGTCGTGGAGCCAGCAGCTGCTGCTGGTGCTGACCCTGATGGTCACTTCCAAAGGTATCGCGGGTGTGCCGGGCGTATCGTTCGTGGTACTGCTGGCCACCTTg > 4:148188/1‑143 (MQ=255) ggcgATCTTCATTGCCCAGTTGTACGGTATCGACCTGTCGTGGAGCCAGCAGCTGCTGCTGGTg < 8:298722/64‑1 (MQ=255) ggcgATCTTCATTGCCCAGTTGTACGGTATCGACCTGTCGTGGAGCCAGCAGCTGCTGCTGGTg > 7:298722/1‑64 (MQ=255) ggcgATCTTCATTGCCCAGTTGTACGGTATCGACCTGTCGTGGAGCCAGCAGCTGCTGCTGGTGCTGACCCTGATGGTCACTTCCAAAGGTATCGCGGGTGTGCCGGGCGTATCGTTCGTGGTACTGCTGGCCACCTTGGGCAGCGTgg < 3:132679/149‑1 (MQ=255) cTTCATTGCCCAGTTGTACGGTATCGACCTGTCGTGGAGCCAGCAGCTGCTGCTGGTGCTGACCCTGATGGTCACTTCCAAAGGTATCGCGGGTGTGCCGGGCGTATCGTTCGTGGTACTGCTGGCCACCTTGGGCAGCGTGGGCATTc > 3:142075/1‑149 (MQ=255) cTTCATTGCCCAGTTGTACGGTATCGACCTGTCGTGGAGCCAGCAGCTGCTGCTGGTGCTGACCCTGATGGTCACTTCCAAAGGTATCGCGGGTGTGCCGGGCGTATCGTTCGTGGTACTGCTGGCCACCTTGGGCAGCGTGGGCATTc > 1:52215/1‑149 (MQ=255) cATTGCCCAGTTGTACGGTATCGACCTGTCGTGGAGCGAGCAGCTGCTGCTGGTGCTGACCCTGATgg < 8:88871/68‑1 (MQ=255) cATTGCCCAGTTGTACGGTATCGACCTGTCGTGGAGCCAGCAGCTGCTGCTGGTGCTGACCCTGATgg > 7:88871/1‑68 (MQ=255) aTTGCCCAGTTGTACGGTATCGACCTGTCGTGGAGCCAGCAGCTGCTGCTGGTGCTGACCCTGATGGTCACTTCCAAAGGTATCGCGGGTGTGCCGGGCGTATCGTTCGTGGTACTGCTGGCCACCTTGGGCAGCGTGGGCATTCCGc < 6:274143/148‑1 (MQ=255) tGCCCAGTTGTACGGTATCGACCTGTCGTGGAGCCAGCAGCTGCTGCTGGTGCTGACCCTGATGGTCACTTCCAAAGGTATCGCGGGTGTGTCGGGCGTATCGTTCGTGGTACTGCTGGCCACCTTGGGCAGCGTGGGc < 1:248816/139‑1 (MQ=255) tGCCCAGTTGTACGGTATCGACCTGTCGTGGAGCCAGCAGCTGCTGCTGGTGCTGACCCTGATGGTCACTTCCAAAGGTATCGCGGGTGTGCCGGGCGTATCGTTCGTGGTACTGCTGGCCACCTTGGGCAGCGTGGGc > 2:248816/1‑139 (MQ=255) aGTTGTACGGTATCGACCTATCGTGGAGCCAGCAGCTGCTGCTGGTGCTGACCCTGATGGTCACTTCCAAAGGTATCGCGGGTGTGCCGGGCGTATCGTTCGTGGTACTGCTGGCCACCTTGGGCAGCGTGGGCATTCCGCTGGAAggc > 8:53573/1‑149 (MQ=255) ttGTACGGTATCGACCTGTCGTGGAGCCTGCAGCTGCTGCTGGTGCTGACCCTGATGGTCACTTCCAAAGGTATCGCGGGTGTGCCGGGCGTATCGTTCGTGGTACTGCTGGCCACCTTGGGCAGCGTGGGCATTCCGCTGGAAggcct > 1:192770/1‑149 (MQ=255) ttGTACGGTATCGACCTGTCGTGGAGCCAGCAGCTGCTGCTGGTGCTGACCCTGATGGTCACTTCCAAAGGTATCGCGGGTGTGCCGGGCGTATCGTTCGTGGTACTGCTGGCCACCTTGGGCAGCGTGGGCATTCCGCTGGAAggcct < 2:112515/149‑1 (MQ=255) tACGGTATCGACCTGTCGTGGAGCCAGCAGCTGCTGCTGGTGCTGACCCTGATGGTCACTTCCAAAGGTATCGCGGGTGTGCCGGGCGTATCGTTCGTGGTACTGCTGGCCACCTTGGGCAGCGTGGGCATTCCTCTGGAAggcctggc < 4:142075/149‑1 (MQ=255) tACGGTATCGACCTGTCGTGGAGCCAGCAGCTGCTGCTGGTGCTGACCCTGATGGTCACTTCCAAAGGTATCGCGGGTGTGCCGGGCGTATCGTTCGTGGTACTGCTGGCCACCTTGGGCAGCGTGGGCATTCCGCTGGAAggcctggc < 2:52215/149‑1 (MQ=255) tATCGACCTGTCGTGGAGCCAGCAGCTGCTGCTGGTGCTGACCCTGATGGTCACTTCCAAAGGTATCGCGGGTGTGCCGGGCGTATCGTTCGTGGTACTGCTGGCCACCTTGGGCAGCGTGGGCATTCCGCTGGAAGGCCTGGCCTTc > 6:126058/1‑148 (MQ=255) tCGACCTGTCGTGGAGCCAGCAGCTACTGCTGGTGCTGACCCTGATGGTCACTTCCAAAGGTATCGCGGGTGTGCCGGGCGTATCGTTCGTGGTACTGCTGGCCACCTTGGGCAGCGTGGGCATTCCGCTGGAAGGCCTGGCCTTCATc < 3:238917/149‑1 (MQ=255) ccTGTCGTGGAGCCAGGAGCTGCTGCTGGTGCTGACCCTGATGGTCACTTCCAAAGGTATCGCGGGTGTGCCGGGCGTATCGTTCGTGGTACTGCTGGCCACCTTGGGCAGCGTGGGCATTCCGCTGGAAGGCCTGGCCTTCATCGCgg < 5:276137/149‑1 (MQ=255) tGTCGTGGAGCCAGCAGCTGCTGCTGGTGCTGACCCTGATGGTCACTTCCAAAGGTATCGCGGGTGTGCCGGGCGTATCGTTCGTGGTACTGCTGGCCACCTTGGGCAGCGTGGGCATTCCGCTGGAAGGCCTGGCCTTCATCGCGGGc > 1:247029/1‑149 (MQ=255) tCGTGGAGCCAGCAGCTGCTGCTGGTGCTGACCCTGATGGTCACTTCCAAAGGTATCGCGGGTGTGCCGGGCGTATCGTTCGTGGTACTGCTGGCCACCTTGGGCAGCGTGGGCATTCCGCTGGAAGGCCTGGCCTTCATCGCGGGCGt > 8:64339/1‑149 (MQ=255) gTGGAGCCAGCAGCTGCTGCTGGTGCTGACCCTGATGGTCACTTCCATCGGTATCGCGGGTGTGCCGGGCGTATCGTTCGTGGTACTGCTGGCCACCTTGGGCAGCGTGGGCATTCCGCTGGAAGGCCTGGCCTTCATCGCGGGCGTgg < 4:102970/149‑1 (MQ=255) gTGGAGCCAGCAGCTGCTGCTGGTGCTGACCCTGATGGTCACTTCCAAAGGTATCGCGGGTGTGCCGGGCGTATCGTTCGTGGTACTGCTGGCCACCTTGGGCAGCGTGGGCATTCCGCTGGAAGGCCTGGCCTTCATCGCGGGCGTg > 8:292423/1‑148 (MQ=255) gAGCCAGCAGCTGCTGCTGGTGCTGACCCTGATGGTCACTTCCAAAGGTATCGCGGGTGTGCCGGGCGTATCGTTCGTGGTACTGCTGGCCACCTTGGGCAGCGTGGGCATTCCGCTGGaa < 3:120953/121‑1 (MQ=255) gAGCCAGCAGCTGCTGCTGGTGCTGACCCTGATGGTCACTTCCAAAGGTATCGCGGGTGTGCCGGGCGTATCGTTCGTGGTACTGCTGGCCACCTTGGGCAGCGTGGGCATTCCGCTGGaa > 4:120953/1‑121 (MQ=255) accAGCAGCAGCTGCTGGTGCTGACCCTGATGGTCACTTCCAAAGGTATCGCGGGTGTGCCGGGCGTATCGTTCGTGGTACTGCTGGCCACCTTGGGCAGCGTGGGCATTCCGCTGGAAGGCCTGGCCTTCATCGCGGGCGTGGACCg > 6:170190/2‑148 (MQ=255) ctgctgGTGCTGACCCTGATGGTCACTTCCAAAGGTATCGCGGGTGTGCCGGGCGTATCGTTCGTGGTACTGCTGGCCACCTTGGGCAGCGTGGGCATTCCGCTGGAAGGCCTGGCCTTCATCGCGGGCGTGGACCGCATCATGGACa < 3:323948/148‑1 (MQ=255) ctgGTGCTGACCCTGATGGTCACTTCCAAAGGTATCGCGGGTGTGCCGGGCGTATCGTTCGTGGTACTGCTGGCCACCTTGGGCAGCGTGGGCATTCCGCTGGAAGGCCTGGCCTTCATCGCGGGCGTGGACCGCATCATGGCCATgg < 7:311216/148‑1 (MQ=255) ctgGTGCTGACCCTGATGGTCACTTCCAAAGGTATCGCGGGTGTGCCGGGCGTATCGTTCGTGGTACTGCTGGCCACCTTGGGCAGCGTGGGCATTCCGCTGGAAGGCCTGGCCTTCATCGCGGGCGTGGACCGCATCATGGACATGGc < 2:192770/149‑1 (MQ=255) gTGCTGACCCTGATGGTCACTTCCAAAGGTATCGCGGGTGTGCCGGGCGTATCGTTCGTGGTACTGCTGGCCACCTTGGGCAGCGTGGGCATTCCGCTGGAAGGCCTGGCCTTCATCGCGGGCGTGGACCGCATCATGGACATGGCCCg < 5:11932/149‑1 (MQ=255) gTGCTGACCCTGATGGTCACTTCCAAAGGTATCGCGGGTGTGCCGGGCGTATCGTTCGTGGTACTGCTGGCCACCTTGGGCAGCGTGGGCATTCCGCTGGAAGGCCTGGCCTTCATCGCGGGCGTGGACCGCATCATGGACATGGCCCg > 7:119155/1‑149 (MQ=255) tGCTGACCCTGATGGTCACTTCCAAAGGTATCGCGGGTGTGCCGGGCGTATCGTTCGTGGTACTGCTGGCCACCTTGGGCAGCGTGGGCATTCCGCTGGAAggcctgg < 3:143068/108‑1 (MQ=255) tGCTGACCCTGATGGTCACTTCCAAAGGTATCGCGGGTGTGCCGGGCGTATCGTTCGTGGTACTGCTGGCCACCTTGGGCAGCGTGGGCATTCCGCTGGAAggcctgg > 4:143068/1‑108 (MQ=255) | CGAAGTCGATCTGCTCGTTCGTGGTACCGACCGGCTATTCGTTCAACCTAGACGGTTCGACCCTGTACCAGAGCATCGCGGCGATCTTCATTGCCCAGTTGTACGGTATCGACCTGTCGTGGAGCCAGCAGCTGCTGCTGGTGCTGACCCTGATGGTCACTTCCAAAGGTATCGCGGGTGTGCCGGGCGTATCGTTCGTGGTACTGCTGGCCACCTTGGGCAGCGTGGGCATTCCGCTGGAAGGCCTGGCCTTCATCGCGGGCGTGGACCGCATCATGGACATGGCCCG > NC_002947/145653‑145941 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |