| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,190,660 | A→C | 5.7% | Q61P (CAG→CCG) | xcpX → | type II secretion system protein K |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,190,660 | 0 | A | C | 5.7% | 210.0 / 2.2 | 66 | Q61P (CAG→CCG) | xcpX | type II secretion system protein K |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (34/28); new base C (2/2); total (36/30) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.96e-01 | |||||||||||
TGGTGATGGTGGTGCTGGCAATGCTGGCGGCGGGCATGGCCTGGCTGGTGGAAGATGGCCGGCGTCAGGTCGACGAAGTGCGCCTGCTGCACCAGCGAGTGCAGGTGCGGGCCATGGAGCAGGCCGGCCTGGCCTATGCCGGGCAGGCCCTGCGTGACCCCGCCTGGCGGCTCAGTCCGCTGTTCTGGCAAGCCTTGCGCGGGCAGCCGCTGAACTACGACTTTGGCGCTGGCCAGGCGCAGTTGCGGGTACGCGACCAGCACACCTGCTTCAACGTCAATGCATTG > NC_002947/1190516‑1190802 | tggtgatggtgGTGCTGGCAATGCTGGCGGCGGGCATGGCCTGGCTGGTGGAAGATGGCCGGCGTCAGGTCGACGAAGTGCGCCTGCTGCACCAGCGAGTGCAGGTGCGGGCCATGGAGCAGGCCTGCCCGGCATAGGCCAggccggcc < 7:191858/149‑1 (MQ=255)tggtgatggtgGTGCTGGCAATGCTGGCGGCGGGCATGGCCTGGCTGGTGGAAGATGGCCGGCGTCAGGTCGACGAAGTGCGCCTGCTGCACCAGCGAGTGCAGGTGCGGGCCATGGAGCAGGCCGGCCTGGCCTATGCCGGGCAGGcc < 5:309654/149‑1 (MQ=255) tgatggtgGTGCTGGCAATGCTGGCGGCGGGCATGGCCTGGCTGGTGGAAGATGGCCGGCGTCAGGTCGACGAAGTGCGCCTGCTGCACCAGCGAGTGCAGGTGCGGGCCATGGAGCAGGCCGGCCTGGCCTATGCCGGGCAGGCCCTg > 7:155137/1‑149 (MQ=255) gCTGGCAATGCTGGCGGCGGGCATGGCCTGGCTGGTGGAAGATGGCCGGCGTCAGGTCGACGAAGTGCGCCTGCTGCACCAGCGAGTGCAGGTGCGGGCCATGGAGCAGGCCGGCCTGGCCTATGCCGGGCAGGCCCTGCGTGACCCCg > 1:189760/1‑149 (MQ=255) gCAATGCTGGCGGCGGGCATGGCCTGGCTGGTGGGAGATGGCCGGCGTCAGGTCGACGAAGTGCGCCTGCTGCACCAGCGAGTGCAGGTGCGGGCCATGGAGCAGGCCGGCCTGGCCTATGCCGGGCAGGCCCTGCGTGACCCCGCCt < 7:16199/148‑1 (MQ=255) aaTGCTGGCGGCGGGCATGGCCTGGCTGGTGGAAGATGGCCGGCGTCAGGTCGACGAAGTGCGCCTGCTGCACCAGCGAGTGCAGGTGCGGGCCATGGAGCAGGCCGGCCTGGCCTATGCCGGGCAGGCCCTGCGTGACCCCGCCTggc > 1:321152/1‑149 (MQ=255) tGCTGGCGGCGGGCATGGCCTGGCTGGTGGAAGATGGCCGGCGTCAGGTCGACGAAGTGCGCCTGCTGCACCAGCGAGTGCAGGTGCGGGCCATGGAGCAGGCCGGCCTGGCCTATGCCGGGCAGGCCCTGCGTGACCCCGCCTggcgg < 2:321152/149‑1 (MQ=255) tGCTGGCGGCGGGCATGGCCTGGCTGGTGGAAGATGGCCGGCGTCAGGTCGACGAAGTGCGCCTGCTGCACCAGCGAGTGCAGGTGCGGGCCATGGAGCAGGCCGGCCTGGCCTATGCCGGGCAGGCCCTGCGTGACCCCGCCTggcgg < 2:175893/149‑1 (MQ=255) tGGCGGCGGGCATGGCCTGGCTGGTGGAAGATGGCCGGCGTCAGGTCGACGAAGTGCGCCTGCTGCACCAGCGAGTGCAGGTGCGGGCCATGGAGCAGGCCGGCCTGGCCTATGCCGGGCAGGCCCTGCGTGACCCCGCCTGGCGGCt > 2:331478/1‑148 (MQ=255) gggCATGGCCTGGCTGGTGGAAGATGGCCGGCGTCAGGTCGACGAAGTGCGCCTGCTGCACCAGCGAGTGCAGGTGCGGGCCATGGAGCAGGCCGGCCTGGCCTATGCCGGGCAGGCCCTGCGTGACCCCGCCTGGCGGCTCAGTCCGc > 6:117610/1‑149 (MQ=255) ggCATGGCCTGGCTGGTGGAAGATGGCCGGCGTCAGGTCGACGAAGTGCGCCTGCTGCACCAGCGAGTGCAGGTGCGGGCCATGGAGCAGGCCGGCCTGGCCTATGCCGGGCAGGCCCTGCGTGACCCCGCCTGGCGGCTCAGTCCGCt < 3:17156/149‑1 (MQ=255) ggCATGGCCTGGCTGGTGGAAGATGGCCGGCGTCAGGTCGACGAAGTGCGCCTGCTGCACCAGCGAGTGCAGGTGCGGGCCATGGAGCAGGCCGGCCTGGCCTATGCCGGGCAGGCCCTGCGTGACCCCGCCTGGCGGCTCAGTCCGCt < 8:155137/149‑1 (MQ=255) ggCCTGGCTGGTGGAAGATGGCCGGCGTCAGGTCGACGAAGTGCGCCTGCTGCACCAGCGAGTGCAGGTGCGGGCCATGGAGCAGGCCGGCCTGGCCTATGCCGGGCAGGCCCTGCGTGACCCCGCCTggc > 3:249804/1‑131 (MQ=255) ggCCTGGCTGGTGGAAGATGGCCGGCGTCAGGTCGACGAAGTGCGCCTGCTGCACCAGCGAGTGCAGGTGCGGGCCATGGAGCAGGCCGGCCTGGCCTATGCCGGGCAGGCCCTGCGTGACCCCGCCTggc < 4:249804/131‑1 (MQ=255) ggCCTGGCTGGTGGAAGATGGCCGGCGTCAGGTCGACGAAGTGCGCCTGCTGCACCAGCGAGTGCAGGTGCGGGCCATGGAGCAGGCCGGCCTGGCCTATGCCGGGCAGGCCCTGCGTGACCCCGCCTGGCGGCTCAGTCCGCTGTTCt > 7:311169/1‑149 (MQ=255) gtggAAGATGGCCGGCGTCAGGTCGACGAAGTGCGCCTGCTGCACCAGCGAGTGCAGGTGCGGGCCATGGAGCAGGCCGGCCTGGCCTATGCCGGGCAGGCCCTGCGTGACCCCGCCTGGCGGCTCAGTCCGCTGTTCTGGCAAGCCtt > 1:157195/1‑149 (MQ=255) ggAAGATGGCCGGCGTCAGGTCGACGAAGTGCGCCTGCTGCACCAGCGAGTGCAGGTGCGGGCCATGGAGCAGGCCGGCCTGGCCTATGCCGGGCAGGCCCTGCGTGACCCCGCCTGGCGGCTc > 2:158777/1‑124 (MQ=255) ggAAGATGGCCGGCGTCAGGTCGACGAAGTGCGCCTGCTGCACCAGCGAGTGCAGGTGCGGGCCATGGAGCAGGCCGGCCTGGCCTATGCCGGGCAGGCCCTGCGTGACCCCGCCTGGCGGCTc < 1:158777/124‑1 (MQ=255) gAAGATGGCCGGCGTCAGGTCGACGAAGTGCGCCTGCTGCACCAGCGAGTGCAGGTGCGGGCCATGGAGCAGGCCGGCCTGGCCTATGCCGGGCAGGCCCTGCGTGACCCCGCCTGGCGGCTCAGTCCGCTGTTCTGGCAAGCCtt < 2:329308/146‑1 (MQ=255) gAAGATGGCCGGCGTCAGGTCGACGAAGTGCGCCTGCTGCACCAGCGAGTGCAGGTGCGGGCCATGGAGCAGGCCGGCCTGGCCTATGCCGGGCAGGCCCTGCGTGACCCCGCCTGGCGGCTCAGTCCGCTGTTCTGGCAAGCCtt > 1:329308/1‑146 (MQ=255) tccatggcccgcacctgcactcgctggtgcagcaggcgcacttcgtcgacctgacgccggccatGGAGCAGGCCGGCCTGGCCTATGCCGGGCAGGCCCTGCGTGACCCCGCCTGGCGGCTCAGTCCGCTGTTCTGGCAAGCCTTgcgc > 5:139420‑M2/65‑149 (MQ=255) gATGGCCGGCGTCAGGTCGACGAAGTGCGCCTGCTGCACCAGCGAGTGCAGGTGCGGGCCATGGAGCAGGCCGGCCTGGCCTATGCCGGGCAGGCCCTGCGTGACCCCGCCTGGCGGCTCAGTCCGCTGTTCTGGCAAGCCTTGCGCgg > 5:100123/1‑149 (MQ=255) gATGGCCGGCGTCAGGTCGACGAAGTGCGCCTGCTGCACCAGCGAGTGCAGGTGCGGGCCATGGAGCAGGCCGGCCTGGCCTATGCCGGGCAGGCCCTGCGTGACCCCGCCTGGCGGCTCAGTCCGCTGTTCTGGCAAGCCTTGCGCgg < 6:159359/149‑1 (MQ=255) catggcccgcacctgcactcgctggtgcagcaggcgcacttcgtcgacctgacgccggccatGGAGCAGGCCGGCCTGGCCTATGCCGGGCAGGCCCTGCGTGACCCCGCCTGGCGGCTCAGTCCGCTGTTCTg > 3:280100‑M2/63‑134 (MQ=255) catggcccgcacctgcactcgctggtgcagcaggcgcacttcgtcgacctgacgccggccatGGAGCAGGCCGGCCTGGCCTATGCCGGGCAGGCCCTGCGTGACCCCGCCTGGCGGCTCAGTCCGCTGTTCTg < 4:280100‑M2/72‑1 (MQ=255) gTCGACGAAGTGCGCCTGCTGCACCAGCGAGTGCAGGTGCGGGCCATGGAGCAGGCCGGCCTGGCCTATGCCGGGCAGGCCCTGCGTGACCCCGCCTGGCGGCTCAGTCCGCTGTTCTGGCAAGCCTTGCGCGGGCAGCCGCTGAACTa < 2:189760/149‑1 (MQ=255) gTCGACGAAGTGCGCCTGCTGCACCAGCGAGTGCAGGTGCGGGCCATGGAGCAGGCCGGCCTGGCCTATGCAGGGCCTGCCCGGcatag > 5:156871/1‑85 (MQ=255) gTCGACGAAGTGCGCCTGCTGCACCAGCGAGTGCAGGTGCGGGCCATGGAGCAGGCCGGCCTGGCCTATGCAGGGCCTGCCCGGcatag < 6:156871/89‑5 (MQ=255) gacgaAGTGCGCCTGCTGCACCAGCGAGTGCAGGTGCGGGCCATGGAGCAGGCCGGCCTGGCCTATGCCGGGCAGGCCCTGCGTGACCCCGCCTGGCGGCTCAGTCCGCTGTTCTGGCAAGCCTTGCGCGGGCAGCCGCTGAACTACGa > 7:131506/1‑149 (MQ=255) gaAGTGCGCCTGCTGCACCAGCGAGTGCAGGTGCGGGCCATGGAGCAGGCCGGCCTGGCCTATGCCGGGCAGGCCCTGCGTGACCCCGCCTGGCGGCTCAGTCCGCTGTTCTGGCAAGCCTTGCGCGGGCAGCCGCTGAACTACGACtt > 5:280555/1‑149 (MQ=255) aaGTGCGCCTGCTGCACCAGCGAGTGCAGGTGCGGGCCATGGAGCAGGCCGGCCTGGCCTATGCCGGGCAGGCCCTGCGTGACCCCGCCTGGCGGCTCAGTCCGCTGTTCTGGCAAGCCTTGCGCGGGCAGCCGCTGAACTACGACttt < 1:331478/149‑1 (MQ=255) tGCGCCTGCTGCACCAGCGAGTGCAGGTGCGGGCCATGGAGCAGGCCGGCCTGGCCTATGCCGGGCAGGCCCTGCGTGACCCCGCCTGGCGGCTCAGTCCGCTGTTCTGGCAAGCCTTGCGCGGGCAGCCGCTGAACTACGACTTTGgc < 1:239130/149‑1 (MQ=255) tGCGCCTGCTGCACCAGCGAGTGCAGGTGCGGGCCATGGAGCAGGCCGGCCTGGCCTATGCCGGGCAGGCCCTGCGTGACCCCGCCTGGCGGCTCAGTCCGCTGTTCTGGCAAGCCTTGCGCGGGCAGCCGCTGAACTACGACTTTGgc < 5:117610/149‑1 (MQ=255) ccTGCTGCACCAGCGAGTGCAGGTGCGGGCCATGGAGCAGGCCGGCCTGGCCTATGCCGGGCAGGCCCTGCGTGACCCCGCCTGGCGGCTCAGTCCGCTGTTCTGGCAAGCCTTGCGCGGGCAGCCGCTGAACTACGACTTTGGCGCTg < 6:280555/149‑1 (MQ=255) ctgctgCACCAGCGAGTGCAGGTGCGGGCCATGGAGCAGGCCGGCCTGGCCTATGCCGGGCAgg > 4:26799/1‑64 (MQ=255) ctgctgCACCAGCGAGTGCAGGTGCGGGCCATGGAGCAGGCCGGCCTGGCCTATGCCGGGCAgg < 3:26799/64‑1 (MQ=255) tgcACCAGCGAGTGCAGGTGCGGGCCATGGAGCAGGCCGGCCTGGCCTATGCCGGGCAGGCCCTGCGTGa < 1:225183/70‑1 (MQ=255) tgcACCAGCGAGTGCAGGTGCGGGCCATGGAGCAGGCCGGCCTGGCCTATGCCGGGCAGGCCCTGCGTGa > 2:225183/1‑70 (MQ=255) aCCAGCGAGTGCAGGTGCGGGCCATGGAGCAGGCCGGCCTGGCCTATGCCGGGCAGGCCCTGCGTGACCCCGCCTGGCGGCGCAGTCCGCTGTTCTGGCAAGCCTTGCGCGGGCAGCCGCTGAACTACGACTTTGGCGCTGGCCAGgcg > 4:195097/1‑149 (MQ=255) gCGAGTGCAGGTGCGGGCCATGGAGCAGGCCGGCCTGGCCTATGCCGGGCAGGCCCTGCGTGACCCCGCCTGGCGGCTCAGTCCGCTGTTCTGGCAAGCCTTGCGCGGGCAGCCGCTGAACTACGACTTTGGCGCTGGCCAGGCGCAGt > 4:314543/1‑149 (MQ=255) aGTGCAGGTGCGGGCCATGGAGCAGGCCGGCCTGGCCTATGCCGGGCAGGCCCTGCGTGACCCCGCCTGGCGGCTCAGTCCGCTGTTCTGGCAAGCCTTGCGCGGGCAGCCGCTGAACTACGACTTTGGCGCTGGCCAGGCGCAGTTGc < 8:311169/149‑1 (MQ=255) cAGGTGCGGGCCATGGAGCAGGCCGGCCTGGCCTATGCCGGGCAGGCCCTGCGTGACCCCGCCTGGCGGCTCAGTCCGCTGTTCTGGCAAGCCTTGCGCGGGCAGCCGCTGAACTa < 8:214144/116‑1 (MQ=255) cAGGTGCGGGCCATGGAGCAGGCCGGCCTGGCCTATGCCGGGCAGGCCCTGCGTGACCCCGCCTGGCGGCTCAGTCCGCTGTTCTGGCAAGCCTTGCGCGGGCAGCCGCTGAACTACGACTTTGGCGCTGGCCAGGCGCAGTTGCggg > 6:212997/1‑148 (MQ=255) gTGCGGGCCATGGAGCAGGCCGGCCTGGCCTATGCCGGGCAGGCCCTGCGTGACCCCGCCTGGCGGCTCAGTCCGCTGTTCTGGCAAGCCTTGCGCGGGCAGCCGCTGAACTACGACTTTGGCGCTGGCCAGGCGCAGTTGCGGGTAcg > 1:88967/1‑149 (MQ=255) gTGCGGGCCATGGAGCAGGCCGGCCTGGCCTATGCCGGGCAGGCCCTGCGTGACCCCGCCTGGCGGCTCAGTCCGCTGTTCTGGCAAGCCTTGCGCGGGCAGCCGCTGAACTACGACTTTGGCGCTGGCCAGGCGCAGTTGCGGGTAcg > 8:300849/1‑149 (MQ=255) tGCGGGCCATGGAGCAGGCCGGCCTGGCCTATGCCGGGCAGGCCCTGCGTGACCCCGCCTGGCGGCTCAGTCCGCTGTTCTGGCAAGCCTTGCGCGGGCAGCCGCTGAACTACGACTTTGGCGCTGGCCAGGCGCAGTTGCGGGTAcgc < 8:110844/149‑1 (MQ=255) gggCCATGGAGCAGGCCGGCCTGGCCTATGCCGGGCAGGCCCTGCGTGACCCCGCCTGGCGGCTCAGTCCGCTGTTCTGGCAAGCCTTGCGCGGGCAGCCGCTGAACTACGACTTTGGCGCTGGCCAGGCGCAGTTGCGGGTACGCGAc > 8:273833/1‑149 (MQ=255) ggccatGGAGCAGGCCGGCCTGGCCTATGCCGGGCAGGCCCTGCGTGACCCCGCCTGGCGGCTCAGTCCGCTGTTCTGGCAAGCCTTGCGCGGGCAGCCGCTGAACTACGACTTTGGCGCTGGCCAGGCGCAGTTGCGGGTACGCGAc > 5:150058‑M2/7‑148 (MQ=255) ggccatGGAGCAGGCCGGCCTGGCCTATGCCGGGCAGGCCCTGCGTGACCCCGCCTGGCGGCTCAGTCCGCTGTTCTGGCAAGCCTTGCGCGGGCAGCCGCTGAACTACGACTTTGGCGCTGGCCAGGCGCAGTTGCGGGTACGCGAc > 5:301782‑M2/7‑148 (MQ=255) gccatGGAGCAGGCCGGCCTGGCCTATGCCGGGCAGGCCCTGCGTGACCCCGCCTGGCGGCTCAGTCCGCTGTTCTGGCAAGCCTTGCGCGGGCAGCCGCTGAACTACGACTTTGGCGCTGGCCAGGCGCAGTTGCGGGTACGCGACCa < 6:139420‑M2/144‑1 (MQ=255) catGGAGCAGGCCGGCCTGGCCTATGCCGGGCAGGCCCTGCGTGACCCCGCCTGGCGGCTCAGTCCGCTGTTCTGGCAAGCCTTGCGCGGGCAGCCGCTGAACTACGACTTTGGCGCTGGCCAGGCGCAGTTGCGGGTACGCGACCAGc < 3:195097‑M2/146‑1 (MQ=255) tGGAGCAGGCCGGCCTGGCCTATGCCGGGCAGGCCCTGCGTGACCCCGCCTGGCGGCTCAGTCCGCTGTTCTgg > 6:213870‑M2/2‑74 (MQ=255) gcagggcctgccCGGCATAGGCCAGGCCGGCCCTGCGTGACCCCGCCTGGCGGCTCAGTCCGCTGTTCTGGCAAGCCTTGCGCGGGCAGCCGCTGAACTACGACTTTGGCGCTg < 6:128539/110‑1 (MQ=37) gcagggcctgccCGGCATAGGCCAGGCCGGCCCTGCGTGACCCCGCCTGGCGGCTCAGTCCGCTGTTCTGGCAAGCCTTGCGCGGGCAGCCGCTGAACTACGACTTTGGCGCTg > 5:128539/5‑114 (MQ=37) ggccggccTGGCCTATGCCGGGCAGGCCCTGCGTGACCCCGCCTGGCGGCTCAGTCCGCGGTTCTGGCAAGCCGTGCGCGGGCAGCCGCTGAACTACGACTTTGGCGCTGGCCAGGCGCAGTTGCGGGTACGCAACCAGCACACCTGCt > 5:246853/1‑149 (MQ=255) gccggccTGGCCTATGCCGGGCAGGCCCTGCGTGACCCCGCCTGGCGGCTCAGTCCGCTGTTCTGGCAAGCCTTGCGCGGGCAGCCGCTGAACTACGACTTTGGCGCTGGCCAGGCGCAGTTGCGGGTACGCGACCAGCACACCTGCtt > 4:337669/1‑149 (MQ=255) ccggccTGGCCTATGCCGGGCAGGCCCTGCGTGACCCCGCCTGGCGGCTCAGTCCGCTGTTCTGGCAAGCCTTGCGCGGGCAGCCGCTGAACTACGACTTTGGCGCTGGCCAGGCGCAGTTGCGGGTACGCGACCAGCACACCTGCTTc < 2:157195/149‑1 (MQ=255) cggccTGGCCTATGCCGGGCAGGCCCTGCGTGACCCCGCCTGGCGGCTCAGTCCGCTGTTCTGGCAAGCCTTGCGCGGGCAGCCGCTGAACTACGACTTTGGCGCTg > 2:310238/1‑107 (MQ=255) cggccTGGCCTATGCCGGGCAGGCCCTGCGTGACCCCGCCTGGCGGCTCAGTCCGCTGTTCTGGCAAGCCTTGCGCGGGCAGCCGCTGAACTACGACTTTGGCGCTg < 1:310238/107‑1 (MQ=255) gcctggcctATGCCGGGCAGGCCCTGCGTGACCCCGCCTGGCGGCTCAGTCCGCTGTTCTGGCAAGCCTTGCGCGGGCAGCCGCTGAACTACGACTTTGGCGCTGGCCAGGCGCAGTTGCGGGTACGCGACCAGCACACCTGCTTCAAc < 5:212997/149‑1 (MQ=255) gcctggcctATGCCGGGCAGGCCCTGCGTGACCCCGCCTGGCGGCTCAGTCCGCTGTTCTGGCAAGCCTTGCGCGGGCAGCCGCTGAACTACGACTTTGGCGCTGGCCAGGCGCAGTTGCGGGTACGCGACCAGCACACCTGCTTCAAc < 7:300849/149‑1 (MQ=255) tggcctATGCCGGGCAGGCCCTGCGTGACCCCGCCTGGCGGCTCAGTCCGCTGTTCTGGCAAGCCTTGCGCGGGCAGCCGCTGAACTACGACTTTGGCGCTGGCCAGGCGCAGTTGCGGGTACGCGACCAGCACACCTGCTTCAACGt > 4:58976/1‑148 (MQ=255) ctATGCCGGGCAGGCCCTGCGTGACCCCGCCTGGCGGCTCAGTCCGCTGTTCTGGCAAGCCTTGCGCGGGCAGCCGCTGAACTACGACTTTGGCGCTGGCCAGGCGCAGTTGCGGGTACGCGACCAGCACACCTGCTTCAACGTCAATg > 4:4741/1‑149 (MQ=255) aTGCCGGGCAGGCCCTGCGTGACCCCGCCTGGCGGCTCAGTCCGCTGTTCTGGCAAGCCTTGCGCGGGCAGCCGCTGAACTACGACTTTGGCGCTGGCCAGGCGCAGTTGCGGGTACGCGACCAGCACACCTGCTTCAACGTCAATGCa > 6:261091/1‑149 (MQ=255) tGCCGGGCAGGCCCTGCGTGACCCCGCCTGGCGGCTCAGTCCGCTGTTCTGGCAAGCCTTGCGCGGGCAGCCGCTGAACTACGACTTTGGCGCTGGCCAGGCGCAGTTGCGGGTACGCGAcc > 5:10341/1‑122 (MQ=255) tGCCGGGCAGGCCCTGCGTGACCCCGCCTGGCGGCTCAGTCCGCTGTTCTGGCAAGCCTTGCGCGGGCAGCCGCTGAACTACGACTTTGGCGCTGGCCAGGCGCAGTTGCGGGTACGCGAcc < 6:10341/122‑1 (MQ=255) ccGGGCAGGCCCTGCGTGACCCCGCCTGGCGGCTCAGTCCGCTGTTCTGGCAAGCCTTGCGCGGGCAGCCGCTGAACTACGACTTTGGCGCTGGCCAGGCGCGGTTGCGGGTACGCGACCAGCACGCCTGCGTCGAGGGGAATGGATTg > 3:256048/1‑149 (MQ=255) | TGGTGATGGTGGTGCTGGCAATGCTGGCGGCGGGCATGGCCTGGCTGGTGGAAGATGGCCGGCGTCAGGTCGACGAAGTGCGCCTGCTGCACCAGCGAGTGCAGGTGCGGGCCATGGAGCAGGCCGGCCTGGCCTATGCCGGGCAGGCCCTGCGTGACCCCGCCTGGCGGCTCAGTCCGCTGTTCTGGCAAGCCTTGCGCGGGCAGCCGCTGAACTACGACTTTGGCGCTGGCCAGGCGCAGTTGCGGGTACGCGACCAGCACACCTGCTTCAACGTCAATGCATTG > NC_002947/1190516‑1190802 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |