| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,249,749 | A→T | 7.7% | intergenic (+22/+49) | bvgA → / ← PP_1091 | virulence factors transcription regulator BvgA/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,249,749 | 0 | A | T | 7.7% | 188.3 / 4.7 | 65 | intergenic (+22/+49) | bvgA/PP_1091 | virulence factors transcription regulator BvgA/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (31/29); new base T (2/3); total (33/32) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.72e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.49e-01 | |||||||||||
CGACAGCATGTACCTCAGTAACAAGACGGTCAGTACCTACAAGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATGCACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTG‑AACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTCCAGCCAGGAGGCTTTGCCAGGGCTATCGGTCCATGACTACGGGACCCGCACTACAGGTCGTAATCGAAATCGGCCAACTGCTTCTGCAGGCGCCGTTCTT‑CCAGCATGTTGTCGATGGTGCGACGTTTGCTCAGGTTGGTCTTTGCGA > NC_002947/1249607‑1249895 | cGACAGCATGTACCTCAGTAACAAGACGGTCAGTACCTACAAGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATGCACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTG‑AACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTccagccag > 7:113954/1‑148 (MQ=255) gACAGCATGTACCTCAGTAACAAGACGGTCAGTACCTACAAGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATGCACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTG‑AACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTCCAGCCagga < 1:266446/149‑1 (MQ=255) gACAGCATGTACCTCAGTAACAAGACGGTCAGTACCTACAAGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATGCACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTATG‑AACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTCCAGCCagga < 1:62496/149‑1 (MQ=255) aGCATGTACCTCAGTAACAAGACGGTCAGTACCTACAAGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATGCACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTG‑AACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTCCAGCCAGGAGGc > 3:17140/1‑149 (MQ=255) tGTACCTCAGTAACAAGACGGTCAGTACCTACAAGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATGCACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTG‑AACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTCCAGCCAGGAGGCTTTg < 5:140193/149‑1 (MQ=255) gTACCTCAGTAACAAGACGGTCAGTACCTACAAGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATGCACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTG‑AACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTCCAGCCAGGAGGCTTTGc > 7:201940/1‑149 (MQ=255) tACCTCAGTAACAAGACGGTCAGTACCTACAAGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATGCACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTG‑AACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTCCTGGCTGGAGGCttcaa < 1:312123/148‑4 (MQ=255) aCCTCAGTAACAAGACGGTCAGTACCTACAAGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATGCACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTG‑AACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTCCAGCCAGGAGGCTTTGc > 7:35717/1‑147 (MQ=255) ccTCAGTAACAAGACGGTCAGTACCTACAAGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATGCACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTG‑AACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTCCAGCCAGGAGGCTTTGCCAg < 8:35717/149‑1 (MQ=255) tCAGTAACAAGACGGTCAGTACCTACAAGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATGCACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTG‑AACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTCCAGCCAGGAGGCTTTGCCAggg > 2:340303/1‑149 (MQ=255) tAACAAGACGGTCAGTACCTACAAGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATGCACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTG‑AACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTCCAGCCAGGAGGCTTTGCCAGGGCTAt < 8:201940/149‑1 (MQ=255) aaCAAGACGGTCAGTACCTACAAGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATGCACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTG‑AACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTCCAGCCAGGAGGCTTTGCCAGGGCTAt < 4:211777/148‑1 (MQ=255) aCAAGACGGTCAGTACCTACAAGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATGCACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTG‑AACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTCCAGCCAGGAGGCTTTGCCAGGGCTATCg > 8:157498/1‑149 (MQ=255) aGACGGTCAGTACCTACAAGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATGCACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTG‑AACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTCCAGCCAGGAGGCTTTGCCAGGGCTATCGGTc > 6:352769/1‑149 (MQ=255) ggTCAGTACCTACAAGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATGCAAGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTG‑AACTGATCGCCAAGCATTGAAGCCTCCAGCCAGGAGGCTTTGCCAGGGCTATCGGTCAAt > 6:350310/1‑148 (MQ=255) gTCAGTACCTACAAGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATGCACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTG‑AACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTCCAGCCAGGAGGCTTTGCCAGGGCTATCGGTCCATGa < 5:240326/149‑1 (MQ=255) gTACCTACAAGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATGCACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTG‑AACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTCCAGCCAGGAGGCTTTGCCAGGGCTATCGGTCCATGACTAc < 1:303577/149‑1 (MQ=255) aCCTACAAGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATGCACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTG‑AACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTCCAGCCAGGAGGCTTTGCCAGGGCTATCGGTCCATGACTACgg > 2:273351/1‑149 (MQ=255) tACAAGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATGCACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTG‑AACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTCCTGGCTGGAGGCttcaa > 7:153020/1‑118 (MQ=255) tACAAGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATGCACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTG‑AACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTCCTGGCTGGAGGCttcaa < 8:153020/121‑4 (MQ=255) tACAAGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATGCACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTG‑AACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTCCAGCCAGGAGGCTTTGCCAGGGCTATCGGTCCATGACTACGGGAc > 2:125405/1‑149 (MQ=255) cAAGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATGCACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTG‑AACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTCCAGCCAGGAGGCTTTGCCAGGGCTATCGGTCCATGACTACGGGAccc < 7:157498/149‑1 (MQ=255) tCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATGCACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTG‑AACTGATCGCCAAGCCTTGAATCCTCCAGCCAGGAGGCTTTGCCAGGGCTATCGGTCCATGACTACGGGACACGCAc > 1:315381/1‑149 (MQ=255) aCGGCTGCTGCTCAAGCTCAATGCACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTG‑AACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTCCAGCCAGGAGGCTTTGCCAGGGCTATCGGTACATGACTACGGGACCCgacct > 8:325/1‑144 (MQ=255) ctgctgctCAAGCTCAATGCACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTG‑AACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTCCAGCCAGGAGGCTTTGCCAGGGCTATCGGTCCATGACTACGGGACCCGCACTACAgg < 8:113954/149‑1 (MQ=255) ctgctgctCAAGCTCAATGCACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTG‑AACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTCCAGCCAGGAGGCTTTGCCAGGGCTATCGGTCCATGACTACGGGACCCGCACTACAgg < 5:352769/149‑1 (MQ=255) gctcaaTGCACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTG‑AACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTCCAGCCAGGAGGCTTTGCCAgg > 2:298549/1‑102 (MQ=255) gctcaaTGCACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTG‑AACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTCCAGCCAGGAGGCTTTGCCAgg < 1:298549/102‑1 (MQ=255) tGCACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTG‑AACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTCCAGCCAGGAGGCTTTGCCAGGGCTATCGGTCCATGACTACGGGACCCGCACTACAGGTCGTAATCGAAATCGGc < 1:125405/149‑1 (MQ=255) cGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGTCTCAACGGCAATGTCTG‑AACTGATCGCCAATACTTTAAGCCTCCAGCCAGGAGGCTTTGCCAGGGCTATCGGTCCATTACTACGTGACCCGCACTACAGGTCGTAATCGAAATCGGCCAAc < 5:350310/149‑1 (MQ=255) ggTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTG‑AACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTCCAGCCAGGAGGCTTTGCCAGGGCTATCGGTCCATGACTACGGGACCCGCACTACAGGTCGTaa > 3:174752/1‑133 (MQ=255) ggTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTG‑AACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTCCAGCCAGGAGGCTTTGCCAGGGCTATCGGTCCATGACTACGGGACCCGCACTACAGGTCGTaa < 4:174752/133‑1 (MQ=255) ggTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTG‑AACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTCCAGCCAGGAGGCTTTGCCAGGGCTATCGGTCCATGACTACGGGACCCGCACTACAGGTCGTAATCGAAATCGGCCAACt > 7:5159/1‑149 (MQ=255) ggTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGGCTG‑AACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTCCAGCCAGGAGGCTTTGCCAGGGCTATCGGTCCATGACTACGGGACCCGCACTACAGGTCGTAATCGAAATCGGCCAACTGCTTCt < 7:325/148‑1 (MQ=255) gTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTGTAACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTCCAGCCAGGAGGCTTTGCCAGGGCTATCGGTCCATGACTACGGGACCCGCACTACAGGTCGTAATCGAAATCGGCCAACTGCTTCTg > 1:231255/1‑149 (MQ=255) gTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTG‑AACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTCCAGCCAGGAGGCTTTGCCAGGGCTATCGGTCCATGACTACGGGACCCGCACTACAGGTCGTAATCGAAATCGGCCAACTGCTTCTg > 4:331199/1‑148 (MQ=255) ccTGATCCAGCTTGCGCAACGGCAAGGTCTG‑AACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTCCAGCCAGGAGGCTTTGCCAGGGCTATCGCTCCATGACAACTTGACCAGCACTACAGGTCGTAATCGAAATCGGCCAACTGCTTCTGAAGgcg > 5:185986/1‑149 (MQ=255) cTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTG‑AACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTCCAGCCAGGAGGCTTTGCCAGGGCTATCGGTCCATGACTACGGGACCCGCACTACAGGTCGTAATCGAAATCGGCCAACTGCTTCTGCAGgcgc > 8:44581/1‑149 (MQ=255) aGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTG‑AACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTCCAGCCAGGAGGCTTTGCCAGGGCTATCGGTCCATGACTACGGGACCCGCACTACAGGTCGTAATCGAAATCGGCCAACTGCTTCTGCAGGCGCCGttctt < 8:5159/149‑1 (MQ=255) gCTGGCGCAACGGCAAGGTCTG‑AACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTCCAGCCAGGAGGCTTTGCCAGGGCTATCGGTCCATGACTACGGGACCCGCACTACAGGTCGTAATCGAAATCGGCCAACTGCTTCTGCAGGCGCCGttctt‑c > 7:47513/1‑149 (MQ=255) cttgcgcAACGGCATGGTCTG‑AACTGATCTCCAAGCCTTGATGCCTCGAGCCATGAGGCTTTGACAGGGCTATCGGTCCATGACTACGGGACCCGCACTACAGGTCGTAATCGAAATCGTCCAACTGCTTCTGCAGGCGCCGTTCTT‑cc < 6:185986/146‑1 (MQ=255) gcgcAACGGCAAGGTCTG‑AACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTCCAGCCAGGAGGCTTTGCCAGGGCTATCGGTCCATGACTACGGGACCCGCACTACAGGTCGTAATCGAAATCGGCCAACTGCTTCTGCAGGCGCCGTTCTT‑CCAg < 8:3731/148‑1 (MQ=255) gcgcAACGGCAAGGTCTG‑AACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTCCAGCCAGGAGGCTTTGCCAGGGCTATCGGTCCATGACTACGGGACCCGCACTACAGGTCGTAATCGAAATCGGCCAACTGCTTCTGCAGGCGCCGTTCTT‑CCAg > 7:3731/1‑148 (MQ=255) gcgcAACGGCAAGGTCTG‑AACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTCCAGCCAGGAGGCTTTGCCAGGGCTATCGGTCCATGACTACGGGACCCGCACTACAGGTCGTAATCGAAATCGGCCAACTGCTTCTGCAGGCGCCGTTCTT‑CCAGc < 1:340303/149‑1 (MQ=255) gcgcAACGGCAAGGTCTG‑AACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTCCAGCCAGGAGGCTTTGCCAGGGCTATCGGTCCATGACTACGGGACACGCACTACAGGTCGTATTCGAAATCGGCCAACTGCTTCTGCAGGCGCCGTTCTT‑CCAg > 7:136732/1‑148 (MQ=255) gcAACGGCAAGGTCTG‑AACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTCCAGCCAGGAGGCTTTGCCAGGGCTATCGGTCCATGACTACGGGACCCGCACTACAGGTCGTAATCGAAATCGGCCAACTGCTTCTGCAGGCGCCGTTCTT‑CCAGCAt > 4:285681/1‑149 (MQ=255) aaCGGCAAGGTCTG‑AACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTCCAGCCAGGAGGCTTTGCCAGGGCTATCGGTCCATGACTACGGGACCCGCACTACAGGTCGTAATCGAAATCGGCCAACTGCTTCTGc > 4:265905/1‑127 (MQ=255) ggCAAGGTCTG‑AACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTCCAGCCAGGAGGCTTTGCCAGGGCTATCGGTCCATGACTACGGGACCCGCACTACAGGTCGTAATCGAAATCGGCCAACTGCTTCTGCAGGCGCCGTTCTT‑CCAGCAtgttgt < 4:17140/149‑1 (MQ=255) gCAAGGTCTG‑AACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTCCAGCCAGGAGGCTTTGCCAGGGCTATCGGTCCATGACTACGGGACCCGCACTACAGGTCGTAATCGAAATCGGCCAACTGCTTCTGCAGGCGCCGTTCTT‑CCAGCATGTTGTc > 3:46604/1‑149 (MQ=255) ggTCTG‑AACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTCCAGCCAGGAGGCTTTGCCAGGGCTATCGGTCCATGACTACGGGACCCGCACTACAGGTCGTAATCGAAATCGGCCAACTGCTTCTGCAGGCGCCGTTCTT‑CCAGCATGTTGTCGATg < 3:285681/149‑1 (MQ=255) tG‑AACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTCCAGCCAGGAGGCTTTGCCAGGGCTATCGGTCCATGACTACGGGACCCGCACTACAGGTCGTAATCGAAATCGGCCAACTGCTTCTGCAGGCGCCGTTCTT‑CCAGCATGTTGTCGATGGTGc > 8:300174/1‑149 (MQ=255) gATCGCCAAGCCTTGAAGCCTCCAGCCAGGAGGCTTTGCCAGGGCTATCGGTCCATGACTACGGGACCCGCACTACAGGTCGTAATCGAAATCGGCCAACTGCTTCTGCAGGCGCCTTTCTT‑CCAGCATGTTGTCGATGGTGCGACGtt > 6:246269/1‑149 (MQ=255) aTCGCCAAGCCTTGAAGCCTCCAGCCAGGAGGCTTTGCCAGGGCTATCGGTCCATGACTACGGGACCCGCACTACAGGTCGTAATCGAAATCGGCCAACTGCTTCTGCAGGCGCCGTTCTT‑CCAGCATGTTGTCGATGGTGCGACGttt < 2:231255/149‑1 (MQ=255) ccAAGCCTTGAAGCCTCCAGCCAGGAGGCTTTGCCAGGGCTATCGGTCCATGACTACGGGACCCGCACTACAGGTCGTAATCGAAATCGGCCAACTGCTTCTGCAGGCGCCGTTCTT‑CCAGCATGTTGTCGATGGTGCGACGTTTGCt > 5:135935/1‑148 (MQ=255) ccAAGCCTTGAAGCCTCCAGCCAGGAGGCTTTGCCAGGGCTATCGGTCCATGACTACGGGACCCGCACTACAGGTCGTAATCGAAATCGGCCAACTGCTTCTGCAGGCGCCGTTCTT‑CCAGCATGTTGTCGATGGTGCGACGTTTGCt > 4:122883/1‑148 (MQ=255) aaGCCTTGAAGCCTCCAGCCAGGAGGCTTTGCCAGGGCTATCGGTCCATGACTACGGGACCCGCACTACAGGTCGTAATCGAAATCGGCCAACTGCTTCTGCAGGCGCCGTTCTT‑CCAGCATGTTGTCGATGGTGCGACGTTTGCTCAg < 3:331199/149‑1 (MQ=255) aaGCCTTGAAGCCTCCAGCCAGGAGGCTTTGCCAGGGCTATCGGTCCATGACTACGGGACCCGCACTACAGGTCGTAATCGAAATCGGCCAACTGCTTCTGCAGGCGCCGTTCTT‑CCAGCATGTTGTCGATGGTGCGACGTTTGCTCAg > 4:108506/1‑149 (MQ=255) ccTTGAAGCCTCCAGCGAGGAGGCTTTGCCAGGGCTATCGGTCCAt < 4:260039/46‑1 (MQ=255) ccTTGAAGCCTCCAGCCAGGAGGCTTTGCCAGGGCTATCGGTCCAt > 3:260039/1‑46 (MQ=255) cTTGAAGCCTCCAGCCAGGAGGCTTTGCCAGGGCTATCGGTCCATGACTACGGGACCCGCACTACAGGTCGTAATCGAAATCGGCCAACTGCTTCTGCAGGCGCCGTTCTT‑CCAGCATGTTGTCGATGGTGCGACGTTTGCTCAGGTTg < 4:46604/149‑1 (MQ=255) caaaGCCTCCTGGCTGGAGGCTTTGCCAGGGCTATCGGTCCATGACTACGGGACCCGCACTACAGGTCGTAATCGAAATCGGCCAACTGCTTCTGCAGGCGCCGTTCTTCCCAGCATGTTGTCGATGGTGCGACGTTTGCTCAgg < 1:225910/143‑1 (MQ=255) caaaGCCTCCTGGCTGGAGGCTTTGCCAGGGCTATCGGTCCATGACTACGGGACCCGCACTACAGGTCGTAATCGAAATCGGCCAACTGCTTCTGCAGGCGCCGTTCTT‑CCAGCATGTTGTCGATGGTGCGACGTTTGCTCAgg > 2:225910/3‑144 (MQ=255) gAAGCCTCCAGCCAGGAGGCTTTGCCAGGGCTATCGGTCCATGACTACGGGACCCGCACTACAGGTCGTAATCGAAATCGGCCAACTGCTTCTGCAGGCGCCGTTCTT‑CCAGCATGTTGTCGATGGTGCGACGTTTGCTCAGGTTGGTc > 2:285863/1‑149 (MQ=255) aaGCCTCCAGCCAGGAGGCTTTGCCAGGGCTATCGGTCCATGACTACGGGACCCGCACTACAGGTCGTAATCGAAATCGGCCAACTGCTTCTGCAGGCGCCGTTCTT‑CCAGCATGTTGTCGATGGTGCGACGTTTGCTCAGGTTGGTc < 7:44581/148‑1 (MQ=255) aaGCCTCCACCCTGGAGGCTTTGCCAGGGCTATCGGTCCATTACTACGGGACCCGCACTACAGGTCGTAATCGAAAGCGGCCAACTGCTTCTGCAGGCGCCTTTCTT‑CCATCATGTTGTCGATGGTGCGACGTTTGCTCATGTTGGTc < 2:315381/148‑1 (MQ=255) ccTCCAGCCAGGAGGCTTTGCCAGGGCTATCGGTCCATGACTACGGGACCCGCACTACAGGTCGTAATCGAAATCGGCCAACTGCTTCTGCAGGCGCCGTTCTT‑CCAGCATGTTGTCGATGGTGCGACGTTTGCTCAGGTTGGTCTTTg < 7:300174/149‑1 (MQ=255) cagccagGAGGCTTTGCCAGGGCTATCGGTCCATGACTACGGGACCCGCACTACAGGTCGTAATCGAAATCGGCCAACTGCTTCTGCAGGCGCCGTTCTT‑CCAGCATGTTGTCGATGGTGCGACGTTTGCTCAGGTTGGTCTTTGCGa < 3:122883/148‑1 (MQ=255) | CGACAGCATGTACCTCAGTAACAAGACGGTCAGTACCTACAAGTCACGGCTGCTGCTCAAGCTCAATGCACGGTCATTGGTTGACCTGATCGAGCTGGCGCAACGGCAAGGTCTG‑AACTGATCGCCAAGCCTTGAAGCCTCCAGCCAGGAGGCTTTGCCAGGGCTATCGGTCCATGACTACGGGACCCGCACTACAGGTCGTAATCGAAATCGGCCAACTGCTTCTGCAGGCGCCGTTCTT‑CCAGCATGTTGTCGATGGTGCGACGTTTGCTCAGGTTGGTCTTTGCGA > NC_002947/1249607‑1249895 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |