Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,665,262 | C→A | 5.4% | E202D (GAG→GAT) | PP_1459 ← | CBS domain‑containing protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,665,262 | 0 | C | A | 5.4% | 235.1 / 3.4 | 74 | E202D (GAG→GAT) | PP_1459 | CBS domain‑containing protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (31/39); new base A (2/2); total (33/41) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.35e-01 |
TTCCAGGGTCAGCTCGGCCTTGGGCAGCAGGTGGCTGATCAGCTTGGTGTTGAGGATCGCTTCGACCTGGTTGATGTCGTTGTGGTAGACCGGCAGGCGGGTGTGGCGGCTGACGATCAGCTGCTCGACGATGCGTTCGATCGGCTCGTCGAGGTTGATGCCATCCACTTCGTTGCGCGGCACCAGGATGTCGTTGACGGTGATCTTGTCCAGCGACTGCAGGCCGTCGAGCAGACCCTGGCGAGGCGCTTCGTGCTGTTCATCCTCATCGAAGTCGTCGGCCTCCT > NC_002947/1665118‑1665404 | ttCCAGGGTCAGCTCGGCCTTGGGCAGCAGGTGGCTGATCAGATTGGTGTTGAGGATCGCTTCTACCAGGTTGATGTCGTTGTGGTAGAGCGGCAGGCGTGTGTGGAGGCTGAAGATCAGATGCTCGACGATGCGTTCGATCGGCtcgt > 4:185182/1‑149 (MQ=255) tCCAGGGTCAGCTCGGCCTTGGGCAGCAGGTGGCTGATCAGCTTGGTGTTGAGGATCGCTTCGACCTGGTTGATGTCGTTGTGGTAGACCGGCAGGCGGGTGTGGCGGCTGACGATCAGCTGCTCGACGATGCGTTCGATCGGCtcgtc > 5:229153/1‑149 (MQ=255) cAGGGTCAGCTCGGCCTTGGGCAGCAGGTGGCTGATCAGCTTGGTGTTGAGGATCGCTTCGACCTGGTTGATGTCGTTGTGGTAGACCGGCAGGCGGGTGTGGCGGCTGACGATCAGCTGCTCGACGATGCGTTCGATCGGCtcgtc > 3:300239/1‑147 (MQ=255) aGGGTCAGCTCGGCCTTGGGCAGCAGGTGGCTGATCAGCTTGGTGTTGAGGATCGCTTCGACCTGGTTGATGTCGTTGTGGTAGACCGGCAGGCGGGTGTGGCGGCTGACGATCAGCTGCTCGACGATGCGTTCGATCGGCTCGTCGAg < 6:229153/149‑1 (MQ=255) aGGGTCAGCTCGGCCTTGGGCAGCAGGTGGCTGATCAGCTTGGTGTTGAGGATCGCTTCGACCTGGTTGACGTCGTTGTGGTAGACCGGCAGGCGGGTGTGGCGGCTGACGATCAGCTGCTCGACGAGCCGATCGAACGCATCGTCGAg < 3:151707/149‑1 (MQ=255) tCAGCTCGGCCTTGGGCAGCAGGTGGCTGATCAGCTTGGTGTTGAGGATCGCTTCGACCTGGTTGATGTCGTTGTGGTAGACCGGCAGGCGGGTGTGGCGGCTGACGATCAGCTGCTCGACGATGCGTTCGATCGGCTCGTCGAGGtt > 1:83448/1‑148 (MQ=255) aGCTCGGGCTTGGGCAGCAGGTGGCTGATCAGCTTGGTGTTGAGGATCGCTTCGACCTGGTTGATGTCGTTGTGGTAGACCGGCAGGCGGGTGTGGCGGCTGACGATCAGCTGCTCGACGATGCGTTCGATCGGCTCGTCGAGGTTGAt < 3:185182/149‑1 (MQ=255) gCTCGGCCTTGGGCAGCAGGTGGCTGATCAGCTTGGTGTTGAGGATCGCTTCGACCTGGTTGATGTCGTTGTGGTAGACCGGCAGGCGGGTGTGGCGGCTGACGATCAGCTGCTCGACGAGCCGATCGAACGCATCGTCGAgc < 1:323958/143‑2 (MQ=255) gCTCGGCCTTGGGCAGCAGGTGGCTGATCAGCTTGGTGTTGAGGATCGCTTCGACCTGGTTGATGTCGTTGTGGTAGACCGGCAGGCGGGTGTGGCGGCTGACGATCAGCTGCTCGACGAGCCGATCGAACGCATCGTCGAgc > 2:323958/1‑142 (MQ=255) cTCGGCCTTGGGCAGCAGGTGGCTGATCAGCTTGGTGTTGAGGATCGCTTCGACCTGGTTGATGTCGTTGTGGTAGACCGGCAGGCGGGTGTGGCGGCTGACGATCAGCTGCTCGACGATGCGTTCGATCGGCTCGTCGAGGTTGATGc > 1:151282/1‑149 (MQ=255) ttGGGCAGCAGGTGGCTGATCAGCTTGGTGTTGAGGATCGCTTCGACCTGGTTGATGTCGTTGTGGTAGACCGGCAGGCGGGTGTGGCGGCTGACGATCAGCTGCTCGACGATGCGTTCGATCGGCTCGTCGAGGTTGATGCCATCCAc > 7:78799/1‑149 (MQ=255) gggCAGCTGGTGGCTGATCAGCTTGGTGTTGAGGATCGCTTCGACCTGGTTGATGTCGTTGTGGTAGACCGGCAGGCGGGTGTGGCGGCTGACGATCAGCTGCTCGACGATGCGTTCGATCGGCTCGTCGAGGTTGATGCCATCCACt < 7:110234/148‑1 (MQ=255) gggCAGCAGGTGGCTGATCAGCTTGGTGTTGAGGATCGCTTCGACCTGGTTGATGTCGTTGTGGTAGACCGGCAGGCGGGTGTGGCGGCTGACGATCAGCTGCTCGACGATGCGTTCGATCGGCTCGTCGAGGTTGATGCCATCCAc < 3:66627/147‑1 (MQ=255) gcagcaGGTGGCTGATCAGCTTGGTGTTGAGGATCGCTTCGACCTGGTTGATGTCGTTGTGGTAGACCGGCAGGCGGGTGTGGCGGCTGACGATCAGCTGCTCGACGATGCGTTCGATCGGCTCGTCGAGGTTGATGCCATCCACTTCg > 2:81985/1‑149 (MQ=255) cTGATCAGCTTGGTGTTGAGGATCGCTTCGACCTGGTTGATGTCGTTGTGGTAGACCGGCAGGCGGGTGTGGCGGCTGACGATCAGCTGCTCGACGATGCGTTCGATCGGCTCGTCGAGGTTGATGCCATCCACTTCGTTGCGCGGCAc < 1:165317/149‑1 (MQ=255) gATCAGCTTGGTGTTGAGGATCGCTTCGACCTGGTTGATGTCGTTGTGGTAGACCGGCAGGCGGGTGTGGCGGCTGACGATCAGCTGCTCGACGATGCGTTCGATCGGCTCGTCGAGGTTGATGCCATCCACTTCGTTGCGCGGCAc > 7:193742/1‑147 (MQ=255) ttGGTGTTGAGGATCGCTTCGACCTGGTTGATGTCGTTGTGGTAGACCGGCAGGCGGGTGTGGCGGCTGACGATCAGCTGCTCGACGATGCGTTCGATCGGCTCGTCGAGGTTGa > 8:84244/1‑115 (MQ=255) ttGGTGTTGAGGATCGCTTCGACCTGGTTGATGTCGTTGTGGTAGACCGGCAGGCGGGTGTGGCGGCTGACGATCAGCTGCTCGACGATGCGTTCGATCGGCTCGTCGAGGTTGa < 7:84244/115‑1 (MQ=255) ggTGTTGAGGATCGCTTCGACCTGGTTGATGTCGTTGTGGTAGACCGGCAGGCGGGTGTGGCGGCTGACGATCAGCTGCTCGACGATGCGTTCGATCGGCTCGTCGAGGTTGATGCCATCCACTTCGTTGCGCGGCACCAGGATGTCg < 6:167254/148‑1 (MQ=255) gtgtTGAGGATCGCTTCGACCTGGTTGATGTCGTTGTGGTAGACCGGCAGGCGGGTGTGGCGGCTGACGATCAGCTGCTCGACGATGCGTTCGATCGGCTCGTCGAGGTTGATGCCATCCACTTCGTTGCGCGGCACCAGGATGTCGtt < 8:193742/149‑1 (MQ=255) tgtTGAGGATCGCTTCGACCTGGTTGATGTCGTTGTGGTAGACCGGCAGGCGGGTGTGGCGGCTGACGATCAGCTGCTCGACGATGCGTTCGATCGGCTCGTCGAGGTTGATGCCATCCACTTCGTTGCGCGGCACCAGGATGTCGtt > 3:210261/1‑148 (MQ=255) ttGAGGATCGCTTCGACCTGGTTGATGTCGTTGTGGTAGACCGGCAGGCGGGTGTGGCGGCTGACGATCAGCTGCTCGACGATGCGTTCGATCGGCTCGTCGAGGTTGATGCCATCCACTTCGTTGCGCGGCACCAGGATGTCGTTGAc > 5:160941/1‑149 (MQ=255) aGGATCGCTTCGACCTGGTTGATGTCGTTGTGGTAGACCGGCAGGCGGGTGTGGCGGCTGACGATCAGCTGCTCGACGATGCGTTCGATCGGCTCGTCGAGGTTGATGCCATCCACTTCGTTGCGCGGCACCAGGATGTCGTTGACgg < 8:78799/148‑1 (MQ=255) gATCGCTTCGACCTGGTTGATGTCGTTGTGGTAGACCGGCAGGCGGGTGTGGCGGCTGACGATCAGCTGCTCGACGATGCGTTCGATCGGCTCGTCGAGGTTGATGCCATCCACTTCGTTGCGCGGCACCAGGATGTCGt > 6:108496/1‑140 (MQ=255) gATCGCTTCGACCTGGTTGATGTCGTTGTGGTAGACCGGCAGGCGGGTGTGGCGGCTGACGATCAGCTGCTCGACGATGCGTTCGATCGGCTCGTCGAGGTTGATGCCATCCACTTCGTTGCGCGGCACCAGGATGTCGt < 5:108496/140‑1 (MQ=255) tCGCTTCGACCTGGTTGATGTCGTTGTGGTAGACCGGCAGGCGGGTGTGGCGGCTGACGATCAGCTGCTCGACGATGCGTTCGATCGGCTCGTCGAGGTTGATGCCATCCACTTCGTTGCGCGGCACCAGGATGTCGTTGACGGTGATc < 2:83448/149‑1 (MQ=255) tCGCTTCGACCTGGTTGATGTCGTTGTGGTAGACCGGCAGGCGGGTGTGGCGGCTGACGATCAGCTGCTCGACGATGCGTTCGATCGGCTCGTCGAGGTTGATGCCATCCACTTCGTTGCGCGGCACCAGGATGTCGTTGACGGTGATc < 5:351360/149‑1 (MQ=255) gCTTCGACCTGGTTGATGTCGTTGTGGTAGACCGGCAGGCGGGTGTGGCGGCTGACGATCAGCTGCTCGACGATGCGTTCGATCGGCTCGTCGAGGTTGATGCCATCCACTTCGTTGCGCGGCACCAGGATGTCGTTGACGGTGATCtt < 5:192428/149‑1 (MQ=255) cTTCGACCTGGTTGATGTCGTTGTGGTAGACCGGCAGGCGGGTGTGGCGGCTGACGATCAGCTGCTCGACGATGCGTTCGATCGGCTCGTCGAGGTTGATGCCATCCACTTCGTTGCGCGGCACCAGGATGTCGTTGACGGTGATCTTg > 4:44771/1‑149 (MQ=255) ttCGACCTGGTCGATGTCGTTGTGGTAGACCGGCAGGCGGGTGTGGCGGCTGACGATCAGCTGCTCGACGATGCGTTCGATCGGCTCGTCGAGGTTGATGCCATCCACTTCGTTGCGCGGCACCAGGATGTCGTTGa < 5:151697/137‑1 (MQ=255) ttCGACCTGGTCGATGTCGTTGTGGTAGACCGGCAGGCGGGTGTGGCGGCTGACGATCAGCTGCTCGACGATGCGTTCGATCGGCTCGTCGAGGTTGATGCCATCCACTTCGTTGCGCGGCACCAGGATGTCGTTGa > 6:151697/1‑137 (MQ=255) cGACCTGGTTGATGTCGTTGTGGTAGACCGGCAGGCGGGTGTGGCGGCTGACGATCAGCTGCTCGACGATGCGTTCGATCGGCTCGTCGAGGTTGATGCCATCCACTTCGTTGCGCGGCACCAGGATGTCGTTGACGGTGATCTTGTc < 6:328099/148‑1 (MQ=255) cGACCTGGTTGATGTCGTTGTGGTAGACCGGCAGGCGGGTGTGGCGGCTGACGATCAGCTGCTCGACGATGCGTTCGATCGGCTCGTCGAGGTTGATGCCATCCACTTCGTTGCGCGGCACCAGGATGTCGTTGACGGTGATCTTGTc < 6:317928/148‑1 (MQ=255) tGGTTGATGTCGTTGTGGTAGACCGGCAGGCGGGTGTGGCGGCTGACGATCAGCTGCTCGACGATGCGTTCGATCGGCTCGTCGAGGTTGATGCCATCCACTTCGTTGCGCGGCACCAGGATGTCGTTGACGGTGATCTTGTCCAGCGa > 4:151618/1‑149 (MQ=255) gTTGATGTCGTTGTGGTAGACCGGCAGGCGGGTGTGGCGGCTGACGATCAGCTGCTCGACGATGCGTTCGATCGGCTCGTCGAGGTTGATGCCATCCACTTCGTTGCGCGGCACCAg > 4:55856/1‑117 (MQ=255) gTTGATGTCGTTGTGGTAGACCGGCAGGCGGGTGTGGCGGCTGACGATCAGCTGCTCGACGATGCGTTCGATCGGCTCGTCGAGGTTGATGCCATCCACTTCGTTGCGCGGCACCAGGATGTCGTTGACGGTGATCTTGTCCAGCGa < 3:338144/147‑1 (MQ=255) ttGATGTGGTTGGGGTAGACCGGCTGGCGGGTGTGGCGGCTGACGATGAGCTGCTCGACGATGCGTTCGATCGGCTCGTCGAGGTTGATGCCATCCACTTCGTTGCGCGGCACCAGGATGTCGTTGACGGTGATCTTGTCCAGCGACTg < 5:265365/149‑1 (MQ=255) tGTCGTTGTGGTAGACCGGCAGGCGGGTGTGGCGGCTGACGATCAGCTGCTCGACGATGCGTTCGATCGGCTCGTCGAGGTTGATGCCATCCACTTCGTTGCGCGGCACCAGGATGTCGTTGACGGTGATCTTGTCCAGCGACTGCAgg < 3:151618/149‑1 (MQ=255) tGTCGTTGTGGTAGACCGGCAGGCGGGTGTGGCGGCTGACGATCAGCTGCTCGACGATGCGTTCGATCGGCTCGTCGAGGTTGATGCCATCCACTTCGTTGCGCGGCACCAGGATGTCGTTGACGGTGATCTTGTCCAGCGACTGCAgg > 8:64658/1‑149 (MQ=255) tCGTTGTGGTAGACCGGCAGGCGGGTGTGGCGGCTGACGATCAGCTGCTCGACGATGCGTTCGATCGGCTCGTCGAGGTTGATGCCATCCACTTCGTTGCGCGGCACCAGGATGTCGTTGACGGTGATCTTGTCCAGCGACTGCAGGcc > 6:24526/1‑149 (MQ=255) gTTGTGGTAGACCGGCAGGCGGGTGTGGCGGCTGACGATCAGCTGCTCGACGATGCGTTCGATCGGCTCGTCGAGGTTGAt < 6:229592/81‑1 (MQ=255) gTTGTGGTAGACCGGCAGGCGGGTGTGGCGGCTGACGATCAGCTGCTCGACGATGCGTTCGATCGGCTCGTCGAGGTTGAt > 5:229592/1‑81 (MQ=255) gTTGTGGTAGACCGGCAGGCGGGTGTGGCGGCTGACGATCAGCTGCTCGACGATGCGTTCGATCGGCTCGTCGAGGTTGATGCCATCCACTTCGTTGCGCGGCACCAGGATGTCGTTGACGGTGATCtt < 7:145946/129‑1 (MQ=255) gTTGTGGTAGACCGGCAGGCGGGTGTGGCGGCTGACGATCAGCTGCTCGACGATGCGTTCGATCGGCTCGTCGAGGTTGATGCCATCCACTTCGTTGCGCGGCACCAGGATGTCGTTGACGGTGATCtt > 8:145946/1‑129 (MQ=255) gTTGTGGTAGACCGGCAGGCGGGTGTGGCGGCTGACGATCAGCTGCTCGACGATGCGTTCGATCGGCTCGTCGAGGTTGATGCCATCCACTTCGTTGCGCGGCACCAGGATGTCGTTGACGGTGATCTTGTCCAGCGACTGCAGGCCGt > 7:254703/1‑149 (MQ=255) tgGTAGACCGGCAGGCGGGTGTGGCGGCTGACGATCAGCTGCTCGACGATGCGTTCGATCGGCTCGTCGAGGTTGATGCCATCCACTTCGTTGCGCGGCACCAGGATGTCGTTGACGGTGATCTTGTCCAGCGACTGCAGGCCGTCGa < 1:81985/148‑1 (MQ=255) tgGTAGACCGGCAGGCGGGTGTGGCGGCTGACGATCAGCTGCGCGACGATGCGTTCGATCGGCTCGTCGAGGTTGATGCCATCCACTTCGTTGCGCGGCACCAGGATGTCGTTGACGGTGATCTTGTCCAGCGACTGCAGGCCGTCGa < 3:300198/148‑1 (MQ=255) gTAGACCGGCAGGCGGGTGTGGCGGCTGACGATCAGCTGCTCGACGATGCGTTCGATCGGCTCGTCGAGGTTGATGCCATCCACTTCGTTGCGCGGCACCAGGATGTCGTTGACGGTGATCTTGTCCAGCGACTGCAGGCCGTCGAg > 7:196107/1‑147 (MQ=255) gACCGGCAGGCGGGTGTGGCGGCTGACGATCAGCTGCTCGACGATGCGTTCGATCGGCTCTTCGAGGTTGATGCCATCCACTTCGTTGCGCGGCACCAGGATGTCGTTGACGGTGATCTTGTCCAGCGACTGCAGGCCGTCGAGCAGAc < 2:255832/149‑1 (MQ=255) ccGGCAGGCGGGTGTGGCGGCTGACGATCAGCTGCTCGACGATGCGTTCGATCGGCTCGTCGAGGTTGATGCCATCCACTTCGTTGCGCGGCACCAGGATGTCGTTGACGGTGATCTTGTCCAGCGACTGCAGGCCGTCGAGCAGAccc > 7:138326/1‑149 (MQ=255) gCGGGTGTGGCGGCTGACGATCAGCTGCTCGACGATGCGTTCGATCGGCTCGTCGAGGTTGATGCCATCCACTTCGTTGCGCGGCACCAGGATGTCGTTGACGGTGATCTTGTCCAGCGACTGCAGGCCGTCGAGCAGACCCTGGCGAg > 4:150790/1‑149 (MQ=255) ggcggcTGACGATCAGCTGCTCGACGATGCGTTCGATCGGCTCGTCGAGGTTGATGCCATCCACTTCGTTGCGCGGCACCAGGATGTCGTTGACGGTGATCTTGTCCAGCGACTGCAGGCCGTCGAGCAGACCCTGGCg < 8:135158/139‑1 (MQ=255) ggcggcTGACGATCAGCTGCTCGACGATGCGTTCGATCGGCTCGTCGAGGTTGATGCCATCCACTTCGTTGCGCGGCACCAGGATGTCGTTGACGGTGATCTTGTCCAGCGACTGCAGGCCGTCGAGCAGACCCTGGCg > 7:135158/1‑139 (MQ=255) gcggcTGACGATCAGCTGCTCGACGATGCGTTCGATCGGCTCGTCGAGGTTGATGCCATCCACTTCGTTGCGCGGCACCAGGATGTCGTTGACGGTGATCTTGTCCAGc > 2:246252/1‑109 (MQ=255) gcggcTGACGATCAGCTGCTCGACGATGCGTTCGATCGGCTCGTCGAGGTTGATGCCATCCACTTCGTTGCGCGGCACCAGGATGTCGTTGACGGTGATCTTGTCCAGc < 1:246252/109‑1 (MQ=255) gcggcTGACGATCAGCTGCTCGACGATGCGTTCGATCGGCTCGTCGAGGTTGATGCCATCCACTTCGTTGCGCGGCACCAGGATGTCGTTGACGGTGATCTTGTCCAGCGACTGCAGGCCGTCGAGCAGACCCTGGCGAGGCGCTTCGt < 8:254703/149‑1 (MQ=255) gcTGACGATCAGCTGCTCGACGATGCGTTCGATCGGCTCGTCGAGGTTGATGCCATCCACTTCGTTGCGCGGCACCAGGATGTCGTTGACGGTGATCTTGTCCAGCGACTGCAGGCCGTCGAGCAGACCCTGGCGAGGCGCTTCGTGCt < 7:135494/149‑1 (MQ=255) aCGATCAGCTGCTCGACGATGCGTTCGATCGGCTCGTCGAGGTTGATGCCATCCACTTCGTTGCGCGGCACCAGGATGTCGTTGACGGTGATCTTGTCCAGCGACTGCAGGCCGTCGAGCAGACCCTGGCGAGGCGCTTCGTGCTGtt > 6:215307/1‑148 (MQ=255) aCGATCAGCTGCTCGACGATGCGTTCGATCGGCTCGTCGAGGTTGATGCCATCCACTTCGTTGCGCGGCACCAGGATGTCGTTGACGGTGATCTTGTCCAGCGACTGCAGGCCGTCGAGCAGACCCTGGCGAGGCGCTTCGTGCTGt < 6:160941/147‑1 (MQ=255) gATCAGCTGCTCGACGATGCGTTCGATCGGCTCGTCGAGGTTGATGCCATCCACTTCGTTGCGCGGCACCAGGATGTCGTTGACGGTGATCTTGTCCAGCGACTGCAGGCCGTCGAGCAGACCCTGGCGAGGCGCTTCGTGCTGTTCAt > 3:186311/1‑149 (MQ=255) gATCAGCTGCTCGACGATGCGTTCGATCGGCTCGTCGAGGTTGATGCCATCCACTTCGTTGCGCGGCACCAGGATGTCGTTGACGGTGATCTTGTCCAGCGACTGCAGGCCGTCGAGCAGACCCTGGCGAGGCGCTTCGTGCTGTTCAt < 7:64658/149‑1 (MQ=255) tCAGCTGCTCGACGATGCGTTCGATCGGCTCGTCGAGGTTGATGCCATCCACTTCGTTGCGCGGCACCAGGATGTCGTTGACGGTGATCTTGTCCAGCGACTGCAGGCCGTCGAGCAGACCCTGGCGAGGCGCTTCGTGCTGTTCATcc < 4:186311/149‑1 (MQ=255) gctCGACGATGCGTTCGATCGGCTCGTCGAGGTTGATGCCATCCACTTCGTTGCGCGGCACCAGGATGTCGTTGACGGTGATCTTGTCCAGCGACTGCAGGCCGTCGAGCAGACCGTGGCTAGGCGCTTc < 8:172512/130‑1 (MQ=255) gctCGACGATGCGTTCGATCGGCTCGTCGAGGTTGATGCCATCCACTTCGTTGCGCGGCACCAGGATGTCGTTGACGGTGATCTTGTCCAGCGACTGCAGGCCGTCGAGCAGACCCTGGCTAGGCGCTTc > 7:172512/1‑130 (MQ=255) ctCGACGATGCGTTCGATCGGCTCGTCGAGGTTGATGCCATCCACTTCGTTGCGCGGCACCAGGATGTCGTTGACGGTGATCTTGTCCAGCGACTGCAGGCCGTCGAGCAGACCCTGGCGAGGCGCTTCGTGCTGTTCATCCTCATCg < 3:44771/148‑1 (MQ=255) tCGACGAGCCGATCGAACGCATCGTCGAGGTTGATGCCATCCACTTCGTTGCGCGGCACCAGGATGTCGTTGACGGTGATCTTGTCCAGCGACTGCAGGCCGTCGAGCAGACCCTGGCGAGGCGCTTCGTGCTGTTCATCCTCATCg > 5:55473/1‑147 (MQ=255) cgacgaTGCGTTCGATCGGCTCGTCGAGGTTGATGCCATCCACTTCGTTGCGCGGCACCAGGATGTCGTTGACGGTGATCTTGTCCAGCGACTGCAGGCCGTCGAGCAGACCCTGGCGAGGCGCTTCGTGCTGTTCATCCTCATCGAAg < 5:24526/149‑1 (MQ=255) gacgaTGCGTTCGATCGGCTCGTCGAGGTTGATGCCATCCACTTCGTTGCGCGGCACCAGGATGTCGTTGACGGTGATCTTGTCCAGCGACTGCAGGCCGTCGAGCAGACCCTGGCGAGGCGCTTCGTGCTGTTCATCCTCATCGaa < 5:215307/147‑1 (MQ=255) aTGCGTTCGATCGGCTCGTCGAGGTTGATGCCATCCACTTCGTTGCGCGGCACCAGGATGTCGTTGACGGTGATCTTGTCCAGCGACTGCAGGCCGTCGAGCAGACCCTGGCGAGGCGCTTCGTGCTGTTCATc < 5:18331/134‑1 (MQ=255) aTGCGTTCGATCGGCTCGTCGAGGTTGATGCCATCCACTTCGTTGCGCGGCACCAGCATGTCGTTGACGGTGATCTTGTCCAGCGACTGCAGGCCGTCGAGCAGACCCTGGCGAGGCGCTTCGTGCTGTTCATc > 6:18331/1‑134 (MQ=255) cGTTCGATCGGCTCGTCGAGGTTGATGCCATCCACTTCGTTGCGCGGCACCAGGATGTCGTTGACGGTGATCTTGTCCAGCGACTGCAGGCCGTCGAGCAGACCCTGGCGAGGCGCTTCGTGCTGTTCATCCTCATCGAAGTCGTCGGc < 2:151282/149‑1 (MQ=255) gATCGGCTCGTCGAGGTTGATGCCATCCACTTCGTTGCGCGGCACCAGGATGTCGTTGACGGTGATCTTGTCCAGCGACTGCAGGCCGTCGAGCAGACCCTGGCGAGGCGCTTCGTGCTGt < 1:45053/121‑1 (MQ=255) gATCGGCTCGTCGAGGTTGATGCCATCCACTTCGTTGCGCGGCACCAGGATGTCGTTGACGGTGATCTTGTCCAGCGACTGCAGGCCGTCGAGCAGACCCTGGCGAGGCGCTTCGTGCTGt > 2:45053/1‑121 (MQ=255) gATCGGCTCGTCGAGGTTGATGCCATCCACTTCGTTGCGCGGCACCAGGATGTCGTTGACGGTGATCTTGTCCAGCGACTGCAGGCCGTCGAGCAGACCCTGGCGAGGCGCTTCGTGCTGTTCATCCTCATCGAAGTCGTCGGcctcct < 3:301501/149‑1 (MQ=255) | TTCCAGGGTCAGCTCGGCCTTGGGCAGCAGGTGGCTGATCAGCTTGGTGTTGAGGATCGCTTCGACCTGGTTGATGTCGTTGTGGTAGACCGGCAGGCGGGTGTGGCGGCTGACGATCAGCTGCTCGACGATGCGTTCGATCGGCTCGTCGAGGTTGATGCCATCCACTTCGTTGCGCGGCACCAGGATGTCGTTGACGGTGATCTTGTCCAGCGACTGCAGGCCGTCGAGCAGACCCTGGCGAGGCGCTTCGTGCTGTTCATCCTCATCGAAGTCGTCGGCCTCCT > NC_002947/1665118‑1665404 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |