| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,693,866 | G→A | 8.4% | C112Y (TGC→TAC) | PP_1489 → | CheW domain‑containing protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,693,866 | 0 | G | A | 8.4% | 205.8 / 6.7 | 71 | C112Y (TGC→TAC) | PP_1489 | CheW domain‑containing protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (31/34); new base A (3/3); total (34/37) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.77e-01 | |||||||||||
CCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCG‑TTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGCCCGGTGCGCCAGGATGCCCAAGGCCTGCTGCAGCGCATCGAAGTCAATGACCTGCTGCCCGACACCGTGCACGCATTGCTGTACACGCA > NC_002947/1693720‑1694013 | ccAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCG‑TTGc > 2:58531/1‑148 (MQ=255) cAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCG‑TTAcc > 7:69168/1‑148 (MQ=255) gTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCG‑TTGCCAACCGGa > 3:127613/1‑149 (MQ=255) ggTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCG‑TTGCCAACCGGACGAGt > 4:18018/1‑149 (MQ=255) aTCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCG‑TTGCCAACCGGACGAGTTCCa < 6:113180/149‑1 (MQ=255) gACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCG‑TTGCCAACCGGACGAGTTCCAGcc > 5:340606/1‑149 (MQ=255) ttGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCG‑TTACCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTAt < 8:69168/149‑1 (MQ=255) ccgccTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCG‑TTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATggg < 4:127613/149‑1 (MQ=255) ccgccTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCG‑TTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATggg < 2:54134/149‑1 (MQ=255) cgccTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCG‑TTGCCAACCGGACGAGTTCCAGcc < 2:215481/141‑1 (MQ=255) cgccTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCG‑TTGCCAACCGGACGAGTTCCAGcc > 1:215481/1‑141 (MQ=255) gccTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCG‑TTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATGGGGt > 3:318359/1‑149 (MQ=255) gccTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCG‑TTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATGGGGt < 3:209624/149‑1 (MQ=255) aGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCG‑TTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATGGGGTGGacac < 8:136272/149‑1 (MQ=255) gCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCG‑TTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATGGGGTGGAcaca < 1:58531/149‑1 (MQ=255) cTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCG‑TTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATGGGGTGGACACAg < 5:106119/149‑1 (MQ=255) cTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCG‑TTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATGGGGTGGACACAg > 3:182810/1‑149 (MQ=255) gCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCG‑TTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATGGGGTGGACACAGGCGAt < 7:300812/149‑1 (MQ=255) cAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCG‑TTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATgc > 8:223192/1‑149 (MQ=255) cAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCG‑TTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATgc > 1:51547/1‑149 (MQ=255) aGCCGGCGGTTCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGATTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATgc < 1:80946/149‑1 (MQ=255) gCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCG‑TTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATgcgc < 2:51547/149‑1 (MQ=255) cggTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCG‑TTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTAt < 6:108912/149‑1 (MQ=255) gTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCG‑TTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCt < 4:182810/149‑1 (MQ=255) cAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCG‑TTGCCAACCGGAc < 5:283583/102‑1 (MQ=255) cAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCG‑TTGCCAACCGGAc > 6:283583/1‑102 (MQ=255) aaCGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCG‑TTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGc < 7:223192/149‑1 (MQ=255) aaCGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCG‑TTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGc > 6:258220/1‑149 (MQ=255) cACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCG‑TTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGCCCgg < 4:318359/149‑1 (MQ=255) aCCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCG‑TTACCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGc > 6:289809/1‑144 (MQ=255) aCCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCG‑TTACCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGc < 5:289809/144‑1 (MQ=255) ccAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCG‑TTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGCCCGGTg > 1:224344/1‑149 (MQ=255) cACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGCAACCCTGCG‑TTACCACCCGGACGAGTTCCAGCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGCCCGGTgcgc > 5:150427/1‑148 (MQ=255) ccGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCG‑TTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATGGGGTg > 4:70456/1‑109 (MQ=255) ccGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCG‑TTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATGGGGTg < 3:70456/109‑1 (MQ=255) gCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCG‑TTGCCAACCGGGCGAGTTCCAGCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGCCCGGTGCGCCAGGAt < 7:122667/149‑1 (MQ=255) ccTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCG‑TTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGCCCGGTGCGCCAGGATg < 2:224344/149‑1 (MQ=255) gggtgctggtgcACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCG‑TTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGCCCGGTGCGCCAGGAt > 6:29868/2‑146 (MQ=255) gggtgctggtgcACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCG‑TTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGCCCGGTGCGCCAGGAt < 5:29868/145‑1 (MQ=255) gctggtgcACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCG‑TTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGCCCGGTGCGCCAGGATGCCCAAg < 6:340606/149‑1 (MQ=255) ctggtgcACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCG‑TTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGCCCGGTGCGCCAGGATGCCCAAgg < 6:298092/149‑1 (MQ=255) tggtgcACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCG‑TTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGCCCGGTGCGCCAGGATGCCCAAGGc > 5:50301/1‑149 (MQ=255) ggtgcACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCG‑TTGCCAACCGGAc < 8:212356/76‑1 (MQ=255) ggtgcACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCG‑TTGCCAACCGGAc > 7:212356/1‑76 (MQ=255) gtgcACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCG‑TTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATGGGGTGGCCACAGGCGAAGCGCCTTATAGGGCCCCGGTGCGCCAGGATGCCCAAGGcat > 7:211271/1‑147 (MQ=255) gtgcACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCG‑TTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGCCCGGTGCGCCAGGATGCCCaa < 3:238032/144‑1 (MQ=255) gtgcACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCG‑TTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGCCCGGTGCGCCAGGATGCCCaa > 4:238032/1‑144 (MQ=255) cTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCG‑TTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATGGGCTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGCCCGGTGCGCCAGGATGCCCAAGGCctgctg > 5:126582/1‑148 (MQ=255) tACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCG‑TTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGCCCGGTGCGCCAGGATGCCCAAGGCctgctg > 4:279048/1‑147 (MQ=255) aCCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCG‑TTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGCCCGGTGCGCCAGGATGCCCAAGGCCTGCTGCAg > 3:224819/1‑149 (MQ=255) ccGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCG‑TTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGCCCGGTGCGCCAGGATGCCCAAGGCCTGCTGCAgc < 6:50301/149‑1 (MQ=255) cGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCG‑TTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGCCCGGTGCGCCAGGATGCCCAAGGCCTGCTGCAgcg > 2:336044/1‑149 (MQ=255) aGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCG‑TTGCCAACCGGACGAGTTCCAg < 4:24131/73‑1 (MQ=255) aGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCG‑TTGCCAACCGGACGAGTTCCAg > 3:24131/1‑73 (MQ=255) aGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCG‑TTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGCCCGGTGCGCCAGGATGCCCAAGGCCTGCTGCAGCGCa > 7:264963/1‑149 (MQ=255) ggcCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCG‑TTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGCCCGGTGCGCCAGGATGCCCAAGGCCTGCTGCAGCGCATCg > 4:241639/1‑148 (MQ=255) cTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCG‑TTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGCCCGGTGCGCCAGGATGCCCAAGGCCTGCTGCAGCGCATCGAAg > 4:32506/1‑148 (MQ=255) cAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCG‑TTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGCCCGGTGCGCCAGGATGCCCAAGGCCTGCTGCAGCGCATCGAAGTCaa < 3:241639/149‑1 (MQ=255) aTCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCG‑TTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGCCCGGTGCGCCAGGATGCCCAAGGCCTGCTGCAGCGCATCGAAGTCAATGACctgctg < 6:126582/147‑1 (MQ=255) cTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCG‑TTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGCCCGGTGCGCCAGGATGCCCAAGGCCTGCTGCAGCGCATCGAAGTCAAt > 8:65003/1‑135 (MQ=255) cTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCG‑TTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGCCCGGTGCGCCAGGATGCCCAAGGCCTGCTGCAGCGCATCGAAGTCAAt < 7:65003/135‑1 (MQ=255) cTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCG‑TTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGCCCGGTGCGCCAGGATGCCCAAGGCCTGCTGCAGCGCATCGAAGTCAATGACCTGCTGCCCGa < 3:32506/149‑1 (MQ=255) gAGCAGGCCACCGAAACCCTGCG‑TTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGCCCGGTGCGCCAGGATGCCCAAGGCCTGCTGCAGCGCATCGAAGTCAATGACCTGCTGCCCGaca < 1:332594/148‑1 (MQ=255) aGCAGGCCACCGAAACCCTGCG‑TTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGCCCGGTGCGCCAGGATGCCCAAGGCCTGCTGCAGCGCATCGAAGTCAATGACCTGCTGCCCGACAcc > 6:30403/1‑149 (MQ=255) aGCAGGCCACCGAAACCCTGCG‑TTACCAACCGGACGAGGTCCAGCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGCCCGGTGCGCCAGGATGCCCAAGGCCTGCTGCAGCGCATCGAAGTCAATGACCTGCTGCCCGACAcc < 6:150427/149‑1 (MQ=255) aaCCCTGCG‑TTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGCCCGGTGCGCCAGGATGCCCAAGGCCTGCTGCAGCGCATCGAAGTCAATGACCTGCTGCCCGACACCGTGCACGCATTg < 1:336044/148‑1 (MQ=255) aCCCTGCG‑TTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGCCCGGTGCGCCAGGATGCCCAAGGCCTGCTGCAGCGCATCGAAGTCAATGACCTGCTGCCCGACACCGTGCACGCATTGCt < 4:224819/149‑1 (MQ=255) ccTGCG‑TTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGCCCGGTGCGCCAGGATGCCCAAGGCCTGCTGCAGCGCATCGAAGTCAATGACCTGCTGCCCGACACCGTGCACGCATTGCTg > 7:315159/1‑148 (MQ=255) ccTGCG‑TTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGCCCGGTGCGCCAGGATGCCCAAGGCCTGCTGCAGCGCATCGAAGTCAATGACCTGCTGCCCGACACCGTGCACGCATTGCTg > 7:93332/1‑148 (MQ=255) tGCG‑TTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGCCCGGTGCGCCAGGATGCCCAAGGCCTGCTGCAGCGCATCGAAGTCAATGACCTGCTGCCCGACACCGTGCACGCATTGCTGTa > 3:47322/1‑148 (MQ=255) cG‑TTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGCCCGGTGCGCCAGGATGCCCAAGGCCTGCTGCAGCGCATCGAAGTCAATGACCTGCTGCCCGACACCGTGCACGCATTGCTGTaca < 5:258220/148‑1 (MQ=255) gCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGCCCGGTGCGCCAGGATGCCCAAGGCCTGCTGCAGCGCATCGAAGTCAATGACCTGCTGCCCGACACCGTGCACGCATTGCTGTACACGCa < 4:47322/148‑1 (MQ=255) | CCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCG‑TTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGCCCGGTGCGCCAGGATGCCCAAGGCCTGCTGCAGCGCATCGAAGTCAATGACCTGCTGCCCGACACCGTGCACGCATTGCTGTACACGCA > NC_002947/1693720‑1694013 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |