| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,744,888 | T→A | 6.7% | intergenic (‑14/+327) | PP_1542 ← / ← PP_1543 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,744,888 | 0 | T | A | 6.7% | 220.3 / 5.0 | 74 | intergenic (‑14/+327) | PP_1542/PP_1543 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (33/36); new base A (2/3); total (35/39) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.55e-01 | |||||||||||
GTTGTTGGCGTCGTCATAGCCTGGGCTGGTGAGGAAATGGTTTCTGTTGCCGGTACGGCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCAGTCAACGAGATGAATACCCGATGGACCGCGAGCCAACAAACCAGGAAATCGCAGCAGCTCTCGGCATTGATGAGGATCAG > NC_002947/1744740‑1745029 | gttgttGGCGTCGTCATAGCCTGGGCTGGTGAGGAAATGGTTTCTGTTGCCGGTACGGCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCtt < 8:202553/149‑1 (MQ=255)gttgttGGCGTCGTCATAGCCTGGGCTGGTGAGGAAATGGTTTCTGTTGCCGGTACGGCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCtt > 3:78721/1‑149 (MQ=255) aTAGCCTGGGCTGGTGAGGAAATGGTTTCTGTTGCCGGTACGGCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGc < 4:78721/148‑1 (MQ=255) aTAGCCTGGGCTGGTGAGGAAATGGTTTCTGTTGCCGGTACGGCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGc < 2:97879/148‑1 (MQ=255) aTAGCCTGGGCTGGTGAGGAAATGGTTTCTGTTGCCGGTACGGCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCCAAGCCGgtgcttgca < 4:230565/148‑7 (MQ=255) tAGCCTGGGCTGGTGAGGAAATGGTTTCTGTTGCCGGTACGGCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCt > 3:28594/1‑149 (MQ=255) gCCTGGGCTGGTGAGGAAATGGTTTCTGTTGCCGGTACGGCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGa < 7:314651/149‑1 (MQ=255) cTGGGCTGGTGAGGAAATGGTTTCTGTTGCCGGTACGGCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATa < 4:28594/149‑1 (MQ=255) tGGGCTGGTGAGGAAATGGTTTCTGTTGCCGGTACGGCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAg > 8:260591/1‑149 (MQ=255) tGGGCTGGTGAGGAAATGGTTTCTGTTGACGGTACGGCATCCCGGGTTCAGTCACAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCGTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATat > 4:194036/1‑148 (MQ=255) gggCTGGTGAGGAAATGGTTTCTGTTGCCGGTACGGCATCACGGGTTCAGTCACAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATAATGGCTTTCTCCATGCAAGCACAGGCTTGGACGGTGTTGTGCCTGATAGt > 8:45960/1‑149 (MQ=255) ggCTGGTGAGGAAATGGTTTCTGTTGCCGGTACGGCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTg < 6:201266/149‑1 (MQ=255) cTGGTGAGGAAATGGTTTCTGGTGCCGGTACGGCATCCCGGGTTCAGTCGCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGc < 8:79905/149‑1 (MQ=255) ttGAGGAAATGGTTTCTGTTGCCGGTACGCCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAAt < 5:308233/148‑1 (MQ=255) gAGGAAATGGTTTCTGTTGCCGGTACGGCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAAtt > 4:265585/1‑148 (MQ=255) ggAAATGGTTTCTGTTGCCGGTACGGCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTaa < 7:260591/149‑1 (MQ=255) gAAATGGTTTCTGTTGCCGGTACGGCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAAt > 3:201727/1‑149 (MQ=255) aaaTGGTTTCTGTTGCCGGTACGGCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATg > 1:4459/1‑149 (MQ=255) aTGGTTTCTGTTGCCGGTACGGCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATgg > 5:61242/1‑148 (MQ=255) ggTTTCTGTTGCCGGTACGGCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGGTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCGTGATAGTGGCAATTTAATGGCAt > 5:39113/1‑149 (MQ=255) tttCTGTTGCCGGTACGGCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTaa < 1:198722/141‑1 (MQ=255) tttCTGTTGCCGGTACGGCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTaa > 2:198722/1‑141 (MQ=255) ttCTGTTGCCGGTACGGCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTg > 2:76868/1‑149 (MQ=255) cTGTTGCCGGTACGGCATCCCGGGTTGAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAATCACCGGCTTGTCCGGTGTTGTGCCTTATAGTGGCAATTTAATGGCATTTgg < 7:45960/148‑1 (MQ=255) ggCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTaa < 2:78668/149‑1 (MQ=255) ggCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTaa > 2:88984/1‑149 (MQ=255) aaccccGGATCAGTCCCAAGGTGTCCCAGAGCAACTCGAGCTGCTACTCGGTGGCTTCCATCATCGCTTACTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGCACTTCTGCCTCATAGTGGCAATTTAAAGGCAATTGGGTTTTAGAATGAAATAc > 6:140103/3‑149 (MQ=255) aTCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATAc < 7:286308/149‑1 (MQ=255) ccGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCa < 6:61242/148‑1 (MQ=255) ttCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCAGTCAAc < 8:20798/149‑1 (MQ=255) aggtccAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCTGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCAGTCAACga < 8:130720/144‑1 (MQ=255) gTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATATCAGTCAACgaga < 4:167292/149‑1 (MQ=255) gTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCAGTCAACgaga < 3:265585/149‑1 (MQ=255) tCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTattgatt > 8:184235/1‑129 (MQ=255) tCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTattgatt < 7:184235/129‑1 (MQ=255) cAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCAGTCAACGAGATGaa > 5:128899/1‑149 (MQ=255) aaGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATa < 1:253045/93‑1 (MQ=255) ccAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCAGTCAACGAGATGAATAcc > 5:149197/1‑144 (MQ=255) ccAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCAGTCAACGAGATGAATAcc < 6:149197/144‑1 (MQ=255) ccAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCAGTCAACGAGATGAATACCCGATg < 6:193736/149‑1 (MQ=255) gCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTatt < 7:272749/108‑1 (MQ=255) gCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTatt > 8:272749/1‑108 (MQ=255) cAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCAGTCAACGAGATGAATACCCGATGGACcgc > 2:329685/1‑149 (MQ=255) cAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCAGTCAACGAGATGAATACCCGATGGACcgc < 1:329685/149‑1 (MQ=255) cAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCAGTCAACGAGATGAATACCCGATGGACcgc > 4:28184/1‑149 (MQ=255) gTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCAGt > 3:265584/1‑119 (MQ=255) gTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCAGt < 4:265584/119‑1 (MQ=255) gTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCAGTCAACGAGATGAATACCCGATGGACCGCGAg > 4:309682/1‑149 (MQ=255) gAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCAGTCAACGAGATGAATACCCGATGGACCGCGAGcc > 6:320974/1‑148 (MQ=255) ctTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCAGTCAACGAGATGAATACCCGATGGACCGCGAGCCAACAAAc > 3:20771/1‑149 (MQ=255) ttCTCGGTGGCTTCGATAATGGATTTAACCATGCAATCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATATTGGCAATTTAAAGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATAACATTCAACGAGATGAATGCCAGATGGACCGCGAGCCAGCACAcc > 6:173902/1‑149 (MQ=255) ctcGGTTGCTTCGATCATGGCTTTCACCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAAATTAATGGCATTCGTGTTATTGATTGTAATACCAGTCAACGAGATGAATACCCGATGGACCGCGACCCAACAAACCa < 5:173902/148‑1 (MQ=255) ctcGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCAGTCAACGAGATGAATACCCGATGGACCGCGAGCCAACAAACCa < 3:28184/148‑1 (MQ=255) ctcGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCAGTCAACGAGATGAATACCCGATGGACCGCGAGCCAACAAACCa < 4:201727/148‑1 (MQ=255) ggTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCAGTCAACGAGATGAATACCCGATGGACCGCGAGCCAACAAACCAgg < 1:76868/147‑1 (MQ=255) ggTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCAGTCAACGAGATGAATACCCGATGGACCGCGAGCCAACAAACCAg < 2:4459/146‑1 (MQ=255) ttCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCAGTCAACGAGATGAATACCCGATGGACCGCGAGCCAACAAACCAGGAAATCg > 5:295759/1‑147 (MQ=255) 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tGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCAGTCAACGAGATGAATACCCGATGGACCGCGAGCCAACAAACCAGGAAATCGCAGCAGCTCTCGGCATtgatga < 4:20771/149‑1 (MQ=255) tGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCAGTCAACGAGATGAATACCCGATGGACCGCGAGCCAACAAACCAGGAAATCGCAGCAGCTCTCGGCATtgatga < 8:181774/149‑1 (MQ=255) gCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCAGTCAACGAGATGAATACCCGATGGACCGCGAGCCAACAAACCAGGAAATc < 6:114175/125‑1 (MQ=255) cacaacACCGGCCAAGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCAGTCAACGAGATGAATACCCGATGGACCGCGAGCCAACAAACCAGGAAATCgtagc < 6:341351/125‑1 (MQ=255) cacaacACCGGCCAAGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCAGTCAACGAGATGAATACCCGATGGACCGCGAGCCAACAAACCAGGAAATCgtagc > 5:341351/6‑130 (MQ=255) cacaacACCGGCCAAGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCAGTCAACGAGATGAATACCCGATGGACCGCGAGCCAACAAACCAGGAAATCgcagc > 5:99574/6‑130 (MQ=255) cacaacACCGGCCAAGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCAGTCAACGAGATGAATACCCGATGGACCGCGAGCCAACAAACCAGGAAATCgcagc < 6:99574/125‑1 (MQ=255) cAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCAGTCAACGAGATGAATACCCGATGGACCGCGAGCCAACAAACCAGGAAATCGCAGCAGCTCTCGGCATTGATGAg > 6:88735/1‑148 (MQ=255) aCCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCAGTCAACGAGATGAATACCCGATGGACCGCGAGCCAACAAACCAGGAAATCGCAGCAGCTCTCGGCATTGATGAGGa < 2:343980/145‑1 (MQ=255) aCCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCAGTCAACGAGATGAATACCCGATGGACCGCGAGCCAACAAACCAGGAAATCGCAGCAGCTCTCGGCATTGATGAGGa > 1:343980/1‑145 (MQ=255) aCCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCAGTCAACGAGATGAATACCCGATGGACCGCGAGCCAACAAACCAGGAAATCGCAGCAGCTCTCGGCATTGATGAGGATCAg > 6:118044/1‑149 (MQ=255) gCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGt < 7:11296/58‑1 (MQ=255) gCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGt > 8:11296/1‑58 (MQ=255) | GTTGTTGGCGTCGTCATAGCCTGGGCTGGTGAGGAAATGGTTTCTGTTGCCGGTACGGCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCAGTCAACGAGATGAATACCCGATGGACCGCGAGCCAACAAACCAGGAAATCGCAGCAGCTCTCGGCATTGATGAGGATCAG > NC_002947/1744740‑1745029 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |