Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,886,878 | G→A | 8.2% | A1132V (GCA→GTA) | PP_1695 ← | sodium‑solute symporter/two‑component system sensor histidine kinase/response regulator |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,886,878 | 0 | G | A | 8.2% | 174.2 / 3.1 | 60 | A1132V (GCA→GTA) | PP_1695 | sodium‑solute symporter/two‑component system sensor histidine kinase/response regulator |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (28/27); new base A (2/3); total (30/30) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.97e-01 |
GAGCTTGCCGGCAGACCTGCTGGAGCGGGCGCTGTCCGATGAGGCGCTGCCCGAGGTAGCGGTTACTGAGCCAGGCTCAGATGGCGATTGAGCAGGGCGCGCAAGGCCGCAGGCTTGACCGGTTTGGCCAGGTAGTCCAGCCCTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGCCGTCGGCGCTGATCACTACACCGGGTACCGGCTCACCCAGCCGTGCTCGAAGCCAGCCCATCAGCCCGGTGCCGGTCTCGCCGTCGTCCAGGTGGTAGTCCACCAATGCCAGGTGCG > NC_002947/1886731‑1887025 | gagCTTGCCGGCAGACCTGCTGGAGCGGGCGCTGTCCGATGAGGCGCTGCCCGAGGTAGCGGTTACTGAGCCAGGCTCAGATGGCGATTGAGCAGGGCGCGCAAGGCCGCAGGCTTGACCGGTTTGGCCAGGTAGTCCAGCCCTGATGc < 7:282673/149‑1 (MQ=255) cGGCAGACCTGCTGGAGCGGGCGCTGTCCGATGAGGCGCTGCCCGAGGTAGCGGTTACTGAGCCAGGCTCAGATGGCGATTGAGCAGGGCGCGCAAGGCCGCAGGCTTGACCGGTTTGGCCAGGTAGTCCAGCCCTGATGCATGTAc > 4:262228/1‑147 (MQ=255) gACCTGCTGGAGCGGGCGCTGTCCGATGAGGCGCTGCCCGAGGTAGCGGTTACTGAGCCAGGCTCAGATGGCGATTGAGCAGGGCGCGCAAGGCCGCAGGCTTGACCGGTTTGGCCAGGTAGTCCAGCCCTGGTACATGCATCAGGGct < 3:222300/149‑2 (MQ=255) gACCTGCTGGAGCGGGCGCTGTCCGATGAGGCGCTGCCCGAGGTAGCGGTTACTGAGCCAGGCTCAGATGGCGATTGAGCAGGGCGCGCAAGGCCGCAGGCTTGACCGGTTTGGCCAGGTAGTCCAGCCCTGGTACATGCATCAGGGct < 5:329028/149‑2 (MQ=255) aCCTGCTGGAGCGGGCGCTGTCCGATGAGGCGCTGCCCGAGGTAGCGGTTACTGAGCCAGGCTCAGATGGCGATTGAGCAGGGCGCGCAAGGCCGCAGGCTTGACCGGTTTGGCCAGGTAGTCCAGCCCTGATGCATGTACCAGGGCGa > 6:133094/1‑149 (MQ=255) ccTGCTGGAGCGGGCGCTGTCCGATGAGGCGCTGCCCGAGGTAGCGGTTACTGAGCCAGGCTCAGATGGCGATTGAGCAGGGCGCGCAAGGCCGCAGGCTTGACCGGTTTGGCCAGGTAGTCCAGCCCTGATGCATGTACCAGGGCGAt < 4:261248/149‑1 (MQ=255) gAGCGGGCGCTGTCCGATGAGGCGCTGCCCGAGGTAGCGGTTACTGAGCCAGGCTCAGATGGCGATTGAGCAGGGCGCGCAAGGCCGCAGGCTTGACCGGTTTGGCCAGGTAGTCCAGCCCTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTcc > 4:297284/1‑149 (MQ=255) gCGGGCGCTGTCCGATGAGGCGCTGCCCGAGGTAGCGGTTACTGAGCCAGGCTCAGATGGCGATTGAGCAGGGCGCGCAAGGCCGCAGGCTTGACCGGTTTGGCCAGGTAGTCCAGCCCTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCtt > 5:151347/1‑149 (MQ=255) cGGGCGCTGTCCGATGAGGCGCTGCCCGAGGTAGCGGTTACTGAGCCAGGCTCAGATGGCGATTGAGCAGGGCGCGCAAGGCCGCAGGCTTGACCGGTTTGGCCAGGTAGTCCAGCCCTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCTtg > 5:102219/1‑149 (MQ=255) tGTCCGATGAGGCGCTGCCCGAGGTAGCGGTTACTGAGCCAGGCTCAGATGGCGATTGAGCAGGGCGCGCAAGGCCGCAGGCTTGACCGGTTTGGCCAGGTAGTCCAGCCCTGGTACATGCATCAGGGct > 4:176406/1‑129 (MQ=255) tGTCCGATGAGGCGCTGCCCGAGGTAGCGGGTACTGAGCCAGGCTCAGATGGCGATTGAGCAGGGCGCGCAAGGCCGCAGGCTTGACCGGTTTGGCCAGGTAGTCCAGCCCTGGTACATGCATCAGGGct < 3:176406/130‑2 (MQ=255) cGATGAGGCGCTGGCCGTGGTAGCGGTTACTGAGCCAGGCTCAGATGGCGATTGTGCAGGGCGCGCAAGGCCGCAGGGTTGACCGGTTTGGCCTGGTAGTCCAGCCCTGATGCATGTAGCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGCCGTCgg < 3:283609/148‑1 (MQ=255) cGATGAGGCGCTGCCCGAGGTAGCGGTTACTGAGCCAGGCTCAGATGGCGATTGAGCAGGGCGCGCAAGGCCGCAGGCTTGACCGGTTTTGCCAGGTAGTCCAGCCCTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGTCGTCGgc > 4:176825/1‑149 (MQ=255) cGATGAGGCGCTGCCCGAGGTAGCGGTTACTGAGCCAGGCTCAGATGGCGATTGAGCAGGGCGCGCAAGGCCGCAGGCTTGACCGGTTTGGCCAGGTAGTCCAGCCCTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGCCGTCGgc > 6:146132/1‑149 (MQ=255) gATGAGGCGCTGCCCGAGGTAGCGGTTACTGAGCCAGGCTCAGATGGCGATTGAGCAGGGCGCGCAAGGCCGCAGGCTTGACCGGTTTGGCCAGGTAGTCCAGCCCTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGCCGTCGgcg > 6:273628/1‑149 (MQ=255) aTGAGGCGCTGCCCGAGGTAGCGGTTACTGAGCCAGGCTCAGATGGCGATTGAGCAGGGCGCGCAAGGCCGCAGGCTTGACCGGTTTGGCCAGGTAGTCCAGCCCTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGCCGTCGgcgc < 6:260555/149‑1 (MQ=255) aGGCGCTGCCCGAGGTAGCGGTTACTGAGCCAGGCTCAGATGGCGATTGAGCAGGGCGCGCAAGGCCGCAGGCTTGACCGGTTTGGCCAGGTAGTCCAGCCCTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGCCGTCGGCGCTGa < 4:291612/149‑1 (MQ=255) ggCGCTGCCCGAGGTAGCGGTTACTGAGCCAGGCTCAGATGGCGATTGAGCAGGGCGCGCAAGGCCGCAGGCTTGACCGGTTTGGCCAGGTAGTCCAGCCCTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGCCGTCGGCGCTGAt > 8:202555/1‑149 (MQ=255) gcTGCCCGAGGTAGCGGTTACTGAGCCAGGCTCAGATGGCGATTGAGCAGGGCGCGCAAGGCCGCAGGCTTGACCGGTTTGGCCAGGTAGTCCAGCCCTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGCCGTCGGCGCTGATCAc > 2:69664/1‑149 (MQ=255) ccGAGGTAGCGGTTACTGAGCCAGGCTCAGATGGCGATTGAGCAGGGCGCGCAAGGCCGCAGGCTTGACCGGTTTGGCCAGGTAGTCCAGCCCTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGCCGTCGGCGCTGATCACTacac < 3:297284/149‑1 (MQ=255) cGAGGTAGCGGTTACTGAGCCAGGCTCAGATGGCGATTGAGCAGGGCGCGCAAGGCCGCAGGCTTGACCGGTTTGGCGAGGTAGTCCAGCCCTGTTAGATGTACCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGCCGTCGGCGCTGATCACTACAcc > 1:111155/1‑149 (MQ=255) ggTAGCGGTTACTGAGCCAGGCTCAGATGGCGATTGAGCAGGGCGCGCAAGGCCGCAGGCTTGACCGGTTTGGCCAGGTAGTCCAGCCCTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGCCGTCGGCGCTGATCACTACACCggg < 5:146132/149‑1 (MQ=255) gCGGTTACTGAGCCAGGCTCAGATGGCGATTGAGCAGGGCGCGCAAGGCCGCAGGCTTGACCGGTTTGGCCAGGTAGTCCAGCCCTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGCCGTCGGCGCTGATCACTACACCGGGTAcc < 5:133094/149‑1 (MQ=255) cTGAGCCAGGCTCAGATGGCGATTGAGCAGGGCGCGCAAGGCCGCAGGCTTGACCGGTTTGGCCAGGTAGTCCAGCCCTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGTCGTCGGCGCTGATCACTACACCGGGTACCGGCTCAc < 3:176825/149‑1 (MQ=255) tGAGCCAGGCTCAGATGGCGATTGAGCAGGGCGCGCAAGGCCGCAGGCTTGACCGGTTTGGCCAGGTAGTCCAGCCCTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGCCGTCGGCGCTGATCACTACAcc > 1:142184/1‑134 (MQ=255) tGAGCCAGGCTCAGATGGCGATTGAGCAGGGCGCGCAAGGCCGCAGGCTTGACCGGTTTGGCCAGGTAGTCCAGCCCTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGCCGTCGGCGCTGATCACTACAcc < 2:142184/134‑1 (MQ=255) aGCCAGGCTCAGATGGCGATTGAGCAGGGCGCGCAAGGCCGCAGGCTTGACCGGTTTGGCCAGGTAGTCCAGCCCTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGCCGTCGGCGCTGATCACTACACCGGGTACCGGCTCAccc < 6:151347/148‑1 (MQ=255) aGCCAGGCTCAGATGGCGATTGAGCAGGGCGCGCAAGGCCGCAGGCTTGACCGGTTTGGCCAGGTAGTCCAGCCCTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGCCGTCGGCGCTGATCACTACACCGGGTACCGGCTCACCCa > 6:129612/1‑149 (MQ=255) cAGGCTCAGATGGCGATTGAGCAGGGCGCGCAAGGCCGCAGGCTTGACCGGTTTGGCCAGGTAGTCCAGCCCTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGCCGTCGGCGCTGATCACTACACCGGGTACCGGCTCACCCAGcc < 3:262228/149‑1 (MQ=255) cAGGCTCAGATGGCGATTGAGCAGGGCGCGCAAGGCCGCAGGCTTGACCGGTTTGGCCAGGTAGTCCAGCCCTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGCCGTCGGCGCTGATCACTACACCGGGTACCGGCTCACCCAGcc > 4:258244/1‑149 (MQ=255) aTGGCGATTGAGCAGGGCGCGCAAGGCCGCAGGCTTGACCGGTTTGGCCAGGTAGTCCAGCCCTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGCCGTCGGCGCTGATCACTACACCGGGTACCGGCTCACCCAGCCGTGCTCGaa < 7:228361/149‑1 (MQ=255) gATTGAGCAGGGCGCGCAAGGCCGCAGGCTTGACCGGTTTGGCCAGGTAGTCCAGCCCTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGCCGTCGGCGCTGATCACTACACCGGGTACCGGc < 2:291084/125‑1 (MQ=255) gAGCAGGGCGCGCAAGGCCGCAGGCTTGACCGGTTTGGCCAGGTAGTCCAGCCCTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGCCGTCGGCGCTGATCACTACACCGGGTACCGGCTCACCCAGCCGTGCTCGa > 6:231279/1‑139 (MQ=255) gAGCAGGGCGCGCAAGGCCGCAGGCTTGACCGGTTTGGCCAGGTAGTCCAGCCCTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGCCGTCGGCGCTGATCACTACACCGGGTACCGGCTCACCCAGCCGTGCTCGa < 5:231279/139‑1 (MQ=255) cAGGGCGCGCAAGGCCGCAGGCTTGACCGGTTTGGCCAGGTAGTCCAGCGCTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGCCGTCGGCGCTGATCACTACACCGGGTACCGGCTCACCCAGCCGTGCTCGAAGCCAGCCCATCa < 5:273628/149‑1 (MQ=255) aGGGCGCGCAAGGCCGCAGGCTTGACCGGTTTGGCCAGGTAGTCCAGCCCTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGCCGTCGGCGCTGATCACTACACCGGGTACCGGCTCACCCAGCCGTGc > 4:224017/1‑131 (MQ=255) aGGGCGCGCAAGGCCGCAGGCTTGACCGGTTTGGCCAGGTAGTCCAGCCCTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGCCGTCGGCGCTGATCACTACACCGGGTACCGGCTCACCCAGCCGTGc < 3:224017/131‑1 (MQ=255) gggCGCGCAAGGCCGCAGGCTTGACCGGTTTGGCCAGGTAGTCTAGCCCTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGCCGTCGGCGCTGATCACTACACCGGGTACCGGCTCACCCAGCCGTGCTCGAAGCCAGCCCATCAGc > 2:82907/1‑149 (MQ=255) ggCGCGCAAGGCCGCAGGCTTGACCGGTTTGGCCAGGTAGTCCAGCCCTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGCCGTCGGCGCTGATCACTACACCGGGTACCGGCTCACCCAGCCGTGCTCGAAGCCAGCCCATCAGcc > 2:163878/1‑149 (MQ=255) cgcAAGGCCGCAGGCTTGACCGGTTTGGCCAGGTAGTCCAGCCCTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGCCGTCGGCGCTGATCACTACACCGGGTACCGGCTCAACCAGCCGTGCTCGAAGCCAGCCCATCAGCCCGGt > 7:90496/1‑149 (MQ=255) gcAAGGCCGCAGGCTTGACCGGTTTGGCCAGGTAGTCCAGCCCTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGCCGTCGGCGCTGATCACTACACCGGGTACCGGCTCACCCAGCCGTGCTCGAAGCCAGCCCATCAGCCCGGTg > 6:269353/1‑149 (MQ=255) aaGGCCGCAGGCTTGACCGGTTTGGCCAGGTAGTCCAGCCCTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGCCGTCGGCGCTGATCACTACACCGGGTACCGGCTCACCCAGCCGTGCTCGAAGCCAGCCCATCAGCCCGGTGcc > 2:111677/1‑149 (MQ=255) aaGGCCGCAGGCTTGACCGGTTTGGCCAGGTAGTCCAGCCCTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGCCGTCGGCGCTGATCACTACACCGGGTACCGGCTCACCCAGCCGTGCTCGAAGCCAGCCCATCAGCCCGGTGcc < 4:50355/149‑1 (MQ=255) gCCGCAGGCTTGACCGGTTTGGCCAGGTAGTCCAGCCCTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGCCGTCGGCGCTGATCACTACACCGGGTACCGGCTCACCCAGCCGTGCTCGaa > 1:138679/1‑124 (MQ=255) cccGCACGCTTGACCGGTTTGGCCAGGTAGTCCAGCCCTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGCCGTCGGCGCTGATCACTACACCGGGTACCGGCTCACCCAGCCGTGCTCGaa < 2:138679/123‑1 (MQ=255) ccGCAGGCTTGACCGGTTTGGCCAGGTAGTCCAGCCCTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGCCGTCGGCGCTGATCACTACACCGGGTACCGGCTCACCCAGCCGTGCTCGAAGCCAGCCCATCAGCCCGGTGCCGGtc > 4:69386/1‑149 (MQ=255) gCAGGCTTGACCGGTTTGGCCAGGTAGTCCAGCCCTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGCCGTCGGCGCTGATCACTACACCGGGTACCGGCTCACCCAGCCGTGCTCGAAGCCAGCCCATCAGCCCGGTGCCGGtctc < 3:258244/149‑1 (MQ=255) aGGCTTGACCGGTTTGGCCAGGTAGTCCAGCCCTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGCCGTCGGCGCTGATCACTACACCGGGTACCGGCTCACCCAGCCGTGCTCGAAGCCAGCCCATCAGCCCGGTGCCGGTCTCGc > 2:108760/1‑149 (MQ=255) gCTTGACCGGTTTGGCCAGGTAGTCCAGCCCTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGCCGTCGGCGCTGATCACTACACCGGGTACCGGCTCACCCAGCCGTGCTCGAAGCCAGCCCATCAGCCCGGTGCCGGTCTCGCcg > 3:252710/1‑149 (MQ=255) gACCGGTTTGGCCAGGTAGTCCAGCCCTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGCCGTCGGCGCTGATCACTACACCGGGTACCGGCTCACCCAGCCGTGCTCGAAGCCAGCCCATCAGCCCGGTGCCGGTCTCGCcgtc < 5:129612/147‑1 (MQ=255) cAGGTAGTCCAGCCCTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGCCGTCGGCGCTGATCACTACACCGGGTACCGGCTCACCCAGCCGTGCTCGAAGCCAGCCCATCAGCCCGGTGCCGGTCTCGCCGTCGTCCAGGTGGTAGt < 2:256728/149‑1 (MQ=255) cAGGTAGTCCAGCCCTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGCCGTCGGCGCTGATCACTACACCGGGTACCGGCTCACCCAGCCGTGCTCGAAGCCAGCCCATCAGCCCGGTGCCGGTCTCGCCGTCGTCCAGGTGGTAGt > 1:181828/1‑149 (MQ=255) ggTAGTCCATCCCTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGCCGTCGGCGCTGATCACTACACCGGGTACCGGCTCACCCAGCCGTGCTCGAAGCCAGCCCATCAGCCCGGTGCCGGTCTCGCCGTCGTCCAGGTGGTAGTcc < 3:69386/149‑1 (MQ=255) ggTAGTCCAGCCCTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGCCGTCGGCGCTGATCACTACACCGGGTACCGGCTCACCCAGCCGTGCTCGAAGCCAGCCCATCAGCCCGGTGCCGGTCTCGCCGTCGTCCAGGTGGTAGTcc < 2:111155/149‑1 (MQ=255) tCCAGCCCTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGCCGTCGGCGCTGATCACTACACCGGGTACCGGCTCACCCAGCCGTGCTCGAAGCCAGCCCATCAGCCCGGTGCCGGTCTCGCCGTCGTCCAGGTGGTAg > 3:233089/1‑141 (MQ=255) tCCAGCCCTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGCCGTCGGCGCTGATCACTACACCGGGTACCGGCTCACCCAGCCGTGCTCGAAGCCAGCCCATCAGCCCGGTGCCGGTCTCGCCGTCGTCCAGGTGGTAg < 4:233089/141‑1 (MQ=255) tCCAGCCCTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGCCGTCGGCGCTGATCACTACACCGGGTACCGGCTCACCCAGCCGTGCTCGAAGCCAGCCCATCAGCCCGGTGCCGGTCTCGCCGTCGTCCAGGTGGTAGTCCACCaa > 5:89561/1‑149 (MQ=255) tCCAGCCCTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGCCGTCGGCGCTGATCACTACACCGGGTACCGGCTCACCCAGCCGTGCTCGAAGCCAGCCCATCAGCCCGGTGACGGTCTCGCCGTCGTCCAGGTGGTAGTCCACCaa > 5:112497/1‑149 (MQ=255) ccTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGCCGTCGGCGCTGATCACTACACCGGGTACCGGCTCACCCAGCCGTGCTCGAAGCCAGCCCATCAGCCCGGTGCCGGTCTCGCCGTCGTCCAGGTGGTAGTCCACCAATGCCAg < 1:108760/149‑1 (MQ=255) tGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGCCGTCGGCGCTGATCACTACACCGGGTACCGGCTCACCCAGCCGTGCTCGAAGCCAGCCCATCAGCCCGGTGCCGGTCTCGCCGTCGTCCAGGTGGTAGTCCACCAATGCCAGGTGCg < 6:112497/149‑1 (MQ=255) | GAGCTTGCCGGCAGACCTGCTGGAGCGGGCGCTGTCCGATGAGGCGCTGCCCGAGGTAGCGGTTACTGAGCCAGGCTCAGATGGCGATTGAGCAGGGCGCGCAAGGCCGCAGGCTTGACCGGTTTGGCCAGGTAGTCCAGCCCTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGCCGTCGGCGCTGATCACTACACCGGGTACCGGCTCACCCAGCCGTGCTCGAAGCCAGCCCATCAGCCCGGTGCCGGTCTCGCCGTCGTCCAGGTGGTAGTCCACCAATGCCAGGTGCG > NC_002947/1886731‑1887025 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |