| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,168,438 | T→A | 6.6% | intergenic (+338/+350) | PP_1921 → / ← PP_1922 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,168,438 | 0 | T | A | 6.6% | 212.5 / 3.0 | 71 | intergenic (+338/+350) | PP_1921/PP_1922 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (34/32); new base A (2/3); total (36/35) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.74e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GCACCGCTGCTCACAAGGCTGACTTCAGTCCTTTTCCGTCATCTCAGCAAGATAATGGGTAGCAATTCCGTTGCTGAATGGCGCTGGTGTTCAAGTCCCCGTATGGGTGAACGGGGACAGCAGGCTGTGTACAACCCTGGGCCGATTCGGCCTCATGGCCGGTTTCGGGTTGAGGCTGCCCACTGGCATTGGACGAACCTAGGCACTGTACGAAGTCCCGACAAACCCAATCGTCTCGCCTCCAGCGCTGAGATTTTGTAGACTCATGTTGCTGCGTGGATTGCAACTGAGGC > NC_002947/2168293‑2168585 | gCACCGCTGCTCACAAGGCTGACTTCAGTCCTTTTCCGTCATCTCAGCAAGATAATGGGTAGCAATTCCGTTGCTGAATGGCGCTGGTGTTCAAGTCCCCGTATGGGTGAACGGGGACAGCAGGCTGTGTACAACCCTGGGCCGATTCg < 6:70739/149‑1 (MQ=255) aCCGCTGCTCACAAGGCTGACTTCAGTCCTTTTCCGTCATCTCAGCAAGATAATGGGTAGCAATTCCGTTGCTGAATGGCGCTGGTGTTCAAGTCCCCGTATGGGTGAACGGGGACAGCAGGCTGTGTACAACCCTGGGCCGATTCGGc > 3:10975/1‑149 (MQ=255) ccGCTGCTCACAAGGCTGACTTCAGTCCTTTTCCGTCATCTCAGCAAGATAATGGGTAGCAATTCCGTTGCTGAATGGCGCTGGTGTTCAAGTCCCCGTATGGGTGAACGGGGACAGCAGGCTGTGTACAACCCTGGGCCGATTCGGcc < 8:27083/149‑1 (MQ=255) ccGCTGCTCACAAGGCTGACTTCAGTCCTTTTCCGTCATCTCAGCAAGATAATGGGTAGCAATTCCGTTGCTGAATGGCGCTGGTGTTCAAGTCCCCGTATGGGTGAACGGGGACAGCAGGCTGTGTACAACCCTGGGCCGATTCGGcc > 2:230592/1‑149 (MQ=255) ctgctCACAAGGCTGACTTCAGTCCTTTTCCGTCATCTCAGCAAGATAATGGGTAGCAATTCCGTTGCTGAATGGCGCTGGTGTTCAAGTCCCCGTATGGGTGAACGGGGACAGCAGGCTGTGTACAACCCTGGGCCGAATCGGcccag < 5:152337/149‑4 (MQ=255) gctCACAAGGCTGACTTCAGTCCTGTTCCGCCATCTCAGCAAGATAATGGGTAGCAATTCCGTTGCTGAATGGCGCTGGTGTTCAAGTCCCCGTATGGGTGAACGGGGACAGCAGGCTGTGTACAACCCTGGGCCGATTCGGCCTCATg > 4:66218/1‑149 (MQ=255) ctCACAAGGCTGACTTCAGTCCTTTTCCGTCATCTCAGCAAGAAAATGGGTAGCAATTCCGTTGCTGAATGGCGCTGGTGTTCAAGTCCCCGTATGGGTGAACGGGGACAGCAGGCTGTGTACAACCCTGGGCCGATTCGGCCTCATgg < 4:70273/149‑1 (MQ=255) cacaAGGCTGACTTCAGTCCTTTTCCGTCATCTCAGCAAGATAATGGGTAGCAATTCCGTTGCTGAATGGCGCTGGTGTTCAAGTCCCCGTATGGGTGAACGGGGACAGCAGGCTGTGTACAACCCTGGGCCGAATCGGcccag > 6:53160/1‑141 (MQ=255) cacaAGGCTGACTTCAGTCCTTTTCCGTCATCTCAGCAAGATAATGGGTAGCAATTCCGTTGCTGAATGGCGCTGGTGTTCAAGTCCCCGTATGGGTGAACGGGGACAGCAGGCTGTGTACAACCCTGGGCCGAATCGGcccag < 5:53160/144‑4 (MQ=255) acaAGGCTGACTTCAGTCCTTTTCCGTCATCTCAGCAAGATAATGGGTAGCAATTCCGTTGCTGAATGGCGCTGGTGTTCAAGTCCCCGTATGGGTGAACGGGGACAGCAGGCTGTGTACAACCCTGGGCCGATTCGGCCTCATGGCCg > 6:302329/1‑149 (MQ=255) aCTTCAGTCCTTTTCCGTCATCTCAGCAAGATAATGGGTAGCAATTCCGTTGCTGAATGGCGCTGGTGTTCAAGTCCCCGTATGGGTGAACGGGTACAGCAGGCTGTGTACAACCCTGGGCCGATTCGGCCTCATGGCCGGTTTCgg < 5:139188/147‑1 (MQ=255) tCAGTCCTTTTCCGTCATCTCAGCAAGATAATGGGTAGCAATTCCGTTGCTGAATGGCGCTGGTGTTCAAGTCCCCGTATGGGTGAACGGGGACAGCAGGCTGTGTACAACCCTGGGCCGAATCGGcccaggg > 4:47285/1‑128 (MQ=255) tCAGTCCTTTTCCGTCATCTCAGCAAGATAATGGGTAGCAATTCCGTTGCTGAATGGCGCTGGTGTTCAAGTCCCCGTATGGGTGAACGGGGACAGCAGGCTGTGTACAACCCTGGGCCGAATCGGcccaggg < 3:47285/133‑6 (MQ=255) aGTCCTTTTCCGTCATCTCAGCAAGATAATGGGTAGCAATTCCGTTGCTGAATGGCGCTGGTGTTCAAGTCCCCGTATGGGTGAACGGGGACAGCAGGCTGTGTACAACCCTGGGCCGATTCGGCCTCATGGCCGGTTTCGGGTTGAgg > 3:183130/1‑149 (MQ=255) aGTCCTTTTCCGTCATCTCAGCAAGATAATGGGTAGCAATTCCGTTGCTGAATGGCGCTGGTGTTCAAGTCCCCGTATGGGTGAACGGGGACAGCAGGCTGTGTACAACCCTGGGCCGATTCGGCCTCATGGCCGGTTTCGGGTTGAgg > 7:103500/1‑149 (MQ=255) aGTCCTTTTCCGTCATCTCAGCAAGATAATGGGTAGCAATTCCGTTGCTGAATGGCGCTGGTGTTCAAGTCCCCGTATGGGTGAACGGGGACAGCAGGCTGTGTACAACCCTGGGCCGATTCGGCCTCATGGCCGGTTTCGGGTTGAgg > 8:292923/1‑149 (MQ=255) gTCCTTTTCCGTCATCTCAGCAAGATAATGGGTAGCAATTCCGTTGCTGAATGGCGCTGGTGTTCAAGTCCCCGTATGGGTGAACGGGGACAGCAGGCTGTGTACAACCCTGGGCCGATTCGGCCTCATGGCCGGTTTCGGGTTGAGGc > 5:340246/1‑149 (MQ=255) ttttCCGTCATCTCAGCAAGATAATGGGTAGCAATTCCGTTGCTGAATGGCGCTGGTGTTCAAGTCCCCGTATGGGTGAACGGGGACAGCAGGCTGTGTACAACCCTGGGCCGATTCGGCCTCATGGCCGGTTTCGGGTTGa < 7:73760/142‑1 (MQ=255) ttttCCGTCATCTCAGCAAGATAATGGGTAGCAATTCCGTTGCTGAATGGCGCTGGTGTTCAAGTCCCCGTATGGGTGAACGGGGACAGCAGGCTGTGTACAACCCTGGGCCGATTCGGCCTCATGGCCGGTTTCGGGTTGa > 8:73760/1‑142 (MQ=255) gTCATCTCAGCAAGATAATGGGTAGCAATTCCGTTGCTGAATGGCGCTGGTGTTCAAGTCCCCGTATGGGTGAACGGGGACAGCAGGCTGTGTACAACCCTGGGCCGATTCGGCCTCATGGCCGGTTTCGGGTTGAGGCTGCCCACTgg > 1:37396/1‑149 (MQ=255) gTCATCTCAGCAAGATAATGGGTAGCAATTCCGTTGCTGAATGGCGCTGGTGTTCAAGTCCCCGTATGGGTGAACGGGGACAGCAGGCTGTGTACAACCCTGGGCCGATTCGGCCTCATGGCCGGTTTCGGGTTGAGGCTGCCCACTgg > 7:69599/1‑149 (MQ=255) gTCATCTCAGCAAGATAATGGGTAGCAATTCCGTTGCTGAATGGCGCTGGTGTTCAAGTCCCCGTATGGGTGAACGGGGACAGCAGGCTGTGTACAACCCTGGGCCGATTCGGCCTCATGGCCGGTTTCGGGTTGAGGCTGCCCACTgg > 5:122993/1‑149 (MQ=255) gTCATCTCAGCAAGATAATGGGTAGCAATTCCGTTGCTGAATGGCGCTGGTGTTCAAGTCCCCGTATGGGTGAAAGGGGACAGCAGGCTGTGTACAACCCTGGGCCGATTCGGCCTCATGGCCGGTTTCGGGTTGAGGCTGCCCACTg > 3:276255/1‑148 (MQ=255) tCATCTCAGCAAGATAATGGGTAGCAATTCCGTTGCTGAATGGCGCTGGTGTTCAAGTCCCCGTATGGGTGAACGGGGACAGCAGGCTGTGTACAACCCTGGGCCGATTCGGCCTCATGGCCGGTTTCGGGTTGAGGCTGCCTACTgg > 6:144725/1‑148 (MQ=255) tCATCTCAGCAAGATAATGGGTAGCAATTCCGTTGCTGAATGGCGCTGGTGTTCAAGTCCCCGTATGGGTGAACGGGGACAGCAGGCTGTGTACAACCCTGGGCCGATTCGGCCTCATGGCCGGTTTCGGGTTGAGGCTGCCCACTgg > 2:326444/1‑148 (MQ=255) cAAGATAATGGGTAGCAATTCCGTTGCTGAATGGCGCTGGTGTTCAAGTCCCCGTATGGGTGAACGGGGACAGCAGGCTGTGTACAACCCTGGGCCGATTCGGCCTCATGGCCGGTTTCGGGTTGa < 8:317270/126‑1 (MQ=255) cAAGATAATGGGTAGCAATTCCGTTGCTGAATGGCGCTGGTGTTCAAGTCCCCGTATGGGTGAACGGGGACAGCAGGCTGTGTACAACCCTGGGCCGATTCGGCCTCATGGCCGGTTTCGGGTTGa > 7:317270/1‑126 (MQ=255) tAATGGGTAGCAATTCCGTTGCTGAATGGCGCTGGTGTTCAAGTCCCCGTATGGGTGAACGGGGACAGCAGGCTGTGTACAACCCTGGGCCGATTCGGCCTCATGGCCGGTTTCGGGTTGAGGCTGCCCACTGGCAtt > 8:51171/1‑138 (MQ=255) tAATGGGTAGCAATTCCGTTGCTGAATGGCGCTGGTGTTCAAGTCCCCGTATGGGTGAACGGGGACAGCAGGCTGTGTACAACCCTGGGCCGATTCGGCCTCATGGCCGGTTTCGGGTTGAGGCTGCCCACTGGCAtt < 7:51171/138‑1 (MQ=255) aTGGGTAGCAATTCCGTTGCTGAATGGCGCTGGTGTTCAAGTCCCCGTATGGGTGAACGGGGACAGCAGGCTGTGTACAACCCTGGGCCGATTCGGCCTCATGGCCGGTTTCGGGTTGAGGCTGCCCACTGGCATTGGACGAACCTAgg < 4:10975/149‑1 (MQ=255) aTGGGTAGCAATTCCGTTGCTGAATGGCGCTGGTGTTCAAGTCCCCGTATGGGTGAACGGGGACAGCAGGCTGTGTACAACCCTGGGCCGATTCGGCCTCATGGCCGGTTTCGGGTTGAGGCTGCCCACTGGCATTGGACGAACCTAgg < 1:326444/149‑1 (MQ=255) aTGGGTAGCAATTCCGTTGCTGAATGGCGCTGGTGTTCAAGTCCCCGTATGGGTGAACGGGGACAGCAGGCTGTGTACAACCCTGGGCCGATTCGGCCTCATGGCCGGTTTCGGGTTGAGGCTGCCCACTGGCATTGGACGAACCTAgg < 3:66218/149‑1 (MQ=255) cAATTCCGTTGCTGAATGGCGCTGGTGTTCAAGTCCCCGTATGGGTGAACGGGGACAGCAGGCTGTGTACAACCCTGGGCCGATTCGGCCTCATGGCCGGTTTCGGGTTGAGGCTGCCCACTGGCATTGGACGAACCTAGGCACTGTAc < 7:115591/149‑1 (MQ=255) ttCCGTTGCTGAATGGCGCTGGTGTTCAAGTCCCCGTATTGGTGAACGGGGACAGCAGGCTGTGTACAACCCTGGGCCGATTCGGCCTCATGGCCGGTTTCGGGTTGAGGCTGCCCACTGGCATTGGACGAACCTAGGCACTGTACGaa < 1:115871/149‑1 (MQ=255) ttCCGTTGCTGAATGGCGCTGGTGTTCAAGTCCCCGTATGGGTGAACGGGGACAGCAGGCTGTGTACAACCCTGGGCCGATTCGGCCTCATGGCCGGTTTCGGGTTGAGGCTGCCCACTGGCATTGGACGAACCTAGGCACTGTACg > 2:115871/1‑147 (MQ=255) cGTTGCTGAATGGCGCTGGTGTTCAAGTCCCCGTATGGGTGAACGGGGACAGCAGGCTGTGTACAACCCTGGGCCGATTCGGCCTCATGGCCGGTTTCGGGTTGAGGCTGCCCACTGGCATTGGACGAACCTAGGCACTGTACGAAGTc > 5:277612/1‑149 (MQ=255) cGTTGCTGAATGGCGCTGGTGTTCAAGTCCCCGTATGGGTGAACGGGGACAGCAGGCTGTGTACAACCCTGGGCCGATTCGGCCTCATGGCCGGTTTCGGGTTGAGGCTGCCCACTGGCATTGGACGAACCTAGGCACTGTACGAAGTc < 2:325766/149‑1 (MQ=255) ttGCTGAATGGCGCTGGTGTTCAAGTCCCCGTATGGGTGAACGGGGACAGCAGGCTGTGTACAACCCTGGGCCGATTCGGCCTCATGGCCGGTTTCGGGTTGAGGCTGCCCACTGGCATTGGACGAACCTAGGCACTGTACGAAGTccc < 6:340246/149‑1 (MQ=255) cTGAATGGCGCTGGTGTTCAAGTCCCCGTATGGGTGAACGGGGACAGCAGGCTGTGTACAACCCTGGGCCGATTCGGCCTCATGGCCGGTTTCGGGTTGAGGCTGCCCACTGGCATTGGACGAACCTAGGCACTGTACGAAGTCCCGa < 1:230592/148‑1 (MQ=255) aTGGCGCTGGTGTTCAAGTCCCCGTATGGGTGAACGGGGACAGCAGGCTGTGTACAACCCTGGGCCGATTCGGCCTCATGGCCGGTTTCGGGTTGAGGCTGCCTACTGGCATTGGACGAACCTAGGCACTGTACGAAGTCCCGACAAAc < 5:144725/149‑1 (MQ=255) ggCGCTGGTGTTCAAGTCCCCGTATGGGTGAACGGGGACAGGAGGCTGTGTACAACCCTGGGCCGATTCGGCCTCATGGCCGGTTTCGGGTTGAGGCTGCCCACTGGCATTGGACGAACCTAGGCACTGTACGAAGTCCCGACAAAcc < 4:183130/148‑1 (MQ=255) ttCAAGTCCCCGTATGGGTGAACGGGGACAGCAGGCTGTGTACAACCCTGGGCCGATTCGGCCTCATGGCCGGTTTCGGGTTGAGGCTGCCCACTGGCATTGGACGAACCTAGGCACTGTACGAAGTcc > 8:42803/1‑129 (MQ=255) ttCAAGTCCCCGTATGGGTGAACGGGGACAGCAGGCTGTGTACAACCCTGGGCCGATTCGGCCTCATGGCCGGTTTCGGGTTGAGGCTGCCCACTGGCATTGGACGAACCTAGGCACTGTACGAAGTcc < 7:42803/129‑1 (MQ=255) ttCAAGTCCCCGTATGGGTGAACGGGGACAGCAGGCTGTGTACAACCCTGGGCCGATTCGGCCTCATGGCCGGTTTCGGGTTGAGGCTGCCCACTGGCATTGGACGAACCTAGGCACTGTACGAAGTCCCGACAAACCCAATCGtctc < 4:276255/148‑1 (MQ=255) cAAGTCCCCGTATGGGTGAACGGGGACAGCAGGCTGTGTACAACCCTGGGCCGATTCGGCCTCATGGCCGGTTTCGGGTTGAGGCTGCCCACTGGCATTGGACGAACCTAGGCACTGTACGAAGTCCCGACAAACCCAATCGTCTCGcc > 3:79470/1‑149 (MQ=255) cAAGTCCCCGTATGGGTGAACGGGGACAGCAGGCTGTGTACAACCCTGGGCCGATTCGGCCTCATGGCCGGTTTCGGGTTGAGGCTGCCCACTGGCATTGGACGAACCTAGGCACTGTACGAAGTCCCGACAAACCCAATCGTCTCGcc > 7:234319/1‑149 (MQ=255) aaGTCCCCGTATGGGTGAACGGGGACAGCAGGCTGTGTACAACCCTGGGCCGATTCGGCCTCATGGCCGGTTTCGGGTTGAGGCTGCCCACTGGCATTGGACg < 3:185925/103‑1 (MQ=255) aaGTCCCCGTATGGGTGAACGGGGACAGCAGGCTGTGTACAACCCTGGGCCGATTCGGCCTCATGGCCGGTTTCGGGTTGAGGCTGCCCACTGGCATTGGACg > 4:185925/1‑103 (MQ=255) gTCCCCGTATGGGTGAACGGGGACAGCAGGCTGTGTACAACCCTGGGCCGATTCGGCCTCATGGCCGGTTTCGGGTTGAGGCTGCCCACTGGCATTGGACGAACCTAGGCACTGTACGAAGTCCCGACAAACCCAATCGTCTCGCCTcc > 8:185831/1‑149 (MQ=255) gTATGGGTGAACGGGGACAGCAGGCTGTGTACAACCCTGGGCCGATTCGGCCTCATGGCCGGTTTCGGGTTGAGGCTGCCCACTGGCATTGGACGAACCTAGGCACTGTACGAAGTCCCGACAAACCCAATCGTCTCGCCTCCAGCGCt < 8:69599/149‑1 (MQ=255) gTATGGGTGAACGGGGACAGCAGGCTGTGTACAACCCTGGGCCGATTCGGCCTCATGGCCGGTTTCGGGTTGAGGCTGCCCACTGGCATTGGACGAACCTAGGCACTGTACGAAGTCCCGACAAACCCAATCGTCTCGCCTCCAGCGCt < 2:37396/149‑1 (MQ=255) ggTGAACGGGGACAGCAGGCTGTGTACAACCCTGGGCCGATTCGGCCTCATGGCCGGTTTCGGGTTGAGGCTGCCCACTGGCATTGGACGAACCTAGGCACTGTACGAAGTCCCGACAAACCCATTCGTCTCGCCTCCAGCGCTGAGAt < 5:302329/149‑1 (MQ=255) gTGAACGGGGACAGCAGGCTGTGTACAACCCTGGGCCGATTCGGCCTCATGGCCGGTTTCGGGTTGAGGCTGCCCACTGGCATTGGACGAACCTAGGCACTGTACGAAGTCCCGACAAACCCAATCGTCTCGCCTCCAGCGCTGAGAtt < 6:122993/149‑1 (MQ=255) aCGGGGACAGCAGGCTGTGTACAACCCTGGGCCGATTCGGCCTCATGGCCGGTTTCGGGTTGAGGCTGCCCACTGGCATTGGACGAACCTAGGCACTGTACGAAGTCCCGACAAACCCAATCGTCTCGCCTCCAGCGCTGAGATTTTGt < 1:50930/149‑1 (MQ=255) ggACAGCAGGCTGTGTACAACCCTGGGCCGATTCGGCCTCATGGCCGGTTTCGGGTTGAGGCTGCCCACTGGCATTGGACGAACCTAGGCACTGTACGAAGTCCCGACAAACCCAATCGTCTCGCCTCCAGCGCTGAGATTTTGTAGa > 3:275887/1‑148 (MQ=255) cagcagGCTGTGTACAACCCTGGGCCGATTCGGCCTCATGGCCGGTTTCGGGTTGAGGCTGCCCACTGGCATTGGACGAACCTAGGCACTGTACGAAGTCCCGACAAACCCAATCGTCTCGCCTCCAGCGCTGAGATTTTGTAGACTCa > 5:187114/1‑149 (MQ=255) gcagGCTGTGTACAACCCTGGGCCGATTCGGCCTCATGGCCGGTTTCGGGTTGAGGCTGCCCACTGGCATTGGACGAACCTAGGCACTGTACGAAGTCCCGACAAACCCAATCGTCTCGCCTCCAGCGCTGAGATTTTGTAGACTCATg < 6:187114/149‑1 (MQ=255) gcagGCTGTGTACAACCCTGGGCCGATTCGGCCTCATGGCCGGTTTCGGGTTGAGGCTGCCCACTGGCATTGGACGAACCTAGGCACTGTACGAAGTCCCGACAAACCCAATCGTCTCGCCTCCAGCGCTGAGATTTTGTAGACTCATg < 8:103500/149‑1 (MQ=255) cTGTGTACAACCCTGGGCCGATTCGGCCTCATGGCCGGTTTCGGGTTGAGGCTGCCCACTGGCATTGGACGAACCTAGGCACTGTACGAAGTCCCGACAAACCCAATCGTCTCGCCTCCAGCGCTGAGATTTTGTAGACTCATGTtgct < 6:277612/149‑1 (MQ=255) tgtgTACAACCCTGGGCCGATTCGGCCTCATGGCCGGTTTCGGGTTGAGGCTGCCCACTGGCATTGGACGAACCTAGGCACTGTACGAAGTCCCGACAAACCCAATCGTCTCCCCTCCAGCGCTGAGATTTTGTAGACTCATGTtgctg > 8:48859/1‑149 (MQ=255) aCAACCCTGGGCCGATTCGGCCTCATGGCCGGTTTCGGGTTGAGGCTGCCCACTGGCATTGGACGAACCTAGGCACTGTACGAAGTCCCGa < 7:48659/91‑1 (MQ=255) aCAACCCTGGGCCGATTCGGCCTCATGGCCGGTTTCGGGTTGAGGCTGCCCACTGGCATTGGACGAACCTAGGCACTGTACGAAGTCCCGa > 8:48659/1‑91 (MQ=255) aaCCCTGGGCCGATTCGGCCTCATGGCCGGTTTCGGGTTGAGGCTGCCCACTGGCATTGGACGAACCTAGGCACTGTACGAAGTCCAGACAAACCAAATCGTCTCGCATCCAGCGCTGAGATTTTGTAGACTCATGTTGCTCCGTGGAt > 6:163062/1‑149 (MQ=255) cccTGGGCCGATTCGGCCTCATGGCCGGTTTCGGGTTGAGGCTGCCCACTGGCATTGGACGAACCTAGGCACTGTACGAAGTCCCGACAAACCCAATCGTCTCGCCTCCAGCGCTGAGATTTTGTAGACTCATGTTGCTGCGTGGATTg > 4:139771/1‑149 (MQ=255) cccTGGGCCGATTCGGCCTCATGGCCGGTTTCGGGTTGAGGCTGCCCACTGGCATTGGACGAACCTAGGCACTGTACGAAGTCCCGACAAACCCAATCGTCTCGCCTCCAGCGCTGAGATTTTGTAGACTCATGTTGCTGCGTGGATTg > 4:134579/1‑149 (MQ=255) ccGATTCGGCCTCATGGCCGGTTTCGGGTTGAGGCTGCCCACTGGCATTGGACGAACCTAGGCACTGTACGAAGTCCCGACAAACCCAATCGTCTCGCCTCCAGCGCTGAGATTTTGTAGACTCATg < 4:283602/127‑1 (MQ=255) ccGATTCGGCCTCATGGCCGGTTTCGGGTTGAGGCTGCCCACTGGCATTGGACGAACCTAGGCACTGTACGAAGTCCCGACAAACCCAATCGTCTCGCCTCCAGCGCTGAGATTTTGTAGACTCATg > 3:283602/1‑127 (MQ=255) cGATTCGGCCTCATGGCCGGTTTCGGGTTGAGGCTGCCCACTGGCATTGGACGAACCTAGGCACTGTACGAAGTCCAGACAAACCCAATCGTCTCGCCTCCAGCGCTGAGATTTTGTAGACTCATGTTGCTGCGTTGATTGCAACTGAg > 6:270986/1‑149 (MQ=255) aTTCGGCCTCATGGCCGGTTTCGGGTTGAGGCTGCCCACTGGCATTGGACGAACCTAGGCACTGTACGAAGTCCCGACAAACCCAATCGTCTCGCCTCCAGCGCTGAGATTTTGTAGACTCATGTTGCTGCGTGGATTGCAACTGAGGc < 4:275887/149‑1 (MQ=255) aTTCGGCCTCATGGCCGGTTTCGGGTTGAGGCTGCCCACTGGCATTGGACGAACCTAGGCACTGTACGAAGTCCCGACAAACCCAATCGTCTCGCCTCCAGCGCTGAGATTTTGTAGACTCATGTTGCTGCGTGGATTGCAACTGAGGc < 4:79470/149‑1 (MQ=255) aTTCGGCCTCATGGCCGGTTTCGGGTTGAGGCTGCCCACTGGCATTGGACGAACCTAGGCACTGTACGAAGTCCCGACAAACCCAATCGTCTCGCCTCCAGCGCTGAGATTTTGTAGACTCATGTTGCTGCGTGGATTGCAACTGAGGc > 2:235470/1‑149 (MQ=255) ttCGGCCTCATGGCCGGTTTCGGGTTGAGGCTGCCCACTGGCATTGGACGAACCTAGGCACTGTACGaa < 4:29237/69‑1 (MQ=255) | GCACCGCTGCTCACAAGGCTGACTTCAGTCCTTTTCCGTCATCTCAGCAAGATAATGGGTAGCAATTCCGTTGCTGAATGGCGCTGGTGTTCAAGTCCCCGTATGGGTGAACGGGGACAGCAGGCTGTGTACAACCCTGGGCCGATTCGGCCTCATGGCCGGTTTCGGGTTGAGGCTGCCCACTGGCATTGGACGAACCTAGGCACTGTACGAAGTCCCGACAAACCCAATCGTCTCGCCTCCAGCGCTGAGATTTTGTAGACTCATGTTGCTGCGTGGATTGCAACTGAGGC > NC_002947/2168293‑2168585 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |