| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,341,875 | C→T | 6.5% | G365G (GGC→GGT) | yraO → | transporter YraO |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,341,875 | 0 | C | T | 6.5% | 183.2 / 2.2 | 61 | G365G (GGC→GGT) | yraO | transporter YraO |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (27/30); new base T (2/2); total (29/32) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.80e-01 | |||||||||||
CGCTGGTGGACTGGATTCCGGAAGCGTGGAGCCACTGGTTCCCGCTGGTGGTGGCGCTGACCAGCATGCCGCTGACCTTCGTGCTGTCCAACGACGCGTACTACTTCGGCGTTGTGCCGATCCTGGCCAATGCCGCGGCCGCGTACGGCATCGACCCGGTGGAAATTGCCCGCGCCTCGGTGCTTGGCCAGCC‑GGTTCACCTGATGAGC‑CCGCTGGTGGCCTCGACCCTGCTGCTGGTGGGCATGGTCGACCGCGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCGTGAAATGGGCC > NC_002947/2341727‑2342019 | cGCTGGTGGACTGGATTCCGGAAGCGTGGAGCCACTGGTTCCCGCTGGTGGTGGCGCTGACCAGCATGCCGCTGACCTTCGTGCTGTCCAACGACGCGTACTACTTCGGCGTTGTGCCGATCCTGGCCAATGCCGCGGCCGCGTACGGc < 5:288716/149‑1 (MQ=255) tggtggACTGGATTCCGGAAGCGTGGAGCCACTGGTTCCCGCTGGTGGTGGCGCTGACCAGCATGCCGCTGACCTTCGTGCTGTCCAACGACGCGTACTACTTCGGCGTTGTGCCGATCCTGGCCAATGCCGCGGCCGCGTACGGCATc > 4:194407/1‑149 (MQ=255) gtggACTGGATTCCGGAAGCGTGGAGCCACTGGTTCCCGCTGGTGGTGGCGCTGACCAGCATGCCGCTGACCTTCGTGCTGTCCAACGACGCGTACTACTTCGGCGTTGTGCCGATCCTGGCCAATGCCGCGGCCGCGTACGGTATCGa > 4:240133/1‑149 (MQ=255) tGGATTCCGGAAGAGTGGAGCCACTGGTTCCCGCTGGTGGTGGCGCTGACCAGCATGCAGCTGACCTTCGTGCTGTCCAACGACGCGTACTACTTCGGCGTTGTGCCGATCCTGGCCAATGCCGCGGCAGCGTACGGCATCGACCCGGt > 3:23824/1‑149 (MQ=255) gATTCCGGAAGCGTGGAGCCACTGGTTCCCGCTGGTGGTGGCGCTGACCAGCATGCCGCTGACCTTCGTGCTGTCCAACGACGCGTACTACTTCGGCGTTGTGCCGATCCTGGCCAATGCCGCGGCCGCGTACGGCATCg > 5:163765/1‑140 (MQ=255) gATTCCGGAAGCGTGGAGCCACTGGTTCCCGCTGGTGGTGGCGCTGACCAGCATGCCGCTGACCTTCGTGCTGTCCAACGACGCGTACTACTTCGGCGTTGTGCCGATCCTGGCCAATGCCGCGGCCGCGTACGGCATCg < 6:163765/140‑1 (MQ=255) gATTCCGGAAGCGTGGAGCCACTGGTTCCCGCTGGTGGTGGCGCTGACCAGCATGCCGCTGACCTTCGTGCTGTCCAACGACGCGTACTACTTCGGCGTTGTGCCGATCCTGGCCAATGCCGCGGCCGCGTACGGCATCGACCCGGTg < 6:212367/148‑1 (MQ=255) gATTCCGGAAGCGTGGAGCCACTGGTTCCCGCTGGTGGTGGCGCTGACCAGCATGCCGCTGACCTTCGTGCTGTCCAACGACGCGTACTACTTCGGCGTTGTGCCGATCCTGGCCAATGCCGCGGCCGCGTACGGCATCGACCCGGTg < 4:39059/148‑1 (MQ=255) gATTCCGGAAGCGTGGAGCCACTGGTTCCCGCTGGTGGTGGCGCTGACCAGCATGCCGCTGACCTTCGTGCTGTCCAACGACGCGTACTACTTCGGCGTTGTGCCGATCCTGGCCAATGCCGCGGCCGCGTACGGCATCGACCCGGTg < 7:142267/148‑1 (MQ=255) cGTGGAGCCACTGGTTCCCGCTGGTGGTGGCGCTGACCAGCATGCCGCTGACCTTCGTGCTGTCCAACGACGCGTACTACTTCGGCGTTGTGCCGATCCTGGCCAATGCCGCGGCCGCGTACGGCATCGACCCGGTGGAAATTGCCcgc < 6:307563/149‑1 (MQ=255) ccACTGGTTCCCGCTGGTGGTGGCGCTGACCAGCATGCCGCTGACCTTCGTGCTGTCCAACGACGCGTACTACTTCGGCGTTGTGCCGATCCTGGCCAATGCCGCGGCCGCGTACGGCATCGACCCGGTGGAAATTGCCCGCGCATCgg > 4:203134/1‑149 (MQ=255) gTTCCCGCTGGTGGTGGCGCTGACCAGCATGCCGCTGACCTTCGTGCTGTCCAACGACGCGTACTACTTCGGCGTTGTGCCGATCCTGGCCAATGCCGCGGCCGCGTACGGTATCGACCCGGTGGAAATTGCCCGCGCCTCGGTGCtt < 3:240133/148‑1 (MQ=255) gTTCCCGCTGGTGGTGGCGCTGACCAGCATGCCGCTGACCTTCGTGCTGTCCAACGACGCGTACTACTTCGGCGTTGTGCCGATCCTGGCCAATGCCGCGGCCGCGTACGGCATCGACCCGGTGGAAATTGCCCGCGCCTCGGTGCTTg > 8:195511/1‑149 (MQ=255) gTTCCCGCTGGTGGTGGCGCTGACCAGCATGCCGCTGACCTTCGTGCTGTCCAACGACGCGTACTACTTCGGCGTTGTGCCGATCCTGGCCAATGCCGCGGCCGCGTACGGCATCGACCCGGTGGAAATTGCCCGCGCCTCGGTGCTTg > 3:256398/1‑149 (MQ=255) ggtggtggCGCTGACCAGCATGCCGCTGACCTTCGGTCTGTCCAACGACGCGTACTACTTCGGCGTTGTGCCGATCCTGGACAATGCCGCGGCCGCGTACGGCATCGACCCGGTGGAAATTGCCCGCGCCTCGGTGCTTGGCCAGCC‑gg < 8:228774/149‑1 (MQ=255) gtggCGCTGACCAGCATGCCGCTGACCTTCGTGCTGTCCAACGACGCGTACTACTTCGGCGTTGTGCCGATCCTGGCCAATGCCGCGGCCGCGTACGGCATCGACCCGGTGGAAATTGCCCGCGCCTCGGTGCTTGGCCAGCC‑GGTTc < 1:17862/148‑1 (MQ=255) cTGACCAGCATGCCGCTGACCTTCGTGCTGTCCAACGACGCGTACTACTTCGGCGTTGTGCCGATCCTGGCCAATGCCGCGGCCGCGTACGGCATCGACCCGGTGGAAATTGCCCGCGCCTCGGTGCTTGGCCAGCC‑GGTTCACCtgat < 7:195511/149‑1 (MQ=255) cAGCATGCCGCTGACCTTCGTGCTGTCCAACGACGCGTACTACTTCGGCGTTGTGCCGATCCTGGCCAATGCCGCGGCCGCGTACGGTATCGACCCGGTGGAAATTGCCCGCGCCTCGGTGCTTGGCCAGCC‑GGTTCACCTGATGAGc‑c > 4:205049/1‑149 (MQ=255) gCCGCTGACCTTCGTGCTGTCCAACGACGCGTACTACTTCGGCGTTGTGCCGATCCTGGCCAATGCCGCGGCCGCGTACGGCATCGACCCGGTGGAAATTGCCCGCGCCTCGGTGCTTGGCCAGCC‑GGTTCACCTGATGAGC‑CCGCtgg > 5:281699/1‑149 (MQ=255) ccGCTGACCTTCGTGCTGTCCAACGACGCGTACTACTTCGGCGTTGTGCCGATCCTGGCCAATGCCGCGGCCGCGTACGGCATCGACCCGGTGGAAATTGCCCGCGCCTCGGTGCTTGGCCAGCC‑GGTTCACCTGATGAGC‑CCGCtggt < 4:148594/149‑1 (MQ=255) ccGCTGACCTTCGTGCTGTCCAACGACGCGTACTACTTCGGCGTTGTGCCGATCCTGGCCAATGCCGCGGCCGCGTACGGCATCGACCCGGTGGAAATTGCCCGCGCCTCGGTGCTTGGCCAGCC‑GGTTCACCTGATGAGC‑CCGCtggt < 3:194407/149‑1 (MQ=255) cGCTGACCTTCGTGCTGTCCAACGACGCGTACTACTTCGGCGTTGTGCCGATCCTGGCCAATGCCGCGGCCGCGTACGGCATCGACCCGGTGGAAATTGCCCGCGCCTCGGTGCTTGGCCAGCC‑GGTTCACCTGATGAGC‑CCGCtggt < 3:203134/148‑1 (MQ=255) gCTGACCTTCGTGCTGTCCAACGACGCGTACTACTTCGGCGTTGTGCCGATCCTGGCCAATGCCGCGGCCGCGTACGGCATCGACCCGGTGGAAATTGCCCGCGCCTCGGAGCTTGGCCAGCC‑GGTTCACCTGATGAGC‑CCGCtggtgg > 1:33095/1‑149 (MQ=255) cTGACCTTCGTGCTGTCCAACGACGCGTACTACTTCGGCGTTGTGCCGATCCTGGCCAATGCCGCGGCCGCGTACGGCATCGACCCGGTGGAAATTGCCcg < 2:22879/101‑1 (MQ=255) cTGACCTTCGTGCTGTCCAACGACGCGTACTACTTCGGCGTTGTGCCGATCCTGGCCAATGCCGCGGCCGCGTACGGCATCGACCCGGTGGAAATTGCCcg > 1:22879/1‑101 (MQ=255) gcccTTCGTGCTGTCCAACGACGCGTACTACTTCGGCGTTGTGCCGATCCTGGCCAATGCCGCGGCCGCGTACGGCATCGACCCGGTGGAAATTGCCCGCGCCTCGGTGCTTGGCCAGCC‑GGTTCACCTGATGAGC‑CCGCTGGTGGCCt < 8:99832/147‑1 (MQ=255) aCCTTCGTGCTGTCCAACGACGCGTACTACTTCGGCGTTGTGCCGATCCTGGCCAATGCCGCGGCCGCGTACGGCATCGACCCGGTGGAAATTGCCCGCGCCTCGGTGCTTGGCCAGCC‑GGTTCACCTGATGAGC‑CCGCTGGTGGCCt < 4:256398/148‑1 (MQ=255) cGTGCTGTCCAACGACGCGTACTACTTCGGCGTTGTGCCGATCCTGGCCAATGCCGCGGCCGCGTACGGCATCGACCCGGTGGAAATTGCCCGCGCCTCGGTGCTTGGCCAGCC‑GGTTCACCTGATGAGC‑CCGCTGGTGGCCTCGAccc > 2:236089/1‑149 (MQ=255) cTGTCCAACGACGCGTACTACTTCGGCGTTGTGCCGATCCTGGCCAATGCCGCGGCCGCGTACGGCATCGACCCGGTGGAAATTGCCCGCGCCTCGGTGCTTGGCCAGCCTGGTTCACCTGATGAGC‑CCGCTGGTGGCCTCGACCctg < 1:236089/148‑1 (MQ=255) tGTCCAACGACGCGTACTACTTCGGCGTTGTGCCGATCCTGGCCAATGCCGCGGCCGCGTACGGCATCGACCCGGTGGAAATTGCCCGCGCCTCGGTGCTTGGCCAGCC‑GGTTCACCTGATGAGC‑CCGCTGGTGGCCTCGACCctgctg > 1:54583/1‑149 (MQ=255) cAACGACGCGTACTACTTCGGCGTTGTGCCGATCCTGGCCAATGCCGCGGCCGCGTACGGCATCGACCCGGTGGAAATTGCCCGCGCCTCGGTGCTTGGCCAGCC‑GGTTCACCTGATGAGC‑CCGCTGGTGGCCTCGACCCTGCTGCtgg > 2:61405/1‑149 (MQ=255) aaCGACGCGTACTACTTCGGCGTTGTGCCGATCCTGGCCAATGCCGCGGCCGCGTACGGCATCGACCCGGTGGAAATTGCCCGCGCCTCGGTGCTTGGCCAGCC‑GGTTCACCTGATGAGC‑CCGCTGGTGGCCTCGACCCTGCTGCtggt > 8:221496/1‑149 (MQ=255) aaCGACGCGTACTACTTCGGCGTTGTGCCGATCCTGGCCAATGCCGCGGCCGCGTACGGCATCGACCCGGTGGAAATTGCCCGCGCCTCGGTGCTTGGCCAGCC‑GGTTCACCTGATGAGC‑CCGCTGGTGGCCTCGACCCTGCTGCtggt > 6:9831/1‑149 (MQ=255) cgacgCGTACTACTTCGGCGTTGTGCCGATCCTGGCCAATGCCGCGGCCGCGTACGGCATCGACCCGGTGGAAATTGCCGGCGCCTCGGTTCTTGGCCAGCC‑GGTTCACCTGATGAGC‑CCGCTGGTGGCCTCGACCCTGCTGCtggtgg < 4:212886/149‑1 (MQ=255) cgacgCGTACTACTTCGGCGTTGTGCCGATCCTGGCCAATGCCGCGGCCGCGTACGGCATCGACCCGGTGGAAATTGCCCGCGCCTCGGTGCTTGGCCAGCC‑GGTTCACCTGATGAGC‑CCGCTGGTGGCCTCGACCCTGCTGCtggtgg < 7:221496/149‑1 (MQ=255) cgacgCGTACTACTTCGGCGTTGTGCCGATCCTGGCCAATGCCGCGGCCGCGTACGGCATCGACCCGGTGGAAATTGCCCGCGCCTCGGTGCTTGGCCAGCC‑GGTTCACCTGATGAGC‑CCGCTGGTGGCCTCGACCCTGCTGCtggtgg < 5:9831/149‑1 (MQ=255) cgacgCGTACTACTTCGGCGTTGGGCCGATCCTGGCCAATGCCGCGGCCGCGTACGGCATCGACCCGGTGGAAATTGCCCGCGCCTCGGTGCTTGGCCAGCC‑GGTTCACCTGATGAGC‑CCGCTGGTGGCCTCGACCCTGCTGCtggtgg < 2:116938/149‑1 (MQ=255) acgCGTACTACTTCGGCGTTGTGCCGATCCTGGCCAATGCCGCGGCCGCGTACGGCATCGACCCGGTGGAAATTGCCCGCGCCTCGGTGCTTGGCCAGCC‑GGTTCACCTGATGAGC‑CCGCTGGTGGCCTCGACCCTGCTGCTGGTggg > 8:149995/1‑148 (MQ=255) gTACTACTTCGGCGTTGTGCCGATCCTGGCCAATGCCGCGGCCGCGTACGGCATCGACCCGGTGGAAATTGCCCGCGCCTCGGTGCTTGGCCAGCC‑GGTTCACCTGATGAGC‑CCGCTGGTGGCCTCGACCCTGCTGCTGGTGGGCATgg < 2:54583/149‑1 (MQ=255) tactacTTCCGCGTTGTGCCGATCCTGGCCAATGCCGCGGCCGCGTACGGCATCGACCCGGTGGAAATTGCCCGCGCCTCGGTGCGTGGCCAGCC‑GGTTCACCTGATGAGCTCCGCTGGTGGCCTCGACCCTGCTGCTGGTGGGCATgg < 1:61405/149‑1 (MQ=255) ctactTCGGCGTTGTGCCGATCCTGGCCAATGCCGCGGCCGCGTACGGTATCGACCCGGTGGAAATTGCCCGCGCCTCGGTGCTTGGCCAGCC‑GGTTCACCTGATGAGC‑CCGCTGGTGGCCTCGACCCTGCTGCTGGTGGGCATGGTc < 3:205049/148‑1 (MQ=255) actTCGGCGTTGTGCCGATCCTGGCCAATGCCGCGGCCGCGTACGGCATCGACCCGGTGGAAATTGCCCGCGCCTCGGTGCTTGGCCAGCC‑GGTTCACCTGATGAGC‑CCGCTGGTGGCCTCGACCCTGCTGCTGGTGGGCATGGTCGAc > 7:189862/1‑149 (MQ=255) ttCGGCGTTGTGCCGATCCTGGCCAATGCCGCGGCCGCGTACGGCATCGACCCGGTGGAAATTGCCCGCGCCTCGGTGCTTGGCCAGCC‑GGTTCACCTGATGAGC‑CCGCTGGTGGCCTCGACCCTGCTGCTGGTGGGCATGGTCGACcg > 2:319901/1‑149 (MQ=255) tCGGCGTTGTGCCGATCCTGGCCAATGCCGCGGCCGCGTACGGCATCGACCCGGTGGAAATTGCCCGCGCCTCGGTGCTTGGCCAGCC‑GGTTCACCTGATGAGC‑CCGCTGGTGGCCTCGACCCTGCTGCTGGTGGGCATGGTCGACcgc > 7:277783/1‑149 (MQ=255) gtgCCGATCCTGGCCAATGCCGCGGCCGCGTACGGCATCGACCCGGTGGAAATTGCCCGCGCCTCGGTGCTTGGCCAGc < 3:53455/79‑1 (MQ=255) gtgCCGATCCTGGCCAATGCCGCGGCCGCGTACGGCATCGACCCGGTGGAAATTGCCCGCGCCTCGGTGCTTGGCCAGc > 4:53455/1‑79 (MQ=255) gCCGATCCTGGCCAATGCCGCGGCCGCGTACGGCATCGACCCGGTGGAAATTGCCCGCGCCTCGGTGCTTGGCCAGCC‑GGTTCACCTGATGAGC‑CCGCTGGTGGCCTCGACCCTGCTGCTGGTGGGCATGGTCGACCGCGATATCGGt > 8:322407/1‑148 (MQ=255) ccGATCCTGGCCAATGCCGCGGCCGCGTACGGCATCGACCCGGTGGAAATTGCCCGCGCCTCGGTGCTTGGCCAGCC‑GGTTCACCTGATGAGC‑CCGCTGGTGGc < 8:324393/104‑1 (MQ=255) cTGGCCAATGCCGCGGCCGCGTACGGCATCGACCCGGTGGAAATTGCCCGCGCCTCGGTGCTTGGCCAGCC‑GGTTCACCTGATGAGC‑CCGCTGGTGGCCTCGACCCTGCTGCTGGTGGGCATGGTCGACCGCGATATCGGTGATTTc > 4:119987/1‑147 (MQ=255) tGGCCAATGCCGCGGCCGCGTACGGCATCGACCCGGTGGAAATTGCCCGCGCCTCGGTGCTTGGCCAGCC‑GGTTCACCTGATGAGC‑CCGCTGGTGGCCTCGACCCTGCTGCTGGTGGGCATGGTCGACCGCGATATCGGTGATTTc > 3:2526/1‑146 (MQ=255) ggCCAATGCCGCGGCCGCGTACGGCATCGACCCGGTGGAAATTGCCCGCGCCTCGGTGCTTGGCCAGCC‑GGTTCACCTGATGAGC‑CCGCTGGTGGCCTCGACCCTGCTGCTGGTGGGCATGGTCGACCGCCATATCGGTGATTTCCAg > 7:150033/1‑148 (MQ=255) gCCAATGCCGCGGCCGCGTACGGCATCGACCCGGTGGAAATTGCCCGCGCCTCGGTGCTTGGCCAGCC‑GGTTCACCTGATGAGC‑CCGCTGGTGGCCTCGACCCTGCTGCTGGTGGGCATGGTCGACCGCGATATCGGTGATTTCCAGa > 4:226386/1‑148 (MQ=255) ccAATGCCGCGGCCGCGTACGGCATCGACCCGGTGGAAATTGCCCGCGCCTCGGTGCTTGGCCAGCC‑GGTTCACCTGATGAGC‑CCGCTGGTGGCCTCGACCCTGCTGCTGGTGGGCATGGTCGACCGCGATATCGGTGATTTCCAGaaa < 8:189862/149‑1 (MQ=255) acAACGCCGCGGCCGCGTACGGCATCGACCCGGTGGAAATTGCCCGCGCCTCGGTGCTTGGCCAGCC‑GGTTCACCTGATGAGC‑CCGCTGGTGGCCTCGACCCTGCTGCTGGTGGGCATGGTCGACCGCGATATCGGTGATTTCCAGa > 3:177186/2‑147 (MQ=255) aaTGCCGCGGCCGCGTACGGCATCGACCCGGTGGAAATTGCCCGCGCCTCGGTGCTTGGCCAGCC‑GGTTCACCTGATGAGC‑CCGCTGGTGGCCTCGACCCTGCTGCtggtg < 2:330204/111‑1 (MQ=255) aaTGCCGCGGCCGCGTACGGCATCGACCCGGTGGAAATTGCCCGCGCCTCGGTGCTTGGCCAGCC‑GGTTCACCTGATGAGC‑CCGCTGGTGGCCTCGACCCTGCTGCtggtg > 1:330204/1‑111 (MQ=255) gccgcggccgcgTACGGCATCGACCCGGTGGAAATTGCCCGCGCCTCGGTGCTTGGCCAGCC‑GGTTCACCtg < 6:339219/72‑1 (MQ=255) gccgcggccgcgTACGGCATCGACCCGGTGGAAATTGCCCGCGCCTCGGTGCTTGGCCAGCC‑GGTTCACCtg > 5:339219/1‑72 (MQ=255) ccgcggccgcgTACGGCATCGACCCGGTGGAAATTGCCCGCGCCTCGGTGCTTGGCCAGCC‑GGTTCACCTGATGAGC‑CCGCTGGTGGCCTCGACCCTGCTGCTGGTGGGCATGGTCGACCGCGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCAc < 4:2526/148‑1 (MQ=255) gccgcgTACGGCATCGACCCGGTGGAAATTGCCCGCGCCTCGGTGCTTGGCCAGCC‑GGTTCACCTGATGAGC‑CCGCTGGTGGCCTCGACCCTGCTGCTGGTGGGCATGGTCGACCGCGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCGTGaa < 3:226386/149‑1 (MQ=255) ccgcgTACGGCATCGACCCGGTGGAAATCGCCCGCGCCTCGGTGCTTGGCCAGCC‑GGTTCACCTGATGAGC‑CCGCTGGTGGCCTCGACCCTGCTGCTGGTGGGCATGGTCGACCGCGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCGTGaaa < 6:281699/149‑1 (MQ=255) cGGCATCGACCCGGTGGAAATTGCCCGCGCCTCGGTGCTTGGCCAGCC‑GGTTCACCTGATGAGC‑CCGCTGGTGGCCTCGACCCTGCTGCTGGTGGGCATGGTCGACCGCGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCGTGAAATGGGcc < 2:291915/148‑1 (MQ=255) | CGCTGGTGGACTGGATTCCGGAAGCGTGGAGCCACTGGTTCCCGCTGGTGGTGGCGCTGACCAGCATGCCGCTGACCTTCGTGCTGTCCAACGACGCGTACTACTTCGGCGTTGTGCCGATCCTGGCCAATGCCGCGGCCGCGTACGGCATCGACCCGGTGGAAATTGCCCGCGCCTCGGTGCTTGGCCAGCC‑GGTTCACCTGATGAGC‑CCGCTGGTGGCCTCGACCCTGCTGCTGGTGGGCATGGTCGACCGCGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCGTGAAATGGGCC > NC_002947/2341727‑2342019 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |