Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 2,421,950 | C→G | 6.0% | P80A (CCG→GCG) ‡ | moeA → | molybdenum::molybdopterin ligase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 2,421,950 | 0 | C | G | 6.0% | 217.3 / 3.9 | 67 | P80A (CCG→GCG) ‡ | moeA | molybdenum::molybdopterin ligase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (36/27); new base G (2/2); total (38/29) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.36e-01 |
CCGATCCGCGAGACCGAAAACCTGCCGCTGGCCGAAGCCGAGGGCCGCGTGCTGGCCACCGACCTGGTGGCCTCGCTCGACCTGCCGCCCTGGCCGAACAGCGCCATGGACGGTTATGCCTTGCGCCTGGCTGACTGGCAGGGCCAGCCGCTGCCGGT‑CAGCCAGCGTATTTTCGCCGGCCATGCGCCCCAGCCGCTGCAACCGGGTACCTGCGCGCGGA‑TCTTCACCGGCGCGCCTGTGCCGGAGGGGGCCGACTGCGTCGAGATGCAGGAAAACACCGAAGTACTCGAAGATGG > NC_002947/2421803‑2422098 | ccGATCCGCGAGACCGAAAACCTGCCGCTGGCCGAAGCCGAGGGCCGCGTGCTGGCCACCGACCTGGTGGCCTCGCTCGACCTGCCGCCCTGGCCGAACAGCGCCATGGACGGTTATGCCTTGCGCCTGGCTGACTGGCAGGGCCAGcc < 5:87608/149‑1 (MQ=255) aTCCGCGAGACCGAAAACCTGCCGCTGGCCGAAGCCGAGGGCCGCGTGCTGGCCACCGACCTGGTGGCCTCGCTCGACCTGCCGCCCTGGCCGAACAGCGCCATGGACGGTTATGCCTTGCGCCTGGCTGACTGGCAGGGCCAGCCGCt > 3:74786/1‑149 (MQ=255) cgcgAGACCGAAACCCTGCCGCTGGCCGAAGCCGAGGGCCGCGTGCTGGCCACCGACCTGGTGGCCTCGCTCGACCTGCCGCCCTGGCCGAACAGCGCCATGGACGGTTATGCCTTGCGCCTGGCTGACTGGCAGGGCCAGCCGCTGc < 5:301630/148‑1 (MQ=255) gcgAGACCGAAAACCTGCCGCTGGCCGAAGCCGAGGGCCGCGTGCTGGCCACCGACCTGGTGGCCTCGCTCGACCTGCCGCCCTGGCCGAACAGCGCCATGGACGGTTATGCCTTGCGCCTGGCTGACTGGCAGGGCCAGCCGCTGCCg > 7:16666/1‑149 (MQ=255) gaCCGAAAACCTGCCGCTGGCCGAAGCCGAGGGCCGCGTGCTGGCCACCGACCTGGTGGCCTCGCTCGACCTGCCGCCCTGGCCGAACAGCGCCATGGACGGTTATGCCTTGCGCCTGGCTGACCGGCAGCGGCTGGCCCTGCCAGT‑ca < 4:22168/149‑1 (MQ=255) cGAAAACCTGCCGCTGGCCGAAGCCGATGGCCGCGTGCTGGCCACCGACCTGGTGGCCTCGCTCGACCTGCCGCCCTGGCCGAACAGCGCCATGGACGGTTATGCCTTGCGCCTGGCTGACTGGCAGGGCCAGCCGCTGCCGGT‑cagc > 7:62276/1‑148 (MQ=255) cGCTGGCCGAAGCCGAGGGCCGCGTGCTGGCCACCGACCTGGTGGCCTCGCTCGACCTGCCGCCCTGGCCGAACAGCGCCATGGACGGTTATGCCTTGCGCCTGGCTGACTGGCAGGGCCAGCCGCTGCCGGT‑CAGCCAGCGTAt < 4:175095/145‑1 (MQ=255) cGCTGGCCGAAGCCGAGGGCCGCGTGCTGGCCACCGACCTGGTGGCCTCGCTCGACCTGCCGCCCTGGCCGAACAGCGCCATGGACGGTTATGCCTTGCGCCTGGCTGACTGGCAGGGCCAGCCGCTGCCGGT‑CAGCCAGCGTAt > 3:175095/1‑145 (MQ=255) ccGAAGCCGAGGGCCGCGTGCTGGCCACCGACCTGGTGGCCTCGCTCGACCTGCCGCCCTGGCCGAACAGCGCCATGGACGGTTATGCCTTGCGCCTGGCTGACTGGCAGGGCCAGCCGCTGCCGGT‑CAGCCAGCGTATTTTc < 6:302478/143‑1 (MQ=255) ccGAAGCCGAGGGCCGCGTGCTGGCCACCGACCTGGTGGCCTCGCTCGACCTGCCGCCCTGGCCGAACAGCGCCATGGACGGTTATGCCTTGCGCCTGGCTGACTGGCAGGGCCAGCCGCTGCCGGT‑CAGCCAGCGTATTTTc > 5:302478/1‑143 (MQ=255) ccGAAGCCGAGGGCCGCGTGCTGGCCACCGACCTGGTGGCCTCGCTCGACCTGCCGCCCTGGCCGAACAGCGCCATGGACGGTTATGCCTTGCGCCTGGCTGACTGGCAGGGCCAGCCGCTGCCGGT‑CAGCCAGCGTATTTTCGCCGGc > 8:239602/1‑149 (MQ=255) ccGAAGCCGAGGGCCGCGTGCTGGCCACCGACCTGGTGGCCTCGCTCGACCTGCCGCCCTGGCCGAACAGCGCCATGGACGGTTATGCCTTGCGCCTGGCTGACTGGCAGGGCCAGCCGCTGCCGGT‑CAGCCAGCGTATTTTCGCCGGc > 6:134050/1‑149 (MQ=255) cGAAGCCGAGGGCCGCGTGCTGGCCACCGACCTGGTGGCCTCGCTCGACCTGCCGCCCTGGCCGAACAGCGCCATGGACGGTTATGCCTTGCGCCTGGCTGACTGGCAGGGCCAGCCGCTGCCGGT‑CAGCCAGCGTATTTTCGCCGGc > 4:100675/1‑148 (MQ=255) cGAAGCCGAGGGCCGCGTGCTGGCCACCGACCTGGTGGCCTCGCTCGACCTGCCGCCCTGGCCGAACAGCGCCATGGACGGTTATGCCTTGCGCCTGGCTGACTGGCAGGGCCAGCCGCTGCCGGT‑CAGCCAGCGTATTTTCGCCGGc > 2:206928/1‑148 (MQ=255) gAAGCCGAGGGCCGCGTGCTGGCCACCGACCTGGTGGCCTCGCTCGACCTGCCGCCCTGGCCGAACAGCGCCATGGACGGTTATGCCTTGCGCCTGGCTGACCGGCAGCGGCTGGCCCTGCCAGT‑ca < 1:250570/127‑1 (MQ=38) gAAGCCGAGGGCCGCGTGCTGGCCACCGACCTGGTGGCCTCGCTCGACCTGCCGCCCTGGCCGAACAGCGCCATGGACGGTTATGCCTTGCGCCTGGCTGACCGGCAGCGGCTGGCCCTGCCAGT‑ca > 2:250570/1‑127 (MQ=38) gAGGGCCGCGTGCTGGCCACCGACCTGGTGGCCTCGCTCGACCTGCCGCCCTGGCCGAACAGCGCCATGGACGGTTATGCCTTGCGCCTGGCTGACTGGCAGGGCCAGcc < 4:15214/110‑1 (MQ=255) gAGGGCCGCGTGCTGGCCACCGACCTGGTGGCCTCGCTCGACCTGCCGCCCTGGCCGAACAGCGCCATGGACGGTTATGCCTTGCGCCTGGCTGACTGGCAGGGCCAGcc > 3:15214/1‑110 (MQ=255) gggCCGCGTGCTGGCCACCGACCTGGTGGCCTCGCTCGACCTGCCGCCCTGGCCGAACAGCGCCATGGACGGTTATGCCTTGCGCCTGGCTGACTGGCAGGGCCAGCCGCTGc < 7:106845/113‑1 (MQ=255) gggCCGCGTGCTGGCCACCGACCTGGTGGCCTCGCTCGACCTGCCGCCCTGGCCGAACAGCGCCATGGACGGTTATGCCTTGCGCCTGGCTGACTGGCAGGGCCAGCCGCTGc > 8:106845/1‑113 (MQ=255) gcgTGCTGGCCACCGACCTGGTGGCCTCGCTCGACCTGCCGCCCTGGCCGAACAGCGCCATGGACGGTTATGCCTTGCGCCTGGCTGACTGGCAGGGCCAGCCGCTGCCGGT‑CAGCCAGCGTATTTTCGCCGGCCATGCGCCCCAGCCg > 1:205246/1‑149 (MQ=255) gTGCTGGCCACCGACCTGGTGGCCTCGCTCGACCTGCCGCCCTGGCCGAACAGCGCCATGGACGGTTATGCCTTGCGCCTGGCTGACTGGCAGGGCCAGCCGCTGCCGGT‑CAGCCAGCGTATTTTCGCCGGCCATGCGCCCCAGCCGCt > 7:252231/1‑149 (MQ=255) gTGCTGGCCACCGACCTGGTGGCCTCGCTCGACCTGCCGCCCTGGCCGAACAGCGCCATGGACGGTTATGCCTTGCGCCTGGCTGACTGGCAGGGCCAGCCGCTGCCGGT‑CAGCCAGCGTATTTTCGCCGGCCATGCGCCCCAGCCGCt < 4:68539/149‑1 (MQ=255) cTGGCCACCGACCTGGTGGCCTCGCTCGACCTGCCGCCCTGGCCGAACAGCGCCATGGACGGTTATGCCTTGCGCCTGGCTGACTGGCAGGGCCAGCCGCTGCCGGT‑CAGCCAGCGTATTTTCGCCGGCCATGCGCCCCAGCCGCTGc > 6:305732/1‑148 (MQ=255) gCCACCGACCTGGTGGCCTCGCTCGACCTGCCGCCCTGGCCGAACAGCGCCATGGACGGTTATGCCTTGCGCCTGGCTGACTGGCAGGGCCAGCCGCTGCCGGT‑c > 6:201883/1‑105 (MQ=255) gCCACCGACCTGGTGGCCTCGCTCGACCTGCCGCCCTGGCCGAACAGCGCCATGGACGGTTATGCCTTGCGCCTGGCTGACTGGCAGGGCCAGCCGCTGCCGGT‑c < 5:201883/105‑1 (MQ=255) cACCGACCTGGTGGCCTCGCTCGACCTGCCGCCCTGGCCGAACAGCGCCATGGACGGTTATGCCTTGCGCCTGGCTGACTGGCAGGGCCAGCCGCTGCCGGT‑CAGCCAGCGTATTTTCGCCGGCCATGCGCCCCAGCCGCTGCAACCgg < 8:62276/149‑1 (MQ=255) cACCGACCTGGTGGCCTCGCTCGACCTGCCGCCCTGGCCGAACAGCGCCATGGACGGTTATGCCTTGCGCCTGGCTGACTGGCAGGGCCAGCCGCTGCCGGT‑CAGCCAGCGTATTTTCGCCGGCCATGCGCCCCAGCCGCTGCAACCgg < 3:216273/149‑1 (MQ=255) cACCGACCTGGTGGCCTCGCTCGACCTGCCGCCCTGGCCGAACAGCGCCATGGACGGTTATGCCTTGCGCCTGGCTGACTGGCAGGGCCAGCCGCTGCCGGT‑CAGCCAGCGTATTTTCGCCGGCCATGCGCCCCAGCCGCTGCAACCgg < 8:16666/149‑1 (MQ=255) cGACCTGGTGGCCTCGCTCGACCTGCCGCCCTGGCCGAACAGCGCCATGGACGGTTATGCCTTGCGCCTGGCTGACTGGCAGGGCCAGCCGCTGCCGGT‑CAGCCAGCGTATTTTCGCCGGCCATGCGCCCCAGCCGCt < 5:30505/138‑1 (MQ=255) cGACCTGGTGGCCTCGCTCGACCTGCCGCCCTGGCCGAACAGCGCCATGGACGGTTATGCCTTGCGCCTGGCTGACTGGCAGGGCCAGCCGCTGCCGGT‑CAGCCAGCGTATTTTCGCCGGCCATGCGCCCCAGCCGCt > 6:30505/1‑138 (MQ=255) cGACCTGGTGGCCTCGCTCGACCTGCCGCCCTGGCCGAACAGCGCCATGGACGGTTATGCCTTGCGCCT‑GCTGACTGGCAGGGCCAGCCGCTGCCGGT‑CAGCCAGCGTATTTTCGCCGGCCATGCGCCCCAGCCGCTGCAACCGGGTAc > 5:46513/1‑149 (MQ=255) gtggCCTCGCTCGACCTGCCGCCCTGGCCGAACAGCGCCATGGACGGTTATGCCTTGCGCCTGGCTGACTGGCAGGGCCAGCCGCTGCCGGT‑CAGCCAGCGTATTTTCGCCGGCCATGCGCCCCAGCCGCTGCAACCGGGTACCTgcgc > 3:79691/1‑149 (MQ=255) gCCTCGCTCGACCTGCCGCCCTGGCCGAACAGCGCCATGGACGGTTATGCCTTGCGCCTGGCTGACTGGCAGGGCCAGCCGCTGCCGGT‑CAGCCAGCGTATTTTCGCCGGCCATGCGCCCCAGCCGCTGCAACCGGGTACCTgcgcgc < 7:239602/148‑1 (MQ=255) gCCTCGCTCGACCTGCCGCCCTGGCCGAACAGCGCCATGGACGGTTATGCCTTGCGCCTGGCTGACTGGCAGGGCCAGCCGCTGCCGGT‑CAGCCAGCGTATTTTCGCCGGCCATGCGCCCCAGCCGCTGCAACCGGGTACCTgcgcgc < 5:134050/148‑1 (MQ=255) gCCTCGCTCGACCTGCCGCCCTGGCCGAACAGCGCCATGGACGGTTATGCCTTGCGCCTGGCTGACTGGCAGGGCCAGCCGCTGCCGGT‑CAGCCAGCGTATTTTCGCCGGCCATGCGCCCCAGCCGCTGCAACCGGGTACCTGcgcgcg < 4:74786/149‑1 (MQ=255) ccTCGCTCGACCTGCCGCCCTGGCCGAACAGCGCCATGGACGGTTATGCCTTGCGCCTGGCTGACTGGCAGGGCCAGCCGCTGCCGGT‑CAGCCAGCGTATTTTCGCCGGCCATGCGCCTCAGCCGCTGCAACCGGGTACCTGCGCGCgg < 1:206928/149‑1 (MQ=255) ctcgctcgACCTGCCGCCCTGGCCGAACAGCGCCATGGACGGTTATGCCTTGCGCCTGGCTGACTGGCAGGGCCAGCCGCTGCCGGT‑CAGCCAGCGTATTTTCGCCGGCCATGCGCCCCAGCCGCTGCAACCGGGTACCTGCGCGCGGa > 4:240417/1‑149 (MQ=255) ctcgctcgACCTGCCGCCCTGGCCGAACAGCGCCATGGACGGTTATGCCTTGCGCCTGGCTGACTGGCAGGGCCAGCCGCTGCCGGT‑CAGCCAGCGTATTTTCGCCGGCCATGCGCCCCAGCCGCTGCAACCGGGTACCTGCGCGCGGa > 3:254797/1‑149 (MQ=255) gctcgACCTGCCGCCCTGGCCGAACAGCGCCATGGACGGTTATGCCTTGCGCCTGGCTGACTGGCAGGGCCAGCCGCTGCCGGT‑CAGCCAGCGTATTTTCGCCGGCCATGCGCCCCAGCCGCTGCAACCGGGTACCTGCGCGCGGA‑TCt > 6:50916/1‑149 (MQ=255) gACCTGCCGCCCTGGCCGAACAGCGCCATGGACGGTTATGCCTTGCGCCTGGCTGACTGGCAGGGCCAGCCGCTGCCGGT‑CAGCCAGCGTATTTTCGCCGGCCATGCGCCCCAGCCGCTGCAACCGGGTACCTGCGCGCGGA‑TCTTc < 5:302907/147‑1 (MQ=255) gccCTGGCCGAACAGCGCCATGGACGGTTATGCCTTGCGCCTGGCTGACTGGCAGGGCCAGCCGCTGCCGGT‑CAGCCAGCGTATTTTCGCCGGCCATGCGCCCCAGCCGCTGCAACCGGGTACCTGCGCGCGGA‑TCTTCACCGgcgcgc > 8:60004/1‑149 (MQ=255) cTGGCCGAACAGCGCCATGGACGGTTATGCCTTGCGCCTGGCTGACTGGCAGGGCCAGCCGCTGCCGGT‑CAGCCAGCGTATTTTCGCCGGCCATGCGCCCCAGCCGCTGCAACCGGGTACCTGCGCGCGGA‑TCTTCACCGGCGCGCCtg > 3:67993/1‑149 (MQ=255) cGAACAGCGCCATGGACGGTTATGCCTTGCGCCTGGCTGACTGGCAGGGCCAGCCGCTGCCGGT‑CAGCCAGCGTATTTTCGCCGGCCATGCGCCCCAGCCGCTGCAACCGGGTACCTGCGCGCGGA‑TCTTCACCGGCGCGCCTGTGCCg < 8:252231/149‑1 (MQ=255) aCAGCGCAATGGACGGTTATGCCTTGCGCCAGGCTGACTGGCAGGGCCAGCCGCTGACGGT‑CAGCCAGCGTATTTTCGCCGGCCATGAGCCCCAGCCGCTGAAACCGGGTACCTGCGCGCGCA‑TCTTCACCGGCGCGCCTGTGCCGGAg > 2:77615/1‑149 (MQ=255) aGCGCCATGGACGGTTATGCCTTGCGCCTGGCTGACTGGCAGGGCCAGCCGCTGCCGGT‑CAGCCAGCGTATTTTCGCCGGCCATGCGCCCCAGCCGCTGCAACCGGGTACCTGCGCGCGGA‑TCTTCACCGGCGCGCCTGTGCCGGAggg > 2:16100/1‑149 (MQ=255) gcgcCATGGACGGTTATGCCTTGCGCCTGGCTGACTGGCAGGGCCAGCCGCTGCCGGTACAGCCAGCGTATTTTCGCCGGCCATGCGCCCCAGCCGCTGCAACCGGGTACCTGCGCGCGGA‑TCTTCACCGGCGCGCCTGTGCCGGAggg > 1:94524/1‑149 (MQ=255) cATGGACGGTTATGCCTTGCGCCTGGCTGACTGGCAGGGCCAGCCGCTGCCGGT‑CAGCCAGCGTATTTTCACCGGCCATGCGCCCCAGCCGCTGCAACCGGGTACCTGCGCGCGGA‑TCTTCACCGGCGCGCCTGTGCCGGAGGGGGcc > 2:90024/1‑148 (MQ=255) aCGGTTATGCCTTGCGCCTGGCTGACTGGCAGGGCCAGCCGCTGCCGGT‑CAGCCAGCGTATTTTCGCCGGCCATGCGCCCCAGCCGCTGCAACCGGGTACCTGCGCGCGGA‑TCTTCACCGGCGCGCCTGTGCCGGAGGGGGCCGACTGc < 4:67993/149‑1 (MQ=255) gTTATGCCTTGCGCCTGGCTGACTGGCAGGGCCAGCCGCTGCCGGT‑CAGCCAGCGTATTTTCGCCGGCCATGCGCCCCAGCCGCTGCAACCGGGTACCTGCGCGCGGA‑TCTTCACCGGCGCGCCTGTGCCGGAGGGGGCCGACTGCGTc < 4:254797/149‑1 (MQ=255) tATGCCTTGCGCCTGGCTGACTGGCAGGGCCAGCCGCTGCCGGT‑CAGCCAGCGTATTTTCGCCGGCCATGCGCCCCAGCCGCTGCAACCGGGTACCTGCGCGCGGA‑TCTTCACCGGCGCGCCTGTGCCGGAGGGGGCCGAc > 1:145565/1‑141 (MQ=255) tATGCCTTGCGCCTGGCTGACTGGCAGGGCCAGCCGCTGCCGGT‑CAGCCAGCGTATTTTCGCCGGCCATGCGCCCCAGCCGCTGCAACCGGGTACCTGCGCGCGGA‑TCTTCACCGGCGCGCCTGTGCCGGAGGGGGCCGAc < 2:145565/141‑1 (MQ=255) ccTTGCGCCT‑GCTGACTGGCAGGGCCAGCCGCTGCCGGT‑CAGCCAGCGTATTTTCGCCGGCCATGCGCCCCAGCCGCTGCAACCGGGTACCTGCGCGCGGA‑TCTTCACCGGCGCGCCTGTGCCGGAGGGGGCCGACTGCGTCGAGATg < 6:46513/148‑1 (MQ=255) cTTGCGCCTGGCTGACTGGCAGGGCCAGCCGCTGCCGGT‑CAGCCAGCGTATTTTCGCCGGCCATGCGCCCCAGCCGCTGCAACCGGGTACCTGCGCGCGGA‑TCTTCACCGGCGCGCCTGTGCCGGAGGGGGCCGACTGCGTCGAGATg > 4:181644/1‑148 (MQ=255) cTTGCGCCTGGCTGACTGGCAGGGCCAGCCGCTGCCGGT‑CAGCCAGCGTATTTTCGCCGGCCATGCGCCCCAGCCGCTGCAACCGGGTACCTGCGCGCGGA‑TCTTCACCGGCGCGCCTGTGCCGGAGGGGGCCGACTGCGTCGAGATg > 8:129331/1‑148 (MQ=255) gcgcCTGGCTGACTGGCAGGGCCAGCCGCTGCCGGT‑CAGCCAGCGTATTTTCGCCGGCCATGCGCCCCAGCCGCTGCAACCGGGTACCTGCGCGCGGA‑TCTTCACCGGCGCGCCTGTGCCGGAGGGGGCCGACTGCGTCGAGATGCAg < 7:60004/148‑1 (MQ=255) gcCTGGCTGACTGGCAGGGCCAGCCGCTGCCGGT‑CAGCCAGCGTATTTTCGCCGGCCATGCGCCCCAGCCGCTGCAACCGGGTACCTGCGCGCGGA‑TCTTCACCGGCGCGCCTGTGCCGGAGGGGGCCGACTGCGTCGAGATGCAGGa > 3:247860/1‑148 (MQ=255) cTGGCTGACTGGCAGGGCCAGCCGCTGCCGGT‑CAGCCAGCGTATTTTCGCCGGCCATGCGCCCCAGCCGCTGCAACCGGGTACCTGCGCGCGGA‑TCTTCACCGGCGCGCCTGTGCCGGAGGGGGCCGACTGCGTCGAGATGCAGGaaaa > 4:24595/1‑149 (MQ=255) cTGGCGGACTGGCAGGGCCAGCCGCTGCCGGG‑CATCCAGCGTATTTTCGCCGGCCATGCGCCCCAGCCGCTGCAACCGGGTTCCTGCGCGCGGATTATTCACCGGCGCGCCTGTGCCGGAGGGGGCCGACTGCGTCGAGATGCAGGaaa < 1:90024/149‑1 (MQ=255) tGACTGGCAGGGCCAGCCGCTGCCGGT‑CAGCCAGCGTATTTTCGCCGGCCATGCGCCCCAGCCGCTGCAACCGGGTACCTGCGCGCGGA‑TCTTCACCGGCGCGCCGGTGCCGGAGGGGGCCGACTGCGTCGAGATGCAGGAAAACAcc > 7:217600/1‑148 (MQ=255) tGACCGGCAGCGGCTGGCCCTGCCAGT‑CAGCCAGCGTATTTTCGCCGGCCATGCGCCCCAGCCGCTGCAACCGGGTACCTGCGCGCGGA‑TCTTCACCGGCGCGCCTGTGCCGGAGGGGGCCGACTGCGTCGAGATGCAGGAAAACAcc > 2:50868/1‑148 (MQ=255) aCTGGCAGGGCCAGCCGCTGCCGGT‑CAGCCAGCGTATTTTCGCCGGCCATGCGCCCCAGCCGCTGCAACCGGGTACCTGCGCGCGGA‑TCTTCACCGGCGCGCCTGTGCCGGAGGGGGCCGACTGCGTCGAGATGCAGGAAAACACCGaa < 3:240417/149‑1 (MQ=255) aCTGGCAGGGCCAGCCGCTGCCGGT‑CAGCCAGCGTATTTTCGCCGGCCATGCGCCCCAGCCGCTGCAACCGGGTACCTGCGCGCGGA‑TCTTCACCGGCGCGCCTGTGCCGGAGGGGGCCGACTGCGTCGAGATGCAGGAAAACACCGa < 5:50916/148‑1 (MQ=255) aCTGGCAGGGCCAGCCGCTGCCGGT‑CAGCCAGCGTATTTTCGCCGGCCATGCGCCCCAGCCGCTGCAACCGGGTACCTGCGCGCGGA‑TCTTCACCGGCGCGCCTGTGCCGGAGGGGGCCGACTGCGTCGAGATGCAGGAAAACACCGa < 5:305732/148‑1 (MQ=255) tGGCAGGGCCAGCCGCTGCCGGT‑CAGCCAGCGTATTTTCGCCGGCCATGCGCCCCAGCCGCTGCAACCGGGTACCTGCGCGCGGA‑TCTTCACCGGCGCGCCTGTGCCGGAGGGGGCCGACTGCGTCGAGATGCAGGAAAACACCGAAg > 1:142746/1‑148 (MQ=255) gCAGGGCCAGCCGCTGCCGGT‑CAGCCAGCGTATTTTCGCCGGCCATGCGCCCCAGCCGCTGCAACCGGGTACCTGCGCGCGGA‑TCTTCACCGGCGCGCCTGTGCCGGAGGGGGCCGACTGCGTCGAGATGCAGGAAAACACCGAAGTAc > 6:283912/1‑149 (MQ=255) gCAGGGCCAGCCGCTGCCGGT‑CAGCCAGCGTATTTTCGCCGGCCATGCGCCCCAGCCGCTGCAACCGGGTACCTGCGCGCGGA‑TCTTCACCGGCGCGCCTGTGCCGGAGGGGGCCGACTGCGTCGAGATGCAGGAAAACACCGAAGTAc > 3:117776/1‑149 (MQ=255) aGGGCCAGCCGCTGCCGGT‑CAGCCAGCGTATTTTCGCCGGCCATGCGCCCCAGCCGCTGCAACCGGGTACCTGCGCGCGGA‑TCTTCACCGGCGCGCCTGTGCCGGAGGGGGCCGACTGCGTCGAGATGCAGGAAAACACCGAAGTACTc > 7:139969/1‑149 (MQ=255) gggCCAGCCGCTGCCGGT‑CAGCCAGCGTATTTTCGCCGGCCATGCGCCCCAGCCGCTGCAACCGGGTACCTGCGCGCGGA‑TCTTCACCGGCGCGCCTGTGCCGGAGGGGGCCGACTGCGTCGAGATGCAGGAAAACACCGAAGTACTCg < 8:139969/149‑1 (MQ=255) aGCCGCTGCCGGT‑CAGCCAGCGTATTTTCGCCGGCCATGCGCCCCAGCCGCTGCAACCGGGTACCTGCGCGCGGA‑TCTTCACCGGCGCGCCTGTGCCGGAGGGGGCCGTCTGCGTCGAGATGCAGGAAAACACCGAAGTACTCGAAGAt < 1:16100/149‑1 (MQ=255) ccGCTGCCGGT‑CAGCCAGCGTATTTTCGCCGGCCATGCGCCCCAGCCGCTGCAACCGGGTACCTGCGCGCGGA‑TCTTCACCGGCGCGCCTGTGCCGGAGGGGGCCGACTGCGTCGAGATGCAGGAAAACACCGAAGTACTCGAAGATgg > 6:33466/1‑149 (MQ=255) | CCGATCCGCGAGACCGAAAACCTGCCGCTGGCCGAAGCCGAGGGCCGCGTGCTGGCCACCGACCTGGTGGCCTCGCTCGACCTGCCGCCCTGGCCGAACAGCGCCATGGACGGTTATGCCTTGCGCCTGGCTGACTGGCAGGGCCAGCCGCTGCCGGT‑CAGCCAGCGTATTTTCGCCGGCCATGCGCCCCAGCCGCTGCAACCGGGTACCTGCGCGCGGA‑TCTTCACCGGCGCGCCTGTGCCGGAGGGGGCCGACTGCGTCGAGATGCAGGAAAACACCGAAGTACTCGAAGATGG > NC_002947/2421803‑2422098 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |