Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 2,498,216 | C→T | 7.7% | H39H (CAC→CAT) ‡ | PP_2193 → | ferric siderophore receptor |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 2,498,216 | 0 | C | T | 7.7% | 183.3 / 4.5 | 65 | H39H (CAC→CAT) ‡ | PP_2193 | ferric siderophore receptor |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (30/30); new base T (2/3); total (32/33) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.12e-01 |
GACTGATCAGCAACCCATTCTCATTTACGACTTGTCAGGAAGCTCATTCGTGCCTCTGATGCTCAAGCCCTTGCACCGCCGTCGCGGTTCTTTTCACCATGCCTTGATGTCTTGCAGTGCCGTGGCCCTGTTGCTCGG‑CCCCCTGCACGCAGGGGCCGCGACGGCTGCCGAACAGACCCAGATGCAGGCCCGCCAGGTCCAGCTCGACCTGCCAGCCCAACCGCTGGACCAGGCGCTGACCACTTTCGCCGACCAGGCCGGCCTGCACCTGCTGTACACCACAGGCGAT > NC_002947/2498069‑2498357 | gaCTGATCAGCAACCCATTCTCATTTACGACTTGTCAGGAAGCTCATTCGTGCCTCTGATGCTCAAGCCCTTGCACCGCCGTCGCGGTTCTTTTCACCATGCCTTGATGTCTTGCAGTGCCGTGGCCCTGTTGCTCGG‑CCCCCTGCACg > 6:175711/1‑149 (MQ=255) aCTGATCAGCAACCCATTCTCATTTACGACTTGTCAGGAAGCTCATTCGTGCCTCTGATGCTCAAGCCCTTGCACCGCCGTCGCGGTTCTTTTCACCATGCCTTGATGTCTTGCAGTGCCGTGGCCCTGTTGCTCGG‑CCCCCTGCACg > 7:107343/1‑148 (MQ=255) aTCAGCAACCCATTCTCATTTACGACTTGTCAGGAAGCTCATTCGTGCCTCTGATGCTCAAGCCCTTGCACCGCCGTCGCGGTTCTTTTCACCATGCCTTGATGTCTTGCAGTGCCGTGGCCCTGTTGCTCGGCCCCCCTGCACGCAgg > 5:157945/1‑149 (MQ=255) aTCAGCAACCCATTCTCATTTACGACTTGTCAGGAAGCTCATTCGTGCCTCTGATGCTCAAGCCCTTGCACCGCCGTCGCGGTTCTTTTCACCATGCCTTGATGTCTTGCAGTGCCGTGGCCCTGTTGCTCGG‑CCCCCTGCACGCAggg < 5:175711/149‑1 (MQ=255) gCAACCCATTCTCATTTACGACTTGTCAGGAAGCTCATTCGTGCCTCTGATGCTCAAGCCCTTGCACCGCCGTCGCGGTTCTTTTCACCATGCCTTGATGTCTTGCAGTGCCGTGGCCCTGTTGCTCGG‑‑CCCCTGCGTGCAgggggccg < 2:211181/149‑5 (MQ=255) gCAACCCATTCTCATTTACGACTTGTCAGGAAGCTCATTCGTGCCTCTGATGCTCAAGCCCTTGCACCGCCGTCGCGGTTCTTTTCACCATGCCTTGATGTCTTGCAGTGCCGTGGCCCTGTTGCTCGG‑‑CCCCTGCGTGCAgggggcc > 6:23742/1‑145 (MQ=255) cAACCCATTCTCATTTACGACTTGTCAGGAAGCTCATTCGTGCCTCTGATGCTCAAGCCCTTGCACCGCCGTCGCGGTTCTTTTCACCATGCCTTGATGTCTTGCAGTGCCGTGGCCCTGTTGCTCGG‑CCCCCTGCACGCAGGGGCcgc < 2:202582/149‑1 (MQ=255) cAACCCATCCTCATTTACGACTTGTCAGGAAGCTCATTCGTGCCTCTGATGCTCAAGCCCTTGCACCGCCGTCGCGGTTCTTTTCACCATGCCTTGATGTCTTGCAGTGCCGTGGCCCTGTTGCTCGG‑‑CCCCTGCGTGCAgggggccga < 5:23742/149‑6 (MQ=255) aCCCATTCTCATTTACGACTTGTCAGGAAGCTCATTCGTGCCTCTGATGCTCAAGCCCTTGCACCGCCGTCGCGGTTCTTTTCACCATGCCTTGATGTCTTGCAGTGCCGTGGCCCTGTTGCTCGG‑CCCCCTGCACGCAGGGGCCGCGa > 7:53351/1‑149 (MQ=255) cATTCTCATTTACGACTTGTCAGGAAGCTCATTCGTGCCTCTGATGCTCAAGCCCTTGCACCGCCGTCGCGGTTCTTTTCACCATGCCTTGATGTCTTGCAGTGCCGTGGCCCTGTTGCTCGG‑CCCCCTGCACGCAGGGGCCGCGACgg < 1:57787/149‑1 (MQ=255) cATTCTCATTTACGACTTGTCAGGAAGCTCATTCGTGCCTCTGATGCTCAAGCCCTTGCACCGCCGTCGCGGTTCTTTTCACAATGCCTTGATTTCTTGTTGTGCCGTGGCCCTGTTGATCGG‑CCCCATGCACGCAGGGGCCGCGACgg > 6:328528/1‑149 (MQ=255) ttCTCATTTACGACTTGTCAGGAAGCTCATTCGTGCCTCTGATGCTCAAGCCCTTGCACCGCCGTCGCGGTTCTTTTCACCATGCCTTGATGTCTTGCAGTGCCGTGGCCCTGTTGCTCGG‑CCCCCTGCACGCAGGGGCCGCGACGGCt < 6:85356/149‑1 (MQ=255) aTTTACGACTTGTCAGGAAGCTCATTCGTGCCTCTGATGCTCAAGCCCTTGCACCGCCGTCGCGGTTCTTTTCACCATGCCTTGATGTCTTGCAGTGCCGTGGCCCTGTTGCTCGG‑CCCCCTGCACGCAGGGGCCGCGACGTCTGc < 8:53351/146‑1 (MQ=255) ttACGACTTGTCAGGAAGCTCATTCGTGCCTCTGATGCTCAAGCCCTTGCACCGCCGTCGCGGTTCTTTTCACCATGCCTTGATGTCTTGCAGTGCCGTGGCCCTGTTGCTCGG‑CCCCCTGCACGCAGGGGCCGCGACGGCTGCCGaa > 2:66172/1‑148 (MQ=255) tACGACTTGTCAGGAAGCTCATTCGTGCCTCTGATGCTCAAGCCCTTGCACCGCCGTCGCGGTTCTTTTCACCATGCCTTGATGTCTTGCAGTGCCGTGGCCCTGTTGCTCGG‑CCCCCTGCACGCAGGGGCCGCGACGGCTGCCGAAc < 7:538/148‑1 (MQ=255) gACTTGTCAGGAAGCTCATTCGTGCCTCTGATGCTCAAGCCCTTGCACCGCCGTCGCGGTTCTTTTCACCATGCCTTGATGTCTTGCAGTGCCGTGGCCCTGTTGCTCGG‑CCCCCTGCACGCAGGGGCCGCGACGGCTGCCGAACAGAc > 3:196161/1‑149 (MQ=255) gTCAGGAAGCTCATTCGTGCCTCTGATGCTCAAGCCCTTGCACCGCCGTCGCGGTTCTTTTCACCATGCCTTGATGTCTTGCAGTGCCGTGGCCCTGTTGCTCGG‑CCCCCTGCACGCAGGGGCCGCGACGGCTGCCGAACAGACCCa < 4:162614/147‑1 (MQ=255) tCAGGAAGCTCATTCGTGCCTCTGATGCTCAAGCCCTTGCACCGCCGTCGCGGTTCTTTTCACCATGCCTTGATGTCTTGCAGTGCCGTGGCCCTGTTGCTCGG‑CCCCCTGCACGCAGGGGCCGCGACGGCTGCCGAACAGAccc > 2:111180/1‑145 (MQ=255) tCAGGAAGCTCATTCGTGCCTCTGATGCTCAAGCCCTTGCACCGCCGTCGCGGTTCTTTTCACCATGCCTTGATGTCTTGCAGTGCCGTGGCCCTGTTGCTCGG‑CCCCCTGCACGCAGGGGCCGCGACGGCTGCCGAACAGACCCAGAt < 1:45304/149‑1 (MQ=255) tCAGGAAGCTCATTCGTGCCTCTGATGCTCAAGCCCTTGCACCGCCGTCGCGGTTCTTTTCACCATGCCTTGATGTCTTGCAGTGCCGTGGCCCTGTTGCTCGG‑CCCCCTGCACGCAGGGGCCGCGACGGCTGCCGAACAGACCCAGAt > 5:145618/1‑149 (MQ=255) tCAGGAAGCTCATTCGTGCCTCTGATGCTCAAGCCCTTGCACCGCCGTCGAGGTTCTTTTCACCATGGCTTGATGTCTTGCAGTGCCGTGGCCCTGTTGCTCGG‑CCCCCTGCACGCAGGGGCCGCGACGGCTGCCGAACAGAccc < 1:111180/145‑1 (MQ=255) gAAGCTCATTCGTGCCTCTGATGCTCAAGCCCTTGCACCGCCGTCGCGGTTCTTTTCACCATGCCTTGATGTCTTGCAGTGCCGTGGCCCTGTTGCTCGG‑CCCCCTGCACGCAGGGGCCGCGACGGCTGCCGAACAGACCCAGATGCAg < 2:225792/149‑1 (MQ=255) cTCATTCGTGCCTCTGATGCTCAAGCCCTTGCACCGCCGTCGCGGTTCTTTTCACCATGCCTTGATGTCTTGCAGTGCCGTGGCCCTGTTGCTCGG‑CCCCCTGCGTGCAg > 7:262738/1‑110 (MQ=255) cTCATTCGTGCCTCTGATGCTCAAGCCCTTGCACCGCCGTCGCGGTTCTTTTCACCATGCCTTGATGTCTTGCAGTGCCGTGGCCCTGTTGCTCGG‑CCCCCTGCGTGCAg < 8:262738/110‑1 (MQ=255) cTCATTCGTGCCTCTGATGCTCAAGCCCTTGCACCGCCGTCGCGGTTCTTTTCACCATGCCTTGATGTCTTGCAGTGCCGTGGCCCTGTTGCTCGG‑CCCCCTGCACGCAGGGGCCGCGACGGCTGCCGAACAGACCCAGATGCAgg > 3:139408/1‑146 (MQ=255) cTCATTCGTGCCTCTGATGCTCAAGCCCTTGCACCGCCGTCGCGGTTCTTTTCACCATGCCTTGATGTCTTGCAGTGCCGTGGCCCTGTTGCTCGG‑CCCCCTGCACGCAGGGGCCGCGACGGCTGCCGAACAGACCCAGATGCAgg < 4:139408/146‑1 (MQ=255) aTTCGTGCCTCTGATGCTCAAGCCCTTGCACCGCCGTCGCGGTTCTTTTCACCATGCCTTGATGTCTTGCAGTGCCGTGGCCCTGTTGCTCGG‑CCCCCTGCACGCAGGGGCCGCGACGGCTGCCGAACAGACCCCGATGCAGGCCCGc > 5:185051/1‑148 (MQ=255) gTGCCTCTGATGCTCAAGCCCTTGCACCGCCGTCGCGGTTCTTTTCACCATGCCTTGATGTCTTGCAGTGCCGTGGCCCTGTTGCTCGG‑CCCCCTGCACGCAGGGGCCGCGACGGCTGCCGAACa > 8:129867/1‑125 (MQ=255) tGCCTCTGATGCTCAAGCCCTTGCACCGCCGTCGCGGTTCTTTTCACCATGCCTTGATGTCTTGCAGTGCCGTGGCCCTGTTGCTAGG‑CCCCCTGCACGCAGGGGCCGCGACGGCTGCCGCACAGAACCAGATCCAGCCCCGCCAGGTc > 8:280869/1‑149 (MQ=255) tctGATGCTCAAGCCCTTGCACCGCCGTCGCGGTTCTTTTCACCATGCCTTGATGTCTTGCAGTGCCGTGGCCCTGTTGCTCGG‑CCCCCTGCACGCAGGGGCCGCGACGGCTGCCGAACAGACCCAGATGCAGGCCCGCCAGGTCCAg > 7:193839/1‑148 (MQ=255) tGCTCAAGCCCTTGCACCGCCGTCGCGGTTCTTTTCACCATGCCTTGATGTCTTGCAGTGCCGTGGCCCTGTTGCTCGG‑CCCCCTGCACGCAGGGGCCGCGACGGCTGCCGAACAGACCCAGATGCAGGCCCGCCAGGTCCAGCTCGAc < 4:157662/149‑1 (MQ=255) aaGCCCTTGCACCGCCGTCGCGGTTCTTTTCACCATGCCTTGATGTCTTGCAGTGCCGTGGCCCTGTTGCTCGG‑CCCCCTGCACGCAGGGGCCGCGACGGCTg < 7:229284/103‑1 (MQ=255) aaGCCCTTGCACCGCCGTCGCGGTTCTTTTCACCATGCCTTGATGTCTTGCAGTGCCGTGGCCCTGTTGCTCGG‑CCCCCTGCACGCAGGGGCCGCGACGGCTg > 8:229284/1‑103 (MQ=255) aGCCCTTGCACCGCCGTCGCGGTTCTTTTCACCATGCCTTGATGTCTTGCAGTGCCGTGGCCCTGTTGCTCGG‑CCCCCTGCACGCAGGGGCCGCGACGGCTGCCGAACAGACCCAGATGCAGGCCCGCCAGGTCCAGCTCGACCTGCCa > 1:320580/1‑149 (MQ=255) gCCCTTGCACCGCCGTCGCGGTTCTTTTCACCATGCCTTGATGTCTTGCAGTGCCGTGGCCCTGTTGCTCGGCCCCCCTGCACGCAGGGGCCGCGACGGCTGCCGAACAGACCCAGATGCAGGCCCGCCAGGTCCAGCTCGACCTGCCa < 6:157945/149‑1 (MQ=255) aCCGCCGTCGCGGTTCTTTTCACCATGCCTTGATGTCTTGCAGTGCCGTGGCCCTGTTGCTCGG‑CCCCCTGCACGCAGGGGCCGCGACGGCTGCCGAACAGACCCAGATGCAGGCCCGCCAGGTCCAGCTCGACCTGCCAGCCCAACCg > 7:22063/1‑149 (MQ=255) cgccgTCGCGGTTCTTTTCACCATGCCTTGATGTCTTGCAGTGCCGTGGCCCTGTTGCTCGG‑CCCCCTGCACGCAGGGGCCGCGACGGCTGCCGAACAGACCCAGATGCAGGCCCGCCAGGTCCAGCTCGACCTGCCAGcc < 3:64442/141‑1 (MQ=255) cgccgTCGCGGTTCTTTTCACCATGCCTTGATGTCTTGCAGTGCCGTGGCCCTGTTGCTCGG‑CCCCCTGCACGCAGGGGCCGCGACGGCTGCCGAACAGACCCAGATGCAGGCCCGCCAGGTCCAGCTCGACCTGCCAGcc > 4:64442/1‑141 (MQ=255) ccgTCGCGGTTCTTTTCACCATGCCTTGATGTCTTGCAGTGCCGTGGCCCTGTTGCTCGG‑CCCCCTGCACGCAGGGGCCGCGACGGCTGCCGAACAGAc > 2:91214/1‑99 (MQ=255) ccgTCGCGGTTCTTTTCACCATGCCTTGATGTCTTGCAGTGCCGTGGCCCTGTTGCTCGG‑CCCCCTGCACGCAGGGGCCGCGACGGCTGCCGAACAGAc < 1:91214/99‑1 (MQ=255) ccgTCGCGGTTCTTTTCACCATGCCTTGATGTCTTGCAGTGCCGTGGCCCTGTTGCTCGG‑CCCCCTGCACGCAGGGGCCGCGACGGCTGCCGAACAGACCCAGATGCAGGCCCGCCAGGTCCAGCTCGACCTGCCAGCCCAACCGCTgg < 7:280869/149‑1 (MQ=255) cgGTTCTTTTCACCATGCCTTGATGTCTTGCAGTGCCGTGGCCCTGTTGCTCGG‑CCCCCTGCACGCAGGGGCCGCGACGGCTGCCGAACAGACCCAGATGCAGGCCCGCCAGGTCCAGCTCGACCTGCCAGCCCAACCGCTGGACCAgg > 3:257755/1‑149 (MQ=255) ttCTTTTCACCATGCCTTGATGTCTTGCAGTGCCGTGGCCCTGTTGCTCGG‑CCCCCTGCACGCAGGGGCCGCGACGGCTGCCGAACAGACCCAGATGCAGGCCCGCCAGGTCCAGCTCGACCTGCCAGCCCAACCGCTGGACCAGgcgc < 1:66172/149‑1 (MQ=255) ttCACCATGCCTTGATGTCTTGCAGTGCCGTGGCCCTGTTGCTCGG‑CCCCCTGCACGCAGGGGCCGCGACGGCTGCCGAACAGACCCAGATGCAGGCCCGCCAGGTCCAGCTCGACCTGCCAGCCCAACCGCTGGACCAGGCGCTGAc < 7:64351/148‑1 (MQ=255) ccTTGATGTCTTGCAGTGCCGTGGCCCTGTTGCTCGG‑CCCCCTGCACGCAGGGGCCGCGACGGCTGCCGAACAGACCCAGATGCAGGCCCGCCAGGTc < 6:304897/98‑1 (MQ=255) ccTTGATGTCTTGCAGTGCCGTGGCCCTGTTGCTCGG‑CCCCCTGCACGCAGGGGCCGCGACGGCTGCCGAACAGACCCAGATGCAGGCCCGCCAGGTc > 5:304897/1‑98 (MQ=255) ccTTGATGTCTTGCAGTGCCGTGGCCCTGTTGCTCGG‑CCCCCTGCACGCAGGGGCCGCGACGGCTGCCGAACAGACCCAGATGCAGGCCCGCCAGGTCCAGCTCGACCTGCCAGCCCAACCGCTGGACCAGGCGCTGACCACTTTCGcc < 8:22063/149‑1 (MQ=255) cTTGATGTCTTGCAGTGCCGTGGCCCTGTTGCTCGG‑CCCCCTGCACGCAGGGGCCGCGACGGCTGCCGAACAGACCCAGATGCAGGCCCGCCAGGTCCAGCTCGACCTGCCAGCCCAACCGCTGGACCAGGCGCTGACCACTTTCGcc > 5:267140/1‑148 (MQ=255) cTTGATGTCTTGCAGTGCCGTGGCCCTGTTGCTCGG‑CCCCCTGCACGCAGGGGCCGCGACGGCTGCCGAACAGACCCAGATGCAGGCCCGCCAGGTCCAGCTCGACCTGCCAGCCCAACCGCTGGACCAGGCGCTGACCACTTTCGCCg < 6:145618/149‑1 (MQ=255) tGTCTTGTAGTGCCGTGGCCCTGTTGCTCGG‑CCCCCTGCACGCAGGGGCCGCGACGGCTGCCGAACAGACCCAGATGCAGGCCCGCCAGGTCCAGCTCGACCTGCCAGCCCAACCGCTGGACCAGGCGCTGACCACTTTCGCCGACCAg < 5:328528/149‑1 (MQ=255) tGCAGTGCCGTGGCCCTGTTGCTCGG‑CCCCCTGCACGCAGGGGCCGCGACGGCTGCCGAACAGACCCAGATGCAGGCCCGCCAGGTCCAGCTCGACCTGCCAGCCCAACCGCTGGACCAGGCGCTGACCACTTTCGCCGACCAggccgg > 5:277927/1‑149 (MQ=255) gCAGTGCCGTGGCCCTGTTGCTCGG‑CCCCCTGCACGCTGGGGCCGCGACGGCTGCCGaa < 1:316511/59‑1 (MQ=255) gCAGTGCCGTGGCCCTGTTGCTCGG‑CCCCCTGCACGCAGGGGCCGCGACGGCTGCCGAACAGACCCAGATGCAGGCCCGCCAGGTCCAGCTCGACCTGCCAGCCCAACCGCTGGACCAGGCGCTGACCACTTTCGCCGACCAggccggc > 8:205882/1‑149 (MQ=255) tGCCGTGGCCCTGTTGCTCGG‑CCCCCTGCACGCAGGGGCCGCGACGGCTGCCGAACAGACCCAGATGCAGGCCCGCCAGGTCCAGCTCGACCTGCCAGCCCAACCGCTGGACCAGGCGCTGACCACTTTCGCCGACCAGGCCGGCCTg > 7:55677/1‑148 (MQ=255) tGCCGTGGCCCTGTTGCTCGG‑CCCCCTGCACGCAGGGGCCGCGACGGCTGCCGAACAGACCCAGATGCAGGCCCGCCAGGTCCAGCTCGACCTGCCAGCCCAACCGCTGGACCAGGCGCTGACCACTTTCGCCGACCAGGCCGGCCTGc < 4:257755/149‑1 (MQ=255) cccTGTTGCTCGG‑CCCCCTGCACGCAGGGGCCGCGACGGCTGCCGAACAGACCCAGATGCAGGCCCGCCAGGTCCAGCTCGACCTGCCAGCCCAACCGCTGGACCAGGCGCTGACCACTTTCGCCGACCAGGCCGGCCTGCACctgctg < 6:277927/149‑1 (MQ=255) cccTGTTGCTCGG‑CCCCCTGCACGCAGGGGCCGCGACGGCTGCCGAACAGACCCAGATGCAGGCCCGCCAGGTCCAGCTCGACCTGCCAGCCCAACCGCTGGACCAGGCGCTGACCACTTTCGCCGACCAGGCCGGCCTGCACctgctg > 5:215150/1‑149 (MQ=255) cccTGTTGCTCGG‑CCCCCTGCACGCAGGGGCCGCGACGGCTGCCGAACAGACCCAGATGCAGGCCCGCCAGGTCCAGCTCGACCTGCCAGCCCAACCGCTGGACCAGGCGCTGACCACTTTCGCCGACCAGGCCGGCCTGCACctgctg < 4:196161/149‑1 (MQ=255) gTTGCTCGG‑CCCCCTGCACGCAGGGGCCGCGACGGCTGGCGAACAGACCCAGATGCAGGCCCGCCAGGTCCAGCTCGACCTGCCAGCCCAACCGCTGGACCAGGCGCTGACCACTTTCGCCGACCAGGCCGGCCTGCACCTGCTGTaca > 3:72157/1‑149 (MQ=255) gTTGCTCGG‑CCCCCTGCACGCAGGGGCCGCGACGGCTGCCGAACAGACCCAGATGCAGGCCCGCCAGGTCCAGCTCGACCTGCCAGCCCACCCGCAGGCCCAGGCGCTGACCACATTCGCCGCCCAGGCCGGCCTGCACCTGCGGGaca > 8:110797/1‑149 (MQ=255) gTTGCTCGG‑CCCCCTGCACGCAGGGGCCGCGACGGCTGCCGAACAGACCCAGATGCAGGCCCGCCAGGTCCAGCTCGACCTGCCAGCCCAACCGCTGGAc > 7:240540/1‑100 (MQ=255) gTTGCTCGG‑CCCCCTGCACGCAGGGGCCGCGACGGCTGCCGAACAGACCCAGATGCAGGCCCGCCAGGTCCAGCTCGACCTGCCAGCCCAACCGCTGGAc < 8:240540/100‑1 (MQ=255) gTTGCTCGG‑CCCCCTGCACGCAGGGGCCGCGACGGCTGCCGAACAGACCCAGATGCAGGCCCGCCAGGTCCAGCTCGACCTGCCAGCCCAACCGCTGGACCAGGCGCTGACCACTTTCGCCGACCAGGCCGGCCTGCACCTGCTGTaca < 8:239197/149‑1 (MQ=255) tCGG‑CCCCCTGCACGCAGGGGCCGCGACGGCTGCCGAACAGACCCAGATGCAGGCCCGCCAGGTCCAGCTCGACCTGCCAGCCCAACCGCTGGACCAGGCGCTGACCACTTTCGCCGACCAGGCCGGCCTGCACCTGCTGTAcacca > 8:52650/1‑147 (MQ=255) cccTGCACGCAGGGGCCGCGACGGCTGCCGAACAGACCCAGATGCAGGCCCGCCAGGTCCAGCTCGACCTGCCAGCCCAACCGCTGGACCAGGCGCTGACCACTTTCGCCGACCAGGCCGGCCTGCACCTGCTGTACACCACAGGCGAt < 2:320580/149‑1 (MQ=255) | GACTGATCAGCAACCCATTCTCATTTACGACTTGTCAGGAAGCTCATTCGTGCCTCTGATGCTCAAGCCCTTGCACCGCCGTCGCGGTTCTTTTCACCATGCCTTGATGTCTTGCAGTGCCGTGGCCCTGTTGCTCGG‑CCCCCTGCACGCAGGGGCCGCGACGGCTGCCGAACAGACCCAGATGCAGGCCCGCCAGGTCCAGCTCGACCTGCCAGCCCAACCGCTGGACCAGGCGCTGACCACTTTCGCCGACCAGGCCGGCCTGCACCTGCTGTACACCACAGGCGAT > NC_002947/2498069‑2498357 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |